| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP042583 | 461,901 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP042583 | 461,901 | 0 | A | T | 99.0% | 719.3 / ‑3.3 | 305 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/1); major base T (154/146); minor base C (1/2); total (156/149) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.15e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.97e-01 | |||||||||||
| * | CP042583 | 461,902 | 0 | G | C | 98.4% | 709.7 / NA | 305 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (2/3); new base C (154/146); total (156/149) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.78e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| * | CP042583 | 461,903 | 0 | C | G | 98.4% | 715.1 / 4.1 | 305 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base G (154/146); minor base . (2/3); total (156/149) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.78e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 305 total aligned reads displayed.
CCCTTGATGATGTTGCGTATCGTCGAATGGAGGGGTACGAATATGATTACGACGGTGAGCATCGCGATGAACCGATAATCGTGAATTACCACAATTTACGCTTTAGCCGTAAAGACCGTTTGCAGTTAAATGTTAGTCAAAGTCTTAATGACTTTGGCAGCCTTTATATTTCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTAGCGATAGTGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TAGC‑CTCAGTTTTAGCTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTC‑GGACTTAATGTTAGTGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACGGGCAAAATAGCTGGCTGGCAGGTGTAGGTGGGACCTTACTGGAAGGCCACAACCTGAGTTATCACGTAAGCCAGGGTGATACCAGCAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGG > CP042583/461629‑462180 ||| cccTTGATGATGTTGCGTATCGTCGAATGGAGGGGTACGAATATGATTACGACGGTGAGCATCGCGATGAACCGATACTCGTGAATTACCACAATTTACGCTTTAGCCGTAAAGACCGTTTGCAGTTAAATGTTTCACAATCACTTAATGACTTTGGCTCGCTTTATATTTCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGTTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGt > 1:382053/1‑289 (MQ=255)cccTTGATGATGTTGCGTATCGTCGAATGGAGGGGTACGAATATGATTACGACGGTGAGCATCGCGATGAACCGATAATCGTGAATTACCACAATTTACGCTTTAGCCGTAAAGACCGTTTGCAGTTAAATGTTTCACAATCACTTAATGACTTTGGCTCGCTTTATATTTCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGt > 1:2136180/1‑289 (MQ=255) cTTGATGATGTTGCGTATCGTCGAATGGAGGGGTACGAATATGATTACGACGGTGAGCATCGCGATGAACCGATAATCGTGAATTACCACAATTTACGCTTTAGCCGTAAAGACCGTTTGCAGTTAAATGTTTCACAATCACTTAATGACTTTGGCTCGCTTTATATTTCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAg > 2:1641423/1‑289 (MQ=255) tgatgaTGTTGCGTATCGTCGAATGGAGGGGTACGAATATGATTACGACGGTGAGCATCGCGATGAACCGATAATCGTGAATTACCACAATTTACGCTTTAGCCGTAAAGACCGTTTGCAGTTAAATGTTTCACAATCACTTAATGACTTTGGCTCGCTTTATATTTCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAggt > 1:2389999/1‑288 (MQ=255) tgTTGCGTATCGTCGAATGGAGGGGTACGAATATGATTACGACGGTGAGCATCGCGATGAACCGATAATCGTGAATTACCACAATTTACGCTTTAGCCGTAAAGACCGTTTGCAGTTAAATGTTTCACAATCACTTAATGACTTTGGCTCGCTTTATATTTCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATccc < 1:707597/288‑1 (MQ=255) tGCGTATCGTCGAATGGAGGGGTACGAATATGATTACGACGGTGAGCATCGCGATGAACCGATAATCGTGAATTACCACAATTTACGCTTTAGCCGTAAAGACCGTTTGCAGTTAAATGTTTCACAATCACTTAATGACTTTGGCTCGCTTTATATTTCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGAt < 1:1272635/289‑1 (MQ=255) tGCGTATCGTCGAATGGAGGGGTACGAATATGATTACGACGGTGAGCATCGCGATGAACCGATAATCGTGAATTACCACAATTTACGCTTTAGCCGTAAAGACCGTTTGCAGTTAAATGTTTCACAATCACTTAATGACTTTGGCTCGCTTTATATTTCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAAGTTGGAGGGATCCCCgtt > 2:208481/1‑287 (MQ=255) cGTATCGTCGAATGGAGGGGTACGAATATGATTACGACGGTGAGCATCGCGATGAACCGATAATCGTGAATTACCACAATTTACGCTTTAGCCGTAAAGACCGTTTGCAGTTAAATGTTTCACAATCACTTAATGACTTTGGCTCGCTTTATATTTCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATa > 1:1167331/1‑288 (MQ=255) cgtcgAATGGAGGGGTACGAATATGATTACGACGGTGAGCATCGCGATGAACCGATAATCGTGAATTACCACAATTTACGCTTTAGCCGTAAAGACCGTTTGCAGTTAAATGTTTCTCAATCACTTAATGACTTTGGCTCGCTTTATATTTCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATaacgaac > 1:424118/1‑289 (MQ=255) tcgAATGGAGGGGTACGAATATGATTACGACGGTGAGCATCGCGATGAACCGATAATCGTGAATTACCACAATTTACGCTTTAGCCGTAAAGACCGTTTGCAGTTAAATGTTTCACAATTACTTAATGACTTTGGCTCGCTTTATATTTCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGt > 2:681440/1‑289 (MQ=255) tcgAATGGAGGGGTACGAATATGATTACGACGGTGAGCATCGCGATGAACCGATAATCGTGAATTACCACAATTTACGCTTTAGCCGTAAAGACCGTTTGCAGTTAAATGTTTCACAATCACTTAATGACTTTGGCTCGCTTTATATTTCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGt > 2:127314/1‑289 (MQ=255) tcgAATGGAGGGGTACGAATATGATTACGACGGTGAGCATCGCGATGAACCGATAATCGTGAATTACCACAATTTACGCTTTAGCCGTAAAGACCGTTTGCAGTTAAATGTTTCACAATCACTTAATGACTTTGGCTCGCTTTATATTTCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGGGGAATGAATCTGCAGGGATCCCCGATAACGAACGt > 1:297956/1‑289 (MQ=255) aGGGGTACGAATATGATTACGACGGTGAGCATCGCGATGAACCGATAATCGTGAATTACCACAATTTACGCTTTAGCCGTAAAGACCGTTTGCAGTTAAATGTTTCACAATCACTTAATGACTTTGGCTCGCTTTATATTTCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTC‑g < 1:873648/288‑1 (MQ=255) gATTACGACGGTGAGCATCGCGATGAACCGATAATCGTGAATTACCACAATTTACGCTTTAGCCGTAAAGACCGTTTGCAGTTAAATGTTTCACAATCACTTAATGACTTTGGCTCGCTTTATATTTCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTC‑GGACTTAATGtttcag > 1:2603981/1‑285 (MQ=255) aTTACGACGGTGAGCATCGCGATGAACCGATAATCGTGAATTACCACAATTTACGCTTTAGCCGTAAAGACCGTTTGCAGTTAAATGTTTCACAATCACTTAATGACTTTGGCTCGCTTTATATTTCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTC‑GGACTTAATGtttcagt > 1:2160356/1‑284 (MQ=255) ttACGACGGTGAGCATCGCGATGAACCGATAATCGTGAATTACCACAATTTACGCTTTAGCCGTAAAGACCGTTTGCAGTTAAATGTTTCACAATCACTTAATGACTTTGGCTCGCTTTATATTTCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTC‑GGACTTAATGtttcagtg < 1:1798360/289‑7 (MQ=255) gTGAGCATCGCGATGAACCGATAATCGTGAATTACCACAATTTACGCTTTAGCCGTAAAGACCGTTTGCAGTTAAATGTTTCACAATCACTTAATGACTTTGGCTCGCTTTATATTTCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTC‑GGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCaa > 2:2659662/1‑289 (MQ=255) tGAGCATCGCGATGAACCGATAATCGTGAATTACCACAATTTACGCTTTAGCCGTAAAGACCGTTTGCAGTTAAATGTTTCACAATCACTTAATGACTTTGGCTCGCTTTATATTTCTGGTACTCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTATTCGCTCTCA‑TTTTAG‑TGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTTTC‑GGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAAt > 2:1880549/1‑289 (MQ=255) tGAGCATCGCGATGAACCGATAATCGTGAATTACCACAATTTACGCTTTAGCCGTAAAGACCGTTTGCAGTTAAATGTTTCACAATCACTTAATGACTTTGGCTCGCTTTATATTTCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTC‑GGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAAt > 1:1871508/1‑289 (MQ=255) aGCATCGCGATGAACCGATAATCGTGAATTACCACAATTTACGCTTTAGCCGTAAAGACCGTTTGCAGTTAAATGTTTCACAATCACTTAATGACTTTGGCTCGCTTTATATTTCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGt < 2:448594/259‑1 (MQ=255) aTCGCGATGAACCGATAATCGTGAATTACCACAATTTACGCTTTAGCCGTAAAGACCGTTTGCAGTTAAATGTTTCACAATCACTTAATGACTTTGGCTCGCTTTATATTTCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTC‑GGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGttt < 2:2275434/288‑1 (MQ=255) cgcgATGAACCGATAATCGTGAATTACCACAATTTACGCTTTAGCCGTAAAGACCGTTTGCAGTTAAATGTTTCACAATCACTTAATGACTTTGGCTCGCTTTATATTTCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATaacgaacg > 1:2646377/1‑248 (MQ=255) tGAACCGATAATCGTGAATTACCACAATTTACGCTTTAGCCGTAAAGACCGTTTGCAGTTAAATGTTTCACAATCACTTAATGACTTTGGCTCGCTTTATATTTCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTC‑GGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCaaa < 2:2683641/289‑1 (MQ=255) gAACCGATAATCGTGAATTACCACAATTTACGCTTTAGCCGTAAAGACCGTTTGCAGTTAAATGTTTCACAATCACTTAATGACTTTGGCTCGCTTTATATTTCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTC‑GGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAAc < 1:208481/289‑1 (MQ=255) tAATCGTTAATTACCACAATTTACGCTTTAGCCGTAAAGACCGTTTGCAGTTAAATGTTTCACAATCACTTAATGACTTTGGCTAGCTTTATATTTCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTC‑GGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCt < 2:2368677/288‑1 (MQ=255) tAATCGTGAATTACCACAATTTACGCTTTAGCCGTAAAGACCGTTTGCAGTTAAATGTTTCACAATCACTTAATGACTTTGGCTCGCTTTATATTTCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTC‑GGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCt < 1:1708851/288‑1 (MQ=255) tACCACAATTTACGCTTTAGCCGTAAAGACCGTTTGCAGTTAAATGTTTCACAATCACTTAATGACTTTGGCTCGCTTTATATTTCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTC‑GGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGaaa < 1:2447527/289‑1 (MQ=255) aCCACAATTTACGCTTTAGCCGTAAAGACCGTTTGCAGTTAAATGTTTCACAATCACTTAATGACTTTGGCTCGCTTTATATTTCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCGGGGTTGGCATCAGTTA‑TCCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAACCTGTAGGGATCCCGGATAACGAACGTATTGTC‑GGCCTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACAAAAGTTCCTTACACCCGGGaa > 1:966872/1‑287 (MQ=255) ccACAATTTACGCTTTAGCCGTAAAGACCGTTTGCAGTTAAATGTTTCACAATCACTTAATGACTTTGGCTCGCTTTATATTTCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTC‑GGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAAt < 2:2603981/289‑1 (MQ=255) ttAGCCGTAAAGACCGTTTGCAGTTAAATGTTTCACAATCACTTAATGACTTTGGCTCGCTTTATATTTCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTC‑GGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGttt > 1:1687142/1‑246 (MQ=255) ttAGCCGTAAAGACCGTTTGCAGTTAAATGTTTCACAATCACTTAATGACTTTGGCTCGCTTTATATTTCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTC‑GGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCaaa < 2:1952054/254‑1 (MQ=255) aGCCGTAAAGACCGTTTGCAGTTAAATGTTTCACAATCACTTAATGACTTTGGCTCGCTTTATATTTCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTC‑GGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCtt > 2:2052359/1‑289 (MQ=255) ttaaGACCGTTTGCAGTTAAATGTTTCACAAGCACTTAATGACTTTGGCTGGCGTTATATTTCTGGTACCCAGCAAAAAGACTGGAATACTGCGGATTCAGATGCGTGGTATCAGGGGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTATTCGCGCTCA‑TTGTCG‑TGGAATGAATCTGATGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTC‑GGACTTAATGTTGCAGTGCCTTTCAATGTGTTGACCACACGGCGCTACACCCGGGAAAATGCGATCGACCGCGCTTATGc < 2:500403/286‑1 (MQ=255) cGTTTGCAGTTAAATGTTTCACAATCACTTAATGACTTTGGCTCGCTTTATATTTCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTC‑GGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACcg > 1:1002416/1‑272 (MQ=255) tttGCAGTTAAATGTTTCACAATCACTTAATGACTTTGGCTCGCTTTATATTTCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTC‑GGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAAc > 1:1613573/1‑289 (MQ=255) ttGCAGTTAAATGTTTCACAATCACTTAATGACTTTGGCTCGCTTTATATTTCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTC‑GGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAAc > 1:145514/1‑288 (MQ=255) gCAGTTAAATGTTTCACAATCACTTAATGACTTTTGCTCGCTTTATATTTCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTTGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTC‑GGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGcc < 1:820382/289‑1 (MQ=255) cAGTTAAATGTTTCACAATCACTTAATGACTTTGGCTCGCTTTATATTTCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTC‑GGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCa < 2:145514/289‑1 (MQ=255) acTTAATGACTTTGGCTCGCTTTATATTTCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTC‑GGACTTAATGtttcagtg < 2:595770/192‑7 (MQ=255) tggctcgcTTTATATTTCTGGTACCCATCAAGAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTC‑GGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACGGGCAAAATAgctggctg > 2:631714/8‑289 (MQ=255) tggctcgcTTTATATTTCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTC‑GGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAAc > 1:51359/8‑203 (MQ=255) tggctcgcTTTATATTTCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTC‑GGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACGGGCAAAATAgctggctg > 2:1725054/8‑289 (MQ=255) tggctcgcTTTATATTTCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTC‑GGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACGGGCAAAATAgctggctg > 2:1924196/8‑289 (MQ=255) tggctcgcTTTATATTTCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTC‑GGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAAAACCAACGGGCCAAATAgccggctg > 2:2416984/8‑289 (MQ=255) cTTTATATTTCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTC‑GGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCttt < 1:1398440/243‑1 (MQ=255) cTTTATATTTCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTC‑GGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACGGGCAAAATAGCTGGCTGGCAGgtg < 2:4101/289‑1 (MQ=255) cTTTATATTTCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTC‑GGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACGGGCAAAATAGCTGGCTGGCAGgtg > 1:1380243/1‑289 (MQ=255) atatTTCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTC‑GGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACGGGCAAAATAGCTGGCTGGCAGGTGTAgg < 2:116315/289‑1 (MQ=255) tttCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTC‑GGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACGGGCAAAATAGCTGGCTGGCAGGTGTAGGTgg < 1:113301/289‑1 (MQ=255) ttCTGGTACCCTGCAAAAATACTTGAATACTTCGGATTCAGTTACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTGA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTTGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTC‑GGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACGGGCAAAATAGCTGGCTGGCAGGTGTAgg < 2:1986774/285‑1 (MQ=255) tcggggaCCCATCAAAAATACTGGACTAATTCGGAATCAGGTACTTGGTATCAGCTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTC‑GGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACGGGCAAAATAGCTGGCTGGCAGGTGTAGGTGGGa < 2:1606793/283‑1 (MQ=255) ttgtgaCCCATCAAAAATTCTGTAGTACTTCGGAATCAGATACGGTGTATCAGGTGGGGTATACCAGCGTCTGGGTTGGCATCAATTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTC‑GGACTTAATGTTTCATTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACGGGCAAAATAGCTGGCTGGCAGGTGTAGGTGGGAc < 2:2312610/284‑1 (MQ=255) cTGGTACCCATCAAGAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATGCGTTGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTC‑GGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACGGGCAAAATAGCTGGCTGGCAGGTGTAGGTGGGAc < 2:1693566/289‑1 (MQ=255) cTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTC‑GGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGAcc > 2:2709590/1‑216 (MQ=255) tGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTC‑GGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACGGGCAAAATAGCtggctggc > 2:1387864/1‑273 (MQ=255) gTACCCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTC‑GGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCa < 2:935931/237‑1 (MQ=255) gTACCCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTC‑GGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTGTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGCCCGCGCTTAGTCCTCCTTTACAGCCAACCGGAACCGCACACGGCAAGATAGCTGGCGGGCAGgtgtggcggggcgctt > 2:2530588/1‑277 (MQ=255) aCCCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTC‑GGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCa > 2:79795/1‑166 (MQ=255) aCCCATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTC‑GGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACGGGCAAAATAgctggctg > 1:61289/1‑267 (MQ=255) cATCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGACTGAATCTGTTGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTC‑GGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACGGGCAAAATAGCTGGCTGGCAGGTGTAGGTGGGACCTTa > 1:1986774/1‑285 (MQ=255) aTCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTC‑GGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACGGGCAAAATAGCTGGCTGGCAGGTGTAGGTGGGACCTTACTGGa < 1:1929670/289‑1 (MQ=255) tCAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTC‑GGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACGGGCAAAATAGCTGGCTGGCAGGTGTAGGTGGGACCTTACTGGaa > 2:1429698/1‑289 (MQ=255) cAAAAATACTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTC‑GGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACGGGCAAAATAGCTGGCTGGCAGGTGTAGGTGGGACCTTACTGGAAg > 1:1319184/1‑289 (MQ=255) aCTGGAATACTTCGGATTCAGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTC‑GGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGACACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACGGGCAAAATAGCTGGCGTGCAGGTGTAGGTGGGACCTTTCTGGAAGGCcacc > 2:733145/1‑287 (MQ=255) cttcggattcagATACGTGGTATCATGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTC‑GGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATCCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACGGGCAAAATAGCTGGCTGGCAGGTGTAGGTGGGACCTTACTGGAAGGCCACAACCTGAGTTa < 1:2712519/278‑1 (MQ=255) cggattcagATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTC‑GGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACGGGCAAAATAGCTGGCTGGCAGGTGTAGGTGGGACCTTACTGGAAGGCCACAACCTGAGTTATc > 1:1817103/9‑288 (MQ=255) ttcagATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTC‑GGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACGGGCAAAATAGCTGGCTGGCAGGTGTAGGTGGGACCTTACTGGAAGGCCACAACCTGAGTTATCACGTa < 2:1319184/285‑1 (MQ=255) agATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTC‑GGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACGGGCAAAATAGCTGGCTGGCAGGTGTAGGTGGGACCTTACTGGAAGGCCACAACCTGAGTTATCACGTAAGc < 2:2139917/288‑1 (MQ=255) gATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTC‑GGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACGGGCAAAATAGCTGGCTGGCAGGTGTAGGTgg < 2:1191705/248‑1 (MQ=255) tATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTC‑GGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACGGGCAAAATAGCTGGCTGGCAGGTGTAGGTGGGACCTTACTGGAAGGcc < 1:1772937/256‑1 (MQ=255) tATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTC‑GGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACGGGCAAAATAGCTGGCTGGCAGGTGTAGGTGGGACCTTACTGGAAGGCCACAACCTGAGTTATCACGTAAGCCAGGGTGATa > 1:2235853/1‑289 (MQ=255) cAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTC‑GGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACGGGCAAAATAGCTGGCTGGCAGGTGTAGGTGGGACCTTACTGGAAGGCCACAACCTGAGTTATCACGTAAGCCAGGGTGATAcct < 2:2230926/289‑2 (MQ=255) gTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTC‑GGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACGGGCAAAATAGCTGGCTGGCAGGTGTAGGTGGGACCTTACTGGAAGGCCACAACCTGAg < 2:1212547/260‑1 (MQ=255) tGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTC‑GGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACGGGCAAAATAGCTGGCTGGCAGGTGTAGGTGGGACCTTACTGGAAGGCCACAACCTGAGTTATCACGTAAGCCAGGGTGATAcctcga < 2:1566405/288‑5 (MQ=255) aggggATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTAGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTC‑GGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACGGGCAAAATAGCTGGCTGGCAGGTGTAGGTGGGACCTTACTGGAAGGCCACAACCTGAGTTATCACGTAAGCCAGGGTGATAcctcga < 1:58159/286‑5 (MQ=255) gggTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTC‑GGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACGGGCAAAATAGCTGGCTGGCAGGTGTAGGTGGGACCTTACTGGAAGGCCACAACCTGAGTTATCACGTAAGCCAGGGTGATAcctcgaata > 1:752197/1‑282 (MQ=255) ggTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTC‑GGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATgcg > 2:762486/1‑152 (MQ=255) ggTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTC‑GGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGAc > 2:2477357/1‑158 (MQ=255) ggTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTC‑GGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGc > 1:1198222/1‑169 (MQ=255) ggTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTC‑GGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCa > 1:778224/1‑195 (MQ=255) ggTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTC‑GGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACGGGCAAAATAGCTGGCTGGCAGGTGTAgg > 1:2506141/1‑226 (MQ=255) ggTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTC‑GGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACGGGCAAAATAGCTGGCTGGCAGGTGTAGGt < 1:268744/227‑1 (MQ=255) ggTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTC‑GGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACGGGCAAAATAGCTGGCTGGCAGGTGTAGGTGGGACCTTACTGGAAGGCCACAACCTGAGTTa < 2:547349/259‑1 (MQ=255) ggTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTC‑GGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACGGGCAAAATAGCTGGCTGGCAGGTGTAGGTGGGACCTTACTGGAAGGCCACAACCTGAGTTATCACGTAAGc < 1:1296455/269‑1 (MQ=255) ggTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTC‑GGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACGGGCAAAATAGCTGGCTGGCAGGTGTAGGTGGGACCTTACTGGAAGGCCACAACCTGAGTTATCACGTAAGCCAGGGTGATa < 2:911684/279‑1 (MQ=255) taCCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTC‑GGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGcc > 1:1571491/1‑166 (MQ=255) taCCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTC‑GGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACGGGCAAAATAGCTGGCTGGCAGGTGTAGGTGGGACCTTACTGGa < 2:1777879/237‑1 (MQ=255) ccAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTC‑GGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACGGGCAAAATAGCTGGCTGGCAGGTGTAGGTGGGACCTTACTGGAAGGCCACAACCTGAGTTATCACGTAAGCCAGGGTGATACCTCGAATAATg < 1:644871/285‑1 (MQ=255) gcagcTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTC‑GGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACGGGCAAAATAGCTGGCTGGCAGGTGTAGGTGGGACCTTACTGGAAGGCCACAACCTGAGTTATCACGTAAGCCAGGGTGATACCTCGAATAATGGGTacac > 1:9320/1‑289 (MQ=255) gcagcTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTC‑GGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACGGGCAAAATAGCTGGCTGGCAGGTGTAGGTGGGACCTTACTGGAAGGCCACAACCTGAGTTATCACGTAAGCCAGGGTGATACCTCGAATAATGGGTacac > 1:46001/1‑289 (MQ=255) cagcTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTC‑GGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACGGGCAAAATAGCTGGCTGGCAGGTGTAGGTGGGACCTTACTGGAAGGCCACAACCTGAGTTATCACg > 2:1806215/1‑254 (MQ=255) cagcTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTC‑GGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACGGGCAAAATAGCTGGCTGGCAGGTGTAGGTGGGACCTTACTGGAAGGCCACAACCTGAGTTATCACGTAAGc < 1:1891146/259‑1 (MQ=255) cagcTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTC‑GGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACGGGCAAAATAGCTGGCTGGCAGGTGTAGGTGGGACCTTACTGGAAGGCCACAACCTGAGTTATCACGTAAGc > 2:1891146/1‑259 (MQ=255) cagcTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTC‑GGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACGGGCAAAATAGCTGGCTGGCAGGTGTAGGTGGGACCTTACTGGAAGGCCACAACCTGAGTTATCACGTAAGc > 2:1825768/1‑259 (MQ=255) cagcTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTC‑GGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACGGGCAAAATAGCTGGCTGGCAGGTGTAGGTGGGACCTTACTGGAAGGCCACAACCTGAGTTATCACGTAAGCCAGGGTGATACCTCGAATAATGGGTACACg > 1:2274175/1‑289 (MQ=255) cagcTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTC‑GGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACGGGCAAAATAGCTGGCTGGCAGGTGTAGGTGGGACCTTACTGGAAGGCCACAACCTGAGTTATCACGTAAGCCAGGGTGATACCTCGAATAATGGGTACACg > 1:1510057/1‑289 (MQ=255) gcTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATaacgaacg > 1:232727/1‑70 (MQ=255) gcTGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTC‑GGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACGGGCAAAATAGCtggctggc < 2:1118754/205‑1 (MQ=255) tGGGTTGGCATCAGTTA‑TTCG‑CTCTCATTTTCGTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTC‑GGACTTAATGTTTCAGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACGGGCAAAATAGCTGGCTGGCAGGTGTAGGTGGGACCTTACTGGAAGGCCACAACCTGAGTTATCACGTAAGCCAGGGTGATACCTCGAATAATGGGTACACGGGCa > 2:2219775/1‑289 (MQ=255) ccttaaattttAG‑TGGAATG‑ATTTGTTGGGGACCCCGATTAAGGAAGTAATGTCGGGACTT‑ATGGTTCAGTGCCTTTTCATGTTTTGAACCAACGTCGCTACCCCCGGGGAAATGCGCTCGGACGCGCCTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACGGGCAAAATAGCTGGCTGGCAGGTGTAGGTGGGACCTTACTGGAAGGCCACAACCTGAGTTATCACGTAAGCCAGGGTGATACCTCGAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAgg < 2:2129621/282‑1 (MQ=255) ||| CCCTTGATGATGTTGCGTATCGTCGAATGGAGGGGTACGAATATGATTACGACGGTGAGCATCGCGATGAACCGATAATCGTGAATTACCACAATTTACGCTTTAGCCGTAAAGACCGTTTGCAGTTAAATGTTAGTCAAAGTCTTAATGACTTTGGCAGCCTTTATATTTCTGGTACCCATCAAAAATACTGGAATACTAGCGATAGTGATACGTGGTATCAGGTGGGGTATACCAGCAGCTGGGTTGGCATCAGTTA‑TAGC‑CTCAGTTTTAGCTGGAATGAATCTGTAGGGATCCCCGATAACGAACGTATTGTC‑GGACTTAATGTTAGTGTGCCTTTCAATGTTTTGACCAAACGTCGCTACACCCGGGAAAATGCGCTCGACCGCGCTTATGCCTCCTTTAACGCCAACCGTAACAGCAACGGGCAAAATAGCTGGCTGGCAGGTGTAGGTGGGACCTTACTGGAAGGCCACAACCTGAGTTATCACGTAAGCCAGGGTGATACCAGCAATAATGGGTACACGGGCAGCGCCACGGCAAACTGGCAGG > CP042583/461629‑462180 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |