| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | CP042583 | 743,978 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP042583 | 743,978 | 0 | A | T | 99.7% | 878.1 / NA | 368 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
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| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| * | CP042583 | 743,979 | 0 | G | C | 100.0% | 880.2 / NA | 368 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base C (159/209); total (159/209) | |||||||||||
| * | CP042583 | 743,980 | 0 | C | G | 100.0% | 884.3 / NA | 368 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (159/209); total (159/209) | |||||||||||
Only 100 of 368 total aligned reads displayed.
CGCGGCGGAACAAACCGTTGAAGCGCCGAGCGTGGATGCGCGTGCATGGATTTTAATGGATTACGCCAGCGGTAAAGTGCTGGCAGAAGGCAATGCGGATGAGAAACTGGATCCCGCGAGCCTGACTAAAATCATGACCAGCTATGTGGTTGGGCAGGCGCTTAAGGCCGATAAGATTAAACTCACCGATATGGTGACGGTCGGTAAAGATGCCTGGGCGACGGGAAATCCGGCACTGCGT‑GGTAGTAGCG‑TAATGTTCCTCAAACCGGGCGATCAGGTTAGCGTGGCAGACTTGAACAAAGGTGTGATTATCCAGTCCGGTAATGACGCCTGTATTGCGCTGGCTGATTACGTTGCCGGGAGCCAGGAGAGTTTTATTGGTCTGATGAATGGTTATGCCAAAAAACTGGGTCTGACCAACACTACCTTCCAGACGGTGCACGGCCTGGATGCGCCGGGGCAGTTCAGCACCGCGCGCGATATGGCATTGCTGGGTAAAGCATTGATCCACGATGTGCCGGAAGAGTACGCCATTCATAAAGAGAAAGAGTTCACCT > CP042583/743698‑744254 ||| cgcgGCGGAACAAACCGTTGAAGCGCCGAGCGTGGATGCGCGTGCATGGATTTTAATGGATTACGCCAGCGGTAAAGTGCTGGCAGAAGGCAATGCGGATGAGAAACTGGATCCCGCGAGCCTGACTAAAATCATGACCAGCTATGTGGTTGGGCAGGCGCTTAAGGCCGATAAGATTAAACTCACCGATATGGTGACGGTCGGTAAAGATGCCTGGGCGACGGGAAATCCGGCACTGCGT‑GGTTCATCGG‑TAATGTTCCTCAAACCGGGCGATCAGGTTTCGGTGGCa < 1:647993/289‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |