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Only 100 of 205 total aligned reads displayed.
GAAAAACTGGCCCCCGTGATGGCGAAAACGCGCATTTTGCGGGCCTATTCTGGCGTGCGCCCGCTGGTTGCCAGCGATGACGACCCGAGCGGACGTAACGTCAGCCGTGGCATCGTGCTGCTCGACCATGCTGAACGCGATGGTCTGGACGGATTTATCACCATCACCGGTGGCAAACTGATGACCTATCGGCTGATGGCTGAATGGGCTACCGACGCGGTATGCCGCAAACTGGGCAACACGCGCCCCTGTACGACTGCCGATCTGGCACTGCCTGGTAGTCAAGAACCCGCTGAAGTTACCTTGCGTAAAGTCATCTCCCTGCCTGCCCCGCTGCGCGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCTGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTATGTGAGTGCGAAGCGGTAACTGCGGGTGAAGTGCAGTACGCGGTAGAAAATTTAAACGTTAATAGCCTGCTGGATTTACGCCGTCGTACCCGTGTGGGGATGGGCACCTGCCAGGGCGAACTCTGCGCCTGCCGCGCTGCCGGACT > CP042583/1924791‑1925350 ||| aaaaaCTGGCCCCCGTGATGGCGAAAACGCGCATTTTGCGGGCCTATTCTGGCGTGCGCCCGCTGGTTGCCAGCGATGACGACCCGAGCGGACGTAACGTCAGCCGTGGCATCGTGCTGCTCGACCATGCTGAACGCGATGGTCTGGACGGATTTATCACCATCACCGGTGGCAAACTGATGACCTATCGGCTGATGGCTGAATGGGCTACCGACGCGGTATGCCGCAAACTGGGCAACACGCGCCCCTGTACGACTGCCGATCTGGCACTGCCTGGTTCACAAGAAc > 1:271017/1‑288 (MQ=255) 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tCTGGCACTGCCTGGTTCACAAGAACCCGCTGAAGTTACCTTGCGTAAAGTCATCTCCCTGCCTGCCCCGCTGCGCGGTTCTGCGTTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCTGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTATGTGAGTGCGAAGCGGTAACTGCGGGTGAAGTGCAGTACGCGGTAGAAAATTTAAACGTTAATAGCCTGCTGGATTTACGCCGTCGTACCCGTGTGGGGATGGGCACCTGCCAGGGCGAACTCTGCGCCTGCcg < 1:1312446/285‑1 (MQ=255) aCTGCCTGGTTCACAAGAACCCGCTGAAGTTACCTTGCGTAAAGTCATCTCCCTGCCTGCCCCGCTGCGCGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCTGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTATGTGAGTGCGAAGCGGTAACTGCGGGTGAAGTGCAGTACGCGGTAGAAAATTTAAACGTTAATAGCCTGCTGGATTTACGCCGTCGTACCCGTGTGGGGATGGGCACCTGCCAGGGCGAACTCTGCGCCTACCGCGCGGCCgg > 1:832406/1‑288 (MQ=255) gCCTGGTTCACAAGAACCCGCTGAAGTTACCTTGCGTAAAGTCATCTCCCTGCCTGCCCCGCTGCGCGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCTGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTATGTGAGTGCGAAGCGGTAACTGCGGGTGAAGTGCAGTACGCGGTAGAAAATTTAAACGTTAATAGCCTGCTGGATTTACGCCGTCGTACCCGTGTGGGGATGGGCACCTGCCAGGGCGAACTCTGCGCCTGCCGCGCTGCCGGAct > 2:880453/1‑288 (MQ=255) ||| GAAAAACTGGCCCCCGTGATGGCGAAAACGCGCATTTTGCGGGCCTATTCTGGCGTGCGCCCGCTGGTTGCCAGCGATGACGACCCGAGCGGACGTAACGTCAGCCGTGGCATCGTGCTGCTCGACCATGCTGAACGCGATGGTCTGGACGGATTTATCACCATCACCGGTGGCAAACTGATGACCTATCGGCTGATGGCTGAATGGGCTACCGACGCGGTATGCCGCAAACTGGGCAACACGCGCCCCTGTACGACTGCCGATCTGGCACTGCCTGGTAGTCAAGAACCCGCTGAAGTTACCTTGCGTAAAGTCATCTCCCTGCCTGCCCCGCTGCGCGGTTCTGCGGTTTATCGTCATGGCGATCGCACGCCTGCCTGGCTGAGCGAAGGCCGTCTGCACCGTAGCCTGGTATGTGAGTGCGAAGCGGTAACTGCGGGTGAAGTGCAGTACGCGGTAGAAAATTTAAACGTTAATAGCCTGCTGGATTTACGCCGTCGTACCCGTGTGGGGATGGGCACCTGCCAGGGCGAACTCTGCGCCTGCCGCGCTGCCGGACT > CP042583/1924791‑1925350 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |