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Only 100 of 272 total aligned reads displayed.
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ttCTGGTTAGAGAGACGACGGTTAGTGATGCGCGACCAGAGGATCGGGTGCATTTCCGCCATGTTTGCGCCCCACAGCACAAACGCGTCAGCCTGCTCGATGTCGTCATAGCAGCCCATCGGCTCATCCATACCAAAGGTACGCATAAAGCCAACTACTGCCGACGCCATACAGTGACGCGCGTTCGGGTCGATGTTGTTCGAACGGAAGCCCGCTTTAAACAGCTTGGACGCTGCATAACCTTCCCAGATAGTCCACTGACCAGAACCGAACATACCGAtcgattccg > 2:1416400/1‑281 (MQ=255) ggTGAGGGAGGCGAGGGTTGGGGATGCGCGACCAGAGGGTCGGGTGCGTTGCGGCCGTGTTTGCGCCCCAGAGCACAGAGGCGTCAGCCTGCTCGGTGTCGTCATAGCAGCCCATCGGCTCATCCATACCAAAGGTACGCATAAAGCCAACTACTGCCGACGCCATACAGTGACGCGCGTTCGGGTCGATGTTGTTCGAACGGAAGCCCGCTTTAAACAGCTTGGACGCGGCATAACCTTCCCAGATAGTCCACTGACCAGAACCGAACATACCGATCGATTCCGGcc < 2:1676519/288‑1 (MQ=255) gTTAGAGAGACGACGGTTAGTGATGCGCGACCAGAGGATCGGGTGCATTTCCGCCATGTTTGCGCCCCACAGCACAAACGCGTCAGCCTGCTCGATGTCGTCATAGCAGCCCATCGGCTCATCCATACCAAAGGTACGCATAAAGCCAACTACTGCCGACGCCATACAGTGACGCGCGTTCGGGTCGATGTTGTTCGAACGGAAGCCCGCTTTAAACAGCTTGGACGCGGCATAACCTTCCCAGATAGTCCACTGAc < 1:56507/257‑1 (MQ=255) 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AACCCGGATTCTTCGCTGCTTTTTCCAGCGGATGGGTCGGACGTAAACCGTAGCCGATGTCCGTCGCCCCTTTGCGCAGGTTAACGTGCTTGCTGAAGAAGTCCTGATTTATCGCATTGTTTTGAATGATATAGTTGGCGATGTAGTTCAGGATCACCAGGTCAGATTGCGGCGTAAAGATGATGCCGTTATCCGCCAGCTCGAAGCTACGATGCTGGTAGGTAGAAAGCACCGCCACGGTGACGTTCTGGTTAGAGAGACGACGGTTAGTGATGCGGCTCCAGAGGATCGGGTGCATTTCCGCCATGTTTGCGCCCCACAGCACAAACGCGTCAGCCTGCTCGATGTCGTCATAGCAGCCCATCGGCTCATCCATACCAAAGGTACGCATAAAGCCAACTACTGCGCTCGCCATACAGTGACGCGCGTTCGGGTCGATGTTGTTGCTACGGAAGCCCGCTTTAAACAGCTTGGACGCGGCATAACCTTCCCAGATAGTCCACTGACCAGAACCGAACATACCGATGCTTTCCGGCCCTTTTTCTTTCAGGG > CP042583/1873061‑1873612 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |