Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 1,738,163 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 1,738,163 | 0 | A | T | 99.6% | 553.2 / NA | 234 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base T (125/107); total (126/108) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,738,164 | 0 | G | C | 99.6% | 549.1 / NA | 234 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/0); new base C (125/107); total (126/108) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,738,165 | 0 | C | G | 99.6% | 550.7 / NA | 234 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base G (125/108); total (126/108) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 234 total aligned reads displayed.
TATATTTGTTTTCATAATATTTCGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTAGCGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAGCATTTCTGGCTTACGGATGTCACTTATTCTAACGGCATGTTTATTGGCGTAATCAGCAATGACCCTGGTATTGTTACAAACGTAGAATATGGCCAGGAGTGGAAAATCAAGAAAGAAGA > CP042583/1737886‑1738440 ||| tttCATAATATTTCGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACggg > 2:2209646/1‑288 (MQ=255) tttCATAATATTTCGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACggg < 1:2209646/288‑1 (MQ=255) ttatattTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGAc < 2:922175/289‑1 (MQ=255) tattTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACAGCGAGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGGCTGAcgcg > 1:1150006/1‑289 (MQ=255) aTGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAA‑CCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGTTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGCTGTCTGgcgctgtccataa > 2:2167650/1‑280 (MQ=255) aaCCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGgaaagaaa > 2:1167999/1‑288 (MQ=255) aCCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATa < 2:2039472/245‑1 (MQ=255) attTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATc > 2:1448819/1‑289 (MQ=255) attTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATc < 2:1342823/289‑1 (MQ=255) attTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATc > 2:225774/1‑289 (MQ=255) attTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATc > 1:2454903/1‑289 (MQ=255) atatGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGTTATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGtt < 2:2436689/289‑1 (MQ=255) tatGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGgaaaga > 2:970603/1‑266 (MQ=255) atGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTAt < 1:154596/289‑1 (MQ=255) gggAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGaa > 1:1339183/1‑289 (MQ=255) aCCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATaaaaa > 1:1739521/1‑289 (MQ=255) aCCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATaaaaa > 2:395474/1‑289 (MQ=255) cTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGAc < 2:2637532/197‑1 (MQ=255) cTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGAc < 1:2119748/228‑1 (MQ=255) cTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGAc > 2:2119748/1‑228 (MQ=255) cTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGAt > 1:1281321/1‑288 (MQ=255) aaTAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCg > 1:1566320/1‑262 (MQ=255) aaTAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCg < 2:1566320/262‑1 (MQ=255) tAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACAGATAAATTCATCGAGGTTATGAAAAAAAAAGATGCCAATACt > 2:1524536/1‑289 (MQ=255) aaaTGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATgcg < 2:59131/232‑1 (MQ=255) aaaTGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATgcg > 1:59131/1‑232 (MQ=255) gATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAg > 1:1685988/1‑289 (MQ=255) tACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGAt < 1:1448819/288‑1 (MQ=255) tACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGAt < 1:688391/288‑1 (MQ=255) aattcaattTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATgcg > 2:605595/1‑204 (MQ=255) aattcaattTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATgcg < 1:605595/204‑1 (MQ=255) ttcaattTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGa > 1:868897/1‑191 (MQ=255) aattTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGgaaga > 1:2474739/1‑289 (MQ=255) aattTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGgaaga > 1:275819/1‑289 (MQ=255) aattTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGCTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGAGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGCCGCGATTAAACGTGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCACGGTTATGAAAAAAAAAGATGCCGATCCTTTCGCAGTCAAGGCCCGGATAAACGATCACGgaaca > 2:2658170/1‑287 (MQ=255) tttCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGgaagaa > 1:1447958/1‑288 (MQ=255) tttCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGAAGCCGATAATTTCGCAGTCAAATCTCCGAAAAACGACAACGgaaaaa > 2:956194/1‑288 (MQ=255) cGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAACGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGATTAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGgaagcaacca > 2:1853791/1‑283 (MQ=255) cGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGAc > 1:1241815/1‑179 (MQ=255) cGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGAc < 2:1241815/179‑1 (MQ=255) cGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGgaaga > 2:1970458/1‑284 (MQ=255) cGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGgaaga < 1:1970458/284‑1 (MQ=255) ggCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAg < 1:521225/289‑1 (MQ=255) gCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGGTATGAAAAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAGc > 2:1296177/1‑289 (MQ=255) aTAATTATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGTGCTTTATTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGAt < 1:2599326/268‑1 (MQ=255) aaCTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGTGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAGCATTTCTGGCTTACg < 1:1370292/289‑1 (MQ=255) aCTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACgg < 2:2536532/133‑1 (MQ=255) aCTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAGCATTTCTGGCTTACgg > 2:2350910/1‑289 (MQ=255) aCTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAGCATTTCTGGCTTACgg > 1:943413/1‑289 (MQ=255) cTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGAAACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCTAGCAGTTCCGGCCTACGGa > 2:650752/1‑289 (MQ=255) ttCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAGCATTTCTGGCTTACGGAt < 1:225774/289‑1 (MQ=255) cacaGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAGCATTTCTGGCTTACGGAt < 2:1347408/286‑1 (MQ=255) cacaGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAGCATTTCTGGCTTACGGATGTc > 2:1923214/1‑289 (MQ=255) cacaGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAGCATTTCTGGCTTACGGATGTc > 1:2303420/1‑289 (MQ=255) acaGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAGCATTTCTGGCTTACGGAt > 1:97232/1‑285 (MQ=255) gTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAg < 2:2140808/210‑1 (MQ=255) gTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAg > 1:2140808/1‑210 (MQ=255) tGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAGCATTTCTGGCTTACGGATGTCACTTATTCTa > 1:83253/1‑289 (MQ=255) tAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAGCATTTCTGGCTTACGGATGTCACTTATTCTAACg < 2:1056235/289‑1 (MQ=255) aCTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTAt < 2:755510/189‑1 (MQ=255) aCTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATAACGGAAGAACCGAGCATTTCTGGCTTACGGAt > 2:19841/1‑271 (MQ=255) aCTTTGAATACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTTCTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGACGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAGCATTTCTGGCTTACGGATGTCACTTATTCTAACGGc < 2:2108311/289‑1 (MQ=255) cTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGTCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAGCATTTCTGGCTTACGGATTACACTTATTCTAACGGCa > 2:2720968/1‑289 (MQ=255) aaaGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAGCATTTCTGGCTTACGGATGTCACTTATTCTAACGGCATGTTTATTgg > 2:422547/1‑289 (MQ=255) aaGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAGCATTTCTGGCTTACGGATGTCACTTATTCTAACGGCATGTTTATTGGc < 1:33732/289‑1 (MQ=255) ttCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAGCATTTCTGGCTTACGGATGTCACTTATTCTAACGGCATGTTTATTGGc < 1:1828673/283‑1 (MQ=255) ttCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAGCATTTCTGGCTTACGGATGTCACTTATTCTAACGGCATGTTTATTGGc > 2:1828673/1‑283 (MQ=255) ttCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAGCATTTCTGGCTTACGGATGTCACTTATTCTAACGGCATGTTTATTGGCTTAATc > 1:1337254/1‑289 (MQ=255) ttCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAGCATTTCTGGCTTACGGATGTCACTTATTCTAACGGCATGTTTATTGGCGTAATc > 2:856357/1‑289 (MQ=255) gagaAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAGCATTTCTGGCTTACGGATGTCACTTATTCTAACGGCATGTTTATTGGCGTAATCAGCaa > 1:2520251/1‑289 (MQ=255) gaAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAGCATTTCTGGCTTACGGATGTCACTTATTCTAACGGCATGTTTATTGGCGTAATCAGCAAt < 1:732079/288‑1 (MQ=255) gaAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAGCATTTCTGGCTTACGGATGTCACTTATTCTAACGGCATGTTTATTGGCGTAATCAGCAAt < 1:1984570/288‑1 (MQ=255) aaaaaaTGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGa < 1:2643636/84‑1 (MQ=255) aaaaaTGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAGCATTTCTGGCTTACGGATGTCACTTATTCTAACGGCATGTTTATTGGCGTAATCAGCAATGAc < 1:1848034/289‑1 (MQ=255) aaaaTAAAAAAGATATTACTTATGTTTAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGTAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAGCATTTCTGGCTTACGGATGTCACTTATTCTAACGGCATGTTTATTGGCGTAATCAGCAATGAcc < 1:2167650/289‑1 (MQ=255) aaaTGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAGCATTTCTGGCTTACGGATGTCACTTATTCTAACGGCATGTTTATTGGCGTAATCAGCAATGAccc < 1:2618692/289‑1 (MQ=255) gAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAAcc < 1:970313/202‑1 (MQ=255) tatTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAGCATTTCTGGCTTACGGATGTCACTTATTCTAACGGCATGTTTATTGGCGTAATCAGCAATGACCCTGGTATTGTTa < 1:395474/288‑1 (MQ=255) tatTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAGCATTTCTGGCTTACGGATGTCACTTATTCTAACGGCATGTTTATTGGCGTAATCAGCAATGACCCTGGTATTGTTAc < 2:1281321/289‑1 (MQ=255) atTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAGCATTTCTGGCTTACGGATGTCACTTATTCTAACGGCATGTTTATTGGCGTAATCAGCAATGACCCTGGTATTGTTACa > 2:1498989/1‑289 (MQ=255) cTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGTAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAGCATTTCTGGCTTACGGATGTCACTTATTCTAACGGCATGTTTATTGGCGTAATCAGCAATGACCCTGGTATTGTTACAAACg < 1:2697518/289‑1 (MQ=255) cTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAGCATTTCTGGCTTACGGATGTCACTTATTCTAACGGCATGTTTATTGGCGTAATCAGCAATGACCCTGGTATTGTTACAAACg < 2:2424591/289‑1 (MQ=255) ttATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAGCATTTCTGGCTTACGGATGTCACTTATTCTAACGGCATGTTTATTGGCGTAATCAGCAATGACCCTGGTATTGTTACAAACGt < 2:83253/289‑1 (MQ=255) ttATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAGCATTTCTGGCTTACGGATGTCACTTATTCTAACGGCATGTTTATTGGCGTAATCAGCAATGACCCTGGTATTGTTACAAACGt < 1:1498989/289‑1 (MQ=255) aTGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAGCATTTCTGGCTTACGGATGTCa > 2:1389339/1‑226 (MQ=255) aTGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAGCATTTCTGGCTTACGGATGTCACTTATTCTAACGGCATGTTTATTGGCGTAATCAGCAATGACCCTGGTATTGTTACAAACGTAg > 1:41587/1‑289 (MQ=255) aTGTGGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGGTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAGCATTTCTGGCTTACGGATGTCACTTATTCTAACGGc < 2:2503887/240‑1 (MQ=255) agTTGAGTCTGTTATTTTTTATGACCGCGGGCTTTAGTGAAGTGTCGGATACGGTATTGGCGGGGGGTTATGTTAAACCAGCGAAGTCGGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAAATCATCGAGATTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAGCATTTCTGGCTTACGGATGTCACTTATTCTAACGGAATGTTTATTGGCGTAATCAGCAATGACCCTGGTATTGTTACAAACGTAGa < 2:52320/288‑1 (MQ=255) aGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAGCATTTCTGGCTTACGGATGTCACTTATTCTAACGGCATGTTTATTGGCGTAATCAGCAATGAccc > 2:1609883/1‑263 (MQ=255) tCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACTGAGCATTTCTGGCTTACGGATGTCACTTATTCTAACGGCATGTTTATTGGCGTAATCAGCAATGACCCTGGTATTGTTACAAACGTAGAATATgg > 1:765933/1‑288 (MQ=255) tCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAGCATTTCTGGCTTACGGATGTCACTTATTCTAACGGCAt < 1:1117887/234‑1 (MQ=255) tCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAGCATTTCTGGCTTACGGATGTCACTTATTCTAACGGCAt > 2:1117887/1‑234 (MQ=255) tCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAGCATTTCTGGCTTACGGATGTCACTTATTCTAACGGCATGTTTATTGGCGTAATCAGCAAt > 2:1697522/1‑256 (MQ=255) tCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAGCATTTCTGGCTTACGGATGTCACTTATTCTAACGGCATGTTTATTGGCGTAATCAGCAATGACCCTGGTATTGTTACAAACGTAGAATATgg > 1:2490085/1‑288 (MQ=255) tGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAGCATTTCTGGCTTACGGATGTCACt < 1:1019306/218‑1 (MQ=255) gCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAGCATTTCTGGCTTACGGATGTCACTTATTCTAACGGCATGTTTATTGGCGTAATCAGCAATGACCCTGGTATTGTTACAAACGTAGAATATGGCCAg > 1:1941043/1‑289 (MQ=255) ccGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAGCATTTCTGGCTTACGGATGTCACTTATTCTAACGGCATGTTTATTGGCGTAATCAGCaa > 2:296540/1‑238 (MQ=255) ggCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAGCATTTCTGGCTTACGGATGTCACTTATTCTAACGGCATGTTTATTGGCGTAATCAGCAATGACCCTGGTATTGTTACAAACGTAGAATATGGCCAGGAGTGGAAAATCaagaaa < 2:709439/288‑1 (MQ=255) tttAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAGCATTTCTGGCTTACGGATGTCACTTATTCTAACGGCATGTTTATTGGCGTAATCAGCAATGACCCTGGTATTGTTACAAACGTAGAATATGGCCAGGAGTGGAAAATCAAGAaagaag < 2:2490085/289‑1 (MQ=255) ttAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAGCATTTCTGGCTTACGGATGTCACTTATTCTAACGGCATGTTTATTGGCGTAATCAGCAATGACCCTGGTATTGTTACAAACGTAGAATATGGCCAGGAGTGGAAAATCAAGAAagaaga < 1:1288293/289‑1 (MQ=255) ||| TATATTTGTTTTCATAATATTTCGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTAGCGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAGCATTTCTGGCTTACGGATGTCACTTATTCTAACGGCATGTTTATTGGCGTAATCAGCAATGACCCTGGTATTGTTACAAACGTAGAATATGGCCAGGAGTGGAAAATCAAGAAAGAAGA > CP042583/1737886‑1738440 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |