Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 1,455,246 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 1,455,246 | 0 | A | T | 99.7% | 802.6 / NA | 335 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (156/178); minor base C (1/0); total (157/178) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.69e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.95e-01 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,455,247 | 0 | G | C | 99.4% | 778.7 / NA | 335 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/2); new base C (156/176); total (157/178) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.01e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,455,248 | 0 | C | G | 99.7% | 799.8 / NA | 335 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base G (155/178); total (157/178) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.67e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 336 total aligned reads displayed.
CTATGGGCTGATTATTCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑T‑TAGTAGCGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCAGCACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGAGTGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCAGCTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCTTCTCCACTGGTGTGCAATGCCGGAGCCTTTGTTATCGGTTTCAGTGCAGCTGGCGGCATTTTACAGCTCGGCG‑TTAGCGTCATGAGTGAGTTTTTTCCCAAAAGCAAAGCCAAAGTCACCAGTATTTATATGATGATGGGTGGACTGGCTAACTTTGTTATT > CP042583/1454963‑1455527 ||| cTATGGGCTGATTATTCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑T‑TTCATCGGTACTGATCGGTGTAGCCGCATTCTCGACATTATATGGAATGGTGGTGAGGATGCTACAATATGCGGTGGCTTTTGCTGGTGTTTCAGAAGCGGAGGGATTAAAACACAGCTCTTATTGTAGGATCGGCacgttg > 2:1030163/1‑284 (MQ=255) attattCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑T‑TTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCt > 1:135970/1‑289 (MQ=255) tCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑T‑TTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTAtt > 2:206221/1‑289 (MQ=255) gTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑T‑TTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGT‑GTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGcc > 1:395130/1‑289 (MQ=255) aTTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑T‑TTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGTCCTTTTATGTGATCGTGGTGTGCATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATTTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCGCCTATTACAGTATGGGCCCGTGTGTCTGTGTCTTTATTTTTGcc > 2:2618224/1‑288 (MQ=255) aTTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑T‑TTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCg < 1:2629611/289‑1 (MQ=255) ttGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑T‑TTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCactact < 1:2125714/289‑1 (MQ=255) gATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑T‑TTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGaaaaaa > 2:98382/1‑289 (MQ=255) gATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑T‑TTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGaaaaaa > 2:749468/1‑289 (MQ=255) gATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑T‑TTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGaaaaaa > 2:1531391/1‑289 (MQ=255) gATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑T‑TTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGaaaaaa > 2:1086658/1‑289 (MQ=255) gATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑T‑TTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGaaaaaa > 1:1995856/1‑289 (MQ=255) gATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑T‑TTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGaaaaaa > 1:1710521/1‑289 (MQ=255) aTCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑T‑TTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCTGTCCTACTGaaaaaaa > 2:1846475/1‑289 (MQ=255) gCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑T‑TTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGaaaaaaa > 2:2485253/1‑284 (MQ=255) gCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑T‑TTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGt > 1:8016/1‑288 (MQ=255) gCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑T‑TTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGt > 1:2042113/1‑288 (MQ=255) tGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑T‑TTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGc < 1:345562/288‑1 (MQ=255) tGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑T‑TTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGc > 2:616515/1‑288 (MQ=255) tGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑T‑TTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGc > 1:2195290/1‑288 (MQ=255) tGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTTGACCCCGGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCTTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑T‑TTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCAt < 2:135970/289‑1 (MQ=255) ttGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑T‑TTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCt < 1:68266/241‑1 (MQ=255) ttGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑T‑TTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCgg > 2:2540407/1‑282 (MQ=255) aaaaGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑T‑TTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTggg < 2:1819878/289‑1 (MQ=255) ataGCAGATTCCCCGGCCCGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGACCAGAAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑T‑TTCCTCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTggg < 1:739071/286‑1 (MQ=255) aGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑T‑TTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTa < 1:2064650/289‑1 (MQ=255) tgttggACGCCAGCGTAACTACTGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑T‑TTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCa < 1:1030163/284‑1 (MQ=255) ggACTCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑T‑TTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGc < 1:509844/288‑1 (MQ=255) ggAAGCCAGCGTAACTAATGAATTACGGAAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTGTT‑TCGTCG‑GTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCACAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGc < 2:2501449/288‑1 (MQ=255) ccAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑T‑TTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCacta < 1:1819774/230‑1 (MQ=255) ccAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑T‑TTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAAt > 1:438642/1‑289 (MQ=255) cAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑T‑TTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGc < 2:367658/258‑1 (MQ=255) cTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑T‑TTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAAcagcag > 1:377184/1‑288 (MQ=255) atAATGAATTTCCGCAAATGAACGGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑T‑TTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACagcagc < 2:1301736/288‑1 (MQ=255) ccGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑T‑TTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTAc > 2:1184283/1‑288 (MQ=255) cGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑T‑TTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGGTGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCt < 1:185401/289‑1 (MQ=255) aCAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑T‑TTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATACCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCtt < 2:2461588/288‑1 (MQ=255) cAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑T‑TTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGc < 2:238427/215‑1 (MQ=255) cAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑T‑TTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGc > 1:238427/1‑215 (MQ=255) aaaCCGTTGGCTTGGGTGGAAGGTG‑TGTCATCG‑GTACTGTTCGGTGTAGCCGCAGTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCTGAAGCTGAGGGATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCTTCTCCa < 2:2181601/288‑1 (MQ=255) cccGTTGTTCTGGCTGGAAGGTG‑T‑TTCATCTGTACTGTTCGGTTTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCTTCTCCACTg < 2:40595/288‑1 (MQ=255) aCCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑T‑TTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGc > 2:861377/1‑246 (MQ=255) aCCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑T‑TTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCTTCTCCACTg < 2:2706277/289‑1 (MQ=255) tAGTCTGGCTGGAAGGTG‑T‑TTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATc < 1:49258/263‑1 (MQ=255) tAGTCTGGCTGGAAGGTG‑T‑TTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATc > 2:49258/1‑263 (MQ=255) tAGTCTGGCTGGAAGGTG‑T‑TTCATCGGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCTTCTCCACTGGtgtg < 2:1995856/289‑1 (MQ=255) gtttcatcggTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCa < 2:1391986/210‑1 (MQ=255) gtttcatcggTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCTTCTCCACTGGTGTGCAATGCCGGAGCCTTTg < 1:1086658/280‑1 (MQ=255) gTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTa < 1:1003017/198‑1 (MQ=255) gTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGc > 1:1315609/1‑215 (MQ=255) aCTGTTCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTAc < 1:1620215/238‑1 (MQ=255) ttCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAAct > 2:655088/1‑199 (MQ=255) ttCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCTTCTCCACTGGTGTGCAATGCCGGAGCCTTTGTTATCGGTTTctca > 2:531069/1‑285 (MQ=255) ttCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCTTCTCCACTGGTGTGCAATGCCGGAGCCTTTGTTATCGGTTTctca > 1:2575451/1‑285 (MQ=255) tCGGTGTAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGc > 1:1094057/1‑174 (MQ=255) tgtAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATc < 1:118018/226‑1 (MQ=255) tgtAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCTTCTCCAc > 2:2345647/1‑245 (MQ=255) tgtAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCTTCTCCACTGGTGTGCAATGCCGGAGCCTTTGTTATCGGTTTctcagca > 1:152365/1‑280 (MQ=255) tgtAGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCTTCTCCACTGGTGTGCAATGCCGGAGCCTTTGTTATCGGTTTcccagca > 2:952664/1‑280 (MQ=255) tgtAGACGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCGCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTATTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGAACAATCTGGGGTCATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCTTATCCACTGGTGTGCAATGACGGAGCCTTTGTTATTGGTTTctcagca > 1:1669510/1‑280 (MQ=255) aGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGcc > 1:1199365/1‑217 (MQ=255) aGCCGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCTTCTCCACTGGTGTGCAATGCCGGAGCCTTTGTTATCGGTTTCTCAGCAGCTgg < 2:328670/288‑1 (MQ=255) ccGCATTCTCGACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTAccc > 1:233618/1‑232 (MQ=255) gcattctcgaCCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCTTCTCCACTGGTGTGCAATGCCGGAGCCTTTGTTATCGGTTTCTCAGCAGCTGGCGGCa < 1:2485166/280‑1 (MQ=255) ttctcgaCCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCTTCTCCACTGGTGTGc < 1:1647061/237‑1 (MQ=255) ttctcgaCCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCTTCTCCACTGGTGTGc > 2:1647061/7‑243 (MQ=255) ttctcgaCCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCTTCTCCACTGGTGTGCAATGCCGGAGCCTTTGTTATCGGTTTCTCAGCAGCTGGCGGCAttt > 1:2556679/7‑289 (MQ=255) ttctcgaCCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCTTCTCCACTGGTGTGCAATGCCGGAGCCTTTGTTATCGGTTTCTCAGCAGCTGGCGGCAttt > 1:1436714/7‑289 (MQ=255) tgtgATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCTTCTCCACTGGTGTGCAATGCCGGAGCCTTTGTTATCGGTTTCTCAGCAGCTGGCGGCATTTTACAGCTCGGCG‑tt < 2:797526/289‑1 (MQ=255) ttGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCTTCTCCACTGGTGTGCAATGCCGGAGCCTTTGTTATCGGTTTCTCAGCAGCTGGCGGCATTTTACAGCTCGGCG‑tttcgg < 1:361342/288‑5 (MQ=255) tggATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTAtttt > 1:778315/1‑104 (MQ=255) tggATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGc < 1:2423561/133‑1 (MQ=255) tggATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGc > 2:2423561/1‑133 (MQ=255) cGATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCTTCTCCACTGGTGTGCAATGCCGGAGCCTTTGTTATCGGTTTCTCAGCAGCTGGCGGCATTTTACAGCTCGGCG‑TTTCGGTCATGTCAGAGTTTTTTCCCaaaa > 1:931785/1‑288 (MQ=255) gATGGCTTTTGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTACGGGCTCCTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCCGTACCGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTCGTCTAATGTATTTCACTCTACACTGGCAACAATAACAGCACCCATTATCTACCTGTACCATTCTCCACTGGTGTGCAATGCCGTAGCCTTTGTTATCGGTTTCTCAGCACCTGGCGGCATCTTACTGCTCGGCGCTTCGC‑TCATGACAGTATTTTTTCCCaaagcc > 2:122163/1‑286 (MQ=255) tttGCTGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCTTCTCCACTGGTGTGCAATGCCGGAGCCTTTGTTATCGGTTTCTCAGCAGCTGGCGGCATTTTACAGCTCGGCG‑TTTCGGTCATGTCAGAGTTTTTTCCCAAAAGCAAAGCCa < 1:531069/289‑1 (MQ=255) tGGTATGTCAGAAGCTGAGGCATTAAAACCCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCTTCTCCACTGGTGTGCAATGCCGGAGCCTTTGTTATCGGTTTCTCAGCAGCTGGCGGCATTTTACAGCTCGGCG‑TTTCGGTCATGTCAGAGTTTTTTCCCAAAAGCAAAGCCAAAGt < 1:1065985/288‑1 (MQ=255) ttgtggtcaagaGCTGGTGCATTAAATACCATCCCTTATTACGTTATGGGGTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGAACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATTTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCTTCTCCACTGGTGTGCAATGCCGGAGCCTTTGTTATCGGTTTCTCAGCAGCTGGCGGCATTTTACAGCTCGGCG‑TTTCGGTCATGTCAGAGTTTTTTCCCAAAAGCAAAGCCAAAGTCa < 2:2121527/278‑1 (MQ=255) gtatgtcagAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCTTCTCCACTGGTGTGCAATGCCGGAGCCTTTGTTATCGGTTTCTCAGCAGCTGGCGGCATTTTACAGCTCGGCG‑TTTCGGTCATGTCAGAGTTTTTTCCCa < 2:1442261/262‑1 (MQ=255) tatgtcagAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTTCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCTTCTCCACTGGTGTGCAATGCCGGAGCCTTTGTCATCGGTTTCTCAGCAGCTGGCGGCATTTTCCAGCTCTGCG‑TTTCGGTCATGCTAGATGTTTTGCCAAAAACCAAACCCAAAggccc > 2:15791/8‑284 (MQ=255) tatgtcagAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCTTCTCCACTGGTGTGCAATGCCGGAGCCTTTGTTATCGGTTTCTCAGCAGCTGGCGGCATTTTa < 2:698387/225‑1 (MQ=255) tatgtcagAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATGTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCTTCTCCACTGGTGTGCAATGCCGGAGCCTTTGTTATCGGTTTCTCAGCAGCTGGCGGCATTTTACAGCTCGGCG‑TTTCGGTCATGTCAGAGTTTTTTCCCAAAAGCAAAGCCAAAGTCAc < 1:1886895/281‑1 (MQ=255) gtgttcagAAGCTGAGGCATTAAAACCCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTTTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCTTCTCCACTGGTGTGCAATGCCGGAGCCTTTGTTATCGGTTTCTCAGCAGCTGGCGGCATTTTACAGCTCGGCG‑TTTCGGTCATGTCAGAGTTTTTTCCCAAAAGCAAAGCCAAAGTCAc < 2:1499546/281‑1 (MQ=255) tcagAAGCTGAGGCAGTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACTCTTCTCCACTGGTGTGCAATGCCGGAGCCTTTGTTATCGGTTTCTCAGCAGCTGGCGGCATTTTACAGCTAGGCG‑TCTCGGTCATGTCAGAGTTTTTTCCCACAAGGAAAGCCACAGTCCCCAgga > 2:1702036/4‑287 (MQ=255) aGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCTTCTCCACTGGTGTGCAATGCCGGAGCCTTTGTTATCGGTTTCTCAGCAGCTggcg < 2:1068880/215‑1 (MQ=255) aGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTTTCTTTATTTTTGCCGCACTACCGAAAAAAATGGTCCGGCTCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCTTCTCCACTGGTGTGCAATGCCGGAGCCTTTGTTATCGGTTTCCCAGCAGCTGGCGGGCTTTTACACCTCGGCG‑TTTCGGTCATGTCAGCGTTTTTTCCCAAAAGCAAAGCCAAAGTCCCAAGTATTTCTatgat > 2:257341/1‑289 (MQ=255) aGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCtt < 2:2311810/156‑1 (MQ=255) aGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCTTCTCCa < 2:38613/161‑1 (MQ=255) aGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCTTCTCCACTGGTGTGCAATGCCGGAGCCTTTGTTATCGGTTTCTCAGCAGCTGGCGGCATTTTACAGCTCGGCG‑TTTCGGTCATGTCAGAGTTTTTTCCCAAAAGCAAAGCCAAAGTCACCAGTATTTATatgat > 2:2035916/1‑289 (MQ=255) aGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCTTCTCCACTGGTGTGCAATGCCGGAGCCTTTGTTATCGGTTTCTCAGCAGCTGGCGGCATTTTACAGCTCGGCG‑TTTCGGTCATGTCAGAGTTTTTTCCCAAAAGCAAAGCCAAAGTCACCAGTATTTATatgat > 2:1951053/1‑289 (MQ=255) aGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCTTCTCCACTGGTGTGCAATGCCGGAGCCTTTGTTATCGGTTTCTCAGCAGCTGGCGGCATTTTACAGCTCGGCG‑TTTCGGGCATGTCAGAGTTTTTTCCCAAAAGCAAAGCCAAAGTCACCAGGATTTATatgac > 1:574611/1‑288 (MQ=255) tAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACAGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCTTCTCCACTGGTGTGCAATGCCGGAGCCTTTGTTATCGGTTTCTCAGCAGCTGGCGGCATTTTACAGCTCGGCG‑TTTCGGTCATGTCAGAGTTTTTTCCCAAAAGCAAAGCCAAAGTCAc > 2:1164254/1‑268 (MQ=255) tctcTTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCTTCTCCACTGGTGTGCAATGCCGGAGCCTTTGTTATCGGTTTCTCAGCAGCTGGCGGCATTTTACAGCTCGGCG‑TTTCGGTCATGTCAGAGATTTTTCCCAAAAGCAAAGCCAAAGTCACCAGTATTTATATGATGATGGGTTGACTg > 1:2705537/1‑287 (MQ=255) ctctTATTACAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCTTCTCCACTGGTGTGCAATGCCGGAGCCTTTGTTATCGGTTTCTCAGCAGCTGGCGGCATTTTACAGCTCGGCG‑TTTCGGTCATGTCAGAGTTTTTTCCCAAAAGCAAAGCCAAAGTCACCAGTATTTATATGATGATGGGTGGACTGGCt < 1:98382/289‑1 (MQ=255) attaCAGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCTTCTCCACTGGTGTGCAATGCCGGAGCCTTTGTTATCgg > 1:623222/1‑172 (MQ=255) aGTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCTTCTCCACTGGTGTGCAATGCCGGAGCCTTTGTTATCGGTTTCTCAGCAGCTGGCGGCATTTTACAGCTCGGCG‑TTTCGGTCATGTCAGAGTTTTTTCCCAAAAGCAAAGCCAAAGTCACCAGTATTtata < 1:1461350/259‑1 (MQ=255) gTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCTTCTCCACTGGTGTGCAATGCCGGAGCCTTTGTTATCGGTTTCTCAGCAGCTGGCGGCATTTTACAGCTCGGCG‑TTTCGGTCATGTCAGAGTTTTTTCCCAAAAGCAAAGCCAAAGTCAc < 2:30480/247‑1 (MQ=255) gTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCTTCTCCACTGGTGTGCAATGCCGGAGCCTTTGTTATCGGTTTCTCAGCAGCTGGCGGCATTTTACAGCTCGGCG‑TTTCGGTCATGTCAGAGTTTTTTCCCAAAAGCAAAGCCAAAGTCAc > 1:30480/1‑247 (MQ=255) gTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCTTCTCCACTGGTGTGCAATGCCGGAGCCTTTGTTATCGGTTTCTCAGCAGCTGGCGGCATTTTACAGCTCGGCG‑TTTCGGTCATGTCAGAGTTTTTTCCCAAAAGCAAAGCCAAAGTCACCAGTATTTATATGATGATGGGTGGa < 2:1802823/272‑1 (MQ=255) gTATGGGCTCGTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCTTCTCCACTGGTGTGCAATGCCGGAGCCTTTGTTATCGGTTTCTCAGCAGCTGGCGGCATTTTACAGCTCGGCG‑TTTCGGTCATGTCAGAGTTTTTTCCCAAAAGCAAAGCCAAAGTAACCAGTATTTATATGATGATGGGTGGACTGGCTAACTTTGTTAt > 1:2603831/1‑289 (MQ=255) ||| CTATGGGCTGATTATTCCGGGTATTCTATTTGTACTGATCACGCTGATGCTGTTGAAAAGCAAATTCCCCAGCCAGTTGGTGGACGCCAGCGTAACTAATGAATTACCGCAAATGAACAGCAAACCGTTAGTCTGGCTGGAAGGTG‑T‑TAGTAGCGTACTGTTCGGTGTAGCCGCATTCAGCACCTTTTATGTGATTGTGGTGTGGATGCCCAAATATGCGATGGCTTTTGCTGGTATGAGTGAAGCTGAGGCATTAAAAACCATCTCTTATTACAGTATGGGCAGCTTGGTCTGTGTCTTTATTTTTGCCGCACTACTGAAAAAAATGGTCCGGCCCATCTGGGCTAATGTATTTAACTCTGCACTGGCAACAATAACAGCAGCCATTATCTACCTGTACCCTTCTCCACTGGTGTGCAATGCCGGAGCCTTTGTTATCGGTTTCAGTGCAGCTGGCGGCATTTTACAGCTCGGCG‑TTAGCGTCATGAGTGAGTTTTTTCCCAAAAGCAAAGCCAAAGTCACCAGTATTTATATGATGATGGGTGGACTGGCTAACTTTGTTATT > CP042583/1454963‑1455527 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |