| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP042583 | 442,475 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP042583 | 442,475 | 0 | A | T | 99.2% | 558.8 / NA | 241 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (121/116); minor base G (1/1); total (124/117) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| * | CP042583 | 442,476 | 0 | G | C | 99.2% | 555.4 / NA | 241 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/2); new base C (123/115); total (124/117) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.37e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 | |||||||||||
| * | CP042583 | 442,477 | 0 | C | G | 99.2% | 557.3 / NA | 241 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (2/0); new base G (122/116); total (124/117) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.98e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
Only 100 of 241 total aligned reads displayed.
ATATTTATCGACTCGCATTGCCGTTATTTGTCGGCATATTTTTAATGGCATTACCGCCTGTGTATCTGCAAGACCTTCCATTAACGCTTCGTCCTCTGCTCAGTAACGGCTTATTGGTCGGGATTTTACTGGCTGTTCTTATGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTAGCACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGCGGGCCGATGGGCGAAAAAGTGAATGCTTTTTATGGCCTTACCGGCGACGGGAAAACGGCGGTGATTGAGATGGCGGCAGCAAGTGGCCTGATGCTGGTCGCGCCTGAAAAGCGTAATCCGTTGCTGGCCTCCAGTTTTGGTACGGGGGAGTTAATTCGTCATGCG > CP042583/442197‑442756 ||| atTTATCGACTCGCATTGCCGTTATTTGTCGGCATATTTTTAATGGCATTACCGCCTGTGTATCTGCAAGACCTTCCATTAACGCTTCGTCCTCTGCTCAGTAACGGCTTATTGGTCGGGATTTTACTGGCTGTTCTTATGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTc < 1:1901011/289‑1 (MQ=255) tCGACTCGCATTGCCGTTATTTGTCGGCATATTTTTAATGGCATTACCGCCTGTGTATCTGCAAGACCTTCCATTAACGCTTCGTCCTCTGCTCAGTAACGGCTTATTGGTCGGGATTTTACTGGCTGTTCTTATGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGAt < 2:2129015/289‑1 (MQ=255) cGACTCGCATTGCCGTTATTTGTCGGCATATTTTTAATGGCATTACCGCCTGTGTATCTGCAAGACCTTCCATTAACGCTTCGTCCTCTGCTCAGTAACGGCTTATTGGTCGGGATTTTACTGGCTGTTCTTATGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATg < 1:2272189/289‑1 (MQ=255) cGACTCGCATTGCCGTTATTTGTCGGCATATTTTTAATGGCATTACCGCCTGTGTATCTGCAAGACCTTCCATTAACGCTTCGTCCTCTGCTCAGTAACGGCTTATTGGTCGGGATTTTACTGGCTGTTCTTATGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATg < 1:30898/289‑1 (MQ=255) cTCGCATTGCCGTTATTTGTCGGCATATTTTTAATGGCATTACCGCCTGTGTATCTGCAAGACCTTCCATTAACGCTTCGTCCTCTGCTCAGTAACGGCTTATTGGTCGGGATTTTACTGGCTGTTCTTATGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCg < 1:727204/288‑1 (MQ=255) cTCGCATTGCCGTTATTTGCCGGCATATTTTTAATGGCATTACCGCCTGTGTATCTGCAAGACCTTCCATTAACGCTTCGTCCTCTGCTCAGTAACGGCTTATTGGTCGGGATTTTACTGGCTGTTCTTATGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCg < 1:164479/288‑1 (MQ=255) cGCATTGCCGTTATTTGTCGGCATATTTTTAATGGCATTACCGCCTGTGTATCTGCAAGACCTTCCATTAACGCTTCGTCCTCTGCTCAGTAACGGCTTATTGGTCGGGATTTTACTGGCTGTTCTTATGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCg > 2:555486/1‑286 (MQ=255) ccGTTATTTGTCGGCATATTTTTAATGGCATTACCGCCTGTGTATCTGCAAGACCTTCCATTAACGCTTCGTCCTCTGCTCAGTAACGGCTTATTGGTCGGGATTTTACTGGCTGTTCTTATGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAATCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGAGGCGAACtata > 2:981050/1‑286 (MQ=255) tCGGCATATTTTTAATGGCATTACCGCCTGTGTATCTGCAAGACCTTCCATTAACGCTTCGTCCTCTGCTCAGTAACGGCTTATTGGTCGGGATTTTACTGGCTGTTCTTATGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGaa > 2:1556156/1‑271 (MQ=255) tatTTTTAATGGCATTACCGCCTGTGTATCTGCAAGACCTTCCATTAACGCTTCGTCCTCTGCTCAGTAACGGCTTATTGGTCGGGATTTTACTGGCTGTTCTTATGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGa < 2:893343/289‑1 (MQ=255) aTGGCATTACCGCCTGTGTATCTGCAAGACCTTCCATTAACGCTTCGTCCTCTGCTCAGTAACGGCTTATTGGTCGGGATTTTACTGGCTGTTCTTATGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGgcggcg > 1:2600234/1‑289 (MQ=255) ttACCGCCTGTGTATCTTCCAGAACTTCCATTAACGCTTCGTCCTCTGCTCAGTAACGGCTTATTGGTCGGGATTTTACTGGCTGTTCTTATGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGa < 2:2016511/289‑1 (MQ=255) ttACCGCCTGTGTATCTGCAAGACCTTCCATTAACGCTTCGTCCTCTGCTCAGTAACGGCTTATTGGTCGGGATTTTACTGGCTGTTCTTATGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGa < 1:774675/289‑1 (MQ=255) tACCGCCTGTGTATCTGCAAGACCTTCCATTAACGCTTCGTCCTCTGCTCAGTAACGGCTTATTGGTCGGGATTTTACTGGCTGTTCTTATGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCCGACGGCGGCGACGGGAc > 2:1168585/1‑289 (MQ=255) aCCGCCTGTGTATCTGCAAGACCTTCCATTAACGCTTCGTCCTCTGCGCAGTAACGGCTTATTGGTCGGGATTTTACTGGCTGTTCTTATGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACg < 1:99618/289‑1 (MQ=255) cTGTGTATCTGCAAGACCTTCCATTAACGCTTCGTCCTCTGCTCAGTAACGGCTTATTGGTCGGGATTTTACTGGCTGTTCTTATGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCgg > 2:1381815/1‑267 (MQ=255) tgtgTATCTGCAAGACCTTCCATTAACGCTTCGTCCTCTGCTCAGTAACGGCTTATTGGTCGGGATTTTACTGGCTGTTCTTATGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCATACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTCCCGCGAGCGGATGGCGGCGACGGGACGGTGCAt > 2:159686/1‑289 (MQ=255) tgtgTATCTGCAAGACCTTCCATTAACGCTTCGTCCTCTGCTCAGTAACGGCTTATTGGTCGGGATTTTACTGGCTGTTCTTATGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATg > 2:640195/1‑239 (MQ=255) tgtATCTGCAAGACCTTCCATTAACGCTTCGTCCTCTGCTCAGTAACGGCTTATTGGTCGGGATTTTACTGGCTGTTCTTATGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGc > 2:1779432/1‑289 (MQ=255) gCAAGACCTTCCATTAACGCTTCGTCCTCTGCTCAGTAACGGCTTATTGGTCGGGATTTTACTGGCTGTTCTTATGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGGGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTc > 1:2039806/1‑289 (MQ=255) gCAAGACCTTCCATTAACGCTTCGTCCTCTGCTCAGTAACGGCTTATTGGTCGGGATTTTACTGGCTGTTCTTATGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGAc > 2:1794660/1‑273 (MQ=255) gCAAGACCTTCCATTAACGCTTCGTCCTCTGCTCAGTAACGGCTTATTGGTCGGGATTTTACTGGCTGTTCTTATGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGAc < 1:1794660/273‑1 (MQ=255) aGACCTTCCATTAACGCTTCGTCCTCTGCTCAGTAACGGCTTATTGGTCGGGATTTTACTGGCTGTTCTTATGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATg < 2:455369/227‑1 (MQ=255) aGACCTTCCATTAACGCTTCGTCCTCTGCTCAGTAACGGCTTATTGGTCGGGATTTTACTGGCTGTTCTTATGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATg > 1:455369/1‑227 (MQ=255) aGACCTTCCATTAACGCTTCGTCCTCTGCTCAGTAACGGCTTATTGGTCGGGATTTTACTGGCTGTTCTTATGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATc > 2:403955/1‑238 (MQ=255) aGACCTTCCATTAACGCTTCGTCCTCTGCTCAGTAACGGCTTATTGGTCGGGATTTTACTGGCTGTTCTTATGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGAc < 1:1156742/270‑1 (MQ=255) aGACCTTCCATTAACGCTTCGTCCTCTGCTCAGTAACGGCTTATTGGTCGGGATTTTACTGGCTGTTCTTATGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTcgcc > 1:2001649/1‑289 (MQ=255) cTTCCATTAACGCTTCGTCCTCTGCTCAGTAACGGCTTATTGGTCGGGATTTTACTGGCTGTTCTTATGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGa < 1:2365445/289‑1 (MQ=255) ttCCATTAACGCTTCGTCCTCTGCTCAGTAACGGCTTATTGGTCGGGCTTTTACTGGATGTTCTTATGGATAACCTTATTCCGTGGGCACGCATCGCATAATTTGTTGACAAAGGATTGATCATGAAGATTGTCATTGCGCCAGCCTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAACTGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGTGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCTATGGTCGCCGCGAc > 1:2659148/1‑289 (MQ=255) cATTAACGCTTCGTCCTCTGCTCAGTAACGGCTTATTGGTCGGGATTTTACTGGCTGTTCTTATGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACggg < 1:756676/289‑1 (MQ=255) cATTAACGCTTCGTCCTCTGCTCAGTAACGGCTTATTGGTCGGGATTTTACTGGCTGTTCTTATGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACggg < 2:384745/289‑1 (MQ=255) cGCTTCGTCCTCTGCTCAGTAACGGCTTATTGGTCGGGATTTTACTGGCTGTTCTTATGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCg < 1:628917/215‑1 (MQ=255) gTCCTCTGCTCAGTAACGGCTTATTGGTCGGGATTTTACTGGCTGTTCTTATGGATAACCTTATTCCTTGGGAACGCATCGAATATTTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGt < 1:1668975/289‑1 (MQ=255) ccTCTGCTCAGTAACGTGTTATTGGTCGAGATTTTTCTTGCTGTTCTTATGGATAACCTTATGCCGTAGGAACGGATCGAATAATTTGTTGAGAAAAGATTGTTACTGAGGATTGTCATTGCGCCAGAATCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGAAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGa < 2:2303681/289‑1 (MQ=255) gCTCAGTAACGGCTTATTGGTCGGGATTTTACTGGCTGTTCTTATGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCtt > 1:2442753/1‑289 (MQ=255) aGTAACGGCTTATTGGTCGGGATTTTACTGGCTGTTCTTATGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAg > 1:131408/1‑289 (MQ=255) tAACGGCTTATTGGTCGGGATTTTACTGGCTGTTCTTATGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTc > 2:306275/1‑289 (MQ=255) cGGCTTATTGGTCGGGATTTTACTGGCTGTTCTTATGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGCCGGGCGGCAACATCGTGCCGATTGAGGTCTGc > 2:1691985/1‑289 (MQ=255) gCTTATTGGTCGGGATTTTACTGGCTGTTCTTATGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAACAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCTAACTATATATGTTTTCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGACGCGACGGGCGTCAACCACGTGACGCTTGAAGTCTGCgg > 2:2215354/1‑289 (MQ=255) gCTTATTGGTCGGGATTTTACTGGCTGTTCTTATGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCTCCGGGCGGCAACATCGTGCAGCTTGAAGCcggcgg > 2:2634350/1‑289 (MQ=255) gCTTATTGGTCGGGATTTTACTGGCTGTTCTTATGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGCgg > 1:890795/1‑289 (MQ=255) gCTTATTGGTCGGGATTTTACTGGCTGTTCTTATGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTCAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGACGGGCCGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGCGCGCCAGCACCGTGCCGCCTGCAGCCTCCgc > 2:2710533/1‑288 (MQ=255) ttGGTCGGGATTTTACTGGCTGTTCTTATGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGa < 2:1413209/268‑1 (MQ=255) tGGTCGGGATTTTACTGGCTGTTCTTATGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGCGGGCCGAt < 1:2638257/289‑1 (MQ=255) cGGGATTTTACTGGCTGTTCTTATGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGTACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTACCGCTTGAAGTCTGCGGGCCGATTGGc > 2:197668/1‑289 (MQ=255) gCTGTTCTTATGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTT‑TCGACCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGCGGGCCGATGGGCGAAAAAGTGAAt > 1:403702/1‑287 (MQ=255) tGTTCTTATGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGCGGGCCGATGGGCGAAAAAGTGAATGc < 2:2606678/288‑1 (MQ=255) gTTCTTATGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGCGGGCCGATGGGCGAAACAGTGAATGcgt > 1:1533355/1‑287 (MQ=255) tatgaaagaacTTATTCTGGGGGAACGCAGCGAATACTTTGTTGAAAATGTATTGATAAGGGAGATTGTCTTTGCCCCATTCTCTTTTAAAGAGAGGTTAAGAGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAACGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTGCCGATGCGAACTATCTCTGTTTGCTGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGCGGGCGGATGGGCGAAAAAGTGAATGCTTTTTAt < 2:1694436/279‑1 (MQ=255) aTGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGCGGGCCGATGGGCGAAAAAGTGAATGCTTTTTATg < 1:306275/289‑1 (MQ=255) gATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCg > 1:1411175/1‑156 (MQ=255) tAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATg > 1:2119856/1‑182 (MQ=255) aaCCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCg > 1:1574131/1‑153 (MQ=255) aaCCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGCGGGCGGATGGGCGAAAAAGTGAATGCTTTTTATGGCCTTa > 1:431330/1‑289 (MQ=255) aaCCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGCGGGCCGATGGGCGAAAAAGGGAATGCTTTTTATGGCCtt > 1:2705268/1‑288 (MQ=255) atgccagcgaactggAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGCGGGCCGATGGGCGAAAAAGTGAATGCTTTTTATGGCCTTa > 1:2410673/14‑288 (MQ=255) aCCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGCGGGCCGATGGGCGAAAAAGTGAATGCTTTTTAt > 1:1254667/1‑281 (MQ=255) aCCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGCGGGCCGATGGGCGAAAAAGTGAATGCTTTTTAt < 2:1254667/281‑1 (MQ=255) aCCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGCGGGCCGATGGGCGAAAAAGTGAATGCTTTTTATGGCCTTa > 1:275351/1‑288 (MQ=255) ccTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGggcgg > 1:1692953/1‑222 (MQ=255) ccTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGTCGGCACCATCGTGACGCTGGAAGTCTGCGGCCCGATGGGCGAAAACGTGAATGCTTTTTATGGCCTTAcg > 2:1132302/1‑288 (MQ=255) ccTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGCGGGCCGATGGGCGAAAAAGTGAATGCTTTTTATGGCCTTAcc > 1:2339869/1‑289 (MQ=255) ttCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCGGCGGGCCGATGGGCGAAAAAGTGAATGCTTTTTATGGCCTTACCGGCg > 2:774664/1‑288 (MQ=255) tGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGt > 1:2570477/1‑221 (MQ=255) tGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGCGGGCCGAt < 2:2568822/245‑1 (MQ=255) tGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGCGGGCCGATGGGCGAAAAAGTGAATGCTTTTTAt > 1:1677474/1‑270 (MQ=255) tGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGCGGGCCGATGGGCGAAAAAGTGAATGCTTTTTATGGCCTTACCGGCGACGGGa > 1:597655/1‑289 (MQ=255) tGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGCGGGCCGATGGGCGAAAAAGTGAATGCTTTTTATGGCCTTACCGGCGACGGGa > 1:1914563/1‑289 (MQ=255) tGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGGGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGCGGGCCGATGGGCGAAAAAGTGAATGCTTTTTATGGCCTTACCGGCGACGGGa > 1:100203/1‑289 (MQ=255) tGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGAGTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGCGGGCCGATGGGCGAAAAAGTGAAGGCTTGTGCTGGCTTTACCGGCCACGGGa > 1:1471429/1‑289 (MQ=255) gggAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGCGGGCCGATGGGCGAAAAAGTGAATGCTTTTTATGGCCTTACCGGCGACGGGaa > 2:573599/1‑289 (MQ=255) cGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGCGGGTCGATGGGCGAAAAAGTGAATGCTTTTTATGGCCTTACCGGCGACGGGAAAAcgg < 2:2442753/289‑1 (MQ=255) cGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGCGGGCCGATGGGCGAAAAAGTGAATGCTTTTTATGGCCTTACCGGCGACGGGAAAAcgg < 1:1779432/289‑1 (MQ=255) cATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGCGGGCCGATGGGCGAAAAAGTGAATGCTTTTTATGGCCTTACCGGCGACGGGAAAAcggcg > 1:195816/1‑289 (MQ=255) aTCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGAAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGCGGGCCGATGGGCGAAAAAGTGAATGCTTTTTATGGCCTTACCGGCGACGGGAAAAcggcg < 2:1914563/288‑1 (MQ=255) aaGGATGGATAATGACGAGTGTAATTGCGCCAGCCTCTTTTAAAGACAGATTAAGTGCAGAACAATGTTGGCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGAAACATCGTGACGTTTGAAGTCTGCGGGCCGATGGGCGAAAAAGTGAATGCTTTTTATGGCCTTACCGGCGACGGGAAAACGGCGGTGATTGAGATGGCGgcagc < 2:2039806/289‑1 (MQ=255) aTTGGTAATGAGGATTGTCATTGGGCAAGACTTTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGAAGAAAAATGTTTTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGCGGGCCGATGGGCGAAAAAGTGAATGCTTTTTATGGCCTTACCGGCGACGGGAAAACGGCGGTGATTGAGATGGCGGCAGCAAg < 2:171769/288‑1 (MQ=255) aTTGATAATGTGGATTGCCATTTGGCTGGATTCTTTTAAAAAGATCTTAAGTTCAGAAACATTTTATCAGGTAATTAAAGCCGCGTTTTCGACCCTCTTTCCCATTGCGAACTATATCTGTTTGCCGGTATCGGATGGCGGCGAAGGGGCGGTGGATGCGATGGTCGCCCCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGCGGGCCGATGGGCGAAAAAGTGAATGCTTTTTATGGCCTTACCGGCGACGGGAAAACGGCGGTGATTGAGATGGCGGCAGCAAg < 2:100203/288‑1 (MQ=255) aTTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGCGGGCCGATGGGCGAAAAAGTGAATGCTTTTTATGGCCTTACCGGCGACGGGAAAACGGCGGTGATTGAGATGGCGGCAGCAAg < 1:1831291/288‑1 (MQ=255) aTTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGCGGGCCGATGGGCGAAAAAGTGAATGCTTTTTATGGCCTTACCGGCGACGGGAAAACGGCGGTGATTGAGATGGCGGCAGCAAg < 2:275351/288‑1 (MQ=255) aTTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGCGGGCCGATGGGCGAAAAAGTGAATGCTTTTTATGGCCTTACCGGCGACGGGAAAACGGCGGTGATTGAGATGGCGGCAGCAAg < 1:2711557/288‑1 (MQ=255) tGATAAAGAGGAATGTTGTTGGGCACGACGTTTTGAAAGAGAGCTGAATTAGCGTAAAGTGTTTTACGGCAATAAAGAGCGGGTTTGGGAACCTCGTGACCGATGAGAAATATATCTGTTTGCCGATGGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTTGATGCGATGGTCGACACGACGTGCGGCAAATGCGGGACGGTTGAAGTCTGCGGGCCGATGGGCG‑AAAAGTGAATGCTTTTTATGGCCTTACCGGCGACGGGAAAACGGCGGTGATTGAGATGGCGGCAGCAAGTGGc < 2:2337626/289‑1 (MQ=255) ttGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGCGGGCCGATGGGCGAAAAAGTGAATGCTTTTTATGGCCTTACCGGCGACGGGAAAACGGCGGTGATTGAGATGGCGGCAGCAAGTGGCCTGATGCTGGt < 1:91581/289‑1 (MQ=255) ttGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGAGGGCCGATGGGCGAAAAAGTGAATGCTTTTTATGGCCTTACCGGCGACGGGAAACGGGCGGTGACTGGGATGGCGGCAGCAAGTGGCCTGGTGCggg > 2:1322023/1‑288 (MQ=255) ccgaatctTTTAAAGAGAGCAGAAGTACAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAGGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGCGGGCCGATGGGCGAAAAAGTGAATGCTTTTTATGGCCTTACCGGCGACGGGAAAACGGCGGTGATTGAGATGGCGGCAGCAAGTGGCCTGATGCTGGTCGCGCCTGaaaa < 2:431330/284‑1 (MQ=255) ctctTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGCGGGCCGATGGGCGAAAAAGTGAATGCTTTTTATGGCCTTACCGGCGACGGGAAAACGGCGGTGATTGAGATGGCGGCAGCAAGTGGCCTGATGCTGGTCGCGCCTGAAAAGCGt < 1:1865807/289‑1 (MQ=255) agCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGCGGGCCGATGGGCGAAAAAGTGAATGCTTTTTATGGCCTTACCGGc < 1:495945/207‑1 (MQ=255) agCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGCGGGCCGATGGGCGAAAAAGTGAATGCTTTTTATGGCCTTACCGGCGACGGGAAAACGGCGGTg > 2:2376849/1‑225 (MQ=255) agCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGCGGGCCGATGGGCGAAAAAGTGAATGCTTTTTATGGCCTTACCGGCGACGGGAAAACGGCGGTGATTGAGATGGCGGCAGCAAGTGGCCTGATGCTGGt < 2:1052890/260‑1 (MQ=255) agCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGCGGGCCGATGGGCGAAAAAGTGAATGCTTTTTATGGCCTTACCGGCGACGGGAAAACGGCGGTGATTGAGATGGCGGCAGCAAGTGGCCTGATGCTGGt > 1:1052890/1‑260 (MQ=255) agCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGCGGGCCGATGGGCGAAAAAGTGAATGCTTTTTATGGCCTTACCGGCGACGGGAAAACGGCGGTGATTGAGATGGCGGCAGCAAGTGGCCTGATGCTGGTCGCGCCTGAAAAGCGTAATCCGTTGCTgg > 1:1357774/1‑289 (MQ=255) agCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGCGGGCCGATGGGCGAAAAAGTGAATGCTTTTTATGGCCTTACCGGCGACGGGAAAACGGCGGTGATTGAGATGGCGGCAGCAAGTGGCCTGATGCTGGTCGCGCCTGAAAAGCGTAATCCGTTGCTg > 1:394032/1‑288 (MQ=255) agCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGCGGGCCGATGGGCGAAAAAGTGAATGCTTTTTATGGCCTTACCGGCGACGGGAAAACGGCGGTGATTGAGATGGCGGCAGCAAGGTGCCGGATGCGGGTCGAGCCTGaa > 2:1902827/1‑270 (MQ=255) gCTTAGGTGCAGAAAAATGTTTTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGCGGGCCGATGGGCGAAAAAGTGAATGCTTTTTATGGCCTTACCGGCGACGGGAAAACGGCGGTGATTGAGATGGCGGCAGCAAGTGGCCTGATGCTGGTCGCGCCTGAAAAGCGTAATCCGTTGCTg < 1:2552653/287‑1 (MQ=255) cTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGCGGGCCGATGGGCGAAAAAGTGAATGCTTTTTATGGCCTTACCGTCGACGGGGAAACGGCGGTTGTTGAGAGTGCGGCAGCAAGTGGCCTGAGGGTGGTAGGGCCGGAAAAGGGGAATcgctttgtggtc > 2:959724/1‑278 (MQ=255) aaGTGAGGAAACATGTTGTCGGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGAGCCTCTTTCACGCGGGGAAGTATAGCGGGTTGCTGATAGCGGATGGGGGGGAAGGGGCGGTGGATGGGATGGTAGCGGCGACGGGCGGCAACAGCGTGACGATTGAAGTATGCGGGACGATGGGCGAAAAAGTGAATGCTGTTTATGGCCTTACCGGCGACGGGAAAACGGCGGTGATTGAGATGGCGGCAGCAAGTGGCCTGATGCTGGTCGCGCCTGAAAAGCGTAATCCGTTGCTGGCCTcc < 2:2655979/289‑1 (MQ=255) cAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGt > 1:962842/1‑68 (MQ=255) cAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGCCGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGCGGGCCGATGGGCGAAAAAGTGAATGCTTTTTATGGCCTTACCGGCGACGGGAAAACGGCGGTGATTGAGATGGCGGCAGCAAGTGGCCTGATGCTGGTCGCGCCTGAAAAGCGTAATCCGTTGCTGGCCTCCAGttt > 1:1190650/1‑289 (MQ=255) aGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGCGGGCCGATGGGCGAAAAAGTGAATGCTTTTTATGGCCTTACCGGCGACGGGAAAACGGCGGTGATTGAGATGGCGGCAGCAAGTGGCCTGATGCTGGTCGCGCCTGAAAAGCGTAATCCGTTGCTGGCCTCCAGttt < 1:1044650/288‑1 (MQ=255) tgttgtCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTTCGACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGCGGGCCGATGGGCGAAAAAGTGAATGCTTTTTATGGCCTTACCGGCGACGGGAAAACGGCGGTGATTGAGATGGCGGCAGCAAGTGGCCTGATGCTGGTCGCGCCTGAAAAGCGTAATCCGTTGCTGGCCTCCAGTTTTGGTACgg > 1:1700694/1‑289 (MQ=255) ||| ATATTTATCGACTCGCATTGCCGTTATTTGTCGGCATATTTTTAATGGCATTACCGCCTGTGTATCTGCAAGACCTTCCATTAACGCTTCGTCCTCTGCTCAGTAACGGCTTATTGGTCGGGATTTTACTGGCTGTTCTTATGGATAACCTTATTCCGTGGGAACGCATCGAATAATTTGTTGAAAAAGGATTGATAATGAAGATTGTCATTGCGCCAGACTCTTTTAAAGAGAGCTTAAGTGCAGAAAAATGTTGTCAGGCAATTAAAGCCGGGTTTAGCACCCTCTTTCCCGATGCGAACTATATCTGTTTGCCGATAGCGGATGGCGGCGAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGCGGGCCGATGGGCGAAAAAGTGAATGCTTTTTATGGCCTTACCGGCGACGGGAAAACGGCGGTGATTGAGATGGCGGCAGCAAGTGGCCTGATGCTGGTCGCGCCTGAAAAGCGTAATCCGTTGCTGGCCTCCAGTTTTGGTACGGGGGAGTTAATTCGTCATGCG > CP042583/442197‑442756 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |