| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | CP042583 | 866,479 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP042583 | 866,479 | 0 | A | T | 99.4% | 783.8 / NA | 329 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
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| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.46e-01 | |||||||||||
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| * | CP042583 | 866,480 | 0 | G | C | 100.0% | 793.3 / NA | 329 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base C (165/164); total (165/164) | |||||||||||
| * | CP042583 | 866,481 | 0 | C | G | 100.0% | 789.9 / NA | 329 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (165/164); total (165/164) | |||||||||||
Only 100 of 329 total aligned reads displayed.
GTGCAAATTCTTGATGCGCAAAGTCAGCAAGAAATCCCGCTCAATCAGGTCCAGCCTCTTACGCCCTTAAAAGCCGGGGATAACACACTCAAATATCAACTTCGTTATAAGTCCACAAAGGCGGGAGCAACGGGCGGTAATGCGACGGCGGTTCTCTATTTTGATCTGGTTTACCAGTGAAGGAGTGATGTTGAAACGGATAATCTGGATTCTGTTCTTATTGGGATTAACGTGGGGCTGTGAGCTATTTGCCCATGATGGCACGGTCAACATTAGCGGAAGCTTTCGCCGTAATACATGCGTGCTGGCACAGGATAGCAAGCAAATCAATGTGCAGTTAGGCGATGTCAGCCTGACACGTTTTTCTCATGGGAATTATGGCCCGGAGAAATCTTTCATCATTAATTTGCAGGATTGCGGAACAGATGTCAGCACGGTTGACGTCACCTTTAGTGGAACCCCCGACGGAGTGCAGAGCGAAATGTTGTCCATTGAAAGTGGTACGGATGCAGCCAGCGGGCTGGCAATTGCGATTCTGGATGATGCGAAGATATTGAT > CP042583/866199‑866756 ||| tGCAAATTCTTGATGCGCAAAGTCAGCAAGAAATCCCGCTCAATCAGGTCCAGCCTCTTACGCCCTTAAAAGCCGGGGATAACACACTCAAATATCAACTTCGTTATAAGTCCACAAAGGCGGGAGCAACGGGCGGTAATGCGACGGCGGTTCTCTATTTTGATCTGGTTTACCAGTGAAGGAGTGATGTTGAAACGGATAATCTGGATTCTGTTCTTATTGGGATTAACGTGGGGCTGTGAGCTATTTGCCCATGATGGCACGGTCAACATTAGCGGATCGTTTCGcc > 2:972738/1‑289 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |