| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP042583 | 537,986 | 3 bp→CGA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP042583 | 537,986 | 0 | G | C | 98.8% | 559.2 / NA | 245 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/3); new base C (125/116); total (125/120) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.14e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| * | CP042583 | 537,987 | 0 | C | G | 99.2% | 553.0 / NA | 245 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (2/0); new base G (121/120); total (125/120) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.98e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| * | CP042583 | 537,988 | 0 | T | A | 97.9% | 529.4 / NA | 245 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base A (119/117); minor base G (3/2); total (125/120) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 245 total aligned reads displayed.
CTGCTTTACGTTACTGCGCGGTAGTAATAAAACTCTGTAATTGGGCTTCGGTTTGCAAACGTTGCTGCAAGGTACTGGCTTCGGCTTTGCTGGCGAATGGGCCAAGCTGGATCCGCCAGACCGCGCCATTTTGAGTTACGCGACCGGGGACGCCGAACTTCTGTCCCAGTTGCTGTTGGTACTGTTGCGCACGAGCCTGATCGCTTACGGCCCCGACTTGCACCATAAAGTTGCCGCTGGCGCTTTGGCTGACGGCTTGCGGTGTCACCATTGCAGGGCTGGTTGCAGGCGTTGT‑GC‑TCGGAGCTGTAACAACGGGCTGTGGCGCAGGCGTCGGTTCGCTGCCTTCCAGTACACCAGGCGCTAAGGTCGTTGGTGCGCCGAGGAAACCGCTACTGGTTACCGGCGCGCCGGTCGGATCTTCGCTTTTTAGCGTGCTATTACTGACCGGAAGAATGTCACCCTGCGGGCCAGACACACTACTTGTTCCCGCGCCACCGCTTAAATCGGGAGGTGCAGGCAGGGCGTAAGTCTGTTTGGCGACTGTGGTACAAGCCATACC > CP042583/537709‑538267 ||| cTGTTTTACGCTACTGGGCGGTAGTAATAAATGACTGGAATTGGGCTTCGGTTTGCAAACGTTGCTGAAAGGTACTGGCTTCGGCTTTGCTGGCGAATGGGCCAAGCTGGATCCGCCAGACCGCGCCATTTTGAGTTACGCGACCGGGGACGCCGAACTTCTGTCCCAGTTGCTGTTGGTACTGTTGCGCACGAGCCTGATCGCTTACGGCCCCGACTTGCACCATAAAGTTGCCGCTGGCGCTTTGCGAGACGGCTTGCGGTGTCACCATTGCAGGCGAGGTTGCAg < 2:1513121/288‑1 (MQ=255) tGCTTTACGCTACTGCGCGGTAGTAATAAATGACTGTAATTGGGCTTCGGTTTGCAAACGTTGCTGCAAGGTACTGGCTTCGGCTTTGCTGGCGAATGGGCCAAGCTGGATCCGCCAGACCGCGCCATTTTGAGTTACGCGACCGGGGACGCCGAACTTCTGTCCCAGTTGCTGTTGGTACTGTTGCGCACGAGCCTGATCGCTTACGGCCCCGACTTGCACCATAAAGTTGCCGCTGGCGCTTTGCGAGACGGCTTGCGGTGTCACCATTGCAGGCGAGGTTGCAGGc > 1:1125465/1‑289 (MQ=255) gctACTGCGCGGTAGTAATAAATGACTGTAATTGGGCTTCGGTTTGCAAACGTTGCTGCAAGGTACTGGCTTCGGCTTTGCTGGCGAATGGGCCAAGCTGGATCCGCCAGACCGCGCCATTTTGAGTTACGCGACCGGGGACGCCGAACTTCTGTCCCAGTTGCTGTTGGTACTGTTGCGCACGAGCCTGATCGCTTACGGCCCCGACTTGCACCATAAAGTTGCCGCTGGCGCTTTGCGAGACGGCTTGCGGTGTCACCATTGCAGGCGAGGTTGCAGGCGTtgtcga < 1:1705137/287‑4 (MQ=255) ctACTGGGCGGTAGGAATAAAGGACGGTAATTGGGCTTCGGTTGGCAAACGTTGCTGCAAGGTACTGGCTTCGGCGTTGCTGGCGAAGGGGCCAAGCTGGATCCGCCAGACCGCGCCATTTTGAGTTACGCGACCGGGGACGCCGAACTTCTGTCCCAGTTGCTGTTGGTACTGTTGCGCACGAGCCTGATCGCTTACGGCCCCGACTTGCACCATAAAGTTGCCGCTGGCGCTTTGCGAGACGGCTTGCGGTGTCACCATTGCAGGCGAGGTTGCAGGCGTtgtcga < 2:1005953/287‑4 (MQ=255) ctACTGCGCGGTAGTAATAAATGACTGTAATTGGGCTTCGGTTTGCAAACGTTGCTGCAAGGTACTGGCTTCGGCTTTGCTGGCGAATGGGCCAAGCTGGATCCGCCAGACCGCGCCATTTTGAGTTACGCGACCGGGGACGCCGAACTTCTGTCCCAGTTGCTGTTGGTACTGTTGCGCACGAGCCTGATCGCTTACGGCCCCGACTTGCACCATAAAGTTGCCGCTGGCGCTTTGCGAGACGGCTTGCGGTGTCACCATTGCAGGCGAGGTTGCAGGCGTtgtcga < 2:1125465/287‑4 (MQ=255) tACTGCGCGGTAGTAATAAATGACTGTAATTGGGCTTCGGTTTGCAAACGTTGCTGCAAGGTACTGGCTTCGGCTTTGCTGGCGAATGGGCCAAGCTGGATCCGCCAGACCGCGCCATTTTGAGTTACGCGACCGGGGACGCCGAACTTCTGTCCCAGTTGCTGTTGGTACTGTTGCGCACGAGCCTGATCGCTTACGGCCCCGACTTGCACCATAAAGTTGCCGCTGGCGCTTTGCGAGACGGCTTGCGGTGTCACCATTGCAGGCGAGGTTGCAGGCGTtgtcgac < 1:1756988/288‑5 (MQ=255) aCTGCGCGGTAGTAATAAATGACTGTAATTGGGCTTCGGTTTGCAAACGTTGCTGCAAGGTACTGGCTTCGGCTTTGCTGGCGAATGGGCCAAGCTGGATCCGCCAGACCGCGCCATTTTGAGTTACGCGTCCGGGGACGCCGAACTTCTGTCCCAGTTGCTGTTGGTACTGTTGCGCACGAGCCTGATCGCTTACGGCCCCGACTTGCACCATAAAGTTGCCGCTGGCGCTTTGCGAGACGGCTTGCGGTGTCACCATTGCAGGCGAGGTTGCAGGCGTtgtcgacgg < 1:510374/289‑7 (MQ=255) ctcggcgTTATTAATAAATGACTGTAATTGGGCTTCGGTTTGCAAACGTTGCTGCAAGGTACTGGCTTCGGCTTTGCTGGCGAATGGGCCAAGCTGGATCCGCCAGACCGCGCCATTTTGAGTTACGCGACCGGGGACGCCGAACTTCTGTCCCAGTTGCTGTTGGTACTGTTGCGCACGAGCCTGATCGCTTACGGCCCCGACTTGCACCATAAAGTTGCCGCTGGCGCTTTGCGAGACGGCTTGCGGTGTCACCATTGCAGGCGAGGTTGCAGGCGTtgtcgacgga < 1:9477/285‑8 (MQ=255) cgcgGTAGTAATAAATGACTGTAATTGGGCTTCGGTTTGCAAACGTTGCTGCAAGGTACTGGCTTCGGCTTTGCTGGCGAATGGGCCAAGCTGGATCCGCCAGACCGCGCCATTTTGAGTTACGCGACCGGGGACGCCGAACTTCTGTCCCAGTTGCTGTTGGTACTGTTGCGCACGAGCCTGATCGCTTACGGCCCCGACTTGCACCATAAAGTTGCCGCTGGCGCTTTGCGCGACGGCTTGCGGTGTCCCCATTGCAGTCGAGGTTGCAGGCGTtgtcgacggaggc > 2:761830/1‑279 (MQ=255) cgGTAGTAATAAATGACTGTAATTGGGCTTCGGTTTGCAAACGTTGCTGCAAGGTACTGGCTTCGGCTTTGCTGGCGAATGGGCCAAGCTGGATCCGCCAGACCGCGCCATTTTGAGTTACGCGACCGGGGACGCCGAACTTCTGTCCCAGTTGCTGTTGGTACTGTTGCGCACGAGCCTGATCGCTTACGGCCCCGACTTGCACCATAAAGTTGCCGCTGGCGCTTTGCGAGACGGCTTGCGGTGTCACCATTGCAGGCGAGGTTGCAGGCGTTGT‑CG‑ACGGAGCTg < 1:1267189/288‑1 (MQ=255) agtaATAAATGACTGTAATTGGGCTTCGGTTTGCAAACGTTGCTGCAAGGTACTGGCTTCGGCTTTGCTGGCGAATGGGCCAAGCTGGATCCGCCAGACCGCGCCATTTTGAGTTACGCGACCGGGGACGCCGAACTTCTGTCCCAGTTGCTGTTGGTACTGTTGCGCACGAGCCTGATCGCTTACGGCCCCGACTTGCACCATAAAGTTGCCGCTGGCGCTTTGCGAGACGGCTTGCGGTGTCACCATTGCAGGCGAGGTTGCAGGCGTTGT‑CG‑ACGGAGCTGTaaca < 1:478837/289‑1 (MQ=255) aataaatgactGTAATTGGGCTTCGGTTTGCAAACGTTGCTGCAAGGTACTGGCTTCGGCTTTGCTGGCGAATGGGCCAAGCTGGATCCGCCAGACCGCGCCATTTTGAGTTACGCGACCGGGGACGCCGAACTTCTGTCCCAGTTGCTGTTGGTACTGTTGCGCACGAGCCTGATCGCTTACGGCCCCGACTTGCACCATAAAGTTGCCGCTGGCGCTTTGCGAGACGGCTTGCGGTGTCACCATTGCAGGCGAGGTTGCAGGCGTTGT‑CG‑ACGGAGCTGTAACAACg < 1:970970/280‑1 (MQ=255) tgactGTAATTGGGCTTCGGTTTGCAAACGTTGCTGCACGGTACTGGCTTCGGCTTTGCTGGCGAATGGGCCAAGCTGGATCCGCCAGACCGCGCCATTTTGAGTTACGCGACCGGGGACGCCGAACTCCTGTCCCAGTTGCTGTTGGTACTGTTGCGCACGAGCCTGATCGCTTACGCCCCCGACTTGCCCCATAAAGTTGCCGCTGGCGCTTTCCGCGACGCCTCGCTGTGTCACCATTGCCGGCGCGGTTGCAGTCGTTGT‑GG‑CGGGAGCTGTAACAACTGGCcgt > 2:1524749/4‑289 (MQ=255) tgactGTAATTGGGCTTCGGTTTGCAAACGTTGCTGCAAGGTACTGGCTTCGGCTTTGCTGGCGAATGGGCCAAGCTGGATCCGCCAGACCGCGCCATTTTGAGTTACGCGACCGGGGACGCCGAACTTCTGTCCCAGTTGCTGTTGGTACTGTTGCTCACGAGCCTGATCGCTTACGGCCCCGACTTGCACCATAAAGTTGCCGCTTGCGCTTTGCGAGACCGCTTGCGGTTTCACCATTGCAGGCGCGGTTGCAGGCGTTGT‑CG‑ACGGAGCTGTAACACCGGGCtgg > 2:1653847/4‑288 (MQ=255) tgactGTAATTGGGCTTCGGTTTGCAAACGTTGCTGCAAGGTACTGGCTTCGGCTTTGCTGGCGAATGGGCCAAGCTGGATCCGCCAGACCGCGCCATTTTGAGTTACGCGACCGGGGACGCCGAACTTCTGTCCCAGTTGCTGTTGGTACTGTTGCGCACGAGCCTGATCGCTTACGGCCCCGACTTTCACCATAAAGTTGCCGCCGGCGCTTTGCGAGACGGCTTGCGGTGTCACCACTGCATGCCAGGTTTCAGGCGTTGTCGC‑TC‑GAGCTGTTACCACCGGCcgt > 2:1916265/4‑289 (MQ=255) tgactGTAATTGGGCTTCGGTTTGCAAACGTTGCTGCAAGGTACTGGCTTCGGCTTTGCTGGCGAATGGGCCAAGCTGGATCCGCCAGACCGCGCCATTTTGAGTTACGCGACCGGGGACGCCGAACTTCTGTCCCAGTTGCTGTTGGTACTGTTGCGCACGAGCCTGATCGCTTACGGCCCCGACTTGCACCATAAAGTTGCCGCTGGCGCTTTGCGAGACGGCTTGCGGTGTCACCATTGCAGGCGAGGTTGCAGGCGTTGT‑CG‑ACGGAGCTGTAACAACGGGCtgt > 1:1918133/4‑289 (MQ=255) ctGTAATTGGGCTTCGGTTTGCAAACGTTGCTGCAAGGTACTGGCTTCGGCTTTGCTGGCGAATGGGCCAAGCTGGATCCGCCAGACCGCGCCATTTTGAGTTACGCGACCGGGGACGCCGAACTTCTGTCCCAGTTGCTGTTGGTACTGTTGCGCACGAGCCTGATCGCTTACGGCCCCGACTTGCACCATAAAGTTGCCGCTGGCGCTTTGCGAGACGGCTTGCGGTGTCACCATTGCAGGCGAGGTTGGAGGCGTTGT‑CG‑ACGGAGGTGTaactgtcgctgattaa > 1:310609/1‑276 (MQ=255) tGTAATTGGGCTTCGGTTTGCAAACGTTGCTGCAAGGTACTGGCTTCGGCTTTGCTGGCGAATGGGCCAAGCTGGATCCGCCAGACCGCGCCATTTTGAGTTACGCGACCGGGGACGCCGAACTTCTGTCCCAGTTGCTGTTGGTACTGTTGCGCACGAGCCTGATCGCTTACGGCCCCGACTTGCACCATAAAGTTGCCGCTGGCGCTTTGCGAGACGGCTTGCGGTGTCACCATTGCAGGCGAGGTTGCAGGCGTTGT‑CG‑ACGGAGCTGTAACAACGGGCTGTGgc > 1:382098/1‑288 (MQ=255) tAATTGGGCTTCGGTTTGCAAACGTTGCTGCAAGGTACTGGCTTCGGCTTTGCTGGCGAATGGGCCAAGCTGGATCCGCCAGACCGCGCCATTTTGAGTTACGCGACCGGGGACGCCGAACTTCTGTCCCAGTTGCTGTTGGTACTGTTGCGCACGAGCCTGATTGCTTACGGCCCCGACTTGCACCATAAAGTTGCCGCTGGCGCTTTGCGAGACGGCTTGCGGTGTCACCATTGCAGGCGAGGTTGCAGGCGTTGT‑CG‑ACGGAGCTGTAACCACGGGGtggtgggca > 2:107778/1‑282 (MQ=255) gggCTTCGGTTTGCAAACGTTGCTGCAAGGTACTGGCTTCGGCTTTGCTGGCGAATGGGCCAAGCTGGATCCGCCAGACCGCGCCATTTTGAGTTACGCGACCGGGGACGCCGAACTTCTGTCCCAGTTGCTGTTGGTACTGTTGCGCACGAGCCTGATCGCTTACGGCCCCGACTTGCACCATAAAGTTGCCGCTGGCGCTTTGCGAGACGGCTTGCGGTGTCACCATTGCAGGCGAGGTTGCAGGCGTTGT‑CG‑ACGGAGCTGTAACAACGGGCTGTGGCGCAGGCg > 1:1569873/1‑288 (MQ=255) cGGTTTGCAAACGTTGCTGCAAGGTACTGGCTTCGGCTTTGCTGGCGAATGGGCCAAGCTGGATCCGCCAGACCGCGCCATTTTGAGTTACGCGACCGGGGACGCCGAACTTCTGTCCCAGTTGCTGTTGGTACTGTTGCGCACGAGCCTGATCGCTTACGGCCCCGACTTGCACCATAAAGTTGCCGCTGGCGCTTTGCGAGACGGCTTGCGGTGTCACCATTTCAGGCGAGGTTGCAGGCGTTGT‑CG‑ACGGAGCTGTAACAACGGGCTGTGGCGCAGGCGTCGGTTc > 1:618083/1‑289 (MQ=255) gTTTGCAAACGTTGCTGCAAGGTACTGGCTTCGGCTTTGCTGGCGAATGGGCCAAGCTGGATCCGCCAGACCGCGCCATTTTGAGTTACGCGACCGGGGACGCCGAACTTCTGTCCCAGTTGCTGTTGGTACTGTTGCGCACGAGCCTGATCGCTTACGGCCCCGACTTGCACCATAAAGTTGCCGCTGGCGCTTTGCGAGACGGCTTGCGGTGTCACCATTGCAGGCGAGGTTGCAGGCGTTGT‑CG‑ACGGAGCTGTAACAACGGGCTGTGGCGCAGGCGTCGGTTCg < 1:1082080/288‑1 (MQ=255) 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aaaCGTTGCTGCAAGGTACTGGCTTCGGCTTTGCTGGCGAATGGGCCAAGCTGGATCCGCCAGACCGCGCCATTTTGAGTTACGCGACCGGGGACGCCGAACTTCTGTCCCAGTTGCTGTTGGTACTGTTGCGCACGAGCCTGATCGCTTACGGCCCCGACTTGCACCATAAAGTTGCCGCTGGCGCTTTGCGAGACGGCTTGCGGTGTCACCATTGCAGGCGAGGTTGCAGGCGTTGT‑CG‑ACGGAGCTGTAACAACGGGCTGTGGCGCAGGCGTCGGTTCGCTGCCt < 1:516862/288‑1 (MQ=255) ttGCTGCAAGGTACTGGCTTCGGCTTTGCTGGCGAATGGGCCAAGCTGGATCCGCCAGACCGCGCCATTTTGAGTTACGCGACCGGGGACGCCGAACTTCTGTCCCAGTTGCTGTTGGTACTGTTGCGCACGAGCCTGATCGCTTACGGCCCCGACTTGCACCATAAAGTTGCCGCTGGCGCTTTGCGAGACGGCTTGCGGTGTCACCATTGCAGGCGAGGTTGCAGGCGTTGT‑CG‑ACGGAGCTGTAACAACGGGCTGTGGCGCAGGCGTCGGTTCGCTGCCTTCCAGt > 1:1937224/1‑289 (MQ=255) gctgcAAGGTACTGGCTTCGGCTTTGCTGGCGAATGGGCCAAGCTGGATCCGCCAGACCGCGCCATTTTGAGTTACGCGACCGGGGACGCCGAACTTCTGTCCCAGTTGCTGTTGGTACTGTTGCGCACGAGCCTGATCGCTTACGGCCCCGACTTGCACCATAAAGTTGCCGCTGGCGCTTTGCGAGACGGCTTGCGGTGTCACCATTGCAGGCGAGGTTGCAGGCGTTTT‑CG‑ACGGAGCTGTAACAACGGGAGGTGGCGCAGGCGTGCGGTCGCTGCCTTCCCGTaa > 2:613718/1‑288 (MQ=255) 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aaGGTACTGGCTTCGGCGTTGCTGGCGAATGGGCCAAGCTGGATCCGCCAGACCGCGCCATTTTGAGTTACGCGACCGGGGACGCCGAACTTCTGTCCCAGTTGCTGTTGGTACTGTTGCGAACGAGCCTGATCGCTTACGGCCCCGACTTGCACCATAAAGTTGCCGCTGGCGCTTTGCGAGACGGCTTGCGGTGTCACCATTGCAGGCGAGGTTGCAGGCGTTGT‑CG‑ACGGAGCTGTAACAACGGGCTGTGGCGCAGGCGTCGGTTCGCTGCCTTCCAGTACACCa < 2:1063342/288‑1 (MQ=255) ggTACTGGCTTCGGCTTTGCTGGCGAATGGGCCAAGCTGGATCCGCCAGACCGCGCCATTTTGAGTTACGCGACCGGGGACGCCGAACTTCTGTCCCAGTTGCTGTTGGTACTGTTGCGCACGAGCCTGATCGCTTAAGGCCCCGACTTGCACCATAAAGTTGCCGCTGGCGCTTTGCGAGACGGCTTGCGGTGTCACCATTTCAGGCGAGGTTGCAGGCGTTGT‑CG‑ACGGTGCTGTAACAACGGGCTGTGGCGCAGGCGTCGGTTCGCTGCCCTCCAGTGAACCAAgc > 1:1797789/1‑289 (MQ=255) tACTGGCTTCGGCTTTGCTGGCGAATGGGCCAAGCTGGATCCGCCAGACCGCGCCATTTTGAGTTACGCGAACGGGGACGCCGAACTTCTGTCCCAGTTGCTGTTGGTACTGTTGCGCACGAGCCTGATCGCTTACGGCCCCGACTTGCACCATAAAGTTGCCGCTGGCGCTTTGCGAGACGGCTTGCGGTGTCACCATTGCAGGCGAGGTTGCAGGCGTTGT‑CG‑ACGGAGCTGTAACAACGGGCTGTGGCGCAGGCGTCGGTTCGCTGCCTTCCAGTACACCAGgcg < 1:367731/288‑1 (MQ=255) 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cTTGCGGTGTCACCATTGCAGGCGAGGTTGCAGGCGTTGT‑CG‑ACGGAGCTGTAACAACGGGCTGTGGCGCAGGCGTCGGTTCGCTGCCTTCCAGTACACCAGGCGCTAAGGTCGTTGGTGCGCCGAGGAAACCGCTACTGGTTACCGGCGCGCCGGTCGGATCTTCGCGTTTTAGCGTCGAATTACTGACCGGAAGAATTTCACCCTGCGGGCCAGACACTGAACTTGTTCCCCCCCCACCGCGTAATCCGGGAGGTGGAGGCCGGGCGTATGTTCGTTTGGCCGCtgt > 2:274652/1‑289 (MQ=255) cTTGCGGTGTCACCATTGCAGGCGAGGTTGCAGGCGTTGT‑CG‑ACGGAGCTGTAACAACGGGCTGTGGCGCAGGCGTCGGTTCGCTGCCTTCCAGTACACCAGGCGCTAAAGTCGTTGGTGCGCCGAGGAAACCGCTACTGGTTACCGGCGCGCCGGTCGGATCTTCGCTTTTTAGCGTCGAATTACTGACCGGAGGAATGTCAACCTGCGGGCCAGACACTGAACTTGTTTCAGCGCCACCGCTTAAATAGGGAGGTGCAGGGCGGGCTTAATGCTGTTTGGCGACggt > 1:1594385/1‑289 (MQ=255) ggTGTCACCATTGCAGGCGAGGTTGCAGGCGTTGT‑CG‑ACGGAGCTGTAACAACGGGCTGTGGCGCAGGCGTCGGTTCGCTGCCTTCCAGTACACCAGGCGCTAAGGTCGTTGGTGCGCCGAGGAAACCGCTACTGGTTACCGGCGCGCCGGTCGGATCTTCGCTTTTTAGCGTCGAATTACTGACCGGAAGAATGTCACCCTGCGGGCCAGACACTGAACTTGTTCCCGCGCCACCGCTTAAATCGGGAGGTGCAGGCAGGGCGTAAGTCTGTTTGGCGACTGTGGTa < 1:1524749/288‑1 (MQ=255) cACCATTGCAGGCGAGGTTGCAGGCGTTGT‑CG‑ACGGAGCTGTAACAACGGGCTGTGGCGCAGGCGTCGGTTCGCTGCCTTCCAGTACACCAGGCGCTAAGGTCGTTGGTGCGCCGAGGAAACCGCTACTGGTTACCGGCGCGCCGGTCGGATCTTCGCTTTTTAGCGTCGAATTACTGACCGGAAGAATGTCACCCTGCGGGCCAGACACTGAACTTGTTCCCGCGCCACCGCTTAAATCGGGAGGTGCAGGCAGGGCGTAAGTCTGTTTGGCGACTGTGGTACAAGc < 2:534838/288‑1 (MQ=255) ttGCAGGCGAGGTTGCAGGCGTTGT‑CG‑ACGGAGCTGTAACAACGGGCTGTGGCGCAGGCGTCGGTTCGCTGCCTTCCAGTACACCAGGCGCTAAGGTCGTTGGTGCGCCGAGGAAACCGCTACTGGTTACCGGCGCGCCGGTCGGATCTTCGCTTTTTAGCGTCGAATTACTGACCGGAAGAATGTCACCCTGCGGGCCAGACACTGAACTTGTTCCCGCGCCACCGCTTAAATCGGGAGGTGCAGGCAGGGCGTAAGTCTGTTTGGCGACTGTGGTACAAGCCATAcc > 2:181560/1‑289 (MQ=255) ||| CTGCTTTACGTTACTGCGCGGTAGTAATAAAACTCTGTAATTGGGCTTCGGTTTGCAAACGTTGCTGCAAGGTACTGGCTTCGGCTTTGCTGGCGAATGGGCCAAGCTGGATCCGCCAGACCGCGCCATTTTGAGTTACGCGACCGGGGACGCCGAACTTCTGTCCCAGTTGCTGTTGGTACTGTTGCGCACGAGCCTGATCGCTTACGGCCCCGACTTGCACCATAAAGTTGCCGCTGGCGCTTTGGCTGACGGCTTGCGGTGTCACCATTGCAGGGCTGGTTGCAGGCGTTGT‑GC‑TCGGAGCTGTAACAACGGGCTGTGGCGCAGGCGTCGGTTCGCTGCCTTCCAGTACACCAGGCGCTAAGGTCGTTGGTGCGCCGAGGAAACCGCTACTGGTTACCGGCGCGCCGGTCGGATCTTCGCTTTTTAGCGTGCTATTACTGACCGGAAGAATGTCACCCTGCGGGCCAGACACACTACTTGTTCCCGCGCCACCGCTTAAATCGGGAGGTGCAGGCAGGGCGTAAGTCTGTTTGGCGACTGTGGTACAAGCCATACC > CP042583/537709‑538267 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |