Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 755,224 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 755,224 | 0 | A | T | 98.9% | 656.9 / NA | 278 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (125/149); minor base G (0/3); total (126/152) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.54e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
* | CP042583 | 755,225 | 0 | G | C | 100.0% | 656.6 / NA | 278 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base C (126/152); total (126/152) | |||||||||||
* | CP042583 | 755,226 | 0 | C | G | 99.6% | 666.8 / NA | 278 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base G (125/152); total (126/152) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.53e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 278 total aligned reads displayed.
GGTTGAAATTCTTGATCCGCTTTCTTGCTACATGAACATAAATCCTGCGGCGTCTTCTATTCA‑CTACAAAGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGG‑CACTGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGAGCG‑TCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATAGCCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGAATATATCAAAGAGGCGCAAGGGTGCGATATCCGCTGTCTGGTTGTTGGCGATGAAGTGGTCGCTGCGATTGAACGGCGGGCGAAA‑GAGGGCGATTTTCGTTCCAATTTGCA > CP042583/754944‑755504 ||| aaTTCTTGATCCGCTTTCTTGCTACATGAACATAAGTCCTGCGGCGTCTTCTATTCA‑CTACAAAGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGG‑CACTGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGG‑TCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATAcc < 2:2711972/289‑1 (MQ=255) ccGCTTTCTTGCTACATGAACATAAATCCTGCGGCGTCTTCTATTCA‑CTACAAAGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGG‑CACTGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGG‑TCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTaa < 1:1495242/289‑1 (MQ=255) ttCTTGCTACATGAACATAAATCCTGCGGCGTCTTCTATTCA‑CTACAAAGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGG‑CACTGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGG‑TCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGAc < 1:2215660/289‑1 (MQ=255) tGAACATAAATCCTGCGGCGTCTTCTATTCA‑CTACAAAGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGG‑CACTGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGG‑TCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCggtgg < 1:1016664/289‑1 (MQ=255) aaCATAAATCCTGCGGCGTCTTCTATTCA‑CTACAAAGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGG‑CACTGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGG‑TCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCggtggt > 1:202446/1‑288 (MQ=255) aCAGAAATCCGGCGGCGTCTCCAATTCA‑CTACAAGGGCCGCAAGTACCGCCATTTTGACGCAGGGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTGCCTTTTATGGGACGGCGG‑CACTGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGG‑TCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGgtggtg < 1:1223831/288‑1 (MQ=255) aTAAATCCTGCGGCGTCTTCTATTCA‑CTACAAAGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGG‑CACTGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGG‑TCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGt > 1:1974793/1‑278 (MQ=255) tCCTGCGGAGTCTT‑TCTTGACCTACCACGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCATGGATCCCGCGTATTGGCACCGCAATTACCTTTTATGGGACGGCGG‑CACTGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGG‑TCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCtg < 2:2332434/289‑1 (MQ=255) gcggcgTCTTCTATTCA‑CTACAAAGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGG‑CACTGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGG‑TCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCtggtgg > 2:1043879/1‑289 (MQ=255) tcttctATTCC‑CTACAAAGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGG‑CACTGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGG‑TCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAAATGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCCCGGGCATTGCGCATTCGCCGGCTGATACCAGCGATTTAATCGACATCGTCGGTGGTGCGCCGCTGGCGGTcctgg > 1:2460321/1‑285 (MQ=255) ctATTCA‑CTACAAAGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGG‑CACTGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGG‑TCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAgttggt < 1:1729196/289‑1 (MQ=255) tACAAAGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGG‑CACTGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGG‑TCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGCCATGGTCGGTGGTTCGCCGCTGGTGGCCAAGTTGGTTGAAGGc > 2:550298/1‑288 (MQ=255) tACAAAGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGG‑CACTGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGG‑TCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGc > 1:1593271/1‑288 (MQ=255) tACAAAGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGG‑CACTGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGG‑TCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCa < 2:274291/289‑1 (MQ=255) tACAAAGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGG‑CACTGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGG‑TCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCGGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACTTGGGCGGTGGTGCTCCGCTGGGGGTCCATGTGGTTGAAGGc > 2:1096483/1‑288 (MQ=255) aaGGACGCAGGTAACCCCATTTTGGCGTAGTTGTCCCGCGTATTGGCAACGCCATTACCTTTTAT‑GGTCAGCGGCCACTGCGCCTGTTCGGGAGGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGG‑TCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGCCCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCa < 2:2093352/289‑1 (MQ=255) aGGCCGGAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGG‑CACTGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGG‑TCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCATGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAg < 1:127035/289‑1 (MQ=255) aGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGG‑CACTGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGG‑TCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTgcgc < 2:1862352/257‑1 (MQ=255) aGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGG‑CACTGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGG‑TCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTgcgc > 1:1862352/1‑257 (MQ=255) aGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGG‑CACTGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGG‑TCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTgcgc > 1:1164028/1‑257 (MQ=255) gCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGG‑CACTGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGG‑TCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAAt > 1:1554452/1‑289 (MQ=255) gCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGG‑CACTGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGG‑TCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTCCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGTTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTTAAGTCACGCAGGGCAt > 2:2111332/1‑289 (MQ=255) gCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGCGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGG‑CACTGCGCCAGATCGAGATGCCGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGG‑TCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATCCAACTGCCGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCCTTGCGCATCCGACGGATGATACCCGCTCTTTACTCGACACTGCCGGTGGTGCCCCGACGGCGCCCAAGGTGGGTGCACGCACGCAGGGaag > 2:2038751/1‑288 (MQ=255) ttACCCCGTGTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCGTTACCTTTTGTGGGACGGCGG‑CACTGCGCCAGTTCGGGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGG‑TCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGcg < 2:2495157/289‑1 (MQ=255) cctttttGACGCATGGATCCCGCGTATTGGCACCGCCGTTACCTTTTATGGGACGGCGG‑CACTGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGG‑TCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTg < 2:215368/286‑1 (MQ=255) ttttGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGG‑CACTGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGG‑TCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCCAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTg > 2:1440803/1‑289 (MQ=255) tttGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGG‑CACTGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGG‑TCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGGGGTCAAGTTGGTTGACGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCggg > 1:2244476/1‑289 (MQ=255) aCGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGG‑CACTGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGG‑TCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGt < 2:1720360/223‑1 (MQ=255) gCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCTCCATTACCTTGTATGGGACGGCGG‑CACTGCGCCAGTTCGATATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGG‑TCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGgaga < 1:2365746/289‑1 (MQ=255) aGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGG‑CACTGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGG‑TCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGcgtcg < 1:1397856/275‑1 (MQ=255) tGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGG‑CACTGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGG‑TCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGcg > 1:1948444/1‑270 (MQ=255) cgcgTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGG‑CACTGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGG‑TCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAggc < 1:2105542/289‑1 (MQ=255) cgTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGG‑CACTGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGG‑TCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAg < 1:1182617/234‑1 (MQ=255) tATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGG‑CACTGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGG‑TCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCa < 2:2248759/249‑1 (MQ=255) accgcgattgaggtttAGGGGACGGCGG‑CACTGCGCCAGTTGGCGTTGCTGGGGAGCTATCCGCTCAGTGAGTCGG‑TCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATGCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGc < 2:2644936/275‑1 (MQ=255) aCCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGG‑CACTGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGG‑TCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGc < 1:1440803/288‑1 (MQ=255) ccGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGG‑CACTGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGG‑TCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAAt < 2:1566461/247‑1 (MQ=255) gCCATTACCTTTTATGGGACGGCGG‑CACTGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGG‑TCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGGTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGa > 1:2429866/1‑289 (MQ=255) ccATTACCTTTTATGGGACGGCGG‑CACTGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGG‑TCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTg < 2:19574/254‑1 (MQ=255) ttATGGGACGGCGG‑CACTGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGG‑TCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCCCGGGCATTGCGCATTCGCCGGCTGATACCCGCGATCTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGGGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCCGGGCGCGGAAAGCGGGGTTGAGGCttt > 2:2234617/1‑288 (MQ=255) ttATGGGACGGCGG‑CACTGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGG‑TCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTgcgc < 2:2510150/197‑1 (MQ=255) tATGGGACGGCGG‑CACTGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGG‑TCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTTGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGGCAGGCGGGGGGAAGGGTGGTTGAGGCGTTcc > 1:735089/1‑289 (MQ=255) aCGGCGG‑CACTGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGG‑TCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAg < 1:2289755/222‑1 (MQ=255) aCGGCGG‑CACTGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGG‑TCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGGCACGGGCATCGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATCTAATCGAACTGTTCGGTGGTGCGCTGCGGGTGGTCACGTTGGTTGCAGGCAAGAAGGTAGTTGGCGGCGGTGTGTCGTAGACGCGTCAGGGCGCGGCAAGCGTGATTGACGcgtatcgtggtg > 2:135816/1‑278 (MQ=255) cTGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGG‑TCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGGGACGCGTCCGGCGGCGGAAAGCGGTGTTGACGCTTTCcgctggctcttctcca > 2:1179763/1‑276 (MQ=255) cTGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGG‑TCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACgcgc < 1:30727/289‑1 (MQ=255) tGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGG‑TCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGGCAGGCGGCGGAAAGCGTGAGTGACGCGTTCCGCGGTCGGAACgcgc > 2:948568/1‑288 (MQ=255) ccAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGG‑TCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCcg < 1:381165/270‑1 (MQ=255) cAGTTCGAGATGCTGGGGGGCTATCCGCTCAATGAGTCGG‑TGGCCATTGCCCGGGGGCGTGACAAATTGCGTTCCAGGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTTAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTc < 2:1979071/289‑1 (MQ=255) cAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGTTCAATGAGTCGG‑TCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTc < 1:2527226/289‑1 (MQ=255) cGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGG‑TCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTg < 1:1118516/289‑1 (MQ=255) cGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGG‑TCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTg < 1:204427/289‑1 (MQ=255) agaTGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGG‑TCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGt > 2:1228950/1‑157 (MQ=255) agaTGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGG‑TCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGaa < 2:2556175/271‑1 (MQ=255) tGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGGGTCGG‑TCGCCATTGCCCGAGCGAGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGa < 1:2191854/289‑1 (MQ=255) gCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGG‑TCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGaa < 1:846877/289‑1 (MQ=255) gCTGGGGAGCTAGCCCCTCAA‑GAGGTCGTTCGCCATTGCCCTGGCGCGTGACAATTTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTAAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGa < 2:1888201/288‑1 (MQ=255) cTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGG‑TCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGgag > 2:1666143/1‑219 (MQ=255) cTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGG‑TCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGgag < 1:1666143/219‑1 (MQ=255) cTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGG‑TCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGAat > 1:2137009/1‑289 (MQ=255) tGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGTCGG‑TCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACgcgc < 1:693252/270‑1 (MQ=255) tATCCGCTCAATGGGTCGG‑TCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGAATATATCAAag < 1:680532/289‑1 (MQ=255) aTCCGCTCAATGAGTCGG‑TCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTGCGCGGTCTGAACGCCCATATTCGGGGGCAGGAATATATCAAagt > 2:1137796/1‑288 (MQ=255) tCCGCTCAATGAGTCGG‑TCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAggc < 2:1938268/219‑1 (MQ=255) cccaagtgctccgg‑TCCCCTTTGCCCGGTCGCGTGACAATTGGGGTTCCATCCATCTGCCGTCGCGGCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGTTTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGAATATATCAAAGAGgcg < 2:817386/276‑1 (MQ=255) cTCAATGAGTCGG‑TCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGAATATATCAAAGAGgcgc > 1:372957/1‑289 (MQ=255) tcactggggcgg‑TCGCCATGGCCGGGGCGGTTGACAAATTGCGTTCCATGGAGCTGCTGGTGGGTAAGGGCATCGGCCTGCCTGTCGCGGGCATTGCGCCTTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGAATATATCAAAGAGGCGCa < 2:455231/278‑1 (MQ=255) tCAATGAGCCGG‑TCGCCATTGCCCGGGCGCGTGGCAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATGCGCCGGATTATACCAGCGATGTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGGTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGAATATATCAAAGAGGCGCa < 1:437760/289‑1 (MQ=255) cAATGAGTCGG‑TCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGAATATATCAAAGAGGCGCaa < 2:736569/289‑1 (MQ=255) aatgggtcgg‑TCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGAATATATCAAAGAGGCGCAAg < 1:2603412/280‑1 (MQ=255) agtcgg‑TCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGAATATATCAAAGAGGCGCAAGGGt < 1:817582/283‑1 (MQ=255) tcgg‑TCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGAc > 2:891357/4‑123 (MQ=255) tCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGATGCGCCGCAGGCGGCGGAAAGCGGGATTGACGCGTGCCGCGGTCTGAACGCGCACATTCGGGTGCAGGAATATACCAACTAGGCCCAAggggtcggt > 2:2627567/1‑281 (MQ=255) tCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGAATATATCAAAGAGGCGCAAGGGtcggcta > 2:533562/1‑282 (MQ=255) tCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGAATATATCAAAGAGGCGCAAGGGTGCGata > 1:1456685/1‑288 (MQ=255) gCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGAATATATCAAAGAGGCGCAAGGGTGCGATATcc > 1:1905827/1‑289 (MQ=255) tGCCCGGGGGCGTGACAAATTGCGTTCCCTGCAACTGCTGGCGCGTGAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGAATATATCAAAGAGGCGCAAGGGTGCGATATCCGCTGt < 2:711185/289‑1 (MQ=255) tGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGAATATATCAAAGAGGCGCAAGGGTGCGATATCCGCTGt < 2:260862/289‑1 (MQ=255) gggCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGc < 1:961891/200‑1 (MQ=255) gcgcGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGCTACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGCTGGTTGAAGGCACGCAGGGCATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGGCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCGGCGGTCTGAACGCGCATATTCCGGTCCACGAATATAACAAAGAGGCGCCACGGTCCGATATCCGCTGTCGGgttg > 2:1517548/1‑289 (MQ=255) gcgcGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGcg < 1:2727494/163‑1 (MQ=255) gcgcGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGc > 2:569350/1‑198 (MQ=255) gcgcGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGc < 1:569350/198‑1 (MQ=255) gcgTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGAATATATCAAAGAGGCGCAAGGGTGCGATATCCGCTGTCTGgttgt < 1:1137796/288‑1 (MQ=255) gCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGAATATATCAAAGAGGCGCAAGGGTGCGATATCCGCTGTCTGGTTGTTGGCGATGAAGTg > 1:833496/1‑289 (MQ=255) gTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGc > 2:1023559/1‑182 (MQ=255) gTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGc < 1:1023559/182‑1 (MQ=255) ggaTGGAACTGCTTGCGCGTCAGGGCATTGACCTGCCGGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGGGGGGCGCCGCTGGTGGTGAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGAATATATCAAAGAGGCGCAAGGGTGCGATATCCGCTGTCTGGTTGTTGGCGATGAAGTGGTCGc < 2:1279964/287‑1 (MQ=255) tGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCa > 1:2498373/1‑130 (MQ=255) ctgGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGAATATATCAAAGAGGCGCAAGGGTGCGATATCCGCTGTCTGGTTGTTGGCGATGAAGTGGTCGCTg < 2:1804949/280‑1 (MQ=255) ctgGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGAATATATCAAAGAGGCGCAAGGGTGCGATATCCGCTGTCTGGTTGTTGGCGATGAAGTGGTCGCTg > 1:1804949/1‑280 (MQ=255) ggCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAgttggttg < 2:345093/110‑1 (MQ=255) gcctgTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACgcgc < 1:926615/176‑1 (MQ=255) gcctgTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACgcgc > 2:926615/1‑176 (MQ=255) gcctgTCACGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGAATATATCAAAGAGGCGCAAGGGTGCGATATCCGCTGTCTGGTTGTTGGCGATGAAGTGGTCGCTGCGATTGAACGGCGGGCGAAA‑GAGGGCGAttt > 1:793459/1‑288 (MQ=255) gtaaCGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGAATATATCAAAGAGGCGCAAGGGTGCGATATCCGCTGTCTGGTTGTTGGCGATGAAGTGGTCGCTGCGATTGAACGGCGGGCGAAA‑GAGGGCGATTTTCGtt < 1:1982805/286‑1 (MQ=255) aCGGGCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGAATATATCAAAGAGGCGCAAGGGTGCGATATCCGCTGTCTGGTTGTTGGCGATGAAGTGGTCGCTGCGATTGAACGGCGGGCGAAA‑GAGGGCGATTTTCGTTCCa > 1:2634173/1‑289 (MQ=255) ggCATTGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGAATATATCAAAGAGGCGCAAGGGTGCGATATCCGCTGTCTGGTTGTTGGCGATGAAGTGGTCGCTGCGATTGAACGGCGGGCGAAA‑GAGGGCGATTTTCGTTCCAAtt > 1:485843/1‑289 (MQ=255) gCATTGCGCATTCGCCGGCTGATACTAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCCGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTTGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACTCGCATATTCTGGTGCAGGAATATATCAAAGAGGCGCAAGGGTGCGATATCCGCGGTCTGGTTGTTGGCGAGGCAGTGGGCGCTGCGTGTGAACGGCGGGCGAAATGAGGG‑GATTTTTGTTACAAgtt > 2:799497/1‑289 (MQ=255) tGCGCATTCGCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGAATATATCAAAGAGGCGCAAGGGTGCGATATCCGCTGTCTGgttgt > 1:2649377/1‑222 (MQ=255) ||| GGTTGAAATTCTTGATCCGCTTTCTTGCTACATGAACATAAATCCTGCGGCGTCTTCTATTCA‑CTACAAAGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCCCGCGTATTGGCACCGCCATTACCTTTTATGGGACGGCGG‑CACTGCGCCAGTTCGAGATGCTGGGGAGCTATCCGCTCAATGAGAGCG‑TCGCCATTGCCCGGGCGCGTGACAAATTGCGTTCCATGCAACTGCTGGCGCGTCAGGGCATCGACCTGCCTGTCACGGGCATTGCGCATAGCCCGGATGATACCAGCGATTTAATCGACATGGTCGGTGGTGCGCCGCTGGTGGTCAAGTTGGTTGAAGGCACGCAGGGAATTGGCGTCGTGCTGGCGGAGACGCGTCAGGCGGCGGAAAGCGTGATTGACGCTTTCCGCGGTCTGAACGCGCATATTCTGGTGCAGGAATATATCAAAGAGGCGCAAGGGTGCGATATCCGCTGTCTGGTTGTTGGCGATGAAGTGGTCGCTGCGATTGAACGGCGGGCGAAA‑GAGGGCGATTTTCGTTCCAATTTGCA > CP042583/754944‑755504 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |