| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP042583 | 898,468 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP042583 | 898,468 | 0 | A | T | 99.7% | 896.0 / NA | 377 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); new base T (182/192); total (184/193) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| * | CP042583 | 898,469 | 0 | G | C | 99.2% | 874.2 / ‑6.6 | 377 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/0); major base C (179/192); minor base T (3/0); total (184/193) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.14e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| * | CP042583 | 898,470 | 0 | C | G | 98.9% | 877.4 / NA | 377 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (4/0); new base G (180/192); total (184/193) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.64e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 377 total aligned reads displayed.
GGCGAGGCGACGTATCTGTTCTATATGGGCTACATCAGGTTAATTCACTTCAGCGCCGGGATGGTTTTTACCGT‑GGTTTTGCTGATGCGGATCTACTGGGCTTTTGTTGGCAATCGATACTCCCGCGAGCTGTTTATCGTGCCGGTATGGCGTAAAAGCTGGTGGCAGGGCGTGTGGTATGAAATCCGCTGGTATCTGTTTCTGGCAAAACGTCCGAGTGCCGATATAGGCCATAATCCCATCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGAGCGT‑CTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGCCAGTACGCTATTTTTGCGCCGTTCCGTTATGTGGTGGAATTTTTCTACTGGACGGGTGGCAACAGTATGGACATTCACAGCTGGCATCGGCTGGGGATGTGGCTGATTGGCGCGTTTGTGATCGGTCATGTCTACATGGCGCTGCGTGAAGACATCATGTCCGACGACACGGTGATCTCCACCATGGTCAACGGCTACCGTAGCCACAAATTTGGCAAAATAAGTAACAAGGA > CP042583/898192‑898748 ||| gcgaggcgaCGTATCTGTTCTATATGGGCTACATCAGGTTAATTCACTTCAGCGCCGGGATGGTTTTTACCGT‑GGTTTTGCTGATGCGGATCTACTGGGCTTTTGTTGGCAATCGATACTCCCGCGAGCTGTTTATCGTGCCGGTATGGCGTAAAAGCTGGTGGCAGGGCGTGTGGTATGAAATCCGCTGGTATCTGTTTCTGGCAAAACGTCCGAGTGCCGATATAGGCCATAATCCCATCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGT‑CTTTATGa < 2:330085/288‑1 (MQ=255) gtcctttCTGTTTTGTCTGGGCTACGTCAGGTTAATTCACTTCAGCGCCGGGATGGTTTTTACCGT‑GGTTTTGCTGATGCGGATCTACTGGGCTTTTGTTGGCAATCGATACTCCCGCGAGCTGTTTATCGTGCCGGTATGGCGTAAAAGCTGGTGGCAGGGCGTGTGGTATGAAATCCGCTGGTATCTGTTTCTGGCAAAACGTCCGAGTGCCGATATAGGCCATAATCCCATCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGT‑CTTTATGATCATCAc < 2:124797/282‑1 (MQ=255) tGTTCTATATGGGCTACATCAGGTTAATTCACTTCAGCGCCGGGATGGTTTTTACCGT‑GGTTTTGCTGATGCGGATCTACTGGGCTTTTGTTGGCAATCGATACTCCCGCGAGCTGTTTATCGTGCCGGTATGGCGTAAAAGCTGGTGGCAGGGCGTGTGGTATGAAATCCGCTGGTATCTGTTTCTGGCAAAACGTCCGAGTGCCGATATAGGCCATAATCCCATCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGT‑CTTTATGATCATCACTGGTTTTgc > 1:1041840/1‑289 (MQ=255) tttgtttgtGGGATACTTTAGGTTAATTCCCTTCGGGGCCGGGATGGTTTTT‑CCGTGGGTTTTGCTGATGCGGTTCTACTGGGCTTTTTTTGGCAATCGATACTCCCGCGCGCTGTTTATCGTGCCGGTATGGCGTAAAAGCTGGTGGCAGGGCGTGTGGTATGAAATCCGCTGGTATCTGTTTCTGGCAAAACGTCCGAGTGCCGATATAGGCCATAATCCCATCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGT‑CTTTATGATCATCACTGGTTTTgcg < 2:134506/281‑1 (MQ=255) gttttttatTGGCTAGATCAGGTTAATTCCCTTCAGCGCCGGGATGGTTTTTACCGT‑GGTTTTGCTGATGCGGATCTACTGGGCTTTTGTTGGCAATCGATACTCCCGCGAGCTGTTTATCGTGCCGGTATGGCGTAAAAGCTGGTGGCAGGGCGTGTGGTATGAAATCCGCTGGTATCTGTTTCTGGCAAAACGTCCGAGTGCCGATATAGGCCATAATCCCATCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGT‑CTTTATGATCATCACTGGTTTTgcg < 2:1767860/283‑1 (MQ=255) gTTCTTTCTGGGCTACATCATTTGATGTTACTCAGGCGCCGGGATGGTTTTTACCGT‑GGTTTTGCTGATGCGGATCTCCTGGGCTTTTGTTGGCAATCGATACTCCCGCGAGCTGTTTATCGTGCCGGTATGGCGTAAAAGCTGGTGGCAGGGCGTGTGGTATGAAATCCGCTGGTATCTGTTTCTGGCAAAACGTCCGAGTGCCGATATAGGCCATAATCCCATCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGT‑CTTTATGATCATCACTGGTTTTgcg < 2:1182628/289‑1 (MQ=255) gTTCTATATGGGCTACATCAGGTTAATTCACTTCAGCGCCGGGATGGTTTTTACCGT‑GGTTTTGCTGATGCGGATCTACTGGGCTTTTGTTGGCAATCGATACTCCCGCGAGCTGTTTATCGTGCCGGTATGGCGTAAAAGCTGGTGGCAGGGCGTGTGGTATGAAATCCGCTGGTATCTGTTTCTGGCAAAACGTCCGAGTGCCGATATAGGCCATAATCCCATCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGT‑CTTTATGATCATCACTGGTTTTgcg < 1:687865/289‑1 (MQ=255) gTTCTATATGGGCTACATCAGGTTAATTCACTTCAGCGCCGGGATGGTTTTTACCGT‑GGTTTTGCTGATGCGGATCTACTGGGCTTTTGTTGGCAATCGATACTCCCGCGAGCTGTTTATCGTGCCGGTATGGCGTAAAAGCTGGTGGCAGGGCGTGTGGTATGAAATCCGCTGGTATCTGTTTCTGGCAAAACGTCCGAGTGCCGATATAGGCCATAATCCCATCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGT‑CTTTATGATCATCACTGGTTTTgcg < 1:1382406/289‑1 (MQ=255) gTTCTATATGGGCTACATCAGGTTAATTCACTTCAGCGCCGGGATGGTTTTTACCGT‑GGTTTTGCTGATGCGGATCTACTGGGCTTTTGTTGGCAATCGATACTCCCGCGAGCTGTTTATCGTGCCGGTATGGCGTAAAAGCTGGTGGCAGGGCGTGTGGTATGAAATCCGCTGGTATCTGTTTCTGGCAAAACGTCCGAGTGCCGATATAGGCCATAATCCCATCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGT‑CTTTATGATCATCACTGGTTTTgcg < 1:2571645/289‑1 (MQ=255) ttCTATATGGGCTACATCAGGTTAATTCACTTCAGCGCCGGGATGGTTTTTACCGT‑GGTTTTGCTGATGCGGATCTACTGGGCTTTTGTTGGCAATCGATACTCCCGCGAGCTGTTTATCGTGCCGGTATGGCGTAAAAGCTGGTGGCAGGGCGTGTGGTATGAAATCCGCTGGTATCTGTTTCTGGCAAAACGTCCGAGTGCCGATATAGGCCATAATCCCATCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGT‑CTTTATGATCATCAc < 1:2239381/278‑1 (MQ=255) tCTATATGGGCTACATCAGGTTAATTCACTTCAGCGCCGGGATGGTTTTTACCGT‑GGTTTTGCTGATGCGGATCTACTGGGCTTTTGTTGGCAATCGATACTCCCGCGAGCTGTTTATCGTGCCGGTATGGCGTAAAAGCTGGTGGCAGGGCGTGTGGTATGAAATCCGCTGGTATCTGTTTCTGGCAAAACGTCCGAGTGCCGATATAGGCCATAATCCCATCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGT‑CTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCt < 1:1773537/289‑1 (MQ=255) cTATATGGGCTACATCAGGTTAATTCACTTCAGCGCCGGGATGGTTTTTACCGT‑GGTTTTGCTGATGCGGATCTACTGGGCTTTTGTTGGCAATCGATACTCCCGCGAGCTGTTTATCGTGCCGGTATGGCGTAAAAGCTGGTGGCAGGGCGTGTGGTATGAAATCCGCTGGTATCTGTTTCTGGCAAAACGTCCGAGTGCCGATATAGGCCATAATCCCATCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGT‑CTTTATGATCATCACTGGTTTTgc > 1:116583/1‑285 (MQ=255) tatGGGCTACATCAGGTTAATTCACTTCAGCGCCGGGATGGTTTTTACCGT‑GGTTTTGCTGATGCGGATCTACTGGGCTTTTGTTGGCAATCGATACTCCCGCGAGCTGTTTATCGTGCCGGTATGGCGTAAAAGCTGGTGGCAGGGCGTGTGGTATGAAATCCGCTGGTATCTGTTTCTGGCAAAACGTCCGAGTGCCGATATAGGCCATAATCCCATCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGT‑CTTTATGATCATCACTGGTTTTgcg < 1:1716303/283‑1 (MQ=255) atGGGCTACATCAGGTTAATTCACTTCAGCGCCGGGATGGTTTTTACCGT‑GGTTTTGCTGATGCGGATCTACTGGGCTTTTGTTGGCAATCGATACTCCCGCGAGCTGTTTATCGTGCCGGTATGGCGTAAAAGCTGGTGGCAGGGCGTGTGGTATGAAATCCGCTGGTATCTGTTTCTGGCAAAACGTCCGAGTGCCGATATAGGCCATAATCCCATCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGT‑CTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACa < 1:610826/289‑1 (MQ=255) gCTACATCAGGTTAATTCACTTCAGCGCCGGGATGGTTTTTACCGT‑GGTTTTGCTGATGCGGATCTACTGGGCTTTTGTTGGCAATCGATACTCCCGCGAGCTGTTTATCGTGCCGGTATGGCGTAAAAGCTGGTGGCAGGGCGTGTGGTATGAAATCCGCTGGTATCTGTTTCTGGCAAAACGTCCGAGTGCCGATATAGGCCATAATCCCATCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGT‑Cttt > 1:2417468/1‑257 (MQ=255) gCTACATCAGGTTAATTCACTTCAGCGCCGGGATGGTTTTTACCGT‑GGTTTTGCTGATGCGGATCTACTGGGCTTTTGTTGGCAATCGATACTCCCGCGAGCTGTTTATCGTGCCGGTATGGCGTAAAAGCTGGTGGCAGGGCGTGTGGTATGAAATCCGCTGGTATCTGTTTCTGGCAAAACGTCCGAGTGCCGATATAGGCCATAATCCCATCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGT‑CTTTATGATCATCACTGGTTTTg > 2:963612/1‑276 (MQ=255) gCTACATCAGGTTAATTCACTTCAGCGCCGGGATGGTTTTTACCGT‑GGTTTTGCTGATGCGGATCTACTGGGCTTTTGTTGGCAATCGATACTCCCGCGAGCTGTTTATCGTGCCGGTATGGCGTAAAAGCTGGTGGCAGGGCGTGTGGTATGAAATCCGCTGGTATCTGTTTCTGGCAAAACGTCCGAGTGCCGATATAGGCCATAATCCCATCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGT‑CTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCg > 1:1182628/1‑288 (MQ=255) gCTACATCAGGTTAATTCACTTCAGCGCCGGGATGGTTTTTACCGT‑GGTTTTGCTGATGCGGATCTACTGGGCTTTTGTTGGCAATCGATACTCCCGCGAGCTGTTTATCGTGCCGGTATGGCGTAAAAGCTGGTGGCAGGGCGTGTGGTATGAAATCCGCTGGTATCTGTTTCTGGCAAAACGTCCGAGTGCCGATATAGGCCATAATCCCATCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGT‑CTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGa > 1:95232/1‑289 (MQ=255) gCTACATCAGGTTAATTCACTTCAGCGCCGGGATGGTTTTTACCGT‑GGTTTTGCTGATGCGGATCTACTGGGCTTTTGTTGGCAATCGATACTCCCGCGAGCTGTTTATCGTGCCGGTATGGCGTAAAAGCTGGTGGCAGGGCGTGTGGTATGAAATCCGCTGGTATCTGTTTCTGGCAAAACGTCCGAGTGCCGATATAGGCCATAATCCCATCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGT‑CTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGa > 1:2366625/1‑289 (MQ=255) gCTACATCAGGTTAATTCACTTCAGCGCCGGGATGGTTTTTACCGT‑GGTTTTGCTGATGCGGATCTACTGGGCTTTTGTTGGCAATCGATACTCCCGCGAGCTGTTTATCGTGCCGGTATGGCGTAAAAGCTGGTGGCAGGGCGTGTGGTATGAAATCCGCTGGTATCTGTTTCTGGCAAAACGTCCGAGTGCCGATATAGGCCATAATCCCATCGCCCAGGCGGCGATGGTCGGCGATTGCCTGA‑CTTCGTGCTTTTTGATCACACCTGGTTTTGCGCTGTACATCGa > 2:2527137/1‑289 (MQ=255) tACATCAGGTTAATTCACTTCAGCGCCGGGATGGTTTTTACCGT‑GGTTTTGCTGATGCGGATCTACTGGGCTTTTGTTGGCAATCGATACTCCCGCGAGCTGTTTATCGTGCCGGTATGGCGTAAAAGCTGGTGGCAGGGCGTGTGGTATGAAATCCGCTGGTATCTGTTTCTGGCAAAACGTCCGAGTGCCGATATAGGCCATAATCCCATCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGT‑CTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGaa < 2:1963493/288‑1 (MQ=255) aTCAGGTTAATTCACTTCAGCGCCGGGATGGTTTTTACCGT‑GGTTTTGCTGATGCGGATCTACTGGGCTTTTGTTGGCAATCGATACTCCCGCGAGCTGTTTATCGTGCCGGTATGGCGTAAAAGCTGGTGGCAGGGCGTGTGGTATGAAATCCGCTGGTATCTGTTTCTGGCAAAACGTCCGAGTGCCGATATAGGCCATAATCCCATCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGT‑CTTTATGATCATCACTGGTTTTgcg < 2:855045/273‑1 (MQ=255) aTCAGGTTAATTCACTTCAGCGCCGGGATGGTTTTTACCGT‑GGTTTTGCTGATGCGGATCTACTGGGCTTTTGTTGGCAATCGATACTCCCGCGAGCTGTTTATCGTGCCGGTATGGCGTAAAAGCTGGTGGCAGGGCGTGTGGTATGAAATCCGCTGGTATCTGTTTCTGGCAAAACGTCCGAGTGCCGATATAGGCCATAATCCCATCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGT‑CTTTATGATCATCACTGGTTTTgcg > 1:855045/1‑273 (MQ=255) aTCAGGTTAATTCACTTCAGCGCCGGGATGGTTTTTACCGT‑GGTTTTGCTGATGCGGATCTACTGGGCTTTTGTTGGCAATCGATACTCCCGCGAGCTGTTTATCGTGCCGGTATGGCGTAAAAGCTGGTGGCAGGGCGTGTGGTATGAAATCCGCTGGTATCTGTTTCTGGCAAAACGTCCGAGTGCCGATATAGGCCATAATCCCATCGCCCAGGCGGCGACTGTCGGCCATTTCCTGATGTCGGT‑CTTTATGAACATCCCTGGTTTTGCGCTGTACAGCg > 2:1716303/1‑283 (MQ=255) gTTAATTCACTTCAGCGCCGGGATGGTTTTTACCGT‑GGTTTTGCTGATGCGGATCTACTGGGCTTTTGTTGGCAATCGATACTCCCGCGAGCTGTTTATCGTGCCGGTATGGCGTAAAAGCTGGTGGCAGGGCGTGTGGTATGAAATCCGCTGGTATCTGTTTCTGGCAAAACGTCCGAGTGCCGATATAGGCCATAATCCCATCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGT‑CTTTATGATCATCACTGGtt > 1:978341/1‑263 (MQ=255) gTTAATTCACTTCAGCGCCGGGATGGTTTTTACCGT‑GGTTTTGCTGATGCGGATCTACTGGGCTTTTGTTGGCAATCGATACTCCCGCGAGCTGTTTATCGTGCCGGTATGGCGTAAAAGCTGGTGGCAGGGCGTGTGGTATGAAATCCGCTGGTATCTGTTTCTGGCAAAACGTCCGAGTGCCGATATAGGCCATAATCCCATCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGT‑CTTTATGATCATCACTGGTTTTgcg < 2:1136585/268‑1 (MQ=255) ttCACTTCAGCGCCGGGATGGTTTTTACCGT‑GGTTTTGCTGATGCGGATCTACTGGGCTTTTGTTGGCAATCGATACTCCCGCGAGCTGTTTATCGTGCCGGTATGGCGTAAAAGCTGGTGGCAGGGCGTGTGGTATGAAATCCGCTGGTATCTGTTTCTGGCAAAACGTCCGAGTGCCGATATAGGCCATAATCCCATCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGT‑CTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCg > 1:2037143/1‑273 (MQ=255) ttCACTTCAGCGCCGGGATGGTTTTTACCGT‑GGTTTTGCTGATGCGGATCTACTGGGCTTTTGTTGGCAATCGATACTCCCGCGAGCTGTTTATCGTGCCGGTATGGCGTAAAAGCTGGTGGCAGGGCGTGTGGTATGAAATCCGCTGGTATCTGTTTCTGGCAAAACGTCCGAGTGCCGATATAGGCCATAATCCCATCGCCCAGGCGGCGAAGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGT‑CTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGCCAGTACGc < 1:2160038/289‑1 (MQ=255) tCAGCGCCGGGATGGTTTTTACCGT‑GGTTTTGCTGATGCGGATCTACTGGGCTTTTGTTGGCAATCGATACTCCCGCGAGCTGTTTATCGTGCCGGTATGGCGTAAAAGCTGGTGGCAGGGCGTGTGGTATGAAATCCGCTGGTATCTGTTTCTGGCAAAACGTCCGAGTGCCGATATAGGCCATAATCCCATCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGT‑CTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTAAAGCGAACACAGCCAGTACGCTAtttt > 1:1145282/1‑289 (MQ=255) gcCGGGATGGTTTTTACCGT‑GGTTTTGCTGTTGCGGATCTACTGGGCTTTTGTTGGCAATCGATACTCCCGCGAGCTGTTTATCGTGCCGGTATGGCGTAAAAGCTGGTGGCAGGGCGTGTGGTATGAAATCCGCTGGTATCTGTTTCTGGCAAAACGTCCGAGTGCCGATATAGGCCATAATCCCATCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGT‑CTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGCCAGTACGCTATTTTTgcg < 1:1216122/288‑1 (MQ=255) ggATGGTTTTTACCGT‑GGTTTTGCTGATGCGGATCTACTGGGCTTTTGTTGGCAATCGATACTCCCGCGAGCTGTTTATCGTGCCGGTATGGCGTAAAAGCTGGTGGCAGGGCGTGTGGTATGAAATCCGCTGGTATCTGTTTCTGGCAAAACGTCCGAGTGCCGATATAGGCCATAATCCCATCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGT‑CTTTATGATCATCACTGGTTTTgcg > 1:1945669/1‑248 (MQ=255) ggATGGTTTTTACCGT‑GGTTTTGCTGATGCGGATCTACTGGGCTTTTGTTGGCAATCGATACTCCCGCGAGCTGTTTATCGTGCCGGTATGGCGTAAAAGCTGGTGGCAGGGCGTGTGGTATGAAATCCGCTGGTATCTGTTTCTGGCAAAACGTCCGAGTGCCGATATAGGCCATAATCCCATCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGT‑CTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGCCAGTACGCTATTTTTGCGccgt > 1:155317/1‑288 (MQ=255) tACCGT‑GGTTTTGCTGATGCGGATCTACTGGGCTTTTGTTGGCAATCGATACTCCCGCGAGCTGTTTATCGTGCCGGTATGGCGTAAAAGCTGGTGGCAGGGCGTGTGGTATGAAATCCGCTGGTATCTGTTTCTGGCAAAACGTCCGAGTGCCGATATAGGCCATAATCCCATCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGT‑CTTTATg > 1:1676363/1‑220 (MQ=255) ggTTTTGCTGATGCGGATCTACTGGGCTTTTGTTGGCAATCGATACTCCCGCGAGCTGTTTATCGTGCCGGTATGGCGTAAAAGCTGGTGGCAGGGCGTGTGGTATGAAATCCGCTGGTATCTGTTTCTGGCAAAACGTCCGAGTGCCGATATAGGCCATAATCCCATCGCTCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGT‑CTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGCCAGTACGCTATTTTTGCGccg > 2:293803/1‑271 (MQ=255) ggTTTTGCTGATGCGGATCTACTGGGCTTTTGTTGGCAATCGATACTCCCGCGAGCTGTTTATCGTGCCGGTATGGCGTAAAAGCTGGTGGCAGGGCGTGTGGTATGAAATCCGCTGGTATCTGTTTCTGGCAAAACGTCCGAGTGCCGATATAGGCCATAATCCCATCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGT‑CTTTATGATCATCACTGGTTTTTCGCTGTACAGCGAACACAGCCAGTACGCTATTTTTGCGCCGGTCCGTTATGTGGTGGaa > 1:1938029/1‑289 (MQ=255) ggTTTTGCTGATGCGGATCTACTGGGCTTTTGTTGGCAATCGATACTCCCGCGAGCTGTTTATCGTGCCGGTATGGAGTAAAAGCTGGTTGCAGGGCGTGTGGTCTGAGATCCGCTGGTATCTGGTTCTGGCAAAACGTCCGAGTGCCGATATAGACCATAATTCCATCTCCCAAGACGCGATGTTCGGCGATGTCCTGCTGTAGGT‑CGTTATGATCATCACCTGTTTTGCGCTGTACCGCGAACACGACCAGTACTCTATATTTTCACCGTTCCGTTATGtggtggga > 2:1923564/1‑287 (MQ=255) tGCGGATCTACTGGGCTTTTGTTGGCAATCGATACTCCCGCGAGCTGTTTATCGTGCCGGTATGGCGTAAAAGCTGGTGGCAGGGCGTGTGGTATGAAATCCGCTGGTATCTGTTTCTGGCAAAACGTCCGAGTGCCGATATAGGCCATAATCCCATCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGT‑CTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTTTACAGCGAACACAGCCAGTACGCTATTCTTGCCCCGTTCCGTTATGTGGTGGATTTTTTCTACTg > 2:2424633/1‑289 (MQ=255) tGCGGATCTACTGGGCTTTTGTTGGCAATCGATACTCCCGCGAGCTGTTTATCGTGCCGGTATGGCGTAAAAGCTGGTGGCAGGGCGTGTGGTATGAAATCCGCAGGTATCTGTTTCTGGCAAAACGTCCGAGTGCCGATATAGGCCATAATCCCATCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGT‑CTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGCCAGTACGCTATTTTTGCGccgtt < 1:374631/262‑1 (MQ=255) tCTACTGGGCTTTTGTTGGCAATCGATACTCCCGCGAGCTGTTTATCGTGCCGGTATGGCGTAAAAGCTGGTGGCAGGGCGTGTGGTATGAAATCCGCTGGTATCTGTTTCTGGCAAAACGTCCGAGTGCCGATATAGGCCATAATCCCATCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGT‑CTTTATGATCATCACTGGtt < 1:239166/210‑1 (MQ=255) cTGGGCTTTTGTTGGAAATGGATTCTCCGGCTGGCGGTGTATCGGGCCGGTATGGCGTAAAAGCTGGTGGCAGGGCGTGTGGTATGAAATCCGCTGGTATCTGTTTCTGGCAAATCGTCCGAGTGCCGATATAGGCCATAATCCCATCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGT‑CTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGCCAGTACGCTATTTTTGCGCCGTTCCGTTATGTGGTGGAATTTTTCTACTGGACGGGTGGc < 2:144635/289‑1 (MQ=255) gggCTTTTGTTGGCAATCGATACTCCCGCGAGCTGTTTATCGTGCCGGTATGGCGTAAAAGCTGGTGGCAGGGCGTGTGGTATGAAATCCGCTGGTATCTGTTTCTGGCAAAACGTCCGAGTGCCGATATAGGCCATAATCCCATCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGT‑CTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGCCAGTACGCTATTTTTGCGCCGTTCCGTTATGTGGTGGAATTTTTCTACTGGACGGGTGGCaa < 1:1318102/289‑1 (MQ=255) cTTTTGTTGGCAATCGATACTCCCGCGAGCTGTTTATCGTGCCGGTATGGCGTAAAAGCTGGTGGCAGGGCGTGTGGTATGAAATCCGCTGGTATCTGTTTCTGGCAAAACGTCCGAGTGCCGATATAGGCCATAATCCCATCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGT‑CTTTATGATCATCACTGGTTTTgc < 2:1653089/205‑1 (MQ=255) cTTTTGTTGGCAATCGATACTCCCGCGAGCTGTTTATCGTGCCGGTATGGCGTAAAAGCTGGTGGCAGGGCGTGTGGTATGAAATCCGCTGGTATCTGTTTCTGGCAAAACGTCCGAGTGCCGATATAGGCCATAATCCCATCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGT‑CTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGCCAGTACGCTATTTTTGCGCCGTTCCGTTATGTGGTGGAATTTTTCTACTGGACGGGTGGCAActc > 2:269481/1‑287 (MQ=255) tttGTTGGCAATCGATACTCCCGCGAGCTGTTTATCGTGCCGGTATGGCGTAAAAGCTGGTGGCAGGGCGTGTGGTATGAAATCCGCTGGTATCTGTTTCTGGCAAAACGTCCGAGTGCCGATATAGGCCATAATCCCATCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGT‑CTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGCCAGTACGCTATTTTTGCGCCGTTCCGTTATGTGGTGGAATTTTTCTACTGGACGGGTGGCAActcaa < 1:189540/289‑5 (MQ=255) cccGCGAGCTGTTTATCGTGCCGGTATGGCGTAAAAGCTGGTGGCAGGGCGTGTGGTATGAAATCCGCTGGTATCTGTTTCTGGCAAAACGTCCGAGTGCCGATATAGGCCATAATCCCATCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGT‑CTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGCCAGTACGCTATTTTTGCGCCGTTCCGTTATGTGGTGGAATTTTTCTACTGGACGGGTGGCAACTCAATGGACATTCACAGCTGGCa < 2:549033/289‑1 (MQ=255) cgcgAGCTGTTTATCGTGCCGGTATGGCGTAAAAGCTGGTGGCAGGGCGTGTGGTATGAAATCCGCTGGTATCTGTTTCTGGCAAAACGTCCGAGTGCCGATATAGGCCATAATCCCATCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGT‑CTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGCCAGTACGCTATTTTTGCGCCGTTCCGTTATGTGGTGGAATTTTTCTACTGGACGGGTGGCAACTCAATGGACATTCACAGCTGGCATc > 1:2118946/1‑289 (MQ=255) aGCTGTTTATCGTGCCGGTATGGCGTAAAAGCTGGTGGCAGGGCGTGTGGTATGAAATCCGCTGGTATCTGTTTCTGGCAAAACGTCCGAGTGCCGATATCGGCCATAATCCCATCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGT‑CTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGCCAGTACGCTATTTTTGCGCCGTTCCGTTATGTGGTGGAATTTTTCTACTGGACGGGTGGCAACTCAATGGACATTCACAGCTGGCAt < 2:1539177/284‑1 (MQ=255) aGCTGTTTATCGTGCCGGTATGGCGTAAAAGCTGGTGGCAGGGCGTGTGGTATGAAATCCGCTGGTATCTGTTTCTGGCAAAACGTCCGAGTGCCGATATAGGCCATAATCCCATCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGT‑CTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGCCAGTACGCTATTTTTGCGCCGTTCCGTTATGTGGTGGAATTTTTCTACTGGACGGGTGGCAACTCAATGGACATTCACAGCTGGCAt > 1:1539177/1‑284 (MQ=255) aGCTGTTTATCGTGCCGGTATGGCGTAAAAGCTGGTGGCAGGGCGTGTGGTATGAAATCCGCTGGTATCTGTTTCTGGCAAAACGTCCGAGTGCCGATATAGGCCATAATCCCATCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGT‑CTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGCCAGTACGCTATTTTTGCGCCGTTCCGTTATGTGGTGGAATTTTTCTACTGGACGGGTGGCAACTCAATGGACATTCACAGCTGGCATCGGCt > 2:1432168/1‑289 (MQ=255) gCTGTTTATCGTGCCGGTATGGCGTAAAAGCTGGTGGCAGGGCGTGTGGTATGAAATCCGCTGGTATCTGTTTCTGGCAAAACGTCCGAGTGCCGATATAGGCCATAATCCCATCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGT‑CTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGCCAGTACGCTATTTTTGCGCCGTTCCGTTATGTGGTGGAATTTTTCTACTGGACGGGTGGCAACTCAATGGACATTCACAGCTGGCATCGGCt < 1:500066/288‑1 (MQ=255) gCCGGTATGGCGTAAAAGCTGGTGGCAGGGCGTGTGGTATGAAATCCGCTGGTATCTGTTTCTGGCAAAACGTCCGAGTGCCGATATAGGCCATCATCCCATCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGT‑CTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGCCAGTGCGCTATTTTTGCGCCGTTCCGTTATGTGGTGGACTTTTTCTACTGGACGGGTGGCAACTCAATGGACATTCACAGCTGGCATCGGCTGGGGATGTGGcgg > 2:396794/1‑287 (MQ=255) gCCGGTATGGCGTAAAAGCTGGTGGCAGGGCGTGTGGTATGAAATCCGCTGGTATCTGTTTCTGGCAAAACGTCCGAGTGCCGATATAGGCCATAATCCCATCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGT‑CTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGCCAGTACGCTATTTTTGCGCCGTTCCGTTATGTGGTGGAATTTTTCTACTGGACGGGTGGCAACTCAATGGACATTCACAGCTGGCATCGGCTGGGGATGTGGCTg > 1:1984835/1‑289 (MQ=255) tATGGCGTAAAAGCTGGTGGCAGGGCGTGTGGTATGAAATCCGCTGGTATCTGTTTCTGGCAAAACGTCCGAGTGCCGATATAGGCCATAATCCCATCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGT‑CTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGCCAGTACGCTATTTTTGCGccg < 1:813139/200‑1 (MQ=255) tATGGCGTAAAAGCTGGTGGCAGGGCGTGTGGTATGAAATCCGCTGGTATCTGTTTCTGGCAAAACGTCCGAGTGCCGATATAGGCCATAATCCCATCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGT‑CTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGCCAGTACGCTATTTTTGCGccg > 2:813139/1‑200 (MQ=255) aGCTGGTGGCAGGGCGTTTGGTATGAAATCCGCTGGTATCTGTTTCTGGCAAAACGTCCGAGTGCCGATATAGGCCATAATCCCATCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGT‑CTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGCCAGTACGCTATTTTTGCGCCGTTCCGTTATGTGGTGGAATTTTTCTACTGGACGGGTGGCAACTCAATGGACATTCACAGCTGGCATCGGCTGGGGATGTGGCTGATTGGCGCGTTTGTGa < 1:2633882/289‑1 (MQ=255) ggtggCAGGGCGTGTGGTATGAAATCCGCTGGTATCTGTTTCTGGCAAAACGTCCGAGTGCCGATATAGGCCATAATCCCATCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGT‑CTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGc > 2:2591443/1‑164 (MQ=255) gtggCAGGGCGTGTGGTATGAAATCCGCTGGTATCTGTTTCTGGCAAAACGTCCGAGTGCCGATATAGGCCATAATCCCATCGCCCAGGCGGCGCTGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGT‑CTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGCCAGTACGCTATTTTTGCGCCGTTCCGTTCTGTGGTGGAATTTTTGTACTGGACGGGTGGCAACTCAATGGACATTCCCAGCTGGCATCGGCCGGGGATGTGGCTGCTTGGCGCGTTtggtatcc > 2:1227467/1‑281 (MQ=255) tggGAGGGAGTGTGGTAGTAAATCCGCTGTTTTCCGTTTCTGGCAAATCGTCCGAGGGCCGATATAGGCCATAATCCCATCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGT‑CTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGCCAGTACGCTATTTTTGCGCCGTTCTGTGATGTGGTGGAATTTTTCTACTGGACGGGTGGCAACTCAATGGACATTCACAGCTGGCATCGGCTGGGGATGTGGCTGATTGGCGCGTTTGTGATCGGt < 2:882516/288‑1 (MQ=255) tggCAGGGCGTGTGGTATGAAATCCGCTGGTATCTGTTTCTGGCAAAACGTCCGAGTGCCGATATAGGCCATAATCCCATCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGT‑CTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGCCAGTACGCTATTTTTGCGCCGTTCCGTTATGTGGTGGAATTTTTCTACTGGACGGGTGGCAACTCAATGGACATTCACAGCTGGCATCGGCTGGGGATGTGGCTGATTGGCGCGTTTGTGATCGGt < 1:2517484/288‑1 (MQ=255) tggCAGGGCGTGTGGTATGAAATCCGCTGGTATCTGTTTCTGGCAAAACGTCCGAGTGCCGATATAGGCCATAATCCCATCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGT‑CTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGCCAGTACGCTATTTTTGCGCCGTTCCGTTATGTGGTGGAATTTTTCTACTGGACGGGTGGCAACTCAATGGACATTCACAGCTGGCATCGGCTGGGGATGTGGCTGATTGGCGCGTTTGTGATCGGt < 1:1238770/288‑1 (MQ=255) gCGTGTGGTATGAAATCCGCTGGTATCTGTTTCTGGCAAAACGTCCGAGTGCCGATATAGGCCATAATCCCATCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGT‑CTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGCCAGTACGCTATTTTTGCGCCGTTCCGTTATGTGGTGGAATTTTTCTACTGGACGGGTGGCAACTCAATGGACATTCACAGCTGGCATCGGCTGGGGATGTGGCTGATTGGCGCGTTTGTGATCGGTCATGt < 1:302190/286‑1 (MQ=255) gtgtGGTATGAAATCCGCTGGTATCTGTTTCTGGCAAAACGTCCGAGTGCCGATATAGGCCATAATCCCATCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGT‑CTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGCCAGTACGCTATTTTTGCGCCGTTCCGTTATGTGGTGGAATTTTTCTACTGGACGGGTGGCAActcaa > 1:2489330/1‑216 (MQ=255) gtgtGGTATGAAATCCGCTGGTATCTGTTTCTGGCAAAACGTCCGAGTGCCGATATAGGCCATAATCCCATCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGT‑CTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGCCAGTACGCTATTTTTGCGCCGTTCCGTTATGTGGTGGAATTTTTCTACTGGACGGGTGGCAActcaa < 2:2489330/220‑5 (MQ=255) tgtgTTATGAAATCCGCTGGTATCTGTTTCTGGCAAAACGTCCGAGTGCCGATATAGGCCATAATCCCATCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGT‑CTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGCCAGTACGCTATTTTTGCGCCGTTCCGTTATGTGGTGGAATTTTTCTACTGGACGGGTGGCAACTCAATGGACATTCACAGCTGGCATCGGCTGGGGATGTGGCTGATTGGCGCGTTTGTGATCGGTCATGTCTACa < 2:487286/288‑1 (MQ=255) tgtgGTATGAAATCCGCTGGTATCTGTTTCTGGCAAAACGTCCGAGTGCCGATATAGGCCATAATCCCATCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGT‑CTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGCCAGTACGCTATTTTTGCGccg < 2:2016166/173‑1 (MQ=255) tttGAAATCCGCTGGTATCTTTTTCTGGCAAAACGTCCGAGTGCCGATATAGGCCATAATCCCATCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGT‑CTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGCCAGTACGCTATTTTTGCGCCGTTCCGTTATGTGGTGGAATTTTTCTACTGGACGGGTGGCAACTCAATGGACATTCACAGCTGGCATCGGCTGGGGATGTGGCTGATTGGCGCGTTTGTGATCGGt < 1:2666081/271‑1 (MQ=255) tATGAAATCCGCTGGTATCTGTTTCTGGCAAAACGTCCGAGTGCCGATATAGGCCATAATCCCATCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGT‑CTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGCCAGTACGCTATTTTTGCGCCGTTCCGTTATGTGGTGGAATTTTTCTACTGGACGGGTGGCAACTCAATGGACATTCACAGCTGGCATCGGCTGGGGATGTGGCTGATTGGCGCGTTTGTGATCGGTCATGTCTACATGgcg < 1:1503258/288‑1 (MQ=255) tATGAAATCCGCTGGTATCTGTTTCTGGCAAAACGTCCGAGTGCCGATATAGGCCATAATCCCATCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGT‑CTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGCCAGTACGCTATTTTTGCGCCGTTCCGTTATGTGGTGGAATTTTTCTACTGGACGGGTGGCAACTCAATGGACATTCACAGCTGGCATCGGCTGGGGATGTGGCTGATTGGCGCGTTTGTGATCGGTCATGTCTACATGgcg < 2:573385/288‑1 (MQ=255) aTGAAATCCGCTGGTATCTGTTTCTGGCAAAACGTCCGAGTGCCGATATAGGCCATAATCCCATCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGT‑CTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGCCAGTACGCTATTTTTGCGCCGTTCCGTTATGTGGTGGAATTTTTCTACTGGACGGGTGGCAACTCAATGGACATTCACAGCTGGCATCGGCTGGGGATGTGGCTGATTGGCGCGTTTGTGATCGGTCATGTCTACATGgcgc < 1:2722138/288‑1 (MQ=255) tGAAATCCGCTGGTATCTGTTTCTGGCAAAACGTCCGAGTGCCGATATAGGCCATAATCCCATCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGT‑CTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGCCAGTACGCTATTTTTGCGCCGTTCCGTTATGTGGTGGAATTTTTCTACTGGACGGGTGGCAACTCAATGGACATTCACAGCTGGCATCGGCTGGGGATGTGGCTGATTGGCGCGTTTGTGATCGGTCATGTCTACATGGCGCt > 1:1446482/1‑288 (MQ=255) tCCGCTGGTATCTGTTTCTGGCAAAACGTCCGAGTGCCGATATAGGCCATAATCCCATCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGT‑CTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGCCAGTACGCTATTTTTGCGCCGTTCCGTTATGTGGTGGAATTTTTCTACTGGACGGGTGGCAACTCAATGGACATTCACAGCTGGCATCGGCTGGGGATGGGGCTGATTGGCGCGTTTGGGCTGCGTCATGTCCACATGGCGCTTCGTGa > 2:1671906/1‑289 (MQ=255) gCTGGTATCTGTTTCTGGCAAAACGTCCGAGTGCCGATATAGGCCATAATCCCATCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGT‑CTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGCCAGTACGCTATTTTTGCGCCGTTCCGTTATGTGGTGGAATTTTTCTACTGGACGGGTGGCAACTCAATGGACATTCACAGCTGGCATCGGCTGGGGATGTGGGTGATTGGCGCGTTGGTGATCGGGCATTTCTAACTGGCGCTGCGTGAAGa > 2:2057782/1‑289 (MQ=255) gCTGGTATCTGTTTCTGGCAAAACGTCCGAGTGCCGATATAGGCCATAATCCCATCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGT‑CTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGCCAGTACGCTATTTTTGCGCCGTTCCGTTATGTGGTGGAATTTTTCTACTGGACGGGTGGCAACTCAATGGACATTCACAGCTGGCATCGGCTGGGGATGTGGCTGATTGGCGCGTTTGTGAt < 2:1573093/259‑1 (MQ=255) ttCTGGCAAAACGTCCGAGTGCCGATATAGGCCATAATCCCATCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGT‑CTTTATGATCATCACTGGTTTTgcg < 2:2215534/107‑1 (MQ=255) ttCTGGCAAAACGTCCGAGTGCCGATATAGGCCATAATCCCATCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGT‑CTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGCCAGTACGCTATTTTTGCGCCGTTCCGTTATGTGGTGGAATTTTTCTACTGGACGGGTGGCAACTCAATGGACATTCACAGCTGGCATCGGCTGGGGATGTGGCTGATTGGCGCGTTTGTGATCGGTCATGTCTACATGGCGCTGCGTGAAGACATCATGTCcga < 1:406301/289‑1 (MQ=255) cTGGCAAAACGTCCGAGTGCCGATATAGGCCATAATCCCATCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGT‑CTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGCCAGTACGCTATTTTTGCGCCGTTCCGTTATGTGGTGGAATTTTTCTACTGGACGGGTGGCAACTCAATGGACATTCACAGCTGGCATCGGCTGGGGATGTGGCTGATTGGCGCGTTTGTGTGCGGTCATGTCTACATGGGGCTGCGTGTAGAcatctgttgcgtc > 2:138121/1‑279 (MQ=255) aaatggtcccgttGCCGATATAGGCCATAATCCCGTCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGT‑CTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGCCAGTACGCTATTTTTGCGCCGTTCCGTTATGTGGTGGAATTTTTCTACTGGGCGGGTGGCAACTCAGTGGACATTCACAGCTGGCATCGGCTGGGGATGTGGCTGATTGGCGCGTTTGTGATCGGTCATGTCTACATGGCGCTGCGTGAAGACATCATGTCCGACGACACg < 2:380283/277‑1 (MQ=255) aaaaCGTCCGAGTGCCGATATAGGCCATAATCCCATCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGT‑CTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGCCAGTACGCTATTTTTGCGCCGTTCCGTTATGTGGTGGAATTTTTCTACTGGACGGGTGGCAACTCAATGGACATTCACAGCTGGCATCGGCTGGGGATGTGGCTGATTGGCGCGTTTGTGATCGGTCATGTCTACATGGCGCTGCGTGAAGACATCATGTCCGACGACACg < 1:902617/289‑1 (MQ=255) gTCCGAGTGCCGATATAGGCCATAATCCCATCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGT‑CTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGCCAGTACGCTATTTTTGCGCCGTTCCGTTATGTGGTGGAATTTTTCTACTGGACGGGTGGCAACTCAATGGACATTCACAGCTGGCATCGGCTGGGGATGTGGCTGATTGGCGCGTTTGTGATCGGTCATGTCTACATGGCGCTGCGTGAAGACATCATGTCCGACGACACGGTGAt < 2:1859463/289‑1 (MQ=255) ggCCATAATCCCATCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGT‑CTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGCCAGTACGCTATTTTTGCGCCGTTCCGTTATGTGGTGGAATTTTTCTACTGGACGGGTGGc < 2:679027/156‑1 (MQ=255) ggCCATAATCCCATCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGT‑CTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGCCAGTACGCTATTTTTGCGCCGTTCCGTTATGTGGTGGAATTTTTCTACTGGACGGGTGGCAACTCAATGGACATTCACAGCTGGCATCGGCTGGGGATGTGGCTGATTGGCGCGTTTGTGATCGGTCATGTCTACATGGCGCTGCGTGAAGACATCATGTCCGACGACACGGTGATCTCCACCATGGTCAACg > 1:1649889/1‑289 (MQ=255) cATAATCCCATCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGT‑CTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGCCAGTACGCTATTTTTGCGCCGTTCCGTTATGTGGTGGAATTTTTCTGCTGGACGGGTGGCAACTCAATGGACATTCACAGCTGGCATCGGCTGGGGa > 1:1020167/1‑190 (MQ=255) cATAATCCCATCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGT‑CTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGCCAGTACGCTATTTTTGCGCCGTTCCGTTATGTGGTGGAATTTTTCTGCTGGACGGGTGGCAACTCAATGGACATTCACAGCTGGCATCGGCTGGGGa < 2:1020167/190‑1 (MQ=255) cATAATCCCATCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGT‑CTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGCCAGTACGCTATTTTTGCGCCGTTCCGTTATGTGGTGGAATTTTTCTACTGGACGGGTGGCAACTCAATGGACATTCACAGCTGGCATCGGCTGGGGATGTGGCTGATTGGCGCGTTTGTGATCGGTCATGTCTACATGgcg < 1:2446670/234‑1 (MQ=255) aTAATCCCATCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGT‑CTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGCCAGTACGCTATTTTTGCGCCGTTCCGTTATGTGGTGGAATTTTTCTACTGGACGGGTGGCAACTCAATGGACATTCACAGCTGGCATCGGCTGGGGATGTGGCTGATTGGCGCGTTTGTGATCGGTCATGTCTACCTGGCGCTGCGTGAAGACATCATGTCCGACGACACGGTGATCTCCACCATGGTCAACGGCt > 1:1108812/1‑288 (MQ=255) tAATCCCATCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGT‑CTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGCCAGTACGCTATTTTTGCGCCGTTCCGTTATGTGGTGGAATTTTTCTACTGGACGGGTGGCAACTCAATGGACATTCACAGCTGGCATCGGCTGGGGAtg < 1:789323/190‑1 (MQ=255) tAATCCCATCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGT‑CTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGCCAGTACGCTATTTTTGCGCCGTTCCGTTATGTGGTGGAATTTTTCTACTGGACGGGTGGCAACTCAATGGACATTCACAGCTGGCATCGGCTGGGGAtg > 2:789323/1‑190 (MQ=255) aaTCCCATCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGT‑CTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGCCAGTACGCTATTTTTGCGCCGTTCCGTTATGTGGTGGAATTTTTCTACTGGACGGGTGGCAACTCAATGGACATTCACAGCTGGCATCGGCTGGGGATGTGGCTGATTGgc < 1:323716/201‑1 (MQ=255) aaTCCCATCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGT‑CTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGCCAGTACGCTATTTTTGCGCCGTTCCGTTATGTGGTGGAATTTTTCTACTGGACGGGTGGCAACTCAATGGACATTCACAGCTGGCATCGGCTGGGGATGTGGCTGATTGGCGCGTTTGTGATCGGTCATGTCTACATGGCGCTGCGTGAAGACATCATGTCcgacg < 2:1474966/256‑1 (MQ=255) aaTCCCATCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGT‑CTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGCCAGTACGCTATTTTTGCGCCGTTCCGTTATGTGGTGGAATTTTTCTACTGGACGGGTGGCAACTCAATGGACATTCACAGCTGGCATCGGCTGGGGATGTGGCTGATTGGCGCGTTTGTGATCGGTCATGTCTACATGGCGCTGCGTGAAGACATCATGTCCGACGACACGGTGATCTCCACCATGGTCAACGGCTAcc > 2:1068246/1‑289 (MQ=255) aaTCCCATCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGT‑CTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGCCAGTACGCTATTTTTGCGCCGTTCCGTTATGTGGTGGAATTTTTCTACTGGACGGGTGGCAACTCAATGGACATTCACAGCTGGCATCGGCTGGGGATGTGGCTGATTGGCGCGTTTGTGATCGGTCATGTCTACATGGCGCTGCGTGAAGACATCATGTCCGACGACACGGTGATCTCCACCATGGTCAACGGCTAcc > 1:399827/1‑289 (MQ=255) cccATCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGT‑CTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGCCAGTACGCTATTTTTGCGCCGTTCCGTTATGTGGTGGAATTTTTCTACTGGACGGGTGGCAACTCAATGGACATTCACAGCTGGCATCGGCTGGGGATGTGGCTGATTGGCGCGTTTGTGATCGGTCATGTCTACATGGCGCTGCGTGAAGACATCATGTCCGACGACACGGTGATCTCCACCATGGTCAACGGCTACCGTa < 1:1432168/289‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGT‑CTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGCCAGTACGCTATTTTTGCGCCGTTCCGTTATGTGGTGGAATTTTTCTACTGGACGGGTGGCAActcaa < 2:23920/151‑5 (MQ=255) tCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGT‑CTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGCCAGTACGCTATTTTTGCGCCGTTCCGTTATGTGGTGGAATTTTTCTACTGGACGGGTGGCAACTCAATGGACATTCACAGCTGGCATCGGCTGGGGATGTGGCTGATTGGCGCGTTTGTGATCGGTCATGt < 1:722568/214‑1 (MQ=255) tCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGT‑CTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGCCAGTACGCTATTTTTGCGCCGTTCCGTTATGTGGTGGAATTTTTCTACTGGACGGGTGGCAACTCAATGGACATTCACAGCTGGCATCGGCTGGGGATGTGGCTGATTGGCGCGTTTGTGATCGGTCATGt > 2:722568/1‑214 (MQ=255) cgATGTTCGGCTATTTCCTGATGTCGGT‑CTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGCCAGTACGCTATTTTTGCGCCGTTCCGTTATGTGGTGGAATTTTTCTACTGGACGGGTGGCAACTCAATGGACATTCACAGCTGGCATCGGCTGGGGATGTGGCTGATTGGCGCGTTTGTGATCGGt < 2:1051316/197‑1 (MQ=255) ttCGGCTATTTCCTGATGTCGGT‑CTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGCCAGTACGCTATTTTTGCGCCGTTCCGTTATGTGGTGGAATTTTTCTACTGGACGGGTGGCAACTCAATGGACATTCACAGCTGGCATCGGCTGGGGATGTGGCTGATTGGCGCGTTTGTGATCGGTCATGTCTACATGGCGCTGCGTGAAGACATCATGTCcga > 2:2147930/1‑230 (MQ=255) tCCTGATGTCGGT‑CTTTATTATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGCCAGTACGCTATTTTTGCGCCGTTCCGTTATGTGGTGGAATTTTTCTACTGGACGGGTGGCAACTCAATGGACATTCACAGCTGGCATCGGCTGGGGATGTGGCTGATTGGCGCGTTTGTGATCGGTCATGTCTACATGGCGCTGCGTGAAGACATCATGTCCGACGACACGGTGATCTCCACCATGGTCAACGGCTACCGTAGCCACAAATTTGGCAAAATAAGTAACAAGGA < 1:2212737‑M1/289‑1 (MQ=255) tCCTGATGTCGGT‑CTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGCCAGTACGCTATTTTTGCGCCGTTCCGTTATGTGGTGGAATTTTTCTACTGGACGGGTGGCAACTCAATGGACATTCACAGCTGGCATCGGCTGGGGATGTGGCTGATTGGCGCGTTTGTGATCGGTCATGTCTACATGGCGCTGCGTGAAGACATCATGTCCGACGACACGGTGATCTCCACCATGGTCAACGGCTACCGTAGCCACAAATTTGGCAAAATAAGTAACAAGGA < 1:2084882‑M1/289‑1 (MQ=255) tCCTGATGTCGGT‑CTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGCCAGTACGCTATTTTTGCGCCGTTCCGTTATGTGGTGGAATTTTTCTACTGGACGGGTGGCAACTCAATGGACATTCACAGCTGGCATCGGCTGGGGATGTGGCTGATTGGCGCGTTTGTGATCGGTCATGTCTACATGGCGCTGCGTGAAGACATCATGTCCGACGACACGGTGATCTCCACCATGGTCAACGGCTACCGTAGCCACAAATTTGGCAAAATAAGTAACAAGGA < 1:1586762‑M1/289‑1 (MQ=255) ||| GGCGAGGCGACGTATCTGTTCTATATGGGCTACATCAGGTTAATTCACTTCAGCGCCGGGATGGTTTTTACCGT‑GGTTTTGCTGATGCGGATCTACTGGGCTTTTGTTGGCAATCGATACTCCCGCGAGCTGTTTATCGTGCCGGTATGGCGTAAAAGCTGGTGGCAGGGCGTGTGGTATGAAATCCGCTGGTATCTGTTTCTGGCAAAACGTCCGAGTGCCGATATAGGCCATAATCCCATCGCCCAGGCGGCGATGTTCGGCTATTTCCTGATGAGCGT‑CTTTATGATCATCACTGGTTTTGCGCTGTACAGCGAACACAGCCAGTACGCTATTTTTGCGCCGTTCCGTTATGTGGTGGAATTTTTCTACTGGACGGGTGGCAACAGTATGGACATTCACAGCTGGCATCGGCTGGGGATGTGGCTGATTGGCGCGTTTGTGATCGGTCATGTCTACATGGCGCTGCGTGAAGACATCATGTCCGACGACACGGTGATCTCCACCATGGTCAACGGCTACCGTAGCCACAAATTTGGCAAAATAAGTAACAAGGA > CP042583/898192‑898748 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |