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| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/1); new base C (132/131); total (133/133) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| * | CP042583 | 839,488 | 0 | C | G | 99.6% | 622.0 / NA | 266 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base G (132/132); total (133/133) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.94e-01 | |||||||||||
Only 100 of 266 total aligned reads displayed.
TGAAAATCATCTGCAACTCAACGATGAAACCGAAGAGAATCAGCCAGATAGCGGAGAGGAAGAATAATGATTGAACGCGGTAAATTTCGCAGTCTGACGCTGATTAACTGGAACGGCTTTTTTGCCCGAACTTTTGACCTTGACGAGCTGGTCACGACGCTTTCTGGCGGTAACGGGGCGGGTAAATCCACCACCATGGCGGCGTTCGTTACGGCGCTGATCCCCGACCTGACCCTGCTGCATTTCCGTAACACTACGGAAGCCGGGGCCACCAGCGGTAGCCGCGATAAAGGTCT‑GCACGGTAAGCTGAAAGC‑GGGTGTCTGTTATAGCATGCTCGACACCATTAACAGCCGCCACCAGCGCGTGGTGGTCGGTGTGCGTCTGCAACAGGTTGCCGGACGCGATCGTAAAGTGGATATCAAGCCGTTTGCCATTCAGGGACTGCCGATGAGCGTGCAGCCGACACAGCTGGTGACCGAAACCCTGAACGAACGCCAGGCGCGCGTGCTGCCGCTTAACGAGCTGAAAGACAAGCTCGAGGCGATGGAAGGCGTGCAGTT > CP042583/839207‑839766 ||| tcTGCAACACAACGATGAAACCGAAGAGAATCAGCCAGATAGCGGAGAAGAAGAATAATGAGTGAACGCGGTAAATTTCGCTCACTGACGCTGATTAACTGGAACGGCTTTTTTGCCCGAACTTTTGACCTTGACGAGCTGGTCACGACGCTTTCTGGCGGTAACGGGGCGGGTAAATCCACCACCATGGCGGCGTTCGTTACGGCGCTGATCCCCGACCTGACCCTGCTGCATTTCCGTAACACTACGGAAGCCGGGGCCACCAGCGGTTCGCGCGATAAAGGTCT‑Gc < 1:2545839/289‑1 (MQ=255) 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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |