| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP042583 | 1,730,193 | 3 bp→TCA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP042583 | 1,730,193 | 0 | A | T | 99.6% | 556.3 / NA | 236 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (107/127); minor base G (0/1); total (107/129) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 | |||||||||||
| * | CP042583 | 1,730,194 | 0 | G | C | 98.7% | 552.0 / NA | 236 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base C (106/126); minor base A (1/2); total (107/129) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| * | CP042583 | 1,730,195 | 0 | T | A | 99.2% | 555.2 / NA | 236 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base A (107/127); minor base C (0/2); total (107/129) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.02e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 236 total aligned reads displayed.
CAAACGCGGCAATTATAGGGATTTCATCCGTCTGATACCAGTCGAATAGCGTTGCCGCGCGCTCAGAGTTAATTGTTGACAAAGAATTCCCGGGGGCAAATTACGTTGATCAGTTTTATGTAAGGTAAAAAATGTTAAACGCAGTTGCGCAAATTATCCGCCTTTACGTCACTTTATGAGCAATTCGCATATAAAATGTAAAACTTTTGTACTAGCATAAACACAGAAACGAATACTGGCGACCAGGTCTTGCGGATAAAGCGGTAATGAGCAAACAAAGTCAGCATGTATTAATTGCCCTGCCCCACCCGCTGCTTCACCTGGTCAGTTTAGGTTTAGTCAGCTTTATCTTTACCCTTTTCAGCCTTGAGCTTAGCCAGTTTGGCACCCAACTCGCCCCACTGTGGTTCCCGACGTCCATCATGATGGTGGCGTTTTATCGCCATGCCGGGCGCATGTGGCCGGGAATTGCGCTGAGCTGTAGCCTGGGAAATATCGCCGCATCCATCCTGCTTTTTTCCACCAGCAGCCTGAACATGACCTGGACGACCATCA > CP042583/1729915‑1730469 ||| aaTTATAGGGATTTCATCCGTCTGATACCAGTCGAATAGCGTTGCCGCGCGCTCAGAGTTAATTGTTGACAAAGAATTCCCGGGGGCAAATTACGTTGATCAGTTTTATGTAAGGTAAAAAATGTTAAACGCAGTTGCGCAAATTATCCGCCTTTACGTCACTTTATGAGCAATTCGCATATAAAATGTAAAACTTTTGTACTAGCATAAACACAGAAACGAATACTGGCGACCAGGTCTTGCGGATAAAGCGGTAATGAGCAAACAATCACAGCATGTATTAATtgc < 2:172876/288‑1 (MQ=255) ggATTTCATCCGTCTGATACCAAGCGAATAGCGTTGCCGCGCGCTCAGAGTTAATTGTTGACAAAGAATTCCCGGGGGAAAATTACGTTGATCAGTTTTATGTAAGGTAAAAAATGTTAAACGCAGTTGCGCAAATTATCCGCCTTTACGTCACTTTATGAGCAATTCGCATATAAAATGTAAAACTTTTGTACTAGCATAAACACAGAAACGAATACTGGCGACCAGGTCTTGCGGATAAAGCGGTAATGAGCAAACAATCACAGCATGTATTAATTGCCCTGcccc < 2:1459884/288‑1 (MQ=255) tttCATCCGTCTGATACCAGTCGAATAGCGTTGCCGCGCGCTCAGAGTTAATTGTTGACAAAGAATTCCCGGGGGCAAATTACGTTGATCAGTTTTATGTAAGGTAAAAAATGTTAAACGCAGTTGCGCAAATTATCCGCCTTTACGTCACTTTATGAGCAATTCGCATATAAAATGTAAAACTTTTGTACTAGCATAAACACAGAAACGAATACTGGCGACCAGGTCTTGCGGATAAAGCGGTAATGAGCAAACAATCACAGCATGTATTAATTGCCCTGCCCCAccc < 2:2434253/289‑1 (MQ=255) tttCATCCGGCTGATACCAGTCGAATTGCGTTGCCGGGCGCTCAGAGTTAATTGTTGACAAAGAATTCCCGGGGGCAAATTACGTTGATCAGTTTTATGTAAGGTAAAAAATGTTAAACGCAGTTGCGCAAATTATCCGCCTTTACGTCACTTTATGAGCAATTCGCATATAAAATGTAAAACTTTTGTACTAGCATAAACACAGAAACGAATACTGGCGACCAGGTCTTGCGGATAAAGCGGTAATGAGCAAACAATCACAGCATGTATTAATTGCCCTGCCCCAccc < 2:595274/289‑1 (MQ=255) ttCATCCGTCTGATACCAGTCGAATAGCGTTGCCGCGCGCTCAGAGTTAATTGTTGACAAAGAATTCCCTGGGGCAAATTACGTTGATCAGTTTTATGTAAGGTAAAAAATGTTAAACGCAGTTGCGCAAATTATCCGCCTTTACGTCACTTTATGAGCAATTCGCATATAAAATGTAAAACTTTTGTACTAGCATAAACACAGAAACGAATACTGGCGACCAGGTCTTGCGGATAAAGCGGTAATGAGCAAACAATCACAGCATGTATTAATTGCCCTGCCCCACCCg < 1:2503265/289‑1 (MQ=255) tCCGTCTGATACCAGTCGAATAGCGTTGCCGCGCGCTCAGAGTTAATTGTTGACAAAGAATTCCCGGGGGCAAATTACGTTGATCAGTTTTATGTAAGGTAAAAAATGTTAAACGCAGTTGCGCAAATTATCCGCCTTTACGTCACTTTATGAGCAATTCGCATATAAAATGTAAAACTTTTGTACTAGCATAAACACAGAAACGAATACTGGCGACCAGGTCTTGCGGATAAAGCGGTAATGAGCAAACAATCACAGCATGTATTAATTGCCCTGCCCCACCCgctgc < 1:2313341/289‑1 (MQ=255) tACCAGTCGAATAGCGTTGCCGCGCGCTCAGAGTTAATTGTTGACAAAGAATTCCCGGGGGCAAATTACGTTGATCAGTTTTATGTAAGGTAAAAAATGTTAAACGCAGTTGCGCAAATTATCCGCCTTTACGTCACTTTATGAGCAATTCGCATATAAAATGTAAAACTTTTGTACTAGCATAAACACAGAAACGAATACTGGCGACCAGGTCTTGCGGATAAAGCGGTAATGAGCAAACAATCACAGCATGTATTAATTGCCCTGCCCCACCCGCTGCTTCACCTgg < 1:1383518/289‑1 (MQ=255) aGTCGAATAGCGTTGCCGCGCGCTCAGAGTTAATTGTTGACAAAGAATTCCCGGGGGCAAATTACGTTGATCAGTTTTATGTAAGGTAAAAAATGTTAAACGCAGTTGCGCAAATTATCCGCCTTTACGTCACTTTATGAGCAATTCGCATATAAAATGTAAAACTTTTGTACTAGCATAAACACAGAAACGAATACTGGCGACCAGGTCTTGCGGATAAAGCGGTAATGAGCAAACAATCACAGCATGTATTAATTGCCCTGCCCCACCCGCTGCTTCACCTGGTCAg > 1:1352125/1‑289 (MQ=255) gTCGAATAGCGTTGCCGCGCGCTCAGAGTTAATTGTTGACAAAGAATTCCCGGGGGCAAATTACGTTGATCAGTTTTATGTAAGGTAAAAAATGTTAAACGCAGTTGCGCAAATTATCCGCCTTTACGTCACTTTATGAGCAATTCGCATATAAAATGTAAAACTTTTGTACTAGCATAAACACAGAAACGAATACTGGCGACCAGGTCTTGCGGATAAAGCGGTAATGAGCAAACAATCACAGCATGTATTAATTGCCCTGCCCCACCCGCTGCTTCACCTGGTCAgt > 1:98435/1‑289 (MQ=255) gTCGAATAGCGTTGCCGCGCGCTCAGAGTTAATTGTTGACAAAGAATTCCCGGGGGCAAATTACGTTGATCAGTTTTATGTAAGGTAAAAAATGTTAAACGCAGTTGCGCAAATTATCCGCCTTTACGTCACTTTATGAGCAATTCGCATATAAAATGTAAAACTTTTGTACTAGCATAAACACAGAAACGAATACTGGCGACCAGGTCTTGCGGATAAAGCGGTAAGGAGCAAACAATCACAGCAGGTATTAATTGCCCTGCCCCACCCGCTGCTTCACCTGGTCAgt > 1:1431214/1‑289 (MQ=255) cGTTGCCGCGCGCTCAGAGTTAATTGTTGACAAAGAATTCCCGGGGGCAAATTACGTTGATCAGTTTTATGTAAGGTAAAAAATGTTAAACGCAGTTGCGCAAATTATCCGCCTTTACGTCACTTTATGAGCAATTCGCATATAAAATGTAAAACTTTTGTACTAGCATAAACACAGAAACGAATACTGGCGACCAGGTCTTGCGGATAAAGCGGTAATGAGCAAACAATCACAGCATGTATTAATTGCCCTGCCCCACCCGCTGCTTCAc < 2:1928027/271‑1 (MQ=255) cGTTGCCGCGCGCTCAGAGTTAATTGTTGACAAAGAATTCCCGGGGGCAAATTACGTTGATCAGTTTTATGTAAGGTAAAAAATGTTAAACGCAGTTGCGCAAATTATCCGCCTTTACGTCACTTTATGAGCAATTCGCATATAAAATGTAAAACTTTTGTACTAGCATAAACACAGAAACGAATACTGGCGACCAGGTCTTGCGGATAAAGCGGTAATGAGCAAACAATCACAGCATGTATTAATTGCCCTGCCCCACCCGCTGCTTCAc > 1:1928027/1‑271 (MQ=255) ttGCCGCGCGCTCAGAGTTAATTGTTGACAAAGAATTCCCGGGGGCAAATTACGTTGATCAGTTTTATGTAAGGTAAAAAATGTTAAACGCAGTTGCGCAAATTATCCGCCTTTACGTCACTTTATGAGCAATTCGCATATAAAATGTAAAACTTTTGTACTAGCATAAACACAGAAACGAATACTGGCGACCAGGTCTTGCGGATAAAGCGGTAATGAGCAAACAATCACAGCATGTATTAATTGCCCTGCCCCACCCGCTGCTTCACCTGGTCAGTTTAGGTTTAGt < 2:657979/289‑1 (MQ=255) tGCCGCGCGCTCAGAGTTAATTGTTGACAAAGAATTCCCGGGGGCAAATTACGTTGATCAGTTTTATGTAAGGTAAAAAATGTTAAACGCAGTTGCGCAAATTATCCGCCTTTACGTCACTTTATGAGCAATTCGCATATAAAATGTAAAACTTTTGTACTAGCATAAACACAGAAACGAATACTGGCGACCAGGTCTTGCGGATAAAGCGGTAATGAGCAAACAATCACAGCATGTATTAATTGCCCTGCCCCACCCGCTGCTTCACCTGGTCAGTTTAGGTTTAGt < 1:681442/288‑1 (MQ=255) gcgcTCAGAGTTAATTGTTGACAAAGAATTCCCGGGGGCAAATTACGTTGATCAGTTTTATGTAAGGTAAAAAATGTTAAACGCAGTTGCGCAAATTATCCGCCTTTACGTCACTTTATGAGCAATTCGCATATAAAATGTAAAACTTTTGTACTAGCATAAACACAGAAACGAATACTGGCGACCAGGTCTTGCGGATAAAGCGGTAATGAGCAAACAATCACAGCATGTATTAATTGCCCTGCCCCACCCGCTGCTTCACCTGGTCAGTTTAGGTTTAGTctcgtt < 1:1012864/288‑6 (MQ=255) gcgcTCAGAGTTAATTGTTGACAAAGAATTCCCGGGGGCAAATTACGTTGATCAGTTTTATGTAAGGTAAAAAATGTTAAACGCAGTTGCGCAAATTATCCGCCTTTACGTCACTTTATGAGCAATTCGCATATAAAATGTAAAACTTTTGTACTAGCATAAACACAGAAACGAATACTGGCGACCAGGTCTTGCGGATAAAGCGGTAATGAGCAAACAATCACAGCATGTATTAATTGCCCTGCCCCACCCGCTGCTTCACCTGGTCAGTTTAGGTTTAGTctcgtt < 2:461120/288‑6 (MQ=255) tAATTGTTGACAAAGAATTCCCGGGGGCAAATTACGTTGATCAGTTTTATGTAAGGTAAAAAATGTTAAACGCAGTTGCGCAAATTATCCGCCTTTACGTCACTTTATGAGCAATTCGCATATAAAATGTAAAACTTTTGTACTAGCATAAACACAGAAACGAATACTGGCGACCAGGTCTTGCGGATAAAGCGGTAATGAGCAAACAATCACAGCATGTATTAATTGCCCTGCCCCACCCGCTGCTTCACCTGGTCAGTTTAGGTTTAGTCTCGTTTATCTTTAcc < 2:890568/287‑1 (MQ=255) tgACAAAGAATTCCCGGGGGCAAATTACGTTGATCAGTTTTATGTAAGGTAAAAAATGTTAAACGCAGTTGCGCAAATTATCCGCCTTTACGTCACTTTATGAGCAATTCGCATATAAAATGTAAAACTTTTGTACTAGCATAAACACAGAAACGAATACTGGCGACCAGGTCTTGCGGATAAAGCGGTAATGAGCAAACAATCACAGCATGTATTAATtgc < 1:1140762/222‑1 (MQ=255) tgACAAAGAATTCCCGGGGGCAAATTACGTTGATCAGTTTTATGTAAGGTAAAAAATGTTAAACGCAGTTGCGCAAATTATCCGCCTTTACGTCACTTTATGAGCAATTCGCATATAAAATGTAAAACTTTTGTACTAGCATAAACACAGAAACGAATACTGGCGACCAGGTCTTGCGGATAAAGCGGTAATGAGCAAACAATCACAGCATGTATTAATTGCCCTGCCCCACCCGCTGCTTCACCTGGTCAGTTTAGGTTTAGTctcgt > 2:1610064/1‑265 (MQ=255) aTTCCCGGGGGCAAATTACGTTGATCAGTTTTATGTAAGGTAAAAAATGTTAAACGCAGTTGCGCAAATTATCCGCCTTTACGTCACTTTATGAGCAATTCGCATATAAAATGTAAAACTTTTGTACTAGCATAAACACAGAAACGAATACTGGCGACCAGGTCTTGCGGATAAAGCGGTAATGAGCAAACAATCACAGCATGTATTAATTGCCCTGCCCCACCCGCTGCTTCACCTGGTc > 1:883002/1‑241 (MQ=255) aTTCCCGGGGGCAAATTACGTTGATCAGTTTTATGTAAGGTAAAAAATGTTAAACGCAGTTGCGCAAATTATCCGCCTTTACGTCACTTTATGAGCAATTCGCATATAAAATGTAAAACTTTTGTACTAGCATAAACACAGAAACGAATACTGGCGACCAGGTCTTGCGGATAAAGCGGTAATGAGCAAACAATCACAGCATGTATTAATTGCCCTGCCCCACCCGCTGCTTCACCTGGTc < 2:883002/241‑1 (MQ=255) cccGGGGGCAAATTACGTTGTTCAGTTTTATGTAAGGTAAAAAAGGTTAAACGCAGTTGCGCAAATTATCCGCCTTTACGTCACTTTATGAGCAATTCGCATATAAAATGTAAAACTTTTGTACTAGCATAAACACAGAAACGAATACTGGCGACCAGGTCTTGCGGATAAAGCGGTAATGAGCAAACAATCACAGCATGTATTAATTGCCCTGCCCCACCCGCTGCTTCACCTGGTCAGTTTAGGTTTAGTCTCGTTTATCTTTACCCTTTTCTCGCTTGAGCtttcg < 2:2541593/289‑4 (MQ=255) cccGGGGGCAAATTACGTTGATCAGTTTTATGTAAGGTAAAAAATGTTAAACGCAGTTGCGCAAATTATCCGCCTTTACGTCACTTTATGAGCAATTCGCATATAAAATGTAAAACTTTTGTACTAGCATAAACACAGAAACGAATACTGGCGACCAGGTCTTGCGGATAAAGCGGTAATGAGCAAACAATCACAGCATGTATTAATTGCCCTGCCCCACCCGCTGCTTCACCTGGTCAGTTTAGGTTTAGTCTCGTTTATCTTTACCCTTTTCTCGCTTGAGCtttcg < 1:867629/289‑4 (MQ=255) gTTGATCAGTTTTATGTAAGGTAAAAAATGTTAAACGCAGTTGCGCAAATTATCCGCCTTTACGTCACTTTATGAGCAATTCGCATATAAAATGTAAAACTTTTGTACTAGCATAAACACAGAAACGAATACTGGCGACCAGGTCTTGCGGATAAAGCGGTAATGAGCAAACAATCACAGCATGTATTAATTGCCCTGCCCCACCCGCTGCTTCACCTGGTCAGTTTAGGTTTAGTCTCGTTTATCTTTACCCTTTTCTCGCTTGAGCTTTCGCAGTTTGGCACCCAAc < 2:1420424/289‑1 (MQ=255) cAGTTTTATGTAAGGTAAAAAATGTTAAACGCAGTTGCGCAAATTATCCGCCTTTACGTCACTTTATGAGCAATTCGCATATAAAATGTAAAACTTTTGTACTAGCATAAACACAGAAACGAATACTGGCGACCAGGTCTTGCGGATAAAGCGGTAATGAGCAAACAATCACAGCATGTATTAATTGCCCTGCCCCACCCGCTGCTTCACCTGGTCAGTTTAGGTTTAGTCTCGTTTATCTTTACCCTTTTCTCGCTTGAGCTTTCGCAGTTTGGCACCCAACTCGccc < 1:361908/289‑1 (MQ=255) ttttATGTAAGGTAAAAAATGTTAAACGCAGTTGCGCAAATTATCCGCCTTTACGTCACTTTATGAGCAATTCGCATATAAAATGTAAAACTTTTGTACTAGCATAAACACAGAAACGAATACTGGCGACCAGGTCTTGCGGATAAAGCGGTAATGAGCAAACAATCACAGCATGTATTaa < 1:557956/181‑1 (MQ=255) ttttATGTAAGGTAAAAAATGTTAAACGCAGTTGCGCAAATTATCCGCCTTTACGTCACTTTATGAGCAATTCGCATATAAAATGTAAAACTTTTGTACTAGCATAAACACAGAAACGAATACTGGCGACCAGGTCTTGCGGATAAAGCGGTAATGAGCAAACAATCACAGCATGTATTaa > 2:557956/1‑181 (MQ=255) tttATGTAAGGTAAAAAATGTTAAACGCAGTTGCGCAAATTATCCGCCTTTACGTCACTTTATGAGCAATTCGCATATAAAATGTAAAACTTTTGTACTAGCATAAACACAGAAACGAATACTGGCGACCAGGTCTTGCGGATAAAGCGGTAATGAGCAAACAATCACAGCATGTATTAATTGCCCTGCCCCACCCGCTGCTTCACCTGGTCAGTTTAGGTTTAGTCTCGTTTATCTTTACCCTTTTCTCGCTTGAGCTTTCGCAGTTTGGCACCCAACTCGCCCCACt < 2:2043305/289‑1 (MQ=255) tGTAAGGTAAAAAATGTTAAACGCAGTTGCGCAAATTATCCGCCTTTACGTCACTTTATGAGCAATTCGCATATAAAATGTAAAACTTTTGTACTAGCATAAACACAGAAACGAATACTGGCGACCAGGTCTTGCGGATAAAGCGGTAATGAGCAAACAATCACAGCATGTATTAATtgcc > 1:1836411/1‑181 (MQ=255) tGTAAGGTAAAAAATGTTAAACGCAGTTGCGCAAATTATCCGCCTTTACGTCACTTTATGAGCAATTCGCATATAAAATGTAAAACTTTTGTACTAGCATAAACACAGAAACGAATACTGGCGACCAGGTCTTGCGGATAAAGCGGTAATGAGCAAACAATCACAGCATGTATTAATTGCCCTGCCCCACCCGCTGCTTCACCTGGTCAGTTTAGGTTTAGTCTCGTTTATCTTTACCCTTTTCTCGCTTGAGCTTTCGCAGTTTGGCACCCAACTCGCCCCACTGTgg > 2:387141/1‑289 (MQ=255) ggTAAAAAATGTTAAACGCAGTTGCGCAAATTATCCGCCTTTACGTCACTTTATGAGCAATTCGCATATAAAATGTAAAACTTTTGTACTAGCATAAACACAGAAACGAATACTGGCGACCAGGTCTTGCGGATAAAGCGGTAATGAGCAAACAATCACAGCATGTATTAATtgcc < 1:829502/176‑1 (MQ=255) ggTAAAAAATGTTAAACGCAGTTGCGCAAATTATCCGCCTTTACGTCACTTTATGAGCAATTCGCATATAAAATGTAAAACTTTTGTACTAGCATAAACACAGAAACGAATACTGGCGACCAGGTCTTGCGGATAAAGCGGTAATGAGCAAACAATCACAGCATGTATTAATtgcc > 2:829502/1‑176 (MQ=255) ggTAAAAAATGTTAAACGCAGTTGCGCAAATTATCCGCCTTTACGTCACTTTATGAGCAATTCGCATATAAAATGTAAAACTTTTGTACTAGCATAAACACAGAAACGAATACTGGCGACCAGGTCTTGCGGATAAAGCGGTAATGAGCAAACAATCACAGCATGTATTAATTGCCCTGCCCCACCCGCTGCTTCACCTGGTCAGTTTAGGTTTAGTctcgtt < 2:1917278/223‑6 (MQ=255) ggTAAAAAATGTTAAACGCAGTTGCGCAAATTATCCGCCTTTACGTCACTTTATGAGCAATTCGCATATAAAATGTAAAACTTTTGTACTAGCATAAACACAGAAACGAATACTGGCGACCAGGTCTTGCGGATAAAGCGGTAATGAGCAAACAATCACAGCATGTATTAATTGCCCTGCCCCACCCGCTGCTTCACCTGGTCAGTTTAGGTTTAGTctcgtt > 1:1917278/1‑218 (MQ=255) ggTAAAAAATGTTAAACGCAGTTGCGCAAATTATCCGCCTTTACGTCACTTTATGAGCAATTCGCATATAAAATGTAAAACTTTTGTACTAGCATAAACACAGAAACGAATACTGGCGACCAGGTCTTGCGGATAAAGCGGTAATGAGCAAACAATCACAGCATGTATTAATTGCCCTGCCCCACCCGCTGCTTCACCTGGTCAGTTTAGGTTTAGTCTCGTTTATCTTTACCCTTTTCTCGCTTGAGCTTTCGCAGTTTGGCACCCAACTCGCCCCACTGTGGTTccc > 2:32421/1‑289 (MQ=255) ggTAAAAAATGTTAAACGCAGTTGCGCAAATTATCCGCCTTTACGTCACTTTATGAGCAATTCGCATATAAAATGTAAAACTTTTGTACTAGCATAAACACAGAAACGAATACTGGCGACCAGGTCTTGCGGATAAAGCGGTAATGAGCAAACAATCACAGCATGTATTAATTGCCCTGCCCCACCCGCTGCTTCACCTGGTCAGTTTAGGTTTAGTCTCGTTTATCTTTACCCTTTTCTCGCTTGAGCTTTCGCAGTTTGGCACCCAACTCGCCCCACTGTGGTTccc > 1:1081274/1‑289 (MQ=255) ggTAAAAAATGTTAAACGCAGTTGCGCAAATTATCCGCCTTTACGTCACTTTATGAGCAATTCGCATATAAAATGTAAAACTTTTGTACTAGCATAAACACAGAAACGAATACTGGCGACCAGGTCTTGCGGATAAAGCGGTAATGAGCAAACAATCACAGCATGTATTAATTGCCCTGCCCCACCCGCTGCTTCACCTGGTCAGTTTAGGTTTAGTCTCGTTTATCTTTACCCTTTTCTCGCTTGAGCTTTCGCAGTTTGGCACCCAACTCGCCCCACTGTGGTTccc > 1:1552260/1‑289 (MQ=255) ttAAACGCAGTTGCGCAAATTATCCGCCTTTACGTCACTTTATGAGCAATTGGCATATAAAATGTAAAACTTTTGTACTAGCATAAACACAGAAACGAATACTGGCGACCAGGTCTTGCGGATAAAGCGGTACTGAGCAAACAATCACAGCATGTATTAATTGCCCTGCCCCACCCGCTGCTTCCCCTGGCCAGTTTAGGTTTAGTCTCGTTTATCTTTACCCTTTTCTCGCTTGAGGTTTCCGAGTTTGGCACCCAACTCGCCCCACTGTGGTTCCCGGCGTCcatca > 2:612639/1‑289 (MQ=255) ttAAACGCAGTTGCGCAAATTATCCGCCTTTACGTCACTTTATGAGCAATTCGCATATAAAATGTAAAACTTTTGTACTAGCATAAACACAGAAACGAATACTGGCGACCAGGTCTTGCGGATAAAGCGGTAATGAGCAAACAATCACAGCATGTATTAATTGCCCTGCCCCACCCGCTGCTTCACCTGGt > 1:2172537/1‑191 (MQ=255) ttAAACGCAGTTGCGCAAATTATCCGCCTTTACGTCACTTTATGAGCAATTCGCATATAAAATGTAAAACTTTTGTACTAGCATAAACACAGAAACGAATACTGGCGACCAGGTCTTGCGGATAAAGCGGTAATGAGCAAACAATCACAGCATGTATTAATTGCCCTGCCCCACCCGCTGCTTCACCTGGTCAGTTTAGGTTTAGTCTCGTTTATCTTTACCCTTTTCTCGCTTGAGCTTTCGCAGTTTGGCACCCAACTCGCCCCACtg > 2:1274864/1‑270 (MQ=255) aGTTGCGCAAATTATCCGCCTTTACGTCACTTTATGAGCAATTCGCATATAAAATGTAAAACTTTTGTACTAGCATAAACACAGAAACGAATACTGGCGACCAGGTCTTGCGGATAAAGCGGTAATGAGCAAACAATCACAGCATGTATTAATTGCCCTGCCCCACCCGCTGCTTCACCTGGTCAGTTTAGGTTTAGTCTCGTTTATCTTTACCCTTTTCTCGCTTGAGCTTTCGCAGTTTGGCACCCAACTCGCCCCACTGTGGTTCCCGACTTCCATCATGTgggtg > 2:106129/1‑289 (MQ=255) ttGCGCAAATTATCCGCCTTTACGTCACTTTATGAGCAATTCGCATATAAAATGTAAAACTTTTGTACTAGCATAAACACAGAAACGAATACTGGCGACCAGGTCTTGCGGATAAAGCGGTAATGAGCAAACAATCACAGCATGTATTAATTGCCCTGCCCCACCCGCTGCTTCACCTGGTCAGTTTAGGTTTAGTCTCGTTTATCTTTACCCTTTTCTCGCTTGAGCTTTCGCAGTTTGGCACCCAACTCGCCCCACTGTGGTTCCCGACGTCCATCATGATGGTGGc > 1:2656634/1‑289 (MQ=255) ttGCGCAAATTATCCGCCTTTACGTCACTTTATGAGCAATTCGCATATAAAATGTAAAACTTTTGTACTAGCATAAACACAGAAACGAATACTGGCGACCAGGTCTTGCGGAAAAAGCGGTAATGAGCAAACAATCACAGCATGTATTAATTGCACTGCCCCACCCGCTGCTTCACGGGGTCAGGTTAGGTTTAGTCTCGTTTATCTTTACCCTTTTCTCGCTTGAGCTTTCGCAGTTTGGCACCCAACTCGCCCCACTGTGGTTCCCGACGTCCATCATGATGGTGGc > 1:1025323/1‑289 (MQ=255) tGCGCAAATTATCCGCCTTTACGTCACTTTATGAGCAATTCGCATATAAAATGTAAAACTTTTGTACTAGCATAAACACAGAAACGAATACTGGCGACCAGGTCTTGCGGATAAAGCGGTAATGAGCAAACAATCACAGCATGTATTAATTGCCCTGCCCCACCCGCTGCTTCACCTGGTCAGTTTAGGTTTAGTCTCGTTTATCTTTACCCTTTTCTCGCTTGAGCTTTCGCAGTTTGGCACCCAACTCGCCCCACTGTGGTTCCCGACGTCCATCATGAtggtg < 2:2367789/286‑1 (MQ=255) gcAAATTATCCGCCTTTACGTCACTTTATGAGCAATTCGCATATAAAATGTAAAACTTTTGTACTAGCATAACCACAGAAACGAATACTGGCGACCAGGTCTTGCGGATAAAGCGGTAATGAGCAAACAATCACAGCATGTATTAATTGCCCTGCCCCACCCGCTGCTTCACCTGGTCAGTTTAGGTTTAGTCTCGTTTATCTTTACCCTTTTCTCGCTTGAGCTTTCGCAGTTTGGCACCCAACTCGCCCCACTGTGGTTCCCGACGTCCATCATGATGGTGGCGttt < 1:1117224/289‑1 (MQ=255) ttACGTCACTTTATGAGCAATTCGCATATAAAATGTAAAACTTTTGTACTAGCATAAACACAGAAACGAATACTGGCGACCAGGTCTTGCGGATAAAGCGGTAATGAGCAAACAATCACAGCATGTATTAATTGCCCTGCCCCACCCGCTGCTTCACCTGGTCAGTTTAGGTTTAGTCTCGTTTATCTTTACCCTTTTCTCGCTTGAGCTTTCGCAGTTTGGCACCCAACTCGCCCCACTGTGGTTCCCGACGTCCATCATGATGGTGGCGTTTTATCGCCATGCCggg < 1:338892/289‑1 (MQ=255) tACGTCACTTTATGAGCAATTCGCATATAAAATGTAAAACTTTTGTACTAGCATAAACACAGAAACGAATACTGGCGACCAGGTCTTGCGGATAAAGCGGTAATGAGCAAACAATCACAGCATGTATTAATTGCCCTGCCCCACCCGCTGCTTCACCTGGTCAGTTTAGGTTTAGTCTCGTTTATCTTTACCCTTTTCTCGCTTGAGCTTTCGCAGTTTGGCACCCAACTCGCCCCACTGTGGTTCCCGACGTCCATCATGATGGTGGCGTTTTATCGCCATGCCGGgc > 1:595610/1‑289 (MQ=255) cTTTATGGGCAATTCGCATATAAAATGTAAAACTTTTGTACTAGAATAACCACAGAAACGAAGACTGGCGACCAGCGCTTGCGGATAAAGCGGTAATGAGCAAACAATCACAGCATGTATTAATTGCCCTGCCCCACCCGCTGCTTCACCTGGTCAGTTTAGGTTTAGTCTCGTTTATCTTTACCCTTTTCTCGCTTGAGCTTTCGCAGTTTGGCACCCAACTCGCCCCACTGTGGTTCCCGACGTCCATCATGATGGTGGCGTTTTATCGCCATGCCGGGCGCAtgtg < 2:2613765/289‑1 (MQ=255) cTTTATGAGCAATTCGCATATAAAATGTAAAACTTTTGTACTAGCATAAACACAGAAACGAATACTGGCGACCAGGTCTTGCGGATAAAGCGGTAATGAGCAAACAATCACAGCATGTATTAATTGCCCTGCCCCACCCGCTGCTTCACCTGGTCAGTTTAGGTTTAGTCTCGTTTATCTTTACCCTTTTCTCGCTTGAGCTTTCGCAGTTTGGCACCCAACTCGccc > 2:1850594/1‑228 (MQ=255) cTTTATGAGCAATTCGCATATAAAATGTAAAACTTTTGTACTAGCATAAACACAGAAACGAATACTGGCGACCAGGTCTTGCGGATAAAGCGGTAATGAGCAAACAATCACAGCATGTATTAATTGCCCTGCCCCACCCGCTGCTTCACCTGGTCAGTTTAGGTTTAGTCTCGTTTATCTTTACCCTTTTCTCGCTTGAGCTTTCGCAGTTTGGCACCCAACTCGCTCCACTTTGGTTCCCGACGTCCATCATGATGGTGGCGTTTTATCGCCAGGCCGGTCGCAtgt > 2:1760365/1‑288 (MQ=255) cTTTATGAGCAATTCGCATATAAAATGTAAAACTTTTGTACTAGCATAAACACAGAAACGAATACTGGCGACCAGGTCTTGCGGATAAAGCGGTAATGAGCAAACAATCACAGCATGTATTAATTGCCCTGCCCCACCCGCTGCTTCACCTGGTCAGTTTAGGTTTAGTCTCGTTTATCTTTACCCTTTTCTCGCTTGAGCTTTCGCAGTTTGGCACCCAACTCGCCCCACTGTGGTTCCCGACGTCCATCATGATGGTGGCGttt < 1:2273894/266‑1 (MQ=255) cTTTATGAGCAATTCGCATATAAAATGTAAAACTTTTGTACTAGCATAAACACAGAAACGAATACTGGCGACCAGGTCTTGCGGATAAAGCGGTAATGAGCAAACAATCACAGCATGTATTAATTGCCCTGCCCCACCCGCTGCTTCACCTGGTCAGTTTAGGTTTAGTCTCGTTTATCTTTACCCTTTTCTCGCTTGAGCTTTCGCAGTTTGGCACCCAACTCGCCCCACTGTGGTTCCCGACGTCCATCATGATGGTGGCGttt > 2:2273894/1‑266 (MQ=255) cTTTATGAGCAATTCGCATATAAAATGTAAAACTTTTGTACTAGCATAAACACAGAAACGAATACTGGCGACCAGGTCTTGCGGATAAAGCGGTAATGAGCAAACAATCACAGCATGTATTAATTGCCCTGCCCCACCCGCTGCTTCACCTGGTCAGTTTAGGTTTAGTCTCGTTTATCTTTACCCTTTTCTCGCTTGAGCTTTCGCAGTTTGGCACCCAACTCGCCCCACTGTGGTTCCCGACGTCCATCATGATGGTGGCGTTTTATCg < 2:1052562/271‑1 (MQ=255) cTTTATGAGCAATTCGCATATAAAATGTAAAACTTTTGTACTAGCATAAACACAGAAACGAATACTGGCGACCAGGTCTTGCGGATAAAGCGGTAATGAGCAAACAATCACAGCATGTATTAATTGCCCTGCCCCACCCGCTGCTTCACCTGGTCAGTTTAGGTTTAGTCTCGTTTATCTTTACCCTTTTCTCGCTTGAGCTTTCGCAGTTTGGCACCCAACTCGCCCCACTGTGGTTCCCGACGTCCATCATGATGGTGGCGTTTTATCGCCATGCCGGGCGCAtgtg > 2:48944/1‑289 (MQ=255) tATGAGCAATTCGCATATAAAATGTAAAACTTTTGTACTAGCATAAACACAGAAACGAATACTGGCGACCAGGTCTTGCGGATAAAGCGGTAATGAGCAAACAATCACAGCATGTATTAATTGCCCTGCCCCACCCGCTGCTTCACCTGGTCAGTTTAGGTTTAGTCTCGTTTATCTTTACCCTTTTCTCGCTTGAGCTTTCGCAGTTTGGCACCCAACTCGCCCCACTGTGGTTCCCGACGTCCATCATGATGGTGGCGTTTTATCGCCATGCCGGGCGCATGTGGcc < 2:786197/289‑1 (MQ=255) tATGAGCAATTCGCATATAAAATGTAAAACTTTTGTACTAGCATAAACACAGAAACGAATACTGGCGACCAGGTCTTGCGGATAAAGCGGTAATGAGCAAACAATCACAGCATGTATTAATTGCCCTGCCCCACCCGCTGCTTCACCTGGTCAGTTTAGGTTTAGTCTCGTTTATCTTTACCCTTTTCTCGCTTGAGCTTTCGCAGTTTGGCACCCAACTCGCCCCACTGTGGTTCCCGACGTCCATCATGATGGTGGCGTTTTATCGCCATGCCGGGCGCATGTGGcc > 1:786197/1‑289 (MQ=255) cAATTCGCATATAAAATGTAAAACTTTTGTACTAGCATAAACACAGAAACGAATACTGGCGACCAGGTCTTGCGGATAAAGCGGTAATGAGCAAACAATCACAGCATGTATTAATTGCCCTGCCCCACCCGCTGCTTCACCTGGTCAGTTTAGGTTTAGTCTCGTTTATCTTTACCCTTTTCTCGCTTGAGCTTTCGCAGTTTGTCACCCAACTCGCCCCACTGTGGTTCCCGACGTCCATCATGATGGTGGCGTTTTATCGCCATGCCGGGCGCATGTGTCCGGGact > 1:2452818/1‑287 (MQ=255) aTTCGCATATAAAATGTAAAACTTTTGTACTAGCATAAACACAGAAACGAATACTGGCGACCAGGTCTTGCGGATAAAGCGGTAATGAGCAAACAATCACAGCATGTATTAATTGCCCTGCCCCACCCGCTGCTTCACCTGGTCAGTTTAGGTTTAGTCTCGTTTATCTTTACCCTTTTCTCGCTTGAGCtttcg > 1:1240409/1‑192 (MQ=255) aTTCGCATATAAAATGTAAAACTTTTGTACTAGCATAAACACAGAAACGAATACTGGCGACCAGGTCTTGCGGATAAAGCGGTAATGAGCAAACAATCACAGCATGTATTAATTGCCCTGCCCCACCCGCTGCTTCACCTGGTCAGTTTAGGTTTAGTCTCGTTTATCTTTACCCTTTTCTCGCTTGAGCTTTCGCAGTTTGGCACCCAACTCGCCCCACTGTGGTTCCCGACg > 2:11828/1‑234 (MQ=255) aTTCGCATATAAAATGTAAAACTTTTGTACTAGCATAAACACAGAAACGAATACTGGCGACCAGGTCTTGCGGATAAAGCGGTAATGAGCAAACAATCACAGCATGTATTAATTGCCCTGCCCCACCCGCTGCTTCACCTGGTCAGTTTAGGTTTAGTCTCGTTTATCTTTACCCTTTTCTCGCTTGAGCTTTCGCAGTTTGGCACCCAACTCGCCCCACTGTGGTTCCCGACg < 1:11828/234‑1 (MQ=255) ttCGCATATAAAATGTAAAACTTTTGTACTAGCATAAACACAGAAACGAATACTGGCGACCAGGTCTTGCGGATAAAGCGGTAATGAGCAAACAATCACAGCATGTATTAATTGCCCTGCCCCACCCGCTGCTTCACCTGGTCAGTTTAGGTTTAGTCTCGTTTATCTTTACCCTTTTCTCGCTTGAGCTTTCGCAGTTTGGCACCCAACTCGCCCCACTGTGGTTCCCGACGTCCATCATGATGGTGGCGTTTTATCGCCATGCCGGGCGCATGTGGCCGGGAATTgc > 1:2612375/1‑289 (MQ=255) aaaaTGTAAAACTTTTGTACTATCATAAACACAGAAACGAATACTGGCGACCAGGTCTTGCGGATAAAGCGGTAATGAGCAAACAATCACAGCATGTATTAATTGCCCTGCCCCACCCGCTGCTTCACCTGGTCAGTTTAGGTTTAGTCTCGTTTATCTTTACCCTTTTCTCGCTTGAGCTTTCGCAGTTTGGCACCCAACTCGCCCCACTGTGGTCCCCGACGTCCATCATGATGGTGGCGTTTTATCGCCATGCCGGGCGCATGTGGCCGGGAATTGCGCTGAGCTg < 1:1810379/289‑1 (MQ=255) aaaTGTAAAACTTTTGTACTAGCATAAACACAGAAACGAATACTGGCGACCAGGTCTTGCGGATAAAGCGGTAATGAGCAAACAATCACAGCATGTATTAATTGCCCTGCCCCACCCGCTGCTTCACCTGGTCAGTTTAGGTTTAGTCTCGTTTATCTTTACCTTTTTCTCGCTTGAGCTTTCGCAGTTTGGCACCCAACTCGCCCCACTGTGGTTCCCGACGTCCATCATGATGGTGGCGTTTTATCGCCATGCCGGGCGCATGTGGCCGGGAATTGCGCTGAGCTGt > 2:181839/1‑289 (MQ=255) gCATAAACACAGAAACGAATACTGGCGACCAGGTCTTGCGGATAAAGCGGTAATGAGCAAACAATCACAGCATGTATTAATTGCCCTGCCCCACCCGCTGCTTCACCTGGt > 1:168190/1‑111 (MQ=255) gCATAAACACAGAAACGAATACTGGCGACCAGGTCTTGCGGATAAAGCGGTAATGAGCAAACAATCACAGCATGTATTAATTGCCCTGCCCCACCCGCTGCTTCACCTGGTCAGTTTAGGTTTAGTCTCGTTTATCTTTACCCTTTTCTCGCTTGAGCTTTCGCAGTTTGGCACCCAACTCGCCCCACTGTGGTTCCCGACGTCCATCATGATGGTGGCGTTTTATCGCCATGCCGGGCGCATGTGGCCGGGAATTgcg > 2:69450/1‑259 (MQ=255) aaCACAGAAACGAATACTGGCGACCAGGTCTTGCGGATAAAGCGGTAATGAGCAAACAATCACAGCATGTATTAATTGCCCTGCCCCACCCGCTGCTTCACCTGGTCAGTTTAGGTTTAGTCTCGTTTATCTTTACCCTTTTCTCGCTTGAGCTTTCGCAGTTTGGCACCCAACTCGCCCCACTGTGGTTCCCGACGTCCATCATGATGGTGGCGTTTTATCGCCATGCCGGGCGCATGTGGcc > 2:1154064/1‑244 (MQ=255) aaCACAGAAACGAATACTGGCGACCAGGTCTTGCGGATAAAGCGGTAATGAGCAAACAATCACAGCATGTATTAATTGCCCTGCCCCACCCGCTGCTTCACCTGGTCAGTTTAGGTTTAGTCTCGTTTATCTTTACCCTTTTCTCGCTTGAGCTTTCGCAGTTTGGCACCCAACTCGCCCCACTGTGGTTCCCGACGTCCATCATGATGGTGGCGTTTTATCGCCATGCCGGGCGCATGTGGCCGGGAATTGCGCTGAGCTGTTCGCTGGGAAATATCGCCGcatcca > 2:2230586/1‑288 (MQ=255) aGAAACGAATACTGGCGACCAGGTCTTGCGGATAAAGCGGTAATGAGCAAACAATCACAGCATGTATTAATTGCCCTGCCCCACCCGCTGCTTCACCTGGTCAGTTTAGGTTTAGTCTCGTTTATCTTTACCCTTTTCTCGCTTGAGCTTTCGCAGTTTGGCACCCAACTCGCCCCACTGTGGTTCCCGACGTCCATCATGATGGTGGCGTTTTATCGCCATg < 2:713628/223‑1 (MQ=255) aGAAACGAATACTGGCGACCAGGTCTTGCGGATAAAGCGGTAATGAGCAAACAATCACAGCATGTATTAATTGCCCTGCCCCACCCGCTGCTTCACCTGGTCAGTTTAGGTTTAGTCTCGTTTATCTTTACCCTTTTCTCGCTTGAGCTTTCGCAGTTTGGCACCCAACTCGCCCCACTGTGGTTCCCGACGTCCATCATGATGGTGGCGTTTTATCGCCATg > 1:713628/1‑223 (MQ=255) aGAAACGAATACTGGCGACCAGGTCTTGCGGATAAAGCGGTAATGAGCAAACAATCACAGCATGTATTAATTGCCCTGCCCCACCCGCTGCTTCACCTGGTCAGTTTAGGTTTAGTCTCGTTTATCTTTACCCTTTTCTCGCTTGAGCTTTCGCAGTTTGGCACCCAACTCGCCCCACTGTGGTTCCCGACGTCCATCATGATGGTGGCGTTTTATCGCCATGCCGGGCGCATGTGGCCGGGAATTGCGCTGAGCTGtt < 1:1269111/259‑2 (MQ=255) aGAAACGAATACTGGCGACCAGGTCTTGCGGATAAAGCGGTAATGAGCAAACAATCACAGCATGTATTAATTGCCCTGCCCCACCCGCTGCTTCACCTGGTCAGTTTAGGTTTAGTCTCGTTTATCTTTACCCTTTTCTCGCTTGAGCTTTCGCAGTTTGGCACCCAACTCGCCCCACTGTGGTTCCCGACGTCCATCATGATGGTGGCGTTTTATCGCCATGCCGGGCGCATGTGGCCGGGAATTGCGCTGAGCTGtt < 1:1490515/259‑2 (MQ=255) aGAAACGAATACTGGCGACCAGGTCTTGCGGATAAAGCGGTAATGAGCAAACAATCACAGCATGTATTAATTGCCCTGCCCCACCCGCTGCTTCACCTGGTCAGTTTAGGTTTAGTCTCGTTTATCTTTACCCTTTTCTCGCTTGAGCTTTCGCAGTTTGGCACCCAACTCGCCCCACTGTGGTTCCCGACGTCCATCATGATGGTGGCGTTTTATCGCCATGCCGGGCGCATGTGGCCGGGAATTGCGCTGAGCTGtt > 2:1490515/1‑258 (MQ=255) aGAAACGAATACTGGCGACCAGGTCTTGCGGATAAAGCGGTAATGAGCAAACAATCACAGCATGTATTAATTGCCCTGCCCCACCCGCTGCTTCACCTGGTCAGTTTAGGTTTAGTCTCGTTTATCTTTACCCTTTTCTCGCTTGAGCTTTCGCAGTTTGGCACCCAACTCGCCCCACTGTGGTTCCCGACGTCCATCATGATGGTGGCGTTTTATCGCCATGCCGGGCGCATGTGGCCGGGAATTGCGCTGAGCTGTTCGCTGGGAAat > 2:132439/1‑270 (MQ=255) aGAAACGAATACTGGCGACCAGGTCTTGCGGATAAAGCGGTAATGAGCAAACAATCACAGCATGTATTAATTGCCCTGCCCCACCCGCTGCTTCACCTGGTCAGTTTAGGTTTAGTCTCGTTTATCTTTACCCTTTTCTCGCTTGAGCTTTCGCAGTTTGGCACCCAACTCGCCCCACTGTGGTTCCCGACGTCCATCATGATGGTGGCGTTTTATCGCCATGCCGGGCGCATGTGGCCGGGAATTGCGCTGAGCTGTTCGCTGGGAAat < 1:132439/270‑1 (MQ=255) aGAAACGAATACTGGCGACCAGGTCTTGCGGATAAAGCGGTAATGAGCAAACAATCACAGCATGTATTAATTGCCCTGCCCCACCCGCTGCTTCACCTGGTCAGTTTAGGTTTAGTCTCGTTTATCTTTACCCTTTTCTCGCTTGAGCTTTCGCAGTTTGGCACCCAACTCGCCCCACTGTGGTTCCCGACGTCCATCATGATGGTGGCGTTTTATCGCCATGCCGGGCGCATGTGGCCGGGAATTGCGCTGAGCTGTTCGCTGGGAAATATCGCCGCATCCATCCt > 1:487196/1‑287 (MQ=255) aGAAACGAATACTGGCGACCAGGTCTTGCGGATAAAGCGGTAATGAGCAAACAATCACAGCATGTATTAATTGCCCTGCCCCACCCGCTGCTTCACCTGGTCAGTTTAGGTTTAGTCTCGTTTATCTTTACCCTTTTCTCGCTTGAGCTTTCGCAGTTTGGCACCCAACTCGCCCCACTGTGGTTCCCGACGTCCATCATGATGGTGGCGTTTTATCGCCATGCCGGGCGCATGTGGCCGGGAATTGCGCTGAGCTGTTCGCTGGGAAATATCGCCGCATCCATCCt > 1:241679/1‑287 (MQ=255) aGAAACGAATACTGGCGACCAGGTCTTGCGGATAAAGCGGTAATGAGCAAACAATCACAGCATGTATTAATTGCCCTGCCCCACCCGCTGCTTCACCTGGTCAGTTTAGGTTTAGTCTCGTTTATCTTTACCCTTTTCTCGCTTGAGCTTTCGCAGTTTGGCACCCAACTCGCCCCACTGTGGTTCCCGACGTCCATCATGATGGTGGCGTTTTATCGCCATGCCGGGCGCATGTGGCCGGGAATTGCGCTGAGCTGTTCGCTGGGAAATATCGCCGCATCCATCCt > 2:848565/1‑287 (MQ=255) aGAAACGAATACTGGCGACCAGGTCTTGCGGATAAAGCGGTAATGAGCAAACAATCACAGCATGTATTAATTGCCCTGCCCCACCCGCTGCTTCACCTGGTCAGTTTAGGTTTAGTCTCGTTTATCTTTACCCTTTTCTCGCTTGAGCTTTCGCAGTTTGGCACCCAACTCGCCCCACTGTGGTTCCCGACGTCCATCATGATGGTGGCGTTTTATCGCCATGCCGGGCGCATGTGGCCGGGAATTGCGCTGAGCTGTTCGCTGGGAAATATCGCCGCATCCATCCt > 1:776987/1‑287 (MQ=255) aGAAACGAATACTGGCGACCAGGTCTTGCGGATAAAGCGGTAATGAGCAAACAATCACAGCATGTATTAATTGCCCTGCCCCACCCGCTGCGTCACCGGGTCAGTTTAGGTTTAGTCTCGTTTATCTTTACCCTTGTCTCGCTTGAGCTTTCGCAGTTTGGCACCCAACTCGCCCCACTGTGGTTCCCGACGTCCATCATGATGGTGGCGTTTTATGGCCATGCCGGGCGCATGTGGCCGGGAATTGCGCTGAGCTGTACGCTGGGAAATACCGCCGCATCCATCCt > 1:1039166/1‑287 (MQ=255) gAAACGAATACTGGCGACCAGGTCTTGCGGATAAAGCGGTAATGAGCAAACAATCACAGCATGTATTAATTGCCCTGCCCCACCCGCTGCTTCACCTGGTCAGTTTAGGTTTAGTCTCGTTTATCTTTACCCTTTTCTCGCTTGAGCTTTCGCAGTTTGGCACCCAACTCGCCCCACTGTGGTTCCCGACGTCCATCATGATGGTGGCGTTTTATCGCCATGCCGGGCGCATTTGGCCGGGAATTGCGCTGAGCTGTTCGCTGGGAAATATCGCCGCCACCCTCCTGCt > 2:472349/1‑289 (MQ=255) gAAACGAATACTGGCGACCAGGTCTTGCGGATAAAGCGGTAATGAGCAAACAATCACAGCATGTATTAATTGCCCTGCCCCACCCGCTGCTTCACCTGGTCAGTTTAGGTTTAGTCTCGTTTATCTTTACCCTTTTCTCGCTTGAGCTTTCGCAGTTTGGCACCCAACTCGCCCCACTGTGGTTCCCGACGTCCATCATGATGGTGGCGTTTTATCGCCATGCCGGGCGCATGTGGCCGGGAATTGCGCTGAGCTGTTCGCTGGGAAATATCGCCGCATCCATCCTGCt > 1:1292226/1‑289 (MQ=255) aaaCGAATACTGGCGACCAGGTCTTGCGGATAAAGCGGTAATGAGCAAACAATCACAGCATGTATTAATTGCCCTGCCCCACCCGCTGCTTCACCTGGTCAGTTTAGGTTTAGTCTCGTTTATCTTTACCCTTTTCTCGCTTGAGCTTTCGCAGTTTGGCACCCAACt < 1:1531560/168‑1 (MQ=255) aaTACTGGCGACCAGGTCTTGCGGATAAAGCGGTAATGAGCAAACAATCACAGCATGTATTAATTGCCCTGCCCCACCCGCTGCTTCACCTGGTCAGTTTAGGTTTAGTCTCGTTTATCTTTACCCTTTTCTCGCTTGAGCTTTCGCAGTTTGGCACCCAACTCGCCCCACTGTGGTTCCCGACGTCCATCATGGTGGTGGCGTTTTATCGCCATGCCGGGCGCATGTGGCCGGGAATTGCGCTGAGCTGTTAGCTGGGAAATATCGCCGCATCCATCCTGCtttttt > 1:1758649/1‑288 (MQ=255) aaTACTGCCAACCAGGTCTGGCGGATAAAGCCGTAATGCGCAAACAATTCCAGCATGTATTAATTGCCCTGCCCCACCCGCTGCTTCACCTGGTCAGTTTAGGTTTAGTCTCGTTTATCTTTACCCTTTTCTCGCTTGAGCTTTCGCAGTTTGGCACCCAACTCGCCCCACTGTGGTTCCCGACGTCCATCATGATGGTGGCGTTTTATCGCCATGCCGGGCGCATGTGGCCGGGAATTGCGCTGAGCTGTTCGCTGGGAAATATCGCCGCATCCATCCTGCTTTTTTc < 2:1259889/289‑1 (MQ=255) aCTGGCGACCAGGTCTTGCGGATAAAGCGGTAATGAGCAAACAATCACAGCATGTATTAATTGCCCTGCCCCACCCGCTGCTTCACCTGGTCAGTTTAGGTTTAGt > 1:490316/1‑106 (MQ=255) tGGCGACCAGGTCTTGCGGATAAAGCGGTAATGAGCAAACAATCACAGCATGTATTAATTGCCCTGCCCCACCCGCTGCTTCACCTGGTCAGTTTAGGTTTAGTCTCGTTTATCTTTACCCTTTTCTCGCTTGAGCTTTCGCAGTTTGGCACCCAACTCGCCCCACTGTGGTTCCCGACGTCCATCATGATGGTGGCGTTTTATCGCCATGCCGGGCGCATGTGGCCGGGAATTGCGCTGAGCTGTTCGCTGGGAAATATCGCCGcat > 2:1227428/1‑268 (MQ=255) tGGCGACCAGGTCTTGCGGATAAAGCGGTAATGAGCAAACAATCACAGCATGTATTAATTGCCCTGCCCCACCCGCTGCTTCACCTGGTCAGTTTAGGTTTAGTCTCGTTTATCTTTACCCTTTTCTCGCTTGAGCTTTCGCAGTTTGGCACCCAACTCGCCCCACTGTGGTTCCCGACGTCCATCATGATGGTGGCGTTTTATCGCCATGCCGGGCGCATGTGGCCGGGAATTGCGCTGAGCTGTTCGCTGGGAAATATCGCCGcat < 1:1227428/268‑1 (MQ=255) aCCAGGTCTTGCGGATAAAGCGGTAATGAGCAAACAATCACAGCATGTATTAATTGCCCTGCCCCACCCGCTGCTTCACCTgg < 2:166069/83‑1 (MQ=255) aCCAGGTCTTGCGGATAAAGCGGTAATGAGCAAACAATCACAGCATGTATTAATTGCCCTGCCCCACCCGCTGCTTCACCTGGTCAGTTTAGGTTTAGTCTCGTTTATCTTTACCCTTTTCTCGCTTGAGCTTTCGCAGTTTGGCACCCAACTCGCCCCACTGTGGTTCCCGACg < 1:46168/175‑1 (MQ=255) aCCAGGTCTTGCGGATAAAGCGGTAATGAGCAAACAATCACAGCATGTATTAATTGCCCTGCCCCACCCGCTGCTTCACCTGGTCAGTTTAGGTTTAGTCTCGTTTATCTTTACCCTTTTCTCGCTTGAGCTTTCGCAGTTTGGCACCCAACTCGCCCCACTGTGGTTCCCGACGTCCATCATGATGGTGGCGTTTTATCGCCATGCCGGGCGCATGTGGCCGGGAATTGCGCTGAGCTGTTCGCTGGGAAATATGGCCGCATCCATCATGCTTTTTTCCACcagctc > 2:1156699/1‑286 (MQ=255) gTCTTGCGGATAAAGCGGTAATGAGCAAACAATCACAGCATGTATTAATTGCCCTGCCCCACCCGCTGCTTCACCTGGTCAGTTTAGGTTTAGTCTCGTTTATCTTTACCCTTTTCTCGCTTGAGCtttcgca > 1:1871191/1‑128 (MQ=255) gTCTTGCGGATAAAGCGGTAATGAGCAAACAATCACAGCATGTATTAATTGCCCTGCCCCACCCGCTGCTTCACCTGGTCAGTTTAGGTTTAGTCTCGTTTATCTTTACCCTTTTCTCGCTTGAGCtttcgca < 2:1871191/133‑6 (MQ=255) cTTGCGGATAAAGCGGGAATGAGCAAACAATCACAGCATGTATTAATTGCCCTGCCCCACCCGCTGCTTCACCTGGTCAGTTTAGGTTTAGTCTCGTTTATCTTTACCCTTTTCTCGCTTGAGCTTTCGCAGTTTGGCACCCAACTCGCCCCACTGTGGTTCCCGACGTCCATCATGATGGTGGCGTTTTATCGCCATGCCGGGCGCATGTGGCCGGGAATTGCGCTGAGCTGTTCGCTGGGAAATATCGCCGCATCCATCCTGCTTTTTTCCACCAGCTCGCTGAACa < 1:2688469/289‑1 (MQ=255) tGCGGATAAAGCGGTAATGAGCAAACAATCACAGCATGTATTAATTGCCCTGCCCCACCCGCTGCTTCACCTGGTCAGTTTAGGTTTAGTCTCGTTTATCTTTACCCTTTTCTCGCTTGAGCTTTCGCAGTTTGGCACCCAACTCGCCCCACTGTGGTTCCCGACGTCCATCATGATGGTGGCGTTTTATCGCCATGCCGGGCGCATGTGGCCGGGAATTGCGCTGAGCTGTTCGCTGGGAAATATCGCCGCATCCATCCTGCTTTTTTCCACCAGCTCGCTGAACATg > 1:1560884/1‑289 (MQ=255) tAAAGCGGTAATGAGCAAACAATCACAGCATGTATTAATTGCCCTGCCCCACCCGCTGCTTCACCTGGTCAGTTTAGGTTTAGTCTCGTTTATCTTTACCCTTTTCTCGCTTGAGCTTTCGCAGTTTGGCACCCAACTCGCCCCACTGTGGTTCCCGACGTCCATCATGATGGTGGCGTTTTATCGCCATGCCGGGCGCATGTGGCCGGGAATTGCGCTGAGCTGTTCGCTGGGAAATATCGCCGCATCCATCCTGCTTTTTTCCACcagctcg < 1:1643154/274‑4 (MQ=255) ggTAATGAGCAAACAATCACAGCATGTATTAATTGCCCTGCCCCACCCGCTGCTTCACCTGGTCAGTTTAGGTTTAGTCTCGTTTATCTTTACCCTTTTCTCGCTTGAGCTTTCGCAGTTTGGCACCCAACTCGCCCCACTGTGGTTCCCGACGTCCATCATGATGGTGGCGTTTTATCGCCATGCCGGGCGCATGTGGCCGGGAATTGCGCTGAGCTGTTCGCTGGGAAATATCGCCGCATCCATCCTGCTTTTTTCCACCAGCTCGCTGAACATGACCTGGACGAcc < 1:1778318/289‑1 (MQ=255) aaTGAGCAAACACTCACAGGATGTATTAATTGCCCTGCCCCACCCCCTGTTTCACCTGGTCAGTTTAGGTTTAGTCTCGTTTATCTTTACCCTTTTCTCGCTTGAGCTTTCGCAGTTTGGCACCCAACTCGCCCCACTGTGGTTCCCGACGTCCATCATGATGGTGGCGTTTTATCGCCATGCCGGGCGCATGTGGCCGGGAATTGCGCTGAGCTGTTCGCTGGGAAATATCGCCGCATCCATCCTGCTTTTTTCCACCAGCTCGCTGAACATGACCTGGACGACCAt < 2:1541165/288‑1 (MQ=255) aaTGAGCAAACAATCACAGCATGTATTAATTGCCCTGCCCCACCCGCTGCTTCACCTGGTCAGTTTAGGTTTAGTCTCGTTTATCTTTACCCTTTTCTCGCTTGAGCTTTCGCAGTTTGGCACCCAACTCGCCCCACTGTGGTTCCCGACGTCCATCATGATGGTGGCGTTTTATCGCCATGCCGGGCGCATGTGGCCGGGAATTGCGCTGAGCTGTTCGCTGGGAAATATCGCCGCATCCATCCTGCTTTTTTCCACCAGCTCGCTGAACATGACCTGGACGACCAt < 1:926164/288‑1 (MQ=255) aaTGAGCAAACAATCACAGCATGTATTAATTGCCCTGCCCCACCCGCTGCTTCACCTGGTCAGTTTAGGTTTAGTCTCGTTTATCTTTACCCTTTTCTCGCTTGAGCTTTCGCAGTTTGGCACCCAACTCGCCCCACTGTGGTTCCCGACGTCCATCATGATGGTGGCGTTTTATCGCCATGCCGGGCGCATGTGGCCGGGAATTGCGCTGAGCTGTTCGCTGGGAAATATCGCCGCATCCATCCTGCTTTTTTCCACCAGCTCGCTGAACATGACCTGGACGACCAt < 1:848565/288‑1 (MQ=255) aTGAGCAAACAATCACAGCATGTATTAATTGCCCTGCCCCACCCGCTGCTTCACCTGGTCAGTTTAGGTTTAGTCTCGTTTATCTTTACCCTTTTCTCGCTTGAGCTTTCGCAGTTTGGCACCCAACTCGCCCCACTGTGGTTCCCGACGTCCATCATGATGGTGGCGTTTTATCGCCATGCCGGGCGCATGTGGCCGGGAATTGCGCTGAGCTGTTCGCTGGGAAATATCGCCGCATCCATCCTGCTTTTTTCCACCAGCTCGCTGAACATGACCTGGACGACCATCa < 2:1557376/289‑1 (MQ=255) ||| CAAACGCGGCAATTATAGGGATTTCATCCGTCTGATACCAGTCGAATAGCGTTGCCGCGCGCTCAGAGTTAATTGTTGACAAAGAATTCCCGGGGGCAAATTACGTTGATCAGTTTTATGTAAGGTAAAAAATGTTAAACGCAGTTGCGCAAATTATCCGCCTTTACGTCACTTTATGAGCAATTCGCATATAAAATGTAAAACTTTTGTACTAGCATAAACACAGAAACGAATACTGGCGACCAGGTCTTGCGGATAAAGCGGTAATGAGCAAACAAAGTCAGCATGTATTAATTGCCCTGCCCCACCCGCTGCTTCACCTGGTCAGTTTAGGTTTAGTCAGCTTTATCTTTACCCTTTTCAGCCTTGAGCTTAGCCAGTTTGGCACCCAACTCGCCCCACTGTGGTTCCCGACGTCCATCATGATGGTGGCGTTTTATCGCCATGCCGGGCGCATGTGGCCGGGAATTGCGCTGAGCTGTAGCCTGGGAAATATCGCCGCATCCATCCTGCTTTTTTCCACCAGCAGCCTGAACATGACCTGGACGACCATCA > CP042583/1729915‑1730469 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |