Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 636,572 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 636,572 | 0 | A | T | 99.6% | 661.6 / NA | 281 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); new base T (148/131); total (149/132) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.71e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 | |||||||||||
* | CP042583 | 636,573 | 0 | G | C | 98.9% | 652.9 / NA | 281 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/2); new base C (148/130); total (149/132) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.02e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 636,574 | 0 | C | G | 99.6% | 654.2 / NA | 281 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base G (148/132); minor base A (1/0); total (149/132) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
Only 100 of 281 total aligned reads displayed.
AACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTACTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAGGGATGATCATTACTCAGGGCGCAACCTATCTGCAAATGCGTACCGTGGGCGAACTGCACCTGCGTACCCGTGCAACGGCTCAGGTGGCTGCGCTGGTGACACTGGTCTGTTTCGCACTGGCTGGCGTATGGGTGATGTACGGTATCGATGGTTATGTCGTGAAAAGCACAATGGACCATTACGCAGCCTCTA‑ACCCACTGAATAAAGAAGTGGTTCGTGAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGGTGTGGTTCTGCCGCTGCTGACCATCCTGACTGCACGTATGGATAAAGCCGCGTGGGCGTTTGTGTTCTCCTCCCTGACGCTGGCCTGCATCATCCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGCCGTCCAGCACCATGATGAACGCAAGTCTGA > CP042583/636293‑636851 ||| aagcgttgtcatggCGTACCATTCAACGTTGAGCAAGCTCTGCATCTGTAGTCCACCGGTAACTTAGTCCAGTTGCTTAGCCCGTGCGGACTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAGGGATGATCATTACTCAGGGCGCAACCTAGCTGCAAATGCGTTGCGTGGGCGAACTGCACCTGCGTACCCGTGCAACGGCTGAGGTGGCTGCGCTGGTGACACTGGTCTGTTTCGCACTGGCTGGCGTATGGGTGATGTACGTTATCGATGGTTATGTCGTGAAATCGACAATg < 2:109999/276‑1 (MQ=255) gaggCGTACCGTTTAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTACTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAGGGATGATCATTACTCAGGGCGCAACCTATCTGCAAATGCGTACCGTGGGCGAACTGCACCTGCGTACCCGTGCAACGGCTCAGGTGGCTGCGCTGGTGACACTGGTCTGTTTCGCACTGGCTGGCGTATGGGTGATGTACGGTATCGATGGTTATGTCGTGAAATCGACAATGGACCATTACg < 2:634025/286‑1 (MQ=255) ggCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTACTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAGGGATGATCATTACTCAGGGCGCAACCTATCTGCAAATGCGTACCGTGGGCGAACTGCACCTGCGTACCCGTGCAACGGCTCAGGTGGCTGCGCTGGTGACACTGGTCTGTTTCGCACTGGCTGGCGTATGGGTGATGTACGGTATCGATGGTTATGTCGTGAAATCGACAATGGACCATTACGCa < 2:592137/288‑1 (MQ=255) tgTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTACTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAGGGATGATCATTACTCAGGGCGCAACCTATCTGCAAATGCGTACCGTGGGCGAACTGCACCTGCGTACCCGTGCAACGGCTCAGGTGGCTGCGCTGGTGACACTGGTCTGTTTCGCACTGGCTGGCGTATGGGTGATGTACGGTATCGATGGTTATGTCGTGAAATCGACAATGGACCATTACGCAGc < 1:833272/287‑1 (MQ=255) tCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTACTACACCGGTACCTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGGCTGCGGGCAGGCGTGGTGAGCGTAGTGATGATCATTACTCAGGGCGCAACCTATCTGCAAATGCGTACCGTGGGCGAACTGCACCTGCGTACCCGTGCAACGGCTCAGGTGGCTGCGCTGGTGACACTGGTCTGTTTCGCACTGGCTGGCGTATGGGTGATGTACGGTATCGATGGTTATGTCGTGAAATCGACAATGGACCATTACGCAGCCTCTA‑Acc < 2:1905780/288‑1 (MQ=255) cAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTACTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAGGGATGATCATTACTCAGGGCGCAACCTATCTGCAAATGCGTACCGTGGGCGAACTGCACCTGCGTACCCGTGCAACGGCTCAGGTGGCTGCGCTGGTGACACTGGTCTGTTTCGCACTGGCTGGCGTATGGGTGATGTACGGTATCGATGGTTATGTCGTGAAATCGACAATGGACCATTACGCAGCCTCTA‑Accc > 2:1132640/1‑288 (MQ=255) aaCGTTGATGAATATCTGCGTCTGTACTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAGGGATGATCATTACTCAGGGCGCAACCTATCTGCAAATGCGTACCGTGGGCGAACTGCACCTGCGTACCCTTGCAACGGCTCAGGTGGCTGCGCTGGTGACACTGGTCTGTTTCGCACTGGCTGGCGTCTGTGTGATGTACGGTATCGATGGTTATTTCGTGAACTCGACAATGGCACATTACGCacactccacccaa > 2:1033825/1‑276 (MQ=255) cGTTGATGAATATCTGCGTCTGTACTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAGGGATGATCATTACTCAGGGCGCAACCTATCTGCAAATGCGTACCGTGGGCGAACTGCACCTGCGTACCCGTGCAACGGCTCAGGTGGCTGCGCTGGTGACACTGGTCTGTTTCGCACTGGCTGGCGTATGGGTGATGTACGGTATCGATGGTTATGTCGTGAAATCGACAATGGACCATTACGTCGCctcacccccccta > 2:1007901/1‑279 (MQ=255) tgatgaATCTCTGCGTCTGTACTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCCGGCGTGGTGAGCGTAGGGATGATCATTACTCAGGGCGCAACCTATCTGCAAATGCGTACCGTGGGCGAACTTCACCTGCGTACCCGTGCAACGGCTCAGGTGGCTGCGCTGGTGCCACTGGTCTGTTGCGCACGGGCTGGCGTATGCGTGATGTACGGTAGAGACGGTTATGTCGTGGCATGGACAGTGGCCGCTTACGCAGCCCCTacatcacttcat > 2:1141544/1‑278 (MQ=255) gatgaATATCTTCGTCTGTCCTACACCTGTAACTGCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAGGGATGATCATTACTCAGGGCGCAACCTATCTGCAAATGCGTACCGTGGGCGAACTGCACCTGCGTACCCGTGCAACGGCTCAGGTGGCTGCGCTGGTGACACTGGTCTGTTTCGCACTGGCTGGCGTATGGGTGATGTACGGTATCGATGGTTATGTCGTGAAATCGACAATGGACCATTACGCAGCCTCTA‑ACCCACTGAATa < 2:939527/289‑1 (MQ=255) atatCTGCGTCTGTACTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAGGGATGATCATTACTCAGGGCGCAACCTATCTGCAAATGCGTACCGTGGGCGAACTGCACCTGCGTACCCGTGCAACGGCTCAGGTGGCTGCGCTGGTGACACTGGTCTGTTTCGCACTGGCTGGCGTATGGGTGATGTACGGTATCGATGGTTATGTCGTGAAATCGACAATGGACCATTACGCAGCCTCTA‑ACCCACTGAATAaagaa < 1:218671/289‑1 (MQ=255) tCTGCGTCTGTACTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAGGGATGATCATTACTCAGGGCGCAACCTATCTGCAAATGCGTACCGTGGGCGAACTGCACCTGCGTACCCGTGCAACGGCTCAGGTGGCTGCGCTGGTGACACTGGTCTGTTTCGCACTGGCTGGCGTATGGGTGATGTACGGTATCGATGGTTATGTCGTGAAATCGACAATGGACCATTACGCAGCCTCTA‑Accc < 1:588395/273‑1 (MQ=255) cGTCTGTACTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAGGGATGATCATTACTCAGGGCGCAACCTATCTGCAAATGCGTACCGTGGGCGAACTGCACCTGCGTACCCGTGCAACGGCTCAGGTGGCTGCGCTGGTGACACTGGTCTGTTTCGCACTGGCTGGCGTATGGGTGATGTACGGTATCGATGGTTATGTCGTGAAATCGACAATGGACCATTACg > 1:601268/1‑256 (MQ=255) tCTGTACTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAGGGATGATCATTACTCAGGGCGCAACCTATCTGCAAATGCGTACCGTGGGCGAACTGCACCTGCGTACCCGTGCAACGGCTCAGGTGGCTGCGCTGGTGACACTGGTCTGTTTCGCACTGGCTGGCGTATGGGTGATGTACGGTATCGATGGTTATGTCGTGAAATCGACAATGGACCATTACGCAGCCTCTA‑ACCCACTGAATAAAGAAGTGGTTCGt > 1:823696/1‑289 (MQ=255) tCTGTACTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAGGGATGATCATTACTCAGGGCGCAACCTATCTGCAAATGCGTACCGTGGGCGAACTGCACCTGCGTACCCGTGCAACGGCTCAGGTGGCTGCGCTGGTGACACTGGTCTGTTTCGCACTGGCTGGCGTATGGGTGATGTACGGTATCGATGGTTATGTCGTGAAATCGACAATGGACCATTACGCAGCCCCTACCCCCACT‑AATAAAGAAGtggttggt > 2:37046/1‑289 (MQ=255) tactacACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAGGGATGATCATTACTCAGGGCGCAACCTATCTGCAAATGCGTACCGTGGGCGAACTGCACCTGCGTACCCGTGCAACGGCTCAGGTGGCTGCGCTGGTGACACTGGTCTGTTTCGCACTGGCTGGCGTATGGGTGATGTACGGTATCGATGGTTATGTCGTGAAATCGACAATGGACCATTACGCAGCCTCTA‑ACCCACTGaa < 2:1766412/269‑1 (MQ=255) acacCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAGGGATGATCATTACTCAGGGCGCAACCTATCTGCAAATGCGTACCGTGGGCGAACTGCACCTGCGTACCCGTGCAACGGCTCAGGTGGCTGCGCTGGTGACACTGGTCTGTTTCGCACTGGCTGGCGTATGGGTGATGTACGGTATCGATGGTTATGTCGTGAAATCGACAATGGACCATTACGCAGCCTCTA‑ACCCACTGAATAAAGAAGTGGTTCGTGAAGCTgg > 1:572076/1‑289 (MQ=255) cacCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAGGGATGATCATTACTCAGGGCGCAACCTATCTGCAAATGCGTACCGTGGGCGAACTGCACCTGCGTACCCGTGCAACGGCTCAGGTGGCTGCGCTGGTGACACTGGTCTGTTTCGCACTGGCTGGCGTATGGGTGATGTACGGTATCGATGGTTATGTCGTGAAATCGACAATGGACCATTACGCAGCCTCTA‑ACCCACTGAATAAAGAAGTGGTTCGTGAAGc < 1:51912/285‑1 (MQ=255) cacCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAGGGATGATCATTACTCAGGGCGCAACCTATCTGCAAATGCGTACCGTGGGCGAACTGCACCTGCGTACCCGTGCAACGGCTCAGGTGGCTGCGCTGGTGACACTGGTCTGTTTCGCACTGGCTGGCGTATGGGTGATGTACGGTATCGATGGTTATGTCGTGAAATCGACAATGGACCATTACGCAGCCTCTA‑ACCCACTGAATAAAGAAGTGGTTCGTGAAGCTGgc > 2:133818/1‑289 (MQ=255) cacCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAGGGATGATCATTACTCAGGGCGCAACCTATCTGCAAATGCGTACCGTGGGCGAACTGCACCTGCGTACCCGTGCAACGGCTCAGGTGGCTGCGCTGGTGACACTGGTCTGTTTCGCACTGGCTGGCGTATGGGTGATGTACGGTATCGATGGTTATGTCGTGAAATCGACAATGGACCATTACGCAGCCTCTA‑ACCCACTGAATAAAGAAGTGGTTCGTGAAGCTGgc > 2:609853/1‑289 (MQ=255) gTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAGGGATGATCATTACTCAGGGCGCAACCTATCTGCAAATGCGTACCGTGGGCGAACTGCACCTGCGTACCCGTGCAACGGCTCAGGTGGCTGCGCTGGTGACACTGGTCTGTTTCGCACTGGCTGGCGTATGGGTGATGTACGGTATCGATGGTTATGTCGTGAAATCGACAATGGACCATTACGCAGCCTCTA‑ACCCACTGAATAAAGAAGTGGTTCGTGAAGCTGGCGCATg > 2:286099/1‑289 (MQ=255) gTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAGGGATGATCATTACTCAGGGCGCAACCTATCTGCAAATGCGTACCGTGGGCGAACTGCACCTGCGTACCCGTGCAACGGCTCAGGTGGCTGCGCTGGTGACACTGGTCTGTTTCGCACTGGCTGGCGTATGGGTGATGTACGGTATCGATGGTTATGTCGTGAAATCGACAATGGACCATTACGCAGCCTCTA‑ACCCACTGAATAAAGAAGTGGTTCGTGAAGCTGGCGCATg > 1:1234366/1‑289 (MQ=255) aCTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAGGGATGATCATTACTCAGGGCGCAACCTATCTGCAAATGCGTACCGTGGGCGAACTGCACCTGCGTACCCGTGCAACGGCTCAGGTGGCTGCGCTGGTGACACTGGTCTGTTTCGCACTGGCTGGCGTATGGGTGATGTACGGTATCGAGGGTTATTTCGTGAAATCGACAATGGACAATGACGCAGCCTCTA‑ACCCACTGAATACACAAGGGGTTCGTGAAGCTGgcgctcg > 2:841874/1‑283 (MQ=255) cttcCAGTTGCGTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCGGGCGTGGTGAGCGTAGGGATGATCATTACTCAGGGCGCAACCTATCTGCAAATGCGTAACGTGGGCGAACTGCACCTGCGTACCCGTGCAACGGCTCAGGTGGCTGCGCTGGTGACACTGGTCTGTTTCGCACTGGCTGGCGTATGGGTGATGTACGGTATCGATGGTTATGTCGTGAAATCGACAATGGACCATTACGCAGCCTCTA‑ACCCACTGAATAAAGAAGTGGTTCGTGAAGCTGGCGCATGGCTGGtt < 1:1169601/289‑1 (MQ=255) ttAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAGGGATGATCATTACTCAGGGCGCAACCTATCTGCAAATGCGTACCGTGGGCGAACTGCACCTGCGTACCCGTGCAACGGCTCAGGTGGCTGCGCTGGTGACACTGGTCTGTTTCGCACTGGCTGGCGTATGGGTGATGTACGGTATCGATGGTTATGTCGTGAAATCGACAATGGACCATTACGCAGCCTCTA‑ACCCACTGAATAAAGAAGTGGTTCGTGAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTcaacaa < 1:1122578/289‑1 (MQ=255) ttCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAGGGATGATCATTACTCAGGGCGCAACCTATCTGCAAATGCGTACCGTGGGCGAACTGCACCTGCGTACCCGTGCAACGGCTCAGGTGGCTGCGCTGGTGACACTGGTCTGTTTCGCACTGGCTGGCGTATGGGTGATGTACGGTATCGATGGTTATGTCGTGAAATCGACAATGGACCATTACGCa < 2:560775/216‑1 (MQ=255) tCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAGGGATGATCATTACTCAGGGCGCAACCTATCTGCAAATGCGTACCGTGGGCGAACTGCACCTGCGTACCCGTGCAACGGCTCAGGTGGCTGCGCTGGTGACACTGGTCTGTTTCGCACTGGCTGGCGTATGGGTGATGTACGGTATCGATGGTTATGTCGTGAAATCGACAATGGACCATTACGCAGCCTCTA‑ACCCACTGAATAAAGAAGTGGTTCGTGAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAAt > 1:1770071/1‑289 (MQ=255) ccTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAGGGATGATCATTACTCAGGGCGCAACCTATCTGCAAATGCGTACCGTGGGCGAACTGCACCTGCGTACCCGTGCAACGGCTCAGGTGGCTGCGCTGGTGACACTGGTCTGTTTCGCACTGGCTGGCGTATGGGTGATGTACGGTATCGATGGTTATGTCGTGAAATCGACAATGGACCATTACGCAGCCTCTA‑ACCCACTGAATAAAGAAGTGGTTCGTGAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCt < 1:328132/288‑1 (MQ=255) tgGCAGGCGTGGTGAGCGTAGGGATGATCATTACTCAGGGCGCAACCTATCTGCAAATGCGTACCGTGGGCGAACTGCACCTGCGTACCCGTGCAACGGCTCAGGTGGCTGCGCTGGTGACACTGGTCTGTTTCGCACTGGCTGGCGTATGGGTGATGTACGGTATCGATGGTTATGTCGTGAAATCGACAATGGACCATTACGCAGCCTCTA‑ACCCACTGAATAAAGAAGTGGTTCGTGAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGc < 2:209817/289‑1 (MQ=255) tgGCAGGCGTGGTGAGCGTAGGGATGATCATTACTCAGGGCGCAACCTATCTGCAAATGCGTACCGTGGGCGAACTGCACCTGCGTACCCGTGCAACGGCTCAGGTGGCTGCGCTGGTGACACTGGTCTGTTTCGCACTGGCTGGCGTATGGGTGATGTACGGTATCGATGGTTATGTCGTGAAATCGACAATGGACCATTACGCAGCCTCTA‑ACCCACTGAATAAAGAAGTGGTTCGTGAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGc < 1:1589557/289‑1 (MQ=255) ggCAGGCGTGGTGGGGGTAGGGATGATCAGTACTCAGGGCGCGACCTATCTGCAAATGCGTACCGTGGGCGAACTGCCCCTGCGTACCCGTGCAACGGCTCAGGTGGCTGCGCTGGTGACACTGGTCTGTTTCGCACTGGCTGGCGTATGGGTGATGTACGGTATCGATGGTTATGTCGTGAAATCGACAATGGACCATTACGCAGCCTCTA‑ACCCACTGAATAAAGAAGTGGTTCGTGAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGc < 2:1611549/288‑1 (MQ=255) ggtgAGCGTAGGGATGATCATTACTCAGGGCGCAACCTATCTGCAAATGCGTACCGTGGGCGAACTGCACCTGCGTACCCGTGCAACGGCTCAGGTGGCTGCGCTGGTGACACTGGTCTGTTTCGCACTGGCTGGCGTATGGGTGATGTACTGTATCGATGGTTATGTCGTGAAATCGACAATGGACCATTACGCAGCCTCTA‑ACCCACTGAATAAAGAAGTGGTTCGTGAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCa < 1:1492875/289‑1 (MQ=255) ggtgAGCGTAGGGATGATCATTACTCAGGGCGCAACCTATCTGCAAATGCGTACCGTGGGCGAACTGCACCTGCGTACCCGTGCAACGGCTCAGGTGGCTGCGCTGGTGACACTGGTCTGTTTCGCACTGGCTGGCGTATGGGTGATGTACGGTATCGATGGTTATGTCGTGAAATCGACAATGGACCATTACGCAGCCTCTA‑ACCCACTGAATAAAGAAGTGGTTCGTGAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCa < 1:546273/289‑1 (MQ=255) ttgtgggtggggATGGTCATTATTTAGGGCGCAAGCTGTCTGCAAATGCGTTTCGTGGGCGAACTGCACCTGCGTTACCGTGCAACGGCTCTGGTGGCTGCGCTGGTGACACTGGTTTGTTTCGCACTGGCTGGCGTATGGGTGATGTACGGTATCGATGGTTATTTCGTGAAATCGACAATGGACCATTACGCAGCCTCTA‑TCCCACTGAATAAAGAAGTGGTTCGTGAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCAc < 2:1940158/280‑1 (MQ=255) gAGCGTAGGGATGATCATTACTCAGGGCGCAACCTATCTGCAAATGCGTACCGTGGGCGAACTGCACCTGCGTACCCGTGCAACGGCTCAGGTGGCTGCGCTGGTGACACTGGTCTGTTTCGCACTGGCTGGCGTATGGGTGATGTACGGTATCGATGGTTATGTCGTGAAATCGACAATGGACCATTACGCAGCCTCTA‑ACCCACTGAATAAAGAAGTGGTTCGTGAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACt < 1:1917503/288‑1 (MQ=255) gAGCGTAGGGATGATCATTACTCAGGGCGCAACCTATCTGCAAATGCGTACCGTGGGCGAACTGCACCTGCGTACCCGTGCAACGGCTCAGGTGGCTGCGCTGGTGACACTGGTCTGTTTCGCACTGGCTGGCGTATGGGTGATGTACGGTATCGATGGTTATGTCGTGAAATCGACAATGGACCATTACGCAGCCTCTA‑ACCCACTGAATAAAGAAGTGGTTCGTGAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACt < 1:998958/288‑1 (MQ=255) gAGCGTAGGGATGATCATTACTCAGGGCGCAACCTATCTGCAAATGCGTACCGTGGGCGAACTGCACCTGCGTACCCGTGCAACGGCTCAGGTGGCTGCGCTGGTGACACTGGTCTGTTGCGCACTGGCTGGCGTATGGGTGATGTACGGTATCGATGGTTATGTCGTGAAATCGACAATGGACCATTACGCAGCCTCTA‑ACCCACTGAATAAAGAAGTGGTTCGTGAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACt < 2:496510/288‑1 (MQ=255) gtatggaggttaaTTACTCAGGGGGCAACCTATCTGCAAATGCGTACCGTGGGCGAACTCCACCTGCGTACCCGTGCAACGGCTCAGGTGGGTGCGCGGGTGACACTGGTCTGTTTCGCACTGGCTGGCGTATGGGTGATGTACGGTATCGATGGTTATGTCGTGAAATCGACAATGGACCATTACGCAGCCTCTA‑ACCCACTGAATAAAGAAGTGGTTCGTGAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGgt < 1:1007901/276‑1 (MQ=255) atCATTACTCAGGGCGCAACCTATCTGCAAATGCGTACCGTGGGCGAACTGCACCTGCGTACCCGTGCAACGGCTCAGGTGGCTGCGCTGGTGACACTGGTCTGTTTCGCACTGGCTGGCGTATGGGTGATGTACGGTATCGATGGTTATGTCGTGAAATCGACAATGGACCATTACGCAGCCTCTA‑ACCCACTGAATAAAGAAGTGGTTCGTGAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGGTGTGGTTCTg > 2:766735/1‑288 (MQ=255) atCATTACTCAGGGCGCAACCTATCTGCAAATGCGTACCGTGGGCGAACTGCACCTGCGTACCCGTGCAACGGCTCAGGTGGCTGCGCTGGTGACACTGGTCTGTTTCGCACTGGCTGGCGTATGGGTGATGTACGGTATCGATGGTTATGTCGTGAAATCGACAATGGACCATTACGCAGCCTCTA‑ACCCACTGAATAAAGAAGTGGTTCGTGAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGGTGTGGTTCTg > 2:984091/1‑288 (MQ=255) atCATTACTCAGGGCGCAACCTATCTGCAAATGCGTACCGTGGGCGAACTGCACCTGCGTACCCGTGCAACGGCTCAGGTGGCTGCGCTGGTGACACTGGTCTGTTTCGCACTGGCTGGCGTATGGGTGATGTACGGTATCGATGGTTATGTCGTGAAATCGACAATGGAACATTACGCAGCCTCTA‑ACCGACTGAATAAAGAAGTGGATCGTGAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTACGGCACTGGGTGTGGTTCTg > 1:208269/1‑288 (MQ=255) cAGGGCGCAACCTATCTGCAAATGCGTACCGTGGGCGAACTGCACCTGCGTACCCGTGCAACGGCTCAGGTGGCTGCGCTGGTGACACTGGTCTGTTTCGCACTGGCTGGCGTATGGGTGATGTACGGTATCGATGGTTATGTCGTGAAATCGACAATGGACCATTACGCAGCCTCTA‑ACCCACTGAATAAAGAAGTGGTTCGTGAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGGTGTGGTTCTGCCGCTGCTGa < 1:133818/289‑1 (MQ=255) aGGGCGCAACCTATCTGCAAATGCGTACCGTGGGCGAACTGCACCTGCGTACCCGTGCAACGGCTCAGGTGGCTGCGCTGGTGACACTGGTCTGTTTCGCACTGGCTGGCGTATGGGTGATGTACGGTATCGATGGTTATGTCGTGAAATCGACAATGGACCATTACGCAGCCTCTA‑ACCCACTGAATAAAGAAGTGGTTCGTGAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGGTGTGGTTCTGCCGCTGCTGa > 1:161586/1‑288 (MQ=255) ggCGCAACCTATCTGCAAATGCGTACCGTGGGCGAACTGCACCTGCGTACCCGTGCAACGGCTCAGGTGGCTGCGCTGGTGACACTGGTCTGTTTCGCACTGGCTGGCGTATGGGTGATGTACGGTATCGATGGTTATGTCGTGAAATCGACAATGGACCATTACGCAGCCTCTA‑ACCCACTGAATAAAGAAGTGGTTCGTGAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGGTGTGGTTCTGCCGCTGCTGAcc > 1:255754/1‑288 (MQ=255) ggCGCAACCTATCTGCAAATGCGTACCGTGGGCGAACTGCACCTGCGTACCCGTGCAACGGCTCAGGTGGCTGCGCTGGTGACACTGGTCTGTTTCGCACTGGCTGGCGTATGGGTGATGTACGGTATCGATGGTTATGTCGTGAAATCGACAATGGACCATTACGCAGCCTCTA‑ACCCACTGAATAAAGAAGTGGTTCGTGAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGGTGTGGTTCTGCCGCTGCTGACCa > 1:67645/1‑289 (MQ=255) cgcAACCTATCTGCAAATGCGTACCGTGGGCGAACTGCACCTGCGTACCCGTGCAACGGCTCAGGTGGCTGCGCTGGTGACACTGGTCTGTTTCGCACTGGCTGGCGTATGGGTGATGTACGGTATCGATGGTTATGTCGTGAAATCGACAATGGACCATTACGCAGCCTCTA‑ACCCACTGAATAAAGAAGTGGTTCGTGAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACTCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGGTGTGGTTCTGGCGCTGCTTACCAt > 2:1265385/1‑288 (MQ=255) tATCGGCAAATGCGTACCGGCGGCGCACTTCACCGGCGTACCCGTGCAACGCCTCAGGTGGCTGCGCGGGGGACACTGGTCTGTTTCGGACTGGCTGGCGTATGGGTGATGTACGGTAGCGATGGTTATGTCGTGAAATCGACAATGGTCCATTACGCAGCCTCTA‑ACCCACTGAAGAAAGAAGTGGTTCGTGAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGGTGTGGTTCTGCCGCTGCTGACCATCCTGACTg < 2:803784/289‑1 (MQ=255) aTCTGCAAATGCGTACCGTGGGCGAACTGCACCTGCGTACCCGTGCAACGGCTCAGGTGGCTGCGCTGGTGACACTGGTCTGTTTCGCACTGGCTGGCGTATGGGTGATGTACGGTATCGATGGTTATGTCGTGAAATCGACAATGGACCATTACGCAGCCTCTA‑ACCCACTGAATAAAGAAGTGGTTCGTGAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCCACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGGGGTGGTTCTGCCGCCGGTGACCTGCCTGAccg > 2:950611/1‑286 (MQ=255) aTCTGCAAATGCGTACCGTGGGCGAACTGCACCTGCGTACCCGTGCAACGGCTCAGGTGGCTGCGCTGGTGACACTGGTCTGTTTCGCACTGGCTGGCGTATGGGTGATGTACGGTATCGATGGTTATGTCGTGAAATCGACAATGGACCATTACGCAGCCTCTA‑ACCCACTGAATAAAGAAGTGGTTCGTGAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGGTGTGGTTCTGCCGCTGCTGACCATCCTGACTg > 2:1211918/1‑288 (MQ=255) gcaaatggcggccGTGGGCGGCCTGACCCGGCGTACCCGTGCACCGGCTCAGGTGGCTGCGCTGGTGATACTGGTCTGTTTCGCACTGGCTGGCGTATGGGTGATGTACGGTATCGATGGTTATGTCGTGAAATCGACAATGGACCATTACGCAGCCTCTA‑ACCCACTGAATAAAGAAGTGGTTCGTGAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGGTGTGGTTCTGCCGCTGCTGACCATCCTGACTGCACGt < 2:1843162/278‑1 (MQ=255) cGTACCGTGGGCGAACTGCACCTGCGTACCCGTGCAACGGCTCAGGTGGCTGCGCTGGTGACACTGGTCTGTTTCGCACTGGCTGGCGTATGGGTGATGTACGGTATCGATGGTTATGTCGTGAAATCGACAATGGACCATTACGCa > 1:990485/1‑147 (MQ=255) ggCGAACTGCACCTGCGTACCCGTGCAACGGCTCAGGTGGCTGCGCTGGTGACACTGGTCTGTTTCGCACTGGCTGGCGTATGGGTGATGTACGGTATCGATGGTTATGTCGTGAAATCGACAATGGACCATTACGCAGCCTCTA‑ACCCACTGAATAAAGAAGTGGTTCGTGAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGTCTATTCCGGCACTGGGTGTGGTTCTGCCGCTGCTGACCATCCTGACTGCACGTATGGATAAAGCCGCGt > 1:1562750/1‑289 (MQ=255) ggCGAACTGCACCTGCGTACCCGTGCAACGGCTCAGGTGGCTGCGCTGGTGACACTGGTCTGTTTCGCACTGGCTGGCGTATGGGTGATGTACGGTATCGATGGTTATGTCGTGAAATCGACAATGGACCATTACGCAGCCTCTA‑ACCCACTGAATAAAGAAGTGGTTCGTGAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACt < 1:728484/233‑1 (MQ=255) ggCGAACTGCACCTGCGTACCCGTGCAACGGCTCAGGTGGCTGCGCTGGTGACACTGGTCTGTTTCGCACTGGCTGGCGTATGGGTGATGTACGGTATCGATGGTTATGTCGTGAAATCGACAATGGACCATTACGCAGCCTCTA‑ACCCACTGAATAAAGAAGTGGTTCGTGAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACt > 2:728484/1‑233 (MQ=255) ggCGAACTGCACCTGCGTACCCGTGCAACGGCTCAGGTGGCTGCGCTGGTGACACTGGTCTGTTTCGCACTGGCTGGCGTATGGGTGATGTACGGTATCGATGGTTATGTCGTGAAATCGACAATGGACCATTACGCAGCCTCTA‑ACCCACTGAATAAAGAAGTGGTTCGTGAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACCGGGTGTGGTTCTTCCGCTGCTGACCCTCCTGACTGCCCGTTTGGTTAAAGCCGCGt > 2:1691536/1‑289 (MQ=255) gAACTGCACCTGCGTACCCGTGCAACGGCTCAGGTGGCTGCGCTGGTGACACTGGTCTGTTTCGCACTGGCTGGCGTATGGGTGATGTACGGTATCGATGGTTATGTCGTGAAATCGACAATGGACCATTACGCAGCCTCTA‑ACCCACTGAATAAAGAAGTGGTTCGTGAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGGTGTGGTTCTGCCGCTGCTGACCATCCTGACTGCACGTATGGATAAAGCCGCGTggg < 1:1381720/289‑1 (MQ=255) ccTGCGTACCCGTGCAACGGCTCAGGTGGCTGCGCTGGTGACATTGTTCTGTTTCGCACTGGCTGGCGTATGGGTGATGTACGGTATCGATGGTTATGTCGTGAAATCGACAATGGACCATGACGCAGCCTCTA‑ACCCACTGAATAAAGAAGTGGTTCGTGAAGCTGGCGCATGTCTGGTTAACTTCATCAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGGTGTGGTTCTGCCGCTGCTGACCATCCTGACTGCACGTATGGATAAAGCCGCGTGGGCGTTtgtg < 1:1141544/289‑1 (MQ=255) tGCGTACCCGTGCAACGGCTCAGGTGGCTGCGCTGGTGACACTGGTCTGTTTCGCACTGGCTGGCGTATGGGTGATGTACGGTATCGATGGTTATGTCGTGAAATCGACAATGGACCATTACGCAGCCTCTA‑ACCCACTGAATAAAGAAGTGGTTCGTGAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGGTGTGGTTCTGCCGCTGCTGACCATCCTGACTGCACGTATGGATAAAGCCGCGTGGGCGTTTGTGtt < 1:179612/289‑1 (MQ=255) tACCCGTGCAACGGCTCAGGTGGCTGCGCTGGTGACACTGGTCTGTTTCGCACTGGCTGGCGTATGGGTGATGTACGGTATCGATGGTTATGTCGTGAAATCGACAATGGACCATTACGCAGCCTCTA‑ACCCACTGAATAAAGAAGTGGTTCGTGAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGc < 2:1813230/204‑1 (MQ=255) cGTGCAACGGCTCAGGTGGCTGCGCTGGTGACACTGGTCTGTTTCGCACTGGCTGGCGTATGGGTGATGTACGGTATCGATGGTTATGTCGTGAAATCGACAATGGACCATTACGCAGCCTCTA‑ACCCACTGAATAAAGAAGTGGTTCGTGAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGGTGTGGTTCTGCCGCTGCTGACCATCCTGACTGCACGTATGGATAAAGCCGCGTGGGCGTTTGTGTTCTCCTccc < 1:1054407/289‑1 (MQ=255) cGTGCAACGGCTCAGGTGGCTGCGCTGGTGACACTGGTCTGTTTCGCACTGGCTGGCGTATGGGTGATGTACGGTATCGATGGTTATGTCGTGAAATCGACAATGGACCATTACGCAGCCTCTA‑ACCCACTGAATAAAGAAGTGGTTCGTGAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGGTGTGGTTCTGCCGCTGCTGACCATCCTGACTGCACGTATGGATAAAGCCGCGTGGGCGTTTGTGTTCTCCTccc < 1:1259674/289‑1 (MQ=255) gTGCAACGGCTCAGGTGGCTGCGCTGGTGACACTGGTCTGTTTCGCACTGGCTGGCGTATGGGTGATGTACGGTATCGATGGTTATGTCGTGAAATCGACAATGGACCATTACGCAGCCTCTA‑ACCCACTGAATAAAGAAGTGGTTCGTGAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGGTGTGGTTCTGCCGCTGCTGACCCTCCTGACTGCACGCATGGATAAAGCCGCGGTGGCGTTTGTGTTcccctctc > 2:1875281/1‑286 (MQ=255) gTGCAACGGCTCAGGTGGCTGCGCTGGTGACACTGGTCTGTTTCGCACTGGCTGGCGTATGGGTGATGTACGGTATCGATGGTTATGTCGTGAAATCGACAATGGACCATTACGCAGCCTCTA‑ACCCACTGAATAAAGAAGTGGTTCGTGAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGGTGTGGTTCTGCCGCTGCTGACCATCCTGACt < 2:573082/245‑1 (MQ=255) tGCAACGGCTCAGGTGGCTGCGCTGGTGACACTGGTCTGTTTCGCACTGGCTGGCGTATGGGTGATGTACGGTATCGATGGTTATGTCGTGAAATCGACAATGGACCATTACGCAGCCTCTA‑ACCCACTGAATAAAGAAGTGGTTCGTGAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGGTGTGGTTCTGCCGCTGCTGACCATCCTGACTGCACGTATGGATAAAGCCGCGTGGGCGTTTGTGTTCTCCTCCCTg > 1:1418576/1‑289 (MQ=255) gCAACGGCTCAGGTGGCTGCGCTGGTGACACTGGTCTGTTTCGCACTGGCTGGCGTATGGGTGATGTACGGTATCGATGGTTATGTCGTGAAATCGACAATGGACCATTACGCAGCCTCTA‑ACCCACTGAATAAAGAAGTGGTTCGTGAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTcaacaa < 1:856649/179‑1 (MQ=255) gCAACGGCTCAGGTGGCTGCGCTGGTGACACTGGTCTGTTTCGCACTGGCTGGCGTATGGGTGATGTACGGTATCGATGGTTATGTCGTGAAATCGACAATGGACCATTACGCAGCCTCTA‑ACCCACTGAATAAAGAAGTGGTTCGTGAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTcaacaa > 2:856649/1‑179 (MQ=255) cAACGGCTCAGGTGGCTGCGCTGGTGACACTGGTCTGTTTCGCACTGGCTGGCGTATGGGTGATGTACGGTATCGATGGTTATGTCGTGAAATCGACAATGGACCATTACGCAGCCTCTA‑ACCCACTGAATAAAGAAGTGGTTCGTGAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGGTGTGGTTCTGCCGCTGCTGACCATCCTGACTGCACGTATGGATAAAGCCGCGTGGGCGTTTGTGTTCTCCTCCCTGa > 1:1228796/1‑288 (MQ=255) cAACGGCTCAGGTGGCTGCGCTGGTGACACTGGTCTGTTTCGCACTGGCTGGCGTATGGGTGATGTACGGTATCGATGGTTATGTCGTGAAATCGACAATGGACCATTACGCAGCCTCTA‑ACCCACTGAATAAAGAAGTGGTTCGTGAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGGTGTGGTTCTGCCGCTGCTGACCATCCTGACTGCACGTATGGATAAAGCCGCGTGGGCGTTTGTGTTCTCCTCCCTGAc > 1:1691246/1‑289 (MQ=255) gCTCAGGTGGCTGCGCTGGTGACACTGGTCTGTTTCGCACTGGCTGGCGCATGGGTGATGTACGGTATCGATGGTTATGTCGTGAAATCGACAATGGACCATTACGCAGCCTCTA‑ACCCACTGAATAAAGAAGGGGTTCGTGAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCAAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACGGGGTGTGGGTCTTCCGCTCCTGACCATCCGGACTGCACGTATGGATAAAGCCCTGTGGGCGGTTGTCTTCGCATCCCttcgcctg > 2:68100/1‑281 (MQ=255) gcTGGTGACACTGGTCTGTTTCGCACTGGCTGGCGTATGGGTGATGTACGGTATCGATGGTTATGTCGTGAAATCGACAATGGACCATTACGCAGCCTCTA‑ACCCACTGAATAAAGAAGTGGTTCGTGAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGGTGTGGTTCTGCCGCTGCTGACCATCCTGACTGCACGTATGGATAAAGCCGCGTGGGCGTTTGTGTTCTCCTCCCTGACGCTGGCCTGc > 2:1924491/1‑280 (MQ=255) gcTGGTGACACTGGTCTGTTTCGCACTGGCTGGCGTATGGGTGATGTACGGTATCGATGGTTATGTCGTGAAATCGACAATGGACCATTACGCAGCCTCTA‑ACCCACTGAATAAAGAAGTGGTTCGTGAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGGTGTGGTTCTGCCGCTGCTGACCATCCTGACTGCACGTATGGATAAAGCCGCGTGGGCGTTTGTGTTCTCCTCCCTGACGCTGGCCTGc < 1:1924491/280‑1 (MQ=255) cacTGGTCTGTTTCTCACTGGCTGGCGTATGGGTGATGTACGGTATCGATGGTTATGTCGTGAAATCGACAATGGACCATTACGCAGCCTCTA‑ACCCACTGAATAAAGAAGTGGTTCGTGAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGGTGTGGTTCTGCCGCTGCTGACCATCCTGACTGCACGTATGGATAAAGCCGCGTGGGCGTTTGTGTTCTCCTCCCTGACGCTGGCCTGCATCATCCTGACAGCCg < 1:1031773/288‑1 (MQ=255) acTGGTCTGTTTCGCACTGGCTGGCGTATGGGTGATGTACGGTATCGATGGTTATGTCGTGAAATCGACAATGGACCATTACGCAGCCTCTA‑ACCCACTGAATAAAGAAGTGGTTCGTGAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCAc < 1:299654/179‑1 (MQ=255) acTGGTCTGTTTCGCACTGGCTGGCGTATGGGTGATGTACGGTATCGATGGTTATGTCGTGAAATCGACAATGGACCATTACGCAGCCTCTA‑ACCCACTGAATAAAGAAGTGGTTCGTGAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCAc > 2:299654/1‑179 (MQ=255) cACTGGCTGGCGTATGGGTGATGTACGGTATCGATGGTTATGTCGTGAAATCGACAATGGACCATTACGCAGCCTCTA‑ACCCACTGAATAAAGAAGTGGTTCGTGAAGCTGGCGCATGGCTTGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGGTGTGGTTCTGCCTCTGCTGACCATCCTGACTGCACGTATGGATAAACCCGCTTGGGCGTTTGTGTTCTCCTCCCTTACGTTGGCCTCCCTCCTCCTGACCGCCCGTATCGCaacttttc > 2:1438584/1‑282 (MQ=255) cACTGGCTGGCGTATGGGTGATGTACGGTATCGATGGTTATGTCGTGAAATCGACAATGGACCATTACGCAGCCTCTA‑ACCCACTGAATAAAGAAGTGGTTCGTGAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGGTGTGGTTCTGCCGCTGCTGACCATCCTGACTGCACGTATGGATAAAGCCGCGTGGGCGTTTGTGTTCTCCTCCCTGACGCTGGCCTGCATCATCCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTccc > 1:622375/1‑289 (MQ=255) gctggcGTATGGGTGATGTACGGTATCGATGGTTATGTCGTGAAATCGACAATGGACCATTACGCAGCCTCTA‑ACCCACTGAATAAAGAAGTGGTTCGTGCAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCCATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGGCGTGGTTCTGCCGCTGCTGACCATCCTGACTGCACGACTGGATTAAGCCGCGTGGGCGTTTGTGGGCTCCTCCTCGACGCTGGCCTGCATCCTCCGGGCAGCCGGTATCTCAATATTCCCGttcg > 2:53685/1‑287 (MQ=255) gctggcGTATGGGTGATGTACGGTATCGATGGTTATGTCGTGAAATCGACAATGGACCATTACGCAGCCTCTA‑ACCCACTGAATAAAGAAGTGGTTCGTGAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTcaacaa < 2:832892/131‑1 (MQ=255) gctggcGTATGGGTGATGTACGGTATCGATGGTTATGTCGTGAAATCGACAATGGACCATTACGCAGCCTCTA‑ACCCACTGAATAAAGAAGTGGTTCGTGAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGGTGTTGTTCTGCCGCTGCTTACCATCCTGACTGCCCGTATGGATAAATCCGCTTGGGCGTTTGTGTTCTCCCTCCTGACGTTGGCCTGTAACATCCTGCCAGCCGGTCTC‑CAATGtgtcctc > 2:39020/1‑279 (MQ=255) ttATGGGTGATGTACGGTATCGATGGTTATGTCGTGAAATCGACAATGGACCATTACGCAGCCTCTA‑ACCCACTGAATAAAGAAGTGTTTCGTGAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGGTGTGGTTCTGCCGCTGCTGACCATCCTGACTGCACGTATGGATAAAGCCGCGTGGGCGTTTGTGTTCTCCTCCCTGACGCTGGCCTGCATCATCCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATg < 1:387599/287‑1 (MQ=255) gTATGGGTGATGTACGGTATCGATGGTTATGTCGTGAAATCGACAATGGACCATTACGCAGCCTCTA‑ACCCACTGAATAAAGAAGTGGTTCGTGAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGTCTATTCCGGCACTGGGTGTGGTTCTGCCGCTGCTGACCATCCTGACTGCACGTATGGATAAAGCCGCGTGGGCGTTTGTGTTCTCCTCCCTGACGCTGGCCTGCATCATCCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATg < 2:1562750/288‑1 (MQ=255) gTATGGGTGATGTACGGTATCGATGGTTATGTCGTGAAATCGACAATGGACCATTACGCAGCCTCTA‑ACCCACTGAATAAAGAAGTGGTTCGTGAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGGTGTGGTTCTGCCGCTGCTGACCATCCTGACTGCACGTATGGATAAAGCCGCGTGGGCGTTTGTGTTCTCCTCCCTGACGCTGGCCTGCATCATCCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATg < 1:950611/288‑1 (MQ=255) gTATGGGTGATGTACGGTATCGATGGTTATGTCGTGAAATCGACAATGGACCATTACGCAGCCTCTA‑ACCCACTGAATAAAGAAGTGGTTCGTGAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGGTGTGGTTCTGCCGCTGCTGACCATCCTGACTGCACGTATGGATAAAGCCGCGTGGGCGTTTGTGTTCTCCTCCCTGACGCTGGCCTGCATCATCCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATg < 1:183204/288‑1 (MQ=255) gTATGGGTGATGTACGGTATCGATGGTTATGTCGTGAAATCGACAATGGACCATTACGCAGCCTCTA‑ACCCACTGAATAAAGAAGTGGTTCGTGAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGGTGTGGTTCTGCCGCTGCTGACCATCCTGACTGCACGTATGGATAAAGCCGCGTGGGCGTTTGTGTTCTCCTCCCTGACGCTGGCCTGCATCATCCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATg < 1:185415/288‑1 (MQ=255) gTATGGGTGATGTACGGTATCGATGGTTATGTCGTGAAATCGACAATGGACCATTACGCAGCCTCTA‑ACCCACTGAATAAAGAAGTGGTTCGTGAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGGTGTGGTTCTGCCGCTGCTGACCATCCTGACTGCACGTATGGATAAAGCCGCGTGGGCGTTTGTGTTCTCCTCCCTGACGCTGGCCTGCATCATCCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATg < 1:766724/288‑1 (MQ=255) gTATGGGTGATGTACGGTATCGATGGTTATGTCGTGAAATCGACAATGGACCATTACGCAGCCTCTA‑ACCCACTGAATAAAGAAGTGGTTCGTGAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGGTGTGGTTCTGCCGCTGCTGACCATCCTGACTGCACGTATGGATAAAGCCGCGTGGGCGTTTGTGTTCTCCTCCCTGACGCTGGCCTGCATCATCCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATg < 2:819942/288‑1 (MQ=255) gggTGATGTACGGTATCGATGGTTATGTCGTGAAATCGACAATGGACCATTACGCAGCCTCTA‑ACCCACTGAATAAAGAAGTGGTTCGTGAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGGTGTGGTTCTGCCGCTGCTGACCATCCTGACTGCACGTATGGATAAAGCCGCGTGGGCGTTTGTGTTCTCCTCCCTGACGCTGGCCTGCATCATCCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGCCGTc < 1:93345/289‑1 (MQ=255) gggTGATGTACGGTATCGATGGTTATGTCGTGAAATCGACAATGGACCATTACGCAGCCTCTA‑ACCCACTGAATAAAGAAGTGGTTCGTGAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGGTGTGGTTCTGCCGCTGCTGACCATCCTGACTGCACGTATGGATAAAGCCGCGTGGGCGTTTGTGTTCTCCTCCCTGACGCTGGCCTGCATCATCCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGCCGTc < 1:808848/289‑1 (MQ=255) tATCGATGGTTATGTCGTGAAATCGACAATGGACCATTACGCAGCCTCTA‑ACCCACTGAATAAAGAAGTGGTTCGTGAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGGTGTGGTTCTGCCGCTGCTGACCATCCTGACTGCACGTATGGATAAAGCCGCGTGGGCGTTTGTGTTCTCCTCCCTGACGCTGGCCTGCATCATCCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGCCGTCCAGCACCatgatg > 1:903745/1‑289 (MQ=255) tCGATGGTTATGTCGTGAAATCGACAATGGACCATTACGCAGCCTCTA‑ACCCACTGAATAAAGAAGTGGTTCGTGAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGGTGTGGTTCTGCCGCTGCTGACCATCCTGACTGCACGTATGGATAAAGCCGCGTGGGCGTTTGTGTTCTCCTCCCTGACGCTGGCCTGCATCATCCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATg < 1:1725126/269‑1 (MQ=255) cGATGGTTATGTCGTGAAATCGACAATGGACCATTACGCAGCCTCTA‑ACCCACTGAATAAAGAAGTGGTTCGTGAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGGTGTGGTTCTGCCGCTGCTGACCATCCTGACTGCACGTATGGATAAAGCCGCGTGGGCGTTTGTGTTCTCCTCCCTGACGCTGGCCTGCATCATCCTGACAGCCGGTATCg < 1:1818334/248‑1 (MQ=255) cGATGGTTATGTCGTGAAATCGACAATGGACCATTACGCAGCCTCTA‑ACCCACTGAATAAAGAAGTGGTTCGTGAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGGTGTGGTTCTGCCGCTGCTGACCATCCTGACTGCACGTATGGATAAAGCCGCGTGGGCGTTTGTGTTCTCCTCCCTGACGCTGGCCTGCATCATCCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGCCGTCCAGCACCATGATGAAc > 1:1359754/1‑289 (MQ=255) cGATGGTTATGTCGTGAAATCGACAATGGACCATTACGCAGCCTCTA‑ACCCACTGAATAAAGAAGTGGTTCGTGAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGGTGTGGTTCTGCCGCTGCTGACCATCCTGACTGCACGTATGGATAAAGCCGCGTGGGCGTTTGTGTTCTCCTCCCTGACGCTGGCCTGCATCATCCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGCCGTCCAGCACCATGATGAAc > 1:801936/1‑289 (MQ=255) aTGGTTATGTCGTGAAATCGACAATGGACCATTACGCAGCCTCTA‑ACCCACTGAATAAAGAAGTGGTTCGTGAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGGTGTGGTTCTGCCGCTGCTGACCATCCTGACTGCACGTATGGATAAAGCCGCGTGGGCGTTTGTGTTCTCCTCCCTGACGCTGGCCTGCATCATCCTGACAGCCGGTATCGCAAGGTTCCCGTTTGTGATTCCGTCCAGCCCCAtgatgaccc > 2:14807/1‑285 (MQ=255) ggTTATGTCGTGAAATGGACAATGGACCATTACGCAGCCTCTA‑CCCCACTGAATAAAGAAGTGGTTCGTGAAGCTGGCGCATGGCTGGTTACCTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGGTGTGGTTCTGCCGCTGCTGACCATCCTGACTGCACGTATGGATAAAGCCGCGTGGGCGTTTGTGTTCTCCTCCCTGACGCTGGCCTGCATCATCCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGCCGTCCAGCACCATGATGAACGCaa < 1:873165/289‑1 (MQ=255) tATGTCGTGAAATCGACAATGGACCATTACGCAGCCTCTA‑ACCCACTGAATAAAGAAGTGGTTCGTGAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGGTGTGGTTCTGCCGCTGCTGACCATCCTGACTGCACGTATGGATAAAGCCGCGTGGGCGTTTGTGTTCTCCTCCCTGACGCTGGCCTGCATCATCCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGCCGTCCAGCACCCTGATGAACGCCAgg > 2:923722/1‑287 (MQ=255) tATGTCGTGAAATCGACAATGGACCATTACGCAGCCTCTA‑ACCCACTGAATAAAGAAGTGGTTCGTGAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGGTGTGGTTCTGCCGCTGCTGACCATCCTGACTGCACGTATGGATAAAGCCGCGTGGGCGTTTGTGTTCTCCTCCCTGACGCTGGCCTGCATCATCCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGCCGTCCAGCACCATGATGAACGCAAg > 2:107748/1‑287 (MQ=255) tGTCGTGAAATCGACAATGGACCATTACGCAGCCTCTA‑ACCCACTGAATCAAGAAGTGGTTCGTGAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGGTGTGGTTCTGCCGCTGCTGACCATCCTGACTGCACGTATGGATAAAGCCGCGTGGGCGTTTGTGTTCTCCTCCCTGACGCTGGCCTGCATCATCCTGACAGCCGGTATCGCAATTTTCCCGTTTGTGATGCCCTCCAGCACCACGCTGCACGCAAGTCTg > 2:441997/1‑289 (MQ=255) tGTCGTGAAATCGACAATGGACCATTACGCAGCCTCTA‑ACCCACTGAATAAAGAAGTGGTTCGTGAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGGTGTGGTTCTGCCGCTGCTGACCATCCTGACTGCACGTATGGATAAAGCCGCGTGGGCGTTTGTGTTCTCCTCCCTGACGCTGGCCTGCATCATCCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATg < 2:179427/259‑1 (MQ=255) tGTCGTGAAATCGACAATGGACCATTACGCAGCCTCTA‑ACCCACTGAATAAAGAAGTGGTTCGTGAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGGTGTGGTTCTGCCGCTGCTGACCATCCTGACTGCACGTATGGATAAAGCCGCGTGGGCGTTTGTGTTCTCCTCCCTGACGCTGGCCTGCATCATCCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGCCGTCCAGCACCATGATGAACGCAAGTCTg > 1:421365/1‑289 (MQ=255) ||| AACCTGTTGCAGGGCGTACCGTTCAACGTTGATGAATATCTGCGTCTGTACTACACCGGTAACTTCTTCCAGTTGCTTAACCCGTTCGGCCTGCTGGCAGGCGTGGTGAGCGTAGGGATGATCATTACTCAGGGCGCAACCTATCTGCAAATGCGTACCGTGGGCGAACTGCACCTGCGTACCCGTGCAACGGCTCAGGTGGCTGCGCTGGTGACACTGGTCTGTTTCGCACTGGCTGGCGTATGGGTGATGTACGGTATCGATGGTTATGTCGTGAAAAGCACAATGGACCATTACGCAGCCTCTA‑ACCCACTGAATAAAGAAGTGGTTCGTGAAGCTGGCGCATGGCTGGTTAACTTCAACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGGTGTGGTTCTGCCGCTGCTGACCATCCTGACTGCACGTATGGATAAAGCCGCGTGGGCGTTTGTGTTCTCCTCCCTGACGCTGGCCTGCATCATCCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGCCGTCCAGCACCATGATGAACGCAAGTCTGA > CP042583/636293‑636851 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |