| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP042583 | 1,762,872 | 2 bp→TGA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP042583 | 1,762,871 | 1 | . | T | 98.8% | 619.6 / ‑0.6 | 259 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (2/1); new base T (133/123); total (135/124) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| * | CP042583 | 1,762,872 | 0 | C | G | 99.6% | 617.0 / NA | 259 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base G (134/124); total (135/124) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
| * | CP042583 | 1,762,873 | 0 | T | A | 99.6% | 620.6 / NA | 259 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base A (134/124); minor base G (1/0); total (135/124) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 270 total aligned reads displayed.
AGAATAATATCCCCTTGTTTACTATTTATTGTTGCTTTGTTACCTGTGGCTGGTAATTGACTAACGGGAATACTGTCTAAAGTAATTAATAAATCGTCCGGTTTGCAGGTTGTGGTTATCGGGTTGTAACTCAATGTCAGATTAAAGGAATAGACACCTGCATTTTGTGCCAATGCATTTCTGTAGCTATTTACACATGCATCCCAACTCTTGCCACCTAATAAACACAGTAGAAATTGTACTGCGGCACTCCCGCGTGTGCTACTA‑CTAGC‑ACTGGATAATGTCGCAACACCATTAATCATCACACTACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACACTATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTACTCAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCGCTCGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCAACTGCTATCATTAAAATTATGCTCATATGTCGCC > CP042583/1762605‑1763162 ||| aGAATTATATCACCTTGTTTACTATTTATTGTTGCTTTGGTACCTGTGGCTGGTCATTGTGAAACGGGAATACTGTCTAAAGTAATTAATAAATCGTCCGGTTTGCAGGTTGTGGTTATCGGTTTGTATGACAATGTCAGATTAAAGGAATAGACACCTGCATTTTGTGCCAATGCATTTCTGTAGCTATTTACACATGCATCCCATGACTTGCCACCTAATAAACACAGTAGAAATTGTACTGCGGCACTCCCGCGTGT‑CGATGATGAAGC‑ACTGGATAATGTCGCaa < 1:2151981/289‑1 (MQ=255) aataatATCCCCTTGTTTACTATTTATTGTTGCTTTGTTACCTGTGGCTGGTAATTGTGAAACGGGAATACTGTCTAAAGTAATTAATAAATCGTCCGGTTTGCAGGTTGTGGTTATCGGGTTGTATGACAATGTCAGATTAAAGGAATAGACACCTGCATTTTGTGCCAATGCATTTCTGTAGCTATTTACACATGCATCCCATGACTTGCCACCTAATAAACACAGTAGAAATTGTACTGCGGCACTCCCGCGTGT‑CGATGATGAAGC‑ACTGGATAATGTCGCAac > 2:490498/1‑288 (MQ=255) ataataTCCCCTTGTTTACTATTTATTGTTGCTTTGTTACCTGTGGCTGGTAATTGTGAAACGGGAATACTGTCTAAAGTAATTAATAAATCGTCCGGTTTGCAGGTTGTGGTTATCGGGTTGTATGACAATGTCAGATTAAAGGAATAGACACCTGCATTTTGTGCCAATGCATTTCTGTAGCTATTTACACATGCATCCCATGACTTGCCACCTAATAAACACAGTAGAAATTGTACTGCGGCACTCCCGCGTGT‑CGATGATGAAGC‑ACTGGATAATGTCGCAac < 2:1978836/287‑1 (MQ=255) ccTTGTTTACTATTTATTGTTGCTTTGTTACCTGTGGCTGGTAATTGTGAAACGGGAATACTGTCTAAAGTAATTAATAAATCGTCCGGTTTGCAGGTTGTGGTTATCGGGTTGTATGACAATGTCAGATTAAAGGAATAGACACCTGCATTTTGTGCCAATGCATTTCTGTAGCTATTTACACATGCATCCCATGACTTGCCACCTAATAAACACAGTAGAAATTGTACTGCGGCCCGCTCGCGTGT‑CGATGA‑CGAACAACTGGATAATGTCGCAATCACATTaaa > 2:2194637/1‑286 (MQ=255) ttGTTTACTATTTATTGTTGCTTTGTTACCTGTGGCTGGTAATTGTGAAACGGGAATACTGTCTAAAGTAATTAATAAATCGTCCGGTTTGCAGGTTGTGGTTATCGGGTTGTATGACAATGTCAGTTTAAAGGAATAGACACCTGCATTTTGTGCCAATGCATTTCTGTAGCTATTTACACATGCATCCCATGACTTGCCACCTAATAAACACAGTAGAAATTGTACTGCGGCACTCCCGCGTGT‑CGATGATGAAGC‑ACTGGATAATGTCGCaa < 2:1238851/275‑1 (MQ=255) ttGTTTACTATTTATTGTTGCTTTGTTACCTGTGGCTGGTAATTGTGAAACGGGAATACTGTCTAAAGTAATTAATAAATCGTCCGGTTTGCAGGTTGTGGTTATCGGGTTGTATGACAATGTCAGATTAAAGGAATAGACACCTGCATTTTGTGCCAATGCATTTATGTAGCTATTTACACATGCATCCCATGACTTGCCACCTAATAAACACAGTAGAAATTGTACTGCGGCCTTCCCGCGTGT‑CGATGATGAAGC‑ACTGGATAATGTCCCAAACCTATTAatcatc > 2:1406838/1‑289 (MQ=255) gTTTACTATTTATTGTTGCTTTGTTACCTGTGGCTGGTAATTGTGAAACGGGAATACTGTCTAAAGTAATTAATAAATCGTCCGGTTTGCAGGTTGTGGTTATCGGGTTGTATGACAATGTCAGATTAAAGGAATAGACACCTGCATTTTGTGCCAATGCATTTCTGTAGCTATTTACACATGCATCCCATGACTTGCCACCTAATAAACACAGTAGAAATTGTACTGCGGCACTCCCGCGTGT‑CGATGATGAAGC‑ACTGGATAATGTCGCAACACCATTAatcatc > 1:1864718/1‑287 (MQ=255) ttACTATTTATTGTTGCTTTGTTACCTGTGGCTGGTAATTGTGAAACGGGAATACTGTCTAAAGTAATTAATAAATCGTCCGGTTTGCAGGTTGTGGTTATCGGGTTGTATGACAATGTCAGATTAAAGGAATAGACACCTGCATTTTGTGCCAATGCATTTCTGTAGCTATTTACACATGCATCCCATGACTTGCCACCTAATAAACACAGTAGAAATTGTACTGCGGCACTCCCGCGTGT‑CGATGATGAAGC‑ACTGGATAATGTCGCAACACCATTAATCATcact < 1:1410841/288‑2 (MQ=255) ttgCTTTGTTACCTGTGGCTGGTAATTGTGAAACGGGAATACTGTCTAAAGTAATTAATAAATCGTCCGGTTTGCAGGTTGTGGTTATCGGGTTGTATGACAATGTCAGATTAAAGGAATAGACACCTGCATTTTGTGCCAATGCATTTCTGTAGCTATTTACACATGCATCCCATGACTTGCCACCTAATAAACACAGTAGAAATTGTACTGCGGCACTCCCGCGTGT‑CGATGATGAAGC‑ACTGGATAATGTCGCAACACCATTAATCATCACTGAACCGCCGcccc > 1:2710804/1‑288 (MQ=255) cTTTGTTACCTGTGGCTGGTAATTGTGAAACGGGAATACTGTCTAAAGTAATTAATAAATCGTCCGGTTTGCAGGTTGTGGTTATCGGGTTGTATGACAATGTCAGATTAAAGGAATAGACACCTGCATTTTGTGCCAATGCATTTCTGTAGCTATTTACACATGCATCCCATGACTTGCCACCTAATAAACACAGTAGAAATTGTACTGCGGCACTCCCGCGTGT‑CGATGATGAAGC‑ACTGGATAATGTCGCAACACCATTAATCATCACTGAACCGCCGCCCCCCGc > 1:667731/1‑289 (MQ=255) cTTTGTTACCTGTGGCTGGTAATTGTGAAACGGGAATACTGTCTAAAGTAATTAATAAATCGTCCGGTTTGCAGGTTGTGGTTATCGGGTTGTATGACAATGTCAGATTAAAGGAATAGACACCTGCATTTTGTGCCAATGCATTTCTGTAGCTATTTACACATGCATCCCATGACTTGCCACCTAATAAACACAGTAGAAATTGTACTGCGGCACTCCCGCGTGT‑CGATGATGAAGC‑ACTGGATAATGTCGCAACACCATTAATCACCACTGAACCGCAGCCCCCCga > 1:2310434/1‑288 (MQ=255) ttGTTACCTGTGGCTGGTAATTGTGAAACGGGAATACTGTCTAAAGTAATTAATAAATCGTCCGGTTTGCAGGTTGTGGTTATCGGGTTGTATGACAATGTCAGATTAAAGGAATAGACACCTGCATTTTGTGCCAATGCATTTCTGTAGCTATTTACACATGCATCCCATGACTTGCCACCTAATAAACACAGTAGAAATTGTACTGCGGCACTCCCGCGTGT‑CGATGATGAAGC‑ACTGGATAATGTCGCAACACCATTAATCATCACTGAACCGCCGCCCCCCGCAg < 1:2474424/289‑1 (MQ=255) cTGTGGCTGGTAATTGTGAAACGGGAATACTGTCTAAAGTAATTAATAAATCGTCCGGTTTGCAGGTTGTGGTTATCGGGTTGTATGACAATGTCAGATTAAAGGAATAGACACCTGCATTTTGTGCCAATGCATTTCTGTAGCTATTTACACATGCATCCCATGACTTGCCACCTAATAAACACAGTAGAAATTGTACTGCGGCACTCCCGCGTGT‑CGATGATGAAGC‑ACTGGATAATGTCGCAACACCATTAATCATCACTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACAtt < 2:2710804/289‑1 (MQ=255) ggCTGGTAATTGTGAAACGGGAATACTGTCTAAAGTAATTAATAAATCGTCCGGTTTGCAGGTTGTGGTTATCGGGTTGTATGACAATGTCAGATTAAAGGAATAGACACCTGCATTTTGTGCCAATGCATTTCTGTAGCTATTTACACATGCATCCCATGACTTGCCACCTAATAAACACAGTAGAAATTGTACTGCGGCACTCCCGCTTGT‑CGATGATGAAGC‑ACTGGATAATGTCGCaa > 2:606867/1‑242 (MQ=255) aaCGGGAATACTGTCTAAAGTAATTAATAAATCGTCCGGTTTGCAGGTTGTGGTTATCGGGTTGTATGACAATGTCAGATTAAAGGAATAGACACCTGCATTTTGTGCCAATGCATTTCTGTAGCTATTTACACATGCATCCCATGACTTGCCACCTAATAAACACAGTAGAAATTGTACTGCGGCACTCCCGCGTGT‑CGATGATGAAGC‑ACTGGATAATGTCGCAACACCATTAATCATCACTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGcc < 1:169109/289‑1 (MQ=255) aaTACTGTCTAAAGTAATTAATAAATCGTCCGGTTTGCAGGTTGTGGTTATCGGGTTGTATGACAATGTCAGATTAAAGGAATAGACACCTGCATTTTGTGCCAATGCATTTCTGTAGCTATTTACACATGCATCCCATGACTTGCCACCTAATAAACACAGTAGAAATTGTACTGCGGCACTCCCGCGTGT‑CGATGATGAAGC‑ACTGGATAATGTCGCAACACCATTAATCATCACTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGgt < 2:1091396/289‑1 (MQ=255) tACTGCTTAAAGTCAGTAATGAATCTGCCGTTTTGCAGGTTGTGGTTATCGGGTTGTATGACAATGTCAGATTAAAGGAATAGACACCTGCATTTTGTGCCAATGCATTTCTGTAGCTATTTACACATGCATCCCATGACTTGCCACCTAATAAACACAGTAGAAATTGTACTGCGGCACTCCCGCGTGT‑CGATGATGAAGC‑ACTGGATAATGTCGCAACACCATTAATCATCACTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGgtgt < 2:2206645/289‑1 (MQ=255) gTCTAAAGTAATTAATAAATCGTCCGGTTTGCAGGTTGTGGTTATCGGGTTGTATGACAATGTCAGATTAAAGGAATAGACACCTGCATTTTGTGCCAATGCATTTCTGTAGCTATTTACACATGCATCCCATGACTTGCCACCTAATAAACACAGTAGAAATTGTACTGCGGCACTCCCGCGTGT‑CGATGATGAAGC‑ACTGGATAATGTCGCaa < 2:2604961/215‑1 (MQ=255) gTCTAAAGTAATTAATAAATCGTCCGGTTTGCAGGTTGTGGTTATCGGGTTGTATGACAATGTCAGATTAAAGGAATAGACACCTGCATTTTGTGCCAATGCATTTCTGTAGCTATTTACACATGCATCCCATGACTTGCCACCTAATAAACACAGTAGAAATTGTACTGCGGCACTCCCGCGTGT‑CGATGATGAAGC‑ACTGGATAATGTCGCaa > 1:2604961/1‑215 (MQ=255) tCTAAAGTAATTAATAAATCGTCCGGTTTGCAGGTTGTGGTTATCGGGTTGTATGACAATGTCAGATTAAAGGAATAGACACCTGCATTTTGTGCCAATGCATTTCTGTAGCTATTTACACATGCATCCCATGACTTGCCACCTAATAAACACAGTAGAAATTGTACTGCGGCACTCCCGCGTGT‑CGATGATGAAGC‑ACTGGATAATGTCGc < 2:306837/212‑1 (MQ=255) tCTAAAGTAATTAATAAATCGTCCGGTTTGCAGGTTGTGGTTATCGGGTTGTATGACAATGTCAGATTAAAGGAATAGACACCTGCATTTTGTGCCAATGCATTTCTGTAGCTATTTACACATGCATCCCATGACTTGCCACCTAATAAACACAGTAGAAATTGTACTGCGGCACTCCCGCGTGT‑CGATGATGAAGC‑ACTGGATAATGTCGc > 1:306837/1‑212 (MQ=255) tCTAAAGTAATTAATAAATCGTCCGGTTTGCAGGTTGTGGTTATCGGGTTGTATGACAATGTCAGATTAAAGGAATAGACACCTGCATTTTGTGCCAATGCATTTCTGTAGCTATTTACACATGCATCCCATGACTTGCCACCTAATAAACACAGTAGAAATTGTACTGCGGCACTCCCGCGTGT‑CGATGATGAAGC‑ACTGGATAATGTCGCAACACCATTAATCATCACTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCg > 2:2279785/1‑289 (MQ=255) aaaGTAATTAATAAATCGTCCGGTTTGCAGGTTGTGGTTATCGGGTTGTATGACAATGTCAGATTAAAGGAATAGACACCTGCATTTTGTGCCAATGCATTTCTGTAGCTATTTACACATGCATCCCATGACTTGCCACCTAATAAACACAGTAGAAATTGTACTGCGGCACTCCCGCGTGT‑CGATGATGAAGC‑ACTGGATAATGTCGCAACACCATTAATCATCACTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTaa < 1:1053434/289‑1 (MQ=255) ttaatAAATCGTCCGGTTTGCAGGTTGTGGTTATCGGGTTGTATGACAATGTCAGATTAAAGGAATAGACACCTGCATTTTGTGCCAATGCATTTCTGTAGCTATTTACACATGCATCCCATGACTTGCCACCTAATAAACACAGTAGAAATTGTACTGCGGCACTCCCGCGTGT‑CGATGATGAAGC‑ACTGGATAATGTCGCAACACCATTAATCATCACTGAACCGCCGCCCCCCg < 1:917177/237‑1 (MQ=255) ttaatAAATCGTCCGGTTTGCAGGTTGTGGTTATCGGGTTGTATGACAATGTCAGATTAAAGGAATAGACACCTGCATTTTGTGCCAATGCATTTCTGTAGCTATTTACACATGCATCCCATGACTTGCCACCTAATAAACACAGTAGAAATTGTACTGCGGCACTCCCGCGTGT‑CGATGATGAAGC‑ACTGGATAATGTCGCAACACCATTAATCATCACTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGgt > 1:2023341/1‑272 (MQ=255) ttaatAAATCGTCCGGTTTGCAGGTTGTGGTTATCGGGTTGTATGACAATGTCAGATTAAAGGAATAGACACCTGCATTTTGTGCCAATGCATTTCTGTAGCTATTTACACATGCATCCCATGACTTGCCACCTAATAAACACAGTAGAAATTGTACTGCGGCACTCCCGCGTGT‑CGATGATGAAGC‑ACTGGATAATGTCGCAACACCATTAATCATCACTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAactgaata > 1:119156/1‑283 (MQ=255) ttaatAAATCGTCCGGTTTGCAGGTTGTGGTTATCGGGTTGTATGACAATGTCAGATTAAAGGAATAGACACCTGCATTTTGTGCCAATGCATTTCTGTAGCTATTTACACATGCATCCCATGACTTGCCACCTAATAAACACAGTAGAAATTGTACTGCGGCACTCCCGCGTGT‑CGATGATGAAGC‑ACTGGATAATGTCGCAACACCATTAATCATCACTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAactgaata > 1:2001487/1‑283 (MQ=255) ttaatAAATCGTCCGGTTTGCAGGTTGTGGTTATCGGGTTGTATGACAATGTCAGATTAAAGGAATAGACACCTGCATTTTGTGCCAATGCATTTCTGTAGCTATTTACACATGCATCCCATGACTTGCCACCTAATAAACACAGTAGAAATTGTACTGCGGCACTCCCGCGTGT‑CGATGATGAAGC‑ACTGGATAATGTCGCAACACCATTAATCATCACTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAactgaata > 2:679720/1‑283 (MQ=255) taaATCGTCCGGTTTGCAGGTTGTGGTTATCGGGTTGTATGACAATGTCAGATTAAAGGAATAGACACCTGCATTTTGTGCCAATGCATTTCTGTAGCTATTTACACATGCATCCCATGACTTGCCACCTAATAAACACAGTAGAAATTGTACTGCGGCACTCCCGCGTGT‑CGATGATGAAGC‑ACTGGATAATGTCGCAACACCATTAATCATCACTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCa < 1:2553439/289‑1 (MQ=255) tatgccGGTTTTCAGGTTGTGGGTATCGGGTTGTATGACAAGGACAGATTAAAGGAATAGACACCTTCCTTTTGTGCCAATGCATTTCTGTAGCTATTTACACATGCATCCCATGACTTGCCACCTAATAAACACAGTAGAAATTGTACTGCGGCACTCCCGCGTGT‑CGATGATGAAGC‑ACTGGATAATGTCGCAACACCATTAATCATCACTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTgg < 2:12171/285‑1 (MQ=255) tCCGGTTTGCAGGTTGTGGTTATCGGGTTGTATGACAATGTCAGATTAAAGGAATAGACACCTGCATTTTGTGCCAATGCATTTCTGTAGCTATTTACACATGCATCCCATGACTTGCCACCTAATAAACACAGTAGAAATTGTACTGCGGCACTCCCGCGTGT‑CGATGATGAAGC‑ACTGGATAATGTCGCAACACCATTAATCATCACTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGa > 1:2628093/1‑289 (MQ=255) cGGTTTGCAGGTTGTGGTTATCGGGTTGTATGACAATGTCAGATTAAAGGAATAGACACCTGCATTTTGTGCCAATGCATTTCTGTAGCTATTTACACATGCATCCCATGACTTGCCACCTAATAAACACAGTAGAAATTGTACTGCGGCACTCCCGCGTGT‑CGATGATGAAGC‑ACTGGATAATGTCGCAACACCATTAATCATCACTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGaaa < 1:2279785/289‑1 (MQ=255) cGGTTTGCAGGTTGTGGTTATCGGGTTGTATGACAATGTCAGATTAAAGGAATAGACACCTGCATTTTGTGCCAATGCATTTCTGTAGCTATTTACACATGCATCCCATGACTTGCCACCTAATAAACACAGTAGAAATTGTACTGCGGCACTCCCGCGTGT‑CGATGATGAAGC‑ACTGGATAATGTCGCAACACCATTAATCATCACTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGaaa < 1:1911303/289‑1 (MQ=255) tGCAGGTTGTGGTTATCGGGTTGTATGACAATGTCAGATTAAAGGAATAGACACCTGCATTTTGTGCCAATGCATTTCTGTAGCTATTTACACATGCATCCCATGACTTGCCACCTAATAAACACAGTAGAAATTGTACTGCGGCACTCCCGCGTGT‑CGATGATGAAGC‑ACTGGATAATGTCGCAACACCATTAATCATCACTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGt < 1:606053/289‑1 (MQ=255) tgtgGTTATCGGGTTGTATGACAATGTCAGATTAAAGGAATAGACACCTGCATTTTGTGCCAATGCATTTCTGTAGCTATTTACACATGCATCCCATGACTTGCCACCTAATAAACACAGTAGAAATTGTACTGCGGCACTCCCGCGTGT‑CGATGATGAAGC‑ACTGGATAATGTCGCAACACCATTAATCATCACTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGt < 2:788169/255‑1 (MQ=255) gtgGTTATCGGGTTGTATGACAATGTCAGATTAAAGGAATAGACACCTGCATTTTGTGCCAATGCATTTCTGTAGCTATTTACACATGCATCCCATGACTTGCCACCTAATAAACACAGTAGAAATTGTACTGCGGCACTCCCGCGTGT‑CGATGATGAAGC‑ACTGGATAATGTCGCAACACCATTAATCATCACTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGattat > 1:2413931/1‑289 (MQ=255) ttgtatgacAATGTCAGATTAAAGGAATAGACACCTGCATTTTGTGCCAATGCATTTCTGTAGCTATTTACACATGCATCCCATGACTTGCCACCTAATAAACACAGTAGAAATTGTACTGCGGCACTCCCGCGTGT‑CGATGATGAAGC‑ACTGGATAATGTCGCAACACCATTAATCATCACTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTg < 1:466427/280‑1 (MQ=255) gtatgacAATGTCAGATTAAAGGAATAGACACCTGCATTTTGTGCCAATGCATTTCTGTAGCTATTTACACATGCATCCCATGACTTGCCACCTAATAAACACAGTAGAAATTGTACTGCGGCACTCCCGCGTGT‑CGATGATGAAGC‑ACTGGATAATGTCGCAACACCATTAATCATCACTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGAtg > 1:1230834/7‑289 (MQ=255) gacAATGTCAGATTAAAGGAATAGACACCTGCATTTTGTGACAATGCATTTCTGTAGCTATTTACACAAGCATCCCATGACTTGCCACCTAATACACACAGTAGAAATTGTACTGCGGCACTCCCGCGTGT‑CGATGATGAAGC‑ACTGGATAATGTCGCAACACCATTAATCATCACTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGAtgttgt < 2:2071308/287‑1 (MQ=255) acAATGTCAGATTAAAGGAATAGACACCTGCATTTTGTGCCAATGCATTTCTGTAGCTATTTACACATGCATCCCATGACTTGCCACCTAATAAACACAGTAGAAATTGTACTGCGGCACTCCCGCGTGT‑CGATGATGAAGC‑ACTGGATAATGTCGCAACACCATTAATCATCACTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATgttgtt > 1:1136444/2‑289 (MQ=255) aaTGTCAGATTAAAGGAATAGACACCTGCATTTTGTGCCAATGCATTTCTGTAGCTATTTACACATGCATCCCATGACTTGCCACCTAATAAACACAGTAGAAATTG‑ACTGCGGCACTCCCGCGTGT‑CGATGATGAAGC‑ACTGGATAATGTCGCAACACCATTAATCATCATTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGttttt > 2:348319/1‑289 (MQ=255) tGTCAGATTAAAGGAATAGACACCTGCATTTTGTGCCAATGCATTTCTGTAGCTATTTACACATGCATCCCATGACTTGCCACCTAATAAACACAGTAGAAATTGTACTGCGGCACTCCCGCGTGT‑CGATGATGAAGC‑ACTGGATAATGTCGCAACACCATTAATCATCACTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGgt < 2:444791/223‑1 (MQ=255) tCAGATTAAAGGAATAGACACCTGCATTTTGTGCCAATGCATTTCTGTAGCTATTTACACATGCATCCCATGACTTGCCACCTAATAAACACAGTAGAAATTGTACTGCGGCACTCCCGCGTGT‑CGATGATGAAGC‑ACTGGATAATGTCGCAACACCATTAATCATCACTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACAtt < 1:2288705/196‑1 (MQ=255) tCAGATTAAAGGAATAGACACCTGCATTTTGTGCCAATGCATTTCTGTAGCTATTTACACATGCATCCCATGACTTGCCACCTAATAAACACAGTAGAAATTGTACTGCGGCACTCCCGCGTGT‑CGATGATGAAGC‑ACTGGATAATGTCGCAACACCATTAATCATCACTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCa < 2:1183922/225‑1 (MQ=255) tCAGATTAAAGGAATAGACACCTGCATTTTGTGCCAATGCATTTCTGTAGCTATTTACACATGCATCCCATGACTTGCCACCTAATAAACACAGTAGAAATTGTACTGCGGCACTCCCGCGTGT‑CGATGATGAAGC‑ACTGGATAATGTCGCAACACCATTAATCATCACTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTTAAACTGGTCTGTTTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTAtt > 2:587311/1‑289 (MQ=255) tCAGATTAAAGGAATAGACACCTGCATTTTGTGCCAATGCATTTCTGTAGCTATTTACACATGCATCCCATGACTTGCCACCTAATAAACACAGTAGAAATTGTACTGCGGCACTCCCGCGTGT‑CGATGATGAAGC‑ACTGGATAATGTCGCAACACCATTAATCATCACTGAACCGCCGCCCCCAGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGattatttgacaacg < 1:1442335/273‑9 (MQ=255) tCAGATTAAAGGAATAGACACCTGCATTTTGTGCCAATGCATTTCTGTAGCTATTTACACATGCATCCCATGACTTGCCACCTAATAAACACAGTAGAAATTGTACTGCGGCACTCCCGCGTGT‑CGATGATGAAGC‑ACTGGATAATGTCGCAACACCATTAATCATCACTGAACCGCCGCCCCCAGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGattatttgacaacg > 2:1442335/1‑265 (MQ=255) aGGAATAGACACCTGCATTTTGTGCCAATGCATTTCTGTAGCTATTTACACATGCATCCCATGACTTGCCACCTAATAAACACAGTAGAAATTGTACTGCGGCACTCCCGCGTGT‑CGATGATGAAGC‑ACTGGATAATGTCGCAACACCATTAATCATCACTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCt < 2:911410/249‑1 (MQ=255) tAGACACCTGCATTTTGTGCCAATGCATTTCTGTAGCTATTTACACATGCATCCCATGACTTGCCACCTAATAAACACAGTAGAAATTGTACTGCGGCACTCCCGCGTGT‑CGATGATGAAGC‑ACTGGATAATGTCGCAACACCATTAATCATCACTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAAt > 1:390287/1‑289 (MQ=255) acCTGCATTTTGTGCCAATGCATTTCTGTAGCTATTTACACATGCATCCCATGACTTGCCACCTAATAAACACAGTAGAAATTGTACTGCGGCACTCCCGCGTGT‑CGATGATGAAGC‑ACTGGATAATGTCGCAACACCATTAATCATCACTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCt > 2:274908/1‑239 (MQ=255) acCTGCATTTTGTGCCAATGCATTTCTGTAGCTATTTACACATGCATCCCATGACTTGCCACCTAATAAACACAGTAGAAATTGTACTGCGGCACTCCCGCGTGT‑CGATGATGAAGC‑ACTGGATAATGTCGCAACACCATTAATCATCACTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCt < 1:274908/239‑1 (MQ=255) cTGCATTTTGTGCCAATGCATTTCTGTAGCTATTTACACATGCATCCCATGACTTGCCACCTAATAAACACAGTAGAAATTGTACTGCGGCACTCCCGCGTGT‑CGATGATGAAGC‑ACTGGATAATGTCGCAACACCATTAATCATCACTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAaatt > 1:2505400/1‑289 (MQ=255) tGCATTTTGTGCCAATGCATTTCTGTAGCTATTTACACATGCATCCCATGACTTGCCACCTAATAAACACAGTAGAAATTGTACTGCGGCACTCCCGCGTGT‑CGATGATGAAGC‑ACTGGATAATGTCGCAACACCATTAATCATCACTGAACCgccgcc < 1:673088/159‑1 (MQ=255) tgtgCCAATGCATTTCTGTAGCTATTTACACATGCATCCCATGACTTGCCACCTAATAAACACAGTAGAAATTGTACTGCGGCACTCCCGCGTGT‑CGATGATGAAGC‑ACTGGATAATGTCGCAACACCATTAATCATCACTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAATTTAATTTTa > 2:1649628/1‑289 (MQ=255) tgCCAATGCATTTCTGTAGCTATTTACACATGCATCCCATGACTTGCCACCTAATAAACACAGTAGAAATTGTACTGCGGCACTCCCGCGTGT‑CGATGATGAAGC‑ACTGGATAATGTCGCAACACCATTAATCATCACTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAactgaataac < 1:152060/209‑9 (MQ=255) tgCCAATGCATTTCTGTAGCTATTTACACATGCATCCCATGACTTGCCACCTAATAAACACAGTAGAAATTGTACTGCGGCACTCCCGCGTGT‑CGATGATGAAGC‑ACTGGATAATGTCGCAACACCATTAATCATCACTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAactgaataac > 2:152060/1‑201 (MQ=255) tgCCAATGCATTTCTGTAGCTATTTACACATGCATCCCATGACTTGCCACCTAATAAACACAGTAGAAATTGTACTGCGGCACTCCCGCGTGT‑CGATGATGAAGC‑ACTGGATAATGTCGCAACACCATTAATCATCACTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAATTTAATTTTAtt > 1:1390829/1‑288 (MQ=255) cAATGCATTTCTGTAGCTATTTACACATGCATCCCATGACTTGCCACCTAATAAACACAGTAGAAATTGTACTGCGGCACTCCCGCGTGT‑CGATGATGAAGC‑ACTGGATAATGTCGCAACACCATTAATCATCACTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAATTTAATTTTATGGTa < 2:2413931/289‑1 (MQ=255) cAATGCATTACTGTAGCTCTTTACATATGCATCCCAGGACTTGCCACCTAATAAACACAGTAGAAATTGTACTGCGGCACTCCGTCGTGT‑CGATGATGAAGC‑ACTGGATAATGTCGCAACACCCTTAATCATCACTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAATCATTCACTTTTGAATTCCTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGCATAACCCCTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAATTTAATTTTATGGTa < 1:1007031/289‑1 (MQ=255) gCTATTTACACATGCATCCCATGACTTGCCACCTAATAAACACAGTAGAAATTGTACTGCGGCACTCCCGCGTGT‑CGATGATGAAGC‑ACTGGATAATGTCGCAACACCATTAATCATCACTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCca > 1:82675/1‑289 (MQ=255) tACACATGCATCCCATGACTTGCCACCTAATAAACACAGTAGAAATTGTACTGCGGCACTCCCGCGTGT‑CGATGATGAAGC‑ACTGGATAATGTCGCAACACCATTAATCATCACTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACaata > 2:667860/1‑289 (MQ=255) tACACATGCATCCCATGACTTGCCACCTAATAAACACAGTAGAAATTGTACTGCGGCACTCCCGCGTGT‑CGATGATGAAGC‑ACTGGATAATGTCGCAACACCATTAATCATCACTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACaata > 2:47044/1‑289 (MQ=255) aTGCATCCCATGACTTGCCACCTAATAAACACAGTAGAAATTGTACTGCGGCACTCCCGCGTGT‑CGATGATGAAGC‑ACTGGATAATGTCGCAACACCATTAATCATCACTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCAc < 2:1895874/139‑1 (MQ=255) cATCCCATGACTTGCCACCTAATAAACACAGTAGAAATTGTACTGCGGCACTCCCGCGTGT‑CGATGATGAAGC‑ACTGGATAATGTCGCAACACCATTAATCATCACTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATccg > 1:1653506/1‑286 (MQ=255) cATCCCATGACTTGCCACCTAATAAACACAGTAGAAATTGTACTGCGGCACTCCCGCGTGT‑CGATGATGAAGC‑ACTGGATAATGTCGCAACACCATTAATCATCACTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATccg > 2:2552912/1‑286 (MQ=255) tcccatgactTGCCACCTAATAAACACAGTAGAAATTGTACTGCGGCACTCCCGCGTGT‑CGATGATGAAGC‑ACTGGATAATGTCGCAACACCATTAATCATCACTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGAt > 2:2299515/9‑212 (MQ=255) cccatgactTGCCACCTAATAAACACAGTAGAAATTGTACTGCGGCACTCCCGCGTGT‑CGATGATGAAGC‑ACTGGATAATGTCGCAACACCATTAATCATCACTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATccgacgg < 2:82675/282‑7 (MQ=255) cccatgactTGCCACCTAATAAACACAGTAGAAATTGTACTGCGGCACTCCCGCGTGT‑CGATGATGAAGC‑ACTGGATAATGTCGCAACACCATTAATCATCACTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATccgacgg < 1:1084680/282‑7 (MQ=255) gactTGCCACCTAATAAACACAGTAGAAATTGTACTGCGGCACTCCCGCGTGT‑CGATGATGAAGC‑ACTGGATAATGTCGCAACACCATTAATCATCACTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTa > 2:1293068/3‑216 (MQ=255) actTGCCACCTAATAAACACAGTAGAAATTGTACTGCGGCACTCCCGCGTGT‑CGATGATGAAGC‑ACTGGATAATGTCGCAACACCATTAATCATCACTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATccgacgg > 2:1995399/2‑277 (MQ=255) ttGCCACCTAATAAACACAGTAGAAATTGTACTGCGGCACTCCCGCGTGT‑CGATGATGAAGC‑ACTGGATAATGTCGCAACACCATTAATCATCACTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAg < 2:2077763/289‑1 (MQ=255) gCCACCTAATAAACACAGTAGAAATTGTACTGCGGCACTCCCGCGTGT‑CGATGATGAAGC‑ACTGGATAATGTCGCAACACCATTAATCATCACTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGattatttgaca < 2:1674065/194‑6 (MQ=255) gCCACCTAATAAACACAGTAGAAATTGTACTGCGGCACTCCCGCGTGT‑CGATGATGAAGC‑ACTGGATAATGTCGCAACACCATTAATCATCACTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGattatttgaca < 1:1604161/194‑6 (MQ=255) gCCACCTAATAAACACAGTAGAAATTGTACTGCGGCACTCCCGCGTGT‑CGATGATGAAGC‑ACTGGATAATGTCGCAACACCATTAATCATCACTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAATTTAATTTTATGGTATCGTtata > 2:2631422/1‑255 (MQ=255) gCCACCTAATAAACACAGTAGAAATTGTACTGCGGCACTCCCGCGTGT‑CGATGATGAAGC‑ACTGGATAATGTCGCAACACCATTAATCATCACTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATCTCCGACGGGCTCATAggg > 2:1031932/1‑289 (MQ=255) gCCACCTAATAAACACAGTAGAAATTGTACTGCGGCACTCCCGCGTGT‑CGATGATGAAGC‑ACTGGATAATGTCGCAACACCATTAATCATCACTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATccgacgg < 2:1889024/279‑7 (MQ=255) gCCACCTAATAAACACAGTAGAAATTGTACTGCGGCACTCCCGCGTGT‑CGATGATGAAGC‑ACTGGATAATGTCGCAACACCATTAATCATCACTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATccgacgg > 1:1889024/1‑273 (MQ=255) gCCACCTAATAAACACAGTAGAAATTGTACTGCGGCACTCCCGCGTGT‑CGATGATGAAGC‑ACTGGATAATGTCGCAACACCATTAATCATCACTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAggg > 1:407403/1‑289 (MQ=255) gCCACCTAATAAACACAGTAGAAATTGTACTGCGGCACTCCCGCGTGT‑CGATGATGAAGC‑ACTGGATAATGTCGCAACACCATTAATCATCACTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAggg > 1:1102168/1‑289 (MQ=255) gCCACCTAATAAACACAGTAGAAATTGTACTGCGGCACTCCCGCGTGT‑CGATGATGAAGC‑ACTGGATAATGTCGCAACACCATTAATCATCACTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAcgg > 1:1284318/1‑289 (MQ=255) aCCTAATAAACACAGTAGAAATTGTACTGCGGCACTCCCGCGTGT‑CGATGATGAAGC‑ACTGGATAATGTCGCAACACCATTAATCATCACTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGAtg < 1:1979883/199‑1 (MQ=255) cTAATAAACACAGACGAAATTCACCTGCGCCACTCCAGCGTGT‑CGATGATGAAGC‑ACTGGATAATGTCGCAACACCATTAATCATCACTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGAt < 2:1054415/289‑1 (MQ=255) taataaACACAGTAGAAATTGTACTGCGGCACTCCCGCGTGT‑CGATGATGAAGC‑ACTGGATAATGTCGCAACACCATTAATCATCACTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATa < 2:2505400/289‑1 (MQ=255) aataaACACAGTAGAAATTGTACTGCGGCACTCCCGCGTGT‑CGATGATGAAGC‑ACTGGATAATGTCGCAACACCATTAATCATCACTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAATTTAATTTTATGGTATCGTtata > 1:2147698/1‑248 (MQ=255) ataaACACAGTACAAATTGTACTGCGGCCCTCCCCCGTGT‑CGATGATGAAGC‑ACTGGATAATGTCGCAACACCATTAATCATCCCTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAATTTAATTTTATgg < 2:2385897/237‑1 (MQ=255) taaACACAGTAGAAATTGTACTGCGGCACTCCCGCGTGT‑CGATGATGAAGC‑ACTGGATAATGTCGCAACACCATTAATCATCACTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTa > 1:124020/1‑289 (MQ=255) caGTAGAAATTGTACTGCGGCACTCCCGCGTGT‑CGATGATGAAGC‑ACTGGATAATGTCGCAACACCATTAATCATCACTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGAt < 1:2347976/279‑1 (MQ=255) caGTAGAAATTGTACTGCGGCACTCCCGCGTGT‑CGATGATGAAGC‑ACTGGATAATGTCGCAACACCATTAATCATCACTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGt > 2:1614270/1‑288 (MQ=255) aGTAGAAATTGTACTGCGGCACTCCCGCGTGT‑CGATGATGAAGC‑ACTGGATAATGTCGCAACACCATTAATCATCACTGAACCGCCGCCCCCCg > 1:2103584/1‑94 (MQ=255) tAGAAATTGTACTGCGGCACTCCCGCGTGT‑CGATGATGAAGC‑ACTGGATAATGTCGCAACACCATTAATCATCACTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTTAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAACATCCGCCGGGCTCATACGGGTGATATTATTTGTACtt > 2:651171/1‑289 (MQ=255) tAGAAATTGTACTGCGGCACTCCCGCGTGT‑CGATGATGAAGC‑ACTGGATAATGTCGCAACACCATTAATCATCACTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGattatttgacaacg > 1:2387817/1‑171 (MQ=255) tAGAAATTGTACTGCGGCACTCCCGCGTGT‑CGATGATGAAGC‑ACTGGATAATGTCGCAACACCATTAATCATCACTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAATTTACTTTTATGGTATCGTTATATAGTCCAACAATAATATACCACGGTCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACtt > 2:1784770/1‑289 (MQ=255) tAGAAATTGTACTGCGGCACTCCCGCGTGT‑CGATGATGAAGC‑ACTGGATAATGTCGCAACACCATTAATCATCACTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAATTTAATTTTATGGTa < 2:938898/229‑1 (MQ=255) tAGAAATTGTACTGCGGCACTCCCGCGTGT‑CGATGATGAAGC‑ACTGGATAATGTCGCAACACCATTAATCATCACTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAATTTAATTTTATGGTa > 1:938898/1‑229 (MQ=255) aTTGTACTGCGGCACTCCCGCGTGT‑CGATGATGAAGC‑ACTGGATAATGTCGCAACACCATTAATCATCACTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCa > 1:766844/1‑289 (MQ=255) cTGCGGCACTCCCGCGTGT‑CGATGATGAAGC‑ACTGGATAATGTCGCAACACCATTAATCATCACTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCatgacga < 1:2204353/289‑7 (MQ=255) cgatgatgaaGC‑ACTGGATAATGTCGCAACACCATTAATCATCACTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAATTTAATTTTATGGTATCGTtata > 2:2332701/10‑207 (MQ=255) tgaaGC‑ACTGGATAATGTCGCAACACCATTAATCATCACTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAATTTAATTTTATGGTa > 2:2142163/4‑193 (MQ=255) tgaaGC‑ACTGGATAATGTCGCAACACCATTAATCATCACTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTATGCTCATATGt < 1:587311/285‑1 (MQ=255) aGC‑ACTGGATAATGTCGCAACACCATTAATCATCACTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTACAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTATGCTCATATGTCGcc > 1:711390/1‑289 (MQ=255) ||| AGAATAATATCCCCTTGTTTACTATTTATTGTTGCTTTGTTACCTGTGGCTGGTAATTGACTAACGGGAATACTGTCTAAAGTAATTAATAAATCGTCCGGTTTGCAGGTTGTGGTTATCGGGTTGTAACTCAATGTCAGATTAAAGGAATAGACACCTGCATTTTGTGCCAATGCATTTCTGTAGCTATTTACACATGCATCCCAACTCTTGCCACCTAATAAACACAGTAGAAATTGTACTGCGGCACTCCCGCGTGTGCTACTA‑CTAGC‑ACTGGATAATGTCGCAACACCATTAATCATCACACTACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACACTATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTACTCAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCGCTCGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCAACTGCTATCATTAAAATTATGCTCATATGTCGCC > CP042583/1762605‑1763162 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |