| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP042583 | 1,675,232 | 3 bp→TGA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP042583 | 1,675,232 | 0 | A | T | 99.7% | 732.0 / NA | 304 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base T (160/142); total (161/143) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| * | CP042583 | 1,675,233 | 0 | C | G | 99.7% | 727.0 / NA | 304 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base G (161/142); minor base T (0/1); total (161/143) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.70e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| * | CP042583 | 1,675,234 | 0 | T | A | 99.7% | 733.1 / NA | 304 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base A (161/142); minor base C (0/1); total (161/143) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.70e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 304 total aligned reads displayed.
ACTGACTTAGACGCTCAAAATCTTTGACTAAAGCATGATGCATTTTATTCAACGCCTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACACTGCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCACTAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAAACTTGGGCTAACTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGATATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATCAATTAACA > CP042583/1674961‑1675512 ||| gACTTAGACGCTCAAAATCTTTGACTAAAGCATGATGCATTTTATTCAACGCCTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGt < 2:1970494/289‑1 (MQ=255) cTTAGACGCTCAAAATCTTTGACTAAAGCATGATGCATTTTATTCAACGCCTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTaa < 2:1690042/289‑1 (MQ=255) aaGCATGATGCATTTTATTCAACGCCTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAACTtcatc > 1:143637/1‑289 (MQ=255) tgCATTTTATTCAACGCCTGCCCAAGAGGTTTTAGATCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAACTTCATCAATATTaa > 1:1768377/1‑289 (MQ=255) aTTCAACGCCTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAACTTCATCAATATTAATTCGTaaa < 1:1072120/289‑1 (MQ=255) aTTCAACGCCTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAACTTCATCAATATTAATTCGTaaa < 2:1552843/289‑1 (MQ=255) tGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAACTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCatctatct < 1:1564049/289‑1 (MQ=255) ggTTTTAGTTCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAACTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATc < 2:261368/287‑1 (MQ=255) gTTTTAGTTCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTATGGATCTCCAAACTACATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCAtt > 2:2112127/1‑289 (MQ=255) tttAGTTCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAACTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATtaa > 1:652165/1‑289 (MQ=255) ctcGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAACTTCATCAATATTAATTCGTa > 1:916687/1‑256 (MQ=255) aTGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAACTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAAt < 2:652165/289‑1 (MQ=255) tAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAACTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCa > 2:1911766/1‑287 (MQ=255) aCCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCca < 1:1344531/196‑1 (MQ=255) aCCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAACTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCt > 1:1409377/1‑288 (MQ=255) aCCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAACTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCt > 2:1295884/1‑288 (MQ=255) aaCAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAACTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTg > 1:2635908/1‑289 (MQ=255) catgCTCTCTGCTATCGTTATAATTAAGCTCTTCCCTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAACTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGAt < 2:1033568/286‑1 (MQ=255) gCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAACTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTg > 1:348134/1‑288 (MQ=255) gCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAACTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTg > 1:2378765/1‑288 (MQ=255) tctcGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAACTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGtc > 2:1843024/1‑288 (MQ=255) tATCGTTATAATTCAGCGATTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAACTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAg < 2:1768377/288‑1 (MQ=255) tCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAACTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAg < 2:2265425/289‑1 (MQ=255) aGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAACTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCatctat < 2:1316071/218‑1 (MQ=255) cgcTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAACTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCat > 1:1194038/1‑212 (MQ=255) cgcTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAACTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTa < 2:14519/278‑1 (MQ=255) acacCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAACTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATc > 2:1133207/1‑287 (MQ=255) cTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAg > 2:1427903/1‑142 (MQ=255) cTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAACTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAg < 1:1937338/235‑1 (MQ=255) cTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAACTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACAt > 1:2129158/1‑289 (MQ=255) cTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAACTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACAt > 2:1509319/1‑289 (MQ=255) cTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAACTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACAt > 1:940742/1‑289 (MQ=255) cTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAACTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTc < 2:348134/289‑1 (MQ=255) cTTTTTAATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTACAACTAAGCAAAGTAAAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCGATTAATTTTATACTGTTAAAGAATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAACTTCATAAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTTTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTc < 1:1034093/289‑1 (MQ=255) aTCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAACTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTAtt < 2:2212738/289‑1 (MQ=255) aTCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAACTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTAtt < 2:939304/289‑1 (MQ=255) tCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAACTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTg > 2:1974342/1‑289 (MQ=255) gTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAACTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCatctat < 2:276807/173‑1 (MQ=255) gTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAACTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACaa > 1:1524421/1‑277 (MQ=255) gTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAACTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACaa < 2:1524421/277‑1 (MQ=255) gTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAACTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGAt > 2:761285/1‑287 (MQ=255) gTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAACTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGAt > 2:1086832/1‑287 (MQ=255) ttAACAGCGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAACTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCAcc < 1:1911766/289‑1 (MQ=255) ttAACAGCGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAACTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTACTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCAcc < 2:1743893/289‑1 (MQ=255) cGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAACTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCat < 1:439686/155‑1 (MQ=255) cGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAACTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCat > 2:439686/1‑155 (MQ=255) gtaCTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAACTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGaataa < 1:1426922/287‑1 (MQ=255) gACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAACTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGaataat > 2:266658/1‑289 (MQ=255) gACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAACTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGaataa > 1:320182/1‑288 (MQ=255) ctgagCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAACTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGATATc < 1:1742600/285‑1 (MQ=255) gagCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAACTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTa > 1:2471179/3‑208 (MQ=255) gagCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAACTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGATATCCt > 2:1395319/3‑289 (MQ=255) agCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAACTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCtt < 1:2527813/166‑1 (MQ=255) agCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAACTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAACATATCTTg > 2:2085746/2‑289 (MQ=255) gCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAACTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGATATCCTg > 2:476559/1‑288 (MQ=255) cAAAGTCCAATTGGTACAATTCACATTATAATGCTATTAATTTTCTACTGTTCAAGCATGTTATGTTAGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGAGAAACTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGATATCCTGAc < 2:812684/289‑1 (MQ=255) aGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAACTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGATATCCTGACTa > 1:991185/1‑288 (MQ=255) aGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAACTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGATATCCTGACTa > 1:80651/1‑288 (MQ=255) aaTGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAACTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTAt > 1:689693/1‑254 (MQ=255) aaTGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAACTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTAt < 2:689693/254‑1 (MQ=255) cGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAACTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGATATCCTGACTAACATtcatca > 1:2213969/1‑288 (MQ=255) aCAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAACTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCatc > 2:2553649/1‑125 (MQ=255) aCAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAACTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGtct < 2:1737963/178‑1 (MQ=255) cAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAACTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGATATCCTGACTAACATCCATCATcc < 1:1509319/288‑1 (MQ=255) aaTGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAACTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGATATCCTGACTAACATCCATCATCCgg < 1:566049/289‑1 (MQ=255) aaTGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAACTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGATATCCTGACTAACATCCATCATCCgg < 2:2129158/289‑1 (MQ=255) gCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAACTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGATATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTa < 1:1972883/289‑1 (MQ=255) gCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAACTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGATATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTa < 1:761285/289‑1 (MQ=255) aaaTTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAACTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACaa < 1:788429/225‑1 (MQ=255) aaaTTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAACTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACaa > 2:788429/1‑225 (MQ=255) taATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAACTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGATATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTacac < 1:1314107/289‑1 (MQ=255) aaTGCTATTAATTTTATACTGTTCATGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAACTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGATATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTAcaca > 1:2693119/1‑289 (MQ=255) aaTGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAACTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGATATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTaca > 1:2663874/1‑287 (MQ=255) tATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAACTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGATATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTaa < 1:1090617/289‑1 (MQ=255) tATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAACTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGATATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTaa < 1:2717247/289‑1 (MQ=255) ttAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAACTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCa < 2:2342323/186‑1 (MQ=255) ttAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAACTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCa > 1:2342323/1‑186 (MQ=255) ttAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAACTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAAt < 1:1666652/212‑1 (MQ=255) ttAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAACTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGATATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACg > 2:2647217/1‑289 (MQ=255) aaTTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAACTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGATATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTa < 2:1929144/289‑1 (MQ=255) ttCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAACTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTaa < 1:362010/165‑1 (MQ=255) ttCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAACTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTaa > 2:362010/1‑165 (MQ=255) ttCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAACTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATg < 2:2226043/208‑1 (MQ=255) ttCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAACTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATg > 1:2226043/1‑208 (MQ=255) ttCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAACTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTa > 2:601910/1‑211 (MQ=255) ttCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAACTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGa < 2:2702393/220‑1 (MQ=255) ttCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAACTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGATATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTAc > 1:897877/1‑288 (MQ=255) ttCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAACTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGATATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTAc > 1:433997/1‑288 (MQ=255) ttCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAACTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGATATCCTGACTAAAATCCATCATCCGGTTAAAGTAAACATGTAACGTACCTGGACTTAc > 2:1365942/1‑288 (MQ=255) atcATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAACTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGATATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCAt < 2:2421480/287‑1 (MQ=255) aGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAACTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGATATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCAt < 2:2498192/289‑1 (MQ=255) aTGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAACTTCATCAATATTAATTCGTCAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATTCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGATATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATCaa < 1:2039167/289‑1 (MQ=255) tGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAACTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGATATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATCAAt > 2:912005/1‑289 (MQ=255) ttATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAACTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAGTCAAGATATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAAc > 1:1854058/1‑264 (MQ=255) ttATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAACTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGATATc < 1:1022711/224‑1 (MQ=255) ttATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAACTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGATATc < 1:1485691/224‑1 (MQ=255) ttATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAACTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGATATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATCAATTa > 2:1624496/1‑289 (MQ=255) ttATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAACTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGATATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATCAATTa > 2:547054/1‑289 (MQ=255) tGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAACTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGATATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATCAATTaaca < 1:256496/289‑1 (MQ=255) tGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAACTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGATATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGACTTACCCCATCAATTaaca < 1:521946/289‑1 (MQ=255) ||| ACTGACTTAGACGCTCAAAATCTTTGACTAAAGCATGATGCATTTTATTCAACGCCTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACACTGCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCACTAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAAACTTGGGCTAACTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGATATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATCAATTAACA > CP042583/1674961‑1675512 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |