Predicted mutation | ||||||
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RA | CP042583 | 1,588,966 | 3 bp→CGA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP042583 | 1,588,966 | 0 | G | C | 99.4% | 807.8 / NA | 343 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
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* | CP042583 | 1,588,967 | 0 | C | G | 99.7% | 810.8 / ‑4.5 | 343 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base G (193/149); minor base . (1/0); total (194/149) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.97e-01 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,588,968 | 0 | T | A | 99.4% | 816.1 / NA | 343 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base A (194/147); minor base G (0/2); total (194/149) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.88e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 343 total aligned reads displayed.
AACGTTTCGCTAATAAATAATACCACGCTTAATCACAAATCCGATGTAAACATCCTAATAAATTAATGGGGTAAATATCTTTTTCTGATATCCCGTTACGCAAATAAATAATATGATAATTATTTGAAGTCAGACCAGAGTTTTAATTTGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTACTCAAGATTGAGGAAGGATTATCGTTCGGCGACCAGACGAATAATATCTTCGTCT‑TCAACGCTTTTTTGACTCTCAACGGTCTTTTTATCTGCTTTCTCTGGTTCGTTTGCTTCGCACAA‑ACGACGTAACAGTGCATTTTGACGTTTTTGCTGATCCAGCAACGCCTCAAGCAGTTCAATCTGTTCGTTAGTCCGACTACTGGCACGATTGATAAAAAACCACAAGATGAGCCCGATAAGAAGAACCACCACGCTTACAACCAAAGACGCAATGTTCATCACGCCACTATTTACAACTTCGTTCATTTCACCACCTCTGAGTAGAGGCGCTATTCTACCAC > CP042583/1588690‑1589246 ||| cTAATAAATAATACCACGCTTAATCACAAATCCGATGTAAACATCCTAATAAATTAATGGGGTAAATATCTTTTTCTGATATCCCGTTACGCAAATAAATAATATGATAATTATTTGAAGTCAGACCAGAGTTTTAATTTGAAGCAGTTGCACCATGACAGTGCGTATAATCAGGATGAATTGAGTAACCCTTCAACGACGGGGTTACTCAAGATTGAGGAAGGATTATCGTTCGGCGACCAGACGAATAATATCTTCGTCT‑TCAACCGATTTTTGACTCTCAACgg > 2:154754/1‑287 (MQ=255) 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