Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 464,399 | 3 bp→TGA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 464,399 | 0 | A | T | 100.0% | 410.1 / NA | 171 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base T (89/82); total (89/82) | |||||||||||
* | CP042583 | 464,400 | 0 | C | G | 98.2% | 401.4 / NA | 171 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base G (87/81); minor base T (2/1); total (89/82) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 464,401 | 0 | T | A | 100.0% | 413.5 / NA | 171 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base A (89/82); total (89/82) |
Only 100 of 171 total aligned reads displayed.
GATACCAACCTGCTGGCTCTGGATGATCCCGCAATGGCACAAACCGTCGCCATCGAATTACGTAATAGCGATCGCTCCCGGCTCGCACTGGGGGAGGCGAGCCCGACTGAGGAAGTAGATGCAAATGGCAATGTCACACTAAACTTTTTTGCCAATTATCGAGCGTTAGCCAGCGGTGTTCGGCCAGGTGTGGCGAAAGCGGATGCGATATTTATGATCAATTATAATTAATATTATATTAATTCGTATAATTTGGCGTAGTCGATAAGCTCTACAATACTATGCAAACCTAGCTTGCCATAAATATTAGATTTATGCGCACTAACTGTTTTATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAACGTAATATGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTACTACTATTCGTACTACATTTATTGCTTTTTATATAGTTAAGCGTTTCGCTGGGAAAAAACGTGTATCCGGAGAGGATCATCTGAACGGCATGAAAAATATCATTCTGATCATTGCATTTACTGACAAA > CP042583/464121‑464680 ||| gATACCAACCTGCTGGCTCTGGATGATCCCGCAATGGCACAAACCGTCGCCATCGAATTACGTAATAGCGATCGCTCCCGGCCCGCACTGGGGGAGGCGAGCCCGACTGAGGAAGTAGATGCAAATGGCAATGTCACACTAAACTTTTTTGCCAATTATCGAGCGTTAGCCAGCGGTGTTCGGCCAGGTGTGGCGAAAGCGGCTGCGATATTTATGATCAATTAGAATTAATATTTTATTAATTCGTATAATTTGGCTTAGTCGATAAGCTCCACAATTTAATGCaac > 2:2028722/1‑287 (MQ=255) ccTGCTGGCTCTGGATGATCCCGCAATGGCACAAACCGTCGCCATCGAATTACGTAATAGCGATCGCTCCCGGCTCGCACTGGGGGAGGCGAGCCCGACTGAGGAAGTAGATGCAAACGGCAATGTCACACTAAACTTTTTTGCCAATTATCGAGCGTTAGCCAGCGGTGTTCGGCCAGGTGTGGCGAAAGCGGATGCGATATTTATGATCAATTATAATTAATATTATATTAATTCGTATAATTTGGCGTAGTCGATAAGCTCTACAATTGAATGCAAACCTAGCtt > 2:2422316/1‑288 (MQ=255) tgctgGCTCTGGATGATCCCGCAATGGCACAAACCGTCGCCATCGAATTACGTAATAGCGATCGCTCCCGGCTCGCACTGGGGGAGGCGAGCCCGACTGAGGAAGTAGATGCAAATGGCAATGTCACACTAAACTTTTTTGCCAATTATCGAGCGTTAGCCAGCGGTGTTCGGCCAGGTGTGGCGAAAGCGGATGCGATATTTATGATCAATTATAATTAATATTATATTAATTCGTATAATTTGGCGTAGTCGATAAGCTCTACAATTGAATGCAAACCTAGCTTGcc > 1:1228696/1‑289 (MQ=255) ctgGCTCTGGATGATCCCGCAATGGCACAAACCGTCGCCATCGAATTACGTAATAGCGATCGCTCCCGGCTCGCACTGGGGGAGGCGAGCCCGACTGAGGAAGTAGATGCAAATGGCAATGTCACACTAAACTTTTTTGCCAATTATCGAGCGTTAGCCAGCGGTGTTCGGCCAGGTGTGGCGAAAGCGGATGCGATATTTATGATCAATTATAATTAATATTATATTAATTCGTATAATTTGGCTTAGTCGATAATCTCTACAATTTAATGCAAACCTAGCTTGCCAt > 2:1806716/1‑289 (MQ=255) ctgGCTCTGGATGATCCCGCAATGGCACAAACCGTCGCCATCGAATTACGTAATAGCGATCGCTCCCGGCTCGCACTGGGGGAGGCGAGCCCGACTGAGGAAGTAGATGCAAATGGCAATGTCACACTAAACTTTTTTGCCAATTATCGAGCGTTAGCCAGCGGTGTTCGGCCAGGTGTGGCGAAAGCGGATGCGATATTTATGATCAATTATAATTAATATTATATTAATTCGTATAATTTGGCGTAGTCGATAAGCTCTACAATTGAATGCAAACCTAGCTTGCCAt > 1:1533115/1‑289 (MQ=255) tctTGATGATCCCGCAATGGCACAAACCTTCGCCATCGAATTACGTAATAGCGATCGCTCCCGGCTCGCACTGGGGGAGGCGAGCCCGACTGAGGAAGTAGATGCAAATGGCAATGTCACACTAAACTTTTTTGCCAATTATCGAGCGTTAGCCAGCGGTGTTCGGCCAGGTGTGGCGAAAGCGGATGCGATATTTATGATCAATTATAATTAATATTATATTAATTCGTATAATTTGGCGTAGTCGATAAGCTCTACAATTGAATGCAAACCTAGCTTGCCATAAata < 1:1469185/289‑1 (MQ=255) gatgatCCCGCAATGGCACAAACCGTCGCCATCGAATTACGTAATAGCGATCGCTCCCGGCTCGCACTGGGGGAGGCGAGCCCGACTGAGGAAGTAGATGCAAATGGCAATGTCACACTAAACTTTTTTGCCAATTATCGAGCGTTAGCCAGCGGTGTTCGGCCAGGTGTGGCGAAAGCGGATGCGATATTTATGATCAATTATAATTAATATTATATTAATTCGTATAATTTGGCGTAGTCGATAAGCTCTACAATTGAATGCAAACCTAGCTTGCCATAAATATTAg > 2:767727/1‑289 (MQ=255) atgatCCCGCAATGGCACAAACCGTCGCCATCGAATTACGTAATAGCGATCGCTCCCGGCTCGCACTGGGGGAGGCGAGCCCGACTGAGGAAGTAGATGCAAATGGCAATGTCACACTAAACTTTTTTGCCAATTATCGAGCGTTAGCCAGCGGTGTTCGGCCAGGTGTGGCGAAAGCGGATGCGATATTTATGATCAATTATAATTAATATTATATTAATTCGTATAATTTGGCGTAGTCGATAAGCTCTACAATTGAATGCAAACCTAGCTTGCCATAAATATTAGa > 1:922360/1‑289 (MQ=255) cAATGGCACAAACCGTCGCCATCGAATTACGTAATAGCGATCGCTCCCGGCTCGCACTGGGGGAGGCGAGCCCGACTGAGGAAGTAGATGCAAATGGCAATGTCACACTAAACTTTTTTGCCAATTATCGAGCGTTAGCCAGCGGTGTTCGGCCAGGTGTGGCGAAAGCGGATGCGATATTTATGATCAATTATAATTAATATTATATTAATTCGTATAATTTGGCGTAGTCGATAAGCTCTACAATTGAATTCAAACCTAGCCTTCCATAAATATTAGATTTATgcgt > 2:1259922/1‑288 (MQ=255) aaTGGCACAAACCGTCGCCATCGAATTACGTAATAGCGATCGCTCCCGGCTCGCACTGGGGGAGGCGAGCCCGACTGAGGAAGTAGATGCAAATGGCAATGTCACACTAAACTTTTTTGCCAATTATCGAGCGTTAGCCAGCGGTGTTCGGCCAGGTGTGGCGAAAGCGGATGCGATATTTATGATCAATTATAATTAATATTATATTAATTCGTATAATTTGGCGTAGTCGATAAGCTCTACAATTGAATGCAAACCTAGCTTGCCATAAATATTAGATTTATGCGCa < 1:2028722/289‑1 (MQ=255) gCACAAACCGTCGCCATCGAATTACGTAATAGCGATCGCTCCCGGCTCGCACTGGGGGAGGCGAGCCCGACTGAGGAAGTAGATGCAAATGGCAATGTCACACTAAACTTTTTTGCCAATTATCGAGCGTTAGCCAGCGGTGTTCGGCCAGGTGTGGCGAAAGCGGATGCGATATTTATGATCAATTATAATTAATATTATATTAATTCGTATAATTTGGCGTAGTCGATAAGCTCTACAATTGAATGCAAACCTAGCTTGCCATAAATATTAGATTTATGCGCa < 2:174492/285‑1 (MQ=255) tCGCCATCGAATTACGTAATAGCGATCGCTCCCGGCTCGCACTGGGGGAGGCGAGCCCGACTGAGGAAGTAGATGCAAATGGCAATGTCACACTAAACTTTTTTGCCAATTATCGAGCGTTAGCCAGCGGTGTTCGGCCAGGTGTGGCGAAAGCGGATGCGATATTTATGATCAATTATAATTAATATTATATTAATTCGTATAATTTGGCGTAGTCGATAAGCTCTACAATTGAATGCAAACCTAGCTTGCCAt < 2:2712299/255‑1 (MQ=255) tCGCCATCGAATTACGTAATAGCGATCGCTCCCGGCTCGCACTGGGGGAGGCGAGCCCGACTGAGGAAGTAGATGCAAATGGCAATGTCACACTAAACTTTTTTGCCAATTATCGAGCGTTAGCCAGCGGTGTTCGGCCAGGTGTGGCGAAAGCGGATGCGATATTTATGATCAATTATAATTAATATTATATTAATTCGTATAATTTGGCGTAGTCGATAAGCTCTACAATTGAATGCAAACCTAGCTTGCCATAAATATTAGATTTATGCGCACTAACTGTTTTAtt > 2:1501709/1‑289 (MQ=255) gCCATCGAATTCCGTAATAGCGATCGCTCCCGGCTCGCACTGGGGGAGGCGAGCCCGACTGAGGAAGTAGATGCAAATGGCAATGTCACACTAAACTTTTTTGCCAATTATCGAGCGTTAGCCAGCGGTGTTCGGCCAGGTGTGGCGAAAGCGGATGCGATATTTATGATCAATTATAATTAATATTATATTAATTCGTATAATTTGGCGTAGTCGATAAGCTCTACAATTGAATGCAAACCTAGCTTGCCATAAATATTAGATTTATGCGCACTAACTGTTTTATTGc < 1:1601104/289‑1 (MQ=255) gCCATCGAATTACGTAATAGCGATCGCTCCCGGCTCGCACTGGGGGAGGCGAGCCCGACTGAGGAAGTAGATGCAAATGGCAATGTCACACTAAACTTTTTTGCCAATTATCGAGCGTTAGCCAGCGGTGTTCGGCCAGGTGTGGCGAAAGCGGATGCGATATTTATGATCAATTATAATTAATATTATATTAATTCGTATAATTTGGCGTAGTCGATAAGCTCTACAATTGAATGCAAACCTAGCTTGCCATAAATATTAGATTTATGCGCACTAACTGTTTTATTGc < 1:749415/289‑1 (MQ=255) tCGAATTACGTAATAGCGATCGCTCCCGGCTCGCACTGGGGGAGGCGAGCCCGACTGAGGAAGTAGATGCAAATGGCAATGTCACACTAAACTTTTTTGCCAATTATCGAGCGTTAGCCAGCGGTGTTCGGCCAGGTGTGGCGAAAGCGGATGCGATATTTATGATCAATTATAATTAATATTATATTAATTCGTATAATTTGGCGTAGTCGATAAGCTCTACAATTGAATGCAAACCTAGCTTGCCATAAATATTAGATTTATGCGCACTAACTGTTTTATTGCTAAg > 1:111181/1‑289 (MQ=255) aTCGCTCCCGGCTCGCACTGGGGGAGGCGAGCCCGACTGAGGACGTAGATGCAAATGGCAATGTCACACTAAACTTTTTTGCCAATTATCGAGCGTTAGCCAGCGGTGTTCGGCCGGGTGTGGCGAAAGCGGATGCGATATTTATGATCAATTATAATTAATATTATATTAATTCGTATAATTTGGCGTAGTAGATAAGCTCTACAATTGAATGCAAACCTAGCTTGCCATAAATATTAGATTAATGCGCACTAACTGTTTTATTGCTAAGTAATAACTTATAGGCAAt > 1:1750205/1‑289 (MQ=255) aTCGCTCCCGGCTCGCACTGGGGGAGGCGAGCCCGACTGAGGAAGTAGATGCAAATGGCAATGTCACACTAAACTTTTTTGCCAATTATCGAGCGTTAGCCAGCGGTGTTCGGCCAGGTGTGGCGAAAGCGGATGCGATATTTATGATCAATTATAATTAATATTATATTAATTCGTATAATTTGGCGTAGTCGATAAGCTCTACAATTGAATGCAAACCTAGc > 2:1417043/1‑224 (MQ=255) aTCGCTCCCGGCTCGCACTGGGGGAGGCGAGCCCGACTGAGGAAGTAGATGCAAATGGCAATGTCACACTAAACTTTTTTGCCAATTATCGAGCGTTAGCCAGCGGTGTTCGGCCAGGTGTGGCGAAAGCGGATGCGATATTTATGATCAATTATAATTAATATTATATTAATTCGTATAATTTGGCGTAGTCGATAAGCTCTACAATTGAATGCAAACCTAGCTTGCCATAAATATTAGATTTATGCGCACTAACTGTTTTATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAAt > 1:1729738/1‑289 (MQ=255) cGCTCCCGGCTCGCACTGGGGGAGGCGAGCCCGACTGAGGAAGTAGATGCAAATGGCAATGTCACACTAAACTTTTTTGCCAATTATCGAGCGTTAGCCAGCGGTGTTCGGCCAGGTGTGGCGAAAGCGGATGCGATATTTATGATCAATTATAATTAATATTATATTAATTCGTATAATTTGGCGTAGTCGATAAGCTCTACAATTGAATGCAAACCTAGCTTGCCATAAATATTAGATTTATGCGCACTAACTGTTTTATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAAttt < 2:1235999/289‑1 (MQ=255) ccGGCTCGCACTGGGGGAGGCGAGCCCGACTGAGGAAGTAGATGCAAATGGCAATGTCACACTAAACTTTTTTGCCAATTATCGAGCGTTAGCCAGCGGTGTTCGGCCAGGTGTGGCGAAAGCGGATGCGATATTTATGATCAATTATAATTAATATTATATTAATTCGTATAATTTGGCGTAGTCGATAAGCTCTACAATTGAATGCAAACCTAGCTTGCCATAAATATTAGATTTATGCGCACTAACTGTTTTATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTtta < 1:6024/289‑1 (MQ=255) cACTGGGGGAGGCGAGCCCGACTGAGGAAGTAGATGCAAATGGCAATGTCACACTAAACTTTTTTGCCAATTATCGAGCGTTAGCCAGCGGTGTTCGGCCAGGTGTGGCGAAAGCGGATGCGATATTTATGATCAATTATAATTAATATTATATTAATTCGTATAATTTGGCGTAGTCGATAAGCTCTACAATTGAATGCAAACCTAGCTTGCCATAAATATTAGATTTATGCGCACTAACTGTTTTATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATaa > 1:2283109/1‑289 (MQ=255) ggggAGGCGAGCCCGACTGAGGAAGTAGATGCAAATGGCAATGTCACACTAAACTTTTTTGCCAATTATCGAGCGTTAGCCAGCGGTGTTCGGCCAGGTGTGGCGAAAGCGGATGCGATATTTATGATCAATTATAATTAATATTATATTAATTCGTATAATTTGGCGTAGTCGATAAGCTCTACAATTGAATGCAAACCTAGCTTGCCATAAATATTAGATTTATGCGCACTAACTGTTTTATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATcc > 1:1276012/1‑287 (MQ=255) ggggAGGCGAGCCCGACTGAGGAAGTAGATGCAAATGGCAATGTCACACTAAACTTTTTTGCCAATTATCGAGCGTTAGCCAGCGGTGTTCGGCCAGGTGTGGCGAAAGCGGATGCGATATTTATGATCAATTATAATTAATATTATATTAATTCGTATAATTTGGCGTAGTCGATAAGCTCTACAATTGAATGCAAACCTAGCTTGCCATAAATATTAGATTTATGCGCACTAACTGTTTTATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATcc > 1:1905702/1‑287 (MQ=255) ggCGAGCCCGACTGAGGAAGTAGATGCAAATGGCAATGTCACACTAAACTTTTTTGCCAATTATCGAGCGTTAGCCAGCGGTGTTCGGCCAGGTGTGGCGAAAGCGGATGCGATATTTATGATCAATTATAATTAATATTATATTAATTCGTATAATTTGGCGTAGTCGATAAGCTCTACAATTGAATGCAAACCTAGCTTGCCATAAATATTAGATTTATGCGCACTAACTGTTTTATTGCTAAGta < 2:545145/248‑1 (MQ=255) ggCGAGCCCGACTGAGGAAGTAGATGCAAATGGCAATGTCACACTAAACTTTTTTGCCAATTATCGAGCGTTAGCCAGCGGTGTTCGGCCAGGTGTGGCGAAAGCGGATGCGATATTTATGATCAATTATAATTAATATTATATTAATTCGTATAATTTGGCGTAGTCGATAAGCTCTACAATTGAATGCAAACCTAGCTTGCCATAAATATTAGATTTATGCGCACTAACTGTTTTATTGCTAAGta > 1:545145/1‑248 (MQ=255) gCGAGCCCGACTGAGGAAGTAGATGCAAATGGCAATGTCACACTAAACTTTTTTGCCAATTATCGAGCGTTAGCCAGCGGTGTTCGGCCAGGTGTGGCGAAAGCGGATGCGATATTTATGATCAATTATAATTAATATTATATTAATTCGTATAATTTGGCGTAGTCGATAAGCTCTACAATTGAATGCAAACCTAGCTTGCCATAAATATTAGATTTATGCGCACTAACTGTTTTATTGCTAAGtaat < 1:720899/249‑1 (MQ=255) gCGAGCCCGACTGAGGAAGTAGATGCAAATGGCAATGTCACACTAAACTTTTTTGCCAATTATCGAGCGTTAGCCAGCGGTGTTCGGCCAGGTGTGGCGAAAGCGGATGCGATATTTATGATCAATTATAATTAATATTATATTAATTCGTATAATTTGGCGTAGTCGATAAGCTCTACAATTGAATGCAAACCTAGCTTGCCATAAATATTAGATTTATGCGCACTAACTGTTTTATTGCTAAGtaat > 2:720899/1‑249 (MQ=255) gAGCCCGACTGAGGAAGTAGATGCAAATGGCAATGTCACACTAAACTTTTTTGCCAATTATCGAGCGTTAGCCAGCGGTGTTCGGCCAGGTGTGGCGAAAGCGGATGCGATATTTATGATCAATTATAATTAATATTATATTAATTCGTATAATTTGGCGTAGTCGATAAGCTCTACAATTGAATGCAAACCTAGCTTGCCATAAATATTAGATTTATGCGCACTAACTGTTTTATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGa < 1:1821353/289‑1 (MQ=255) gAGCCCGACTGAGGAAGTAGATGCAAATGGCAATGTCACACTAAACTTTTTTGCCAATTATCGAGCGTTAGCCAGCGGTGTTCGGCCAGGTGTGGCGAAAGCGGATGCGATATTTATGATCAATTATAATTAATATTATATTAATTCGTATAATTTGGCGTAGTCGATAAGCTCTACAATTGAATGCAAACCTAGCTTGCCATAAATATTAGATTTATGCGCACTAACTGTTTTATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGa > 2:556376/1‑289 (MQ=255) gCCCGACTGAGGAAGTAGATGCAAATGGCAATGTCACACTAAACTTTTTTGCCAATTATCGAGCGTTAGCCAGCGGTGTTCGGCCAGGTGTGGCGAAAGCGGATGCGATATTTATGATCAATTATAATTAATATTATATTAATTCGTATAATTTGGCGTAGTCGATAAGCTCTACAATTGAATGCAAACCTAGCt < 2:628050/195‑1 (MQ=255) aGTAGATGCAAATGGCAATGTCACACTAAACTTTTTTGCCAATTATCGAGCGTTAGCCAGCGGTGTTCGGCCAGGTGTGGCGAAAGCGGATGCGATATTTATGATCAATTATAATTAATATTATATTAATTCGTATAATTTGGCGTAGTCGATAAGCTCTACAATTGAATGCAAACCTAGCTTGCCATAAATATTAGATTTATGCGCACTAACTGTTTTATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAACGTAATATGGt < 1:24414/288‑1 (MQ=255) aGTAGATGCAAATGGCAATGTCACACTAAACTTTTTTGCCAATTATCGAGCGTTAGCCAGCGGTGTTCGGCCAGGTGTGGCGAAAGCGGATGCGATATTTATGATCAATTATAATTAATATTATATTAATTCGTATAATTTGGCGTAGTCGATAAGCTCTACAATTGAATGCAAACCTAGCTTGCCATAAATATTAGATTTATGCGCACTAACTGTTTTATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAACGTAATATGGt < 1:1898555/288‑1 (MQ=255) tGCAAATGGCAATGTCACACTAAACTTTTTTGCCAATTATCGAGCGTTAGCCAGCGGTGTTCGGCCAGGTGTGGCGAAAGCGGATGCGATATTTATGATCAATTATAATTAATATTATATTAATTCGTATAATTTGGCGTAGTCGATAAGCTCTACAATTGAATGCAAACCTAGCTTGCCATAAATATTAGATTTATGCGCACTAACTGTTTTATTGCt > 2:1871717/1‑219 (MQ=255) tGCAAATGGCAATGTCACACTAAACTTTTTTGCCAATTATCGAGCGTTAGCCAGCGGTGTTCGGCCAGGTGTGGCGAAAGCGGATGCGATATTTATGATCAATTATAATTAATATTATATTAATTCGTATAATTTGGCGTAGTCGATAAGCTCTACAATTGAATGCAAACCTAGCTTGCCATAAATATTAGATTTATGCGCACTAACTGTTTTATTGCt < 1:1871717/219‑1 (MQ=255) tGCAAATGGCAATGTCACACTAAACTTTTTTGCCAATTATCGAGCGTTAGCCAGCGGTGTTCGGCCAGGTGTGGCGAAAGCGGATGCGATATTTATGATCAATTATAATTAATATTATATTAATTCGTATAATTTGGCGTAGTCGATAAGCTCTACAATTGAATGCAAACCTAGCTTGCCATAAATATTAGATTTATGCGCACTAACTGTTTTATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAACGt < 2:666914/274‑1 (MQ=255) tGCAAATGGCAATGTCACACTAAACTTTTTTGCCAATTATCGAGCGTTAGCCAGCGGTGTTCGGCCAGGTGTGGCGAAAGCGGATGCGATATTTATGATCAATTATAATTAATATTATATTAATTCGTATAATTTGGCGTAGTCGATAAGCTCTACAATTGAATGCAAACCTAGCTTGCCATAAATATTAGATTTATGCGCACTAACTGTTTTATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAACGTAATATGGTCACTTCa < 1:192874/289‑1 (MQ=255) tGCAAATGGAAATGTCACACTAAACTTGTTTGCCAATTATCGAGCGTTAGCCAGCGGTGTTCGGCCAGGTGTGGCGAAAGCGGATGCGATATTTATGATCAATTATAATTAATTTTATATTAATTCGTATAATTTGGCGTAGTCGATAAGCTCTACAATTGAATGCAAACCTAGCTTGCCATAAATATTAGATTTATGCGCACTAACTGTTTTATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAACGTAATATGGTCACtt < 2:1913530/287‑1 (MQ=255) aaaTGGCAATGTCCCACTAAACTTTTTTGCCAATTATCGAGCGTTAGCCAGCGGTGTTCGGCCAGGTGTGGCGAAAGCGGATGCGATATTTATGATCAATTATAATTAATATTATATTAATTCGTATAATTTGGCGTAGTCGATAAGCTCTACAATTGAATGCAAACCTAGCTTGCCATAAATATTAGATTTATGCGCACTAACTGTTTTATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAACGTAATATGGTCACTTCACGa < 2:2192038/289‑1 (MQ=255) aaaTGGCAATGTCACACTAAACTTTTTTGCCAATTATCGAGCGTTAGCCAGCGGTGTTCGGCCAGGTGTGGCGAAAGCTGATGCGATATTTATGATCAATTATAATTAATATTATATTAATTCGTATAATTTGGCGTAGTCGATAAGCTCTACAATTGAATGCAAACCTAGCTTGCCATAAATATTAGATTTATGCGCACTAACTGTTTTATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAACGTAATATGGTCACTTCACGa < 2:786021/289‑1 (MQ=255) aaaTGGCAATGTCACACTAAACTTTTTTGCCAATTATCGAGCGTTAGCCAGCGGTGTTCGGCCAGGTGTGGCGAAAGCGGATGCGATATTTATGATCAATTATAATTAATATTATATTAATTCGTATAATTTGGCGTAGTCGATAAGCTCTACAATTGAATGCAAACCTAGCTTGCCATAAATATTAGATTTATGCGCACTAACTGTTTTATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAACGTAATATGGTCACTTCACGa < 1:1356758/289‑1 (MQ=255) aTGGCAATGTCACACTAAACTTTTTTGCCAATTATCGAGCGTTAGCCAGCGGTGTTCGGCCAGGTGTGGCGAAAGCGGATGCGATATTTATGATCAATTATAATTAATATTATATTAATTCGTATAATTTGGCGTAGTCGATAAGCTCTACAATTGAATGCAAACCTAGCTTGCCATAAATATTAGATTTATGCGCACTAACTGTTTTATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAACGTAATATGGTCACTTCACGa < 2:1062412/287‑1 (MQ=255) aTGGCAATGTCACACTAAACTTTTTTGCCAATTATCGAGCGTTAGCCAGCGGTGTTCGGCCAGGTGTGGCGAAAGCGGATGCGATATTTATGATCAATTATAATTAATATTATATTAATTCGTATAATTTGGCGTAGTCGATAAGCTCTACAATTGAATGCAAACCTAGCTTGCCATAAATATTAGATTTATGCGCACTAACTGTTTTATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAACGTAATATGGTCACTTCACGa > 1:1062412/1‑287 (MQ=255) aTGTCACACTAAACTTTTTTGCCAATTATCGAGCGTTAGCCAGCGGTGTTCGGCCAGGTGTGGCGAAAGCGGATGCGATATTTATGATCAATTATAATTAATATTATATTAATTCGTATAATTTGGCGTAGTCGATAAGCTCTACAATTGAATGCAAACCTAGCTTGCCATAAATATTAGATTTATGCGCACTAACTGTTTTATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAACGTAATATGGTCACTTCACGATTAGATAg < 1:556376/289‑1 (MQ=255) aaCTTTTTTGCCAATTATCGAGCGTTAGCCAGCGGTGTTCGGCCAGGTGTGGCGAAAGCGGATGCGATATTTATGATCAATTATAATTAATATTATATTAATTCGTATAATTTGGCGTAGTCGATAAGCTCTACAATTGAATGCAAACCTAGCTTGCCATAAATATTAGATTTATGCGCACTAACTGTTTTATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGa > 1:2737575/1‑246 (MQ=255) gCCAATTATCGAGCGTTAGCCAGCGGTGTTCGGCCAGGTGTGGCGAAAGCGGATGCGATATTTATGATCAATTATAATTAATATTATATTAATTCGTATAATTTGGCGTAGTCGATAAGCTCTACAATTGAATGCAAACCTAGCTTGCCATAAATATTAGATTTATGCGCACTAACTGTTTTATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAACGTAATATGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGttgaactat < 1:138257/289‑9 (MQ=255) gTTAGCCAGCGGTGTTCGGCCAGGTGTGGCGAAAGCGGATGCGATATTTATGATCAATTATAATTAATATTATATTAATTCGTATAATTTGGCGTAGTCGATAAGCTCTACAATTGAATGCAAACCTAGCTTGCCATAAATATTAGATTTATGCGCACTAACTGTTTTATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAACGTAATATGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTTGAACTATTCGTACTACATTTa < 1:662913/289‑1 (MQ=255) ttAGCCAGCGGTGTTCGGCCAGGTGTGGCGAAAGCGGATGCGATATTTATGATCAATTATAATTAATATTATATTAATTCGTATAATTTGGCGTAGTCGATAAGCTCTACAATTGAATGCAAACCTAGCTTGCCATAAATATTAGATTTATGCGCACTAACTGTTTTATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAACGTAATATGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTTGAACTATTCGTACTACATTTAt > 1:1821575/1‑289 (MQ=255) tAGCCAGCGGTGTTCGGCCAGGTGTGGCGAAAGCGGATGCGATATTTATGATCAATTATAATTAATATTATATTAATTCGTATAATTTGGCGTAGTCGATAAGCTCTACAATTGAATGCAAACCTAGCTTGCCATAAATATTAGATTTATGCGCACTAACTGTTTTATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAACGTAATATGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTTGAACTATTCGTACTACATTTAtt < 1:50027/289‑1 (MQ=255) cAGCGGTGTTCGGCCAGGTGTGGCGAAAGCGGATGCGATATTTATGATCAATTATAATTAATATTATATTAATTCGTATAATTTGGCGTAGTCGATAAGCTCTACAATTGAATGCAAACCTAGCTTGCCATAAATATTAGATTTATGCGCACTAACTGTTTTATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAACGTAATATGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTTGAACTATTCGTACTACATTTATTGCt < 1:2088630/288‑1 (MQ=255) cGGTGTTCGGCCAGGTGTGGCGAAAGCGGATGCGATATTTATGATCAATTATAATTAATATTATATTAATTCGTATAATTTGGCGTAGTCGATAAGCTCTACAATTGAATGCAAACCTAGCTTGCCATAAATATTAGATTTATGCGCACTAACTGTTTTATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGa > 2:1315005/1‑214 (MQ=255) ccAGGTGTGGCGAAAGCGGATGCGATATTTATGATCAATTATAATTAATATTATATTAATTCGTATAATTTGGCGTAGTCGATAAGCTCTACAATTGAATGCAAACCTAGCTTGCCATAAATATTAGATTTATGCGCACTAACTGTTTTATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAAc > 2:2650119/1‑208 (MQ=255) ccAGGTGTGGCGAAAGCGGATGCGATATTTATGATCAATTATAATTAATATTATATTAATTCGTATAATTTGGCGTAGTCGATAAGCTCTACAATTGAATGCAAACCTAGCTTGCCATAAATATTAGATTTATGCGCACTAACTGTTTTATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAAc < 1:2650119/208‑1 (MQ=255) ggTGTGGCGAAAGCGGATGCGATATTTATGATCAATTATAATTAATATTATATTAATTCGTATAATTTGGCGTAGTCGATAAGCTCTACAATTGAATGCAAACCTAGCTTGCCATAAATATTAGATTTATGCGCACTAACTGTTTTATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAACGTAATATGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTTGAACTATTCGTACTACCTTTTTTGCTTTTTATATAGTTAAGCg > 1:2702749/1‑289 (MQ=255) ggTGTGGCGAAAGCGGATGCGATATTTATGATCAATTATAATTAATATTATATTAATTCGTATAATTTGGCGTAGTCGATAAGCTCTACAATTGAATGCAAACCTAGCTTGCCATAAATATTAGATTTATGCGCACTAACTGTTTTATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAACGTAATATGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTTGAACTATTAGTACTACATTTATTGCTTTTTATATAGTTAAGCg > 1:2534814/1‑289 (MQ=255) tgtgGCGAAAGCGGATGCGATATTTATGATCAATTATAATTAATATTATATTAATTCGTATAATTTGGCGTAGTCGATAAGCTCTACAATTGAATGCAAACCTAGCTTGCCATAAATATTAGATTTATGCGCACTAACTGTTTTATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGa > 2:1188033/1‑199 (MQ=255) tgtgGCGAAAGCGGATGCGATATTTATGATCAATTATAATTAATATTATATTAATTCGTATAATTTGGCGTAGTCGATAAGCTCTACAATTGAATGCAAACCTAGCTTGCCATAAATATTAGATTTATGCGCACTAACTGTTTTATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGa < 1:1188033/199‑1 (MQ=255) tgtgGCGAAAGCGGATGCGATATTTATGATCAATTATAATTAATATTATATTAATTCGTATAATTTGGCGTAGTCGATAAGCTCTACAATTGAATGCAAACCTAGCTTGCCATAAATATTAGATTTATGCGCACTAACTGTTTTATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAACGTAATATGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTTGAACTATTCGTACTACATTTATTGCTTTTTATATAGTTAAGCGtt > 1:461562/1‑289 (MQ=255) aGCGGATGCGATATTTATGATCAATTATAATTAATATTATATTAATTCGTATAATTTGGCGTAGTCGATAAGCTCTACAATTGAATGCAAACCTAGCTTGCCATAAATATTAGATTTATGCGCACTAACTGTTTTATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAACGTAATATGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTTGAACTATTCGTACTACATTTATTGCTTTTTATATAGTTAAGCGTTTCGCTGGGa > 2:198772/1‑289 (MQ=255) gCGGATGCGATATTTATGATCAATTATAATTAATATTATATTAATTCGTATAATTTGGCGTAGTCGATAAGCTCTACAATTGAATGCAAACCTAGCTTGCCATAAATATTAGATTTATGCGCACTAACTGTTTTCTTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGGTAACGTAATATGGTCATTTCACGATTAGATAGCACTGTGACCGTTGAACGTCTCGTACTACCTTTATTGCTTTTTATATAGTTAAGCGGTTCGCTGGGaa > 2:1382792/1‑289 (MQ=255) atTTATGATCAATTATAATTAATATTATATTAATTCGTATAATTTGGCGTAGTCGATAAGCTCTACAATTGAATGCAAACCTAGCTTGCCATa < 2:2462900/93‑1 (MQ=255) tttATGATCAATTATAATTAATATTATATTAATTCGTATAATTTGGCGTAGTCGATAAGCTCTACAATTGAATGCAAACCTAGCTTGCCATAAata > 2:1868106/1‑96 (MQ=255) cAATTATAATTAATATTATATTAATTCGTATAATTTGGCGTAGTCGATAAGCTCTACAATTGAATGCAAACCTAGCTTGCCATAAATATTAGATTTATGCGCACTAACTGTTTTATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAACGTAATATGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTTGAACTATTCGTACTACATTTATTGCTTTTTATATAGTTAAGCGTTTCGCTGGGAAAAAACGTGTATCCGGAGAgg < 1:334187/289‑1 (MQ=255) cAATTATAATTAATATTATATTAATTCGTATAATTTGGCGTAGTCGATAAGCTCTACAATTGAATGCAAACCTAGCTTGCCATAAATATTAGATTTATGCGCACTAACTGTTTTATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAACGTAATATGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTTGAACTATTCGTACTACATTTATTGCTTTTTATATAGTTAAGCGTTTCGCTGGGAAAAAACGTGTATCCGGAGAgg < 2:1228696/289‑1 (MQ=255) cAATTATAATTAATATTATATTAATTCGTATAATTTGGCGTAGTCGATAAGCTCTACAATTGAATGCAAACCTAGCTTGCCATAAATATTAGATTTATGCGCACTAACTGTTTTATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAACGTAATATGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTTGAACTATTCGTACTACATTTATTGCTTTTTATATAGTTAAGCGTTTCGCTGGGAAAAAACGTGTATCCGGAGAgg < 1:860328/289‑1 (MQ=255) tattatattaATTCGTATAATTTGGCGTAGTCGATAAGCTCTACAATTGAATGCAAACCTAGCTTGCCATAAATATTAGATTTATGCGCACTAACTGTTTTATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAACGTAATATGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTTGAACTATTCGTACTACATTTATTGCTTTTTATATAGTTAAGCGTTTCGCTGGGAAAAAACGTGTATCCGGAGAGGATCATCTGAACg > 1:1620081/1‑288 (MQ=255) tattatattaATTCGTATAATTTGGCGTAGTCGATAAGCTCTACAATTGAATGCAAACCTAGCTTGCCATAAATATTAGATTTATGCGCACTAACTGTTTTATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAACGTAATATGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTTGAACTATTCGTACTACATTTATTGCTTTTTATATAGTTAAGCGTTTCGCTGGGAAAAAACGTGTATCCGGAGAGGATCATCTGAACg > 1:2417577/1‑288 (MQ=255) tattaATTCGTATAATTTGGCGTAGTCGATAAGCTCTACAATTGAATGCAAACCTAGCTTGCCATAAATATTAGATTTATGCGCACTAACTGTTTTATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAACGTAATATGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTTGAACTATTCGTATTACATTTATTGCt > 1:1535956/1‑222 (MQ=255) tattaATTCGTATAATTTGGCGTAGTCGATAAGCTCTACAATTGAATGCAAACCTAGCTTGCCATAAATATTAGATTTATGCGCACTAACTGTTTTATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAACGTAATATGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTTGAACTATTCGTACTACATTTATTGCt < 2:1535956/222‑1 (MQ=255) aTTCGTATAATTTGGCGTAGTCGATAAGCTCTACAATTGAATGCAAACCTAGCTTGCCATAAATATTAGATTTATGCGCACTAACTGTTTTATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAAttt < 1:159594/120‑1 (MQ=255) aTTCGTATAATTTGGCGTAGTCGATAAGCTCTACAATTGAATGCAAACCTAGCTTGCCATAAATATTAGATTTATGCGCACTAACTGTTTTATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAAttt > 2:159594/1‑120 (MQ=255) aTTCGTATAATTTGGCGTAGTCGATAAGCTCTACAATTGAATGCAAACCTAGCTTGCCATAAATATTAGATTTATGCGCACTAACTGTTTTATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAAttt > 1:2697557/1‑120 (MQ=255) aTTCGTATAATTTGGCGTAGTCGATAAGCTCTACAATTGAATGCAAACCTAGCTTGCCATAAATATTAGATTTATGCGCACTAACTGTTTTATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTaa > 2:2566393/1‑141 (MQ=255) aTTCGTATAATTTGGCGTAGTCGATAAGCTCTACAATTGAATGCAAACCTAGCTTGCCATAAATATTAGATTTATGCGCACTAACTGTTTTATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTaa < 1:2566393/141‑1 (MQ=255) aTTCGTATAATTTGGCGTAGTCGATAAGCTCTACAATTGAATGCAAACCTAGCTTGCCATAAATATTAGATTTATGCGCACTAACTG‑TTTATTGc > 1:21467/1‑95 (MQ=255) aTTCGTATAATTTGGCGTAGTCGATAAGCTCTACAATTGAATGCAAACCTAGCTTGCCATAAATATTAGATTTATGCGCACTAACTG‑TTTATTGc < 2:21467/95‑1 (MQ=255) tataATTTGGCGTAGTCGATAAGCTCTACAATTGAATGCAAACCTAGCTTGCCATAAATATTAGATTTATGCGCACTAACTGTTTTATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGa > 2:1602087/1‑141 (MQ=255) tataATTTGGCGTAGTCGATAAGCTCTACAATTGAATGCAAACCTAGCTTGCCATAAATATTAGATTTATGCGCACTAACTGTTTTATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAACGTAATATGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTTGAACTATTCGTACTACATTTATTGCTTTTTATATAGTTAAGCGTTTCGCTGGGAAAAAACGTGTATCCGGAGAgg < 1:674730/261‑1 (MQ=255) tataATTTGGCGTAGTCGATAAGCTCTACAATTGAATGCAAACCTAGCTTGCCATAAATATTAGATTTATGCGCACTAACTGTTTTATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAACGTAATATGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTTGAACTATTCGTACTACATTTATTGCTTTTTATATAGTTAAGCGTTTCGCTGGGAAAAAACGTGTATCCGGAGAGGATCATCTGAACGGCATGAAAAATATCAt > 1:621624/1‑289 (MQ=255) tataATTTGGCGTAGTCGATAAGCTCTACAATTGAATGCAAACCTAGCTTGCCATAAATATTAGATTTATGCGCACTAACTGTTTTATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAACGTAATATGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTTGAACTATTCGTACTACATTTATTGCTTTTTATATAGTTAAGCGTTTCGCTGGGAAAAAACGTGTATCCGGAGAGGATCATCTGAACGGCATGAAAAATATCAt > 2:818097/1‑289 (MQ=255) tataATTTGGCGTAGTCGATAAGCTCTACAATTGAATGCAAACCTAGCTTGCCATAAATATTAGATTTATGCGCACTAACTGTTTTATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAACGTAATATGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTTGAACTATTCGTACTACATTTATTGCTTTTTATATAGTTAAGCGTTTCGCTGGGAAAAAACGTGTATCCGGAGAGGATCATCTGAACGGAATGAAAAATATCAt > 2:399415/1‑289 (MQ=255) tataATTTGGCGTAGTCGATAAGCTCTACAATTGAATGCAAACCTAGCTTGCCATAAATATTAGATTTATGCGCACTAACTGTTTTATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCAGCTAACCAGATAACGTAATATGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTTGAACTATTCGTACTACATTTATTGCTTTT‑‑TATAGTAAAGCGTTTCGCTGGGAAAAAACGTGTATCCGGAGAGGATCATCGGAACGGCATGAAAAATCTAAtta > 1:1883049/1‑288 (MQ=255) ataATTTGGCGTAGTCGATAAGCTCTACAATTGAATGCAAACCTAGCTTGCCATAAATATTAGATTTATGCGCACTAACTGTTTTATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAACGTAATATGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTTGAACTATTCGTACTACATTTATTGCTTTTTATATAGTTAAGCGTTTCGCTGGGAAAAAACGTGTATCCGGAGAGGATCATCTGAACGGCATGAAAAATATCAtt < 2:2417577/289‑1 (MQ=255) tttGGCGTAGTCGATAAGCTCTACAATTGAATGCAAACCTAGCTTGCCATAAATATTAGATTTATGCGCACTAACTGTTTTATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAACGTAATATGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTTGAACTATTCGTACTACATTTATTGCt < 1:98496/207‑1 (MQ=255) tGGCGTAGTCGATAAGCTCTACAATTGAATGCAAACCTAGCTTGCCATAAATATTAGATTTATGCGCACTAACTGTTTTATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAACGTAATATGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTTGAACTATTCGTACTACATTTATTGCTTTTTATATAGTTAAGCGTTTCGCTGGGAAAAAACGTGTATCCGGAGAGGATCATCTGAACGGCATGAAAAATATCATTCTGATc < 2:461562/289‑1 (MQ=255) tGGCGTAGTCGATAAGCTCTACAATTGAATGCAAACCTAGCTTGCCATAAATATTAGATTTATGCGCACTAACTGTTTTATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAACGTAATATGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTTGAACTATTCGTACTACATTTATTGCTTTTTATATAGTTAAGCGTTTCGCTGGGAAAAAACGTGTATCCGGAGAGGATCATCTGAACGGCATGAAAAATATCATTCTGATc < 1:1557489/289‑1 (MQ=255) cGTAGTCGATAAGCTCTACAATTGAATGCAAACCTAGCTTGCCATAAATATTAGATTTATGCGCACTAACTGTTTTATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAACGTAATATGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTTGAACTATTCGTACTACATTTAtt > 2:971001/1‑199 (MQ=255) cGTAGTCGATAAGCTCTACAATTGAATGCAAACCTAGCTTGCCATAAATATTAGATTTATGCGCACTAACTGTTTTATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAACGTAATATGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTTGAACTATTCGTACTACATTTATTGCTTTTTATATAGTTAAGCGTTTCGCTGGGAAAAAACGTGTATCCGGAGAGGATCATCTGAACGGCATGAAAAATATCATTCTGATCAtt > 1:2025373/1‑289 (MQ=255) gTCGATAAGCTCTACAATTGAATGCAAACCTAGCTTGCCATAAATATTAGATTTATGCGCACTAACTGTTTTATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAACGTAATATGGTCACTTCAc < 1:1243596/149‑1 (MQ=255) tCGATAAGCTCTACAATTGAATGCAAACCTAGCTTGCCATAAATATTAGATTTATGCGCACTAACTGTTTTATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAACGTAATATGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTTGAACTATTCGTACTACATTTATTGCTTTTTATATAGTTAAGCGTTTCGCTTGGCAACAACGTGTAACCGGAGAGGATCATCTGAACGGAATGAAAAATATCATTCTGATCATTGCCtt > 1:694136/1‑289 (MQ=255) tCGATAAGCTCTACAATTGAATGCAAACCTAGCTTGCCATAAATATTAGATTTATGCGCACTAACTGTTTTATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAACGTAATATGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTTGAACTATTCGTACTACATTTATTGCTTTTTATATAGTTAAGCGTTTCGCTGGGAAAAAACGTGTATCCGGAGAGGATCATCTGAACGGCATGAAAAATATCATCCTGATCATTGAAtt > 2:2523578/1‑289 (MQ=255) gCTCTACAATTGAATGCAAACCTAGCTTGCCATAAATATTAGATTTATGCGCACTAACTGTTTTATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAACGTAATATGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTTGAACTATTCGTACTACATTTATTGCTTTTTATATAGTTAAGCGTTTCGCTGGGAAAAAACGTGTATCCGGAGAGGATCATCTGAACGGCATGAAAAATATCATTCTGATCATTGCATTTACTGAc > 1:1499154/1‑289 (MQ=255) tctACAATTGAATGCAAACCTAGCTTGCCATAAATATTAGATTTATGCGCACTAACTGTTTTATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATcc < 2:1533695/107‑1 (MQ=255) tctACAATTGAATGCAAACCTAGCTTGCCATAAATATTAGATTTATGCGCACTAACTGTTTTATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAACGTAATATGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTTGAACTATTCGTACTACATTTATTGCTTTTTATATAGTTAAGCGTTTCGCTGGGAAAAAACGTGTATCCGGAGAGGATCATCTGAACGGCATGAAAAATATCATTCTGATCATTGCATTTACTGACaa > 1:1435379/1‑289 (MQ=255) ctACAATTGAATGCAAACCTAGCTTGCCATAAATATTAGATTTATGCGCACTAACTGTTTTATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGa < 1:807134/116‑1 (MQ=255) ctACAATTGAATGCAAACCTAGCTTGCCATAAATATTAGATTTATGCGCACTAACTGTTTTATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAACGTAATATGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTTGAACTATTCGTACTACATTTATTGCTTTTTATATAGTTAAGCGTTTCGCTGGGAAAAAACGTGTATCCGGAGAGGATCATCTGaa > 1:1681721/1‑246 (MQ=255) ctACAATTGAATGCAAACCTAGCTTGCCATAAATATTAGATTTATGCGCACTAACTGTTTTATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAACGTAATATGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTTGAACTATTCGTACTACATTTATTGCTTTTTATATAGTTAAGCGTTTCGCTGGGAAAAAACGTGTATCCGGAGAGGATCATCTGaa < 2:1681721/246‑1 (MQ=255) ctACAATTGAATGCAAACCTAGCTTGCCATAAATATTAGATTTATGCGCACTAACTGTTTTATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAACGTAATATGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTTGAACTATTCGTACTACATTTATTGCTTTTTATATAGTTAAGCGTTTCGCTGGGAAAAAACGTGTATCCGGAGAGGATCATCTGAAc > 2:2737770/1‑247 (MQ=255) ctACAATTGAATGCAAACCTAGCTTGCCATAAATATTAGATTTATGCGCACTAACTGTTTTATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAACGTAATATGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTTGAACTATTCGTACTACATTTATTGCTTTTTATATAGTTAAGCGTTTCGCTGGGAAAAAACGTGTATCCGGAGAGGATCATCTGAACGGCATGAAAAATATCATTCTGATCATTGCATTTACTGACaaa > 2:487039/1‑289 (MQ=255) ctACAATTGAATGCAAACCTAGCTTGCCATAAATATTAGATTTATGCGCACTAACTGTTTTATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAACGTAATATGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTTGAACTATTCGCACTACATTTATTGCTTTTTATATAGTTAAGCGTTTCGCTGGGAAAAAACGTGTATCCGGAGAGGAACATCTGAACGGCATGAAAAATATCATGCTGATCATTGCATTTACTGACaaa > 2:296098/1‑289 (MQ=255) ||| GATACCAACCTGCTGGCTCTGGATGATCCCGCAATGGCACAAACCGTCGCCATCGAATTACGTAATAGCGATCGCTCCCGGCTCGCACTGGGGGAGGCGAGCCCGACTGAGGAAGTAGATGCAAATGGCAATGTCACACTAAACTTTTTTGCCAATTATCGAGCGTTAGCCAGCGGTGTTCGGCCAGGTGTGGCGAAAGCGGATGCGATATTTATGATCAATTATAATTAATATTATATTAATTCGTATAATTTGGCGTAGTCGATAAGCTCTACAATACTATGCAAACCTAGCTTGCCATAAATATTAGATTTATGCGCACTAACTGTTTTATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAACGTAATATGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTACTACTATTCGTACTACATTTATTGCTTTTTATATAGTTAAGCGTTTCGCTGGGAAAAAACGTGTATCCGGAGAGGATCATCTGAACGGCATGAAAAATATCATTCTGATCATTGCATTTACTGACAAA > CP042583/464121‑464680 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |