| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP042583 | 1,675,978 | 3 bp→TGA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP042583 | 1,675,978 | 0 | A | T | 100.0% | 864.7 / NA | 356 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base T (185/171); total (185/171) | |||||||||||
| * | CP042583 | 1,675,979 | 0 | C | G | 99.7% | 847.6 / NA | 356 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); new base G (185/169); total (185/171) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.79e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| * | CP042583 | 1,675,980 | 0 | T | A | 100.0% | 861.3 / NA | 356 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base A (185/171); total (185/171) | |||||||||||
Only 100 of 356 total aligned reads displayed.
ATAGCCCATCCCCCGGATTGTGGCAATTAGCTTTTCAGGAAAAGGATCATCAACTTTTGCGCGGAGCCTGCGAATGGCGACGTCCACCGTATTGGTATCACTATCAAAGTTGATTCCCCAAATTTCACTCGCAATAACCGTTCTGGGTATAATTTCGCCAGCTCTGGAGGCCAGTAGCCAAAGTAACTGAAACTCCTTGCGCGTCAGTGTAATACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTACTATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAAACTAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAACGTTTGTAAGATCTGCCAGCCATCCATACCCGGAAGCATAATATCCAGAATGATCAATGCATAATCATCCTTCAGCGCAAGATAAAGCCCATCTCTGCCATCAGAAA > CP042583/1675699‑1676258 ||| cccATCCCCCGGATTGTGGCAATTAGCTTTTCAGGAAAAGGATCATCAACTTTTGCGCGGAGCCTGCGAATGGCGACGTCCACCGTATTGGTATCACTATCAAAGTTGATTCCCCAAATTTCACTCGCAATAACCGTTCTGGGTATAATTTCGCCAGCTCTGGAGGCCAGTAGCCAAAGTAACTGAAACTCCTTGCGCGTCAGTGTAATACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGt > 2:566208/1‑289 (MQ=255) aTCCCCCGGATTGTGGCAATTAGCTTTTCAGGAAAAGGATCATCAACTTTTGCGCGGAGCCTGCGAATGGCGACGTCCACCGTATTGGTATCACTATCAAAGTTGATTCCCCAAATTTCACTCGCAATAACCGTTCTGGGTATAATTTCGCCAGCTCTGGAGGCCAGTAGCCAAAGTAACTGAAACTCCTTGCGCGTCAGTGTAATACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGAt < 2:168035/289‑1 (MQ=255) tCCCCCGGATTGTGGCAATTAGCTTTTCAGGAAAAGGATCATCAACTTTTGCGCGGAGCCTGCGAATGGCGACGTCCACCGTATTGGTATCACTATCAAAGTTGATTCCCCAAATTTCACTCGCAATAACCGTTCTGGGTATAATTTCGCCAGCTCTGGAGGCCAGTAGCCAAAGTAACTGAAACTCCTTGCGCGTCAGTGTAATACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCAATCTTAAGTCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTgtgg > 2:1099015/1‑286 (MQ=255) cccccGGATTGTGGCAATTAGCTTTTCAGGAAAAGGATCATCAACTTTTGCGCGGAGCCTGCGAATGGCGACGTCCACCGTATTGGTATCACTATCAAAGTTGATTCCCCAAATTTCACTCGCAATAACCGTTCTGGGTATAATTTCGCCAGCTCTGGAGGCCAGTAGCCAAAGTAACTGAAACTCCTTGCGCGTCAGTGTAATACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTAAAAGCGTGATGt > 2:2595288/1‑289 (MQ=255) gtgGCAATTAGCTTTTCAGGAAAAGGATCATCAACTTTTGCGCGGAGCCTGCGAATGGCGACGTCCACCGTATTGGTATCACTATCAAAGTTGATTCCCCAAATTTCACTCGCAATAACCGTTCTGGGTATAATTTCGCCAGCTCTGGAGGCCAGTAGCCAAAGTAACTGAAACTCCTTGCGCGTCAGTGTAATACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAAtt < 2:2678479/289‑1 (MQ=255) tgGCAATTAGCTTTTCAGGAAAAGGATCATCAACTTTTGCGCGGAGCCTGCGAATGGCGACGTCCACCGTATTGGTATCACTATCAAAGTTGATTCCCCAAATCTCACTCGCAATAACCGTTCTGGGTATAATTTCGCCAGCTCTGGAGGCCAGTAGCCAAAGTAACTGAAACTCCTTGCGCGTCAGTGTAATACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGTGTCCATTATTAAGCCGTTGGTTTCTAATGTTGAATTAAAAGCGTGATGTTGCCTTAAttt > 2:2511217/1‑288 (MQ=255) ggCAATTAGCTTTTCAGGAAAAGGATCATCAACTTTTGCGCGGAGCCTGCGAATGGCGACGTCCACCGTATTGGTATCACTATCAAAGTTGATTCCCCAAATTTCACTCGCAATAACCGTTCTGGGTATAATTTCGCCAGCTCTGGAGGCCAGTAGCCAAAGTAACTGAAACTCCTTGCGCGTCAGTGTAATACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATtgt > 1:101010/1‑289 (MQ=255) tttCAGGAAAAGGATCATCAACTTTTGCGCGGAGCCTGCGAATGGCGACGTCCACCGTATTGGTATCACTATCAAAGTTGATTCCCCAAATTTCACTCGCAATAACCGTTCTGGGTATAATTTCGCCAGCTCTGGAGGCCAGTAGCCAAAGTAACTGAAACTCCTTGCGCGTCAGTGTAATACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCt > 1:1857409/1‑289 (MQ=255) gcgcGGAGCCTGCGAATGGCGACGTCCACCGTATTGGTATCACTATCAAAGTTGATTCCCCAAATTTCACTCGCAATAACCGTTCTGGGTATAATTTCGCCAGCTCTGGAGGCCAGTAGCCAAAGTAACTGAAACTCCTTGCGCGTCAGTGTAATACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGaaaatgaaaaag > 2:553735/1‑281 (MQ=255) gcgGAGCCTGCGAATGGCGACGTCCACCGTATTGGTATCACTATCAAAGTTGATTCCCCAAATTTCACTCGCAATAACCGTTCTGGGTATAATTTCGCCAGCTCTGGAGGCCAGTAGCCAAAGTAACTGAAACTCCTTGCGCGTCAGTGTAATACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAgg < 1:2277580/288‑1 (MQ=255) ccTGCGAATGGCGACGTCCACCGTATTGGTATCACTATCAAAGTTGATTCCCCAAATTTCACTCGCAATAACCGTTCTGGGTATAATTTCGCCAGCTCTGGAGGCCAGTAGCCAAAGTAACTGAAACTCCTTGCGCGTCAGTGTAATACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTAc < 1:1896620/288‑1 (MQ=255) ccTGCGAATGGCGACGTCCACCGTATTGGTATCACTATCAAAGTTGATTCCCCAAATTTCACTCGCAATAACCGTTCTGGGTATAATTTCGCCAGCTCTGGAGGCCAGTAGCCAAAGTAACTGAAACTCCTTGCGCGTCAGTGTAATACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTAc < 1:2179115/288‑1 (MQ=255) tGGCGACGTCCACCGTATTGGTATCACTATCAAAGTTGATTCCCCAAATTTCACTCGCAATAACCGTTCTGGGTATAATTTCGCCAGCTCTGGAGGCCAGTAGCCAAAGTAACTGAAACTCCTTGCGCGTCAGTGTAATACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATc < 1:566208/289‑1 (MQ=255) cACCGTATTGGTATCACTATCAAAGTTGATTCCCCAAATTTCACTCGCAATAACCGTTCTGGGTATAATTTCGCCAGCTCTGGAGGCCAGTAGCCAAAGTAACTGAAACTCCTTGCGCGTCAGTGTAATACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCa < 2:1203891/289‑1 (MQ=255) ttGTTATCACTATCAAAGTTGGTTCCCCAACTTTCACTCGCAATAACAGTTCTTGGTATAATTTCGCCAGCTCTGGAGGCCAGTAGCCAAAGTAACTGAAACTCCTTGCGCGTCAGTGTAATACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCa < 2:237878/289‑1 (MQ=255) tGGTATCACTATCAAAGTTGATTCCCCAAATTTCACTCGCAATAACCGTTCTGGGTATAATTTCGCCAGCTCTGGAGGCCAGTAGCCAAAGTAACTGAAACTCCTTGCGCGTCAGTGTAATACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAACAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCa > 1:1081328/1‑288 (MQ=255) tGGTATCACTATCAAAGTTGATTCCCCAAATTTCACTCGCAATAACCGTTCTGGGTATAATTTCGCCAGCTCTGGAGGCCAGTAGCCAAAGTAACTGAAACTCCTTGCGCGTCAGTGTAATACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCa > 2:426919/1‑281 (MQ=255) tCACTATCAAAGTTGATTCCCCAAATTTCACTCGCAATAACCGTTCTGGGTATAATTTCGCCAGCTCTGGAGGCCAGTAGCCAAAGTAACTGAAACTCCTTGCGCGTCAGTGTAATACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCACCCct > 2:2634342/1‑288 (MQ=255) aCTATCAAAGTTGATTCCCCAAATTTCACTCGCAATAACCGTTCTGGGTATAATTTCGCCAGCTCTGGAGGCCAGTAGCCAAAGTAACTGAAACTCCTTGCGCGTCAGTGTAATACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGc < 2:1318503/192‑1 (MQ=255) aCTATCAAAGTTGATTCCCCAAATTTCACTCGCAATAACCGTTCTGGGTATAATTTCGCCAGCTCTGGAGGCCAGTAGCCAAAGTAACTGAAACTCCTTGCGCGTCAGTGTAATACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAAt > 1:2085924/1‑208 (MQ=255) aCTATCAAAGTTGATTCCCCAAATTTCACTCGCAATAACCGTTCTGGGTATAATTTCGCCAGCTCTGGAGGCCAGTAGCCAAAGTAACTGAAACTCCTTGCGCGTCAGTGTAATACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTg > 1:2134206/1‑289 (MQ=255) tATCAAAGTTGATTCCCCAAATTTCACTCGCAATAACCGTTCTGGGTATAATTTCGCCAGCTCTGGAGGCCAGTAGCCAAAGTAACTGAAACTCCTTGCGCGTCAGTGTAATACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGt > 1:1830214/1‑197 (MQ=255) tATCAAAGTTGATTCCCCAAATTTCACTCGCAATAACCGTTCTGGGTATAATTTCGCCAGCTCTGGAGGCCAGTAGCCAAAGTAACTGAAACTCCTTGCGCGTCAGTGTAATACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGt > 1:781667/1‑197 (MQ=255) aTCAAGGTTGATTCCCCAAATTTAATCCGCAATAACCGTTCTGGGTATAATTTCGCCAGCTCTGGAGGCCAGTAGCCAAAGTAACTGAAACTCCTTGCGCGTCAGTTTAATACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGAct < 2:2612976/289‑1 (MQ=255) aTCAAAGTTGATTCCCCAAATTTCACTCGCAATAACCGTTCTGGGTATAATTTCGCCAGCTCTGGAGGCCAGTAGCCAAAGTAACTGAAACTCCTTGCGCGTCAGTGTAATACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGAct < 2:1134903/289‑1 (MQ=255) cAAAGTTGATTCCCCAAATTTCACTCGCAATAACCGTTCTGGGTATAATTTCGCCAGCTCTGGAGGCCAGTAGCCAAAGTAACTGAAACTCCTTGCGCGTCAGTGTAATACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTc < 2:2194388/274‑1 (MQ=255) gATTCCCCAAATTTCACTCGCAATAACCGTTCTGGGTATAATTTCGCCAGCTCTGGAGGCCAGTAGCCAAAGTAACTGAAACTCCTTGCGCGTCAGTGTAATACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGa < 2:1789095/247‑1 (MQ=255) gATTCCCCAAATTTCACTCGCAATAACCGTTCTGGGTATAATTTCGCCAGCTCTGGAGGCCAGTAGCCAAAGTAACTGAAACTCCTTGCGCGTCAGTGTAATACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGa > 1:1789095/1‑247 (MQ=255) ttCCCCAAATTTCACTCGCAATAACCGTTCTGGGTATAATTTCGCCAGCTCTGGAGGCCAGTAGCCAAAGTAACTGAAACTCCTTGCGCGTCAGTGTAATACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGAc < 1:1459128/289‑1 (MQ=255) cccAAATTTCACTCGCAATAACCGTTCTGGGTATAATTTCGCCAGCTCTGGAGGCCAGTAGCCAAAGTAACTGAAACTCCTTGCGCGTCAGTGTAATACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGa < 2:1070207/289‑1 (MQ=255) cccAAATTTCACTCGCAATAACCGTTCTGGGTATAATTTCGCCAGCTCTGGAGGCCAGTAGCCAAAGTAACTGAAACTCCTTGCGCGTCAGTGTAATACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGa < 1:552797/289‑1 (MQ=255) tttCACTCGCAATAACCGTTCTGGGTATAATTTCGCCGGTCCTGGAGGCCAGTAGCCAAAGTAACTGAAACTCCTTGCGCGTCAGTGTAATACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCt < 2:504431/289‑1 (MQ=255) tttCACTCGCAATAACCGTTCTGGGTATAATTTCGCCAGCTCTGGAGGCCAGTAGCCAAAGTAACTGAAACTCCTTGCGCGTCAGTGTAATACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCt < 2:850972/289‑1 (MQ=255) cggaaTAACCGTTCTGGGTATAATTTCGCCAGCTCTGGAGGCCAGTAGCCAAAGTAACTGAAACTCCTTGCGCGTCAGTGTAATACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTa < 1:971157/286‑1 (MQ=255) cGCAATAACCGTACTGTGTATAATTTCGCCAGCTCGTGAGGCCAGTAGCCAAAGTAACTGAAACTCCTTGCGCGTCAGTGTAATACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTa < 2:2182803/289‑1 (MQ=255) ttCTGGGTATAATTTCGCCAGCTCTGGAGGCCAGTAGCCAAAGTAACTGAAACTCCTTGCGCGTCAGTG‑AATACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCAt > 1:260229/1‑257 (MQ=255) gggTATAATTTCGCCAGCTCTGGAGGCCAGTAGCCAAAGTAACTGAAACTCCTTGCGCGTCAGTGTAATACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAggg < 1:2511217/289‑1 (MQ=255) tataATTTCGCCAGCTCTGTAGGCCAGTAGCCAAAGTAACTGAAACTCCTTGCGCGTCAGTGTAATACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAATGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCACATAACAGGGGt < 1:1283760/288‑1 (MQ=255) cGCCAGCTCTGGAGGCCAGTAGCCAAAGTAACTGAAACTCCTTGCGCGTCAGTGTAATACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGtttgcttt > 1:412273/1‑287 (MQ=255) agCCAGCTCTGGAGGCCAGTAGCCAAAGTAACTGAAACTCCTTGCGCGTCAGTGTAATACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGtttgctttgc < 2:315375/288‑1 (MQ=255) tctGGAGGCCAGTAGCCAAAGTAACTGAAACTCCTTGCGCGTCAGTGTAATACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCtt < 2:734313/289‑1 (MQ=255) ggAGGCCAGTAGCCAAAGTAACTGAAACTCCTTGCGCGTCAGTGTAATACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAAc < 2:783047/289‑1 (MQ=255) aGGCCAGTAGCCAAAGTAACTGAAACTCCTTGAGCGTCAGTGTAATACTGTTATTGTACCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAACg < 2:619730/288‑1 (MQ=255) cAGTAGCCAAAGTAACTGAAACTCCTTGCGCGTCAGTGTAATACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGt > 1:742104/1‑127 (MQ=255) cAGTAGCCAAAGTAACTGAAACTCCTTGCGCGTCAGTGTAATACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAg < 1:605865/210‑1 (MQ=255) cAGTAGCCAAAGTAACTGAAACTCCTTGCGCGTCAGTGTAATACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGt > 1:2729702/1‑264 (MQ=255) cAGTAGCCAAAGTAACTGAAACTCCTTGCGCGTCAGTGTAATACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGt < 2:2729702/264‑1 (MQ=255) aGCCAAAGTAACTGAAACTCCTTGCGCGTCAGTGTAATACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAACGTTTGTAAg < 1:1158902/288‑1 (MQ=255) aaaGTAACTGAAACTCCTTGCGCGTCAGTGTAATACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGtttg < 2:1503312/259‑1 (MQ=255) aaaGTAACTGAAACTCCTTGCGCGTCAGTGTAATACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAACGTTTGTAAGATCt > 2:1036473/1‑288 (MQ=255) aGTAACTGAAACTCCTTGCGCGTCAGTGTAATACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTa > 2:1515964/1‑237 (MQ=255) tAACTGAAACTCCTTGCGCGTCAGTGTAATACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAACGTTTGTAAGATCTgccag < 2:1608843/289‑1 (MQ=255) cTTGCGCGTCAGTGTAATACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAACGTTTGTAAGATCTGCCAGCCATCCATAccc > 2:458997/1‑289 (MQ=255) tGCGCGTCAGTGTAATACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAACGTTTGTAAGATCTGCCAGCCATCCATACCCgg < 1:2339310/289‑1 (MQ=255) tGCGCGTCAGTGTAATACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAACGTTTGTAAGATCTGCCAGCCATCCATACCCgg > 2:1431710/1‑289 (MQ=255) gcgTCAGTGTAATACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAACGTTTGTAAGATCTGCCAGCCATCCATACCCGGaa < 1:83053/288‑1 (MQ=255) cAGTGTAATACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAACGTTTGTAAGATCTGCCAGCCATCCATACCCGGAAGCata < 1:729439/289‑1 (MQ=255) cAGTGTAATACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAACGTTTGTAAGATCTGCCAGCCATCCATACCCGGAAGCat < 1:1111996/288‑1 (MQ=255) tACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGa > 2:2257248/1‑193 (MQ=255) aCTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAACGTTTGTAAGATCTGCCAGCCATCCATACCCGGAAGCATAATATCCAGa < 2:2012660/289‑1 (MQ=255) atatTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGAt > 1:504886/1‑79 (MQ=255) atatTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCa > 2:2152258/1‑156 (MQ=255) atatTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCct > 2:231158/1‑168 (MQ=255) atatTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGtttg > 2:750035/1‑221 (MQ=255) atatTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAACGTTTGTAAGATCTgccagc < 2:916642/256‑1 (MQ=255) atatTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAACGTTTGTAAGATCTgccagc > 1:916642/1‑256 (MQ=255) atatTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAACGTTTGTAAGATCTGCCAGCCATCCATACCCGGAAGCATAATATCCAGAATGa > 2:2051102/1‑289 (MQ=255) atatTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAACGTTTGTAAGATCTGCCAGCCATCCATACCCGGAAGCATAATATCCAGAATGa > 1:1756153/1‑289 (MQ=255) atatTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAACGTTTGTAAGATCTGCCAGCCATCCATACCCGGAAGCATAATATCCAGAATGa > 1:1636039/1‑289 (MQ=255) atTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAACGTTTGTAAGATCTGCCAGCCATCCATACCCGGAAGCATAATATCCAGAATGATc > 2:382964/1‑289 (MQ=255) atTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAACGTTTGTAAGATCTGCCAGCCATCCATACCCGGAAGCATAATATCCAGAATGATc > 1:1512906/1‑289 (MQ=255) gTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAACGTTTGTAAGATCTGCCAGCCATCCATACCCGGAAGCATAATATCCAGAATGATCAAt > 2:1892344/1‑289 (MQ=255) cTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAACGTTTGTAAGATCTGCCAGCCATCCATACCCGGAAGCATAATATCCAGAATGATCAATGCAt < 2:1756153/289‑1 (MQ=255) tGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAACGTTTGTAAGAt < 1:2470883/238‑1 (MQ=255) tGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAACGTTTGTAAGATCTGCCAGCCATCCATACCCGGAAGCata > 2:2112443/1‑266 (MQ=255) tGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAACGTTTGTAAGATCTGCCAGCCATCCATACCCGGAAGCATAATATCCAGAATGATCAATGCATa > 2:1948668/1‑289 (MQ=255) cTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAACGTTTGTAAGATCTgccag < 2:1159638/243‑1 (MQ=255) cacTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACa > 2:1255777/1‑197 (MQ=255) acTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTTCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAACGTTTGTAATATCTGCCAGCCATCCATACCCGGAAGCATAATATCCAGAATGATCAATGCATAatcat > 1:2386519/1‑287 (MQ=255) acTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAACGTTTGTAAGATCTGCCAGCCATCCATACCCGGAAGCATAATATCCAGAATGATCAATGCATAatcat > 1:1303891/1‑287 (MQ=255) tATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAACGTTTGTAAGATCTGCCAGCCATCCATACCCGGAAGCATAATATCCAGAATGATCAATGCATAATCATCCtt < 2:1646895/289‑1 (MQ=255) tGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAACGTTTGTAAGATCTGCCAGCCATCCATACCCGGAAGCATAATATCCAGAATGATCAATGCATAATCATCCTTCa > 1:295887/1‑289 (MQ=255) gACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAACGTTTGTAAGATCTGCCAGCCATCCATACCCGGAAGCATAATATCCAGAATGATCAATGCATAATCATCCTTCa > 1:1650604/1‑288 (MQ=255) aCTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAACGTTTGTAAGATCTGCCAGCCATCCATACCCGGAAGCATAATATCCAGAATGATCAATGCATAATCATCCTTCAgc > 1:2192496/1‑289 (MQ=255) cTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAACGTTTGTAAGATCTGCCAGCCATCCATACCCGGAAGCat > 1:2237765/1‑251 (MQ=255) tAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAACGTTTGTAAGATCTGCCAGCCATCCATACCCGGAAGCATAATATCCAGAATGATCAATGCATAATCATCCTTCAgcgc < 1:1990394/289‑1 (MQ=255) aCAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTc > 1:452817/1‑134 (MQ=255) aCAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAACGTTTGTAAGATCTGCCAGCCATCCATACCCGGaa < 2:866220/244‑1 (MQ=255) aCAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAACGTTTGTAAGATCTGCCAGCCATCCATACCCGGaa > 1:866220/1‑244 (MQ=255) aCAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAACGTTTGTAAGATCTGCCAGCCATCCATACCCGGAAGCATAATATCCATAATGATCAATGCATAATCATCCTTCAGCGCaa > 1:1561716/1‑289 (MQ=255) aCAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAACGTTTGTAAGATCTGCCAGCCATCCATACCCGGAAGCATAATATCCAGAATGATCAATGCATAATCATCCTTCAGCGCaa > 1:1386959/1‑289 (MQ=255) tCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGTTTTGCTTTGCTGTTCTTAACGTTTGTAAGATCTGCCAGCCATCCATACCCGGAAGCATAATATCCAGAATGATCAATGCATAATCATCCTTCAGCGCAAAATaac > 2:2332650/1‑288 (MQ=255) tCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAACGTTTGTAAGATCTGCCAGCCATCCATACCCGGAAGCa < 1:2426352/241‑1 (MQ=255) tCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAACGTTTGTAAGATCTGCCAGCCATCCATACCCGGAAGCa > 2:2426352/1‑241 (MQ=255) tCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAACGTTTGTAAGATCTGCCAGCCATCCATACCCGGAAGCATAATATCCAGAATGATCAATGCATAATCATCCTTCAGCGCAAGATAAAGCCCa > 1:2634489/1‑289 (MQ=255) aGCCGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGcc < 2:82668/110‑1 (MQ=255) cGCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAACGTTTGTAAGATCTGCCAGCCATCCATACCCGGAAGCATAATATCCAGAATGATCAATGCATAATCATCCTTCAGCGCAAGATAAAGCCCATCTCTg < 1:2074466/287‑1 (MQ=255) cGCTGATTGTTAATTTTTAATTCAAAGCGTGATGTTGCATTAGTTGTGCCCGAAACCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGCAAAAGGTTTTTCCAGATAATCAGTTGCCCCACGTGCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAACGTTTGTAAGATCTGCCAGCCATCCATACCCGGAAGCATAATATCCAGAATGATCAATGCATAATCATCCTTCAGCGCAAGATAAAGCCCATCTCTg < 2:1838828/287‑1 (MQ=255) gCTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGtttgctttgc > 1:1056055/1‑180 (MQ=255) cTGATTTCTAATGTTGAATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAATGAAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAACGTTTGTAAGATCTgccag < 1:1196792/207‑1 (MQ=255) ||| ATAGCCCATCCCCCGGATTGTGGCAATTAGCTTTTCAGGAAAAGGATCATCAACTTTTGCGCGGAGCCTGCGAATGGCGACGTCCACCGTATTGGTATCACTATCAAAGTTGATTCCCCAAATTTCACTCGCAATAACCGTTCTGGGTATAATTTCGCCAGCTCTGGAGGCCAGTAGCCAAAGTAACTGAAACTCCTTGCGCGTCAGTGTAATACTGATATTGTCCCTGCTCACACTATGACTAACAGAGTCCATTCTTAAGCCGCTGATTTCTAATGTACTATTCAAAGCGTGATGTTGCCTTAATTGTGCCCGAACCCTTGCCAGCAACTCAGAAAAACTAAAAGGTTTTACCAGATAATCATTTGCCCCACTGTCCAGCCCTCTGACTCTGTCATCGACAGAATCCCTTGCAGTAAGGCAAATAACAGGGGTTTGCTTTGCTGTTCTTAACGTTTGTAAGATCTGCCAGCCATCCATACCCGGAAGCATAATATCCAGAATGATCAATGCATAATCATCCTTCAGCGCAAGATAAAGCCCATCTCTGCCATCAGAAA > CP042583/1675699‑1676258 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |