Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 1,924,599 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 1,924,599 | 0 | A | T | 99.6% | 529.6 / NA | 226 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (98/126); minor base C (1/0); total (100/126) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.40e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.97e-01 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,924,600 | 0 | G | C | 99.1% | 523.3 / NA | 226 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/1); new base C (98/125); total (100/126) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,924,601 | 0 | C | G | 99.6% | 522.0 / NA | 226 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base G (99/126); total (100/126) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.42e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 226 total aligned reads displayed.
CGCGGTGAAAGTTCCGGATGGCACCGTTGATCCATTTCGTCTGACCGCAGCAAACATGCTGGATGCCAAAGAACACGGTGCCGTTATCCTTACCGCTCATGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGAAGCCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCGATATTCTGGTGCCTGGCGATACCATTAGCCTGATTGGTACCACCTCTTTACGTATTGATTACAACGAGATTGACGATAATCGAGTGACGGCAGAAGAGGTTGATATTCTGCTGC‑GTGAAGGGGAAAAACTGGCCCCCGTGATGGCGAAAACGCGCATTTTGCGGGCCTATTCTGGCGTGCGCCCGCTGGTTGCCAGCGATGACGACCCGAG > CP042583/1924322‑1924879 ||| cgcgGTGAAAGTTCCGGATGGCACCGTTGATCCATTTCGTCTGACCGCAGCAAACATGCTGGATGCCAAAGAACACGGTGCCGTTATCCTTACCGCTCATGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATc > 1:708538/1‑289 (MQ=255) tGAAAGTTCCGGATGGCACCGTTGATCCATTTCGTCTGACCGCAGCAAACATGCTGGATGCCAAAGAACACGGTGCCGTTATCCTTACCGCTCATGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGa > 2:1016913/1‑289 (MQ=255) aaGTTCCGGATGGCCCCGTTGATCCATTTCGTCTGACCGCAGCAAACATGCTGGATGCCAAAGAACACGGTGCCGTTATCCTTACCGCTCATGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCa < 2:1403047/289‑1 (MQ=255) aaGTTCCGGATGGCACCGTTGATCCATTTCGTCTGACCGCAGCAAACATGCTGGATGCCAAAGAACACGGTGCCGTTATCCTTACCGCTCATGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCa < 2:1345585/289‑1 (MQ=255) aaGTTCCGACTTGCACCGTTGCTCCATTTCGTCTGTCCGCAGCAACCATGCTTGATGACGAAGAACAGGGTGCCGTTATCCTTGCCGCTCAGGAAGACACGGGGCTGAATCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGTGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATcc < 2:1199849/289‑2 (MQ=255) cGGATGGCACCGTTGATCCATTTCGTCTGACCGCAGCAAACATGCTGGATGCCAAAGAACACGGTGCCGTTATCCTTACCGCTCATGAAGTCACGGGGCTGAGTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCAt < 2:1735382/289‑1 (MQ=255) tGGCACCGTTGATCCATTTCGTCTGACCGCAGCAAACATGCTGGATGCCAAAGAACACGGTGCCGTTATCCTTACCGCTCATGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAAc < 1:799690/289‑1 (MQ=255) ggCACCGTTGATCCATTTCGTCTGACCGCAGCAAACATGCTGGATGCCAAAGAACACGGTGCCGTTATCCTTACCGCTCATGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAAcc < 2:1369443/289‑1 (MQ=255) tccGTTGATCCCATTCGGCAGACCGCAGCAAACAGGCTGGATGGCACAGAACACGGGGCCGTTATCCTTACCGCGCAGGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGGAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACAGTGCCGAATATGCCGATGTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGc < 2:1265051/288‑1 (MQ=255) aCCGTTGATCCATTTCGTCTGACCGCAGCAAACATGCTGGATGCCAAAGAACACGGTGCCGTTATCCTTACCGCTCATGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGc < 1:1149615/289‑1 (MQ=255) gTTGATCCATTTCGTCTGACCGCAGCAAACATGCTGGATGCCAAAGAACACGGTGCCGTTATCCTTACCGCTCATGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCAtg < 2:453840/289‑1 (MQ=255) ttGATCCATTTCGTCTGACCGCAGCAAACATGCTGGATGCCAAAGAACACGGTGCCGTTATCCTTACCGCTCATGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCAtgt > 1:240901/1‑289 (MQ=255) aTTTCGTCTGACCGCAGCAAACATGCTGGATGCCAAAGAACACGGTGCCGTTATCCTTACCGCTCATGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAAc < 1:870189/289‑1 (MQ=255) aCCGCAGCAAACATGCTGGATGCCAAAGAACACGGTGCCGTTATCCTTACCGCTCATGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTa > 1:1538717/1‑289 (MQ=255) aaaCATGCTGGATGCCACAGGACGCGGTGCCGTTATCCTTACCGCTCATGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTATGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTc < 1:1116053/288‑1 (MQ=255) aaagcagggAGGCAAAAGAACACGGTGCCGTTTGCCTTACCGCTCATGAGGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGa < 2:784924/282‑1 (MQ=255) aCATGCTGGATGCCAAAGAACACGGTGCCGTTATCCTTACCGCTCATGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGa < 1:141114/289‑1 (MQ=255) aCATGCTGGATGCCAAAGAACACGGTGCCGTTATCCTTACCGCTCATGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGa < 1:1682822/289‑1 (MQ=255) aCATGCTGGATGCCAAAGAACACGGTGCCGTTATCCTTACCGCTCATGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGa < 1:370267/289‑1 (MQ=255) aCATGCTGGATGCCAAAGAACACGGTGCCGTTATCCTTACCGCTCATGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCACTTCATGCACCTGTCGTGGATAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAACGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTCACTAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTACACCTTCCg > 1:1282428/1‑288 (MQ=255) aTGCTGGATGCCAAAGAACACGGTGCCGTTATCCTTACCGCTCATGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTTCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGACCCTGGATCCCCGCCTGAACCAGCCTGGGACCAAACGCTGTCGTAACCTTTcccag > 2:652046/1‑285 (MQ=255) tGCTGGATGCCAAAGAACACGGTGCCGTTATCCTTACCGCTCATGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGc < 1:849966/289‑1 (MQ=255) tGCTGGATGCCAAAGAACACGGTGCCGTTATCCTTACCGCTCATGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGc < 1:554080/289‑1 (MQ=255) tGCTGGATGCCAAAGAACACGGTGCCGTTATCCTTACCGCTCATGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGc < 1:1634313/289‑1 (MQ=255) tGCTGGATGCACAAGAACACGGTGCCGTTATCCTTACCGCTCATGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGc < 1:1335233/289‑1 (MQ=255) gCTGGATGCCAAAGAACACGGTGCCGTTATCCTTACCGCTCATGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCACCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGc > 2:1518908/1‑288 (MQ=255) cTGGATGCCAAAGAACACGGTGCCGTTATCCTTACCGCTCATGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCCGCTGATCATGGATCACCTCATTAACCACCATTGGACCCACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCg > 2:1012104/1‑289 (MQ=255) cTGGATGCCAAAGAACACGGTGCCGTTATCCTTACCGCTCATGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGAGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCg > 1:1873477/1‑289 (MQ=255) tGGAGGCCAACGAACACGGTGTCGTTCTCCTTACCGCTCATGAAGTACCGGTGCTGATTCCTGAAGGCGCGACGGTCTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCGa < 2:668792/289‑1 (MQ=255) cAAAGAACACGGTGCCGTTATCCGTACCGCTCATGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCGATATTCTg < 2:1829851/289‑1 (MQ=255) acacGGTGCCGGTACCCTTACCGCTCAGGAGGTCACGGGGCTGATTCGGGAAGGCGCGACGGTGTGCGATGTTCGTGTACGTAACCATCTCGCCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGAATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTGCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCGATATTCTGGTGc < 2:1411164/287‑1 (MQ=255) cacGGTGCCGTTATCCTTACCGCTCATGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATTGATCCCCGCATTAACCCGCATGTGATCAACCGCTGCCGGACACCTTCCGACCCCGAGTTTCTGGTGcccg > 2:291057/1‑287 (MQ=255) acGGTGCCGTTATCCTTACCGCTCATGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCGATATTCTGGTGCCTgg < 1:1207787/289‑1 (MQ=255) tGCCGTTATCCTTACCGCTCATGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCATTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCGATATTCTGGTGCCTGGCGAt > 2:1941057/1‑289 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |