| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP042583 | 1,520,900 | 3 bp→TCA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP042583 | 1,520,900 | 0 | A | T | 99.7% | 781.1 / NA | 324 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (149/174); minor base G (0/1); total (149/175) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| * | CP042583 | 1,520,901 | 0 | G | C | 100.0% | 777.3 / NA | 324 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base C (149/175); total (149/175) | |||||||||||
| * | CP042583 | 1,520,902 | 0 | T | A | 99.7% | 776.3 / NA | 324 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base A (148/174); minor base G (0/1); total (149/175) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 324 total aligned reads displayed.
CTGAGGCGGTGGCATTAAGCAGCGGCGGCAGCAACGGTATTCTCGCCGCCCAGGCTTTATGGCAACTGCTATTACCGCTTATTATTTTTGCCCTGACCGCGTTAGTCGCAAAATGGGTAGGTTATGTCAGACAAGGACTCCGCTAATGCTCTGCGTGAAAAATGTTAGCCTACGTTTACCAGAAAGCCGCTTGCTGACAAACGTTAACTTTACGGTGGATAAAGGTGACATTGTCACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTAGTTGGATGATTGGTGCACTGGCCGAACAGTTTTCTTGTACAGGTGAGCTATGGCTCAATGAGCAACGGATTGACATCCTACCCACCGCACAGCGTCAGATTGGCATTCTTTTTCAGGATGCACTGTTATTTGACCAGTTCAGTGTCGGGCAAAATTTACTGCTGGCGCTACCGGCGACACTTAAAGGGAATGCCCGACGTAATGCCGTGAATGATGCACTTGAGCGTAGTGGCCTTGAGGGAGCTTTCCATCAGGATCCTGCCACTTTGTCTGGCG > CP042583/1520623‑1521176 ||| aGGCGGTGGCATTAAGCAGCGGCGGCAGCAACGGTATTCTCGCCGCCCAGGCTTTATGGCAACTGCTATTACCGCTTATTATTTTTGCCCTGACCGCGTTAGTCGCAACATGGGTAGGTTATGTCAGACAAGGACTCCGCTAATGCCCTGCGTGAAAAATGTTTCGCTACGTTTACCAGAAAGCCGCTTGCTGACAAACGTTAACTTTACGGTGGATAAAGGTGACATTGTCACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATTGTTGATTGGt > 2:2087256/1‑289 (MQ=255) aGGCGGTGGCATTAAGCAGCGGCGGCAGCAACGGTATTCTCGCCGCCCAGGCTTTATGGCAACTGCTATTACCGCTTATTATTTTTGCCCTGACCGCGTTAGTCGCAAAATGGGTAGGTTATGTCAGACAAGGACTCCGCTAATGCTCTGCGTGAAAAATGTTTCGCTACGTTTACCAGAAAGCCGCTTGCTGACAAACGTTAACTTTACGGTGGATAAAGGTGACATTGTCACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGGGGAAAATCCCTTCTGTTTTCCTGGATTAGTGGt > 2:2520084/1‑289 (MQ=255) gTGGCATTAAGCAGCGGCGGCAGCAACGGTATTCTCGCCGCCCAGGCTTTATGGCAACTGCTATTACCGCTTATTATTTTTGCCCTGACCGCGTTAGTCGCAAAATGGGTAGGTTATGTCAGACAAGGACTCCGCTAATGCTCTGCGTGAAAAATGTTTCGCTACGTTTACCAGAAAGCCGCTTGCTGACAAACGTTAACTTTACGGTGGATAAAGGTGACATTGTCACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGc > 1:1188141/1‑286 (MQ=255) gTGGCATTAAGCAGCGGCGGCAGCAACGGTATTCTCGCCGCCCAGGCTTTATGGCAACTGCTATTACCGCTTATTATTTTTGCCCTGACCGCGTTAGTCGCAAAATGGGTAGGTTATGTCAGACAAGGACTCCGCTAATGCTCTGCGTGAAAAATGTTTCGCTACGTTTACCAGAAAGCCGCTTGCTGACAAACGTTAACTTTACGGTGGATAAAGGTGACATTGTCACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGc > 2:508127/1‑286 (MQ=255) gTGGCATTAAGCAGCGGCGGCAGCAACGGTATTCTCGCCGCCCAGGCTTTATGGCAACTGCTATTACCGCTTATTATTTTTGCCCTGACCGCGTTAGTCGCAAAATGGGTAGGTTATGTCAGACAAGGACTCCGCTAATGCTCTGCGTGAAAAATGTTTCGCTACGTTTACCAGAAAGCCGCTTGCTGACAAACGTTAACTTTACGGTGGATAAAGGTGACATTGTCACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGc > 2:270101/1‑286 (MQ=255) gTGGCATTAAGCAGCGGCGGCAGCAACGGTATTCTCGCCGCCCAGGCTTTATGGCAACTGCTATTACCGCTTATTATTTTTGCCCTGACCGCGTTAGTCGCAAAATGGGTAGGTTATGTCAGACAAGGACTCCGCTAATGCTCTGCGTGAAAAATGTTTCGCTACGTTTACCAGAAAGCCGCTTGCTGACAAACGTTAACTTTACGGTGGATAAAGGTGACATTGTCACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGc > 1:2639607/1‑286 (MQ=255) gTGGCAGTAGGCAGCGGCGGCAGCAACGGTATTCTCGCCGCCCAGGCTTTATGGCAACTGCTATTACCGCTTATTATTTTTGCCCTGACCGCGTTAGTCGCAAAATGGGTAGGTTATGTCAGACAAGGACTCCGCTAATGCTCTGCGTGAAAAATGTTTCGCTACGTTTACCAGAAAGCCGCTTGCTGACAAACGTTAACTTTACGGTGGATAAAGGTGACATTGTCACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCAc < 2:2198710/288‑1 (MQ=255) tAAGCAGCGGCGGCAGCAACGGTATTCTCGCCGCCCAGGCTTTATGGCAACTGCTATTACCGCTTATTATTTTTGCCCTGACCGCGTTAGTCGCAAAATGGGTAGGTTATGTCAGACAAGGACTCCGCTAATGCTCTGCGTGAAAAATGTTTCGCTACGTTTACCAGAAAGCCGCTTGCTGACAAACGTTAACTTTACGGTGGATAAAGGTGACATTGTCACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGgatga < 2:95318/272‑1 (MQ=255) tAAGCAGCGGCGGCAGCAACGGTATTCTCGCCGCCCAGGCTTTATGGCAACTGCTATTACCGCTTATTATTTTTGCCCTGACCGCGTTAGTCGCAAAATGGGTAGGTTATGTCAGACAAGGACTCCGCTAATGCTCTGCGTGAAAAATGTTTCGCTACGTTTACCAGAAAGCCGCTTGCTGACAAACGTTAACTTTACGGTGGATAAAGGTGACATTGTCACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGgatga > 1:95318/1‑272 (MQ=255) tAAGCAGCGGCGGCAGCAACGGTATTCTCGCCGCCCAGGCTTTATGGCAACTGCTATTACCGCTTATTATTTTTGCCCTGACCGCGTTAGTCGCAAAATGGGTAGGTTATGTCAGACAAGGACTCCGCTAATGCTCTGCGTGAAAAATGTTTCGCTACGTTTACCAGAAAGCCGCTTGCTGACAAACGTTAACTTTACGGTGGATAAAGGTGACATTGTCACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGCCGa > 1:1026423/1‑288 (MQ=255) cagcGGCGGGAGCAACGGTATTCTCGCCGCCCAGGCTTTATGGCAACTGATATTACCGCTTATTATTTTTGCCCTGACCGGGTTAGTCGCAAAATGGGTAGGTTATGTCAGACAAGGACTCCGCTAATGCTCTGCGTGAAAAATGTTTCGCTACGTTTACCAGAAAGCCGCTTGCTGACAAACGTTAACTTTACGGTGGATAAAGGTGACATTGTCACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGCCGAACAg < 2:1857084/288‑1 (MQ=255) cagcGGCGGCAGCAACGGTATTCTCGCCGCCCAGGCTTTATGGCAACTGCTATTACCGCTTATTATTTTTGCCCTGACCGCGTTAGTCGCAAAATGGGTAGGTTATGTCAGACAAGGACTCCGCTAATGCTCTGCGTGAAAAATGTTTCGCTACGTTTACCAGAAAGCCGCTTGCTGACAAACGTTAACTTTACGGTGGATAAAGGTGACATTGTCACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGCCGAACAg < 2:704690/288‑1 (MQ=255) agcGGCGGCAGCAACGGTATTCTCGCCGCCCAGGCTTTATGGCAACTGCTATTACCGCTTATTATTTTTGCCCTGACCGCGTTAGTCGCAAAATGGGTAGGTTATGTCAGACAAGGACTCCGCTAATGCTCTGCGTGAAAAATGTTTCGCTACGTTTACCAGAAAGCCGCTTGCTGACAAACGTTAACTTTACGGTGGATAAAGGTGACATTGTCACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGCCGAACAg < 1:1714819/287‑1 (MQ=255) ggcggcAGCAACGGTATTCTCGCCGCCCAGGCTTTATGGCAACTGCTATTACCGCTTATTATTTTTGCCCTGACCGCGTTAGTCGCAAAATGGGTAGGTTATGTCAGACAAGGACTCCGCTAATGCTCTGCGTGAAAAATGTTTCGCTACGTTTACCAGAAAGCCGCTTGCTGACAAACGTTAACTTTACGGTGGATAAAGGTGACATTGTCACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGCCGAACAGtt < 2:2471276/286‑1 (MQ=255) ggcAGCAACGGTATTCTCGCCGCCCAGGCTTTATGGCAACTGCTATTACCGCTTATTATTTTTGCCCTGACCGCGTTAGTCGCAAAATGGGTAGGTTATGTCAGACAAGGACTCCGCTAATGCTCTGCGTGAAAAATGTTTCGCTACGTTTACCAGAAAGCCGCTTGCTGACAAACGTTAACTTTACGGTGGATAAAGGTGACATTGTCACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGCCGAACAGTTTTCTTg < 1:1956914/289‑1 (MQ=255) ggcAGCAACGGTATGCTGGCCGCCCCGGCTTTATGGCAACTGCTATTGCCGCTTATTATTTTTTCCCGTACCGCGTTAGTCGCAAAATGGGTAGGTTATGTCAGACAAGGACTCCGCTAATGCTCTGCGTGAAAAATGTTTCGCTACGTTTACCAGAAAGCCGCTTGCTGACAAACGTTAACTTTACGGTGGATAAAGGTGACATTGTCACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGCCGAACAGTTTTCTTg < 2:1508424/289‑1 (MQ=255) agcGGTAGTCTCGCCGCCCAGGCTTTATGGCAACTGCTATTACCTCTTATTATTTTTGCCCTGACCGCGTTAGTCGCAAAATGGGTAGGTTATGTCAGACAAGGACTCCGCTAATGCTCTGCGTGAAAAATGTTTCGCTACGTTTACCAGAAAGCCGCTTGCTGACAAACGTTAACTTTACGGTGGATAAAGGTGACATTGTCACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGCCGAACAGTTTTCTTGTAc < 2:1114885/284‑1 (MQ=255) aaCGGTATTCTCGCCGCCCAGGCTTTATGGCAACTGCTATTACCGCTTATTATTTTTGCCCTGACCGCGTTAGTCGCAAAATGGGTAGGTTATGTCAGACAAGGACTCCGCTAATGCTCTGCGTGAAAAATGTTTCGCTACGTTTACCAGAAAGCCGCTTGCTGACAAACGTTAACTTTACGGTGGATAAAGGTGACATTGTCACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAGATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGCCGAACAGTTTTCTTGTACAg < 1:642789/288‑1 (MQ=255) aaCGGTATTCTCGCCGCCCAGGCTTTATGGCAACTGCTATTACCGCTTATTATTTTTGCCCTGACCGCGTTAGTCGCAAAATGGGTAGGTTATGTCAGACAAGGACTCCGCTAATGCTCTGCGTGAAAAATGTTTCGCTACGTTTACCAGAAAGCCGCTTGCTGACAAACGTTAACTTTACGGTGGATAAAGGTGACATTGTCACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGCCGAACAGTTTTCTTGTACAg < 1:1659752/288‑1 (MQ=255) tttctgtccgccCAGGCTTTATGGCAACTGCTATTACCGCTTATTATTTTTGCCCTGACCGCGTTAGTCGCAAAATGGGTAGGTTATGTCAGACAAGGACTCCGCTAATGCTCTGCGTGAAAAATGTTTCGCTACGTTTACCAGAAAGCCGCTTGCTGACAAACGTTAACTTTACGGTGGATAAAGGTGACATTGTCACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGCCGAACAGTTTTCTTGTACAGGTGAGCt < 2:1375788/282‑1 (MQ=255) gccgccCAGGCTTTATGGCAACTGCTATTACCGCTTATTATTTTTGCCCTGACCGCGTTAGTCGCAAAATGGGTAGGTTATGTCAGACAAGGACTCCGCTAATGCTCTGCGTGAAAAATGTTTCGCTACGTTTACCAGAAAGCCGCTTGCTGACAAACGTTAACTTTACGGTGGATAAAGGTGACATTGTCACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGTCGAACAGTTTTCTTGTACCGTTGAGTTATGGc > 1:2714539/1‑288 (MQ=255) cgccCAGGCTTTATGGCAACTGCTATTACCGCTTATTATTTTTGCCCTGACCGCGTTAGTCGCAAAATGGGTAGGTTATGTCAGACAAGGACTCCGCTAATGCTCTGCGTGAAAAATGTTTCGCTACGTTTACCAGAAAGCCGCTTGCTGACAAACGTTAACTTTACGGTGGATAAAGGTGACATTGTCACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGCCGAACAGTTTTCTTGTACAGGTGAGCTATGGCTCa < 1:1543137/289‑1 (MQ=255) gccCAGGCTTTATGGCAACTGCTATTACCGCTTATTATTTTTGCCCTGACCGCGTTAGTCGCAAAATGGGTAGGTTATGTCAGACAAGGACTCCGCTAATGCTCTGCGTGAAAAATGTTTCGCTACGTTTACCAGAAAGCCGCTTGCTGACAAACGTTAACTTTACGGTGGATAAAGGTGACATTGTCACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGGTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGCCGAACAGTTTTCTTGTAAAGGTTAGGTATGGCTCaa > 2:2132382/1‑289 (MQ=255) aTGGCAACTGCTATTACCGCTTATTATTTTTGCCCTGACCGCGTTAGTCGCAAAATGGGTAGGTTATGTCAGACAAGGACTCCGCTAATGCTCTGCGTGAAAAATTTTTCGCTACGTTTACCAGAAAGCCGCTTGCTGACAAACGTTAACTTTACGGTGGATAAAGGTGACATTGTCACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGGTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGCCTAATAGTTTTCGTGTACGGGTGAGCTATGGTTctgccttctataca > 2:1603098/1‑276 (MQ=255) aaCTGCTATTACCGCTTATTATTTTTGCCCTGACCGCGTTAGTCGCAAAATGGGTAGGTTATGTCAGACAAGGACTCCGCTAATGCTCTGCGTGAAAAATGTTTCGCTACGTTTACCAGAAAGCCGCTTGCTGACAAACGTTAACTTTACGGTGGATAAAGGTGACATTGTCACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGCCGAACAGTTTTCTTGTACAGGTGAGCTATGGCTCAATGAGCAACGGATTGAc > 2:928539/1‑289 (MQ=255) tGCTATTACCGCTTATTATTTTTGCCCTGACCGCGTTAGTCGCAAAATGGGTAGGTTATGTCAGACAAGGACTCCGCTAATGCTCTGCGTGAAAAATGTTTCGCTACGTTTACCAGAAAGCCGCTTGCTGACAAACGTTAACTTTACGGTGGATAAAGGTGACATTGTCACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGCCGAACAGTTTTCTTGTACAGGTGAGCTATGGCTCAATGAGCAACGGATTGACATc < 2:1174797/289‑1 (MQ=255) tGCTATTACCGCTTATTATTTTTGCCCTGACCGCGTTAGTCGCAAAATGGGTAGGTTATGTCAGACAAGGACTCCGCTAATGCTCTGCGTGAAAAATGTTTCGCTACGTTTACCAGAAAGCCGCTTGCTGACAAACGTTAACTTTACGGTGGATAAAGGTGACATTGTCACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGCCGAACAGTTTTCTTGTACAGGTGAGCTATGGCTCAATGAGCAACGGATGGaaag > 2:2594376/1‑285 (MQ=255) ttattaTTTTTGCCCTTGCCGCGTTTGTCGCAAAATGGGTATGTTATGTCAGACAAGGACTCCGCTAATGCTCTGCGTGAAAAATGTTTCGCTACGTTTACCAGAAAGCCGCTTGCTGACAAACGTTAACTTTACGGTGGATAAAGGTGACATTGTCACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGCCGAACAGTTTTCTTGTACAGGTGAGCTATGGCTCAATGAGCAACGGATTGACATCCTACCCACCGca < 2:1473985/289‑1 (MQ=255) tattatTTTTGCCCTGACCGCGTTAGTCGCAAAATGGGTAGGTTATGTCAGACAAGGACTCCGCTAATGCTCTGCGTGAAAAATGTTTCGCTACGTTTACCAGAAAGCCGCTTGCTGACAAACGTTAACTTTACGGTGGATAAAGGTGACATTGTCACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGTCGAACAGTTTTCTTGTACAGGTGAGCTATGGCTCAATGAGCAACGGATTGAc < 2:540713/273‑1 (MQ=255) tattatTTTTGCCCTGACCGCGTTAGTCGCAAAATGGGTAGGTTATGTCAGACAAGGACTCCGCTAATGCTCTGCGTGAAAAATGTTTCGCTACGTTTACCAGAAAGCCGCTTGCTGACAAACGTTAACTTTACGGTGGATAAAGGTGACATTGTCACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGCCGAACAGTTTTCTTGTACAGGTGAg > 2:815944/1‑246 (MQ=255) tattatTTTTGCCCTGACCGCGTTAGTCGCAAAATGGGTAGGTTATGTCAGACAAGGACTCCGCTAATGCTCTGCGTGAAAAATGTTTCGCTACGTTTACCAGAAAGCCGCTTGCTGACAAACGTTAACTTTACGGTGGATAAAGGTGACATTGTCACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGCCGAACAGTTTTCTTGTACAGGTGAg < 1:934703/246‑1 (MQ=255) tattatTTTTGCCCTGACCGCGTTAGTCGCAAAATGGGTAGGTTATGTCAGACAAGGACTCCGCTAATGCTCTGCGTGAAAAATGTTTCGCTACGTTTACCAGAAAGCCGCTTGCTGACAAACGTTAACTTTACGGTGGATAAAGGTGACATTGTCACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGCCGAACAGTTTTCTTGTACAGGTGAg < 1:815944/246‑1 (MQ=255) tattatTTTTGCCCTGACCGCGTTAGTCGCAAAATGGGTAGGTTATGTCAGACAAGGACTCCGCTAATGCTCTGCGTGAAAAATGTTTCGCTACGTTTACCAGAAAGCCGCTTGCTGACAAACGTTAACTTTACGGTGGATAAAGGTGACATTGTCACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGCCGAACAGTTTTCTTGTACAGGTGAGCTATGGCTCAATGAGCAACGGATTGAc < 2:2722389/273‑1 (MQ=255) tattatTTTTGCCCTGACCGCGTTAGTCGCAAAATGGGTAGGTTATGTCAGACAAGGACTCCGCTAATGCTCTGCGTGAAAAATGTTTCGCTACGTTTACCAGAAAGCCGCTTGCTGACAAACGTTAACTTTACGGTGGATAAAGGTGACATTGTCACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGCCGAACAGTTTTCTTGTACAGGTGAGCTATGGCTCAATGAGCAACGGATTGACATCCTAcc < 1:1898012/281‑1 (MQ=255) tattatTTTTGCCCTGACCGCGTTAGTCGCAAAATGGGTAGGTTATGTCAGACAAGGACTCCGCTAATGCTCTGCGTGAAAAATGTTTCGCTACGTTTACCAGAAAGCCGCTTGCTGACAAACGTTAACTTTACGGTGGATAAAGGTGACATTCTCACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATACACTCTGTTCTCATGGATGATTTGTTCCCTGGCCGAACAGTCTTCTTGAACAGCTTCGCTATGGCTCAATCAGCAACGGAGTGACATCCAACCCCACGcac > 2:2182279/1‑289 (MQ=255) gTTAGTCGCAAAATGGGTAGGTTATGTCAGACAAGGACTCCGCTAATGCTCTGCGTGAAAAATGTTTCGCTACGTTTACCAGAAAGCCGCTTGCTGACAAACGTTAACTTTACGGTGGATAAAGGTGACATTGTCACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGCCGAACAGTTTTCTTGTACAGGTGAGCTATGGCTCAATGAGCAACGGATTGACATCCTACCCACCGCACAGCGTCAGATTGGCATTCttt > 2:2336064/1‑289 (MQ=255) gTTAGTCGCAAAATGGGTAGGTTATGTCAGACAAGGACTCCGCTAATGCTCTGCGTGAAAAATGTTTCGCTACGTTTACCAGAAAGCCGCTTGCTGACAAACGTTAACTTTACGGTGGATAAAGGTGACATTGTCACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGCCGAACAGTTTTCTTGTACAGGTGAGCTATGGCTCAATGAGCAACGGATTGACATCCTACCCACCGCACAGCGTCAGATTGGCATTCttt > 1:1850284/1‑289 (MQ=255) cGCAAAATGGGTAGGTTATGTCAGACAAGGACTCCGCTAATGCTCTGCGTGAAAAATGTTTCGCTACGTTTACCAGAAAGCCGCTTGCTGACAAACGTTAACTTTACGGTGGATAAAGGTGACATTGTCACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGCCGAACAGTTTTCTTGTACAGGTGAGCTATGGCTCAATGAGCAACGGATTGACATCCTACCCACCGCACAGCGTCAGATTGGCATTCTTTTTCAgg < 1:1266492/289‑1 (MQ=255) aaaaTGGGTAGGTTATGTCAGACAAGGACTCCGCTAATGCTCTGCGTGAAAAATGTTTCGCTACGTTTACCAGAAAGCCGCTTGCTGACAAACGTTAACTTTACGGTGGATAAAGGTGACATTGTCACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGCCGAACAGTTTTCTTGTACAGGTGAGCTATGGCTCAATGAGCAACGGATTGACATCCTACCCACCGCACAGCGTCAGATTGGCATTCTTTTTCAGGATg < 2:839588/289‑1 (MQ=255) aTGTCAGACAAGGACTCCGCTAATGCTCTGCGTGAAAAATGTTTCGCTACGTTTACCAGAAAGCCGCTTGCTGACAAACGTTAACTTTACGGTGGATAAAGGTGACATTGTCACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGCCGAACAGTTTTCTTGTACAGGTGAGCTATGGCTCAATGAGCAACGGATTGACATCCTACCCACCGCACAGCGTCAGATTGGCATTCTTTTTCAGGATGCACTGTTATTTGa > 1:2504522/1‑288 (MQ=255) aTGTCAGACAAGGACTCCGCTAATGCTCTGCGTGAAAAATGTTTCGCTACGTTTACCAGAAAGCCGCTTGCTGACAAACGTTAACTTTACGGTGGATAAAGGTGACATTGTCACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGCCGAACAGTTTTCTTGTACAGGTGAGCTATGGCTCAATGAGCAACGGATTGACATCCTACCCACCGCACAGCGTCAGATTGGCATTCTTTTTCAGGATGCACTGTTATTTGAc < 2:2639607/289‑1 (MQ=255) aTGTCAGACAAGGACTCCGCTAATGCTCTGCGTGAAAAATGTTTCGCTACGTTTACCAGAAAGCCGCTTGCTGACAAACGTTAACTTTACGGTGGATAAAGGTGACATTGTCACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGCCGAACAGTTTTCTTGTACAGGTGAGCTATGGCTCAATGAGCAACGGATTGACATCCTACCCACCGCACAGCGTCAGATTGGCATTCTTTTTCAGGATGCACTGTTATTTGAc < 2:2486518/289‑1 (MQ=255) aTGTCAGACAAGGACTCCGCTAATGCTCTGCGTGAAAAATGTTTCGCTACGTTTACCAGAAAGCCGCTTGCTGACAAACGTTAACTTTACGGTGGATAAAGGTGACATTGTCACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGCCGAACAGTTTTCTTGTACAGGTGAGCTATGGCTCAATGAGCAACGGATTGACATCCTACCCACCGCACAGCGTCAGATTGGCATTCTTTTTCAGGATGCACTGTTATTTGAc < 1:729814/289‑1 (MQ=255) aTGTCAGACAAGGACTCCGCTAATGCTCTGCGTGAAAAATGTTTCGCTACGTTTACCAGAAAGCCGCTTGCTGACAAACGTTAACTTTACGGTGGATAAAGGTGACATTGTCACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGCCGAACAGTTTTCTTGTACAGGTGAGCTATGGCTCAATGAGCAACGGATTGACATCCTACCCACCGCACAGCGTCAGATTGGCATTCTTTTTCAGGATGCACTGTTATTTGAc < 1:2594376/289‑1 (MQ=255) aTGTCAGACAAGGACTCCGCTAATGCTCTGCGTGAAAAATGTTTCGCTACGTTTACCAGAAAGCCGCTTGCTGACAAACGTTAACTTTACGGTGGATAAAGGTGACATTGTCACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGCCGAACAGTTTTCTTGTACAGGTGAGCTATGGCTCAATGAGCAACGGATTGACATCCTACCCACCGCACAGCGTCAGATTGGCATTCTTTTTCAGGATGCACTGTTATTTGAc < 1:21199/289‑1 (MQ=255) gTCAGACAAGGACTCCGCTAATGCTCTGCGTGAAAAATGTTTCGCTACGTTTACCAGAAAGCCGCTTGCTGACAAACGTTAACTTTACGGTGGATAAAGGTGACATTGTCACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGCCGAACAGTTTTCTTGTACAGGTGAGCTATGGCTCAATGAGCAACGGATTGACATCCTACCCACCGCACAGCGTCAGATTGGCATTCTTTTTCAGGATGCACTGTTATTTGACCa > 2:396489/1‑289 (MQ=255) aCAAGGACTCCGCTAATGCTCTGCGTGAAAAATGTTTCGCTACGTTTACCAGAAAGCCGCTTGCTGACAAACGTTAACTTTACGGTGGATAAAGGTGACATTGTCACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGCCGAACAGTTTTCTTGTACAGGTGAGCTATGGCTCAATGAGCAACGGATTGACATc < 2:2547503/225‑1 (MQ=255) aCAAGGACTCCGCTAATGCTCTGCGTGAAAAATGTTTCGCTACGTTTACCAGAAAGCCGCTTGCTGACAAACGTTAACTTTACGGTGGATAAAGGTGACATTGTCACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGCCGAACAGTTTTCTTGTACAGGTGAGCTATGGCTCAATGAGCAACGGATTGACATCCt > 2:1900860/1‑227 (MQ=255) aCAAGGACTCCGCTAATGCTCTGCGTGAAAAATGTTTCGCTACGTTTACCAGAAAGCCGCTTGCTGACAAACGTTAACTTTACGGTGGATAAAGGTGACATTGTCACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGCCGAACAGTTTTCTTGTACAGGTGAGCTATGGCTCAATGAGCAACGGATTGACATCCTACCCACCGCACAGCGTCAGATTGGCATTCTTTTTCAGGATGCACt < 2:1655162/272‑1 (MQ=255) cAAGGACTCCGCTAATGCTCTGCGTGAAAAATGTTTCGCTACGTTTACCAGAAAGCCGCTTGCTGACAAACGTTAACTTTACGGTGGATAAAGGTGACATTGTCACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGCCGAACAGTTTTCTTGTACAGGTGAGCTATGGCTCAATGAGCAACGGATTGACATCCTACCCACCGCACAGCGTCAGATTGGCATTCTTTTTCAGGATGCACTGTTAt < 1:407610/276‑1 (MQ=255) gACTCCGCTAATGCTCTGCGTGAAAAATGTTTCGCTACGTTTACCAGAAAGCCGCTTGCTGACAAACGTTAACTTTACGGTGGATAAAGGTGACATTGTCACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGCCGAACAGTTTTCTTGTACAGGTGAGCTATGGCTCAATGAGCAACGGATTGACATCCTACCCACCGCACAGCGTCAGATTGGCATTCTTTTTCAGGATGCACTGTTATTTGACCAGTTCAGTGTc > 1:1751691/1‑289 (MQ=255) aCTCCGCTAATGCTCTGCGTGAAAAATGTTTCGCTACGTTTACCAGAAAGCCGCTTGCTGACAAACGTTAACTTTACGGTGGATAAAGGTGACATTGTCACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGCCGAACAGTTTTCTTGTACAGGTGAGCTATGGCTCAATGAGCAACGGATTGACATCCTACCCACCGCACAGCGTCAGATTGGCATTCTTTTTCAGGATGCACTGTTATTTGACCAGTTCAGTGTc < 1:1500543/288‑1 (MQ=255) tCCGCTAATGCTCTGCGTGAAAAATGTTTCGCTACGTTTACCAGAAAGCCGCTTGCTGACAAACGTTAACTTTACGGTGGATAAAGGTGACATTGTCACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGCCGAACAGTTTTCTTGTACAGGTGAGCTATGGCTCAATGAGCAACGGATTGACATc > 1:2682250/1‑217 (MQ=255) cGCTAATGCTCTGCGTGAAAAATGTTTCGCTACGTTTACCAGAAAGCCGCTTGCTGACAAACGTTAACTTTACGGTGGATAAAGGTGACATTGTCACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGCCGAACAGTTTTCTTGTACAGGTGAGCTATGGCTCAATGAGCAACGGATTGACATCCTACCCACCGCACAGCGTCAGATTGGCATTCTTTTTCAGGATGCACTGTTATTTGAc < 1:1679845/272‑1 (MQ=255) cGCTAATGCTCTGCGTGAAAAATGTTTCGCTACGTTTACCAGAAAGCCGCTTGCTGACAAACGTTAACTTTACGGTGGATAAAGGTGACATTGTCACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGCCGAACAGTTTTCTTGTACAGGTGAGCTATGGCTCAATGAGCAACGGATTGACATCCTACCCACCGCACAGCGTCAGATTGGCATTCTTTTTCAGGATGCACTGTTATTTGAc > 2:1679845/1‑272 (MQ=255) cGCTAATGCTCTGCGTGAAAAATGTTTCGCTACGTTTACCAGAAAGCCGCTTGCTGACAAACGTTAACTTTACGGTGGATAAAGGTGACATTGTCACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGCCGAACAGTTTTCTTGTACAGGTGAGCTATGGCTCAATGAGCAACGGATTGACATCCTACCCACCGCACAGCGTCAGATTGGCATTCTTTTTCAGGATGCACTGTTATTTGACCAGTTCAGTGTCGGGCa < 2:1850162/289‑1 (MQ=255) cGCTAATGCTCTGCGTGAAAAATGTTTCGCTACGTTTACCAGAAAGCCGCTTGCTGACAAACGTTAACTTTACGGTGGATAAAGGTGACATTGTCACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGCCGAACAGTTTTCTTGTACAGGTGAGCTATGGCTCAATGAGCAACGGATTGACATCCTACCCACCGCACAGCGTCAGATTGGCAGTCTTTTTTAGGATGCACTGTTATTTGACCAGTTCAGTTTCGGGCa > 2:1131643/1‑289 (MQ=255) aTGCTCTGCGTGAAAAATGTTTCGCTACGTTTACCAGAAAGCCGCTTGCTGACAAACGTTAACTTTACGGTGGATAAAGGTGACATTGTCACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGCCGAACAGTTTTCTTGTACAGGTGAGCTATGGCTCa > 2:102054/1‑190 (MQ=255) ctGCGTGAAAAATGTTTCGCTACGTTTACCAGAAAGCCGCTTGCTGACAAACGTTAACTTTACGGTGGATAAAGGTGACATTGTCACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGCCGAACAGTTTTCTTGTACAGGTGAGCTATGGCTCAATGAGCAACGGATTGACATCCTACCCACCGc > 2:1318365/1‑216 (MQ=255) ctGCGTGAAAAATGTTTCGCTACGTTTACCAGAAAGCCGCTTGCTGACAAACGTTAACTTTACGGTGGATAAAGGTGACATTGTCACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGCCGAACAGTTTTCTTGTACAGGTGAGCTATGGCTCAATGAGCAACGGATTGACATCCTACCCACCGc < 1:1318365/216‑1 (MQ=255) ctGCGTGAAAAATGTTTCGCTACGTTTACCAGAAAGCCGCTTGCTGACAAACGTTAACTTTACGGTGGATAAAGGTGACATTGTCACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGCCGAACAGTTTTCTTGTACAGGTGAGCTATGGCTCAATGAGCAACGGATTGACATCCTACCCACCGCACAGCGTCAGATTGGCATTCTTTTTCAGGATGCACt > 2:2013497/1‑252 (MQ=255) tGCGTGAAAAATGTTTCGCTACGTTTACCAGAAAGCCGCTTGCTGACAAACGTTAACTTTACGGTGGATAAAGGTGACATTGTCACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGCCGAACAGTTTTCTTGTACAGGTGAGCTATGGCTCAATGAGCAACGGATTGACATCCTACCCACCGCACAGCGTCAGATTGGCATTCTTTTTCAGGATGCACTGTTATTTGACCAGTTCAGTGTCGGGCAAAATTTAct > 1:2575056/1‑287 (MQ=255) gCGTGAAAAATGTTTCGCTACGTTTACCAGAAAGCCGCTTGCTGACAAACGTTAACTTTACGGTGGATAAAGGTGACATTGTCACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGCTGATTGGTGCACTGGCCGAACAGTCTTCTTGTACAGGTGAGCTATGGCTCAATGAGCAACGGATTGACATCCTACCCACCGCACAGCGTCAGATTGGCATTCTTTTTCAGGATGCACCGTTATTTGGCCAGTTCAGTGTCGGGCAAAATTTCct > 1:1531465/1‑286 (MQ=255) cGTGAAAAATGTTTCGCTACGTTTACCAGAAAGCCGCTTGCTGACAAACGTTAACTTTACGGTGGATAAAGGTGACATTGTCACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGCCGAACAGTTTTCTTGTACAGGTGAGCTATGGCTCAATGAGCAACGGATTGACATCCTACCCACCGCACAGCGTCAGATTGGCATTCTTTTTCAGGATGCACt < 2:2739659/249‑1 (MQ=255) cGTGAAAAATGTTTCGCTACGTTTACCAGAAAGCCGCTTGCTGACAAACGTTAACTTTACGGTGGATAAAGGTGACATTGTCACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGCCGAACAGTTTTCTTGTACAGGTGAGCTATGGCTCAATGAGCAACGGATTGACATCCTACCCACCGCACAGCGTCAGATTGGCATTCTTTTTCAGGATGCACTGTTATTTGAc < 1:27350/259‑1 (MQ=255) tcgcTACGTTTACCAGAAAGCCGCTTGCTGACAAACGTTAACTTTACGGTGGATAAAGGTGACATTGTCACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGCCGAACAGTTTTCTTGTACAGGTGAGCTATGGCTCAATGAGCAACGGATTGACATCCTACCCACCGCACAGCGTCAGATTGGCATTCTTTTTCAGGATGCACTGTTATTTGACCAGTTCAGTGTCGGGCAAAATTTACTGCTGGCGCTACCGGCGa < 1:1990210/286‑1 (MQ=255) tcgcTACGTTTACCAGAAAGCCGCTTGCTGACAAACGTTAACTTTACGGTGGATAAAGGTGACATTGTCACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGCCGAACAGTTTTCTTGTACAGGTGAGCTATGGCTCAATGAGCAACGGATTGACATCCTACCCACCGCACAGCGTCAGATTGGCATTCTTTTTCAGGATGCACTGTTATTTGACCAGTTCAGTGTCGGGCAAAATTTACTGCTGGCGCTACCGGCGa < 1:586772/286‑1 (MQ=255) aCCAGAAAGCCGCTTGCTGACAAACGTTAACTTTACGGTGGATAAAGGTGACATTGTCACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGAACTGGCCGAACAGTTTTCTTGTACAGGt > 2:1774559/1‑145 (MQ=255) aaGCCGCTTGCTGACAAACGTTAACTTTACGGTTGATAAAGGTGACATTGTCACGTGAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGCCGAACAGTTTTCTTGTACAGGTGAGCTATGGCTCAATGAGCAACGGATTGACATCCTACCCACCGCACAGCGTCAGATTGGCATTCTTTTTCAGGATGCACTGTTATTTGACCAGTTCAGTGTCGGGCAAAATTTACTGCTGGCGCTACCGGCGACACTTAAAGGGAATGcc < 1:84021/289‑1 (MQ=255) aGCCGCTTGCTGACAAACGTTAACTTTACGGTGGATAAAGGTGACATTGTCACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGCCGAACAGTTTTCTTGTACAGGTGAGCTATGGCTCAATGAGCAACGGAt > 1:1347228/1‑164 (MQ=255) aGCCGCTTGCTGACAAACGTTAACTTTACGGTGGATAAAGGTGACATTGTCACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGCCGAACAGTTTTCTTGTACAGGTGAGCTATGGCTCAATGAGCAACGGATTGACATCCTACCCACCGCACAGCGTCAGATTGGCATTCTTTTTCAGGATGCACTGTTATTTGACCAGTTCAGTGTCGGGCAAAATTTACTGCTGGCGCTACCGGCGACACTTAAAGGGAATGccc > 1:532197/1‑289 (MQ=255) aGCCGCTTGCTGACAAACGTTAACTTTACGGTGGATAAAGGTGACATTGTCACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGCCGAACAGTTTTCTTGTACAGGTGAGCTATGGCTCAATGAGCAACGGATTGACATCCTACCCACCGCACAGCGTCAGATTGGCATTCTTTTTCAGGATGCACTGTTATTTGACCAGTTCAGTGTCGGGCAAAATTTACTGCTGGCGCTACCGGCGACACTTAAAGGGAATGcc > 2:1939163/1‑288 (MQ=255) cGCTTGCTGACAAACGTTAACTTTACGGTGGATAAAGGTGACATTGTCACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGCCGAACAGTTTTCTTGTACAGGTGAGCTATGGCTCAATGAGCAACGGATTGACATCCTACCCACCGCACAGCGTCAGATTGGCATTCTTTTTCAGGATGCACTGTTATTTGACCAGTTCAGTGTCGGGCAAAATTTACTGCTGGCGCTACCGGc < 1:1351985/266‑1 (MQ=255) tGACAAACGTTAACTTTACGGTGGATAAAGGTGACATTGTCACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGCCGAACAGTTTTCTTGTACAGGTGAGCTATGGCTCAATGAGCAACGGATTGACATCCTACCCACCGCACAGCGTCAGATTGGCATTCTTTTTCAGGATGCACTGTTATTTGACCAGTTCAGTGTCGGGCAAAATTTACTGCTGGCGCTACCGGCGACACTTAAAGGGAATGCCCGACGTAATg < 1:1816928/288‑1 (MQ=255) cAAACGTTAACTTTACGGTGGATAAAGGTGACATTGTCACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGCCGAACAGTTTTCTTGTACAGGTGAGCTATGGCTCAATGAGCAACGGATTGACATCCTACCCACCGCACAGCGTCAGATTGGCATTCTTTTTCAGGATGCACTGTTATTTGAc > 1:545481/1‑215 (MQ=255) aCGTTAACTTTACGGTGGATAAAGGTGACATTGTCACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGCCGAACAGTTTTCTTGTACAGGTGAGCTATGGCTCAATGAGCAACGGATTGACATCCTACCCACCGCACAGCGTCAGATTGGCATTCTTTTTCAGGATGCACTGTTATTTGACCAGTTCAGTGTCGGGCAAAATTTACTGCTGGCGCTACCGGCGACACTTAAAGGGAATGCCCGACGTAATGCCGTGaa < 2:1245828/289‑1 (MQ=255) tACGGTGGATAAAGGTGACATTGTCACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGCCGAACAGTTTTCTTGTACAGGTGAGCTATGGCTCAATGAGCAACGGATTGACATCCTACCCACCGCACAGCGTCAGATTGGCATTCTTTTTCAGGATGCACTGTTATTTGa > 1:342872/1‑201 (MQ=255) tACGGTGGATAAAGGTGACATTGTCACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGCCGAACAGTTTTCTTGTACAGGTGAGCTATGGCTCAATGAGCAACGGATTGACATCCTACCCACCGCACAGCGTCAGATTGGCATTCTTTTTCAGGATGCACTGTTATTTGACCAGTTCAGTGTCGGGCAAAATTTACTGCTGGCGCTACCGGCGACACTTAAAGGGAATGCCCGACGTAATGCCGTGAATGATGCACtg > 2:935749/1‑288 (MQ=255) cGGTGGATAAAGGTGACATTGTCACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGCCGAACAGTTTTCTTGTACAGGTGAGCTATGGCTCAATGAGCAACGGATTGACATCCTACCCACCGCACAGCGTCAGATTGGCATTCTTTTTCAGGATGCACTGTTATTTGAc < 1:2380114/200‑1 (MQ=255) gATAAAGGTGACATTGTCACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGCCGAACAGTTTTCTTGTACAGGTGAGCTATGGCTCAATGAGCAACGGATTGAc > 1:1012589/1‑135 (MQ=255) gATAAAGGTGACATTGTCACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGCCGAACAGTTTTCTTGTACAGGTGAGCTATGGCTCAATGAGCAACGGATTGACATCCTACCCACCGCACAGCGTCAGATTGGCATTCTTTTTc > 2:1720986/1‑175 (MQ=255) gATAAAGGTGACATTGTCACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGCCGAACAGTTTTCTTGTACAGGTGAGCTATGGCTCAATGAGCAACGGATTGACATCCTACCCACCGCACAGCGTCAGATTGGCATTCTTTTTCAGGATGCACTGTTATTTGACCAGTTCAGTGTCGGGCAAAATTTACTGCTGGCGCTACCGGCGACACTTAAAGGGAATGCCCGACGTAATGCCGTGAATGATGCACTTGAGCGt > 1:2555961/1‑288 (MQ=255) aTAAAGGTGACATTGTCACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGCCGAACAGTTTTCTTGTACAGGTGAGCTATGGCTCAATGAGCAACGGATTGACATCCTACCCACCGCACAGCGTCAGATTGGCATTCTTTTTCAGGATGCACTGTTATTTGAc > 1:2193143/1‑194 (MQ=255) aTAAAGGTGACATTGTCACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGCCGAACAGTTTTCTTGTACAGGTGAGCTATGGCTCAATGAGCAACGGATTGACATCCTACCCACCGCACAGCGTCAGATTGGCATTCTTTTTCAGGATGCACTGTTATTTGACCAGTTCAGTGTCGGGc > 1:2447858/1‑210 (MQ=255) aTAAAGGTGACATTGTCACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGCCGAACAGTTTTCTTGTACAGGTGAGCTATGGCTCAATGAGCAACGGATTGACATCCTACCCACCGCACAGCGTCAGATTGGCATTCTTTTTCAGGATGCACTGTTATTTGACCAGTTCAGTGTCGGGCAAAATTTACTGCTGGCGCTACCGGCGACACTTAAAGGGAATGCCCGACGTAATGCCGTGAATGATGCACTTGAGCGtt > 2:780247/1‑287 (MQ=255) tGACATTGTCACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGCCGAACAGTTTTCTTGTACAGGTGAGCTATGGCTCAATGAGCAACGGATTGACATCCTACCCACCGCACAGCGTCAGATTGGCATTCTTTTTCAGGATGCACTGTTATTTGACCAGTTCAGTGTCGGGCa > 2:63422/1‑204 (MQ=255) aCATTGTCACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGCCGAACAGTTTTCTTGTACAGGTGAGCTATGGCTCAATGAGCAACGGATTGACATCCTACCCACCGCACAGCGTCAGATTGGCATTCTTTTTCAGGATGCACTGTTATTTGAc < 2:1963949/185‑1 (MQ=255) aCATTGTCACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGCCGAACAGTTTTCTTGTACAGGTGAGCTATGGCTCAATGAGCAACGGATTGACATCCTACCCACCGCACAGCGTCAGATTGGCATTCTTTTTCAGGATGCACTGTTATTTGACCAGTTCAGTGTCGGGCAAAATTTACTGCTGGCGCTACCGGCGACACTTAAAGGGAATGCACGACGTAATGCTGTGAATGATGCACTTGAGCGTCCAGGCCTTgc > 2:974588/1‑288 (MQ=255) aTTGTCACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGCCGAACAGTTTTCTTGTACAGGTGAGCTATGGCTCAATGAGCAACGGATTGACATCCTACCCACCGCACAGCGTCAGATTGGCATTCTTTTTCAGGATGCACTGTTATTTGAc < 2:470841/183‑1 (MQ=255) aTTGTCACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGCCGAACAGTTTTCTTGTACAGGTGAGCTATGGCTCAATGAGCAACGGATTGACATCCTACCCACCGCACAGCGTCAGATTGGCATTCTTTTTCAGGATGCACTGTTATTTGAc > 1:470841/1‑183 (MQ=255) gTCACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGCCGAACAGTTTTCTTGTACAGGTGAGCTATGGCTCAATGAGCAACGGATTGACATCCTACCCACCGCACAGCGTCAGATTGGCATTCTTTTTCAGGATGCACTGTTATTTGACCAGTTCAGTGTCGGGCAAAATTTACTGCTGGCGCTACCGGCGACACTTAAAGGGAATGCCCGACGTAATGCCGTGaa < 2:1422100/257‑1 (MQ=255) gTCACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGCCGAACAGTTTTCTTGTACAGGTGAGCTATGGCTCAATGAGCAACGGATTGACATCCTACCCACCGCACAGCGTCAGATTGGCATTCTTTTTCAGGATGCACTGTTATTTGACCAGTTCAGTGTCGGGCAAAATTTACTGCTGGCGCTACCGGCGACACTTAAAGGGAATGCCCGACGTAATGCCGTGaa > 1:1422100/1‑257 (MQ=255) gTCACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGCCGAACAGTTTTCTTGTACAGGTGAGCTATGGCTCAATGAGCAACGGATTGACATCCTACCCACCGCACAGCGTCAGATTGGCATTCTTTTTCAGGATGCACTGTTATTTGACCAGTTCAGTGTCGGGCAAAATTTACTGCTGGCGCTACCGGCGACACTTAAAGGGAATGCCCGACGTAATGCCGTGAATGATGCACTTGAGCGTTCAGGCCTTGAGGGa > 1:1512918/1‑288 (MQ=255) ttAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGCCGAACAGTTTTCTTGTACAGGTGAGCTATGGCTCAATGAGCAACGGATTGACATCCTACCCACCGCACAGCGTCAGATTGGCATTCTTTTTCAGGATGCACTGTTATTTGACCAGTTCAGTGTCGGGCAAAATTTACTGCTGGCGCTACCGGCGACACTTAAAGGGAATGCCCGACGTAATGCCGTGAATGATGCACTTGAGCGTTCAGGCCTTGAGGGAGCTTTcc > 2:2304172/1‑289 (MQ=255) tGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGCCGAACAGTTTTCTTGTACAGGTGAGCTATGGCTCAATGAGCAACGGATTGACATCCTACCCACCGCACAGCGTCAGATTGGCATTCTTTTTCAGGATGCACTGt > 2:1533508/1‑162 (MQ=255) tGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGCCGAACAGTTTTCTTGTACAGGTGAGCTATGGCTCAATGAGCAACGGATTGACATCCTACCCACCGCACAGCGTCAGATTGGCATTCTTTTTCAGGATGCACTGTTATTTGACCAGTTCAGTGTCGGGCAAAATTTACTGCTGGCGCTACCGGCGACACTTAAAGGGAATGCCCGACGTAATGCCGTGAATGATGCATTTGAGCGTTCAGGCCTTGAGGGGGCTTTTCTTCa > 2:2386486/1‑289 (MQ=255) tGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGCCGAACAGTTTTCTTGTACAGGTGAGCTATGGCTCAATGAGCAACGGATTGACATCCTACCCACCGCACAGCGTCAGATTGGCATTCTTTTTCAGGATGCACTGTTATTTGACCAGTTCAGTGTCGGGCAAAATTTACTGCTGGCGCTACCGGCGACACTTAAAGGGAATGCCCGACGTAATGCCGTGAATGATGCACTTGAGCGTTCAGGCCTTGAGGGAGCTTTCCATCa > 2:1003986/1‑289 (MQ=255) gCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGCCGAACAGTTTTCTTGTACAGGTGAGCTATGGCTCAATGAGCAACGGATTGACATCCt > 1:1043032/1‑111 (MQ=255) ccGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGCCGAACAGTTTTCTTGTACAGGTGAGCTATGGCTCAATGAGCAACGGATTGACATCCTACCCACCGCACAGCGTCAGATTGGCATTCTTTTTCAGGATGCACTGTTATTTGACCAGTTCAGTGTCGGGCAAAATTTACTGCTGGCGCTACCGGCGACACTTAAAGGGAATGCCCGACGTAATGCCGTGAATGATGCACTTGAGCGTTCAGGCCTTGAGGGAGCTTTCCATCAGGAt > 1:2046468/1‑288 (MQ=255) cGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTTCATGGATGATTGGTGCACTGGCCGAACAGTTTTCTTGTACAGGTGAGCTATGGCTCAATGAGCAACGGATTGACATCCTACCCACCGCACAGCGTCAGATTGGCATTCTTTTTCAGGATGCACt < 2:1040619/154‑1 (MQ=255) ||| CTGAGGCGGTGGCATTAAGCAGCGGCGGCAGCAACGGTATTCTCGCCGCCCAGGCTTTATGGCAACTGCTATTACCGCTTATTATTTTTGCCCTGACCGCGTTAGTCGCAAAATGGGTAGGTTATGTCAGACAAGGACTCCGCTAATGCTCTGCGTGAAAAATGTTAGCCTACGTTTACCAGAAAGCCGCTTGCTGACAAACGTTAACTTTACGGTGGATAAAGGTGACATTGTCACGTTAATGGGGCCGTCTGGCTGTGGAAAATCCACTCTGTTTAGTTGGATGATTGGTGCACTGGCCGAACAGTTTTCTTGTACAGGTGAGCTATGGCTCAATGAGCAACGGATTGACATCCTACCCACCGCACAGCGTCAGATTGGCATTCTTTTTCAGGATGCACTGTTATTTGACCAGTTCAGTGTCGGGCAAAATTTACTGCTGGCGCTACCGGCGACACTTAAAGGGAATGCCCGACGTAATGCCGTGAATGATGCACTTGAGCGTAGTGGCCTTGAGGGAGCTTTCCATCAGGATCCTGCCACTTTGTCTGGCG > CP042583/1520623‑1521176 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |