| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | CP042583 | 605,373 | 3 bp→TGA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP042583 | 605,373 | 0 | A | T | 99.6% | 602.9 / NA | 257 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
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| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.96e-01 | |||||||||||
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| * | CP042583 | 605,374 | 0 | C | G | 100.0% | 609.0 / NA | 257 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (130/127); total (130/127) | |||||||||||
| * | CP042583 | 605,375 | 0 | T | A | 100.0% | 611.9 / NA | 257 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base A (130/127); total (130/127) | |||||||||||
Only 100 of 258 total aligned reads displayed.
GATGGATCTCACTGGCACCCAGCACCACATGACCGATCGCCATCAACAACGCCCCCAGCATCACCGCCATGCGATTGCCGAGAACTTTATCCGCCAAAAAGCCACCGAGGATTGGCGTGACATACACCAGGCTACAGTAGGCGCTAAATAACTCGTAGGCGTGAGTATCGTTGTATTTTAGTTGATTGGTGAGATAGAGAATCAGCAGGGCACGCATGCCGTAAAAGCTAAAATATTCCCAGATTTGCAGCGCAACGACATAGTAAATAGCGCGCGGCTGACTTGCGTGTTTATTCATAATAATTCCACAATTGACGGCAACGTCACGTAATAGTTGCGCGGCGTGCTTGTGTTTCCTTAAAGTTAAAACTTTGATACAGATCTGATTATTTATGCAATATGCTGTCTGATTGCATAAATATACATTAGCTGAAGCGTGATGATATAAACAATTTGCGTCTTTTGGCGTCGGGTTTGTTTCTTAATATGTCAAAAGATTGGCTATCGACGAACTGGCGAGGTAACGCTATGTTAACGGTGTAGCTATCAGAATACGGAAGGCGCGA > CP042583/605093‑605658 ||| gatggatCTCACTGGCACCCAGCACCACATGACCGATCGCCATCAACAACGCCCCCAGCATCACCGCCATGCGATTGCCGAGAACTTTATCCGCCAAAAAGCCACCGAGGATTGGCGTGACATACACCAGCGAACAGTAGGCGCTAAATAACTCGTAGGCGTGAGTATCGTTGTATTTTAGTTGATTGGTGAGATAGAGAATCAGCAGGGCACGCATGCCGTAAAAGCTAAAATATTCCCAGATTTGCAGCGCAACGACATAGTAAATAGCGCGCGGCTGTGATGCgtg > 1:723358/1‑289 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |