Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
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RA | CP042583 | 1,764,284 | 3 bp→TGA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP042583 | 1,764,285 | 0 | C | G | 99.5% | 493.3 / NA | 208 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base G (118/88); minor base A (0/1); total (119/89) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.30e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,764,286 | 0 | T | A | 100.0% | 500.1 / NA | 208 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base A (119/89); total (119/89) |
Only 100 of 208 total aligned reads displayed.
TTCCACTTAATCCCGTATTATTACTGGCAAACCCCTGATCATCAAACGTCGTACTGTTAGACATATATATTTGCCGACGAGGCGTGCTAACGTCATCACCCCAATCAAAGGGAATGCTTATAAAAATATTAAAACGTTTCTCTTCATGATGATTCTCGTCATAAGCCTGGCTTGCCGCGAGGGTATAGCTTATCCGTCGCAGGTTGTTGGAATAACTCAACTGATAATCCTTACTACTGCCGCTACGCCCCCAGTAATCTCGCCATAACGTACTTAAACTCACAGACCCCCAACCTTCTGGCAAACTCTGGCTCATATTGGCGGAAAAGCTATTTTTGCGGCCAAAATCGTTCTGGTAATAATCGGCAATGTCATAGACATCGTTTTCATCACGGCGATAATTATCTTTATTGTTTGCCCAAACGTGATCGTTAAATGTCCGGTAATCACGGCTGCTATAACGCCAGGCCGCCAGACCAAAACGCGTGCTCGTTTGGCTCACAAATTTGTTGTAGGCAATTTGATAACTTTGCCCGTCAAACACATCGCCGTT > CP042583/1764007‑1764559 ||| ttcctgatAATCCCGTATTATTTGAGGCAAACCCCTGATCATCAAACGTCGTTGAGTTAGACATATATATTTGCCGACGAGGCGTCGAAACGTCATCACCCCAATCAAAGGGAATCGATATAAAAATATTAAAACGTTTCTCTTCATGATGATTCTCGTCATAAGCCTGGCTTGCCGCGAGGGTATAGCTTATCCGTCGCAGGTTGTTGGAATAACTCAACTGATAATCCTTACTACTGCCGCTACGCCCCCAGTAATCTCGCCATCACGTACTTAATGACACAGAcc > 2:1082238/8‑288 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |