| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP042583 | 1,675,262 | 3 bp→TGA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP042583 | 1,675,262 | 0 | A | T | 99.7% | 793.1 / NA | 327 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (167/159); minor base G (1/0); total (168/159) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| * | CP042583 | 1,675,263 | 0 | C | G | 100.0% | 787.4 / NA | 327 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (168/159); total (168/159) | |||||||||||
| * | CP042583 | 1,675,264 | 0 | T | A | 99.7% | 791.0 / NA | 327 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base A (167/159); minor base C (1/0); total (168/159) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 327 total aligned reads displayed.
AAGCATGATGCATTTTATTCAACGCCTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACACTGCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCACTAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAAACTTGGGCTAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGATATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATCAATTAACAACTGCTTGATCTGCGCTGTCCGGTTAAT > CP042583/1674991‑1675540 ||| aaGCATGATGCATTTTATTCAACGCCTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTtcatc > 1:143637/1‑289 (MQ=255) aGCATGATGCATTTTATTCAACGCCTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGTCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTtcatca > 2:1742600/1‑289 (MQ=255) tgCATTTTATTCAACGCCTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTa < 2:1209328/288‑1 (MQ=255) aaCGCCTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCa > 1:2677742/1‑288 (MQ=255) tGCCCAATAGGTTTTAGTTCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAAAAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCTTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCatctatct < 2:2105607/289‑1 (MQ=255) tGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCatctatct < 1:1564049/289‑1 (MQ=255) cctataagtttttAGTACTCTCGGTAAGGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATctct < 2:1539442/280‑1 (MQ=255) gagGTTTTAGTTCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCatcta > 1:1301041/1‑279 (MQ=255) tttAGTTCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATtaa > 1:652165/1‑289 (MQ=255) tAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCa > 2:1911766/1‑287 (MQ=255) aCCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGt < 2:1571277/257‑1 (MQ=255) aCCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCt > 1:1409377/1‑288 (MQ=255) aaCAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTg > 1:2635908/1‑289 (MQ=255) ctctcacacaTCGTTCTAATTCTGCGCTTCCGTTACACCAGTTAACTCTTTGACCTCACGTAGTCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACAGAGCAAAGTACAATGGCGACAATGAGAATTATAATGCTATTAATTTCCTACTGTTCCATCAAGTTATGTCTGGCGGCAGACACTTTAGCCACACTAACCGTTAATGAT‑TGCTAACCTTCATCAACATTAATTCGTGAAGCACCTCTCGCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTCATTGt < 2:1763447/279‑1 (MQ=255) tctcGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGtc > 2:1843024/1‑288 (MQ=255) tCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAg < 2:2265425/289‑1 (MQ=255) aaTTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCAtt > 1:315534/1‑235 (MQ=255) aaTTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAACGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCAtt < 2:315534/235‑1 (MQ=255) cgcTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATTCCAGCTGCGCGGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAAc > 2:1726931/1‑289 (MQ=255) cgcTTCCGTTACACCACGCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCGATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAAc > 2:2191529/1‑289 (MQ=255) acacCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATc > 2:1133207/1‑287 (MQ=255) cacccataaaCTGTTTGATCTCTCGTAATCCCGTGCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTACATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACt < 2:1441450/281‑1 (MQ=255) cTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAg < 1:1937338/235‑1 (MQ=255) cTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAg > 2:1937338/1‑235 (MQ=255) cTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTACTTAACATGCCATCACTGACAt > 1:1743893/1‑289 (MQ=255) ctcGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAAt > 1:1915267/1‑289 (MQ=255) tcGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAAtt > 2:693878/1‑289 (MQ=255) aTCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTAtt < 2:939304/289‑1 (MQ=255) gTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACaa > 1:1524421/1‑277 (MQ=255) gTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGAt > 2:761285/1‑287 (MQ=255) gtAACAGCGTACTTAATACTAGGCAAAGTACAATGGCGAAAATTCAATTTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTATCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATGTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATTTTATTTACCATGCTATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCAcc < 2:2439194/288‑1 (MQ=255) cGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCatc > 1:217024/1‑156 (MQ=255) cGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCat < 1:439686/155‑1 (MQ=255) cGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCat > 2:439686/1‑155 (MQ=255) cGGACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTa > 1:979729/1‑221 (MQ=255) ggACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGaataa < 1:2112127/289‑1 (MQ=255) gACTTAATACTGAGCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTa > 1:1392129/1‑219 (MQ=255) taatactgagCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAg < 1:1133207/280‑1 (MQ=255) taatactgagCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAg < 1:343186/280‑1 (MQ=255) aatactgagCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCAc < 2:1515086/227‑1 (MQ=255) gagCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTTAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTa > 1:925156/3‑173 (MQ=255) gagCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGt < 1:1040190/192‑1 (MQ=255) gagCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGt > 2:1040190/3‑194 (MQ=255) gagCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTa > 1:2471179/3‑208 (MQ=255) gagCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGatat > 1:2222657/3‑286 (MQ=255) agCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCtt > 2:2527813/2‑167 (MQ=255) gCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGATATCCTg > 2:1314107/1‑288 (MQ=255) gCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGATATCCTg > 2:476559/1‑288 (MQ=255) aaTGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTAt > 1:689693/1‑254 (MQ=255) tGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGATATCCTGACTAAcatccat > 2:669916/1‑289 (MQ=255) aCAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGtct > 1:1737963/1‑178 (MQ=255) aCAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGt > 2:358763/1‑189 (MQ=255) aCAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCTCCATGAATAATCAAGATATCCTGACTAACATCCATCATcc > 1:903573/1‑289 (MQ=255) aCAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGATATCCTGACTAACATCCATCATcc > 1:2542803/1‑289 (MQ=255) aaTGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGTTTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCACGATATCCTGACTAACATCCATCATCCgg < 1:795482/289‑1 (MQ=255) aaTGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGATATCCTGACTAACATCCATCATCCgg < 2:2122230/289‑1 (MQ=255) aaTGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGATATCCTGACTAACATCCATCATCCgg < 1:566049/289‑1 (MQ=255) gCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGATATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTa < 1:761285/289‑1 (MQ=255) gCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGATATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTa < 1:1972883/289‑1 (MQ=255) ttATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGATATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTa < 1:2715728/289‑1 (MQ=255) ataATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGATATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTaca < 1:2334585/289‑1 (MQ=255) tGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGATATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTa < 2:268591/283‑1 (MQ=255) ttAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTa < 1:1491801/169‑1 (MQ=255) ttAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAAt < 1:1666652/212‑1 (MQ=255) ttAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAAt > 2:1666652/1‑212 (MQ=255) ttCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTaa < 1:362010/165‑1 (MQ=255) ttCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTAtt > 1:893914/1‑204 (MQ=255) ttCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTAtt < 2:893914/204‑1 (MQ=255) ttCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATg < 2:2226043/208‑1 (MQ=255) ttCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTa > 2:601910/1‑211 (MQ=255) ttCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGa < 2:2702393/220‑1 (MQ=255) ttCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGa < 2:1415902/220‑1 (MQ=255) ttCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGa > 1:1415902/1‑220 (MQ=255) ttCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGATATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTa < 1:2397213/264‑1 (MQ=255) ttCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGATATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTAc > 1:433997/1‑288 (MQ=255) ttCAAGCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGATATCCTGACTAAAATCCATCATCCGGTTAAAGTAAACATGTAACGTACCTGGACTTAc > 2:1365942/1‑288 (MQ=255) gCATGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGATATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATc > 2:19767/1‑289 (MQ=255) tGTTATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGATATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATCAAt > 2:912005/1‑289 (MQ=255) ttATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAGTCAAGATATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAAc > 1:1854058/1‑264 (MQ=255) ttATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGATATc < 1:1022711/224‑1 (MQ=255) ttATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGATATc > 2:1022711/1‑224 (MQ=255) ttATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGATATc > 2:1485691/1‑224 (MQ=255) ttATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGATATCCTGACTAACATCcatca < 2:2357270/241‑1 (MQ=255) ttATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGATATCCTGACTAACATCcatca > 1:2357270/1‑241 (MQ=255) ttATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGATATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATCAATTa > 2:2660210/1‑289 (MQ=255) ttATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGATATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATCAATTa > 2:2619014/1‑289 (MQ=255) ttATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGATATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATCAATTa > 2:547054/1‑289 (MQ=255) ttATGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGATATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATCAATTa > 1:1082054/1‑289 (MQ=255) aTGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGATATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATCAATTaac < 1:178195/289‑1 (MQ=255) tGTCTGGCTGAAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGATATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATCAATTaaca < 1:256496/289‑1 (MQ=255) tctggctgaaGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGATATCCTGa < 2:139929/214‑1 (MQ=255) tggctgaaGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGATATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATCAATTAACAACt > 1:1339759/8‑288 (MQ=255) ggctgaaGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGATATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTaca < 2:2034687/242‑1 (MQ=255) gctgaaGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGATATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTaaa < 2:2564546/237‑1 (MQ=255) gctgaaGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGATATCCTGAC‑AACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATCAATTAACAACTGCtt > 1:489883/6‑289 (MQ=255) gCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGaa > 2:1924606/1‑196 (MQ=255) aGCCACAGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGATATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATCAATTAACAACTGCTTGATCTGCGCTGTc < 2:784726/289‑1 (MQ=255) aGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGATATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTaa < 1:1474172/234‑1 (MQ=255) aGTAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGATATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCAt > 1:1986684/1‑254 (MQ=255) tAACCGTTAATGATGGCGAAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGATATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATCAATTAACAACTGCTTGATCTGCGCTGTCCGGTTAAt < 2:378810/289‑1 (MQ=255) ||| AAGCATGATGCATTTTATTCAACGCCTGCCCAAGAGGTTTTAGTTCTCTCGGTAATGCGCTAACCTCAACAGGCTCTCGGCTATCGTTATAATTCAGCGCTTCCGTTACACCACTCAACTTTTTGATCTCTCGTAATCCCGTTCTGATTAACAGCGGACTTAATACACTGCAAAGTACAATGGCGACAATGCAAATTATAATGCTATTAATTTTATACTGTTCAAGCATGTTATGTCTGGCACTAGCCAATTTAGCCACAGTAACCGTTAAACTTGGGCTAA‑CTTCATCAATATTAATTCGTAAAGCATCTATCTCTGTATCATTAATAATGCTTCTGTAAATGCCAGCTGCGCTGATTGTCTCACTAGCAGGTATGTTATTTAACATGCCATCACTGACATTTGTCCGGTTAACAATTTTATTGATGCTATCACCATGAATAATCAAGATATCCTGACTAACATCCATCATCCGGTTAAAGTACACAGGTAACGTATCTGGATTTACCCCATCAATTAACAACTGCTTGATCTGCGCTGTCCGGTTAAT > CP042583/1674991‑1675540 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |