| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | CP042583 | 675,781 | A→G | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP042583 | 675,781 | 0 | A | G | 99.7% | 730.4 / NA | 307 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
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| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.92e-01 | |||||||||||
Only 100 of 307 total aligned reads displayed.
TTGCAGATTGGGTAACACAGGAACAACTGCCGGTGATACTGGTAGTTGGTGTGAAACTCGGCTGTATTAATCACGCGATGTTGACTGCACAGGTAATACAACACGCCGGACTGACTCTGGCGGGTTGGGTGGCGAACGATGTTACGCCTCCGGGAAAACGTCACGCTGAATATATGACCACGCTCACCCGCATGATTCCCGCGCCGCTGCTGGGAGAGATCCCCTGGCTTGCAGAAAATCCAGAAAATGCGGCAACCGGAAAGTACATAAA‑CCTTGCCTTGTTGTAACCATTCTGTATTTGGTTAAATTGCGAGCGAGATCGCGTCTTCGATTGACTGCAATTTAACCAATTAAATTCTAAAATAATCACGAAAAAAATTTTACTTCCGCCTCATGCGGCGAATGTGGGAATTGCCCAGGCGGCGGGGGATAGGGGCTGGAGACAGTTATCCACTATTCCTGTGGATAACCATGTGTATTAGAGTTAGAAAACACGAGGCAAGCGAGAGAATACGCGGCTTGCACGCGAATTGGCGTTAAAGACGGCTCAAAGAAATATCTTTTATTTTTTA > CP042583/675495‑676066 | cacaGGAACAACTGCCGGTGATACTGGTAGTTGGTGTGAAACTCGGCTGTATTAATCACGCGATGTTGACTGCACAGGTAATACAACACGCCGGACTGACTCTGGCGGGTTGGGTGGCGAACGATGTTACGCCTCCGGGAAAACGTCACGCTGAATATATGACCACGCTCACCCGCATGATTCCCGCGCCGCTGCTGGGAGAGATCCCCTGGCTTGCAGAAAATCCAGAAAATGCGGCAACCGGAAAGTACATAAA‑CCTTGCCTTGTTGTAGCCATTCTGTATTTGGtt > 2:1355846/1‑289 (MQ=255) gAACAACTGCCGGTGATACTGGTAGTTGGTGTGAAACTCGGCTGTATTAATCACGCGATGTTGACTGCACAGGTAATACAACACGCCGGACTGACTCTGGCGGGTTGGGTGGCGAACGATGTTACGCCTCCGGGAAAACGTCACGCTGAATATATGACCACGCTCACCCGCATGATTCCCGCGCCGCTGCTGGGAGAGATCCCCTGGCTTGCAGAAAATCCAGAAAATGCGGCAACCGGAAAGTACATAAA‑CCTTGCCTTGTTGTAGCCATTCTGTATTTGGTTAAAtt > 1:1922398/1‑289 (MQ=255) gAACAACTGCCGGTGATACTGGTAGTTGGTGTGAAACTCGGCTGTATTAATCACGCGATGTTGACTGCACAGGTAATACAACACGCCGGACTGACTCTGGCGGGTTGGGTGGCGAACGATGTTACGCCTCCGGGAAAACGTCACGCTGAATATATGACCACGCTCACCCGCATGATTCCCGCGCCGCTGCTGGGAGAGATCCCCTGGCTTGCAGAAAATCCAGAAAATGCGGCAACCGGAAAGTACATAAA‑CCTTGCCTTGTTGTAGCCATTCTGTATTTGGTTAAAtt > 2:747125/1‑289 (MQ=255) cTGCCGGTGATACTGGTAGTTGGTGTGAAACTCGGCTGTATTAATCACGCGATGTTGACTGCACAGGTAATACAACACGCCGGACTGACTCTGGCGGGTTGGGTGGCGAACGATGTTACGCCTCCGGGAAAACGTCACGCTGAATATATGACCACGCTCACCCGCATGATTCCCGCGCCGCTGCTGGGAGAGATCCCCGGGCTTGCAGAAAATCCAGAAAATGCGGCAACCGGAAAGTACATAAA‑CCTTGCCTTGTTGTAGCCATTCTGTATTTGGTTAAATCtcgaga > 2:2508182/1‑288 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |