Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 829,872 | 3 bp→TCA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 829,872 | 0 | A | T | 100.0% | 829.8 / NA | 346 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base T (169/177); total (169/177) | |||||||||||
* | CP042583 | 829,873 | 0 | G | C | 99.1% | 810.5 / NA | 346 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/3); new base C (168/174); total (169/177) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.48e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 829,874 | 0 | T | A | 99.4% | 819.9 / NA | 346 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/1); new base A (168/176); total (169/177) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
Only 100 of 346 total aligned reads displayed.
GATCGTGGCGGGCGTAGCGTTAATCCTCAACGCAGCCAGCGATACCTTCATGTTAAGCCTCCTTAAGCCACTTCTTGATGATGGCTTTGGTAAAACAGATCGCTCCGTGCTGGTGTGGATGCCGCTGGTGGTGATCGGGCTGATGATTTTACGTGGTATCACCAGCTATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTAAGTGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTAGTTTCTTTGACAAACAGAGTACGGGTACGCTGTTGAGTCGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGAGCATCATCGGCCTGTTCATCATGATGTTCTATTACAGTTGGCAACTGAGCATCATTTTGATTGTGCTGGCACCGATTGTTAGCATTGCGATTCGCGTTGTAAGCAAGCGTTTTCGCAACATCAGTAAAAACATGCAGAACACCATGGGGCAGGTGACCACCAGCGCAGAACAAATGCTGAAGGG > CP042583/829595‑830152 ||| cGTGGCTGGCGTAGCGTTAATCCTCAACGCAGCCAACGATACCTTCATGTTATCGCTCCTTAAGCCACTTCGTGATGATGGCTTTGGTAAAACAGATCGCTCCGTGCTGGGGTGGATGCCGCTGGTGGTGATCGGGCTGATGATTTTACGTTGTATCACCAGCTATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCAAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTg < 1:1592034/289‑1 (MQ=255) cgggcgTGGCCGTTAGCCTCGACGCAGCCAGCGATACCTTCATGTTATCGCTCCTTAAGCCACTTCTTGATGATGGCTTTGGTAAAACAGGTCGCTCCGTGCTGGTGT‑GATGCCGCTGGTGGTGATCGGGCTGATGATTTTACGTGGTATCACCAGCTATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTgtc < 2:2288881/288‑3 (MQ=255) gTAGCGTTAATCCTCAACGCAGCCAGCGATACCTTCATGTTATCGCTCCTTAAGCCACTTCTTGATGATGGCTTTGGTAAAACAGATCGTTCCGTGCTGGTGTGGATGCCGCTGGTGGTGATCGTGCTGATGATTTTACGTGGTATCACCAGCTATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTgtcacgta < 1:2586932/289‑8 (MQ=255) aGCGTTAATCCTCAACGCAGGCGGCGATACCTTCATGTTATCGCTCCTTAAGCCACTTCTTGATGTTGGCTTTGTTAAAACAGATCTCTCCGTGCTGGTGTGGATGCCGCTGGTGGTGATCGGGCTGATGATTTTACGTGGTATCACCAGCTATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTAtt < 1:959201/289‑1 (MQ=255) tAATCCTCAACGCAGCCAGCGATACCTTCATGTTATCGCTCCTTAAGCCACTTCTTGATGATGGCTTTGGTAAAACAGATCGCTCCGTGCTGGTGTGGATGCCGCTGGTGGTGATCGGGCTGATGATTTTACGTGGTATCACCAGCTATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTa < 1:236523/289‑1 (MQ=255) cccagccagcGATACCTTCAAGTTATCGCTCCTTAGGCCACTTCTTGATGATGGCTTTGGTAAAACAGATCGCTCCGTGCTGGTGTGGATGCCGCTGGTGGTGATCGGGCTGATGATTTTACGTGGTATCACCAGCTATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGaa < 2:749847/287‑1 (MQ=255) gccagcGATACCTTCATGTTATCGCTCCTTAAGCCACTTCTTGATGATGGCTTTGGTAAAACAGATCGCTCCGTGCTGGTGTGGATGCCGCTGGTGGTGATCGGGCTGATGATTTTACGTGGTATCACCAGCTATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACg > 2:938556/1‑255 (MQ=255) gccagcGATACCTTCATGTTATCGCTCCTTAAGCCACTTCTTGATGATGGCTTTGGTAAAACAGATCGCTCCGTGCTGGTGTGGATGCCGCTGGTGGTGATCGGGCTGATGATTTTACGTGGTATCACCAGCTATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACg < 1:938556/255‑1 (MQ=255) aTACTTTCATGTTATCGTTCCTTAAGCCACTTCTTGATGATGGCTTTGGTAAAACAGTTCGCTCCGTGCTGGTTTGGATGCCGCTGGTGGTGATCGGGCTGATGATTTTACGTGGTATCACCAGCTATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGctt < 1:2393887/288‑1 (MQ=255) cATGTTATCGCTCCTTAAGCCACTTCTTGATGATGGCTTTGGTAAAACAGATCGCTCCGTGCTGGTGTGGATGCCGCTGGTGGTGATCGGGCTGATGATTTTACGTGGTATCACCAGCTATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGcttcttcttct > 1:171576/1‑289 (MQ=255) atcgctcctTAAGCCACTTCTTGATGATGGCTTTGGTAAAACAGATCGCTCCGTGCTGGTGTGGATGCCGCTGGTGGTGATCGGGCTGATGATTTTACGTGGTATCACCAGCTATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGgc > 1:1859630/5‑289 (MQ=255) tcgctcctTAAGCCACTTCTTGATGCTGGCTTTGGTAAAACAGATCGCTCCGTGCTGGTGTGGATGCCGCTGGTGGTGATCGGGCTGATGATTTTACGTGGTATCACCAGCTATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGgcg < 1:1106060/286‑1 (MQ=255) tcgctcctTAAGCCACTTCTTGATGATGGCTTTGGTAAAACAGATCGCTCCGTGCTGGTGTGGATGCCGCTGGTGGTGATCGGGCTGATGATTTTACGTGGTATCACCAGCTATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGgc > 2:2112024/4‑288 (MQ=255) gctcctTAAGCCACTTCTTGATGATGGCTTTGGTAAAACAGGTCGCTCCGTGCTGGTGTGGATGCCGCTGGTGGTGATCGGGCTGATGATTTTACGTGGTATCACCAGCTATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCa < 2:595385/288‑1 (MQ=255) tcctTAAGCCACTTCTTGATGATGGCTTTGGTAAAACAGATCGCTCCGTGCTGGTGTGGATGCCGCTGGTGGTGATCGGGCTGATGATTTTACGTGGTATCACCAGCTATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACt < 1:1484799/289‑1 (MQ=255) tcctTAAGCCACTTCTTGATGATGGCTTTGGTAAAACAGATCGCTCCGTGCTGGTGTGGATGCCGCTGGTGGTGATCGGGCTGATGATTTTACGTGGTATCACCAGCTATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACt < 1:2274424/289‑1 (MQ=255) tcctTAAGCCACTTCTTGATGATGGCTTTGGTAAAACAGATCGCTCCGTGCTGGTGTGGATGCCGCTGGTGGTGATCGGGCTGATGATTTTACGTGGTATCACCAGCTATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACt < 1:199263/289‑1 (MQ=255) tcctTAAGCCACTTCTTGATGATGGCTTTGGTAAAACAGATCGCTCCGTGCTGGTGTGGATGCCGCTGGTGGTGATCGGGCTGATGATTTTACGTGGTATCACCAGCTATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACt < 2:2701504/289‑1 (MQ=255) cctTAAGCCACTTCTTGATGATGGCTTTGGTAAAACAGATCGCTCCGTGCTGGTGTGGATGCCGCTGGTGGTGATCGGGCTGATGATTTTACGTCGTATCACCAGCTATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGCATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGTTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATCCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCGGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGATTGCTTCTTCTTCTTCCGgcgccgtt > 2:1660363/1‑285 (MQ=255) cACTTCTTGATGATGGCTTTGGTAAAACAGATCGCTCCGTGCTGGTGTGGATGCCGCTGGTGGTGATCGGGCTGATGATTTTACGTGGTATCACCAGCTATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACtg < 2:1391482/288‑1 (MQ=255) ttcttGCTGATGGCTTTGGTAAAACAGATCGCTCCGTGCTGGGGTGGATGCCGCTGGTGGTGAACGGGCTGATGATTTTACGTGGTATCACCAGCTATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGGCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGTGAATGCAAGTTTCATTCTTTGACAAACCGTCAACTGGTACGCCGTTGTCCCGTCTCACCTACGATTCCAAACAGGTTGCTACTTATTCTTCCGTAGCGCTGATTACttttgt > 2:2034891/1‑289 (MQ=255) gatgatGGCTTTGGTAAAACAGATCGCTCCGTGCTGGTGTGGATGCCGCTGGTGGTGATCGGGCTGATGATTTTACGTGGTATCACCAGCTATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTg > 2:315829/1‑289 (MQ=255) tttGGTAAAACAGATCGCTCCGTGCTGGTGTGGATGCCGCTGGTGGTGATCGGGCTGATGATTTTACGTGGTATCACCAGCTATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCgt < 1:2485741/289‑2 (MQ=255) tGGTAAAACAGATCGCTCCGTGCTGGCGTGGATGCCGCTGGTGGTGATCGGGCTGATGATTTTACGTGGTATCACCAGCTATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCCACGATTCCGAACAGGTTGGTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGTTTACTGTTGTTCGTGAAGGTTCgtcg > 2:1186178/1‑286 (MQ=255) aaagtaGATCGCTCCGTGCTGGTGTGGAAGCCGCTGGTTGTGATCGGGCTGATGATTTTACGTGGTATCACCAGCTATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCgtcgatca < 1:261541/284‑8 (MQ=255) aaCAGATCGCTCCGTGCTGGTGTGGATGCCGCTGGTGGTGATCGGGCTGATGATTTTACGTGGTATCACCAGCTATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGatcatc < 1:386777/289‑1 (MQ=255) tCGCTCCGTGCTGGTGTGGATGCCGCTGGTGGTGATCGGGCTGATGATTTTACGTGGTATCACCAGCTATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGa > 1:2173451/1‑213 (MQ=255) tCCGTGCTGGTGTGGATGCCGCTGGTGGTGATCGGGCTGATGATTTTACGTGGTATCACCAGCTATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGCCTGTtca > 2:2428561/1‑289 (MQ=255) tGCTGGTGTGGATGCCGCTGGTGGTGATCGGGCTGATGATTTTACGTGGTATCACCAGCTATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCa < 2:2609107/239‑1 (MQ=255) tGGTGTGGATGCCGCTGGTGGTGATCGGGCTGATGATTTTACGTGGTATCACCAGCTATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGCCTGTTCATCatga < 1:2027741/288‑1 (MQ=255) gtgtGGATGCCGCTGGTGGTGATCGGGCTGATGATTTTACGTGGTATCACCAGCTATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGCCTGTTCATCATGATGt > 1:888635/1‑289 (MQ=255) tgGATGCCGCTGGTGGTGATCGGGCTGATGATTTTACGTGGTATCACCAGCTATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACg > 2:537738/1‑174 (MQ=255) tgGATGCCGCTGGTGGTGATCGGGCTGATGATTTTACGTGGTATCACCAGCTATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACg < 1:537738/174‑1 (MQ=255) gATGCCGCTGGTGGTGATCGGGCTGATGATTTTACGTGGTATCACCAGCTATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTa < 2:1141292/192‑1 (MQ=255) gATGCCGCTGGTGGTGATCGGGCTGATGATTTTACGTGGTATCACCAGCTATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTTCGTCGGTCATCGGCCTGTTCATCATGGTTTTCtca > 2:1627832/1‑287 (MQ=255) gATGCCGCTGGTGGTGATCGGGCTGATGATTTTACGTGGTATCACCAGCTATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGCCTGTTCATCATGATGTTCTAt > 1:687268/1‑289 (MQ=255) gCCGCTGGTGGTGATCGGGCTGATGATTTTACGTGGTATCACCAGCTATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGCCTGTTCATCATGATGTTCTATTAc > 2:2468260/1‑289 (MQ=255) cGCTGGTGGTGATCGGGCTGATGATTTTACGTGGTATCACCAGCTATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCa < 2:2233494/224‑1 (MQ=255) cGCTGGTGGTGATCGGGCTGATGATTTTACGTGGTATCACCAGCTATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACtgtt < 2:2739455/236‑1 (MQ=255) cGCTGGTGGTGATCGGGCTGATGATTTTACGTGGTATCACCAGCTATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGCCTGTTCATCATGATGTTCTATTACa < 1:2468260/288‑1 (MQ=255) gATCGGGCTGATGATTTTACGTGGTATCACCAGCTATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGCCTGTTCATCATGATGTTCTATTACAGTTGGCa > 1:1234614/1‑285 (MQ=255) cGGGCTGATGATTTTACGTGGTATCACCAGCTATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACtg < 1:2163549/221‑1 (MQ=255) cGGGCTGATGATTTTACGTGGTATCACCAGCTATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACtg > 2:2163549/1‑221 (MQ=255) ttttACGGTGTATCACCAGCTATGTCTCCAGCTACTGTCTCTCCTGGGTATCAGGAAATGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTAAGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGCCTGTTCATCATGATGTTCTATTACAGTTGGCAACTGTCGATCATTTTGAt < 2:486421/289‑1 (MQ=255) aCGTGGTATCACCAGCTATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGCCTGTTCATCATGATGTTCTATTACAGTTGGCAACTGTCGATCATTTTGATtgtg < 2:684131/289‑1 (MQ=255) ggTATCACCAGCTATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTgtc < 1:1905235/143‑3 (MQ=255) ccAGCTATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCa > 2:2493498/1‑185 (MQ=255) tATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGt > 1:1178566/1‑158 (MQ=255) tATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACtgtt < 2:2003043/192‑1 (MQ=255) tATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTg > 1:274205/1‑205 (MQ=255) tGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGATAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGACTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGCCTGTTCATCCTGATGTTCTATTACAGTTGGCAACTGTCCATCCTTTTGATTGCTCTGGCCCCCATTCttt > 2:1027723/1‑286 (MQ=255) tGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACt < 1:591033/180‑1 (MQ=255) tGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGCCTGTTCATCATGATGTTCTATTACAGTTGGCAACTGTCGATCATTTTGATTGTGCTGGCAc < 1:1278911/278‑1 (MQ=255) tGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGCCTGTTCATCATGATGTTCTATTACAGTTGGCAACTGTCGATCATTTTGATTGTGCTGGCAc > 2:1278911/1‑278 (MQ=255) tctcCAGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGCCTGTTCATCATGATGTTCTATTACAGTTGGCAACTGTCGATCATTTTGATTGTGCTGGCACCGATTGtttcgat < 1:2112024/289‑6 (MQ=255) aGCTACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCa > 2:1889906/1‑171 (MQ=255) tACTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGCCTGTTCATCATGATGTTCTATTACAGTTGGCAACTGTCGATCATTTTGATTGTGCTGGCACCGATTGTTTCGATTGCGAt < 1:713463/287‑1 (MQ=255) cTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACtg > 2:852637/1‑176 (MQ=255) cTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACtg < 1:852637/176‑1 (MQ=255) cTGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGCCTGTTCATCatga < 1:1827569/218‑1 (MQ=255) tGTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGCCTGTTCATCATGATGTTCTATTACAGTTGGCAACTGTCGATCATTTTGATTGTGCTGGCACCGATTGTTTCGATTGCGATTcgcg < 2:354296/289‑1 (MQ=255) gTATCTCCTGGGTATCAGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGCCTGTTCATCATGATGTTCTATTACAGTTGGCAACTGTCGATCATTTTGATTGTGCTGGCACCGATTGtttcgat > 1:2631968/1‑272 (MQ=255) gggtatcaggAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGc < 2:1521356/186‑1 (MQ=255) gtatcaggAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGCCTGTTCATCatgatg > 1:2061776/7‑207 (MQ=255) tcaggAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGCCTGTTCATCATGATGTTCTATTACAGTTGGCAACTGTCGATCATTTTGATTGTGCTGGCACCGATTGTTTCGATTGCGATTCGCGTTGtgtcgaagcgtt > 2:701975/4‑278 (MQ=255) tcaggAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGCCTGTTCATCATGATGTTCTATTACAGTTGGCAACTGTCGATCATTTTGATTGTGCTGGCACCGATTGTTTCGATTGCGATTCGCGTTGTATCGAAGCGtt < 2:171576/286‑1 (MQ=255) caggAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGCCTGTTCATCATGATGTTCTATTACAGTTGGCAACTGTCGATCATTTTGAt < 1:1388720/236‑1 (MQ=255) caggAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGCCTGTTCATCATGATGTTCTATTACAGTTGGCAACTGTCGATCATTTTGATTGTGCTGGCACCGATTGTTTCGATTGCGATTCGCGTTGTATCGAAGCGttt > 2:2073417/3‑289 (MQ=255) ggAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGCCTGTTCATCATGATGTTCTATTACAGTTGGCAACTGTCGATCATTTTGAt < 2:2630288/236‑1 (MQ=255) ggtggtAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGCCTGTTCATCATGATGTTCTATTACAGTTGGCAACTGTCGATCATTTTGATTGTGCTGGCCCCGATTGTTTCGATTGCGATTCGCGTTGTATCGGAGCCTTTTCGCAAc > 2:1595294/1‑289 (MQ=255) gtggtAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTg < 1:1675393/87‑1 (MQ=255) tggtAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGTCTGTTCATCATGATGTTCTCTTACAGTTGGCAACTGTCGATCATTTTGATTGTGCTGGCACCGATTGTTTCGATTGCGATTCGCGTTGTATCGATGCGTTTTCGCAACa > 1:1934232/1‑288 (MQ=255) aaTGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGCCTGTTCATCATGATGTTCTATTACAGTTGGCAACTGTCGATCATTTTGATTGTGCTGGCACCGATTGTTTCGATTGCGATTCGCGTTGTATCGAAGCGTTTTCGCAACATCAGt > 1:1397254/1‑289 (MQ=255) cATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGTGTCGATCATCGGCCTGTTCATCatga > 1:1335299/1‑182 (MQ=255) cATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGTGTCGATCATCGGCCTGTTCATCatga < 2:1335299/182‑1 (MQ=255) tGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACtgtt < 1:2668366/140‑1 (MQ=255) gCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGCCTGTTCATCATGATGTTCTATTACAGTTGGCAACTGTCGATCATTTTGATTGTGCTGGCACCGATTGTTTCGATTGCGATTCGCGTTGTATCGAAGCGTTTTCGCAACATCAGTAAAAACATg < 2:1774941/289‑1 (MQ=255) gCGTCGCCGCCTGGTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGCCTGTTCATCATGATGTTCTATTACAGTTGGCAACTGTCGATCATTTTGATTGTGCTGGCACCGATTGTTTCGATTGCGATTCGCGTTGTATCGAAGCGTTTTCGCAACATCAGTAAAAACATg < 2:943214/289‑1 (MQ=255) gccgccTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTgtca < 2:1091999/74‑4 (MQ=255) gccgccTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGCCTGTTCATCATGATGTTCTATTACAGTTGGCAACTGTCGATCATTTTGATTGTGCTGGCACCGATTGTTTCGATTGCGATTCGCGTTGTATCGAAGCGTTTTCGCAACATCAGTAAAAACATGCAGa > 1:1768865/1‑288 (MQ=255) cTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGCCTGTTCATCATGATGTTCTATTACAGTTGGCAACTGTCGATCATTTTGATTGTGCTGGCACCGATTGTTTCGATTGCGATTCGCGTTGTATCGAAGCGTTTTCGCAACATCAGTAAAAACATGCAGAACACCa > 1:2415029/1‑289 (MQ=255) tGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGCCTGTTCATCATGATGTTCTATTACAGTTGGCAACTGTCGATCATTTTGATTGTGCTGGCACCGATTGTTTCGATTGCGATTCGCGTTGTATCGAAGCGTTTTCGCAACATCAGTAAAAACATGCAGaa < 2:460034/283‑1 (MQ=255) ggTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGCCTGTTCATCATGATGTTCTATTACAGTTGGCAACTGTCGATCATTTTGa < 1:1550095/199‑1 (MQ=255) ggTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGCCTGTTCATCATGATGTTCTATTACAGTTGGCAACTGTCGATCATTTTGATTGTGCTGGCACCGATTGTTTCGATTGCGATTCGCGTTGTATCGAAGCGTTTTCGCAACATCAGTAAAAACATGCAGAACACCATGGGGc < 2:870064/289‑1 (MQ=255) gTCACATGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGCCTGTTCATCATGATGTTCTATTACAGTTGGCAACTGTCGATCATTTTGATTGTGCTGGCACCGATTGTTTCGATTGCGATTCGCGTTGTATCGAAGCGTTTTCGCAACATCAGTAAAAAc < 1:1017177/269‑1 (MQ=255) caTGATGGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGCCTGTTCATCATGATGTTCTATTACAGTTGGCAACTGTCGATCATTTTGATTGTGCTGGCACCGATTGTTTCGATTGCGATTCGCGTTGTATCGAAGCGTTTTCGCAACATCAGTAAAAACATGCAGAACACCATGGGGCAGGTg < 1:2731659/289‑1 (MQ=255) atgatgGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGCCTGTTCATCATGATGTTCTATTACAGTTGGCAACTGTCGATCATTTTGATTGTGCTGGCACCGATTGTTTCGATTGCGATTCGCGTTGTATCGAAGCGTTTTCGCAACATCAGTAAAAACATGCAGAACACCATGGGGCAGGTg > 1:1100594/1‑288 (MQ=255) tgatgGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGCCTGTTCATCATGATGTTCTATTACAGTTGGCAACTGTCGATCATTTTGATTGTGCTGGCACCGATTGTTTCGATTGCGATTCGCGTTGTATCGAAGCGTTTTCGCAACATCAGTAAAAACATGCAGAACACCATGGGGCAGGTGa > 1:1621305/1‑288 (MQ=255) tgGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGCCTGTTCATCATGATGTTCTATTACAGTTGGCAACTGTCGATCATTTTGATTGTGCTGGCACCGATTGTTTCGATTGCGATTCGCGTTGTATCGAAGCGTTTTCGCAACATCAGTAAAAACATGCAGAACACCATGGGGCAGGTGaccac < 1:315829/289‑1 (MQ=255) tgGGAATGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGCCTGTTCATCATGATGTTCTATTACAGTTGGCAACTGTCGATCATTTTGATTGTGCTGGCACCGATTGTTTCGATTGCGATTCGCGTTGTATCGAAGCGTTTTCGCAACATCAGTAAAAACATGCAGAACACCATGGGGCAGGTGaccac < 2:2378636/289‑1 (MQ=255) tGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGCCTGTTCATCATGATGTTCTATTACAGTTGGCAACTgtcgat > 1:456230/1‑170 (MQ=255) tGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGCCTGTTCATCATGATGTTCTATTACAGTTGGCAACTGTCGATCATTTTGATTGTGCTGGCACCGTTTGTTTCGATTGCGATTCGCGTTGTATCGAAGCGTTTTCGCAACATCAGTAAAAACATGCAGAACACCATGGGGCAGGTGACCACCAgcgc > 1:2198086/1‑289 (MQ=255) tGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGCCTGTTCATCATGATGTTCTATTACAGTTGGCAACTGTCGATCATTTTGATTGTGCTGGCACCGATTGTTTCGATTGCGATTcgcg < 2:1264391/219‑1 (MQ=255) tGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGCCTGTTCATCATGATGTTCTATTACAGTTGGCAACTGTCGATCATTTTGATTGTGCTGGCACCGATTGTTTCGATTGCGATTCGCGTTGTATCGAAGCGTTTTCGc < 2:2175882/239‑1 (MQ=255) tGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGCCTGTTCATCATGATGTTCTATTACAGTTGGCAACTGTCGATCATTTTGATTGTGCTGGCACCGATTGTTTCGATTGCGATTCGCGTTGTATCGAAGCGTTTTCGCAAc > 1:7951/1‑242 (MQ=255) tGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGCCTGTTCATCATGATGTTCTATTACAGTTGGCAACTGTCGATCATTTTGATTGTGCTGGCACCGATTGTTTCGATTGCGATTCGCGTTGTATCGAAGCGTTTTCGCAAc < 2:7951/242‑1 (MQ=255) tGCCAGTTTCATTCTTTGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGCCTGTTCATCATGATGTTCTATTACAGTTGGCAACTGTCGATCATTTTGATTGTGCTGGCACCGATTGTTTCGATTGCGATTCGCGTTGTATCGAAGCGTTTTCGCAACATCAGTAAAAACATGCAGAACACCATGGGGCAGGTGACCACCAgcg > 2:2403923/1‑288 (MQ=255) tGCCAGTTTCATTCTGTGACAAACAGTCAACGGGTCGTCTTTTGTCACGTATTACCTACGTTTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGGGCGTTAAGGTGCGTCGATCATCGGCCTGTTCATCATGATGTTCTATTACAGTTGGCAACTGTCGATCATTTTGATTGTGCTGGCACCGATTGTTTCGATTGCGATTCGCGTTGTATCGAAGCGTTTTCGCAACATCAGTAAAAACATGCAGAACACCATGGGGCAGGTGACCACCAgcgc < 2:1439300/289‑1 (MQ=255) tGACAAACAGTCAACGGGTTAGCTTTTGTACCGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGCCTGTTCATCATGATGTTCTATTACAGTTGGCAACTGTCGATCATTTTGATTGTGCTGGCACCGATTGTTTCGATTGCGATTCGCGTTGTATCGAAGCGTTTTCGCAACATCAGTAAAAACATGCAGAACACCATGGGGCAGGTGACCACCAGCGCAGAACAAATGCTGAAg < 2:19525/289‑1 (MQ=255) tGACAAACAGTCAACGGGTACGCTGTTGTCACGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGTCGATCATCGGCCTGTTCATCATGATGTTCTATTACAGTTGGCAACTGTCGATCATTTTGATTGTGCTGGCACCGATTGTTTCGATTGCGATTCGCGTTGTATCGAAGCGTTTTCGCAACATCAGTAAAAACATGCAGAACACCATGGGGCAGGTGACCACCAGCGCAGAACAAATGCTGAAg < 2:630833/289‑1 (MQ=255) ||| GATCGTGGCGGGCGTAGCGTTAATCCTCAACGCAGCCAGCGATACCTTCATGTTAAGCCTCCTTAAGCCACTTCTTGATGATGGCTTTGGTAAAACAGATCGCTCCGTGCTGGTGTGGATGCCGCTGGTGGTGATCGGGCTGATGATTTTACGTGGTATCACCAGCTATGTCTCCAGCTACTGTATCTCCTGGGTAAGTGGAAAGGTGGTAATGACCATGCGTCGCCGCCTGTTTGGTCACATGATGGGAATGCCAGTTAGTTTCTTTGACAAACAGAGTACGGGTACGCTGTTGAGTCGTATTACCTACGATTCCGAACAGGTTGCTTCTTCTTCTTCCGGCGCACTGATTACTGTTGTGCGTGAAGGTGCGAGCATCATCGGCCTGTTCATCATGATGTTCTATTACAGTTGGCAACTGAGCATCATTTTGATTGTGCTGGCACCGATTGTTAGCATTGCGATTCGCGTTGTAAGCAAGCGTTTTCGCAACATCAGTAAAAACATGCAGAACACCATGGGGCAGGTGACCACCAGCGCAGAACAAATGCTGAAGGG > CP042583/829595‑830152 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |