Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 1,532,231 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 1,532,231 | 0 | A | T | 99.0% | 729.3 / NA | 310 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); major base T (157/148); minor base G (2/1); total (160/150) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,532,232 | 0 | G | C | 99.4% | 724.9 / NA | 310 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/2); new base C (160/148); total (160/150) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.33e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,532,233 | 0 | C | G | 99.7% | 730.0 / NA | 310 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base G (159/149); total (160/150) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
Only 100 of 310 total aligned reads displayed.
GCACAAATCCGCGACGCTCGCCTTGACCCGAAAGTGAAAGCGATTGTCCTGCGTGTTAATAGCCCAGGCGGCAGCGTTACCGCGTCTGAAGTGATTCGCGCTGAACTGGCAGCAGCCCGGGCAGCGGGTAAGCCTGTGGTTGTAAGCATGGGCGGCATGGCGGCATCTGGTGGTTACTGGATTTCCACGCCAGCTAATTACATTGTGGCTAACCCCAGCACCCTGACCGGTTCTATCGGTATCTTCGGCGTGATCACCACCGTAGAAAATAGTCTGG‑ATAGCATTGGTGTTCATACTGATGGTGTCAGTACTAGTCCGCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAGCATTGAGAATGGCTATAAACGCTTTATCACGCTGGTTGCTGATGCGCGTCATAGCACGCCGGAGCAGATTGATAAAATTGCCCAGGGCCACGTCTGGACCGGTCAGGATGCAAAAGCTAACGGGCTGGTCGATAGTCTCGGGGATTTCGATGATGCGGTCGCCAAAGCAGCAGAGCTGGCA > CP042583/1531952‑1532512 ||| acaAATCCGCGACGCTCGCCTTGACCCGAAAGTGAAAGCGATTGTCCTGCGTGTTAATAGCCCAGGCGGCAGCGTTACCGCGTCTGAAGTGATTCGCGCTGAACTGGCAGCAGCCCGGGCAGCGGGTAAGCCTGTGGTTGTATCGATGGGCGGCATGGCGGCATCTGGTGGTTACTGGATTTCCACGCCAGCTAATTACATTGTGGCTAACCCCAGCACCCTGACCGGTTCTATCGGTATCTTCGGCGTGATCACCACCGTAGAAAATAGTCTGG‑ATTCGATTGgtgt < 2:114642/288‑1 (MQ=255) aaaaaTCCGCGACGCCCGCCTTGACCCGAAAGTGAAAGCGATTGTCCTGCGTGTTAATAGCCCAGGCGGCAGCGTTACCGCGTCTGAAGTGATTCGCGCTGAACTGGCAGCAGCCCGGGCAGCGGGTAAGCCTGTGGTTGTATCGATGGGCGGCATGGCGGCATCTGGTGGTTACTGGATTTCCACGCCAGCTAATTACATTGTGGCTAACCCCAGCACCCTGACCGGTTCTATCGGTATCTTCGGCGTGATCACCACCGTAGAAAATAGTCTGG‑ATTCGATTGGTGtt < 1:1185999/287‑1 (MQ=255) aaaTCCGCGACGCTCGCCTTGACCCGAAAGTGAAAGCGATTGTCCTGCGTGTTAATAGCCCAGGCGGCAGCGTTACCGCGTCTGAAGTGATTCGCGCTGAACTGGCAGCAGCCCGGGCAGCGGGTAAGCCTGTGGTTGTATCGATGGGCGGCATGGCGGCATCTGGTGGTTACTGGATTTCCACGCCAGCTAATTACATTGTGGCTAACCCCAGCACCCTGACCGGTTCTATCGGTATCTTCGGCGTGATCACCACCGTAGAAAATAGTCTGG‑ATTCGATTGGTGTTCa < 1:48067/289‑1 (MQ=255) ggtggcggtgagcggAAAGGGAAAGCGTTTGTCCGGCGGGTTAATAGCCCGGGCGGCAGCGTTACCGTGTCTGAGGTGATTCGCGCTGAACGGGCGGCAGCCCGGGCAGCGGGTAAGCCTGTGGTTGTATCGATGGGCGGCATGGCGGCATCTGGTGGTTACTGGATTTCCACGCCAGCTAATTACATTGTGGCTAACCCCAGCACCCTGACCGGTTCTATCGGTATCTTCGGCGTGATCACCACCGTAGAAAATAGTCTGG‑ATTCGATTGGTGTTCATACTGATGgt < 2:2043231/274‑1 (MQ=255) gAAAGTGAAAGCGATTGTCCTGCGTGTTAATAGCCCAGGCGGCAGCGTTACCGCGTCTGAAGTGATTCGCGCTGAACTGGCAGCAGCCCGGGCAGCGGGTAAGCCTGTGGTTGTATCGATGGGCGGCATGGCGGCATCTGGTGGTTACTGGATTTCCACGCCAGCTAATTACATTGTGGCTAACCCCAGCACCCTGACCGGTTCTATCGGTATCTTCGGCGTGATCACCACCGTAGAAAATAGTCTGG‑ATTCGATTGGTGTTCATACTGATGGTGTctcaacttcacc > 2:2256917/1‑277 (MQ=255) cGATTGTCCTGCGTGTTAATAGCCCAGGCGGCAGCGTTACCGCGTCTGAAGTGATTCGCGCTGAACTGGCAGCAGCCCGGGCAGCGGGTAAGCCTGTGGTTGTATCGATGGGCGGCATGGCGGCATCTGGTGGTTACTGGATTTCCACGCCAGCTAATTACATTGTGGCTAACCCCAGCACCCTGACCGGTTCTATCGGTATCTTCGGCGTGATCACCACCGTAGAAAATAGTCTGG‑ATTCGATTGGTGTTCATACTGATGGTGTCTCAACTTCACCGCTGGCGGATGt > 1:733352/1‑289 (MQ=255) tGTCCTGCGTGTTAATAGCCCAGGCGGCAGCGTTACCGCGTCTGAAGTGATTCGCGCTGAACTGGCAGCAGCCCGGGCAGCGGGTAAGCCTGTGGTTGTATCGATGGGCGGCATGGCGGCATCTGGTGGTTACTGGATTTCCACGCCAGCTAATTACATTGTGGCTAACCCCAGCACCCTGACCGGTTCTATCGGTATCTTCGGCGTGATCACCACCGTAGAAAATAGTCTGG‑ATTCGATTGGTGTTCATACTGATGGTGTCTCAACTTCACCGCTGGCGGATGTTTCt < 1:542332/289‑1 (MQ=255) tGTCCTGCGTGTTAATAGCCCAGGCGGCAGCGTTACCGCGTCTGAAGTGATTCGCGCTGAACTGGCAGCAGCCCGGGCAGCGGGTAAGCCTGTGGTTGTATCGATGGGCGGCATGGCGGCATCTGGTGGGTACTGGATTTCCACGCCAGCTAATTACATTGTGGCTAACCCCAGCACCCTGACCGGTTCTATCGGTATCTTCGGCGTGATCACCACCGTAGAAAATAGTCTGG‑ATGCGATTGGTGTTCATACTGATGGTGTCTCACCTTAACCGCTGGCGGATGTTTCt > 2:1463912/1‑289 (MQ=255) tAATAGCCCAGGCGGCAGCGTTACCGCGTCTGAAGTGATTCGCGCTGAACTGGCAGCAGCCCGGGCAGCGGGTAAGCCTGTGGTTGTATCGATGGGCGGCATGGCGGCATCTGGTGGTTACTGGATTTCCACGCCAGCTAATTACATTGTGGCTAACCCCAGCACCCTGACCGGTTCTATCGGTATCTTCGGCGTGATCACCACCGTAGAAAATAGTCTGG‑ATTCGATTGGTGTTCATACTGATGGTGTCTCAACTTCACCGCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGc > 2:106924/1‑288 (MQ=255) tAATAGCCCAGGCGGCAGCGTTACCGCGTCTGAAGTGATTCGCGCTGAACTGGCAGCAGCCCGGGCAGCGGGTAAGCCTGTGGTTGTATCGATGGGCGGCATGGCGGCATCTGGTGGTTACTGGATTTCCACGCCAGCTAATTACATTGTGGCTAACCCCAGCACCCTGACCGGTTCTATCGGTATCTTCGGCGTGATCACCACCGTAGAAAATAGTCTGG‑ATTCGATTGGTGTTCATACTGATGGTGTCTCAACTTCACCGCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGc > 1:527526/1‑288 (MQ=255) tAATAGCCCAGGCGGCAGCGTTACCGCGTCTGAAGTGATTCGCGCTGAACTGGCAGCAGCCCGGGCAGCGGGTAAGCCTGTGGTTGTATCGATGGGCGGCATGGCGGCATCTGGTGGTTACTGGATTTCCACGCCAGCTAATTACATTGTGGCTAACCCCAGCACCCTGACCGGTTCTATCGGTATCTTCGGCGTGATCACCACCGTAGAAAATAGTCTGG‑ATTCGATTGGTGTTCATACTGATGGTGTCTCAACTTCACCGCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCa < 1:652102/289‑1 (MQ=255) gCCCAGGCGGCAGCGTTACCGCGTCTGAAGTGATTCGCGCTGAACTGGCAGCAGCCCGGGCAGCGGGTAAGCCTGTGGTTGTATCGATGGGCGGCATGGCGGCATCTGGTGGTTACTGGATTTCCACGCCAGCTAATTACATTGTGGCTAACCCCAGCACCCTGACCGGTTCTATCGGTATCTTCGGCGTGATCACCACCGTAGAAAATAGTCTGG‑ATTCGATTGGTGTTCATACTGATGGTGTCTCAACTTCACCGCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTgcc > 1:1405905/1‑289 (MQ=255) aGGCGGCAGCGTTACCGCGTCTGAAGTGATTCGCGCTGAACTGGCAGCAGCCCGGGCAGCGGGTAAGCCTGTGGTTGTATCGATGGGCGGCATGGCGGCATCTGGTGGTTACTGGATTTCCACGCCAGCTAATTACATTGTGGCTAACCCCAGCACCCTGACCGGTTCTATCGGTATCTTCGGCGTGATCACCACCGTAGAAAATAGTCTGG‑ATTCGATTGGTGtt < 2:2602121/226‑1 (MQ=255) ggcggcAGCGTTACCGCGTCTGAAGTGATTCGCGCTGAACTGGCAGCAGCCCGGGCAGCGGGTAAGCCTGTGGTTGTATCGATGGGCGGCATGGCGGCATCTGGTGGTTACTGGATTTCCACGCCAGCTAATTACATTGTGGCTAACCCCAGCACCCTGACCGGTTCTATCGGTATCTTCGGCGTGATCACCACCGTAGAAAATAGTCTGG‑ATTCGATTGgtg < 1:223461/223‑1 (MQ=255) ggcggcAGCGTTACCGCGTCTGAAGTGATTCGCGCTGAACTGGCAGCAGCCCGGGCAGCGGGTAAGCCTGTGGTTGTATCGATGGGCGGCATGGCGGCATCTGGTGGTTACTGGATTTCCACGCCAGCTAATTACATTGTGGCTAACCCCAGCACCCTGACCGGTTCTATCGGTATCTTCGGCGTGATCACCACCGTAGAAAATAGTCTGG‑ATTCGATTGGTGTTCATACTGATGGTGTCTCAACTTCACCGCTGGCgg < 2:2143895/259‑1 (MQ=255) gcggcAGCGTTACCGCGTCTGAAGTGATTCGCGCTGAACTGGCAGCAGCCCGGGCAGCGGGTAAGCCTGTGGTTGTATCGATGGGCGGCATGGCGGCCTCTGGTGGTTCCTGGATTTCCACGCGATTTAATTACATGTTGGCTACCCCCAACCCCCTGCCCGTTCCTTTCGGTCTCTTCGGCGTGCTCACAACGTAAGAAACTATTTTGG‑ATTCCATTGTTTTTCATACGTTTGCTGTCTCAACTCCCCCGCTGCCGGCTGTTTCTATCACAAGGCCACGCCGGCCGGa > 2:1576275/1‑289 (MQ=255) aGCGTTACCGCGTCTGAAGTGATTCGCGCTGAACTGGCAGCAGCCCGGGCAGCGGGTAAGCCTGTGGTTGTATCGATGGGCGGCATGGCGGCATCTGGTGGTTACTGGATTTCCACGCCAGCTAATTACATTGTGGCTAACCCCAGCACCCTGACCGGTTCTATCGGTATCTTCGGCGTGATCACCACCGTAGAAAATAGTCTGG‑ATTCGATTGGTGTTCATACTGATGGTGTCTCAACTTCACCGCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAgcgc > 1:2291468/1‑289 (MQ=255) aGCGTTACCGCGTCTGAAGTGATTCGCGCTGAACTGGCAGCAGCCCGGGCAGCGGGTAAGCCTGTGGTTGTATCGATGGGCGGCATGGCGGCATCTGGTGGTTACTGGATTTCCACGCCAGCTAATTACATTGTGGCTAACCCCAGCACCCTGACCGGTTCTATCGGTATCTTCGGCGTGATCACCACCGTAGAAAATAGTCTGG‑ATTCGATTGGTGTTCATACTGATGGTGTCTCAACTTCACCGCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAgcg > 2:2187380/1‑288 (MQ=255) gTTACCGCGTCTGAAGTGATTCGCGCTGAACTGGCAGCAGCCCGGGCAGCGGGTAAGCCTGTGGTTGTATCGATGGGCGGCATGGCGGCATCTGGTGGTTACTGGATTTCCACGCCAGCTAATTACATTGTGGCTAACCCCAGCACCCTGACCGGTTCTATCGGTATCTTCGGCGTGATCACCACCGTAGAAAATAGTCTGG‑ATTCGATTGGTGTTCATACTGATGGTGTCTCAACTTCACCGCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCa < 1:1907094/287‑1 (MQ=255) gcgTCTGAAGTGATTCGCGCTGAACTGGCAGCAGCCCGGGCAGCGGGTAAGCCTGTGGTTGTATCGATGGGCGGCATGGCGGCATCTGGTGGTTACTGGATTTCCACGCCAGCTAATTACATTGTGGCTAACCCCAGCACCCTGACCGGTTCTATCGGTATCTTCGGCGTGATCACCACCGTAGAAAATAGTCTGG‑ATTCGATTGGTGTTCATACTGATGGTGTCTCAACTTCACCGCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCtgatga < 1:2077244/289‑1 (MQ=255) gcgTCTGAAGTGATTCGCGCTGAACTGGCAGCAGCCCGGGCAGCGGGTAAGCCTGTGGTTGTATCGATGGGCGGCATGGCGGCATCTGGTGGTTACTGGATTTCCACGCCAGCTAATTACATTGTGGCTAACCCCAGCACCCTGACCGGTTCTATCGGTATCTTCGGCGTGATCACCACCGTAGAAAATAGTCTGG‑ATTCGATTGGTGTTCATACTGATGGTGTCTCAACTTCACCGCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCtgatga < 1:765267/289‑1 (MQ=255) tGAAGTGATTCGCGCTGAACTGGCATCAGCCCGGGCAGCGGGTAAGCCTGCGGTTGTATCGATGGGCGGCATGGCGGCATCTGGTGGCTACTGGACTCCCACGCCAGCTAATTACATTGTGGCTAACCCCCGCACCCTTATCGGTTCTATCGGTATCTTCTGCGTGAACACCACCGTAGAAAATAGTCTGG‑ATTCGATTGGTTTTCATACTCATGGTGTCTCCACTTCACCGCTGGCGGATGGTTCTATCCTCAGTGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCCGCTGACGCAg > 2:2371709/1‑289 (MQ=255) aGTGATTCGCGCTGAACTGGCAGCAGCCCGGGCAGCGGGTAAGCCTGTGGTTGTATCGATGGGCGGCATGGCGGCATCTGGTGGTTACTGGATTTCCACGCCAGCTAATTACATTGTGGCTAACCCCAGCACCCTGACCGGTTCTATCGGTATCTTCGGCGTGATCACCACCGTAGAAAATAGTCTGG‑ATTCGATTGGTGTTCATACTGATGGTGTCTCAACTTCACCGCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGtt < 2:704318/288‑1 (MQ=255) aGTGATTCGCGCTGAACTGGCAGCAGCCCGGGCAGCGGGTAAGCCTGTGGTTGTATCGATGGGCGGCATGGCGGCATCTGGTGGTTACTGGATTTCCACGCCAGCTAATTACATTGTGGCTAACCCCAGCACCCTGACCGGTTCTATCGGTATCTTCGGCGTGATCACCACCGTAGAAAATAGTCTGG‑ATTCGATTGGTGTTCATACTGATGGTGTCTCAACTTCACCGCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGtt < 1:1295615/288‑1 (MQ=255) aTTCGCGCTGAACTGGCAGCAGCCCGGGCAGCGGGTAAGCCTGTGGTTGTATCGATGGGCGGCATGGCGGCATCTGGTGGTTACTGGATTTCCACGCCGGCTAATTACATTGTGGCTAACCCCAGCACCCTGACCGGTTCTATCGGTATCTTCGGCGTGATCACCACCGTAGAAAATAGTCTGG‑ATGCGATTGGTGTTCATACTGATGGTGTATCAACTTCACTGCTGGCGGATGTTTCTATCACAAGTGCACTGCGGCTGGAAGCGGTGCTGGTGATGCAGTTAAGCa > 2:1638857/1‑289 (MQ=255) aTTCGCGCTGAACTGGCAGCAGCCCGGGCAGCGGGTAAGCCTGTGGTTGTATCGATGGGCGGCATGGCGGCATCTGGTGGTTACTGGATTTCCACGCCAGCTAATTACATTGTGGCTAACCCCAGCACCCTGACCGGTTCTATCGGTATCTTCGGCGTGATCACCACCGTAGAAAATAGTCTGG‑ATTCGATTGGTGTTCATACTGATGGTGTCTCAACTTCACCGCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAGCa > 1:445088/1‑289 (MQ=255) tCGCGCTGAACTGGCAGCAGCCCGGGCAGCGGGTAAGCCTGTGGTTGTATCGATGGGCGGCATGGCGGCATCTGGTGGTTACTGGATTTCCACGCCAGCTAATTACATTGTGGCTAACCCCAGCACCCTGACCGGTTCTATCGGTATCTTCGGCGTGATCACCACCGTAGAAAATAGTCTGG‑ATTCGATTGGTGTTCATACTGATGGTGTCTCAACTTCACCGCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGGCGAGGATTCAGTTAAGCAtt > 2:560819/1‑289 (MQ=255) agcCCGGGCAGCGGGTAAGCCTGTGGTTGTATCGATGGGCGGCATGGCGGCATCTGGTGGTTACTGGATTTCCACGCCAGCTAATTACATTGTGGCTAACCCCAGCACCCTGACCGGTTCTATCGGTATCTTCGGCGTGATCACCACCGTAGAAAATAGTCTGG‑ATTCGATTGGTGTTCATACTGATGGTGTCTCAACTTCACCGCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAGCATTGAGAATgg < 1:1617110/279‑1 (MQ=255) cAGCGGGTAAGCCTGTGGTTGTATCGATGGGCGGCATGGCGTCATCTGGTGGTTACTGGATTTCCACGCCAGCTAATTACATTGTGGCTAACCCCAGCACCCTGACCGGTTCTATCGGTATCTTCGGCGTGATCACCACCGTAGAAAATAGTCTGG‑ATTCGATTGGTGTTCATACTGATGGTGTCTCAACTTCACCGCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAGCATTGAGAATGGCTATAAACGCTTTATCa < 1:1817068/288‑1 (MQ=255) cGGGTAAGCCTGTGGTTGTATCGATGGGCGGCATGGCGGCATCTGGTGGTTACTGGATTTCCACGCCAGCTAATTACATTGTGGCTAACCCCAGCACCCTGACCGGTTCTATCGGTATCTTCGGCGTGATCACCACCGTAGAAAATAGTCTGG‑ATTCGATTGGTGTTCATACTGATGGTGTCTCAACTTCACCGCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACt > 1:926233/1‑223 (MQ=255) gggTCAGCCTGTGGGTGTTTCGATGGGCGGGAAGGCGGGATCTGGTGGTTCATGGATTTCCACGACAGCTAATTACATTGTGGCTAACCCCAGCACCCTGACCGGTTCTATCGGTATCTTCGGCGTGATCACCACCGTAGAAAATAGTCTGG‑ATTCGATTGGTGTTCATACTGATGGTGTCTCAACTTCACCGCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAGCATTGAGAATGGCTATAAACGCTTTATCACg < 2:2362138/286‑1 (MQ=255) gggTAAGCCTGTGGTTGTATCGATGGGCGGCATGGCGGCATCTGGTGGTTACTGGATTTCCACGCCAGCTAATTACATTGTGGCTAACCCCAGCACCCTGACCGGTTCTATCGGTATCTTCGGCGTGATCACCACCGTAGAAAATAGTCTGG‑ATTCGATTGGTGTTCATACTGATGGTGTCTCAACTTCACCGCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCCCGTCCGCCGGAAGCGCAGCTCATGATGCATGTAAGCATAGAGAATGGCTATAAACGCCTTATCACGccg > 2:280040/1‑287 (MQ=255) aGCCTGTGGTTGTATCGATGGGCGGCATGGCGGCATCTGGTGGTTACTGGATTTCCACGCCAGCTAATTACATTGTGGCTAACCCCAGCACCCTGACCGGTTCTATCGGTATCTTCGGCGTGATCACCACCGTAGAAAATAGTCTGG‑ATTCGATTGGTGTTCATACTGATGGTGTCTCAACTTCACCGCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCtgatga < 2:623982/240‑1 (MQ=255) aGCCTGTGGTTGTATCGATGGGCGGCATGGCGGCATCTGGTGGTTACTGGATTTCCACGCCAGCTAATTACATTGTGGCTAACCCCAGCACCCTGACCGGTTCTATCGGTATCTTCGGCGTGATCACCACCGTAGAAAATAGTCTGG‑ATTCGATTGGTGTTCATACTGATGGTGTCTCAACTTCACCGCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTAAGCATTGAGAATGGCTATAAACGCTTTATCACGCTGGtt > 1:146547/1‑287 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |