| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP042583 | 1,954,424 | 3 bp→TCA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP042583 | 1,954,424 | 0 | A | T | 99.6% | 606.7 / ‑4.9 | 253 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (104/148); minor base . (0/1); total (104/149) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| * | CP042583 | 1,954,425 | 0 | G | C | 100.0% | 601.4 / NA | 253 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base C (104/149); total (104/149) | |||||||||||
| * | CP042583 | 1,954,426 | 0 | T | A | 100.0% | 605.3 / NA | 253 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base A (104/149); total (104/149) | |||||||||||
Only 100 of 253 total aligned reads displayed.
ATAATATTGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTAAGCATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAAAGTCATGATAGTGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTAGCAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCT‑GAAAAACAG‑AGCCTTAGTAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCAGAAGATCGCCGCTAATGCAAAAAATACTCAAGTCAATTATCCTACTGGTCTCTACGTCCCCTACTCCACCAGAACTCACCTGGAAGACGCTCTCAATGAAAATATTAAGAGCGATCCAAGTTGGCCGAATGAAGTCCAGTTATTCCCCATAAATACTGGCGGACACT > CP042583/1954152‑1954694 ||| taataTTGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCT‑GAAAAACAG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAat < 2:1293007/289‑1 (MQ=255) tatTGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCT‑GAAAAACAG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAatgat < 1:8275/289‑1 (MQ=255) tatTGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCT‑GAAAAACAG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAatgat < 2:270328/289‑1 (MQ=255) tttcGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCT‑GAAAAACAG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAAtgatga < 1:472986/286‑1 (MQ=255) ttGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCT‑GAAAAACAG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAAtgatga < 1:246039/289‑1 (MQ=255) cGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCT‑GAAAAACAG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGaa > 2:82819/1‑289 (MQ=255) ttAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCT‑GAAAAACAG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGaata > 1:1386057/1‑289 (MQ=255) ttAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAACTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTAAATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCT‑GAAAAACAG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGaata < 2:252833/289‑1 (MQ=255) ggTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCT‑GAAAAACAG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAatgat < 2:1921048/279‑1 (MQ=255) ggTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCT‑GAAAAACAG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAatgat > 1:1921048/1‑279 (MQ=255) ggTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCT‑GAAAAACAG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATg > 2:750529/1‑289 (MQ=255) tATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACACCAACAAATTAGACCCTATCGATTATCCGAATTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCT‑GAAAAACAT‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGaa < 1:729377/288‑1 (MQ=255) tGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCT‑GAAAAACAG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAAtgatga > 2:735362/1‑276 (MQ=255) tGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCT‑GAAAAACAG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTg > 2:764463/1‑289 (MQ=255) ggAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCT‑GAAAAACAG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTAc > 2:1695638/1‑289 (MQ=255) aagaagCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCT‑GAAAAACAG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACaaa < 1:1120553/289‑1 (MQ=255) tACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCT‑GAAAAACAG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAAtgatga < 1:1692394/242‑1 (MQ=255) tACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCT‑GAAAAACAG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAAtgatga > 2:1692394/1‑242 (MQ=255) tatTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCT‑GAAAAACAG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAAtgatga < 2:316266/237‑1 (MQ=255) tatTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCT‑GAAAAACAG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTa > 2:1909504/1‑289 (MQ=255) atTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCT‑GAAAAACAG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTaa > 2:1537698/1‑289 (MQ=255) ttAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCT‑GAAAAACAG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAGTGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACcac > 2:1768623/1‑289 (MQ=255) aGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCT‑GAAAAACAG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAg > 1:1437881/1‑289 (MQ=255) aCCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCT‑GAAAAACAG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATg > 2:187404/1‑289 (MQ=255) caaATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCT‑GAAAAACAG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGc < 1:783529/289‑1 (MQ=255) caaATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCT‑GAAAAACAG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGc < 1:750529/289‑1 (MQ=255) gagaCCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAAGCTGGACCATATCTCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGAAGAAATTCCTCTTATATCT‑GAAAAACAG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTTGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCt < 2:572768/289‑1 (MQ=255) agaCCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCT‑GAAAAACAG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTa > 2:1424862/1‑289 (MQ=255) tatcgaTTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCT‑GAAAAACAG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGt > 1:1923003/6‑254 (MQ=255) tatcgaTTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCT‑GAAAAACAG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGt < 2:1923003/249‑1 (MQ=255) tatcgaTTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCT‑GAAAAACAG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCa > 2:850178/6‑289 (MQ=255) atcgaTTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCT‑GAAAAACAG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGa > 1:1604958/5‑225 (MQ=255) atcgaTTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCT‑GAAAAACAG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGa < 2:1604958/221‑1 (MQ=255) cTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCT‑GAAAAACAG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCAGAAGATCGCCGCTa > 1:994232/1‑289 (MQ=255) tATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCT‑GAAAAACAG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCAGAAGATcgc < 1:951440/282‑1 (MQ=255) tATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCT‑GAAAAACAG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCAGAAGATCGCCGCTAAt < 1:1349421/289‑1 (MQ=255) aTCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCT‑GAAAAACAG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCAGAAGATCGCCGCTAAt > 2:189243/1‑288 (MQ=255) tCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCT‑GAAAAACAG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCAGAAGATCGCCGCTAATGc < 1:516135/289‑1 (MQ=255) cTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCT‑GAAAAACAG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCAGAAGATCGCCGCTAATGCAAAAAAt > 1:435265/1‑287 (MQ=255) ttatttAAAATTCTATTATCTAGCAAGTATCACCACCAACTTCCCCCTCAAATCACATTATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACGATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCT‑GAAAAACAG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAAAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCAGAAGATCGCCGCTAATGCAAAAAATACt < 2:1442035/286‑1 (MQ=255) tttAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCT‑GAAAAACAG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCAGAAGATCGCCGCTAATGCAAAAAATACTCaa < 2:1014955/289‑1 (MQ=255) aaaaTTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCT‑GAAAAACAG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCAGAAGATCGCCGCTAATGCAAAAAATACTCAAGTc < 1:187404/289‑1 (MQ=255) aaTTATATAATCTGGGACCTATCGCAAACAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTAGTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCT‑GAAAAACAG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCAGAAGATCGCCGCTAATGCAAAAAATACTCAAGTCaa < 2:649666/289‑1 (MQ=255) tataATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCT‑GAAAAACAG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCAGAAGATCGCCGCTAATGCAAAAAATACTCaa < 1:561602/279‑1 (MQ=255) tataATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCT‑GAAAAACAG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCAGAAGATCGCCGCTAATGCAAAAAATACTCaa > 2:561602/1‑279 (MQ=255) aaTCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCT‑GAAAAACAG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCAGAAGATCGCCGCTAATGCAAAAAATACTCAAGTCAATTATCCTa < 1:689707/289‑1 (MQ=255) cacaTATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCT‑GAAAAACAG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCAGAAGATCGCAGCTAATGCAAAAAATACTCAAGTCAATTATCCTACTGGtt > 1:1096683/1‑287 (MQ=255) caTATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCT‑GAAAAACAG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCAGAAGATCGCCGCTAATGCAAAAAATACTCAAGTCAATTATCCTACTGGTctct < 1:850178/289‑1 (MQ=255) tatCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACCTGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCT‑GAAAAACAG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCAGAAGATCGCCGCTAATGCAAAAAATACTCAAGTCAATTATCCTACTGGTCTCTAc < 2:1176087/289‑1 (MQ=255) atCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCT‑GAAAAACAG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCAGAAGATCGCCGCTAATGCAAAAAATACTCAAGTCAATTATCCTACTGGTCTCTACg > 2:1813694/1‑289 (MQ=255) atCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCT‑GAAAAACAG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCAGAAGATCGCCGCTAATGCAAAAAATACTCAAGTCAATTATCCTACTGGTCTCTACg > 2:1571861/1‑289 (MQ=255) atCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCT‑GAAAAACAG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCAGAAGATCGCCGCTAATGCAAAAAATACTCAAGTCAATTATCCTACTGGTCTCTACg > 1:843936/1‑289 (MQ=255) atCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCT‑GAAAAACAG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCAGAAGATCGCCGCTAATGCAAAAAATACTCAAGTCAATTATCCTACTGGTCTCTACg > 1:1734369/1‑289 (MQ=255) cGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCT‑GAAAAACAG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCAGAAGATCGCCGCTAATGCAAAAAATACTCAAGTCAATTATCCTACTGGTCTCTACGt > 2:401765/1‑288 (MQ=255) caaccaacTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCT‑GAAAAACAG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAatg < 2:145656/144‑1 (MQ=255) caaccaacTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCT‑GAAAAACAG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCAGAAGATCGCCGCTAATGCAAAAAATACTCAAGTCAATTATCCTACTGGTCTCTACGTcc > 2:1113033/1‑288 (MQ=255) catgattcagatgatCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCT‑GAAAAACAG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCAGAAGATCGCCGCTAATGCAAAAAATACTCAAGTCAATTATCCTACTGGTCTCTACGTCCCCTACTCCACCAGAACTCACCTgg > 2:1286450/10‑289 (MQ=255) atgattcagatgatCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCT‑GAAAAACAG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCAGAAGATCGCCGCTAATGCAAAAAATACTCAAGTCAATTa > 1:917620/9‑244 (MQ=255) atgattcagatgatCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCT‑GAAAAACAG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCAGAAGATCGCCGCTAATGCAAAAAATACTCAAGTCAATTa < 2:917620/236‑1 (MQ=255) atgattcagatgatCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCT‑GAAAAACAG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCAGAAGATCGCCGCTAATGCAAAAAATACTCAAGTCAATTATCCTACTTGTCTCTACGTCCCCTACTCCACAAGAACTCACCTGGa > 1:41626/9‑289 (MQ=255) tcagatgatCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCT‑GAAAAACAG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCAGAAGATCGCCGCTAATGCAAAAAATACTCAAGTCAATTATCCTACTGGTCTCTAc < 1:1007802/252‑1 (MQ=255) tgatCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCT‑GAAAAACAG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCAGAAGATCGCCGCTAATGCAAAAAATACTCAAGTCAATTATCCTACTGGTCTCTACGTCCCCTACTCCACCAGAACTCACCTGGAAGACGct < 1:342769/286‑1 (MQ=255) atCTTCTGTTGAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATTGCTATTATCGGTGATGAAAATCCTCTTATATAT‑GAAAAACAGTTGCCTT‑CAAAGGTGCTTTTAAATGATTGAAATAATTAACTTAGGGATGGTAACAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCAGAAGATCGCCGCTAATGCAAAAAATACTCAAGTCAATTATCCTACTGGTctct < 2:1029199/246‑1 (MQ=255) tctcCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCT‑GAAAAACAG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCAGAAGATCGCCGCTAATGCAAAAAATACTCAAGTCAATTATCCTACTGGTCTCTACGTCCCCTACTCCACCAGAACTCACCTGGAAGACGct > 1:592670/1‑283 (MQ=255) tctcCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCT‑GAAAAACAG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCAGAAGATCGCCGCTAATGCAAAAAATACTCAAGTCAATTATCCTACTGGTCTCTACGTCCCCTACTCCACCAGAACTCACCTGGAAGACGct > 1:1280383/1‑283 (MQ=255) ctcCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCATCTTATATCT‑GAAAAACAG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCAGAAGATCGCCGCTAATGCAAAAAATACTCAAGTCAATTATCCTACTGGTCTCTACGTCCCCTACTCCACCAGAACTCACCTGGAAGACGCTCTCAATg > 2:1516505/1‑289 (MQ=255) ccTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCT‑GAAAAACAG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCAGAAGATCGCCGCTAATGCAAAAAATACTCAAGTCAATTATCCTACTGGTCTCTACGTCCCCTACTCCACCAGAACTCACCTGGAAGACGCTCTCAATGaa < 2:1386057/289‑1 (MQ=255) ccTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCT‑GAAAAACAG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCAGAAGATCGCCGCTAATGCAAAAAATACTCAAGTCAATTATCCTACTGGTCTCTACGTCCCCTACTCCACCAGAACTCACCTGGAAGACGCTCTCAATGaa < 2:535911/289‑1 (MQ=255) cAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCT‑GAAAAACAG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCATTTAACCACAGATGAAATAGCTTCCTATCTTCAGAAGACCGCCGCTAATGCAAAAAATACTCAAGCCAATTATCCTACTGGTCTCTACGTCCCCTa > 1:1029199/1‑246 (MQ=255) cAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCT‑GAAAAACAG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCAGAAGATCGCCGCTAATGCAAAAAATACTCAAGTCAATTATCCTACTGGTCTCTACGTCCCCTACTCCACCAGAACTCACCTGGAAGACGCTCTCAATGAAAATAtt > 1:28399/1‑289 (MQ=255) cAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCT‑GAAAAAAAG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGATTGCTAt > 2:1189127/1‑178 (MQ=255) aaaaaCTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCT‑GAAAAACAG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCAGAAGATCGCCGCTAATGCAAAAAATACTCAAGTCAATTATCCTACTGGTCTCTACGTCCCCTACTCCACCAGaa > 1:1561220/1‑255 (MQ=255) aaaaCTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCT‑GAAAAACAG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCAGAAGATCGCCGCTAATGCAAAAAATACTCAAGTCAATTATCCTACTGGTCTCTACGTCCCCTACTCCACCAGAACTCACCTGGAAGACGCTCTCAATGAAAATATTAag < 2:1734369/289‑1 (MQ=255) aaCTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCT‑GAAAAACAG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCAGAAGATCGCCGCTAATGCAAAAAATACTCAAGTCAATTATCCTACTGGTCTCTACGTCCCCTACTCCACCAGAACTCGCCTGGAAGACGCTCTCAATGAAAATATTAagag < 1:617599/289‑1 (MQ=255) aaCTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCT‑GAAAAACAG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCAGAAGATCGCCGCTAATGCAAAAAATACTCAAGTCAATTATCCTACTGGTCTCTACGTCCCCTACTCCACCAGAACTCACCTGGAAGACGCTCTCAATGAAAATATTAagag < 1:31681/289‑1 (MQ=255) aaCTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCT‑GAAAAACAG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCAGAAGATCGCCGCTAATGCAAAAAATACTCAAGTCAATTATCCTACTGGTCTCTACGTCCCCTACTCCACCAGAACTCACCTGGAAGACGCTCTCAATGAAAATATTAaga > 1:582302/1‑288 (MQ=255) aTTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCT‑GAAAAACAG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCAGAAGATCGCCGCTAATGCAAAAAATACTCAAGTCAATTATCCTACTGGTCTCTACGTCCCCTACTCCACCAGAACTCACCTGGAAGACGCTCTCAATGAAAATATTAAGAGCGAt < 1:1909504/289‑1 (MQ=255) tccccttcgaaaTTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCT‑GAAAAACAG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCAGAAGATCGCCGCTAATGCAAAAAATACTCAAGTCAATTATCCTACTGGTCTCTACGTCCCCTACTCCACCAGAACTCACCTGGAAGACGCTCTCAATGAAAATATTAAGAGCGATCCat < 2:993043/280‑2 (MQ=255) tcgaaaTTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCT‑GAAAAACAG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCAGAAGATCGCCGCTAATGCAAAAAATACTCAAGTCAATTATCCTACTGGTCTCTACGTCCCCTACTCCACCAGAACTCACCTGGAAGACGCTCTCAATGAAAATATTAAGAGCGATCCatcatggc < 1:1431549/286‑8 (MQ=255) ttAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCT‑GAAAACCAG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGATAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCAGAAGATCGCCGCTAATGCAAAAAATACTCAAGTCAATTATCCTACTGGTCTCTACGTCCCCTACTCCACCAGAACTCACCTGGAAGACGCTCTCAATGAAAATATTAAGAGCGATCCATCATGGCCGAATg < 2:1490813/289‑1 (MQ=255) ttAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCT‑GAAAAACAG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCAGAAGATCGCCGCTAATGCAAAAAATACTCAAGTCAATTATCCTACTGGTCTCTACGTCCCCTACTCCACCAGAACTCACCTGGAAGACGCTCTCAATGAAAATATTAAGAGCGATCCATCATGGCCGAATg < 1:1341804/289‑1 (MQ=255) tAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCT‑GAAAAACAG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCAGAAGATCGCCGCTAATGCAAAAAATACTCAAGTCAATTATCCTACTGGTCTCTACGTcccc > 1:1181262/1‑218 (MQ=255) aTGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCT‑GAAAAACAG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCAGAAGATCGCCGCTAATGCAAAAAACACTCAAGTCAATTATCCTACTGGTCTCTACGTCCCCTACTCCACCAGAACTCACCTGGAAGACGCTCTCAATGAAAATATTAAGAGCGATCCATCATGGCCGAATGAAg < 1:1186768/289‑1 (MQ=255) aTGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCT‑GAAAAACAG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTCGCTATCTTCAGAAGATCGCCGCTAATGCAAAAAATACTCAAGTCAATTATCCTACTGGTCTCTACGTCCCCTACTCCACCAGAACTCACCTGGAAGACGCTCTCAATGAAAATATTAAGAGCGATCCATCATGGCCGAATGAAg < 1:193583/289‑1 (MQ=255) tCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCT‑GAAAAACAG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAAtgatga > 2:231507/1‑64 (MQ=255) tCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCT‑GAAAAACAG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAAtgatga < 1:231507/64‑1 (MQ=255) cGGTGATGAAATTCCTCTTATATCT‑GAAAAACAG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCAGAAGATCGCCGCTAATGCAAAAAATACTCAAGTCAATTATCCTACTGGTCTCTACGTCCCCTACTCCACCAGAACTCACCTGGAAGACGCTCTCAATGAAAATATTAAGAGCGATCCATCATGGCCGAATGAAGTCCAGTTATTc < 1:1755149/289‑1 (MQ=255) cGGTGATGAAATTCCTCTTATATCT‑GAAAAACAG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCAGAAGATCGCCGCTAATGCAAAAAATACTCAAGTCAATTATCCTACTGGTCTCTACGTCCCCTACTCCACCAGAACTCACCTGGAAGACGCTCTCAATGAAAATATTAAGAGCGATCCATCATGGCCGAATGAAGTCCAGTTATTc < 1:1286450/289‑1 (MQ=255) aggTGATGAAATTCCTCTTATATCT‑GAAAAACAG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCAGAAGATCGCCGCTAATGCAAAAAATACTCAAGTCAATTATCCTACTGGTCTCTACGTCCCCTACTCCACCAGAACTCACCTGGAAGACGCTCTCAATGAAAATATTAAGAGCGATCCATCATGGCCGAATGAAGTCCAGTTATTc < 1:1495182/288‑1 (MQ=255) gatgaAATTCCTCTTATATCT‑GAAAAACAG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCAGAAGATCGCCGCTAATGCAAAAAATACTCAAGTCAATTATCCTACTGGTCTCTACGTCCCCTACTCCACCAGAACTc > 2:435217/1‑217 (MQ=255) aTTTCTCTTATATCTGGAAAAACAG‑CG‑CTTTCAAAGGTGCGTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCAGAAGATCGCCGCTAATGCAAAAAATACTCAAGTCAATTATCCTACTGGTCTCTACGTCCCCTACTCCACCAGAACTCACCTGGAAGACGCTCTCAATGAAAATATTAAGAGCGATCCATCATGGCCGAATGAAGTCCAGTTATTCCCCATAAATa < 2:589296/289‑1 (MQ=255) aTTCCTCTTATATCT‑GAAAAACAG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCAGAAGATCGCCGCTAATGCAAAAAATACTCAAGTCAATTATCCTACTGGTCTCTACGTCCCCTACTCCACCAGAACTCACCTGGAAGACGCTCTCAATGAAAATATTAAGAGCGATCCATCATGGCCGAATGAAGTCCAGTTATTCCCCATAAATa < 1:1424862/289‑1 (MQ=255) ttATATCT‑GAAAAACAG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCAGAAGATCGCCGCTAATGCAAAAAATACTCAAGTCAATTATCCTACTGGTCTCTACGTCCCCTACTCCACCAGAACTCACCTGGAAGACGCTCTCAATGAAAATATTAAGAGCGATCCATCATGGCCGAATGAAGTCCAGTTATTCCCCATAAATACTGGCgg < 1:189243/289‑1 (MQ=255) tatCT‑GAAAAACGG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTGGCTTCAGAAGATCGCCGCTAATGCAATAAATACTCAAGTCAATTATCCTACTGGTCTCTACGTCCCCTACTCCACCAGAACTCACCTGGAAGACGCTCTCAATGAAAATATTAAGAGCGATCCATCATGGCCGAATTAAGTCCAGTTATTCCCCATAAATACTGGCGGaca < 2:213985/289‑1 (MQ=255) tatCT‑GAAAAACAG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCAGAAGATCGCCGCTAATGCAAAAAATACTCAAGTCAATTATCCTACTGGTCTCTACGTCCCCTACTCCACCAGAACTCACCTGGAAGACGCTCTCAATGAAAATATTAAGAGCGATCCATCATGGCCGAATGAAGTCCAGTTATTCCCCATAAATACTGGCGGaca < 2:612264/289‑1 (MQ=255) tatCT‑GAAAAACAG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCAGAAGATCGCCGCTAATGCAAAAAATACTCAAGTCAATTATCCTACTGGTCTCTACGTCCCCTACTCCACCAGAACTCACCTGGAAGACGCTCTCAATGAAAATATTAAGAGCGATCCATCATGGCCGAATGAAGTCCAGTTATTCCCCATAAATACTGGCGGaca < 1:1810027/289‑1 (MQ=255) tatCT‑GAAAAACAG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCAGAAGATCGCCGCTAATGCAAAAAATACTCAAGTCAATTATCCTACTGGTCTCTACGTCCCCTACTCCACCAGAACTCACCTGGAAGACGCTCTCAATGAAAATATTAAGAGCGATCCATCATGGCCGAATGAAGTCCAGTTATTCCCCATAAATACTGGCGGaca < 2:143130/289‑1 (MQ=255) tatCT‑GAAAAACAG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCAGAAGATCGCCGCTAATGCAAAAAATACTCAAGTCAATTATCCTACTGGTCTCTACGTCCCCTACTCCACCAGAACTCACCTGGAAGACGCTCTCAATGAAAATATTAAGAGCGATCCATCATGGCCGAATGAAGTCCAGTTATTCCCCATAAATACTGGCAGaca < 2:1232439/289‑1 (MQ=255) tatCT‑GAAAAACAG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCAGAAGATCGCCGCTAATGCAAAAAATACTCAAGTCAATTATCCTACTGGTCTCTACGTCCCCTACTCCACCAGAACCCACCTGGAAGACGCTCTCAATGAAAATATTAAGAGCGATCCATCATGGCCGAATGAAGTCCAGTTATTCCCCATAAATACTGGCGGaca < 2:135870/289‑1 (MQ=255) t‑GAAAAACAG‑TCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCAGAAGATCGCCGCTAATGCAAAAAATACTCAAGTCAATTATCCTACTGGTCTCTACGTCCCCTACTCCACCAGAACTCACCTGGAAGACGCTCTCAATGAAAATATTAAGAGCGATCCATCATGGCCGAATGAAGTCCAGTTATTCCCCATAAATACTGGCGGacac > 1:1535387/1‑286 (MQ=255) ||| ATAATATTGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTAAGCATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAAAGTCATGATAGTGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTAGCAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCT‑GAAAAACAG‑AGCCTTAGTAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCTATCTTCAGAAGATCGCCGCTAATGCAAAAAATACTCAAGTCAATTATCCTACTGGTCTCTACGTCCCCTACTCCACCAGAACTCACCTGGAAGACGCTCTCAATGAAAATATTAAGAGCGATCCAAGTTGGCCGAATGAAGTCCAGTTATTCCCCATAAATACTGGCGGACACT > CP042583/1954152‑1954694 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |