Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 458,736 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 458,736 | 0 | A | T | 99.0% | 243.4 / NA | 104 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (72/31); minor base C (1/0); total (73/31) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
* | CP042583 | 458,737 | 0 | G | C | 99.0% | 241.6 / NA | 104 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base C (72/31); minor base A (1/0); total (73/31) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 458,738 | 0 | C | G | 100.0% | 244.5 / NA | 104 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (73/31); total (73/31) |
Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
AATTTAAGAAATACCTGACAATATAAAAAGAATTTTCAGCCTGGTAATTTACCGCTTCAGGTCTATATTTGTGTTGAATATATTTTGCGCGGAAGTATTCATCTAACGGGGCTCTCTATTTTTTAGAATAGAGTGCATATTTTCAATTAAGACATTCTTAGAGGATAAAAAGGAATTTACTACTATCAGTGTCTTAAATAAAGTAATCGGTTATATACGGATGTGGAGTCGATAAATGAGATTGAAGGAATATATATGAAATTAAGATTTATTAGCTCTGCGCTGGCTGCCGCACTA‑TTCGCCGCTACGGGTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTGTAGTGTGAATACTGACAGCGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGTACCGATATTTTCAATGCTGTTGGTAATACCTCTGCATTAATTCCATTCACCATTCAGTTGAACGACTGCGATCCTGTTGTTGCCGCTAATGCTGCCGTTGCATTTTCTGGTCAGGCTGATGCAA > CP042583/458463‑459015 ||| aaTTTAAGAAATACCTGACAATATAAAAAGAATTTTCAGCCTGGTAATTTACCGCTTCAGGTCTATATTTGTGTTGAATATATTTTGCGCGGAAGTATTCATCTAACGGGGCTCTCTATTTTTTAGAATAGAGTGCATATTTTCAATTAAGACATTCTTAGAGGATAAAAAGGAATTTACTACTATCAGTGTCTTAAATAAAGTAATCGGTTATATACGGATGTGGAGTCGATAAATGAGATTGAAGGAATATATATGAAATTAAGATTTATTTCGTCTGCgctggctg < 1:512655/289‑1 (MQ=255) aCAATATAAAAAGAATTTTCAGCCTGGTAATTTACCGCTTCAGGTCTATATTTGTGTTGAATATATTTTGCGCGGAAGTATTCATCTAACGGGGCTCTCTATTTTTTAGAATAGAGTGCATATTTTCAATTAAGACATTCTTAGAGGATAAAAAGGAATTTACTACTATCAGTGTCTTAAATAAAGTAATCGGTTATATACGGATGTGGAGTCGATAAATGAGATTGAAGGAATATAAATGAATTTAAGATTTATTTCGTTTGCGCTGGCTGCCG‑ACTATTTcgccgtt > 2:1306703/1‑287 (MQ=255) gCTTCAGGTCTATATTTGTGTTGAATATATTTTGCGCGGAAGTATTCATCTAACGGGGCTCTCTATTTTTTAGAATAGAGTGCATATTTTCAATTAAGACATTCTTAGAGGATAAAAAGGAATTTACTACTATCAGTGTCTTAAATAAAGTAAACGGTTATATACGGATGTGGAGTCGATAAATGAGATTGAAGGAATATATATGAAATTAAGATTTATTTCGTCTGCGCTGGCTGCCGCACTA‑TTCGCCGCTACGGGTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACa > 1:1274144/1‑289 (MQ=255) gtgtTGAATATATTTTGCGCGGAAGTATTCATCTAACGGGGCTCTCTATTTTTTAGAATAGAGTGCATATTTTCAATTAAGACATTCTTAGAGGATAAAAAGGAATTTACTACTATCAGTGTCTTAAATAAAGTAATCGGTTATATACGGATGTGGAGTCGATAAATGAGATTGAAGGAATATATATGAAATTAAGATTTATTTCGTCTGCGCTGGCTGCCGCACTA‑TTCGCCGCTACGGGTAGTTATTCTGCCGTTGTAGATGGAGGTACAATTCACTATGAAGGCGa > 2:628304/1‑289 (MQ=255) aaTATATTTTGCGCGGAAGTATTCATCTAACGGGGCTCTCTATTTTTTAGAATAGAGTGCATATTTTCAATTAAGACATTCTTAGAGGATAAAAAGGAATTTACTACTATCAGTGTCTTAAATAAAGTAATCGGTTATATACGGATGTGGAGTCGATAAATGAGATTGAAGGAATATATATGAAATTAAGATTTATTTCGTCTGCGCTGGCTGCCGCACTA‑TTCGCCGCTACGGGTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGt > 1:1618081/1‑289 (MQ=255) tatatTTTGCGCGGAAGTATTCATCTAACGGGGCTCTCTATTTTTTAGAATAGAGTGCATATTTTCAATTAAGACATTCTTAGAGGATAAAAAGGAATTTACTACTATCAGTGTCTTAAATAAAGTAATCGGTTATATACGGATGTGGAGTCGATAAATGAGATTGAAGGAATATATATGAAATTAAGATTTATTTCGTCTGCGCTGGCTGCCGCACTA‑TTCGCCGCTAc > 2:1873739/1‑230 (MQ=255) tatatTTTGCGCGGAAGTATTCATCTAACGGGGCTCTCTATTTTTTAGAATAGAGTGCATATTTTCAATTAAGACATTCTTAGAGGATAAAAAGGAATTTACTACTATCAGTGTCTTAAATAAAGTAATCGGTTATATACGGATGTGGAGTCGATAAATGAGATTGAAGGAATATATATGAAATTAAGATTTATTTCGTCTGCGCTGGCTGCCGCACTA‑TTCGCCGCTAc < 1:1873739/230‑1 (MQ=255) gcgcGGAAGTATTCATCTAACGGGGCTCTCTATTTTTTAGAATAGAGTGCATATTTTCAATTAAGACATTCTTAGAGGATAAAAAGGAATTTACTACTATCAGTGTCTTAAATAAAGTAATCGGTTATATACGGATGTGGAGTCGATAAATGAGATTGAAGGAATATATATGAAATTAAGATTTATTTCGTCTGCGCTGGCTGCCGCACTA‑TTCGCCGCTACGGGTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAAtgctg > 2:1106855/1‑287 (MQ=255) gcgcGGAAGTATTCATCTAACGGGGCTCTCTATTTTCTAGAATAGAGTGCATATTTTCAATTAAGACATTCTTAGAGGATAAAAAGGAATTTACTACTATCAGTGTCCTAAATATAGTAATCGGTTATATACGGATGTGGAGTCGATAAATGAGATTGAAGGAATATATATGAAATTAAGATTTATTTCGTCTGCGCTGGCTGCCGCACTA‑TTCGCCGCTACGGGTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAAtgctg > 2:561105/1‑287 (MQ=255) ggAAGTATTCATCTAACGGGGCTTTCTATTTTTTAGAATAGAGTGCATATTTTCAATTAAGACATTCTTAGAGGATAAAAAGGAAATTACTACTATCAGTGTCTTAAATAAAGTAATCGGTTATATACGGATGTGGAGTCGATAAATGAGATTGAAGGAATATATATGAAATTAAGATTTATTTCGTCTGCGCTGGCTGCCGCACTA‑TTCGCCGCTACGGGTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTGt < 1:1306703/288‑1 (MQ=255) ttCATCTAACGGGGCTCTCTATTTTTTAGAATAGAGTGCATATTTTCAATTAAGACATTCTTAGAGGATAAAAAGGAATTTACTACTATCAGTGTCTTAAATAAAGTAATCGGTTATATACGGATGTGGAGTCGATAAATGAGATTGAAGGAATATATATGAAATTAAGATTTATTTCGTCTGCGCTGGCTGCCGCACTA‑TTCGCCGCTACGGGTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTGttcagtgaa > 1:1916357/1‑281 (MQ=255) cTAACGGGGCTCTCTATTTTTTAGAATAGAGTGCATATTTTCAATTAAGACATTCTTAGAGGATAAAAAGGAATTTACTACTATCAGTGTCTTAAATAAAGTAATCGGTTATATACGGATGTGGAGTCGATAAATGAGATTGAAGGAATATATATGAAATTAAGATTTATTTCGTCTGCGCTGGCTGCCGCACTA‑TTCGCCGCTACGGGTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTGTTCAGTGAATACTg < 2:1618081/289‑1 (MQ=255) gCTCTCTATTTTTTAGAATAGAGTGCATATTTTCAATTAAGACATTCTTAGAGGATAAAAAGGAATTTACTACTATCAGTGTCTTAAATAAAGTAATCGGTTATATACGGATGTGGAGTCGATAAATGAGATTGAAGGAATATATATGAAATTAAGATTTATTTCGTCTGCGCTGGCTGCCGCACTA‑TTCGCCGCTACGGGTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTGTTCAGTGAATACTGActcggca > 2:597246/1‑283 (MQ=255) ctctctATTTTTTAGAATAGAGTGCATATTTTCAATTAAGACATTCTTAGAGGATAAAAAGGAATTTACTACTATCAGTGTCTTAAATAAAGTAATCGGTTATATACGGATGTGGAGTCGATAAATGAGATTGAAGGAATATATATGAAATTAAGATTTATTTCGTCTGCGCTGGCTGCCGCACTA‑TTCGCCGCTACGGGTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTGTTCAGTGAATACTGActcggcag > 2:325074/1‑282 (MQ=255) ttttAGAATAGAGTGCATATTTTCAATTAAGACATTCTTAGAGGATAAAAAGGAATTTACTACTATCAGTGTCTTAAATAAAGTAATCGGTTATATACGGATGTGGAGTCGATAAATGAGATTGAAGGAATATATATGAAATTAAGATTTATTTCGTCTGCGCTGGCTGCCGCACTA‑TTCGCCGCTACGGGTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTg > 2:1874124/1‑289 (MQ=255) agTGCATATTTTCAATTAAGACATTCTTAGAGGATAAAAAGGAATTTACTACTATCAGTGTCTTAAATAAAGTAATCGGTTATATACGGATGTGGAGTCGATAAATGAGATTGAAGGAATATATATGAAATTAAGATTTATTTCGTCTGCGCTGGCTGCCGCACTA‑TTCGCCGCTACGGGTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCgg > 1:1477468/1‑288 (MQ=255) agTGCATATTTTCAATTAAGACATTCTTAGAGGATAAAAAGGAATTTACTACTATCAGTGTCTTAAATAAAGTAATCGGTTATATACGGATGTGGAGTCGATAAATGAGATTGAAGGAATATATATGAAATTAAGATTTATTTCGTCTGCGCTGGCTGCCGCACTA‑TTCGCCGCTACGGGTAGTTATGCTGCCATTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACGCgg > 1:58466/1‑288 (MQ=255) tGCATATTTTCAATTAAGACATTCTTAGAGGATAAAAAGGAATTTACTACTATCAGTGTCTTAAATAGAGTAATCGGTTATATACGGATGTGGAGTCGATAAATGAGATTGAAGGAATATATATGAAATTAAGATTTATTTAGTCTGCGCTGGCTGCCGAACTA‑TTCGCCGCTCAGGGTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGTTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTTgggta > 1:1543044/1‑286 (MQ=255) ttCAATTAAGACATTCTTAGAGGATAAAAAGGAATTTACTACTATCAGTGTCTTAAATAAAGTAATCGGTTATATACGGATGTGGAGTCGATAAATGAGATTGAAGGAATATATATGAAATTAAGATTTATTTCGTCTGCGCTGGCTGCCGCACTA‑TTCGCCGCTACGGGTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGTa < 2:545146/289‑1 (MQ=255) cAATTAAGACATTCTTAGAGGATAAAAAGGAATTTACTACTATCAGTGTCTTAAATAAAGTAATCGGTTATATACGGATGTGGAGTCGATAAATGAGATTGAAGGAATATATATGAAATTAAGATTTATTTCGTCTGCGCTGGCTGCCGCACTA‑TTCGCCGCTACGGGTAGCTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGTAcc > 2:235703/1‑289 (MQ=255) cTTAGAGGATAAAAAGGAATTTACTACTATCAGTGTCTTAAATAAAGTAATCGGTTATATACGGATGTGGAGTCGATAAATGAGATTGAAGGAATATATATGAAATTAAGATTTATTTCGTCTGCGCTGGCTGCCGCACTA‑TTCGCCGCTACGGGTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGTACCGATATTTTCAATg < 2:1916357/289‑1 (MQ=255) aTAAAAAGGAATTTACTACTATCAGTGTCTTAAATAAAGTAATCGGTTATATACGGATGTGGAGTCGATAAATGAGATTGAAGGAATATATATGAAATTAAGATTTATTTCGTCTGCGCTGGCTGCCGCACTA‑TTCGCCGCTACGGGTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGTACCGATATTTTCAATGCTGTTgg < 1:276770/288‑1 (MQ=255) tAAAAAGGAATTTACTACTATCAGTGTCTTAAATAAAGTAATCGGTTATATACGGATGTGGAGTCGATAAATGAGATTGAAGGAATATATATGAAATTAAGATTTATTTCGTCTGCGCTGGCTGCCGCACTA‑TTCGCCGCTACGGGTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGaa > 1:170274/1‑195 (MQ=255) tAAAAAGGAATTTACTACTATCAGTGTCTTAAATAAAGTAATCGGTTATATACGGATGTGGAGTCGATAAATGAGATTGAAGGAATATATATGAAATTAAGATTTATTTCGTCTGCGCTGGCTGCCGCACTA‑TTCGCCGCTACGGGTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGaa < 2:170274/195‑1 (MQ=255) tAAAAAGGAATTTACTACTATCAGTGTCTTAAATAAAGTAATCGGTTATATACGGATGTGGAGTCGATAAATGAGATTGAAGGAATATATATGAAATTAAGATTTATTTCGTCTGCGCTGGCTGCCGCACTA‑TTCGCCGCTACGGGTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGt > 1:72903/1‑255 (MQ=255) tAAAAAGGAATTTACTACTATCAGTGTCTTAAATAAAGTAATCGGTTATATACGGATGTGGAGTCGATAAATGAGATTGAAGGAATATATATGAAATTAAGATTTATTTCGTCTGCGCTGGCTGCCGCACTA‑TTCGCCGCTACGGGTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGt < 2:72903/255‑1 (MQ=255) tAAAAAGGAATTTACTACTATCAGTGTCTTAAATAAAGTAATCGGTTATATACGGATGTGGAGTCGATAAATGAGATTGAAGGAATATATATGAAATTAAGATTTATTTCGTCTGCGCTGGCTGCCGCACTA‑TTCGCCGCTACGGGTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGTACCGATATTTTCAATGCTGTTGGTa > 1:639803/1‑289 (MQ=255) tAAAAAGGAATTTACTACTATCAGTGTCTTAAATAAAGTAATCGGTTATATACGGATGTGGAGTCGATAAATGAGATTGAAGGAATATATATGAAATTAAGATTTATTTCGTCTGCGCTGGCTGCCGCACTA‑TTCGCCGCTACGGGTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGTACCGATATTTTCAATGCTGTTGGTa > 1:1543677/1‑289 (MQ=255) tactacTATCAGTGTCTTAAATAAAGTAATCGGTTATATACGGATGTGTAGTCGATAAATGAGATTGAAGGAATATATATGAAATTAAGATTTATTTCGTCTGCGCTGGCTGCCTCACTA‑TTCGCCGCTACGGGTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCCCTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGTACCGATATTTTCAATGCTGTTGGTAATACCTCTGCAt < 1:1242231/289‑1 (MQ=255) actactATCAGTGTCTTAAATAAAGTAATCGGTTATATACGGATGTGGAGTCGATAAATGAGATTGAAGGAATATATATGAAATTAAGATTTATTTCGTCTGCGCTGGCTGCCGCACTA‑TTCGCCGCTACGGGTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGTACCGATATTTTCAATGCTGTTGGTAATACCTCTGCAtt > 2:1249436/1‑289 (MQ=255) tCAGTGTCTTAAATAAAGTAATCGGTTATATACGGATGTGGAGTCGATAAATGAGATTGAAGGAATATATATGAAATTAAGATTTATTTCGTCTGCGCTGGCTGCCGCACTA‑TTCGCCGCTACGGGTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAata < 1:740657/240‑1 (MQ=255) tCAGTGTCTTAAATAAAGTAATCGGTTATATACGGATGTGGAGTCGATAAATGAGATTGAAGGAATATATATGAAATTAAGATTTATTTCGTCTGCGCTGGCTGCCGCACTA‑TTCGCCGCTACGGGTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAata > 2:740657/1‑240 (MQ=255) tCAGTGTCTTAAATAAAGTAATCGGTTATATACGGATGTGGAGTCGATAAATGAGATTGAAGGAATATATATGAAATTAAGATTTATTTCGTCTGCGCTGGCTGCCGCACTA‑TTCGCCGCTACGGGTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGTACCGATATTTTCAATGCTGTTGGTAATACCTCTGCATTAATTcca > 1:974923/1‑289 (MQ=255) gtCTTAAATAAAGTAATCGGTTATATACGGATGTGGAGTCGATAAATGAGATTGAAGGAATATATATGAAATTAAGATTTATTTCGTCTGCGCTGGCTGCCGCACTA‑TTCGCCGCTACGGGTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGTACCGCTATTTTCAATGCTGTTGGTACTACCTCTGCATTAATTccattca > 2:39655/1‑288 (MQ=255) gtCTTAAATAAAGTAATCGGTTATATACGGATGTGGAGTCGATAAATGAGATTGAAGGAATATATATGAAATTAAGATTTATTTCGTCTGCGCTGGCTGCCGCACTA‑TTCGCCGCTACGGGTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGTACCGATATTTTCAATGCTGTTGGTAATACCTCTGCATTAATTccattca > 1:460131/1‑288 (MQ=255) cTTAAATAAAGTAATCGGTTATATACGGATGTGGAGTCGATAAATGAGATTGAAGGAATATATATGAAATTAAGATTTATTTCGTCTGCGCTGGCTGCCGCACTA‑TTCGCCGCTACGGGTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGTACCGATATTTTCAATGCTGTTGGTAATACCTCTGCATTAATTccattcacca < 1:1249436/289‑1 (MQ=255) ttAAATAAAGTAATCGGTTATATACGGATGTGGAGTCGATAAATGAGATTGAAGGAATATATATGAAATTAAGATTTATTTCGTCTGCGCTGGCTGCCGCACTA‑TTCGCCGCTACTGGTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCa < 2:52575/211‑1 (MQ=255) ttAAATAAAGTAATCGGTTATATACGGATGTGGAGTCGATAAATGAGATTGAAGGAATATATATGAAATTAAGATTTATTTCGTCTGCGCTGGCTGCCGCACTA‑TTCGCCGCTACTGGTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCa > 1:52575/1‑211 (MQ=255) taaataaaGTAATCGGTTATATACGGATGTGGAGTCGATAAATGAGATTGAAGGAATATATATGAAATTAAGATTTATTTCGTCTGCGCTGGCTGCCGCACTA‑TTCGCCGCTACGGGTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGTACCGATATTTTCAATGCTGTTGGTAATACCTCTGCATTAATTccattcaccatt < 1:538137/289‑1 (MQ=255) aaataaaGTAATCGGTTATATACGGATGTGGAGTCGATAAATGAGATTGAAGGAATATATATGAAATTAAGATTTATTTCGTCTGCGCTGGCTGCCGCACTA‑TTCGCCGCTACGGGTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGTACCGATATTTTCAATGCTGTTGGTAAt < 2:1882144/261‑1 (MQ=255) aaataaaGTAATCGGTTATATACGGATGTGGAGTCGATAAATGAGATTGAAGGAATATATATGAAATTAAGATTTATTTCGTCTGCGCTGGCTGCCGCACTA‑TTCGCCGCTACGGGTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGTACCGATATTTTCAATGCTGTTGGTAAt > 1:1882144/1‑261 (MQ=255) aaGTAATCGGTTATATACGGATGTGGAGTCGATAAATGAGATTGAAGGAATATATATGAAATTAAGATTTATTTCGTCTGCGCTGGCTGCCGCACTA‑TTCGCCGCTACGGGTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGTACCGATATTTTCAATGCTGTTGGTAATACCTCTGCATTAATTCCATTCACCATTCAGTTg < 2:1543677/289‑1 (MQ=255) aGTAATCGGTTATATACGGATGTGGAGTCGATAAATGAGATTGAAGGAATATATATGAAATTAAGATTTATTTCGTCTGCGCTGGCTGCCGCACTA‑TTCGCCGCTACGGGTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACCGTCGGGCAATATCGTACGGATAGGTTCAATTCTGTTGGTAATAGTTGGGGATTAATGCCATGCACCATTCAGTTGa > 2:425433/1‑289 (MQ=255) aGTAATCGGTTATATACGGATGTGGAGTCGATAAATGAGATTGAAGGAATATATATGAAATTAAGATTTATTTCGTCTGCGCTGGCTGCCGCACTA‑TTCGCCGCTACGGGTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGTACCGATATTTTCAATGCTGTTGGTAATACCTCTGCATTAATTCCATTCACCATTCAGTTGa > 2:1752138/1‑289 (MQ=255) aGTAATCGGTTATATACGGATGTGGAGTCGATAAATGAGATTGAAGGAATATATATGAAATTAAGATTTATTTCGTCTGCGCTGGCTGCCGCACTA‑TTCGCCGCTACGGGTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGTACCGATATTTTCAATGCTGTTGGTAATACCTCTGCATTAATTCCATTCACCATTCAGTTGa > 2:1287293/1‑289 (MQ=255) aGTAATCGGTTATATACGGATGTGGAGTCGATAAATGAGATTGAAGGAATATATATGAAATTAAGATTTATTTCGTCTGCGCTGGCTGCCGCACTA‑TTCGCCGCTACGGGTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGTACCGATATTTTCAATGCTGTTGGTAATACCTCTGCATTAATTCCATTCACCATTCAGTTGa > 2:900210/1‑289 (MQ=255) tAATCGGTTATATACGGATGTGGAGTCGATAAATGAGATTGAAGGAATATATATGAAATTAAGATTTATTTCGTCTGCGCTGGCTGCCGCACTA‑TTCGCCGCTACGGGTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGTACCGATATTTTCAATGCTGTTGGTAATACCTCTGCATTAATTCCATTCACCATTCAGTTGAAc > 1:98046/1‑289 (MQ=255) tCGGTTATATACGGATGTGGAGTCGATAAATGAGATTGAAGGAATATATATGAAATTAAGATTTATTTCGTCTGCGCTGGCTGCCGCACTA‑TTCGCCGCTACGGGTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGTACCGATATTTTCAATGCTGTTGGTAATACCTCTGCATTAATTCCATTCACCATTCAGTTGAACg > 2:1332833/1‑287 (MQ=255) aTGTGGAGTCGCTAAAGGAGATGGAAGGAATATATATGAAATTAAGATTTATTTCGTCTGCGCTGGCTGCCGCACTA‑ATCGCCGCTACGGGTAGTTATACTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGGTAATGCTGCCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCATACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGTACCGATATTTTCAATGCTGTTGGTAATACCTATGCATTAATTCCATTCACCATTCAGTTTAACGACAGCGAACCtgtt > 2:881082/1‑287 (MQ=255) aTGTGGAGTCGATAAATGAGATTGAAGGAATATATATGAAATTAAGATTTATTTCGTCTGCgct < 1:1239762/64‑1 (MQ=255) aTGTGGAGTCGATAAATGAGATTGAAGGAATATATATGAAATTAAGATTTATTTCGTCTGCgct > 2:1239762/1‑64 (MQ=255) aTGTGGAGTCGATAAATGAGATTGAAGGAATATATATGAAATTAAGATTTATTTCGTCTGCGCTGGCTGCCGCACTA‑TTCGCCGCTACGGGTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGTACCGATATTTTCAATGCTGTTGGTAATACCTCTGCATTAATTCCATTCACCCTTCAGTTGAACGACTGCGATCCtgttgt > 2:1053119/1‑289 (MQ=255) aTGTGGAGTCGATAAATGAGATTGAAGGAATATATATGAAATTAAGATTTATTTCGTCTGCGCTGGCTGCCGCACTA‑TTCGCCGCTACGGGTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGTACCGATATTTTCAATGCTGTTGGTAATACCTCTGCATTAATTCCATTCACCATTCAGTTTAACGACTGCGATCCtgttgt > 2:1886449/1‑289 (MQ=255) aTGTGGAGTCGATAAATGAGATTGAAGGAATATATATGAAATTAAGATTTATTTCGTCTGCGCTGGCTGCCGCACTA‑TTCGCCGCTACGGGTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGTACCGATATTTTCAATGCTGTTGGTAATACCTCTGCATTAATTCCATTCACCATTCAGTTGAACGACTGCGATCCtgttgt > 2:817886/1‑289 (MQ=255) aTGTGGAGTCGATAAATGAGATTGAAGGAATATATATGAAATTAAGATTTATTTCGTCTGCGCTGGCTGCCGCACTA‑TTCGCCGCTACGGGTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGTACCGATATTTTCAATGCTGTTGGTAATACCTCTGCATTAATTCCATTCACCATTCAGTTGAACGACTGCGATCCtgttgt > 1:1000343/1‑289 (MQ=255) aTGTGGAGTCGATAAATGAGATTGAAGGAATATATATGAAATTAAGATTTATTTCGTCTGCGCTGGCTGCCGCACTA‑TTCGCCGCTACGGGTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGTACCGATATTTTCAATGCTGTTGGTAATACCTCTGCATTAATTCCATTCACCATTCAGTTGAACGACTGCGATCCtgttgt > 2:704487/1‑289 (MQ=255) aTGTGGAGTCGATAAATGAGATTGAAGGAATATATATGAAATTAAGATTTATTTCGTCTGCGCTGGCTGCCGCACTA‑TTCGCCGCTACGGGTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTAAATGCTGCCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGTACCGATATTTTCAATGCTGTTGGTAATACCTCTGCATTAATTCCATTCACCATTCAGTTGAACGACTGCGATCCtgttgt > 1:1729530/1‑289 (MQ=255) tgGAGTCGATAAATGAGATTGAAGGAATATATATGAAATTAAGATTTATTTCGTCTGCGCTGGCTGCCGCACTA‑TTCGCCGCTACGGGTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGTACCGATATTTTCAATGCTGTTGGTAATACCTCTGCATTAATTccatt < 2:1632802/253‑1 (MQ=255) tgGAGTCGATAAATGAGATTGAAGGAATATATATGAAATTAAGATTTATTTCGTCTGCGCTGGCTGCCGCACTA‑TTCGCCGCTACGGGTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGTACCGATATTTTCAATGCTGTTGGTAATACCTCTGCATTAATTccatt > 1:1632802/1‑253 (MQ=255) tgGAGTCGATAAATGAGATTGAAGGAATATATATGAAATTAAGATTTATTTCGTCTGCGCTGGCTGCCGCACTA‑TTCGCCGCTACGGGTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGTACCGATATTTTCAATGCTGTTGGTAATACCTCTGCATTAATTCCCTTCACCATTCAGTTGAACGACTTCGATCCTTttgttg > 2:1795878/1‑288 (MQ=255) tgGAGTCGATAAATGAGATTGAAGGAATATATATGAAATTAAGATTTATTTCGTCTGCGCTGGCTGCCGCACTA‑TTCGCCGCTACGGGTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGTACCGATATTTTCAATGCTGTTGGTAATACCTCTGCATTAATTCCATTCACCCTTCAGTTGACCAACTGCGATCCTGttgttg > 2:1189838/1‑288 (MQ=255) tgGAGTCGATAAATGAGATTGAAGGAATATATATGAAATTAAGATTTATTTCGTCTGCGCTGGCTGCCGCACTA‑TTCGCCGCTACGGGTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGTACCGATATTTTCAATGCTGTTGGTAATACCTCTGCATTAATTCCATTCACCATTCAGTTGAACGACTGCGATCCTGttgttg > 1:42541/1‑288 (MQ=255) tgGAGTCGATAAATGAGATTGAAGGAATATATATGAAATTAAGATTTATTTCGTCTGCGCTGGCTGCCGCACTA‑TTCGCCGCTACGGGTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGTACCGATATTTTCAATGCTGTTGGTAATACCTCTGCATTAATTCCATTCACCATTCAGTTGAACGACTGCGATCCTGttgttg > 1:1907408/1‑288 (MQ=255) tgGAGTCGATAAATGAGATTGAAGGAATATATATGAAATTAAGATTTATTTCGTCTGCGCTGGCTGCCGCACTA‑TTCGCCGCTACGGGTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGTACCGATATTTTCAATGCTGTTGGTAATACCTCTGCATTAATTCCATTCACCATTCAGTTGAACGACTGCGATCCTGttgttg > 1:1831729/1‑288 (MQ=255) tgGAGTCGATAAATGAGATTGAAGGAATATATATGAAATTAAGATTTATTTCGTCTGCGCTGGCTGCCGCACTA‑TTCGCCGCTACGGGTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGTACCGATATTTTCAATGCTGTTGGTAATACCTCTGCATTAATTCCATTCACCATTCAGTTGAACGACTGCGATCCTGttgttg > 2:498262/1‑288 (MQ=255) tgGAGTCGATAAATGAGATTGAAGGAATATATATGAAATTAAGATTTATTTCGTCTGCGCTGGCTGCCGCACTA‑TTCGCCGCTACGGGTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGTACCGATATTTTCAATGCTGTTGGTAATACCTCTGCATTAATTCCATTCACCATTCAGTTGAACGACTGCGATCCTGttgttg > 1:1593584/1‑288 (MQ=255) tgGAGTCGATAAATGAGATTGAAGGAATATATATGAAATTAAGATTTATTTCGTCTGCGCTGGCTGCCGCACTA‑TTCGCCGCTACGGGTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATACACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGTACCGat < 2:1627353/212‑1 (MQ=255) tgGAGTCGATAAATGAGATTGAAGGAATATATATGAAATTAAGATTTATTTCGTCTGCGCTGGCTGCCGCACTA‑TTCGCCGCTACGGGTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATACACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGTACCGat > 1:1627353/1‑212 (MQ=255) gAGTCGATAAATGAGATTGAAGGAATATATATGAAATTAAGATTTATTTCGTCTGCGCTGGCTGCCGCACTA‑TTCGCCGCTACGGGTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGTACCGATATTTTCAATGCTGTTGGTAATACCTCTGCATTAATTCCATTCACCATTCAGTTGAACGACTGCGATCCTGTTGTTGcc > 2:1939498/1‑288 (MQ=255) aGTCGATAAATGAGATTGAAGGAATATATATGAAATTAAGATTTATTTCGTCTGCGCTGGCTGCCGCACTA‑TTCGCCGCTACGGGTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGTACCGATATTTTCAATGCTGTTGGTAATACCTCTGCATTAATTCCATTCACCATTCAGTTGAACGACTGCGATCCTGTTGTTGcc > 2:58799/1‑287 (MQ=255) tCGATAAATGAGATTGAAGGAATATATATGAAATTAAGATTTATTTCGTCTGCGCTGGCTGCCGCACTA‑TTCGCCGCTACGGGTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGTACCGATATTTTCAATGCTGTTGGTAATACCTCTGCATTAATTCCATTCACCATTCAGTTGAACGACTGCGATCCTGTTGTTGCCGCTa > 1:296436/1‑289 (MQ=255) gATAAATGAGATTGAAGGAATATATATGAAATTAAGATTTATTTCGTCTGCGCTGGCTGCCGCACTA‑TTCGCCGCTACGGGTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGTACCGATATTTTCAATGCTg < 1:1151495/218‑1 (MQ=255) gATAAATGAGATTGAAGGAATATATATGAAATTAAGATTTATTTCGTCTGCGCTGGCTGCCGCACTA‑TTCGCCGCTACGGGTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGTACCGATATTTTCAATGCTg > 2:1151495/1‑218 (MQ=255) gATAAATGAGATTGAAGGAATATATATGAAATTAAGATTTATTTCGTCTGCGCTGGCTGCCGCACTA‑TTCGCCGCTACGGGTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGTACCGATATTTTCAATGCTGTTGGTAATACctc < 2:1796071/231‑1 (MQ=255) gATAAATGAGATTGAAGGAATATATATGAAATTAAGATTTATTTCGTCTGCGCTGGCTGCCGCACTA‑TTCGCCGCTACGGGTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGTACCGATATTTTCAATGCTGTTGGTAATACctc > 1:1796071/1‑231 (MQ=255) gATAAATGAGATTGAAGGAATATATATGAAATTAAGATTTATTTCGTCTGCGCTGGCTGCCGCACTA‑TTCGCCGCTACGGGTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGTACCGATATTTTCAATGCTGTTGGTAATACCTCTGCATTAATTCCATTCACCATTCAGTTGAACGACTGCGATCCTGTTGTTGCCGCTaa > 2:1129409/1‑288 (MQ=255) gATAAATGAGATTGAAGGAATATATATGAAATTAAGATTTATTTCGTCTGCGCTGGCTGCCGCACTA‑TTCGCCGCTACGGGTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGTACCGATATTTTCAATGCTGTTGGTAATACCTCTGCATTAATTCCATTCACCATTCAGTTGAACGACTGCGATCCTGTTGTTGCCGCTAAt > 1:465743/1‑289 (MQ=255) gATAAATGAGATTGAAGGAATATATATGAAATTAAGATTTATTTCGTCTGCGCTGGCTGCCGCACTA‑TTCGCCGCTACGGGTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGTACCGATATTTTCAATGCTGTTGGTAATACCTCTGCATTAATTCCATTCACCATTCAGTTGAACGACTGCGATCCTGTTGTTGCCGCTAAt > 1:763223/1‑289 (MQ=255) gATAAATGAGATTGAAGGAATATATATGAAACCCAGACTTATTCCGTCCCCGCTCTCTGCCGCACCA‑TTCGCCGCTACGGGTCGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCTCACTCGGTCAATATCGTACCGATATTTTCAATGCTGTTGGTAATACCTCTGCATTAATTCCATTCCCCATTCAGCTGAACGACTGCGATACCGTTGTTGCCGCTAAt > 2:1822332/1‑289 (MQ=255) tAAATGAGATTGAAGGAATATATATGAAATTAAGATTTATTTCGTCTGCGCTGGCTGCCGCACTA‑TTCGCCGCTACGGGTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGTACCGATATTTTCAATGCTGTTGGTAATACCTCTGCATTAATTCCATTCACCATTCAGTTGAACGACTGCGATCCTGTTGTTGCCGCTAAtgc < 1:1886449/289‑1 (MQ=255) tGAAGGAATATATATGAAATTAAGATTTATTTCGTCTGCGCTGGCTGCCGCACTA‑TTCGCCGCTACGGGTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGTACCGATATTTTCAATGCTGTTGGTAATACCTCTGCATTAATTCCATTCACCATTCAGTTGAACGACTGCGATCCTGTTGTTGCCGCTAATGCTGCCGTTGCa > 1:492258/1‑289 (MQ=255) aGGAATATATATGAAATTAAGATTTATTTCGTCTGCGCTGGCTGCCGCACTA‑TTCGCCGCTACGGGTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGTACCGATATTTTCAATGCTGTTGGTAATACCTCTGCATTAATTCCATTCACCATTCAGTTGAACGACTGCGATCCTGTTGTTGCCGCTAATGCTGCCGTTGCAttt < 1:817886/289‑1 (MQ=255) ggAATATATATGAAATTAAGATTTATTTCGTCTGCGCTGGCTGCTGCACTA‑TTCGCCGCTACGGGTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGTACCGATATTTTCAATGCTGTTGGTAATACCTCTGCATTAATTCCATTCACCATTCAGTTGAACGACTGCGATCCTGTTGTTGCAGCTAATGCTGCCGTTGCAttt > 2:1164634/1‑288 (MQ=255) aaTATATATGAAATTAAGATTTATTTCGTCTGCGCTGGCTGCCGCACTA‑TTCGCCGCTACGGGTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGTACCGATATTTTCAATGCTGTTGGTAATACCTCTGCATTAATTCCATTCACCATTCAGTTGAACGACTGCGATCCTGTTGTTGCCGCTAATGCTGCCGTTGCAtttt < 1:976964/287‑1 (MQ=255) tatatatGAAATTAAGATTTATTTCGTCTGCGCTGGCTGCCGCACTA‑TTCGCCGCTACGGGTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGTACCGATATTTTCAATGCTGTTGGTAATACCTCTGCATTAATTCCATTCACCATTCAGTTGAACGACTGCGATCCTGTTGTTGCCGCTAATGCTGCCGTTGCATTTTCTgg > 2:473555/1‑289 (MQ=255) atatatGAAATTAAGATTTATTTCGTCTGCGCTGGCTGCCGCACTA‑TTCGCCGCTACGGGTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGTACCGATATTTTCAATGCTGTTGGTAATACCTCTGCATTAATTCCATTCACCATTCAGTTGAACGACTGCGATCCTGTTGTTGCCGCTAATGCTGCCGTTGCATTTTCTgg > 1:827784/1‑288 (MQ=255) atatatGAAATTAAGATTTATTTCGTCTGCGCTGGCTGCCGCACTA‑TTCGCCGCTACGGGTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGTACCGATATTTTCAATGCTGTTGGTAATACCTCTGCATTAATTCCATTCACCATTCAGTTGAACGACTGCGATCCTGTTGTTGCCGCTAATGCTGCCGTTGCATTTTCTGGt < 1:1106855/289‑1 (MQ=255) atatatGAAATTAAGATTTATTTCGTCTGCGCTGGCTGCCGCACTA‑TTCGCCGCTACGGGTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGTACCGATATTTTCAATGCTGTTGGTAATACCTCTGCATTAATTCCATTCACCATTCAGTTGAACGACTGCGATCCTGTTGTTGCCGCTAATGCTGCCGTTGCATTTTCTGGt < 1:628304/289‑1 (MQ=255) atGAAATTAAGATTTATTTCGTCTGCGCTGGCTGCCGCACTA‑TTCGCCGCTACGGGTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGTACCGATATTTTCAATGCTGTTGGTAATACCTCTGCATTAATTCCATTCACCATTCAGTTGAACGACTGCGATCCTGTTGTTGCCGCTAATGCTGCCGTTGCATTTTCTGGTCAgg < 1:235703/289‑1 (MQ=255) aaaTTAAGATTTATTTCGTCTGCGCTGGCTGCCGCACTA‑TTCGCCGCTACGGGTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGTACCGATATTTTCAATGCTGTTGGTAATACCTCTGCATTAATTCCATTCACCATTCAGTTGAACGACTGCGATCCTGTTGTTGCCGCTAATGCTGCCGTTGCATTTTCTGGTCAGGCTg > 2:1326386/1‑289 (MQ=255) aaaTTAAGATTTATTTCGTCTGCGCTGGCTGCCGCACTA‑TTCGCCGCTACGGGTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGTACCGATATTTTCAATGCTGTTGGTAATACCTCTGCATTAATTCCATTCACCATTCAGTTGAACGACTGCGATCCTGTTGTTGCCGCTAATGCTGCCGTTGCATTTTCTGGTCAGGCTg > 1:829123/1‑289 (MQ=255) aTTAAGATTTATTTCGTCTGCGCTGGCTGCCGCACTA‑TTCGCCGCTACGGGTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGTACCGATATTTTCAATGCTGTTGGTAATACCTCTGCATTAATTCCATTCACCATTCAGTTGAACGACTGCGATCCTGTTGTTGCCGCTAATGCTGCCGTTGCATTTTCTGGTCAgg > 2:1369119/1‑284 (MQ=255) aTTAAGATTTATTTCGTCTGCGCTGGCTGCCGCACTA‑TTCGCCGCTACGGGTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGTACCGATATTTTCAATGCTGTTGGTAATACCTCTGCATTAATTCCATTCACCATTCAGTTGAACGACTGCGATCCTGTTGTTGCCGCTAATGCTGCCGTTGCATTTTCTGGTCAgg < 1:1369119/284‑1 (MQ=255) aTTAAGATTTATTTCGTCTGCGCTGGCTGCCGCACTA‑TTCGCCGCTACGGGTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGTACCGATATTTTCAATGCTGTTGGTAATACCTCTGCATTAATTCCATTCACCATTCAGTTGAACGACTGCGATCCTGTTGTTGCCGCTAATGCTGCCGTTGCATTTTCTGGTCAGGCTGAt > 1:1734455/1‑289 (MQ=255) aTTAAGATTTATTTCGTCTGCGCTGGCTGCCGCACTA‑TTCGCCGCTACGGGTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGTACCGATATTTTCAATGCTGTTGGTAATACCTCTGCATTAATTCCATTCAACATTCTGTTGAACGACTGCGATCCTGTTGTTGCCGCTAATGCTGCCGTTGCATTTTCTGTTCAggatact > 2:1215365/1‑284 (MQ=255) aaGATTTATTTCGTCTGCGCTGGCTGCCGCACTA‑TTCGCCGCTACGGGTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTGTTCAGTGAATACTGActc < 1:1790151/132‑3 (MQ=255) aaGATTTATTTCGTCTGCGCTGGCTGCCGCACTA‑TTCGCCGCTACGGGTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTGTTCAGTGAATACTGActc > 2:1790151/1‑130 (MQ=255) aaGATTTATTTCGTCTGCGCTGGCTGCCGCACTA‑TTCGCCGCTACGGGTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGTACCGATATTTTCAATGCTGTTGGTAATACCTCTGCATTAATTCCATTCACCATTCAGTTGAACGACTGCGATCCTGTTGTTGCCGCTAATGCTGCCGTTGCATTTTCTGGTCAGGCTGATGca < 1:597246/289‑1 (MQ=255) aGATTTATTTCGTCTGCGCTGGCTGCCGCACTA‑TTCGCCGCTACGGGTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGTACCGATATTTTCAATGCTGTTGGTAATACCTCTGCATTAATTCCATTCACCATTCAGTTGAACGACTGCGATCCTGTTGTTGCCGCTAATGCTTCCGTTGCATTTTCTGGTCAGGCTGATGcaa > 2:647220/1‑289 (MQ=255) aGATTTATTTCGTCTGCGCTGGCTGCCGCACTA‑TTCGCCGCTACGGGTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTGTTCAGTGAATACTGACTCGGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGTACCGATATTTTCAATGCTGTTGGTAATACCTCTGCATTAATTCCATTCACCATTCAGTTGAACGACTGCGATCCTGTTGTTGCCGCTAATGCTGCCGTTGCATTTTCTGGTCAGGCTGATGcaa > 2:1811509/1‑289 (MQ=255) ||| AATTTAAGAAATACCTGACAATATAAAAAGAATTTTCAGCCTGGTAATTTACCGCTTCAGGTCTATATTTGTGTTGAATATATTTTGCGCGGAAGTATTCATCTAACGGGGCTCTCTATTTTTTAGAATAGAGTGCATATTTTCAATTAAGACATTCTTAGAGGATAAAAAGGAATTTACTACTATCAGTGTCTTAAATAAAGTAATCGGTTATATACGGATGTGGAGTCGATAAATGAGATTGAAGGAATATATATGAAATTAAGATTTATTAGCTCTGCGCTGGCTGCCGCACTA‑TTCGCCGCTACGGGTAGTTATGCTGCCGTTGTAGATGGCGGTACAATTCACTTTGAAGGCGAACTGGTGAATGCTGCCTGTAGTGTGAATACTGACAGCGCAGACCAGGTTGTCACACTCGGTCAATATCGTACCGATATTTTCAATGCTGTTGGTAATACCTCTGCATTAATTCCATTCACCATTCAGTTGAACGACTGCGATCCTGTTGTTGCCGCTAATGCTGCCGTTGCATTTTCTGGTCAGGCTGATGCAA > CP042583/458463‑459015 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |