Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 1,601,251 | 3 bp→TCA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 1,601,251 | 0 | A | T | 99.6% | 657.8 / NA | 273 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (143/129); minor base G (0/1); total (143/130) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.76e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,601,252 | 0 | G | C | 100.0% | 653.5 / NA | 273 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base C (143/130); total (143/130) | |||||||||||
* | CP042583 | 1,601,253 | 0 | T | A | 99.3% | 651.9 / NA | 273 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base A (141/130); minor base C (2/0); total (143/130) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.99e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 273 total aligned reads displayed.
GCCTTTCTGACACAAATGCGCGAAGCGATGCCTAGCACGCTCAGTTTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTAGTATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGGTAATGCACCACAGCGGGTGATGGATGTCGCTGCCGCGCCTGGCTCCAAAACGACGCAAATTTCCGCGCGGATGAATAACGAAGGGGCAATCCTTGCCAATGAGTTTTCCGCCAGTCGGGTAAAAGTGTTACATGCCAATATCAGCCGCTGTGGTATCAGTAATGTTGCGCTCACACATTTTGATGGCCGCGTGTTTGGTGCGGCAGTGCCAGAAATGTTCGATGCCATTTTGCTGGACGCTCC > CP042583/1600972‑1601528 ||| gCCTTTCTGACACAAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAAtgttgc < 1:1658315/289‑1 (MQ=255) aGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGACAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGAc > 2:2135283/1‑289 (MQ=255) cttcgacgctctcatttGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGGTAATGc < 2:531199/275‑1 (MQ=255) ttcgacgctctcatttGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGGTAATGca < 1:1862201/276‑1 (MQ=255) tcgacgctctcatttGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGGTAATGca > 1:2258554/13‑288 (MQ=255) cctcgcatttGATGATTTTTTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTTCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGGTAATGCACCACAg < 2:935703/282‑1 (MQ=255) ctcatttGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACgg < 2:1502779/269‑1 (MQ=255) tcatttGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGGTAATGCACCACAGCgg > 2:948827/4‑288 (MQ=255) tgatTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGCCGGTAAGTCACCCCAGCGGGggatggat > 2:887367/1‑289 (MQ=255) tgatTTTCTCGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTGCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGGTAATGCACCACAGCGGGTgatgga < 2:378310/288‑1 (MQ=255) ccTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGGTAATGCACCACAGCGGGTGATGGATGTCGCTGCCGCGcc < 1:2028103/289‑1 (MQ=255) cccGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTTTTTGCTGACTGTAATGCACCACAGCGGGTGATGGATGTCGGTGCCGCGCCTGGCTCCaaa > 2:1139311/1‑289 (MQ=255) gTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGGTAATGCACCACAGCGGGTGATGGATGTCGCTGCCGCGCCTGGCTCCAAAacg > 1:1086623/1‑289 (MQ=255) caTTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACACTGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCCATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGGTAATTCCCCACCGAGGGTGATGGATGTCGCTGCCGCCTCCGGCTCCCTAACGACCCCAATTTcc > 2:1681023/1‑289 (MQ=255) tagcctgaaTACGCTGCACATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGAGGCTTACGCCAATTGCGTGGTGTGAAGAAGTTTTCTGGCTTGAACGTGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTAACGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGGTAACGCACCACAGCGGGTGATGGATGTCGCTGCCGCGCCTGGCTCCAACACGACGCAAATTTCcgcg < 2:1010208/282‑1 (MQ=255) tCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGGTAATGCACCACAGCGGGTGATGGATGTCGCTGCCGCGCCTGGCTCCAAAACGACGCAAATTTCcgcg < 1:2344143/289‑1 (MQ=255) tCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGGTAATGCACCACAGCGGGTGATGGATGTCGCTGCCGCGCCTGGCTCCAAAACGACGCAAATTTCcgcg < 2:218670/289‑1 (MQ=255) gTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGGTAATGCACCACAGCGGGTGATGGATGTCGCTGCCGCGCCTGGCTCCAAAACGACGCAAATTTCCGCGCgg < 1:654669/288‑1 (MQ=255) aaTACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGGTAATGCACCACAGCGGGTGATGGATGTCGCTGCCGCGCCTGGCTCCAAAACGCCGCAAATTTCcgcg > 2:1300714/1‑282 (MQ=255) aaTACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGGTAATGCACCACAGCGGGTGATGGATGTCGCTGCCGCGCCTGGCTCCAAAACGACGCAAATTTCcgcg < 1:1300714/282‑1 (MQ=255) attcGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGGTAATGCACCACAGCGGGTGATGGATGTCGCTGCCGCGCCTGGCTCCAAAACGACGCAAATTTCCGCGCGGATGaa < 1:1845241/286‑1 (MQ=255) gCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTCAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGa > 1:1493820/1‑207 (MQ=255) cTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGGTa > 2:1347649/1‑211 (MQ=255) cTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGCGGTGTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGGTAATGCACCACAGCGGGTGATGGATGTCGCTGCCGCGCCTGGCTCCAAAACGACGCAAATTTCCGCGCGGa > 1:1010225/1‑280 (MQ=255) tGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGGTAATGCACCACAGCGGGTGATGGATGTCGCTGCCGCGCCTGGCTCCAAAACGACGCAAATTTCCGCGCGGATGAATAACGa < 1:1922123/289‑1 (MQ=255) aTCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGGTAATGCACCACAGCGGGTGATGGATGTCGCTGCCGCGCCTGGCTCCAAAACGACGCAAATTTCCGCGCGGATGAATAACGAAgggg < 2:627041/289‑1 (MQ=255) aTCTCAGTTGCGGATTTCCTGCACTTAACCGCGCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGGGGTGTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGGTAATGCACCACAGCGGGTGATGGATGTCGCTGCCGCGCCTGGCTCCAAAACGACGCAAATTTCCGCGCGGATGAATAACGAAgggg < 2:1540506/289‑1 (MQ=255) ttCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGGTAATGCACCACAGCGGGTGATGGATGTCGCTGCCGCGCCTGGCTCCAAAACGACGCAAATTTCCGCGCGGATGAATAACGAAGGGGCAATCCTTGCCAATg < 2:1969537/289‑1 (MQ=255) aTTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGGTAATGCACCACAGCGGGTGATGGATGTCGCTGCCGCGCCTGGCTCCAAAACGACGCAAATTTCcg < 2:2514803/245‑1 (MQ=255) tAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGGTAATGCACCACAGCGGGTGATGGATGTCGCTGCCGCGCCTGGCTCCAAAACGACGCAAATTTCCGCGCGGATGAATAACGAAGGGGCAATCCTTGCCAATGAGTTTTCCGc < 1:2383155/289‑1 (MQ=255) cccgtCCTTATGGCTTGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGGTAATGCACCACAGCGGGTGATGGATGTCGCTGCCGCGCCTGGCTCCAAAACGACGCAAATTTCCGCGCGGATGAATAACGAAGGGGCAATCCTTGCCAATGAGTTTTCCGCCAg < 2:2088719/285‑1 (MQ=255) gctgctTTTGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCTTGGTGTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGGTAATGCACCACAGCGGGTGATGGATGTCGCTGCCGCGCCTGGCTCCAAAACGACGCAAATTTCCGCGCGGATGAATAACGAAGGGGCAATCCTTGCCAATGAGTTTTCCGCCAGTc < 2:2648891/289‑1 (MQ=255) gCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGGTAATGCACCACAGCGGGTGATGGATGTCGCTGCCGCGCCTGGCTCCAAAACGACGCAAATTTCCGCGCGGATGAATAACGAAGGGGCAATCCTTGCCAATGAGTTTTCCGCCAGTc < 2:1822178/289‑1 (MQ=255) cTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGGTAATGCACCACAGCGGGTGATGGATGTCGCTGCCGCGCCTGGCTCCAAAACGACGCAAATTTCCGCGCGGATGAATAACGAAGGGGCAATCCTTGCCAATGAGTTTTCCGCCAGTCg > 1:373440/1‑289 (MQ=255) cTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGGTAATGCACCACAGCGGGTGATGGATGTCGCTGCCGCGCCTGGCTCCAAAACGACGCAAATTTCCGCGCGGATGAATAACGAAGGGGCAATCCTTGCCAATGAGTTTTCCGCCAGTCg > 2:2232356/1‑289 (MQ=255) tCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGa < 1:1176480/168‑1 (MQ=255) tCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGGTAATGCACCACAGCGGGTGATGGATGTCGCTGCCGCGCCTGGCTCCAAAACGACGCAAATTTCcgcg > 1:62275/1‑238 (MQ=255) cTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGGTAATGCACCACAGCGGGTGATGGATGTCGCTGCCGCGCCTGGCTCCAAAACGACGCAAATTTCCGCGCGGATGAATAACGAAGGGGCAATCCTTGCCAATGAGTTTTCCGCCAGTCGGGt < 2:2014072/289‑1 (MQ=255) cTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGGTAATGCACCACAGCGGGTGATGGATGTCGCTGCCGCGCCTGGCTCCAAAACGACGCAAATTTCCGCGCGGATGAATAACGAAGGGGCAATCCTTGCCAATGAGTTTTCCGCCAGTCGGGt < 2:710271/289‑1 (MQ=255) ggCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTCTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGGTAATGCACCACAGCGGGTGATGGATGTCGCTGCTGCGCCTGGCTCCAAAACGACGCCAATTTCCGCGCGGATGAATAACGAAGGGGCAATCCTTGCAAATTAGTTTTTCGCCAGTTGGGTAAAAg > 2:1403996/1‑289 (MQ=255) tGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGGTAATGCACCACAGCGGGTGATGGATGTCGCTGCCGCGCCTGGCTCCAAAACGACGCAAATTTCCGCGCGGATGAATAACGAAGGGGCAATCCTTGCCAATGAGTTTTCCGCCAGTCGGGTAAAAgtgt > 1:1821687/1‑289 (MQ=255) ggACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGGTAATGCACCACAGCGGGTGATGGATGTCGCTGCCGCGCCTGGCTCCAAAACGACGCAAATTTCCGCGCGGATGAATAACGAAGGGGCAATCCTTGCCAATGAGTTTTCCGCCAGTCGGGTAAAAgtgt < 2:1775067/288‑1 (MQ=255) gACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGGTAATGCACCACAGCGGGTGATGGATGTCGCTGCCGCGCCTGGCTCCAAACCGACGCCAATTTCCGCGCGGATGAATAACGAAGGGGCAATCCTTGCCAATGAGTTTTCCGCCATTCGGGTAAAAGGGTTa > 2:2423535/1‑289 (MQ=255) gACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGGTAATGCACCACAGCGGGTGATGGATGTCGCTGCCGCGCCTGGCTCCAAAACGACGCAAATTTCCGCGCGGATGAATAACGa < 2:1184175/240‑1 (MQ=255) gACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGGTAATGCACCACAGCGGGTGATGGATGTCGCTGCCGCGCCTGGCTCCAAAACGACGCAAATTTCCGCGCGGATGAATAACGAAGGGGCAATCCTTGCCAATGAGTTTTCCGCCAGTCGGGTAAAAGTGtt > 1:570685/1‑288 (MQ=255) gACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGGTAATGCACCACAGCGGGTGATGGATGTCGCTGCCGCGCCTGGCTCCAAAACGACGCAAATTTCCGCGCGGATGAATAACGAAGGGGCAATCCTTGCCAATGAGTTTTCCGCCAGTCGGGTAAAAGTGTTa > 1:729189/1‑289 (MQ=255) gACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGGTAATGCACCACAGCGGGTGATGGATGTCGCTGCCGCGCCTGGCTCCAAAACGACGCAAATTTCCGCGCGGATGAATAACGAAGGGGCAATCCTTGCCAATGAGTTTTCCGCCAGTCGGGTAAAAGTGTTa > 1:2673401/1‑289 (MQ=255) gACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGGTAATGCACCACAGCGGGTGATGGATGTCGCTGCCGCGCCTGGCTCCAAAACGACGCAAATTTCCGCGCGGATGAATAACGAAGGGGCAATCCTTGCCAATGAGTTTTCCGCCAGTCGGGTAAAAGTGTTa > 1:509401/1‑289 (MQ=255) aCGCTTACGCCAATTCCGTTGTGTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGGTAATGCACCACAGCGGGTGATGGATGTCGCTGCCGCGCCTGGCTCCAAAACGACGCAAATTTCCGCGCGGATGAATAACGAAGGGGCAATCCTTGCCAATGAGTTTTCCGCCAGTCGGGTAAAAGTGTTa < 1:2595599/288‑1 (MQ=255) aCGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGGTAATGCACCACAGCGGGTGATGGATGTCGCTGCCGCGcc > 1:2114741/1‑197 (MQ=255) aCGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGGTAATGCACCACAGCGGGTGATGGATGTCGCTGCCGCGCCTGGCTCCAAAACGACGCAAATTTCCGCGCGGATGAATAACGAAGGGGCAATCCTTGCCAATGAGTTTTCCGCCAGTCGGGTAAAAGTGTTa < 1:1151482/288‑1 (MQ=255) cGCTTACGCCAATTCCGTGGGGTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGGTAATGCACCACAGCGGGTGATGGATGTCGCTGCCGCGCCTGGCTCCAAAACGACGCAAATTTCCGCGCGGATGAATAACGAAGGGGCAATCCTTGCCAATGAGTTTTCCGCCAGTCGGGTAAAAGTGTTAc < 1:1381691/288‑1 (MQ=255) cGCCAATTCCGTGGTGTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGGTAATGCACCACAGCGGGTGATGGATGTCGCTGCCGCGCCTGGCTCCAAAACGACGCAAATTTCcgcgc < 1:847650/219‑1 (MQ=255) cGCCAATTCCGTGGTGTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGGTAATGCACCACAGCGGGTGATGGATGTCGCTGCCGCGCCTGGCTCCAAAACGACGCAAATTTCcgcgc > 2:847650/1‑219 (MQ=255) aTTCCGTGGTGTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGGTAATGCACCACAGCGGGTGATGGATGTCGCTGCCGCGCCTGGCTCCAAAACGACGCAAATTTCCGCGCGGATGAATAACGAAGGGGCAATCCTTGCCAATGAGTTTTCCGCCAGTCGGGTAAAAGTGTTACATg < 1:926542/280‑1 (MQ=255) ttCCGTGGTGTGAGGAAGGTTGCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGGAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATAGTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGGTAATGCACCACAGCGGGTGATGGATGTCGCTGCCGCGCCTGGCTCCAAAACGACGCAAATTTCCGCGCGGATGAATAACGAAGGGGCAATCCTTGCCAATGAGTTTTCCGCCAGTCGGGTAAAAGTGTTACATGCCAATATCAg < 1:2557150/289‑1 (MQ=255) tggtgTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGGTAATGCACCACAGCGGGTGATGGATGTCGCTGCCGCGCCTGGCTCCAAAACGACGCAAATTTCCGCGCGGATGAATAACGAAGGGGCAATCCTTGCCAATGAGTTTTCCGCCAGTCGGGTAAAAGTGTTACATGCCAATATCAGcc > 2:193617/1‑286 (MQ=255) tgAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGGTAATGCACCACAGCGGGt < 2:480612/153‑1 (MQ=255) tgAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGGTAATGCACCACAGCGGGt > 1:480612/1‑153 (MQ=255) gaagaaGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGAATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGATGACGGTAATGCACCACAGCGGGTGATGGATGTCGCTGCCGCGCCTGGCTCCAAAACGACGCAAATTTCCGCGCGGATGAATAACGAAGGGGCAATCCTTGCCAATGAGTTTTCCGCCAGTCGGGTAAAAGTGTTACATGCCAATATCAGCCGCTGTGGt < 1:2410004/288‑1 (MQ=255) agaagGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGGTAATGCACCACAGCGGGTGATGGATGTCGCTGCCGCGCCTGGCTCCAAAACGACGCAAATTTCCGCGCGGATGAATAACGAAGGGGCAATCCTTGCCAATGAGTTTTCCGCCAGTCGGGTAAAAGTGTTACATGCCAATATCAGCCGCTGTGGTATc > 1:1937066/1‑289 (MQ=255) gTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGGTAATGCACCACAGCGGGTGATGGATGTCGCTGCCGCGCCTGGCTCCAAAACGACGCAAATTTCCGCGCGGATGAATAACGAAGGGGCAATCCTTGCCAATGAGTTTTCCGCCAGTCGGGTAAAAGTGTTACATGCCAATATCAGCCGc > 1:780685/1‑275 (MQ=255) gTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGGTAATGCACCACAGCGGGTGATGGATGTCGCTGCCGCGCCTGGCTCCAAAACGACGCAAATTTCCGCGCGGATGAATAACGAAGGGGCAATCCTTGCCAATGAGTTTTCCGCCAGTCGGGTAAAAGTGTTACATGCCAATATCAGCCGc < 2:780685/275‑1 (MQ=255) ttCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGGTAATGCACCACAGCGGGTGATGGATGTCGCTGCCGCGCCTGGCTCCAAAACGACGCAAATTTCCGCGCGGATGAATAACGAAGGGGCAATCCTTGCCAATGAGTTTTCCGCCAGTCGGGTAAAAGTGTTACATGCCAATATCAGCCGCTGTGGTATCAGTAATg > 1:466465/1‑289 (MQ=255) gATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGGTAATGCACCACAGCGGGTGATGGATGTCGCTGCCGCGCCTGGCTCCAAAACGACGCAAATTTCCGCGCGGATGAATAACGAAGGGGCAATCCTTGCCAATGAGTTTTCCGCCAGTCGGGTAAAAGTGTTACATGCCAATATCAGCCGCTGTGGTATCAGTAATGTTgc > 1:1948163/1‑288 (MQ=255) ttGAATGGGACAATGAAGATGCATTGCCCTTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGGCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGGTAATGCACCACAGCGGGTGATGGATGTCGCTGCCGCGCCTGGCTCCAAAACGACGCAAATTTCCGCGCGGATGAATAACGAAGGGGCAATCCTTGCCAATGAGTTTTCCGCCAGTCGGGTAAAAGTGTTACATGCCAATATCAGCCGCTGTGGTATCAGTAATGTTGCGCt < 2:2565985/289‑1 (MQ=255) gAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGGTAATGCACCACAGCGGGTGATGGATGTCGCTGCCGCGCCTGGCTCCAAAACGACGCAAATTTCCGCGCGGATGAATAACGAAGGGGCAATCCTTGCCAATGAGTTTTCCGCCAGTCGGGTAAAAGTGTTACATg < 1:2572669/250‑1 (MQ=255) gAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGGTAATGCACCACAGCGGGTGATGGATGTCGCTGCCGCGCCTGGCTCCAAAACGACGCAAATTTCCGCGCGGATGAATAACGAAGGGGCAATCCTTGCCAATGAGTTTTCCGCCAGTCGGGTAAAAGTGTTACATg > 2:2572669/1‑250 (MQ=255) cgcgACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGGTAATGCACCACAGCGGGTGATGGATGTCGCTGCCGCGCCTGGCTCCAAAACGACGCAAATTTCCGCGCGGATGAATAACGAAGGGGCAATCCTTGCCAATGAGTTTTCCGCCAGTCGGGTAAAAGTGTTACATGCCAATATCAGCCGCTGTGGTATCAGTAATGTTGCGCTcacac < 1:2005368/289‑1 (MQ=255) gCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGGTAATGCACCACAGCGGGTGATGGATGTCGCTGCCGCGCCTGGCTCCAAAACGACGCAAATTTCCGCGCGGATGAATAACGAAGGGGCAATCCTTGCCAATGAGTTTTCCGCCAGTCGGGTAAAAGTGTTACATGCCAATATCAGCCGCTGTGGTATCAGTAATGTTGCGCTCACACATTTTGATGGCCGCGTGttt > 1:142315/1‑289 (MQ=255) gggTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGGTAATGCACCACAGCGGGTGATGGATGTCGCTGCCGCGCCTGGCTCCAAAACGACGCAAATTTCCGCGCGGATGAATAACGAAGGGGCAATCCTTGCCAATGAGTTTTCCGCCAGTCGGGTAAAAGTGTTAc < 2:813772/218‑1 (MQ=255) tagtaCCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGGTAATGCACCACAGCGGGTGATGGATGTCGCTGCCGCGCCTGGCTCCAAAACGACGCAAATTTCCGCGCGGATGAATAACGAAGGGGCAATCCTTGCCAATGAGTTTTCCGCCAGTCGGGTAAAAGTGTTACATGCCAATATCAGCCGCTGTGGTATCAGTAATGTTGCGCTCACACATTTTGATGGCCGCGTGTTTGGTGCGGc < 2:466465/288‑1 (MQ=255) aCCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGGTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGGTAATGCACCACAGCGGGTGATGGATGTCGCTGCCGCGCCTGGCTCCAAAACGACGCAAATTTCCGCGCGGATGAATAACGAAGGGGCAATCCTTGCCAATGAGTTTTCCGCCAGTCGGGTAAAAGTGTTACATGCCAATATCAGCCGCTGTGGTATCAGTAATGTTGCGCTCACACATTTTGATGGCCGCGTGTTTGGTGCGGCAGTGc < 1:1766878/289‑1 (MQ=255) cgccgAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGGTAATGCACCACAGCGGGTGATGGATGTCGCTGCCGCGCCTGGCTCCAAAACGACGCAAATTTCCGCGCGGATGAATAACGACGGGGCAATCCTTGCCAATGAGTTTTCCGCCAGTCGGGTAAAAGGGTTACATGCCAATAGCAGACGCTGTTGTATCCTTTATGTTGCGCCTACAACTTTTTATGGCCGCGTGTTTGTTGCGTCAGTGCCa > 2:2454059/1‑289 (MQ=255) ccgAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGGTAATGCACcaca > 2:273603/1‑88 (MQ=255) ccgAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGGTAATGCACCACAGCgg > 1:2236459/1‑92 (MQ=255) ccgAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGGTAATGCACCACAGCGGGTGATGGATGTCGCTGCCGCGCCTGGCTCCAAAACGACGCAAATTTCCGCGCgg > 2:1429332/1‑146 (MQ=255) ccgAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGGTAATGCACCACAGCGGGTGATGGATGTCGCTGCCGCGCCTGGCTCCAAAACGACGCAAATTTCCGCGCGGATGAATAACGAAGGGGCAATCCTTGCCAATGAGTTTTCCGCCAGTCGGGTAAAAGTGTTACATGCCAATATCAGCCGCTGTGGTAt < 2:1861241/232‑1 (MQ=255) ccgAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGGTAATGCACCACAGCGGGTGATGGATGTCGCTGCCGCGCCTGGCTCCAAAACGACGCAAATTTCCGCGCGGATGAATAACGAAGGGGCAATCCTTGCCAATGAGTTTTCCGCCAGTCGGGTAAAAGTGTTACATGCCAATATCAGCCGCTGTGGTAt > 2:1612497/1‑232 (MQ=255) ccgAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGGTAATGCACCACAGCGGGTGATGGATGTCGCTGCCGCGCCTGGCTCCAAAACGACGCAAATTTCCGCGCGGATGAATAACGAAGGGGCAATCCTTGCCAATGAGTTTTCCGCCAGTCGGGTAAAAGTGTTACATGCCAATATCAGCCGCTGTGGTATCAGTAATGTTGCGCTCACACATTTTGATGGCCGCGTGTTTGGTGCGGCAGTGCCAGa > 1:2220481/1‑289 (MQ=255) ccgAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGGTAATGCACCACAGCGGGTGATGGATGTCGCTGCCGCGCCTGGCTCCAAAACGACGCAAATTTCCGCGCGGATGAATAACGAAGGGGCAATCCTTGCCAATGAGTTTTCCGCCAGTCGGGTAAAAGTGTTACATGCCAATATCAGCCGCTGTGGTATCAGTAATGTTGCGATCACACATTTTGATGGCCGCGTGTTTGGTGCGGCAGTGCCAGa > 1:2718752/1‑289 (MQ=255) ccgAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGGTAATGCACCACAGCGGGTGATGGATGTCGCTGCCGCGCCTGGCTCCAAAACGACGCAAATTTCCGCGCGGATGAATAACGAAGGGGCAATCCTTGCCAATGAGTTTTCCGCCAGTCGGGT‑‑AAGTGTTACATGCCAATATCAGCCGCTGTGGTATCAGTAATGTTGCGCTCACACATTTTGATGGCCGCGTGTTTGGTGCGGCAGTGCCAGaaa > 1:1025640/1‑289 (MQ=255) ccgAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGGTAATGCACCACAGCGGGTGATGGATGTCGCTGCCGCGCCTGGCTCCAAAACGACGCAAATTTCCGAGCGGATGAATAACGAAGGGGCAATCCGTGCCAATGAGTTTTCCGCCAGTCGGGTAAAAGTGTTACATGCCAAGATCAGCCGCTGTGGCATCAGTAATGTTGCGTTCATTCATTTTGAGTGCCGCGCGTTTtgtggcgccgtcaccag > 2:2313720/1‑276 (MQ=255) gCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGGTAATGCACCACAGCGGGTGATGGATGTCGCTGCCGCGCCTGGCTCCAAAACGACGCAAATTTCCGCGCGGATGAATAACGAAGGGGCAATCCTTGCCAATGAGTTTTCCGCCAGTc > 1:2484729/1‑177 (MQ=255) gCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGGTAATGCACCACAGCGGGTGATGGATGTCGCTGCCGCGCCTGGCTCCAAAACGACGCAAATTTCCGCGCGGATGAATAACGAAGGGGCAATCCTTGCCAATGAGTTTTCCGCCAGTCGGGt < 2:90091/181‑1 (MQ=255) gCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGGTAATGCACCACAGCGGGTGATGGATGTCGCTGCCGCGCCTGGCTCCAAAACGACGCAAATTTCCGCGCGGATGAATAACGAAGGGGCAATCCTTGCCAATGAGTTTTCCGCCAGTCGGGt > 1:90091/1‑181 (MQ=255) gCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGGTAATGCACCACAGCGGGTGATGGATGTCGCTGCCGCGCCTGGCTCCAAAACGACGCAAATTTCCGCGCGGATGAATAACGAAGGGGCAATCCTTGCCAATGAGTTTTCCGCCAGTCGGGTAAAAGTGTTACATGCCAATATCAGCCGCTGTGGTATCAGTAATGTTGCGCTCACACATTTTGATGGCCGCGTGTTTGGTGCGGCAGTGCCAGAAATGTTCGATGCCAt > 1:1587731/1‑289 (MQ=255) gCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGGTAATGCACCACAGCGGGTGATGGATGTCGCTGCCGCGCCTGGCTCCAAAACGACGCAAATTTCCGCGCGGATGAATAACGAAGGGGCAATCCTTGCCAATGAGTTTTCCGCCAGTCGGGTAAAAGTGGTACATGCCAATATCAGCCGCTGTGGTATCAGTAATGTTGCGCTCACACATTTTGATGGGCGCGTGTTTGGTTGGGCAGGGCCGGAAAGGtt > 2:2384441/1‑280 (MQ=255) tGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGGTAATGCACCACAGCGGGTGATGGATGTCGCTGCCGCGCCTGGCTCCAAAACGACGCAAATTTCCGCGCGGATGAATAACGAAGGGGCAATCCTTGCCAATGAGTTTTCCGCCAGTCGGGTAAAAGTGTTACATGCCAATATCAGCCGCTGTGGTATCAGTCATGTTGCGCTCACTCTTTTTGATGGCCGCGTTCTTGGGTCGGTAGTGCCTGAAATGTTCGATGCCAttgt > 2:2552988/1‑287 (MQ=255) tGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGGTAATGCACCACAGCGGGTGATGGATGTCGCTGCCGCGCCTGGCTCCAAAACGACGCAAATTTCCGCGCGGATGAATAACGAAGGGGCAATCCTTGCCAATGAGTTTTCCGCCAGTCGGGTAAAAGTGTTACATGCCAATATCAGCCGCTGTGGTATCAGTAATGTTGCGCTCACACATTTTGATGGCCGCGTGTTTGGTGCGGCAGTGCCAGAAATGTTCGATGCCAtttt > 1:1192488/1‑289 (MQ=255) gTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTGGTTTGCTGACGGTAATGCACCACAGCGGGTGATGGATGTCGCTGCCGCGCCTGGCTCCAAAACGACGCAAATTTCCGCGCGGATGAATAACGAAGGGGCAATCCTTGCCAATGAGTTTTCCGCCAGTCGGGTAAAAGTGTTACATGCCAATATCAGCCGCTGTGGTATCAGTAATGTTGCGCTCACACATTTTGATGGCCGCGTGTTTGGTGCGGCAGTGCCAGAAATGTTCGATGCCATTTTg < 1:291184/289‑1 (MQ=255) tataTTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGGTAATGCACCACAGCGGGTGATGGATGTCGCTGCCGCGCCTGGCTCCAAAACGACGCAAATTTCCGCGCGGATGAATAACGAAGGGGCAATCCTTGCCAATGAGTTTTCCGCCAGTCGGGTAAAAGTGTTACATGCCAATAACAGCCGCTGTGGTATCAGTAATTTTGCGCTCACACATTTTGATGGCCGCGTGTTTGGTGCGGCAGTGCCAGATATGTTAGATGCCATTTTTCTgt > 2:570126/1‑288 (MQ=255) atgttCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGGTAATGCACCACAGCGGGTGATGGATGTCGCTGCCGCGCCTGGCTCAAAAACGACGCAAATTTCCGCGCGGATGAATAACGAAGGGGCAATCCTTGCCAATGAGGTTTCCGCCAGTCGGGTAAAAGTGTTACATGCCAATATCAGCCGCTGTGGTATCAGTAATGTTGCGCTCACACATTTTGATGGCCGCGTGTTTGGTGCGGCAGTGCCAGAAATGTTCGATGCCATTTTGCTGGa < 1:682297/286‑1 (MQ=255) aGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGGTAATGCACCACAGCGGGTGATGGATGTCGCTGCCGCGCCTGGCTCCAAAACGACGCAAATTTCCGCGCGGATGAATAACGAAGGGGCAATCCTTGCCAATGAGTTTTCCGCCAGTCGGGTAAAAGTGTTACATGCCAATATCAGCCGCTGTGGTCTCAGTAATGTTGCGCTCACCTATTTTGATGGGCGCGTGTTGGGTGCGGGAGGGCCAGGAAGGGTCGTTGCTCttttcgtggtcgtgc > 2:2240216/1‑277 (MQ=255) aGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGGTAATGCACCACAGCGGGTGATGGATGTCGCTGCCGCGCCTGGCTCCAAAACGACGCAAATTTCCGCGCGGATGAATAACGAAGGGGCAATCCTTGCCAATGAGTTTTCCGCCAGTCGGGTAAAAGTGTTACATGCCAATATCAGCCGCTGTGGTATCAGTAATGTTGCGCTCACACATTTTGATGGCCGCGTGTTTGGTGCGGCAGTGCCAGAAATGTTCGATg < 1:944639/270‑1 (MQ=255) aGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGGTAATGCACCACAGCGGGTGATGGATGTCGCTGCCGCGCCTGGCTCCAAAACGACGCAAATTTCCGCGCGGATGAATAACGAAGGGGCAATCCTTGCCAATGAGTTTTCCGCCAGTCGGGTAAAAGTGTTACATGCCAATATCAGCCGCTGTGGTATCAGTAATGTTGCGCTCACACATTTTGATGGCCGCGTGTTTGGTGCGGCAGTGCCAGAAATGTTCGATGCCATTTTGCTGGACGCTc > 2:837453/1‑288 (MQ=255) aGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGGTAATGCACCACAGCGGGTGATGGATGTCGCTGCCGCGCCTGGCTCCAAAACGACGCAAATTTCCGCGCGGATGAATAACGAAGGGGCAATCCTTGCCAATGAGTTTTCCGCCAGTCGGGTAAAAGTGTTACATGCCAATATCAGCCGCTGTGGTATCAGTAATGTTGCGCTCACACATTTTGATGGCCGCGTGTTTGGTGCGGCAGTGCCAGAAATGTTCGATGCCATTTTGCTGGACGCTc > 2:1013280/1‑288 (MQ=255) aGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGGTAATGCACCACAGCGGGTGATGGATGTCGCTGCCGCGCCTGGCTCCAAAACGACGCAAATTTCCGCGCGGATGAATAACGAAGGGGCAATCCTTGCCAATGAGTTTTCCGCCAGTCGGGTAAAAGTGTTACATGCCAATATCAGCCGCTGTGGTATCAGTAATGTTGCGCTCACACATTTTGATGGCCGCGTGTTTGGTGCGGCAGTGCCAGAAATGTTCGATGCCATTTTGCTGGACGCTc > 2:2304027/1‑288 (MQ=255) aGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGGTAATGCACCACAGCGGGTGATGGATGTCGCTGCCGCGCCTGGCTCCAAAACGACGCAAATTTCCGCGCGGATGAATAACGAAGGGGCAATCCTTGCCAATGAGTTTTCCGCCAGTCGGGTAAAAGTGTTACATGCCAATATCAGCCGCTGTGGTATCAGTAATGTTGCGCTAACACATTTTGATGGCCGCGTGTTTGGTGCGGCAGTGCCAGAAATTTTCGATGCCATTTTGCTGGACGCTc > 1:1607473/1‑288 (MQ=255) gAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGGTAATGCACCACAGCGGGTGATGGATGTCGCTGCCGCGCCTGGCTCCAAAACGACGCAAATTTCCGCGCGGATGAATAACGAAGGGGCAATCCTTGCCAATGAGTTTTCCGCCAGTCGGGTAAAAGTGTTACATGCCAATATCAGCCGCTGTGGTATCAGTAATGTTGCGCTCACACATTTTGATGGCCGCGTGTTTGGTGCGGCAGTGCCAGAAATGTTCGATGCCATTTTGCTGGACGCTc > 1:2509010/1‑286 (MQ=255) ||| GCCTTTCTGACACAAATGCGCGAAGCGATGCCTAGCACGCTCAGTTTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTGAAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTAGTATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGGTAATGCACCACAGCGGGTGATGGATGTCGCTGCCGCGCCTGGCTCCAAAACGACGCAAATTTCCGCGCGGATGAATAACGAAGGGGCAATCCTTGCCAATGAGTTTTCCGCCAGTCGGGTAAAAGTGTTACATGCCAATATCAGCCGCTGTGGTATCAGTAATGTTGCGCTCACACATTTTGATGGCCGCGTGTTTGGTGCGGCAGTGCCAGAAATGTTCGATGCCATTTTGCTGGACGCTCC > CP042583/1600972‑1601528 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |