| Predicted mutation | ||||||
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| RA | CP042583 | 466,217 | 3 bp→TGA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP042583 | 466,218 | 0 | C | G | 99.4% | 805.9 / NA | 340 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base G (173/165); minor base T (0/2); total (173/167) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.41e-01 | |||||||||||
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| * | CP042583 | 466,219 | 0 | T | A | 100.0% | 806.1 / NA | 340 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base A (173/167); total (173/167) | |||||||||||
Only 100 of 340 total aligned reads displayed.
TATACATCAGTAGGGCAATAAACCGGCTTTGCTCAAGAAAGTTAGACAATACGGTAAAAAGCAATGCGCGCGTCAACTCCGCTTCGCAGGGTCTGCTGGGTTGCTGCTTGCTGTGGTTGGCGGCTAGCCGGAACACTTCCGGTGTACGGCTATGACAAGCGATAACCGGGGTTGCCAGCCGGCTCCAGGGCTTTACACAGGTTAAGTTCTTATTTAAAAACAACAGATAATCGTTGATGATGTTACGGTTGATGTGGGTGATTAATACGTGATTTAACGTACTGAGTTCA‑ATGACGTTATTGTTGCACGCGAAGGCGGCCAGGTAGTTTTTCGGAAGGGTAAACGTAGCATGGTTATTGACGCTTACCTCTACCTCTTTTTCGGTCAGGATCACCACGCAAGGTTCACTGCTGCTCAATTGCATTTCGCACTCCTCAGATATCAGAAACTCCGCTCAAAGGATCTATGCTTCCTGCATGAGTGATCGGCCCGTTCGCCGATAACGATCTTCTTTCTTTAGCACGCTTTTTAGCAATTAATCTTGATGGAATTCTGATGAG > CP042583/465937‑466496 ||| tataCATCAGTAGGGCAATAAACCGCGATTGCTCAAGAAAGTTAGACAATACGGTAAAAAGCAATGCGCGCGTCAACTCCGCTTCGCAGGGTCTGCTGGGTTGCTGCTTGCTGTGGTTGGCGGCTAGCCGGAACACTTCCGGTGTACGGCTATGACAAGCGATAACCGGGGTTGCCAGCCGCGACCAGGGCTTTACACAGGTTAAGTTCTTATTTAAAAACAACAGATAATCGTTGATGATGTTACGGTTGATGTGGGTGATTAATACGTGATTTAACGTTGAGAGTTc > 2:707130/1‑289 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |