| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP042583 | 920,460 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP042583 | 920,460 | 0 | A | T | 99.1% | 775.3 / NA | 333 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (158/171); minor base C (3/0); total (162/171) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.13e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| * | CP042583 | 920,461 | 0 | G | C | 99.7% | 786.6 / NA | 333 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/0); new base C (161/171); total (162/171) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.86e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.93e-01 | |||||||||||
| * | CP042583 | 920,462 | 0 | C | G | 100.0% | 798.7 / NA | 333 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (162/171); total (162/171) | |||||||||||
Only 100 of 333 total aligned reads displayed.
ATCGCCGCAGCTGTGGCAGGGATAGTTTTACTCGCTAGTAAC‑GCTCAGGCACAAACCGTACCGGAAGGCTATCAGCTACAGCAAGTGCTCATGATGAGCCGCCATAACTTACGTGCGCCGCTGGCGAACAATGGCAGTGTGCTGGAGCAGAGCACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAAAGCGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCGGGGTGTGATATTCCTGTGCATCACCAGGAAAAAATGGGCACTATGGACCCAACCTTTAACCCGGTGATCACCGATGATTCCGCCGCATTCAGTGAACAGGCGGTGGCGGCAATGGAGAAAGAGCTCAGCAAACTCCAGCTTACCGACAGCTACCAGCTACTGGAAAAAATCGTTAACTAT > CP042583/920184‑920738 ||| aTCGCCGCAGCTGTGGCAGGGATAGTTTTACTCGCTTCAAAC‑GCTCAGGCACAAACCGTACCGGAAGGCTATCAGCTACAGCAAGTGCTCATGATGAGCCGCCATAACTTACGTGCGCCGCTGGCGAACAATGGCAGTGTGCTGGAGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGcc < 1:1097188/289‑1 (MQ=255) cggaGCTGTGGCGGGGATAGTTTTAGTCGCTACAAAC‑GCTCAGGAACAAACCGTACCGGAATGCTATCAGCTACAGCAAGTGCTCATGATGAGCCGCCATAACTTACGTGCGCCGCTGGCGAACAATGGCAGTGTGCTGGAGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCccgcc < 2:378092/285‑1 (MQ=255) cgcAGCTGTGGCAGGGATAGTTTTACTCGCTTCAAAC‑GCTCATGCACAAACCGTACCGGACGCCTATCAGCTACAGCAAGTGCCCATGCTGACCCGCCATAACTTACGTGCGCCGCTGGCGAACAATGGCAGTGTGCTGGAGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGGGGGCAACTCCCCACCAAAGGGTGCGTGCCCGAAGTGGACATGGGCCATTACAGGCAGTAAGGGCGGGGAGAGCAGGGGACGGTGAAACCGGGGGCATGCcagcc > 2:945208/1‑288 (MQ=255) cgcAGCTGTGGCAGGGATAGTTTTACTCGCTTCAAAC‑GCTCAGGCACAAACCGTACCGGAAGGCTATCAGCTACAGCAAGTGCTCATGATGAGCCGCCATAACTTACGTGCGCCGCTGGCGAACAATGGCAGTGTGCTGGAGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCccgccg < 1:81705/289‑1 (MQ=255) cgagccTGGGGCAGGGATAGTTTTACTCGGT‑GCAACAGCACGGGCACAAACCGTACCGGAAGGCTATCAGCTACAGCAAGTGCTCAGGATGAGCCGCCATAACTTACGTGCGCCGCTGGCGAACAATGGCAGTGTGCTGGAGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCccgccg < 2:2341477/284‑1 (MQ=255) gtgGCAGGGATAGTTTTACTCGCTTCAAAC‑GCTCAGGCACAAACCGTACCGGAAGGCTATCAGCTACAGCAAGTGCTCATGATGAGCCGCCATAACTTACGTGCGCCGCTGGCGAACAATGGCAGTGTGCTGGAGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTaca < 1:835656/289‑1 (MQ=255) ggATTGTTTTCCTCGCTTCAAAC‑GCTCAGGCCCAAACCGTACCGGAAGGCTATGAGCTACAGCAAGTGCTCATGATGAGCCGCCATAACTTACGTGCGCCGCTGGCGAACAATGGCAGTGTGCTGGAGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGttt < 2:2150660/288‑1 (MQ=255) gATAGTTTTACTCGCTTCAAAC‑GCTCAGGCACAAACCGTACCGGAAGGCTATCAGCTACAGCAAGTGCTCATGATGAGCCGCCATAACTTACGTGCGCCGCTGGCGAACAATGGCAGTGTGCTGGAGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTaca < 1:1897973/281‑1 (MQ=255) gATAGTTTTACTCGCTTCAAAC‑GCTCAGGCACAAACCGTACCGGAAGGCTATCAGCTACAGCAAGTGCTCATGATGAGCCGCCATAACTTACGTGCGCCGCTGGCGAACAATGGCAGTGTGCTGGAGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTtat > 1:893071/1‑289 (MQ=255) gATAGTTTTACTCGCTTCAAAC‑GCTCAGGCACAAACCGTACCGGAAGGCTATCAGCTACAGCAAGTGCTCATGATGAGCCGCCATAACTTACGTGCGCCGCTGGCGAACAATGGCAGTGTGCTGGAGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGGaca > 2:1897973/1‑281 (MQ=255) tatttttACCCGCTGCAACC‑GCTCAGGCACAAACCGTACCGGAAGGCTATCAGCTACAGCAAGTGCTCATGTGGAGCCGCCATAACTTACGTGCGCCGCTGGCGAACAATGGCAGTGTGCTGGAGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTtatg < 2:1386152/285‑1 (MQ=255) aGTTTTACTCGTATCAAAC‑GCACATGCCCAAACCGTACCGGAAGGCTATCAGCTACAGCAAGTGCTCATGATGAGCCGCCATAACTTACGTGCGCCGCTGGCGAACAATGGCCGTGTGCTGGAGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTtatgcc < 2:1080167/289‑1 (MQ=255) aGTTTTACTCGCTTCAAAC‑GCTCAGGCACAAACCGTACCGGAAGGCTATCAGCTACAGCAAGTGCTCATGATGAGCCGCCATAACTTACGTGCGCCGCTGGCGAACAATGGCAGTGTGCTGGAGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTtatgcc < 1:2084745/289‑1 (MQ=255) ttttACTCGCTTCAAAC‑GCTCAGGCACAAACCGTACCGGAAGGCTATCAGCTACAGCAAGTGCTCATGATGAGCCGCCATAACTTACGTGCGCCGCTGGCGAACAATGGCAGTGTGCTGGAGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCATGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTtctgccta > 1:627721/1‑289 (MQ=255) aCTCGCTTCAAAC‑GCTCAGGCACAAACCGTACCGGAAGGCTATCAGCTACAGCAAGTGCTCATGATGAGCCGCCATAACTTACGTGCGCCGCTGGCGAACAATGGCAGTGTGCTGGAGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGTGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGGTtatgcctatgc > 1:1988577/1‑288 (MQ=255) ctcgcttcaaaC‑GCTCAGGCACAAACCGTACCGGAAGGCTATCAGCTACAGCAAGTGCTCATGATGAGCCGCCATAACTTACGTGCGCCGCTGGCGAACAATGGCAGTGTGCTGGAGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCTCCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACCTGCGTGAATGGCTGGCAGGTCAGGGGATGGGGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGGTGAGGCCTATGCCa > 2:348323/10‑289 (MQ=255) ctcgcttcaaaC‑GCTCAGGCACAAACCGTACCGGAAGGCTATCAGCTACAGCAAGTGCTCATGATGAGCCGCCATAACTTACGTGCGCCGCTGGCGAACAATGGCAGTGTGCTGGAGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTaca < 1:1853043/262‑1 (MQ=255) tggcttcaaaC‑GCCCAGGAACAAACCGACCCGGAGAGCTGTCAGGTACAGCAAGTGCTAGTGGTGGGCCGCCCTAACTCACGTGCGCCGCTGGCGAACAATGGCAGTGTGCTGGAGCAGTCGACGACGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCaa < 2:1614936/281‑1 (MQ=255) cAGGCACAAACCGTACCGGAAGGCTATCAGCTACAGCAAGTGCTCATGATGAGCCGCCATAACTTACGTGCGCCGCTGGCGAACAATGGCAGTGTGCTGGAGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCaa > 2:550049/1‑275 (MQ=255) aCCGTACCGGAAGGCTATCAGCTACAGCAAGTGCTCATGATGAGCCGCCATAACTTACGTGCGCCGCTGGCGAACAATGGCAGTGTGCTGGAGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCg > 1:2308623/1‑288 (MQ=255) tACCGGAAGGCTATCAGCTACAGCAAGTGCTCATGATGAGCCGCCATAACTTACGTGCGCCGCTGGCGAACAATGGCAGTGTGCTGGAGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTtatgcc < 1:1836529/254‑1 (MQ=255) tACCGGAAGGCTATCAGCTACAGCAAGTGCTCATGATGAGCCGCCATAACTTACGTGCGCCGCTGGCGAACAATGGCAGTGTGCTGGAGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCCATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGc > 1:2109842/1‑289 (MQ=255) tACCGGAAGGCTATCAGCTACAGCAAGTGCTCATGATGAGCCGCCATAACTTACGTGCGCCGCTGGCGAACAATGGCAGTGTGCTGGAGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCg > 2:1291475/1‑288 (MQ=255) tACCGGAAGGCTATCAGCTACAGCAAGTGCTCATGATGAGCCGCCATAACTTACGTGCGCCGCTGGCGAACAATGGCAGTGTGCTGGAGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCg > 2:674144/1‑288 (MQ=255) tACCGGAAGGCTATCAGCTACAGCAAGTGCTCATGATGAGCCGCCATAACTTACGTGCGCCGCTGGCGAACAATGGCAGTGTGCTGGAGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGAAGTCCCCGGTGGGCAACGCACCACCAAAGGTGGCGTGCCCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGGGAATGTCTGGCCTACCAAGGGAGGGTGAAATCGGGGGAATGCCGGCCGCCGTGCACCGTTTATGCCGATGCCAAGAGTATCGAACGGACCGTTGCgcacg > 2:1832740/1‑284 (MQ=255) aCCGGAAGGCTATCAGCTACAGCAAGTGCTCATGATGAGCCGCCATAACTTACGTGCGCCGCTGGCGAACAATGGCAGTGTGCTGGAGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGca < 1:59246/289‑1 (MQ=255) cTATCAGCTACAGCAAGTGCTCATGATGAGCCGCCATAACTTACGTGCGCCGCTGGCGAACAATGGCAGTGTGCTGGAGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCccgccg < 1:2152560/226‑1 (MQ=255) cTATCAGCTACAGCAAGTGCTCATGATGAGCCGCCATAACTTACGTGCGCCGCTGGCGAACAATGGCAGTGTGCTGGAGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGt < 1:1011332/270‑1 (MQ=255) cTATCAGCTACAGCAAGTGCTCATGATGAGCCGCCATAACTTACGTGCGCCGCTGGCGAACAATGGCAGTGTGCTGGAGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGt > 2:1011332/1‑270 (MQ=255) tATCAGCTACAGCAAGTGCTCATGATGAGCCGCCATAACTTACGTGCGCCGCTGGCGAACAATGGCAGTGTGCTGGAGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTtta > 1:1968456/1‑289 (MQ=255) cAGCTACAGCCAGTGCTCAGGATGAGCCGACATAACTTGCGTGCGCCGCTGGCGAACAATGGCAGTGTGCTGGAGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTttatta < 2:2371417/289‑1 (MQ=255) cAGCTACAGCAAGTGCTCATGATGAGCCGCCATAACTTACGTGCGCCGCTGGCGAACAATGGCAGTGTGCTGGAGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCCACCAGTTCTttatt > 1:49873/1‑288 (MQ=255) tACAGCAAGTGCTCATGATGAGCCGCCATAACTTACGTGCGCCGCTGGCGAACAATGGCAGTGTGCTGGAGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTAc < 1:674144/286‑1 (MQ=255) cAGCAAGTGCTCATGATGAGCCGCCATAACTTACGTGCGCCGCTGGCGAACAATGGCAGTGTGCTGGAGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGgc > 1:2477750/1‑288 (MQ=255) cAAGTGCTCATGATGAGCCGCCATAACTTACGTGCGCCGCTGGCGAACAATGGCAGTGTGCTGGAGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCAt > 2:618527/1‑289 (MQ=255) aGTGCTCATGATGAGCCGCCATAACTTACGTGCGCCGCTGGCGAACAATGGCAGTGTGCTGGAGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGca < 2:1495466/265‑1 (MQ=255) aGTGCTCATGATGAGCCGCCATAACTTACGTGCGCCGCTGGCGAACAATGGCAGTGTGCTGGAGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGca > 1:1495466/1‑265 (MQ=255) tGCTCATGATGAGCCGCCATAACTTACGTGCGCCGCTGGCGAACAATGGCAGTGTGCTGGAGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGca < 1:970958/263‑1 (MQ=255) tGCTCATGATGAGCCGCCATAACTTACGTGCGCCGCTGGCGAACAATGGCAGTGTGCTGGAGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTccc > 1:2618417/1‑289 (MQ=255) tGCTCATGATGAGCCGCCATAACTTACGTGCGCCGCTGGCGAACAATGGCAGTGTGCTGGAGCAGTCGAAGCGGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGACCGCCGCCGTAACCCGTTTATGCCTGTGCCAATAGTTTGCAACGTACCGTTGAGACTGCACAGTTCTTTCTTACGGGCGCATTccc > 2:1987124/1‑289 (MQ=255) caatgatgAGCCGCCATAACTTCCGTGCGCCGCTGGCGAACAATGGCAGTGTGCTGGAGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCggg < 2:2618417/287‑1 (MQ=255) cATGATGAGCCGCCATAACTTACGTGCGCCGCTGGCGAACAATGGCAGTGTGCTGGAGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTaca < 2:272544/212‑1 (MQ=255) cATGATGAGCCGCCATAACTTACGTGCGCCGCTGGCGAACAATGGCAGTGTGCTGGAGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCCTCAACGTACCGTTTCCACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCCTTCCCgggg > 2:2508151/1‑289 (MQ=255) cATGATGAGCCGCCATAACTTACGTGCGCCGCTGGCGAACAATGGCAGTGTGCTGGAGCAGTCGACGCCAAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATCACATGCGTGAATTGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCgggg < 1:1659611/289‑1 (MQ=255) tgatgaGCCGCCATAACTTACGTGCGCCGCTGGCGAACAATGGCAGTGTGCTGGAGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGATGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCGGGgtg < 2:304078/289‑1 (MQ=255) gccATAACTTACGTGCGCCGCTGGCGAACAATGGCAGTGTGCTGGAGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCggg > 1:1404712/1‑277 (MQ=255) gccATAACTTACGTGCGCCGCTGGCGAACAATGGCAGTGTGCTGGAGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAAGCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTCCACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCCCCGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCGGGTGGTGATATTc > 2:2228078/1‑288 (MQ=255) gTGCGCCGCTGGCGAACAATGGCAGTGTGCTGGAGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTaca < 1:2420985/189‑1 (MQ=255) gcgcCGCTGGCGAACAATGGCAGTGTGCTGGAGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCccg > 2:2285766/1‑177 (MQ=255) gcgcCGCTGGCGAACAATGGCAGTGTGCTGGAGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCccg < 1:2285766/177‑1 (MQ=255) cgccgcTGGCGAACAATGGCAGTGTGCTGGAGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTtatgcc < 1:2053419/197‑1 (MQ=255) cgccgcTGGCGAACAATGGCAGTGTGCTGGAGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGGGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCGGGGTGTGa < 2:1568776/268‑1 (MQ=255) ccgcTGGCGAACAATGGCAGTGTGCTGGAGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGtt < 1:1200205/189‑1 (MQ=255) ccgcTGGCGAACAATGGCAGTGTGCTGGAGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGtt > 2:1200205/1‑189 (MQ=255) gAACAATGGCAGTGTGCTGGAGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCGGGGTGTGATATTCCTGTGCATCACCAGGAAAAAATggg < 2:1119573/288‑1 (MQ=255) acgtgCTGGAGTAGAGGAAGCCGAATAAATGCCGCGACTGTGACGTCCCCGGTGGACAACACACCACCATATGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTATATGCGTGAATGGCTGGCAGATGAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCATTAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGAACAGTTTTCTATTAGAGGCGCATTCCCGCGGTGGGATATTCCTGCGCATAGCCAGGAAAAAATGGGCACTATGGAcc < 2:1350004/286‑1 (MQ=255) tgtgCTGGAGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCGGGGTGTGATATTCCTGTGCATCACCAGGAAAAAATGGGCACTATGGACCCa > 2:976475/1‑289 (MQ=255) gtgCTGGAGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCGGGGTGTGATATTCCTGTGCATCACCAGGAAAAAATGGGCACTATGGACCCa < 1:2578859/288‑1 (MQ=255) gtgCTGGAGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTA‑TACCGGCGCATTCCCGGGGTGTGATATTCCTGTGCATCACCAGGAAAAAATGGGCACTATGGAccc < 1:1291475/286‑1 (MQ=255) gCTGGAGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCGGGGTGTGATATTCCTGTGCATCACCAGGAAAAAATGGGCACTATGGACCCAAcc < 1:1364546/289‑1 (MQ=255) gtcgaCGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTtatgcc > 2:872941/5‑163 (MQ=255) gtcgaCGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGt < 1:1807216/171‑1 (MQ=255) gtcgaCGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGt > 2:1807216/5‑175 (MQ=255) gtcgaCGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTTTGCAACGTACCGTTGCGACCGCCCAGTTCTTTATTACCGGCTCATTCCCGGGGTGTTATATTCCTGGGCACTACCAGGAAAAAATGGGCACGATGGACCCAACCCTTAAacct > 2:2421576/5‑288 (MQ=255) gtcgaCGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCCCAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCGGGGGGTGATCATCCTTTGCATCACCACGAAAAAATGGGCAACATTGACCCAACCTGTAACCCg > 2:1255194/5‑289 (MQ=255) gtcgaCGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCGGGGTGTGATATTCCTGTGCATCACCAGGAAAAAATGGGCACTATGGACCCAACCTTTAACCCg > 1:27160/5‑289 (MQ=255) gtcgaCGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGAAGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCGGGTGGTGACATTCCTTTGCATCCCCATGAAAAAATGGGCACTATGGACTCAAGCCATAAcccc > 2:1781265/5‑288 (MQ=255) cAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGcc < 1:1301499/120‑1 (MQ=255) cAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGcc > 2:1301499/1‑120 (MQ=255) cAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTaca < 1:2231715/132‑1 (MQ=255) aaTGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCGGGGTGTGATATTCCTGTGCATCACCAGGAAAAAATGGGCACTa > 1:689700/1‑246 (MQ=255) aaTGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCGGGGTGTGATATTCCTGTGCATCACCAGGAAAAAATGGGCACTa < 2:689700/246‑1 (MQ=255) cGTCCCCGGTGGGCAACTGACCGACAAAGGGGGCGGGGTCGAAGTATATATTGGCCAGTACATGCGTGAATGGCTGTGAGAGCAGGTGATGGTGAAATCGGGGGAGTGCCCGCCGCCGTAAACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCTACCGCACAGGTTTTTATTACCGGCGCATTCCCGGGGTGTGATCTTCCTGTGGATCACCAGGAAAAAATGGGCACTATGGACCCAACCGTTAACCCGGTGATCACCGATGATTCCGCCGCATTCAg < 2:1938999/288‑1 (MQ=255) ccccGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCGGGGTGTGATATTCCTGTGCATCACCAGGAAAAAATGGGCACTCTGGACCCAACCTTTAACCCGGGGATCACCGATGATTCCGCCCCATTCAGGGac > 2:218079/1‑288 (MQ=255) ccccGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCGGGGTGTGATATTCCTGTGCATCACCAGGAAAAAATGGGCACTATGGACCCAACCTTTAACCCGGTGAt < 2:510038/261‑1 (MQ=255) ggCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCGGGGTGTGATATTCCTGTGCATCACCAGGAAAAAATGGGCACTATGGACCCAACCTTTAACCCGGTGATCACCGATGATTCCGCCGCATTCAGTGAACAGGCGGt > 2:2074820/1‑289 (MQ=255) cAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGca < 2:1676696/156‑1 (MQ=255) cTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCGGGGTGTGATATTCCTGTGCATCACCAGGAAAAAATGGGCACTATGGACCCAACCTTTAACCCGGTGATCACCGATGATTCCGCCGCATTCAGTGAACAGGCGGTggcgg > 2:2055463/1‑289 (MQ=255) accaccAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTACGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCGGGGTGTGATATTCCTGTGCATCACCAGGAAAAAATGGGCACTATGGAccc < 1:1723374/227‑1 (MQ=255) cGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCGGGGTGTGATATTCCTGTGCATCACCAGGAAAAAATGGGCACTATGGACGCAACCTTTAACCCGGTGATCACCGATGATTCCGCCGCATGCAGTGAACAGGCGGCGGCGGTAATGGCGAAAGAGCTc > 2:2121805/1‑289 (MQ=255) cGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCGCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCGGGGGGTGATATTCCTGTGCATCACCAGGAAAAAATGGGCACTATCGACCCAACCTCTAACCCTGCGCACACCCATGATTCCGCCGCACTCCGTCAACATTCGGTGGCCTCAGTGGAGCACGCACCCAGCaaa > 2:1840711/1‑289 (MQ=255) tataTGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCGGGGTGTGATATTCCTGTGCATCACCAGGAAAAAATGGGCACTATGGACCCAACCTTTAACCCGGTGATCACCGATGATTCCGCCGCATTCAGTGAACAGGCGGTGGCGGCAATGGAGAAAGAGCTCAGCAAACTcc < 1:302804/286‑1 (MQ=255) tatGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCAGTCCCGGGGTGTGATATTCCTGTGCATCACCAGGAAAAAATGGGCACTATGGACCCAACCTTTAACCCGGTGATCACCGATGATTCCGCCGCATTCAGTGAACAGGCGGTGGCGGCAATGGAGAAAGAGCTCAGCaaa < 1:2505506/280‑1 (MQ=255) ccATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCgggg < 1:1793503/145‑1 (MQ=255) ccATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCGGGGTGTGa < 2:1444680/150‑1 (MQ=255) ccATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCGGGGTGTGATATTCCTGTGCATCACCAGGAAAAAATGGGCACTATGGACCCAACCTTTAACCCGGTGATCACCGATGAtt > 1:2361566/1‑221 (MQ=255) ccATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCGGGGTGTGATATTCCTGTGCATCACCAGGAAAAAATGGGCACTATGGACCCAACCTTTAACCCGGTGATCACCGATGATTCCGCCGCATTCAGTGAACAGGCGGTGGCGGCAATGGAGAAAGAGCTCAGCAAACTCCAGCTTACCGAc > 1:2005851/1‑289 (MQ=255) cATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCGGGGTGTGATATTCCTGTGCATCACCAGGAAAAAATGGGCACTATGGACCCAACCTTTAACCCGGTGATCACCGATGATTCCGCCGCATTCAGTGAACAGGCGGTGGCAGCAATGGAGAAAGAGCTCAGCAAACTCCAGCTTACCGAc < 1:376462/288‑1 (MQ=255) aTTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCGGGGTGTGATATTCCTGTGCATCACCAGGAAAAATTGGGCACTATGGACCCAACCTTTAACCCGGTGATCACCGATGATTCCGCCGCATTCAGTGAACAGGCGGTGGCGGCAATGGAGAAAGAGCTCAGCAAACTCCAGCTTACCGAca > 1:516820/1‑288 (MQ=255) aTTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCGGGGTGTGATATTCCTGTGCATCACCAGGAAAAAATggg > 1:1171829/1‑178 (MQ=255) aTTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCGGGGTGTGATATTCCTGTGCATCACCAGGAAAAAATGGGCACTATGGACCCAACCTTTAACCCGGTGATCACCGATGATTCCGCCGCATTCAGTGAACAGGCGGTGGCGGCAATGGAGAAAGAGCTCAGCAAACTCCAGCTTACCGAca > 1:348075/1‑288 (MQ=255) gCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCGGGGTGTGATATTCCTGTGCATCACCAGGAAAAAATGGGCACTATGGACCCAACCTTTAACCCGGTGATCACCGATGATTCCGCCGCATTCAGTGAACAGGCGGTGGCGGCAATGGAGAAAGAGCTCAGCAAACTCCAGCTTACCGAcagctacca > 1:1441581/1‑288 (MQ=255) gAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCGGGGTGTGATATTCCTGTGCATCACCAGGAAAAAATGGGCACTATGGACCCAACCTTTAACCCGGTGATCACCGATGATTCCGCCGCATTCAGTGAACAGGCGGTGGCGGCAATGGAGAAAGAGCTCAGCAAACTCCAGCTTACCGAcagctaccagcta < 1:92051/288‑1 (MQ=255) aaTGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCGGGgtg > 1:766129/1‑133 (MQ=255) aaTGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCGGGgtg < 2:766129/133‑1 (MQ=255) ggcAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCGGGGTGTGATATTCCTGTGCATCACCAGGAAAAAATGGGCACTATGGACCCAACCTTTAACCCGGTGATCACCGCTGATTCCGCCGCATTCAGTGAACAGGCGGTGGCGGCAATGGAGAAAGAGCTCAGCAAACACCAGCTTACCGAAAGCTACCAGCTACTGGaaaaa > 1:2169415/1‑289 (MQ=255) cAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACCCCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCGGGGTGTGATATTCCTGTGCATCACCAGGAAAAAATGGGCACTATGGACCCAACCTTTAACCCGGTGATCACCGATGATTCCGCCGCATTCAGTGAACAGGCGGTGGCGGCAATGGAGAAAGAGCTCAGCAAACTCCAGCTTACCGACAGCTACCAGCTACTGGAAAAAATCGtt < 1:1262294/288‑1 (MQ=255) cAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCGGGGTGTGATATTCCTGTGCATCACCAGGAAAAAATGGGCACTATGGACCCAACCTTTAACCCGGTGATCACCGATGATTCCGCCGCATTCAGTGAACAGGCGGTGGCGGCAATGGAGAAAGAGCTCAGCAAACTCCAGCTTACCGACAGCTACCAGCTACTGGAAAAAATCGtt < 2:2477750/288‑1 (MQ=255) cAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCGGGGTGTGATATTCCTGTGCATCACCAGGAAAAAATGGGCACTATGGACCCAACCTTTAACCCGGTGATCACCGATGATTCCGCCGCATTCAGTGAACAGGCGGTGGCGGCAATGGAGAAAGAGCTCAGCAAACTCCAGCTTACCGACAGCTACCAGCTACTGGAAAAAATCGtt < 2:2039632/288‑1 (MQ=255) gggATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCGGGGTGTGATATTCCTGTGCATCACCAGGAAAAAATGGGCACTATGGACCCAACCTTTAACCCGGTGATCACCGATGATTCCGCCGCATTCAGTGAACAGGCGGTGGCGGCAATGGAGAAAGAGCTCAGCAAACTCCAGCTTACCGACAGCTACCAGCTACTGGAAAAAATCGTTAACt > 1:1609291/1‑289 (MQ=255) ||| ATCGCCGCAGCTGTGGCAGGGATAGTTTTACTCGCTAGTAAC‑GCTCAGGCACAAACCGTACCGGAAGGCTATCAGCTACAGCAAGTGCTCATGATGAGCCGCCATAACTTACGTGCGCCGCTGGCGAACAATGGCAGTGTGCTGGAGCAGAGCACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAAAGCGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCGGGGTGTGATATTCCTGTGCATCACCAGGAAAAAATGGGCACTATGGACCCAACCTTTAACCCGGTGATCACCGATGATTCCGCCGCATTCAGTGAACAGGCGGTGGCGGCAATGGAGAAAGAGCTCAGCAAACTCCAGCTTACCGACAGCTACCAGCTACTGGAAAAAATCGTTAACTAT > CP042583/920184‑920738 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |