Predicted mutation | ||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.98e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,675,159 | 0 | T | A | 99.6% | 598.4 / NA | 251 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base A (126/124); minor base G (0/1); total (126/125) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.98e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 251 total aligned reads displayed.
TGGTTTGACTGAGCGTAACCTGATTCTGACCCAGTAATGCATTAATTGGCGTTCTAAGTTCATGAGCGAGATCGTCAGCAAACTGACTTAGACGCTCAAAATCTTTGACTAAAGCATGATGCATTTTATTCAACGCCTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACACTGCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCACTAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAAACTTGGGCTAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAAT > CP042583/1674880‑1675435 ||| gACTGAGCGTAACCTGATTCTGACCCAGTAATGCATTAATTGGCGTTCTAAGTTCATGAGCGAGATCGTCAGCAAACTGACTTAGACGCTCAAAATCTTTGACTAAAGCATGATGCATTTTATTCAACGCCTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGc < 1:884502/289‑1 (MQ=255) 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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |