Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 465,962 | 3 bp→CGA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 465,962 | 0 | G | C | 99.7% | 845.7 / NA | 356 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base C (194/161); total (194/162) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.55e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.95e-01 | |||||||||||
* | CP042583 | 465,963 | 0 | C | G | 99.4% | 829.8 / NA | 356 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (2/0); new base G (191/162); total (194/162) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.02e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
* | CP042583 | 465,964 | 0 | T | A | 99.7% | 843.7 / NA | 356 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/0); new base A (193/162); total (194/162) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 356 total aligned reads displayed.
GCTCGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGTTATCCATCAATAACATCTGTACGGCGTAACGCATACGACACTCTGTGACAATCTGGCTATAGCTGGTATTTTCGTTTTTTAATTTCTTTTTGAGCAGGCTGGGGCTTAAACATAGGCTACTGGCGACAATTCGCAGATTCCAGTAATGCTGAATATCGCTTTGAATAATGCGGCAGACGCTGTCGCGGACGCTGCTGCGTAAGATATACATCAGTAGGGCAATAAACCGGCTTTGCTCAAGAAAGTTAGACAATACGGTAAAAAGCAATGCGCGCGTCAACTCCGCTTCGCAGGGTCTGCTGGGTTGCTGCTTGCTGTGGTTGGCGGCTAGCCGGAACACTTCCGGTGTACGGCTATGACAAGCGATAACCGGGGTTGCCAGCCGGCTCCAGGGCTTTACACAGGTTAAGTTCTTATTTAAAAACAACAGATAATCGTTGATGATGTTACGGTTGATGTGGGTGATTAATACGTGATTTAACGTACTGAGTTCAATGACGTTATTGTTGC > CP042583/465683‑466242 ||| cgacGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGTTATCCATCAATAACATCTGTACGGCGTAACGCATACGACACTCTGTGACAATCTGGCTATAGCTGGTATTTTCGTTTTTTAATTTCTTTTTGAGCAGGCTGGGGCTTAAACATAGCGAACTGGCGACAATTCGCAGATTCCAGTAATGCTGAATATCGCTTTGAATAATGCGGCAGACGCTGTCGCGGACGCTGCTGCGTAAGATATACATCAGTAGGGCAATAAACCGCGATTGCTCa > 1:637112/4‑289 (MQ=255) cgacGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGTTATCCATCAATAACATCTGTACGGCGTAACGCATACGACACTATGTGACAATCTGGCTATAGCTGGTATTTTCGTTTTTTAATTTCTTTTTGAGCAGGCTGGGGCTTAAACATAGCGAACTGGCGACAATTCGCAGATTCCAGTAATGCTGAATATCGCTTTGAATAATGCGGCAGACGCTGTAGCGGACGCTGCTGCGTAAGATATACATAAGCAGGGCAATAAACCGCGATTGCTCa > 1:841513/4‑289 (MQ=255) acGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGTTATCCATCAATAACATCTGTACGGCGTAACGCATACGACACTCTGTGACAATCTGGCTATAGCTGGTATTTTCGTTTTTTAATTTCTTTTTGAGCAGGCTGGGGCTTAAACATAGCGAACTGGCGACAATTCGCAGATTCCAGTAATGCTGAATATCGCTTTGAATAATGCGGCAGACGCTGTCGCGGACGCTGCTGCGTAAGATATACATCAGTAGGGCAATAAACCGCGATTGCTCaa < 2:2299741/287‑1 (MQ=255) acGTGCTGCTATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGTTATCCATCAATAACATCTGTACGGCGTAACGCATACGACACTCTGTGACAATCTGGCTATAGCTGGTATTTTCGTTTTTTAATTTCTTTTTGAGCAGGCTGGGGCTTAAACATAGCGAACTGGCGACAATTCGCAGATTCCAGTAATGCTGAATATCGCTTTGAATAATGCGGCAGACGCTGTCGCGGACGCTGCTGCGTAAGATATACATCAGTAGGGCAATAAACCGCGATTGCTCAAg > 1:2330912/2‑289 (MQ=255) ctgctATAGCCACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGTTATCCATCAATAACATCTGTACGGCGTAACGCATACGACACTCTGTGACAATCTGGCTATAGCTGGTATTTTCGTTTTTTAATTTCTTTTTGAGCAGGCTGGGGCTTAAACATAGCGAACTGGCGACAATTCGCAGATTCCAGTAATGCTGAATATCGCTTTGAATAATGCGGCAGACGCTGTCGCGGACGCTGCTGCGTAAGATATACATCAGTAGGGCAATAAACCGCGATTGCTCAAGAAAGt > 1:758435/1‑289 (MQ=255) ccACATAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGTTATCCATCAATAACATCTGTACGGCGTAACGCATACGACACTCTGTGACAATCTGGCTATAGCTGGTATTTTCGTTTTTTAATTTCTTTTTGAGCAGGCTGGGGCTTAAACATAGCGAACTGGCGACAATTCGCAGATTCCAGTAATGCTGAATATCGCTTTGAATAATGCGGCAGACGCTGTCGCGGACGCTGCTGCGTAAGATATACATCAGTAGGGCAATAAACCGCGATTGCTCAAGAAAGTTAGACAATa < 1:280658/289‑1 (MQ=255) aTAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGTTATCCATCAATAACATCTGTACGGCGTAACGCATACGACACTCTGTGACAATCTGGCTATAGCTGGTATTTTCGTTTTTTAATTTCTTTTTGAGCAGGCTGGGGCTTAAACATAGCGAACTGGCGACAATTCGCAGATTCCAGTAATGCTGAATATCGCTTTGAATAATTCGGCAGACGCTGTCGCGGACGCTGCTGCGTAAGATATACATCAGTAGGGCAATAAACCGCGAATGGCCAAGAAAGTTAGACAATAcctg > 2:2547346/1‑286 (MQ=255) aTAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGTTATCCATCAATAACATCTGTACGGCGTAACGCATACGACACTCTGTGACAATCTGGCTATAGCTGGTATTTTCGTTTTTTAATTTCTTTTTGAGCAGGCTGGGGCTTAAACATAGCGAACTGGCGACAATTCGCAGATTCCAGTAATGCTGAATATCGCTTTGAATAATGCGGCAGACGCTGTCGCGGACGCTGCTGCGTAAGATATACATCAGTAGGGCAATAAACCGCGATTGCTCAAGAAAg > 2:1208711/1‑275 (MQ=255) aTAATTGCGCCACCTGAGTGATATTTTTGTTATCCATCAATAACATCTGTACGGCGTAACGCATACGACACTCTGTGACAATCTGGCTATAGCTGGTATTTTCGTTTTTTAATTTCTTTTTGAGCAGGCTGGGGCTTAAACATAGCGAACTGGCGACAATTCGCAGATTCCAGTAATGCTGAATATCGCTTTGAATAATGCGGCAGACGCTGTCGCGGACGCTGCTGCGTAAGATATACATCAGTAGGGCAATAAACCGCGATTGCTCAAGAAAGTTAGACAATACGGt > 2:1095880/1‑289 (MQ=255) gTGATATTTTTGTTATCCATCAATAACATCTGTACGGCGTAACGCATACGACACTCTGTGACAATCTGGCTATAGCTGGTATTTTCGTTTTTTAATTTCTTTTTGAGCAGGCTGGGGCTTAAACATAGCGAACTGGCTACAATTCGCAGATTCCAGTAATGCTGAATATCGCTTTGAATAATGCGGCAGACGCTGTCGCGGACGCTGCTGCGTAAGATATCCAACCGTAGGTCAAAAAACCGCGTGTGCTCAAGCAAGTTAGACAATACGATAAAAAGCAAtaccgcag > 2:2251914/1‑282 (MQ=255) atatTTTTGTTATCCATCAATAACATCTGTACGGCGTAACGCATACGACACTCTGTGACAATCTGGCTATAGCTGGTATTTTCGTTTTTTAATTTCTTTTTGAGCAGGCTGGGGCTTAAACATAGCGAACTGGCGACAATTCGCAGATTCCAGTAATGCTGAATATCGCTTTGAATAATGCGGCAGACGCTGTCGCGGACGCTGCTGCGTAAGATATACATCAGTAGGGCAATAAACGGCGATTGCCACAGAAAGTTAGACAATACGGTAAAAAGCAATGCGCGCGTCa > 2:2196163/1‑289 (MQ=255) tCAATAACATCTGTACGGCGTAACGCATACGACACTCTGTGACAATCTGGCTATAGCTGGTATTTTCGTTTTTTAATTTCTTTTTGAGCAGGCTGGGGCTTAAACATAGCGAACTGGCGACAATTCGCAGATTCCAGTAATGCTGAATATCGCTTTGAATAATGCGGCAGACGCTGTCGCGGACGCTGCTGCGTAAGATATACATCAGTAGGGCAATAAACCGCGATTGCTCAAGAAAGTTAGACAATACGGTAAAAAGCAATGCGCGCGTCAACTCCGCTTCGCAggg > 1:1608681/1‑289 (MQ=255) tCAATAACATCTGTACGGCGTAACGCATACGACACTCTGTGACAATCTGGCTATAGCTGGTATTTTCGTTTTTTAATTTCTTTTTGAGCAGGCTGGGGCTTAAACATAGCGAACTGGCGACAATTCGCAGATTCCAGTAATGCTGAATATCGCTTTGAATAATGCGGCAGACGCTGTCGCGGACGCTGCTGCGTAAGATATACATCAGTAGGGCAATAAACCGCGATTGCTCAAGAAAGTTAGACAATACGGTAAAAAGCAATGCGCGCGTCAACTCCGCTTCGCAggg > 1:389777/1‑289 (MQ=255) tCTGTACGGCGTAACGCATACGACACTCTGTGACAATCTGGCTATAGCTGGTATTTTCGTTTTTTAATTTCTTTTTGAGCAGGCTGGGGCTTAAACATAGCGAACTGGCGACAATTCGCAGATTCCAGTAATGCTGAATATCGCTTTGAATAATGCGGCAGACGCTGTCGCGGACGCTGCTGCGTAAGATATACATCAGTAGGGCAATAAACCGCGATTGCTCAAGAAAGTTAGACAATACGGTAAAAAGCAATGCGCGCGTCAACTCCGCTTCGCAGGGTCTGCTggg < 2:2369096/289‑1 (MQ=255) cTGTACGGCGTAACGCATACGACACTCTGTGACAATCTGGCTATAGCTGGTATTTTCGTTTTTTAATTTCTTTTTGAGCAGGCTGGGGCTTAAACATAGCGAACTGGCGACAATTCGCAGATTCCAGTAATGCTGAATATCGCTTTGAATAATGCGGCAGACGCTGTCGCGGACGCTGCTGCGTAAGATATACATCAGTAGGGCAATAAACCGCGATTGCTCAAGAAAGTTAGACAATACGGTa < 1:1493839/244‑1 (MQ=255) tGTACGGCGTAACGCATACGACACTCTGTGACAATCTGGCTATAGCTGGTATTTTCGTTTTTTAATTTCTTTTTGAGCAGGCTGGGGCTTAAACATAGCGAACTGGCGACAATTCGCAGATTCCAGTAATGCTGAATATCGCTTTGAATAATGCGGAAGACGCTGTCGCGGACGCTGCTGCGTAAGATATACATCAGTAGGGCAATAAACCGCGATAGCTCAAGAAAGTTAGACAATACGGTAAAAAGCAATGCGCGCGTCAACTCCGCTTCCCAGGATCTGGTGGGtt > 2:2453683/1‑289 (MQ=255) gTACGGCGTAACGCATACGACACTCTGTGACAATCTGGCTATAGCTGGTATTTTCGTTTTTTAATTTCTTTTTGAGCAGGCTGGGGCTTAAACATAGCGAACTGGCGACAATTCGCAGATTCCAGTAATGCTGAATATCGCTTTGAATAATGCGGCAGACGCTGTCGCGGACGCTGCTGCGTAAGATATACATCAGTAGGGCAATAAACCGCGATTGCTCAAGAAAGTTAGACAATACGGTAAAAAGCAATGCGCGCGTCAACTCCGCTTCGCAGGGTCTGCTGGGtt > 2:2206873/1‑288 (MQ=255) tACGGCGTAACGCATACGACACTCTGTGACAATCTGGCTATAGCTGGTATTTTCGTTTTTTAATTTCTTTTTGAGCAGGCTGGGGCTTAAACATAGCGAACTGGCGACAATTCGCAGATTCCAGTAATGCTGAATATCGCTTTGAATAATGCGGCAGACGCTGTCGCGGACGCTGCTGCGTAAGATATACATCAGTAGGGCAATAAACCGCGATTGCTCAAGAAAGTTAGACAATACGGTAAAAAGCAATGCGCGCGTCAACTCCGCTTCGCAGGGTCTGCTGGGtt > 1:876030/1‑287 (MQ=255) cGTAACGCATACGACACTCTGTGACAATCTGGCTATAGCTGGTATTTTCGTTTTTTAATTTCTTTTTGAGCAGGCTGGGGCTTAAACATAGCGAACTGGCGACAATTCGCAGATTCCAGTAATGCTGAATATCGCTTTGAATAATGCGGCAGACGCTGTCGCGGACGCTGCTGCGTAAGATATACATCAGTAGGGCAATAAACCGCGATTGCTCAAGAAAGTTAGACAATACGGTAAAAAGCAATGCGCGCGTCAACTCCGCTTCGCAGGGTCTGCTGGGTTgctgct < 2:637112/288‑1 (MQ=255) aaCGCATACGACACTCTGTGACAATCTGGCTATAGCTGGTATTTTCGTTTTTTAATTTCTTTTTGAGCAGGCTGGGGCTTAAACATAGCGAACTGGCGACAATTCGCAGATTCCAGTAATGCTGAATATCGCTTTGAATAATGCGGCAGACGCTGTCGCGGACGCTGCTGCGTAAGATATACATCAGTAGGGCAATAAACCGCGATTGCTCAAGAAAGTTAGACAATACGGTAAAAAGCAATGCGCGCGTCAACt < 2:2012503/255‑1 (MQ=255) aaCGCATACGACACTCTGTGACAATCTGGCTATAGCTGGTATTTTCGTTTTTTAATTTCTTTTTGAGCAGGCTGGGGCTTAAACATAGCGAACTGGCGACAATTCGCAGATTCCAGTAATGCTGAATATCGCTTTGAATAATGCGGCAGACGCTGTCGCGGACGCTGCTGCGTAAGATATACATCAGTAGGGCAATAAACCGCGATTGCTCAAGAAAGTTAGACAATACGGTAAAAAGCAATGCGCGCGTCAACTCCGCTTCGCAGGGTCTGCTGGGTTGCtgctt > 1:424573/1‑286 (MQ=255) cGCATACGACACTCTGTGACAATCTGGCTATAGCTGGTATTTTCGTTTTTTAATTTCTTTTTGAGCAGGCTGGGGCTTAAACATAGCGAACTGGCGACAATTCGCAGATTCCAGTAATGCTGAATATCGCTTTGAATAATGCGGCAGACGCTGTCGCGGACGCTGCTGCGTAAGATATACATCAGTAGGGCAATAAACCGCGATTGCTCAAGAAAGTTAGACAATACGGTAAAAAGCAATGCGCGCGTCAACTACGCTTCGCAGGGTCTGCTGGGTTGCTGCTTGCtgt > 1:1202297/1‑289 (MQ=255) aCGACACTCTGTGACAATCTGGCTATAGCTGGTATTTTCGTTTTTTAATTTCTTTTTGAGCAGGCTGGGGCTTAAACATAGCGAACTGGCGACAATTCGCAGATTCCAGTAATGCTGAATATCGCTTTGAATAATGCGGCAGACGCTGTCGCGGACGCTGCTGCGTAAGATATACATCAGTAGGGCAATAAACCGCGATTGCTCAAGAAAGTTAGACAATACGGTAAAAAGCAATGCGCGCGTCAACTCCGCTTCGCAGGGTCTGCTGGGTTGCTGCTTGCTGTGGTTg > 1:2587773/1‑289 (MQ=255) aCGACACTCTGTGACAATCTGGCTATAGCTGGTATTTTCGTTTTTTAATTTCTTTTTGAGCAGGCTGGGGCTTAAACATAGCGAACTGGCGACAATTCGCAGATTCCAGTAATGCTGAATATCGCTTTGAATAATGCGGCAGACGCTGTCGCGGACGCTGCTGCGTAAGATATACATCAGTAGGGCAATAAACCGCGATTGCTCAAGAAAGTTAGACAATACGGTAAAAAGCAATGCGCGCGTCAACTCCGCTTCGCAGGGTCTGCTGGGTTGCTGCTTGCTGTGGTTg > 1:899639/1‑289 (MQ=255) tctGTGACAATCTGGCTATAGCTGGTATTTTCGTTTTTTAATTTCTTTTTGAGCAGGCTGGGGCTTAAACATAGCGAACTGGCGACAATTCGCAGATTCCAGTAATGCTGAATATCGCTTTGAATAATGCGGCAGACGCTGTCGCGGACGCTGCTGCGTAAGATATACATCAGTAGGGCAATAAACCGCGATTGCTCaa < 1:2686703/199‑1 (MQ=255) tctGTGACAATCTGGCTATAGCTGGTATTTTCGTTTTTTAATTTCTTTTTGAGCAGGCTGGGGCTTAAACATAGCGAACTGGCGACAATTCGCAGATTCCAGTAATGCTGAATATCGCTTTGAATAATGCGGCAGACGCTGTCGCGGACGCTGCTGCGTAAGATATACATCAGTAGGGCAATAAACCGCGATTGCTCAAGAAAGTTAGACAATACGGTAAAAAGCAATGCGCGCGTCAACTCCGCTTCGCAgg < 2:748870/253‑1 (MQ=255) gtgACAATCTGGCTATAGCTGGTATTTTCGTTTTTTAATTTCTTTTTGAGCAGGCTGGGGCTTAAACATAGCGAACTGGCGACAATTCGCAGATTCCAGTAATGCTGAATATCGCTTTGAATAATGCGGCAGACGCTGTCGCGGACGCTGCTGCGTAAGATATACATCAGTAGGGCAATAAACCGCGATTGCTCAAGAAAGTTAGACAATACGGTAAAAAGCAATGCGCGCGTCAACTCCGCTTCGCAGGGTCTGCTGGGTTGCTGCTTGCTGTGGTTGGCGGCTAGcc > 1:589150/1‑289 (MQ=255) gACAATCTGGCTATAGCTGGTATTTTCGTTTTTTAATTTCTTTTTGAGCAGGCTGGGGCTTAAACATAGCGAACTGGCGACAATTCGCAGATTCCAGTAATGCTGAATATCGCTTTGAATAATGCGGCAGACGCTGTCGCGGACGCTGCTGCGTAAGATATACATCAGTAGGGCAATAAACCGCGATTGCTCAAGAAAGTTAGACAATACGGTAAAAAGCAATGCGCGCGTCAACTCCGCTTCGCAGGGTCTGCTGGGTTGCTGCTTGCTGTGGTTGGCGGCTAGCCgg < 2:1227882/289‑1 (MQ=255) cAATCTGGCTATAGCTGGTATTTTCGTTTTTTAATTTCTTTTTGAGCAGGCTGGGGCTTAAACATAGCGAACTGGCGACAATTCGCAGATTCCAGTAATGCTGAATATCGCTTTGAATAATGCGGCAGACGCTGTCGCGGACGCTGCTGCGTAAGATATACATCAGTAGGGCAATAAACCGCGATTGCTCAAGAAAGTTAGACAATACGGTAAAAAGCAATGCGCGCGTCAACTCCGCTTCGCAGGGTCTGCTGGGTTGCTGCTTGCTGTGGTTGGCGGCTAGCCGGaa < 1:499138/289‑1 (MQ=255) tGGCTATAGCTGGTATTTTCGTTTTTTAATTTCTTTTTGAGCAGGCTGGGGCTTAAACATAGCGAACTGGCGACAATTCGCAGATTCCAGTAATGCTGAATATCGCTTTGAATAATGCGGCAGACGCTGTCGCGGACGCTGCTGCGTAAGATATACATCAGTAGGGCAATAAACCGCGATTGCTCAAGAAAg > 2:1691516/1‑192 (MQ=255) tGGCTATAGCTGGTATTTTCGTTTTTTAATTTCTTTTTGAGCAGGCTGGGGCTTAAACATAGCGAACTGGCGACAATTCGCAGATTCCAGTAATGCTGAATATCGCTTTGAATAATGCGGCAGACGCTGTCGCGGACGCTGCTGCGTAAGATATACATCAGTAGGGCAATAAACCGCGATTGCTCAAGAAAGTTAGACAATACGGTAAAAAGCAATGCGCGCGTCAACTCCGCTTCGCAGGGTCTGCTGGGTTGCTGCTTGCTGTGGTTGGCGGCTAGCCGGAACACt > 2:691531/1‑288 (MQ=255) ggCTATAGTTGGTATTTTCTTTTTTTAATTTCTTGTTGAGCAGGCGGGGGCTTAAACATAGCGAACTGGCGACAATTCGCAGATTCCAGTAATGCTGAATATCGCTTTGAATAATGCGGCAGACGCTGTCGCGGACGCTGCTGCGTAAGATATACATCAGTAGGGCAATAAACCGCGATTGCTCAAGAAAGTTAGACAATACGGTAAAAAGCAATGCGCGCGTCAACTCCGCTTCGCAGGGTCTGCTGGGTTGCTGCTTGCTGTGGTTGGCGGCTAGCCGGAACACTTc < 2:190663/289‑1 (MQ=255) ggCTATAGCTGGTATTTTCGTTTTTTAATTTCTTTTTGAGCAGGCTGGGGCTTAAACATAGCGAACTGGCGACAATTCGCAGATTCCAGTAATGCTGAATATCGCTTTGAATAATGCGGCAGACGCTGTCGCGGACGCTGCTGCGTAAGATATACATCAGTAGGGCAATAAACCGCGATTGCTCAAGAAAGTTAGACAATACGGTAAAAAGCAATGCGCGCGTCAACTCCGCTTCGCAGGGTCTGCTGGGTTGCTGCTTGCTGTGGTTGGCGGCTAGCCGGAACACTTc < 1:1065005/289‑1 (MQ=255) gCTATAGCTGGTATTTTCGTTTTTTAATTTCTTTTTGAGCAGGCTGGGGCTTAAACATAGCGAACTGGCGACAATTCGCAGATTCCAGTAATGCTGAATATCGCTTTGAATAATGCGGCAGACGCTGTCGCGGACTCTGCTGCGTAAGATATACATCAGTAGGGCAATAAACCGCGATTGCTCAAGAAAGTTAGACAATACGGTAAAAAGCAATGCGCGCGTCAACTCCGCTTCGCAGGGTCTGCTGGGTTGCTGCTTGCTGTGGTTGGCGGCTAGCCGGAACACTTc < 2:853873/288‑1 (MQ=255) taGCTGGTATTTTCGTTTTTTAATTTCTTTTTGAGCAGGCTGGGGCTTAAACATAGCGAACTGGCGACAATTCGCAGATTCCAGTAATGCTGAATATCGCTTTGAATAATGCGGCAGACGCTGTCGCGGACGCTGCTGCGTAAGATATACATCAGTAGGGCAATAAACCGCGATTGCTCAAGAAAGTTAGACAATACGGTAAAAAGCAATGCGCGCGTCAACTCCGCTTCGCAGGGTCTGCTGGGTTGCTGCTTGCTGTGGTTGGCGGCTAGCCGGAACACTTCCGgtg < 1:1678940/289‑1 (MQ=255) aGCTGGTATTTTCGTTTTTTAATTTCTTTTTGAGCAGGCTGGGGCTTAAACATAGCGAACTGGCGACAATTCGCAGATTCCAGTAATGCTGAATATCGCTTTGAATAATGCGGCAGACGCTGTCGCGGACGCTGCTGCGTAAGATATACATCAGTAGGGCAATAAACCGCGATTGCTCAAGAAAGTTAGACAATACGGTAAAAAGCAATGCGCGCGTCAACTCCGCTTCGCAGGGTCTGCTGGGTTGCTGCTTGCTGTGGTTGGCGGCTAGCCGGAACACTTCCGgtgt < 1:691531/289‑1 (MQ=255) tGGTATTTTCGTTTTTTAATTTCTTTTTGAGCAGGCTGGGGCTTAAACATAGCGAACTGGCGACAATTCGCAGATTCCAGTAATGCTGAATATCGCTTTGAATAATGCGGCAGACGCTGTCGCGGACGCTGCTGCGTAAGATATACATCAGTAGGGCAATAAACCGCGATTGCTCAAGAAAGTTAGACAATACGGTAAAAAGCAATGCGCGCGTCAACTCCGCTTCGCAGGGTCTGCTGGGTTGCTGCTTGCTGTGGTTGGCGGCTAGCCGGAACACTTCCGGTGTa < 2:385849/287‑1 (MQ=255) gggaTTTTCGTTTTTTAATTTATTTTTGGGCAGGCTGGGGCTTAAACATAGCGAACTGGCGACAATTCGCAGATTCCAGTAATGCTTAATATCGCTTTGAATAATGCGGCAGACGCTGTCGCGGACGCTGCTGCGTAAGATATACATCAGTAGGGCAATAAACCGCGATTGCTCAAGAAAGTTAGACAATACGGTAAAAAGCAATGCGCGCGTCAACTCCGCTTCGCAGGGTCTGCTGGGTTGCTGCTTGCTGTGGTTGGCGGCTAGCCGGAACACTTCCGGTGTACgg < 2:896922/286‑1 (MQ=255) gTATTTTCGTTTTTTAATTTCTTTTTGAGCAGGCTGGGGCTTAAACATAGCGAACTGGCGACAATTCGCAGATTCCAGTAATGCTGAATATCGCTTTGAATAATGCGGCAGACGCTGTCGCGGACGCTGCTGCGTAAGATATACATCAGTAGGGCAATAAACCGCGATTGCTCAAGAAAGTTAGACAATACGGTAAAAAGCAATGCGCGCGTCAACTCCGCTTCGCAGGGTCTGCTGGGTTGCTGCTTGCTGTGGTTGGCGGCTAGCCGGAACACTTCCGGTGTACg > 1:2399803/1‑287 (MQ=255) gTATTTTCGTTTTTTAATTTCTTTTTGAGCAGGCTGGGGCTTAAACATAGCGAACTGGCGACAATTCGCAGATTCCAGTAATGCTGAATATCGCTTTGAATAATGCGGCAGACGCTGTCGCGGACGCTGCTGCGTAAGATATACATCAGTAGGGCAATAAACCGCGATTGCTCAAGAAAGTTAGACAATACGGTAAAAAGCAATGCGCGCGTCAACTCCGCTTCGCAGGGTCTGCTGGGTTGCTGCTTGCTGTGGTTGGCGGCTAGCCGGAACACTTCCGGTGTACg > 1:2113970/1‑287 (MQ=255) 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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |