Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 1,732,647 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 1,732,647 | 0 | A | T | 99.7% | 816.6 / NA | 341 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (189/151); minor base G (1/0); total (190/151) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,732,648 | 0 | G | C | 99.7% | 802.4 / NA | 341 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base C (188/150); total (190/151) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.45e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,732,649 | 0 | C | G | 99.4% | 803.6 / NA | 341 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (2/0); new base G (187/151); total (190/151) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.05e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 |
Only 100 of 341 total aligned reads displayed.
GCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGAGCTTAATGCTGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAGCGCGCGTTTTATCGCTACACGCATTATCAGTGCCGTGAATGACTATCACTTTATATGGGAAGGCCGTGTGCATCGGGTAGGTGCCA‑‑GTGCCGGGATTACCTTGATTGATGACAACAATCATCAGGCGGCAGAAGTGATGAGCCAGGCTGATATCGCCTGTTATGCCTCCAAAAATGGTGGCCGGGGCCGGGTGACGGTTTACGAACCGCAGCAAGCTGCCGCACATAGCGAACGGGCGGCGATGAGCCTTGATGAACAGTGGCGGATGATTAAAGAGAATCAGTTGATGATGCTCGCCCACGGTGTCG‑C‑TAGCCCACGGATCCCGGAAGCGCGTAATTTGTGGCTGATTAGTCTTAAGCTCTGGAGTTGCGAAGGCGAGATTATTGATGAACAAACATTTCGTCGTAGCTTCAGCGATC > CP042583/1732369‑1732926 ||| ccGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCTGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAGCGCGCGTTTTATCGCTACACGCATTATCAGTGCCGTGAATGACTATCACTTTATATGGGAAGGCCGTGTGCATCGGGTAGGTGCCA‑‑GTGCCGGGATTACCTTGATTGATGACAACAATCATCAGGCGGCAGAAGTGATGTCGCAGGCTGata > 1:1261421/1‑288 (MQ=255) cggGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCTGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAGCGCGCGTTTTATCGCTACACGCATTATCAGTGCCGTGAATGACTATCACTTTATATGGGAAGGCCGTGTGCATCGGGTAGGTGCCA‑‑GTGCCGGGATTACCTTGATTGATGACAACAATCATCAGGCGGCAGAAGTGATGTCGCAGGCTGATATCGCCTGTTATg < 2:1100593/288‑1 (MQ=255) gctgcGCGAACTGGCGTCTGTAATGCTGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGCATTTGGTCTGATGCTACCAGACTGTATTGTTGAAAGCGCGCGTTTTATCGCTACACGCATTATCAGTGCCGTGAATGACTACTACTTTATATGGGATGGCCGTGTGCATCGGGTCGGTGCCA‑‑GTGCCGGGCTTACCTTTCTTGTTGGCTAACATCCTCAGGCGGCAGACTGCAGGGCCCAGGCTGGTGTCGCATTGTATGCCTCCAAACAtggt > 2:2573930/1‑289 (MQ=255) gtcgttAATGCTGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAGCGCGCGTTTTATCGCTACACGCATTATCAGTGCCGTGAATGACTATCACTTTATATGGGAAGGCCGTGTGCATCGGGTAGGTGCCA‑‑GTGCCGGGATTACCTTGATTGATGACAACAATCATCAGGCGGCAGAAGTGATGTCGCAGGCCGGTATCGCCTGTTATGCCTCCCAAAAGGGTggccggggccctgc > 2:1409832/5‑284 (MQ=255) tcgttAATGCTGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAGCGCGCGTTTTATCGCTACACGCATTATCAGTGCCGTGAATGACTATCACTTTATATGGGAAGGCCGTGTGCATCGGGTAGGTGCCA‑‑GTGCCGGGATTACCTTGATTGATGACAACAATCATCAGGCGGCAGAAGTGATGTCGCAGGCTGATATCGCCTGTTATGCCTCCAAAAATGGTGGCCGGGGCCGGGTg < 1:1058149/285‑1 (MQ=255) ttAATGCTGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAGCGCGCGTTTTATCGCTACACGCATTATCAGTGCCGTGAATGACTATCACTTTATATGGGAAGGCCGTGTGCATCGGGTAGGTGCCA‑‑GTGCCGGGATTACCTTGATTGATGACAACAATCATCAGGCGGCAGAAGTGATGTCGCAGGCTGATATCGCCTGTTATGCCTCCAAAAATGGTGGCCGGGGCCGGGTGACgg > 1:1437889/1‑289 (MQ=255) tATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAGCGCGCGTTTTATCGCTACACGCATTATCAGTGCCGTGAATGACTATCACTTTATATGGGAAGGCCGTGTGCATCGGGTAGGTGCCA‑‑GTGCCGGGATTACCTTGATTGATGACAACAATCATCAGGCGGCAGAAGTGATGTCGCAGGCTGATATCGCCTGTTATGCCTCCAAAAATGGTGGCCGGGGCCGGGTGACGGTTTACGAAcc > 2:1841944/1‑288 (MQ=255) tgcGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAGCGCGCGTTTTATCGCTACACGCATTATCAGTGCCGTGAATGACTATCACTTTATATGGGAAGGCCGTGTGCATCGGGTAGGTGCCA‑‑GTGCCGGGATTACCTTGATTGATGACAACAATCATCAGGCGGCAGAAGTGATGTCGCAGGCTGATATCGCCTGTTATGCCTCCAAAAATGGTGGCCGGGGCCGGGTGACGGTTTACGAACCgcagca < 1:149384/289‑1 (MQ=255) gTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAGCGCGCGTTTTATCGCTACACGCATTATCAGTGCCGTGAATGACTATCACTTTATATGGGAAGGCCGTGTGCATCGGGTAGGTGCCA‑‑GTGCCGGGATTACCTTGATTGATGACAACAATCATCAGGCGGCAGAAGTGATGTCGCAGGCTGATATCGCCTGTTATGCCTCCAAAAATGGTGGCCGGGGCCGGGTGACGGTTTACGAACCGCAGCAAg < 1:2628419/288‑1 (MQ=255) tCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAGCGCGCGTTTTATCGCTACACGCATTATCAGTGCCGTGAATGACTATCACTCTATATGGGAAGGCCGTGTGCATCGGGTAGGTGCCA‑‑GTGCCGGGATTACCTTGATTGATGACAACAATCATCAGGCGGCAGAAGTGATGTCGCAGGCTGATATCGCCTGTTAGTCCTCCAAAACTGGTGGCCGGGGCCGGGTGAGGGTTTACGAACCgcagccaact > 2:155749/1‑283 (MQ=255) tGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAGCGCGCGTTTTATCGCTACACGCATTATCAGTGCCGTGAATGACTATCACTTTATATGGGAAGGCCGTGTGCATCGGGTAGGTGCCA‑‑GTGCCGGGATTACCTTGATTGATGACAACAATCATCAGGCGGCAGAAGTGATGTCGCAGGCTGATATCGCCTGTTATGCCTCCAAAAATGGTGGCCGGGGCCGGGTGACGGGTTACGAACCGCAGCAAGCTGCCGCACATa > 1:715033/1‑288 (MQ=255) gcgcGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAGCGCGCGTTTTATCGCTACACGCATTATCAGTGCCGTGAATGACTATCACTTTATATGGGAAGGCCGTGTGCATCGGGTAGGTGCCA‑‑GTGCCGGGATTACCTTGATTGATGACAACAATCATCAGGCGGCAGAAGTGATGTCGCAGGCTGATATCGCCTGTTATGCCTCCAAAAATGGTGGCCGGGGCCGGGTGACGGTTTACGAACCGCAGCAAGCTGCCGcaca < 1:1783083/281‑1 (MQ=255) aCTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAGCGCGCGTTTTATCGCTACACGCATTATCAGTGCCGTGAATGACTATCACTTTATATGGGAAGGCCGTGTGCATCGGGTAGGTGCCA‑‑GTGCCGGGATTACCTTGATTGATGACAACAATCATCAGGCGGCAGAAGTGATGTCGCAGGCTGATATCGCCTGTTATGCCTCCAAAAATGGTGGCCGGGGCCGGGTGACGGTTTACGAACCgcagca < 1:592120/264‑1 (MQ=255) aCTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAGCGCGCGTTTTATCGCTACACGCATTATCAGTGCCGTGAATGACTATCACTTTATATGGGAAGGCCGTGTGCATCGGGTAGGTGCCA‑‑GTGCCGGGATTACCTTGATTGATGACAACAATCATCAGGCGGCAGAAGTGATGTCGCAGGCTGATATCGCCTGTTATGCCTCCAAAAATGGTGGCCGGGGCCGGGTGAAGGTTTACGAACCGCAGCAAGCTGCCGCACATACCGAACGggcc > 2:1127650/1‑288 (MQ=255) gTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAGCGCGCGTTTTATCGCTACACGCATTATCAGTGCTGTGAATGACTATCACTATATATGGGAAGGCCGTGTGCATCAGGTAGGTGCCA‑‑GTGCCGGGATTACCTTGATTGATGACAACAATCATCAGGCGGCAGAAGTGATGTCGCAGGCTGATATCGCACGTTATGCCCCCAAACATGGTAGCCGGGGACGGGTGACGGTTTACGAACCGCAGCAAGCTGCAGAAAATACCGAACGggcgggcat > 2:254268/1‑285 (MQ=255) gggtGAATTTTGTCTGCGGCGACCTGACTGTAAGGTTGAAAGCGCGGGTTTTATCGCTAAACGCATTATCAGTGCCGTGAATGACTATCACTTTATATGGGAAGGCCGTGTGCATCGGGTAGGTGCCA‑‑GTGCCGGGATTACCTTGATTGATGACAACAATCATCAGGCGGCAGAAGTGATGTCGCAGGCTGATATCGCCTGTTATGCCTCCAAAAATGGTGGCCGGGGCCGGGTGACGGTTTACGAACCGCAGCAAGCTGCCGCACATAGCGAACGGGCGGCGATgtc < 2:2629345/285‑3 (MQ=255) tttGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAGCGCGCGTTTTATCGCTACACGCATTATCAGTGCCGTGAATGACTATCACTTTATATGGGAAGGCCGTGTGCATCGGGTAGGTGCCA‑‑GTGCCGGGATTACCTTGATTGATGACAACAATCATCAGGCGGCAGAAGTGATGTCGCAGGCTGATATCGCCTGTTATGCCTCCAAAAATGGTGGCCGGGGCCGGGTGACGGTTTACGAACCGCAGCAAGCTGCCGCACATAGCGAACGGGCGGCGATGTCGCTtgatg < 2:1159509/289‑1 (MQ=255) tGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAGCGCGCGTTTTATCGCTACACGCATTATCAGTGCCGTGAATGACTATCACTTTATATGGGAAGGCCGTGTGCATCGGGTAGGTGCCA‑‑GTGCCGGGATTACCTTGATTGATGACAACAATCATCAGGCGGCAGAAGTGATGTCGCAGGCTGATATCGCCTGTTATGCCTCCAAAAATGGTGGCCGGGGCCGGGTGACGGTTTACGAACCGCAGCAAGCTGCCGCACATAGCGAACGGGCGGCGATGTCGCTTGATGaa < 1:397615/289‑1 (MQ=255) tCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAGCGCGCGTTTTATCGCTACACGCATTATCAGTGCCGTGAATGACTATCACTTTATATGGGAAGGCCGTGTGCATCGGGTAGGTGCCA‑‑GTGCCGGGATTACCTTGATTGATGACAACAATCATCAGGCGGCAGAAGTGATGTCGCAGGCTGATATCGCCTGTTATGCCTCCAAAAATGGTGGCCGGGGCCGGGTGACGGTTTACGAACCGCAGCAAGCTGCCGCCCATAGCGAACGGGCGGCGATGTCGCTTGATGAACAg > 2:860173/1‑289 (MQ=255) tgctACCAGACTGTAATGTTGAAAGCGCGCGTTTTATCGCTACACGCATTATCAGTGCCGTGAATGACTATCACTTTATATGGGAAGGCCGTGTGCATCGGGTAGGTGCCA‑‑GTGCCGGGATTACCTTGATTGATGACAACAATCATCAGGCGGCAGAAGTGATGTCGCAGGCTGATATCGCCTGTTATGCCTCCAAAAATGGTGGCCGGGGCCGGGTGACGGTTTACGAACCGCAGCAAGCTGCCGCACATAGCGAACGGGCGGCGATGTCGCTTGATGAACAGTGGCg < 1:2460621/289‑1 (MQ=255) tACCAGACTGTAATGTTGAAAGCGCGCGTTTTATCGCTACACGCATTATCAGTGCCGTGAATGACTATCACTTTATATGGGAAGGCCGTGTGCATCGGGTAGGTGCCA‑‑GTGCCGGGATTACCTTGATTGATGACAACAATCATCAGGCGGCAGAAGTGATGTCGCAGGCTGATATCGCCTGTTATGCCTCCAAAAATGGTGGCCGGGGCCGGGTGACGGTTTACGAACCGCAGCAAGCTGCCGCACATAGCGAACGGGCGGCGATGTCGCTTGATGAACAGTGGCGga < 2:558956/288‑1 (MQ=255) aCCAGACTGTAATGTTGAAAGCGCGCGTTTTATCGCTACACGCATTATCAGTGCCGTGAATGACTATCACTTTATATGGGAAGGCCGTGTGCATCGGGTAGGTGCCA‑‑GTGCCGGGATTACCTTGATTGATGACAACAATCATCAGGCGGCAGAAGTGATGTCGCAGGCTGATATCGCCTGTTATGCCTCCAAAAATGGTGGCCGGGGCCGGGTGAc > 1:2650639/1‑216 (MQ=255) aCTGTAATGTTGAAAGCGCGCGTTTTATCGCTACACGCATTATCAGTGCCGTGAATGACTATCACTTTATATGGGAAGGCCGTGTGCATCGGGTAGGTGCCA‑‑GTGCCGGGATTACCTTGATTGATGACAACAATCATCAGGCGGCAGAAGTGATGTCGCAGGCTGATATCGCCTGTTATGCCTCCAAAAATGGTGGCCGGGGCCGGGTGACGGTTTACGAAc < 1:1750950/222‑1 (MQ=255) aCTGTAATGTTGAAAGCGCGCGTTTTATCGCTACACGCATTATCAGTGCCGTGAATGACTATCACTTTATATGGGAAGGCCGTGTGCATCGGGTAGGTGCCA‑‑GTGCCGGGATTACCTTGATTGATGACAACAATCATCAGGCGGCAGAAGTGATGTCGCAGGCTGATATCGCCTGTTATGCCTCCAAAAATGGTGGCCGGGGCCGGGTGACGGTCTACGAACCGCAGCAAGCTGCCGCCCATAGCGAACGGGCGGCGTTGTCGCTGGATGAACAGTGGCGGAGGACTaa > 1:2310632/1‑289 (MQ=255) tAATGTTGAAAGCGCGCGTTTTATCGCTACACGCATTATCAGTGCCGTGAATGACTATCACTTTATATGGGAAGGCCGTGTGCATCGGGTAGGTGCCA‑‑GTGCCGGGATTACCTTGATTGATGACAACAATCATCAGGCGGCAGAAGTGATGTCGCAGGCTGat < 2:374016/163‑1 (MQ=255) aaTGTTGAAAGCGCGCGTTTTATCGCTACACGCATTATCAGTGCCGTGAATGACTATCACTTTATATGGGAAGGCCGTGTGCATCGGGTAGGTGCCA‑‑GTGCCGGGATTACCTTGATTGATGACAACAATCATCAGGCGGCAGAAGTGATGTCGCAGGCTGATATCGCCTGTTATGCCTCCAAAAATGGTGGCCGGGGCCGGGTGACGGTTTACGAACCGCAGCAAGCTGCCGCACATAGCGAACGGGCGGCGATGTCGCTTGATGAACAGTGGCGGATGATTAAAgaga < 1:155749/289‑1 (MQ=255) tggTTGTAGGCGCGCGTTTTAACGCTCAACGCATTATCAGTGCCAGTAATGTCTATCACTTTTGAGGGGAAGGCCGTATGCATCGGGTAGGTGCCA‑‑GTGCCGGGATTACCTTGATTGATGACAACAATCATCAGGCGGCAGAAGTGATGTCGCAGGCTGATATCGCCTGTTATGCCTCCCAAAATGGTGGCCGGGGCCGGGTGACGGTTTACGAACCGCAGCAAGCTGCCGCACATAGCGAACGGGCGGCGATGTCGCTTGATGAACAGTGGCGGATGATTAAAGAGaa < 2:952223/287‑1 (MQ=255) aTGTTGAAAGCGCGCGTTTTATCGCTACACGCATTATCAGTGCCGTGAATGACTATCACTTTATATGGGAAGGCCGTGTGCATCGGGTAGGTGCCA‑‑GTGCCGGGATTACCTTGATTGATGACAACAATCATCAGGCGGCAGAAGTGATGTCGCAGGCTGATATCGCCTGTTATGCCTCCAAAAATGGTGGCCGGGGCCGGGTGACGGTTTACGAACCGCAGCAAGCTGCCGCACATAGCGAACGGGCGGCGATGTCGCTTGATGAACAGTGGCGGATGATTAAAGAGaa < 1:1411970/289‑1 (MQ=255) aaaGCGCGCGTTTTATCGCTACACGCATTATCAGTGCCGTGAATGACTATCACTTTATATGGGAAGGCCGTGTGCATCGGGTAGGTGCCA‑‑GTGCCGGGATTACCTTGATTGATGACAACAATCATCAGGCGGCAGAAGTGATGTCGCAGGCTGATATCGCCTGTTATGCCTCCAAAAATGGTggc > 2:2147175/1‑185 (MQ=255) aaaGCGCGCGTTTTATCGCTACACGCATTATCAGTGCCGTGAATGACTATCACTTTATATGGGAAGGCCGTGTGCATCGGGTAGGTGCCA‑‑GTGCCGGGATTACCTTGATTGATGACAACAATCATCAGGCGGCAGAAGTGATGTCGCAGGCTGATATCGCCTGTTATGCCTCCAAAAATGGTggc < 1:2147175/185‑1 (MQ=255) aaaGCGCGCGTTTTATCGCTACACGCATTATCAGTGCCGTGAATGACTATCACTTTATATGGGAAGGCCGTGTGCATCGGGTAGGTGCCA‑‑GTGCCGGGATTACCTTGATTGATGACAACAATCATCAGGCGGCAGAAGTGATGTCGCAGGCTGATATCGCCTGTTATGCCTCCAAAAATGGTGGCCGGGGCCGGGTGACGGTTTACGAACCGCAGCAAGCTGCCGCACATAGCGAACGGGCGGCGATGTCGCTTGATGAACGGTGGCGGATGATTAAAGAGAATCAGtt > 1:2043069/1‑289 (MQ=255) 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cgTTTTATCGCTACACGCATTATCAGTGCCGTGAATGACTATCACTTTATATGGGAAGGCCGTGTGCATCGGGTAGGTGCCA‑‑GTGCCGGGATTACCTTGATTGATGACAACAATCATCAGGCGGCAGAAGTGATGTCGCAGGCTGATATCGCCTGTTATGCCTCCAAAAATGGTGGCCGGGGCCGGGTGACGGTTTACGAACCgcagca > 1:988637/1‑209 (MQ=255) tttATCGCTACACGCATTATCAGTGCCGTGAATGACTATCACTTTATATGGGAAGGCCGTGTGCATCGGGTAGGTGCCA‑‑GTGCCGGGATTACCTTGATTGATGACAACAATCATCAGGCGGCAGAAGTGATGTCGCAGGCTGATATCGCCTGTTATGCCTCCAAAAATGGTGGCCGGGGCCGGGTGACGGTTTACGAACCGCAGCAAGCTGCCGCACATAGCGAACGGGCGGCGATGTCGCTTGATGAACAGTGGCGGATGATTAAAGAGAATCAGTTGATGATGCTc < 1:2281961/288‑1 (MQ=255) tCGCTACACGCATTATCAGTGCCGTGAATGACTATCACTTTATATGGGAAGGCCGTGTGCATCGGGTAGGTGCCA‑‑GTGCCGGGATTACCTTGATTGATGACAACAATCATCAGGCGGCAGAAGTGATGTCGCAGGCTGATATCGCCTGTTATGCCTCCAAAAATGGTGGCCGGGGCCGGGTGACGGTTTACGAACCGCAGCAAGCTGCCGCACATAGCGAACGGGCGGCGATGTCGCTTGATGAACAGTGGCg > 1:919934/1‑253 (MQ=255) 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cGCATTATCAGTGCCGTGAATGACTATCACTTTATATGGGAAGGCCGTGTGCATCGGGTAGGTGCCA‑‑GTGCCGGGATTACCTTGATTGATGACAACAATCATCAGGCGGCAGAAGTGATGTCGCAGGCTGatat > 2:455753/1‑134 (MQ=255) cGCATTATCAGTGCCGTGAATGACTATCACTTTATATGGGAAGGCCGTGTGCATCGGGTAGGTGCCA‑‑GTGCCGGGATTACCTTGATTGATGACAACAATCATCAGGCGGCAGAAGTGATGTCGCAGGCTGatat < 1:455753/134‑1 (MQ=255) aTCAGTGCCGTGAATGACTATCTCTTTATATGGGAAGGCCGTGTGCATCGGGTAGGTGCCA‑‑GTGCCGGGATTACCTTGATTGATGACAACAATCATCAGGCGGCAGAAGTGATGTCGCAGGCTGATATCGCCTGTTATGCCTCCAAAAATGGTGGCCGGGGCCGGGTGACGGTTTACGAACCGCAGCAAGCTGCCGCACATAGCGAACGGGCGGCGATGTCGCTTGATGAACAGTGGCGGATGATTAAAGAGAATCAGTTGATGATGCTCGCCCACGGTGTCG‑C‑ttcg > 1:560871/1‑285 (MQ=255) cggggCCGTGAATGACTAGCACGTTATATGGGAAGGCCGGGTGCATCGGGTAGGGGCCA‑‑GTGCCGGGATTACCTTGATTGATGACAAAAATCATCAGGCGGCAGAAGTGATGTCGCAGGCTGATATCGCCTGTTATGCCTCCAAAAATGGTGGCCGGGGCCGGGTGACGGTTTACGAACCGCAGCAAGCTGCCGCACATAGCGAACGGGCGGCGATGTCGCTTGATGAACAGTGGCGGATGATTAAAGAGAATCAGTTGATGATGCTCGCCCACGGTGTCG‑C‑ttcgcca < 2:2490611/285‑7 (MQ=255) cAGTGCCGTGAATGCCGATCACTTGATATGGGAAGGCCGTGTGCATCGGGTAGGTGCCA‑‑GTGCCGGGATTACCTTGATTGATGACAACAATCATCAGGCGGCAGAAGTGATGTCGCAGGCTGATATCGCCTGTTATGCCTCCAAAAATGGTGGCCGGGGCCGGGTGACGGTTTACGAACCGCAGCAAGCTGCCGCACATAGCGAACGGGCGGCGATGTCGCTTGATGAACAGTGGCGGATGATTAAAGAGAATCAGTTGATGATGCTCGCCCACGGTGTCG‑C‑ttcgcca < 2:2450390/289‑7 (MQ=255) tGCCGTGAATGACTATCACTTTATATGGGAAGGCCGTGTGCATCGGGTAGGTGCCA‑‑GTGCCGGGATTACCTTGATTGATGACAACAATCATCAGGCGGCAGAAGTGATGTCGCAGGCTGATATCGCCTGTTATGCCTCCAAAAATGGTGGCCGGGGCCGGGTGACGGTTTACGAACCgcagca < 1:950288/183‑1 (MQ=255) tGCCGTGAATGACTATCACTTTATATGGGAAGGCCGTGTGCATCGGGTAGGTGCCA‑‑GTGCCGGGATTACCTTGATTGATGACAACAATCATCAGGCGGCAGAAGTGATGTCGCAGGCTGATATCGCCTGTTATGCCTCCAAAAATGGTGGCCGGGGCCGGGTGACGGTTTACGAACCGCAGCAAGCTGCCGCACATAGCGaa > 2:175449/1‑202 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |