Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 711,779 | 3 bp→TGA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 711,779 | 0 | A | T | 100.0% | 960.1 / NA | 395 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base T (179/216); total (179/216) | |||||||||||
* | CP042583 | 711,780 | 0 | C | G | 99.8% | 951.9 / NA | 395 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base G (179/215); minor base T (0/1); total (179/216) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 711,781 | 0 | T | A | 100.0% | 946.4 / NA | 395 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base A (179/216); total (179/216) |
Only 100 of 395 total aligned reads displayed.
GGTTTTGCTGTTGATAACTTGAGTGGTCCCCAGAGCTACACCGCCCAGCTGCACTGCACGTTCTGCCATGGTATCCAGATGATCGATCAGTGCGGTGCGGAAGCCATCCAGCATTTCATGTACGGCAATGAAGTTAGCGCCGCGCATGTTCCAGTGCGCTTGTTTGGTAATCAAAGAAAGATCAATAAACTGGATAACCTGGCGATTCAGCAACTCTACTGTTGCTTTTTTCTCGCTGTCGGAGACATCGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTACTTTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTCATATCCTCTTGATGTTATGTCCCAGTAATTAACGAGATTAAGTATAGCACCGGCTATGTGTTCCGCTATTCTGGCTGTTCCTATCACACTAATAGTGGTAACAAGCGTGAAAAACAAAACTAATAAAGATTCAATGAGTTAGATATATTGATAAGAACAATTCTTATTTATCTGCTCGCCAGGAATTTTCGGAATAAATATGCTTTTGCATAATTCGATATATAAAGACGGTGTAGAGGAAAAGTAGCG > CP042583/711500‑712060 ||| tGTTGATAACTTGAGAGGTCCCCAGAGCTACACCGCCCAGCTGCACTGCACGTTCTGCCATGGTATCCAGATGATCGATCAGTGCGGTGCGGAAGCCATCCAGCATTTCATGTACGGCAATGAAGTTAGCGCCGCGCATGTTCCAGTGCGCTTGTTTGGTAATCAAAGAAAGATCAATAAACTGGATAACCTGGCGATTCAGCAACTCTACTGTTGCTTTTTTCTCGCTGTCGGAGACATCGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAg < 1:1807487/288‑1 (MQ=255) gATAACTTTGTTGGGCCCCCGAGCTCAACCGCCCAGCTGAACTGCACGTTCTGCCATGGTATCCAGATGATCGATCAGTGCGGTGCGGAAGCCATCCAGCATTTCATGTACGGCAATGAAGTTAGCGCCGCGCATGTTCCAGTGCGCTTGTTTGGTAATCAAAGAAAGATCAATAAACTGGATAACCTGGCGATTCAGCAACTCTACTGTTGCTTTTTTCTCGCTGTCGGAGACATCGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTa < 2:1056953/289‑1 (MQ=255) gATAACTTGAGTGGTCCCCAGAGCTACACCGCCCAGCTGCACTGCACGTTCTGCCATGGTATCCAGATGATCGATCAGTGCGGTGCGGAAGCCATCCAGCATTTCATGTACGGCAATGAAGTTAGCGCCGCGCATGTTCCAGTGCGCTTGTTTGGTAATCAAAGAAAGATCAATAAACTGGATAACCTGGCGATTCAGCAACTCTACTGTTGCTTTTTTCTCGCTGTCGGAGACATCGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTa < 1:676837/289‑1 (MQ=255) aaCTTGAGTGGTCCCCAGAGCTACACCGCCCAGCTGCACTGCACGTTCTGCCATGGTATCCAGATGATCGATCAGTGCGGTGCGGAAGCCATCCAGCATTTCATGTACGGCAATGAAGTTAGCGCCGCGCATGTTCCAGTGCGCTTGTTTGGTAATCAAAGAAAGATCAATAAACTGGATAACCTGGCGATTCAGCAACTCTACTGTTGCTTTTTTCTCGCTGTCGGAGACATCGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTACTc < 1:722464/289‑1 (MQ=255) cTTGAGTGGTCCCCAGAGCTACACCGCCCAGCTGCACTGCACGTTCTGCCATGGTATCCAGATGAGCGATCAGTGCGGTGCGGAAGCCATCCAGCATTTCATGTACGGCAATGAAGTTAGCGCCGCGCATGTTCCAGTGCGCTTGTTTGGTAATCAAAGAAAGATCAATAATCTGCATAACCTGGCGGTTCAGCAACTCTACTGTTGCTGTTTTCTCGCTGTCAGAGCCTTGGGTGCGGGTATAAAGCAGTTTGGTCGCTTTTGACTTGACTGATTTAGGGGAACTAAt > 2:299056/1‑289 (MQ=255) tGGTCCCCAGAGCTACACCGCCCAGCTGCACTGCACGTTCTGCCATGGTATCCAGATGATCGATCAGTGCGGTGCGGAAGCCATCCAGCATTTCATGTACGGCAATGAAGTTAGCGCCGCGCATGTTCCAGTGCGCTTGTTTGGTAATCAAAGAAAGATCAATAAACTGGATAACCTGGCGATTCAGCAACTCTACTGTTGCTTTTTTCTCGCTGTCGGAGACATCGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTc > 2:243784/1‑289 (MQ=255) ccccAGAGCTACCCCGCCCTGCTGCACTGCACGTTCTGCCATGGTATCCAGATGATCGTTCAGTGCGGTGCGGAAGCCATCCAGCATTTCATGTACGGCAATGAAGTTAGCGCCGCGCATGTTCCAGTGCGCTTGTTTGGTAATCAAAGAAAGATCAATAAACTGGATAACCTGGCGATTCAGCAACTCTACTGTTGCTTTTTTCTCGCTGTCGGAGACATCGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTCata < 1:1042994/288‑1 (MQ=255) ccccAGAGCTACCCCGCCCAGCTGCACTGCACGTTCTGCCATGGTATTCAGATGATCGATAAGTGCGGTGCGGAAGCCATCCAGCATTTCATGTACGGCAATGAAGTTAGCGCCGCGCATGTTCCAGTGCGCTTGTTTGGTAATCAAAGAAAGATCAATAAACTGGATAACCTGGCGATTCAGCAACTCTACTGTTGCTTTTTTCTCGCTGTCGGAGACATCGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTCata < 1:1943570/288‑1 (MQ=255) ccccAGAGCTACACCGCCCAGCTGCACTGCACGTTCTGCCATGGTATCCAGATGATCGATCAGTGCGGTGCGGAAGCCATCCAGCATTTCATGTACGGCAATGAAGTTAGCGCCGCGCATGTTCCAGTGCGCTTGTTTGGTAATCAAAGAAAGATCAATAAACTGGATAACCTGGCGATTCAGCAACTCTACTGTTGCTTTTTTCTCGCTGTCGGAGACATCGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTCata < 1:1075862/288‑1 (MQ=255) ccccAGAGCTACACCGCCCAGCTGCACTGCACGTTCTGCCATGGTATCCAGATGATCGATCAGTGCGGTGCGGAAGCCATCCAGCATTTCATGTACGGCAATGAAGTTAGCGCCGCGCATGTTCCAGTGCGCTTGTTTGGTAATCAAAGAAAGATCAATAAACTGGATAACCTGGCGATTCAGCAACTCTACTGTTGCTTTTTTCTCGCTGTCGGAGACATCGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTCata < 2:1286073/288‑1 (MQ=255) gCTACACCGCCCAGCTGCACTGCACGTTCTGCCATGGTATCCAGATGATCGATCAGTGCGGTGCGGAAGCCATCCAGCATTTCATGTACGGCAATGAAGTTAGCGCCGCGCATGTTCCAGTGCGCTTGTTTGGTAATCAAAGAAAGATCAATAAACTGGATAACCTGGCGATTCAGCAACTCTACTGTTGCTTTTTTCTCGCTGTCGGAGACATCGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTCATATCCTCtt < 1:493984/288‑1 (MQ=255) ctaacccGCCCCGCGGCACTTCACGTTCTGCCATGGTATCCAGATGAGCGATCAGTGCGGTGCGGAAGCCATCCAGCATTTAATGTACGGCAATGAAGTTAGCGCCGCGCATGTTCCAGTGCGCTTGTTTGGTAATCAAAGAAAGATCAATAAACTGGATAACCTGGCGATTCAGCAACTCTACTGTTGCTTTTTTCTCGCTGTCGGAGACATCGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTCATATCCTCTTg < 2:2581270/283‑1 (MQ=255) tACACCGCCCAGCTGCACTGCACGTTCTGCCATGGTATCCAGATGATCGATCAGTGCGGTGCGGAAGCCATCCAGCATTTCATGTACGGCAATGAAGTTAGCGCCGCGCATGTTCCAGTGCGCTTGTTTGGTAATCAAAGAAAGATCAATAAACTGGATAACCTGGCGATTCAGCAACTCTACTGTTGCTTTTTTCTCGCTGTCGGAGACATCGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTCATATCCTCTTGAt > 2:2365807/1‑289 (MQ=255) gCCCAGCTGCACTGCACGTTCTGCCATGGTATCCAGATGATCGATCAGTGCGGTGCGGAAGCCATCCAGCATTTCATGTACGGCAATGAAGTTAGCGCCGCGCATGTTCCAGTGCGCTTGTTTGGTAATCAAAGAAAGATCAATAAACTGGATAACCTGGCGATTCAGCAACTCTACTGTTGCTTTTTTCTCGCTGTCGGAGACATCGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTCATATCCTCTTGATGTTATg < 2:1089185/289‑1 (MQ=255) cccAGCTGCACTGCACGTTCTGCCATGGTATCCAGATGATCGATCAGTGCGGTGCGGAAGCCATCCAGCATTTCATGTACGGCAATGAAGTTAGCGCCGCGCATGTTCCAGTGCGCTTGTTTGGTAATCAAAGAAAGATCAATAAACTGGATAACCTGGCGATTCAGCAACTCTACTGTTGCTTTTTTCTCGCTGTCGGAGACATCGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTACTCATa < 1:535034/264‑1 (MQ=255) cccAGCTGCACTGCACGTTCTGCCATGGTATCCAGATGATCGATCAGTGCGGTGCGGAAGCCATCCAGCATTTCATGTACGGCAATGAAGTTAGCGCCGCGCATGTTCCAGTGCGCTTGTTTGGTAATCAAAGAAAGATCAATAAACTGGATAACCTGGCGATTCAGCAACTCTACTGTTGCTTTTTTCTCGCTGTCGGAGACATCGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTCATATCCTCTTGATGTTATg > 1:1980596/1‑288 (MQ=255) cccAGCTGCACTGCACGTTCTGCCATGGTATCCAGATGATCGATCAGTGCGGTGCGGAAGCCATCCAGCATTTCATGTACGGCAATGAAGTTAGCGCCGCGCATGTTCCAGTGCGCTTGTTTGGTAATCAAAGAAAGATCAATAAACTGGATAACCTGGCGATTCAGCAACTCTACTGTTGCTTTTTTCTCGCTGTCGGAGACATCGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTCATATCCTCTTGATGTTATg > 2:2178921/1‑288 (MQ=255) cccAGCTGCACTGCACGTTCTGCCATGGTATCCAGATGATCGATCAGTGCGGTGCGGAAGCCATCCAGCATTTCATGTACGGCAATGAAGTTAGCGCCGCGCATGTTCCAGTGCGCTTGTTTGGTAATCAAAGAAAGATCAATAAACTGGATAACCTGGCGATTCAGCAACTCTACTGTTGCTTTTTTCTCGCTGTCGGAGACATCGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTCATATCCTCTTGATGTTATGt > 2:1874129/1‑289 (MQ=255) cccAGCTGCACTGCACGTTCTGCCATGGTATCCAGATGATCGATCAGTGCGGTGCGGAAGCCATCCAGCATTTCATGTACGGCAATGAAGTTAGCGCCGCGCATGTTCCAGTGCGCTTGTTTGGTAATCAAAGAAAGATCAATAAACTGGATAACCTGGCGATTCAGCAACTCTACTGTTGCTTTTTTCTCGCTGTCGGAGACATCGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTCATATCCTCTTGATGTTATGt > 2:1647180/1‑289 (MQ=255) cccAGCTGCACTGCACGTTCTGCCATGGTATCCAGATGATCGATCAGTGCGGTGCGGAAGCCATCCAGCATTTCATGTACGGCAATGAAGTTAGCGCCGCGCATGTTCCAGTGCGCTTGTTTGGTAATCAAAGAAAGATCAATAAACTGGATAACCTGGCGATTCAGCAACTCTACTGTTGCTTTTTTCTCGCTGTCGGAGACATCGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTCATATCCTCTTGATGTTATGt > 2:500755/1‑289 (MQ=255) cactgcacGTTCTGCCATGGTATCCAGATGATCGATCAGTGCGGTGCGGAAGCAATCCAGCATTTCATGTACGGCAATGAAGTTAGCGCCGCGCATGTTCCAGTGCGCTTGTTTGGTAATAAAAGAAAGATCAATAAACTGGATAACCTGGCGATTCAGCAACTCTACTGTTGCTTTTTTCTCGCTGTCGGAGCCATCGTTGGGCGTATAAAGCAGAGTGGTAGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGGAATAATAATTTCATATCCTCTTGTTGTTATGTCCCAGTaa > 2:1468581/1‑289 (MQ=255) gcacGTTCTGCCATGGTATCCAGATGATCGATCAGTGCGGTGCGGAAGCCATCCAGCATTTCATGTACGGCAATGAAGTTAGCGCCGCGCATGTTCCAGTGCGCTTGTTTGGTAATCAAAGAAAGATCAATAAACTGGATAACCTGGCGATTCAGCAACTCTACTGTTGCTTTTTTCTCGCTGTCGGAGACATCGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTCATATCCTCTTGATGTTATGTCCCAGTAATTaa < 2:1756690/289‑1 (MQ=255) gcacGTTCTGCCATGGTATCCAGATGATCGATCAGTGCGGTGCGGAAGCCATCCAGCATTTCATGTACGGCAATGAAGTTAGCGCCGCGCATGTTCCAGTGCGCTTGTTTGGTAATCAAAGAAAGATCAATAAACTGGATAACCTGGCGATTCAGCAACTCTACTGTTGCTTTTTTCTCGCTGTCGGAGACATCGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTCATATCCTCTTGATGTTATGTCCCAGTAATTaa < 2:458416/289‑1 (MQ=255) gcacGTTCTGCCATGGTATCCAGATGATCGATCAGTGCGGTGCGGAAGCCATCCAGCATTTCATGTACGGCAATGAAGTTAGCGCCGCGCATGTTCCAGTGCGCTTGTTTGGTAATCAAAGAAAGATCAATAAACTGGATAACCTGGCGATTCAGCAACTCTACTGTTGCTTTTTTCTCGCTGTCGGAGACATCGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTCATATCCTCTTGATGTTATGTCCCAGTAATTaa < 2:1147152/289‑1 (MQ=255) cacGTTCTGCCATGGTATCCAGATGATCGATCAGTGCGGTGCGGAAGCCATCCAGCATTTCATGTACGGCAATGAAGTTAGCGCCGCGCATGTTCCAGTGCGCTTGTTTGGTAATCAAAGAAAGATCAATAAACTGGATAACCTGGCGATTCAGCAACTCTACTGTTGCTTTTTTCTCGCTGTCGGAGACATCGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTCATATCCTCTTGATGTTATGTCCCAGTAATTAAc > 2:1575591/1‑289 (MQ=255) cTGCCATGGTATCCAGATGATCGATCAGTGCGGTGCGGAAGCCATCCAGCATTTCATGTACGGCAATGAAGTTAGCGCCGCGCATGTTCCAGTGCGCTTGTTTGGTAATCAAAGAAAGATCAATAAACTGGATAACCTGGCGATTCAGCAACTCTACTGTTGCTTTTTTCTCGCTGTCGGAGACATCGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTCATATCCTCTTGATGTTATGTCCCAGTAATTAACGAGAtt < 1:456344/289‑1 (MQ=255) gCCATGGTATCCAGATGATCGATCAGTGCGGTGCGGAAGCCATCCAGCATTTCATGTACGGCAATGAAGTTAGCGCCGCGCATGTTCCAGTGCGCTTGTTTGGTAATCAAAGAAAGATCAATAAACTGGATAACCTGGCGATTCAGCAACTCTACTGTTGCTTTTTTCTCGCTGTCGGAGACATCGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTCATATCCTCTTGATGTTATGTCCCAGTAATTAACGAGAtt < 1:208865/287‑1 (MQ=255) tGGTATCCAGATGATCGATCAGTGCGGTGCGGAAGCCATCCAGCATTTCATGTACGGCAATGAAGTTAGCGCCGCGCATGTTCCAGTGCGCTTGTTTGGTAATCAAAGAAAGATCAATAAACTGGATAACCTGGCGATTCAGCAACTCTACTGTTGCTTTTTTCTCGCTGTCGGAGACATCGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTCATATCCTCTTGATGTTATGTCCCAGTAATTAACGAGATTAAGtat > 1:1555376/1‑289 (MQ=255) gtgTATCCAGATGATCGATCAGGGCGGTGCGGAAGCCATCCAGCATTTCATGTACGGCAATGAAGTTAGCGCCGCGCATGTTCCAGTGCGCTTGTTTGGTAATCAAAGAAAGATCAATAAACTGGATAACCTGGCGATTCAGCAACTCTACTGTTGCTTTTTTCTCGCTGTCGGAGACATCGTTGCTGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTCATATCCTCTTGATGTTATGTCCCAGTAATTAACGAGATTAAGtat < 1:1468581/287‑1 (MQ=255) gTATCCAGATGATCGATCAGTGCGGTGCGGAAGCCATCCAGCATTTCATGTACGGCAATGAAGTTAGCGCCGCGCATGTTCCAGTGCGCTTGTTTGGTAATCAAAGAAAGATCAATAAACTGGATAACCTGGCGATTCAGCAACTCTACTGTTGCTTTTTTCTCGCTGTCGGAGACATCGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTCATATCCTCTTGATGTTATGTCCCAGTAATTAACGAGATTAAGtata > 1:2293374/1‑288 (MQ=255) ccAGATGATCGATCAGTGCGGTGCGGAAGCCATCCAGCATTTCATGTACGGCAATGAAGTTAGCGCCGCGCATGTTCCAGTGCGCTTGTTTGGTAATCAAAGAAAGATCAATAAACTGGATAACCTGGCGATTCAGCAACTCTACTGTTGCTTTTTTCTCGCTGTCGGAGACATCGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTCATATCCTCTTGATGTTATGTCCCAGTAATTAACGAGATTAAGTATAGCAc < 1:936295/288‑1 (MQ=255) cAGATGATCGATCAGTGCGGTGCGGAAGCCATCCAGCATTTCATGTACGGCAATGAAGTTAGCGCCGCGCATGTTCCAGTGCGCTTGTTTGGTAATCAAAGAAAGATCAATAAACTGGATAACCTGGCGATTCAGCAACTCTACTGTTGCTTTTTTCTCGCTGTCGGAGACATCGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTCATATCCTCTTGATGTTATGTCCCAGTAATTAACGAGATTAAGTATAGCACCg > 1:2420219/1‑289 (MQ=255) ataaagaacagggtcggtggcgAAGCCATTCAGGATTTCATGGTAGGCAATGAAGTTAAGGCCCCGCATGTTCCCGTGCGCTTGTTTTGGAATTAAAAAAAGGTCAATTAACTGGATAACCTGGCGGTTCAGCAACTCTACTGTTGGTTTTTTCTCGCTGTCGGAGACATCGTTGCGGGTATTAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTCATATCCTCTTGATGTTATGTCCCAGTAATTAACGAGATTAAGTATAGCACCGGCt < 2:681235/275‑1 (MQ=255) gatcgatcAGGGCGGTGCGGAAGCCATCAAGCATTTCATGTACGGCAATGAAGTTAGCGCCGCGCATGTTCCAGTGCGCTTGTTTGGTAATCAAAGAAAGATCAATAAACTGGATAACCTGGCGATTCAGCAACTCTACTGTTGCTTTTTTCTCGCTGTCGGAGACATCGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTCATATCCTCTTGATGTTATGTCCCAGTAATTAACGAGATTAAGTATAGCACCGGCTAt < 2:2492686/289‑1 (MQ=255) gatcgagcAGTGCGATGCGGAAGCCATCCAGCATTTCATGTACGGAAAAGAAGTTAGCGCCGCGCATGTTCCAGTGCGCTTGTTTGGTAATCAAAGAAAGACCAATAAACTGGATAACCTGGCGATTCAGCAATTCAACAGTTGCTTTTTTCTCGCCGTCGGAGACATCGTTGCGGGTCAAAATCAGTTTGGTAGCTTCTGATTTAACTAATTTAGCGGTAATCATCATGTCCCATCCTCTTGATGTTATGTCCTAGTAAATAATGTGATTAAGTTTATCACCGGcatt > 2:2531591/1‑286 (MQ=255) attgatcAGTGCGGTGCGGAAGCCATCCAGCATTTCATGTACGGCAATGAAGTTAGCGCCGCGCATGTTCCAGTGCGCTTGTTTGGTAATCAAAGAAAGATCAATAAACTGGATAACCTGGCGATTCAGCAACTCTACTGTTGCTTTTTTCTCGCTGTCGGAGACATCGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTCATATCCTCTCGATGTTATGTCCCAGTAATTAACGAGATTAAGTATAGCACCgg < 2:161500/281‑1 (MQ=255) atcgatcAGTGCGGTGCGGAAGCCATCCAGCATTTCATGTACGGCAATGAAGTTAGCGCCGCGCATGTTCCAGTGCGCTTGTTTGGTAATCAAAGAAAGATCAATAAACTGGATAACCTGGCGATTCAGCAACTCTACTGTTGCTTTTTTCTCGCTGTCGGAGACATCGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTCATATCCTCTTGATGTTATGTCCCAGTAATTAACGAGATTAAGTATAGCACCGGCTAtg > 1:2690654/1‑289 (MQ=255) atcgatcAGTGCGGTGCGGAAGCCATCCAGCATTTCATGTACGGCAATGAAGTTAGCGCCGCGCATGTTCCAGTGCGCTTGTTTGGTAATCAAAGAAAGATCAATAAACTGGATAACCTGGCGATTCAGCAACTCTACTGTTGCTTTTTTCTCGCTGTCGGAGACATCGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTCATATCCTCTTGATGTTATGTCCCAGTAATTAACGAGATTAAGTATAGCACCGGCTAtg > 2:1423559/1‑289 (MQ=255) cgatcAGTGCGGTGCGGAAGCCATCCAGCATTTCATGTACGGCAATGAAGTTAGCGCCGCGCATGTTCCAGTGCGCTTGTTTGGTAATCAAAGAAAGATCAATAAACTGGATAACCTGGCGATTCAGCAACTCTACTGTTGCTTTTTTCTCGCTGTCGGAGACATCGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTCATATCCTCTTGATGTTATGTCCCAGTAATTAACGAGATTAAGTATAGCACCGGCTAtgtg < 1:1665905/289‑1 (MQ=255) cgatcAGTGCGGTGCGGAAGCCATCCAGCATTTCATGTACGGCAATGAAGTTAGCGCCGCGCATGTTCCAGTGCGCTTGTTTGGTAATCAAAGAAAGATCAATAAACTGGATAACCTGGCGATTCAGCAACTCTACTGTTGCTTTTTTCTCGCTGTCGGAGACATCGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTCATATCCTCTTGATGTTATGTCCCAGTAATTAACGAGATTAAGTATAGCACCGGCTAtgtg < 1:1423559/289‑1 (MQ=255) gcggtgcggAAGCCATCCAGCATTTCATGTACGGCAATGAAGTTAGCGCCGCGCATGTTCCAGTGCGCTTGTTTGGTAATCAAAGAAAGATCAATAAACTGGATAACCTGGCGATTCAGCAACTCTACTGTTGCTTTTTTCTCGCTGTCGGAGACATCGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGTGGTACTCATAATTTCATATCCTCTTGATGTTATGTCCCAGTAATTAACGAGATTAAGTATAGCACCGGCTATGTGTTCCg < 2:1723495/286‑1 (MQ=255) cggtgcggAAGCCATCCAGCATTTCATGTACGGCAATGAAGTTAGCGCCGCGCATGTTCCAGTGCGCTTGTTTGGTAATCAAAGAAAGATCAATAAACTGGATAACCTGGCGATTCAGCAACTCTACTGTTGCTTTTTTCTCGCTGTCGGAGACATCGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTCATATCCTCTTGATGTTATGTCCCAGTAATTAACGAGATTAAGTATAGCACCGGCTATGTGTTCCGCTAt > 2:1193111/1‑289 (MQ=255) tgcggAAGCCATCCAGCATTTCATGTACGGAAATGAAGTTAGCGCCGCGCATGTTCCAGTGCGCTTGTTTGGTAATCAAAGAAAGATCAATAAACTGGATAACCTGGCGATTCAGCAACTCTACTGTTGCTTTTTTCTCGCTGTCGGAGACATCGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTCATATCCTCTTGATGTTATGTCCCAGTAATTaa < 2:951668/249‑1 (MQ=255) cggAAGCCATCCAGCATTTCATGTACGGCAATGAAGTTAGCGCCGCGCATGTTCCAGTGCGCTTGTTTGGTAATCAAAGAAAGATCAATAAACTGGATAACCTGGCGATTCAGCAACTCTACTGTTGCTTTTTTCTCGCTGTCGGAGACATCGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTCATATCCTCTTGATGTTATGTCCCAGTAATTAACgaga > 1:2570435/1‑252 (MQ=255) aaGCCATCCAGCATTTCATGTACGGCAATGAAGTTAGCGCCGCGCATGTTCCAGTGCGCTTGTTTGGTAATCAAAGAAAGATCAATAAACTGGATAACCTGGCGATTCAGCAACTCTACTGTTGCTTTTTTCTCGCTGTCGGAGACATCGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTCATATCCTCTTGATGTTATGTCCCAGTAATTAACGAGATTAAGTATAGCACCGGCt < 1:881517/267‑1 (MQ=255) aaGCCATCCAGCATTTCATGTACGGCAATGAAGTTAGCGCCGCGCATGTTCCAGTGCGCTTGTTTGGTAATCAAAGAAAGATCAATAAACTGGATAACCTGGCGATTCAGCAACTCTACTGTTGCTTTTTTCTCGCTGTCGGAGACATCGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGACTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTCATATCCTCTTGATGTTATGTCCCAGTAATTAACGAGATTAAGTATAGCACCGGCTATGTGTTCCGCTATTCTg > 2:1859341/1‑285 (MQ=255) aGCCATCCAGCATTTCATGTACGGCAATGAAGTTAGCGCCGCGCATGTTCCAGTGCGCTTGTTTGGTAATCAAAGAAAGATCAATAAACTGGATAACCTGGCGATTCAGCAACTCTACTGTTGCTTTTTTCTCGCTGTCGGAGACATCGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTCATATCCTCTTGATGTTATGTCCCAGTAATTAACGAGATTAAGTATAGCACCGGCTATGTGTTCCGCTATTCTGGCTGt < 1:2228325/289‑1 (MQ=255) aGCCATCCAGCATTTCATGTACGGCAATGAAGTTAGCGCCGCGCATGTTCCAGTGCGCTTGTTTGGTAATCAAAGAAAGATCAATAAACTGGATAACCTGGCGATTCAGCAACTCTACTGTTGCTTTTTTCTCGCTGTCGGAGACATCGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTCATATCCTCTTGATGTTATGTCCCAGTAATTAACGAGATTAAGTATAGCACCGGCTATGTGTTCCGCTATTCTGGCTGt < 1:1517276/289‑1 (MQ=255) aTCCAGCATTTCATGTACGGCAATGAAGTTAGCGCCGCGCATGTTCCAGTGCGCTTGTTTGGTAATCAAAGAAAGATCAATAAACTGGATAACCTGGCGATTCAGCAACTCTACTGTTGCTTTTTTCTCGCTGTCGGAGACATCGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTCATATCCTCTTGATGTTATGTCCCAGTAATTAACGAGATTAAGTATAGCACCGGCTATGTGTTCCGCTATTCTGGCTGTTCCt > 1:82019/1‑289 (MQ=255) aTCCAGCATTTCATGTACGGCAATGAAGTTAGCGCCGCGCATGTTCCAGTGCGCTTGTTTGGTAATCAAAGAAAGATCAATAAACTGGATAACCTGGCGATTCAGCAACTCTACTGTTGCTTTTTTCTCGCTGTCGGAGACATCGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTCATATCCTCTTGATGTTATGTCCCAGTAATTAACGAGATTAAGTATAGCACCGGCTATGTGTTCCGCTATTCTGGCTGTTCCt > 1:2156449/1‑289 (MQ=255) ccAGCATTTCATGTACGGCAATGAAGTTAGCGCCGCGCATGTTCCAGTGCGCTTGTTTGGTAATCAAAGAAAGATCAATAAACTGGATAACCTTGCGATTCAGCAACTCTACTGTTGCTTTTTTCTCGCTGTCGGAGACATCGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTCATATCCTCTTGATGTTATGTCCCAGTAATTAACGAGATTAAGTATAGCACCGGCTATGTGTTCCGCGATTCTGGCTGTTCCTAt < 1:299056/289‑1 (MQ=255) ccAGCATTTCATGTACGGCAATGAAGTTAGCGCCGCGCATGTTCCAGTGCGCTTGTTTGGTAATCAAAGAAAGATCAATAAACTGGATAACCTGGCGATTCAGCAACTCTACTGTTGCTTTTTTCTCGCTGTCGGAGACATCGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTCATATCCTCTTGATGTTATGTCCCAGTAATTAACGAGATTAAGTATAGCACCGGCTATGTGTTCCGCTATTCTGGCTGTTCCTAt < 2:2293374/289‑1 (MQ=255) ccAGCATTTCATGTAAGGCAATGAAGTTAGCGCCGCGCATGTTCCAGTGCGCTTGTTTGGTAATCAAAGAAAGATCAATAAACTGGATAACCTGGCGATTCAGCAACTCTACTGTTGCTTTTTTCTCGCTGTCGGAGACATCGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTCATATCCTCTTGATGTTATGTCCCAGTAATTAACGAGATTAAGTATAGCACCGGCTATGTGTTCCGCTATTCTGGCTGTTCCTAt < 2:1528090/289‑1 (MQ=255) aTTTCATGTACGGCAATGAAGTTAGCGCCGCGCATGTTCCAGTGCGCTTGTTTGGTAATCAAAGAAAGATCAATAAACTGGATAACCTGGCGATTCAGCAACTCTACTGTTGCTTTTTTCTCGCTGTCGGAGACATCGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTCATATCCTCTTGATGTTATGTCCCAGTAATTAACGAGATTAAGTATAGCACCGGCTATGTGTTCCGCTATTCTGGCTGTTCCTATcaca < 1:1193111/288‑1 (MQ=255) aTGTACGGCAATGAAGTTAGCGCCGCGCATGTTCCAGTGCGCTTGTTTGGTAATCAAAGAAAGATCAATAAACTGGATAACCTGGCGATTCAGCAACTCTACTGTTGCTTTTTTCTCGCTGTCGGAGACATCGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTCATATCCTCTTGATGTTATGTCCCAGTAATTAACGAGATTAAGTATAGCACCGGCTATGTGTTCCGCTATTCTGGCTGTTCCTATCACACTAATa < 1:2496672/289‑1 (MQ=255) cGGCAATGAAGTTAGCGCCGCGCATGTTCCAGTGCGCTTGTTTGGTAATCAAAGAAAGATCAATAAACTGGATAACCTGGCGATTCAGCAACTCTACTGTTGCTTTTTTCTCGCTGTCGGAGACATCGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTCATATCCTCTTGATGTTATGTCCCAGTAATTAACGAGATTAAGTATAGCACCGGCTATGTGTTCCGCTATTCTGGCTGTTCCTATCACACTAATAGTGGt > 2:1962499/1‑289 (MQ=255) aaTGAAGTTAGCGCCGCGCATGTTCCAGTGCGCTTGTTTGGTAATCAAAGAAAGATCAATAAACTGGATAACCTGGCGATTCAGCAACTCTACTGTTGCTTTTTTCTCGCTGTCGGAGACATCGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTCATATCCTCTTGATGTTATGTCCCAGTAATTAACGAGATTAAGTATAGCAc < 2:1235711/236‑1 (MQ=255) aTGAAGTTAGCGCCGCGCATGTTCCAGTGCGCTTGTTTGGTAATCAAAGAAAGATCAATAAACTGGATAACCTGGCGATTCAGCAACTCTACTGTTGCTTTTTTCTCGCTGTCGGAGACATCGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTCATATCCTCTTGATGTTATGTCCCAGTAATTAACGAGATTAAGTATAGCACCGGCTATGTGTTCCGCTATTCTGGCTGTTCCTATCACACTAATAGTGGTAACaa < 1:630531/289‑1 (MQ=255) tGAAGTTAGCGCCGCGCATGTTCCAGTGCGCTTGTTTGGTAATCAAAGAAAGATCAATAAACTGGATAACCTGGCGATTCAGCAACTCTACTGTTGCTTTTTTCTCGCTGTCGGAGACATCGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTCata < 2:2415992/187‑1 (MQ=255) tGAAGTTAGCGCCGCGCATGTTCCAGTGCGCTTGTTTGGTAATCAAAGAAAGATCAATAAACTGGATAACCTGGCGATTCAGCAACTCTACTGTTGCTTTTTTCTCGCTGTCGGAGACATCGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTCATATcc > 2:854121/1‑190 (MQ=255) tAGCGCCGCGCGTGTTCCAGTGCGCTTGTTTGGTAATCAAAGAAAGATCAATAAACTGGATAACCTGGCGATTCAGCAACTCTACTGTTGCTTTTTTCTCGCTGTCGGAGACATCGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTCATATCCTCTTGATGTTATGTCCCAGTAATTAACGAGATTAAGTATAGCACCGGCTATGTGTTCCGCTATTCTGGCTGTTCCTATCACACTAATAGTGGTAACAAGCGTg < 1:1234411/287‑1 (MQ=255) cgcATGTTCCAGTGCGCTTGTTTGGTAATCAAAGAAAGATCAATAAACTGGATAACCTGGCGATTCAGCAACTCTACTGTTGCTTTTTTCTCGCTGTCGGAGACATCGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTCATATCCTCTTGATGTTa > 1:2479813/1‑187 (MQ=255) cgcATGTTCCAGTGCGCTTGTTTGGTAATCAAAGAAAGATCAATAAACTGGATAACCTGGCGATTCAGCAACTCTACTGTTGCTTTTTTCTCGCTGTCGGAGACATCGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTCATATCCTCTTGATGTTATGTCCCAGTAATTAACGAGATTAAGTATAGCACCGGCTATGTGTTCCGCTATTCTGGCTGt > 2:208960/1‑248 (MQ=255) gcATGTTCCAGTGCGCTTGTTTGGTAATCAAAGAAAGATCAATAAACTGGATAACCTGGCGATTCAGCAACTCTACTGTTGCTTTTTTCTCGCTGTCGGAGACATCGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTCATATCCTCTTGATGTTATGTCCCAGTAATTAACGAGATTAAGTATAGCACCGGCTATGTGTTCCGCTATTCTGGCTGTTCCTATCACACTAATAGTGGTAACAAGCGTGAaaaacaaaac > 2:1990907/1‑289 (MQ=255) gTGCGCTTGTTTGGTAATCAAAGAAAGATCAATAAACTGGATAACCTGGCGATTCAGCAACTCTACTGTTGCTTTTTTCTCGCTGTCGGAGACATCGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTCATATCCTCTTGATGTTATGTCCCAGTAATTAACGAGAtt > 1:331314/1‑198 (MQ=255) gTGCGCTTGTTTGGTAATCAAAGAAAAATCAATAAACTGGATAACCTGGCGATTCAGCAACTCTACTGTTGCTTTTTTCTCGCTGTCGGAGACATCGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTCATATCCTCTTGATGTTATGTCCCAGTAATTAACGAGAtt < 2:331314/198‑1 (MQ=255) tGCGCTTGTTTGGTAATCAAAGAAAGATCAATAAACTGGATAACCTGGCGATTCAGCAACTCTACTGTTGCTTTTTTCTCGCTGTCGGAGACATCGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTCATATCCTCTTGATGTTATGTCCCAGTAATTAACGAGATTAAGTATAGCACCGGCTATGTGTTCCGCTATTCTGGCTGTTCCTATCACACTAATAGTGGTAACAAGCGTGAAAAACAAAACTAATAAAGAt > 2:779163/1‑288 (MQ=255) gcTTGTTTGGTAATCAAAGAAAGATCAATAAACTGGATAACCTGGCGATTCAGCAACTCTACTGTTGCTTTTTTCTCGCTGTCGGAGACATCGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTCATATCCTCTTGATGTTATGTCCCAGTAATTAACGAGATTAAGTATAGCACCGGCTATGTGTTCCGCTATTCTGGCTGTTCCTATCACACTAATAGTGGTAACAAGCGTGAAAAACAAAACTAATAAAGATTCa < 2:82019/288‑1 (MQ=255) gcTTGTTTGGTAATCAAAGAAAGATCAATAAACTGGATAACCTGGCGATTCAGCAACTCTACTGTTGCTTTTTTCTCGCTGTCGGAGACATCGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTCATATCCTCTTGATGTTATGTCCCAGTAATTAACGAGATTAAGTATAGCACCGGCTATGTGTTCCGCTATTCTGGCTGTTCCTATCACACTAATAGTGGTAACAAGCGTGAAAAACAAAACTAATAAAGATTCa < 1:1739472/288‑1 (MQ=255) gcTTGTTTGGTAATCAAAGAAAGATCAATAAACTGGATAACCTGGCGATTCAGCAACTCTACTGTTGCTTTTTTCTCGCTGTCGGAGACATCGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTCATATCCTCTTGATGTTATGTCCCAGTAATTAACGAGATTAAGTATAGCACCGGCTATGTGTTCCGCTATTCTGGCTGTTCCTATCACACTAATAGTGGTAACAAGCGTGAAAAACAAAACTAATAAAGATTCa < 2:566921/288‑1 (MQ=255) gcTTGTTTGGTAATCAAAGAAAGATCAATAAACTGGATAACCTGGCGATTCAGCAACTCTACTGTTGCTTTTTTCTCGCTGTCGGAGACATCGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTCATATCCTCTTGATGTTATGTCCCAGTAATTAACGAGATTAAGTATAGCACCGGCTATGTGTTCCGCTATTCTGGCTGTTCCTATCACACTAATAGTGGTAACAAGCGTGAAAAACAAAACTAATAAAGATTCa < 1:1135068/288‑1 (MQ=255) cTTGTTTGGTAATCAAAGAAAGATCAATAAACTGGATAACCTGGCGATTCAGCAACTCTACTGTTGCTTTTTTCTCGCTGTCGGAGACATCGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTCATATCCTCTTGATGTTATGTCCCAGTAATTAACGAGATTAAGTATAGCACCGGCt < 1:1600104/209‑1 (MQ=255) tGGTAATCAAAGAAAGATCAATAAACTGGATAACCTGGCGATTCAGCAACTCTACTGTTGCTTTTTTCTCGCTGTCGGAGACATCGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTCATATCCTCTTGATGTTATGTCCCAGTAATTAACGAGATTAAGTATAGCACCGGCTATGTGTTCCGCTATTCTGGCTGTTCCTATCACACt > 2:3963/1‑238 (MQ=255) tGGTAATCAAAGAAAGATCAATAAACTGGATAACCTGGCGATTCAGCAACTCTACTGTTGCTTTTTTCTCGCTGTCGGAGACATCGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTCATATCCTCTTGATGTTATGTCCCAGTAATTAACGAGATTAAGTATAGCACCGGCTATGTGTTCCGCTATTCTGGCTGTTCCTATCACACTAATAGTGGTAACAAGCGTg > 2:2231296/1‑257 (MQ=255) aTCAAAGAAAGATCAATAAACTGGATAACCTGGCGATTCAGCAACTCTACTGTTGCTTTTTTCTCGCTGTCGGAGACATCGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTCATATCCTCTTGATGTTATGTCCCAGTAATTAACGAGATTAAGTATAGCACCGGCTATGTGTTCCGCTATTCTGGCTGTTCCTAt < 2:2455415/227‑1 (MQ=255) tCAAAGAAAGATCAATAAACTGGATAACCTGGCGATTCAGCAACTCTACTGTTGCTTTTTTCTCGCTGTCGGAGACATCGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTCATATCCTCTTGATGTTATGTCCCAGTAATTAACGAGATTAAGTATAGCACCGGCTATGTGTTCCGCTATTCTGGCTGTTCCTATCACACTAATAGTGGTAACAAGCGTGAAAAACAAAACTAATAAAGATTCAATGAGTTAGatata < 1:1708257/289‑1 (MQ=255) cAAAGAAAGATCAATGAACTGGATAACCTGGCGATTCAGCAACTCTACTGTTGCTTTTTTCTCGCTGTCGGAGACATCGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTCATATCCTCTTGATGTTATGTCCCAGTAATTAACGAGATTAAGTATAGCACCGGCTATGTGTTCCGCTATTCTGGCTGTTCCTATCACACTAATAGTGGTAACAAGCGTGAAAAACAAAACTAATAAAGATTCa < 1:1335267/274‑1 (MQ=255) aagaTCAATAAACTGGATAACCTGGCGATTCAGCAACTCTACTGTTGCTTTTTTCTCGCTGTCGGAGACATCGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTCATATCCTCTTGATGTTATGTCCCAGTAATTAACGAGATTAAGTATAGCACCGGCTATGTGTTCCGCTATTCTGGCTGTTCCTATCACACTAATAGTGGTAACAAGCGTGAAAAACAAAACTAATAAAGATTCAATGAGTTAGATATATTGAt < 1:2365807/287‑1 (MQ=255) gaTCAATAAACTGGATAACCTGGCGATTCAGCAACTCTACTGTTGCTTTTTTCTCGCTGTCGGAGACATCGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTCATATCCTCTTGATGTTATGTCCCAGTAATTAACGAGATTAAGTATAGCACCGGCTATGTGTTCCGCTATTCTGGCTGTTCCTAt < 2:1684585/217‑1 (MQ=255) tCAATAAACTGGATAACCTGGCGATTCAGCAACTCTACTGTTGCTTTTTTCTCGCTGTCGGAGACATCGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTCATATCCTCTTGATGTTATGTCCCAGTAATTAACGAGATTAAGTATAGCACCGGCTATGTGTTCCGCTATTCTGGCTGTTCCTATAACACTAATAGTGGTAACAAGCGTGAAAAACAAAAATAAAAAAGATTCAATGATTTTGa > 2:1335267/1‑274 (MQ=255) aCTGGATAACCTGGCGATTCAGCAACTCTACTGTTGCTTTTTTCTCGCTGTCGGAGACATCGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTCATATCCTCTTGATGTTATGTCCCAGTAATTAACGAGATTAAGta > 1:609141/1‑168 (MQ=255) tGGATAACCTGGCGATTCAGCAACTCTACTGTTGCTTTTTTCTCGCTGTCGGAGACATCGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTCATATCCTCTTGATGTTATGTCCCAGTAATTAACGAGATTAAGTATAGCACCGGCTATGTGTTCCGCTATTCTGGCTGTTCCTATCACACTAATAGTGGTAACAAGCGTGAAAAACAAAACTAATAAAGATTCAATGAGTTAGATATATTGATAAGaa < 1:996970/279‑1 (MQ=255) gATAACCTGGCGATTCAGCAACTCTACTGTTGCTTTTTTCTCGCTGTCGGAGACATCGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTCATATCCTCTTGATGTTATGTCCCAGTAATTAACGAGATTAAGTATAGCAc < 2:2709170/170‑1 (MQ=255) tCAGCAACTCTACTGTTGCTTTTTTCTCGCTGTCGGAGACATCGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTCATATCCTCTTGATGTTATGTCCCAGTAATTAACGAGAtt < 2:2635106/145‑1 (MQ=255) cAGCAACTCTACTGTTGCTTTTTTCTCGCTGTCGGAGACATCGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTCATATCCTCTTGATGTTATGTCCCAGTAATTAACg > 2:184173/1‑139 (MQ=255) cAGCAACTCTACTGTTGCTTTTTTCTCGCTGTCGGAGACATCGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTCATATCCTCTTGATGTTATGTCCCAGTAATTAACg < 1:184173/139‑1 (MQ=255) cAGCAACTCTACTGTTGCTTTTTTCTCGCTGTCGGAGACATCGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTCATATCCTCTTGATGTTATGTCCCAGTAATTAACGAGATTAAGTATAGCACCGGCTATGTGTTCCGCTATTCTGGCTGTTCCTATCACACTAATAGTGGTAACAAGCGTGAAAAACAAAACTAATAAAGATTCAATGAGTTAGATATATTGATAAg < 2:903184/260‑1 (MQ=255) cAGCAACTCTACTGTTGCTTTTTTCTCGCTGTCGGAGACATCGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTCATATCCTCTTGATGTTATGTCCCAGTAATTAACGAGATTAAGTATAGCACCGGCTATGTGTTCCGCTATTCTGGCTGTTCCTATCACACTAATAGTGGTAACAAGCGTGAAAAACAAAACTAATAAAGATTCAATGAGTTAGATATATTGATAAg > 1:903184/1‑260 (MQ=255) aGCAACTCTACTGTTGCTTTTTTCTCGCTGTCGGAGACATCGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTCATATCCTCTTGATGTTATGTCCCAGTAATTAACGAGATTAAGTATAGCACCGGCTATGTGTTCCGCTATTCTGGCTGTTCCTATca < 1:394816/190‑1 (MQ=255) gCTTTTTTCTCGCTGTCGGAGACATCGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTCATATCCTCTTGATGTTATGTCCCAGTAATTAACGAGATTAAGTATAGCACCGGCTATGTGTTCCGCTATTCTGGCTGTTCCTATCACACTAATAGTGGTAACAAGCGTGAAAAACAAAACTAATAAAGATTCAATGAGTTAGATATATTGATAAGAACAATTCTTATTTATCTGCTCGCCAGGAATTTTCGGaataaata > 1:2624855/1‑289 (MQ=255) gCTTTTTTCTCGCTGTCGGAGACATCGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTCATATCCTCTTGATGTTATGTCCCAGTAATTAACGAGATTAAGTATAGCACCGGCTATGTGTTCCGCTATTCTGGCTGTTCCTATCACACTAATAGTGGTAACAAGCGTGAAAAACAAAACTAATAAAGATTCAATGAGTTAGATATATTGATAAGAACAATTCTTATTTATCTGCTCGCCAGGAATTTTCGGaataaata < 2:631995/289‑1 (MQ=255) ctcGCTGTCGGAGACATCGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTCATATCCTCTTGATGTTATGTCCCAGTAATTAACGAGATTAAGTATAGCACCGGCTATGTGTTCCGCTATTCTGGCTGTTCCTATCACACTAATAGTGGTAACAAGCGTGAAAAACAAAACTAATAAAGATTCAATGAGTTAGATATATTGATAAGAACAATTCTTATTTATCTGCTCGCCAGGAATTTTCGGAATAAATATGCTTTTg > 2:618688/1‑289 (MQ=255) tCGGAGACATCGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTCATATCCTCTTGATGTTATGTCCCAGTAATTAACGAGAtt > 1:2405631/1‑113 (MQ=255) tCGGAGACATCGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTCATATCCTCTTGATGTTATGTCCCAGTAATTAACGAGAtt < 2:2405631/113‑1 (MQ=255) agaCATCGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTCATATCCTCTTGATGTTATGTCCCAGTAATTAACGAGATTAAGTATAGCACCGGCTATGTGTTCCGCTATTCTGGCTGTTCCTATCACACTAATAGTGGTAACAAGCGTGAAAAACAAAACTAATAAAGATTCAATGAGTTAGATATATTGATAAGAACAATTCTTATTTATCTGCTCGCCAGGAATTTTCGGAATAAATATGCTTTTGCATAATTCGa < 1:1267149/288‑1 (MQ=255) cGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTCATATCCTCTTGATGTTATGTCCCAGTAATTAACGAGATTAAGTATAGCACCGGCTATGTGTTCCGCTAtt < 1:1872610/134‑1 (MQ=255) cGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTCATATCCTCTTGATGTTATGTCCCAGTAATTAACGAGATTAAGTATAGCACCGGCTATGTGTTCCGCTATTCTGGCTGTTCCTATCACACTAATAGTGGTAACAAGCGTGAAAAACAAAACTAATAAAGATTCAATGAGTTAGATATATTGATAAGAACAATTCTTATTTATCTGCTCGCCAGGAATTTTCGGAATAAATATGCTTTTGCATAATTCGa > 1:590879/1‑282 (MQ=255) gATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTCATATCCTCTTGATGTTATGTCCCAGTAATTAACGAGATTAAGTATAGCACCGGCTATGTGTTCCGCTATTCTGGCTGTTCCTATCACACTAATAGTGGTAACAAGCGTGAAAAACAAAACTAATAAAGATTCAATg < 2:189491/182‑1 (MQ=255) gATTGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTCATATCCTCTTGATGTTATGTCCCAGTAATTAACGAGATTAAGTATAGCACCGGCTATGTGTTCCGCTATTCTGGCTGTTCCTATCACACTAATAGTGGTAACAAGCGTGAAAAACAAAACTAATAAAGATTCAATg > 1:189491/1‑182 (MQ=255) tGGTCGCTTTTGATTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTCATATCCTCTTGATGTTATGTCCCAGTAATTAACGAGATTAAGTATAGCACCGGCTATGTGTTCCGCTATTCTGGCTGTTCCTATCACACTaa < 1:2441968/135‑1 (MQ=255) ||| GGTTTTGCTGTTGATAACTTGAGTGGTCCCCAGAGCTACACCGCCCAGCTGCACTGCACGTTCTGCCATGGTATCCAGATGATCGATCAGTGCGGTGCGGAAGCCATCCAGCATTTCATGTACGGCAATGAAGTTAGCGCCGCGCATGTTCCAGTGCGCTTGTTTGGTAATCAAAGAAAGATCAATAAACTGGATAACCTGGCGATTCAGCAACTCTACTGTTGCTTTTTTCTCGCTGTCGGAGACATCGTTGCGGGTATAAAGCAGATTGGTCGCTTTACTTTTAACTAATTTAGCGGTACTCATAATTTCATATCCTCTTGATGTTATGTCCCAGTAATTAACGAGATTAAGTATAGCACCGGCTATGTGTTCCGCTATTCTGGCTGTTCCTATCACACTAATAGTGGTAACAAGCGTGAAAAACAAAACTAATAAAGATTCAATGAGTTAGATATATTGATAAGAACAATTCTTATTTATCTGCTCGCCAGGAATTTTCGGAATAAATATGCTTTTGCATAATTCGATATATAAAGACGGTGTAGAGGAAAAGTAGCG > CP042583/711500‑712060 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |