| Predicted mutation | ||||||
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| RA | CP042583 | 464,552 | 3 bp→TGA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP042583 | 464,553 | 0 | C | G | 99.6% | 603.0 / NA | 256 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base G (151/104); minor base A (1/0); total (152/104) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
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| * | CP042583 | 464,554 | 0 | T | A | 100.0% | 616.5 / NA | 256 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base A (152/104); total (152/104) | |||||||||||
Only 100 of 256 total aligned reads displayed.
GTTAGCCAGCGGTGTTCGGCCAGGTGTGGCGAAAGCGGATGCGATATTTATGATCAATTATAATTAATATTATATTAATTCGTATAATTTGGCGTAGTCGATAAGCTCTACAATACTATGCAAACCTAGCTTGCCATAAATATTAGATTTATGCGCACTAACTGTTTTATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAACGTAATATGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTACTACTATTCGTACTACATTTATTGCTTTTTATATAGTTAAGCGTTTCGCTGGGAAAAAACGTGTATCCGGAGAGGATCATCTGAACGGCATGAAAAATATCATTCTGATCATTGCATTTACTGACAAAACCGTTAGCACCAGCTTGTATCGCTCTGCCAGCATAAAAGCATTC‑ACTTTTGCTACTTAAAAATAACACTTTCACTGTGCTCTGGATTTGTTTGATCCTTTTCAGGAAGGTAAAACCGTCTGTTCCGGGCAAGTCTATATCCATAATGATTAA > CP042583/464285‑464833 ||| gTTAGCCAGCGGTGTTCGGCCAGGTGTGGCGAAAGCGGATGCGATATTTATGATCAATTATAATTAATATTATATTAATTCGTATAATTTGGCGTAGTCGATAAGCTCTACAATTGAATGCAAACCTAGCTTGCCATAAATATTAGATTTATGCGCACTAACTGTTTTATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAACGTAATATGGTCACTTCACGATTAGATAGCACAGTGACCGTTGAACTATTCGTACTACATTTa < 1:662913/289‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |