Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 517,872 | 3 bp→CGA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 517,872 | 0 | G | C | 99.7% | 756.0 / NA | 319 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/0); new base C (169/148); total (171/148) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 517,873 | 0 | C | G | 99.7% | 755.0 / NA | 319 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base G (169/148); total (171/148) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.97e-01 | |||||||||||
* | CP042583 | 517,874 | 0 | T | A | 99.7% | 756.9 / NA | 319 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base A (171/147); minor base G (0/1); total (171/148) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.64e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 319 total aligned reads displayed.
CACCGTCAGGCGGCGAGGGTTTAACTCACATGATGATACTGACTGTTGCTCACTCTTTGAAGTGATTTGCGTCACATTCAGGGAATTCCTCAATGCAGCGCATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAACCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAAACTGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATGC‑TGATCTGAATTT‑CAGTCAAATACGCAGGGTTACCCTGGCACGTTAGCTTAACTGCTTTCACGTTCTCTTTTCCCCAGCTTTTGGCAAAGGCGGCGTCAAAGTCACGGCGGCTCACTGTTTTACCGTAATTATCCGCAAGGAATTTTCCGGCTTCGCTCTCTTTAATTTCTTGATTCAGGCGTACCATCGTACCGAAGTATGCGTCCGGATCAAAACCAAAGCAGGCACCGTGTTTGGCATATTCGTAGCGTTCCAGGCAGGAACGTCCGCCAGCT > CP042583/517596‑518148 |||| cggcgATGGTTTAACTCACATGATGATACTGACTGTTGCTCACTCTTTTAAGTTATTTGCGTCACATTCAGGGAATTCCTCAATGCAGCGCAGTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGAGTAATAACCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATCG‑AGATCTGAATTT‑CAGTCaaa < 2:1169488/288‑1 (MQ=255) cgAGGGTTTAACTCACATGATGATACTGACTGTTGCTCACTCTTTGAAGTGATTTGCGTCACATTCAGGGAATTCCTCAATGCAGCGCATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAACCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATCG‑AGATCTGAATTT‑CAGTCAAATaa > 1:1181001/1‑287 (MQ=255) gAGGGTTTAACTCACATGATGATACTGACTGTTGCTCACTCTTTGAAGTGATTTGCGTCACATTCAGGGAATTCCTCAATGCAGCGCATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAACCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATCG‑AGATCTGAATTT‑CAGTCAAATACg < 1:1019024/288‑1 (MQ=255) gAGGGTTTAACTCACATGATGATACTGACTGTTGCTCACTCTTTGAAGTGATTTGCGTCACATTCAGGGAATTCCTCAATGCAGCGCATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAACCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATCG‑AGATCTGAATTT‑CAGTCAAATACg < 1:1806703/288‑1 (MQ=255) gAGGGTTTAACTCACATGATGATACTGACTGTTGCTCACTCTTTGAAGTGATTTGCGTCACATTCAGGGAATTCCTCAATGCAGCGCATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAACCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATCG‑AGATCTGAATTT‑CAGTCAAATACg < 2:2171463/288‑1 (MQ=255) tttAACTCACATGATGATACTGACTGTTGCTCACTCTTTGAAGTGATTTGCGTCACATTCAGGGAATTCCTCAATGCAGCGCATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAACCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATCG‑AGATCTGAATTT‑CAGTCAAATACg < 1:818508/283‑1 (MQ=255) tttAACTCACATGATGATACTGACTGTTGCTCACTCTTTGAAGTGATTTGCGTCACATTCAGGGAATTCCTCAATGCAGCGCATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAACCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATCG‑AGATCTGAATTT‑CAGTCAAATACGCAggg < 2:2094770/288‑1 (MQ=255) tttAACTCACATGATGATACTGACTGTTGCTCACTCTTTGAAGTGATTTGCGTCACATTCAGGGAATTCCTCAATGCAGCGCATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAACCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATCG‑AGATCTGAATTT‑CAGTCAAATACGCAGGGt > 1:1691263/1‑289 (MQ=255) acaTGATGATACTGACTGTTGCTCACTCTTTGAAGTGATTTGCGTCACATTCAGGGAATTCCTCAATGCAGCGCATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAACCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATCG‑AGATCTGAATTT‑CAGTCAAATACGCAGGGTTACCCTg > 1:1744988/1‑288 (MQ=255) gactgTTGCTCACTCTTTGAAGTGGTTTGCGTCACGTTCAGGGAATTCCTAGATGCAGCGCATTATGTATAGAGCTTAATCGGCGTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAACCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCTACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATCG‑AGATCTGAATTT‑CAGTCAAATACGCAGGGTTACCCTGGCACGTTAGCTTa < 1:1604436/288‑1 (MQ=255) actgTTGCTCACTCTTTGAAGTGATTTGCGTCACATTCAGGGAATTCCTCAATGCAGCGCATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAACCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATCG‑AGATCTGAATTT‑CAGTCAAATACGCAggg > 1:1375360/1‑266 (MQ=255) actgTTGCTCACTCTTTGAAGTGATTTGCGTCACATTCAGGGAATTCCTCAATGCAGCGCATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAACCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATCG‑AGATCTGAATTT‑CAGTCAAATACGCAGGGTTACCCTGGCACGTTAGCTTa > 2:1915667/1‑287 (MQ=255) actgTTGCTCACTCTTTGAAGTGATTTGCGTCACATTCAGGGAATTCCTCAATGCAGCGCATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAACCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATCG‑AGATCTGAATTT‑CAGTCAAATACGCAGGGTTACCCTGGCACGTTAGCTTAAc > 2:1421239/1‑289 (MQ=255) actgTTGCTCACTCTTTGAAGTGATTTGCGTCACATTCAGGGAATTCCTCAATGCAGAGCATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGCTTATGGAAGACGAATTATCGTGTTATGTCAATAAGATGATTAATAACCCGCTTTACCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGACTGAGTTTGCAGAAAGCGGACCGTTGCTGGCCTCCGTCTTG‑TGCGAGCACTGAATTTACGGTCAATTACCCA‑GGTTACCATCGCACGTTGACTTa > 2:1998712/1‑287 (MQ=255) ttGCTCACTCTTTGAAGTGATTTGCGTCACATTCAGGGAATTCCTCAATGCAGCGCATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAACCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCGGCTTTGATCG‑AGATCTGAATTT‑CAGTCAAATACGc < 1:221960/258‑1 (MQ=255) cACTCTTTGAAGTGATTTGCGTCACATTCAGGGAATTCCTCAATGCAGCGCATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAACCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATCG‑AGATCTGAATTT‑CAGTCAAATACGCAGGGTTACCCTGGCACGt < 1:2312636/271‑1 (MQ=255) aCTATTTGAAGTGATGTGCGTCACAGTCAGGGAATTCCTCAATGCAGCGCATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAACCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATCG‑AGATCTGAATTT‑CAGTCAAATACGCAGGGTTACCCTGGCACGTTAGCTTAACTGCTTTCACg < 2:132989/289‑1 (MQ=255) tctTTGAAGTGATTTGCGTCACATTCAGGGAATTCCTCAATGCAGCGCATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAACCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATCG‑AGATCTGAATTT‑CAGTCAAATACGCAGGGTTACCCTGGCACGTTAGCTTAACTGCTTTCACGtt > 2:398147/1‑289 (MQ=255) gATTTGCGTCACATTCAGGGAATTCCTCAATGCAGCGCATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAACCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATCG‑AGATCTGAATTT‑CAGTCAAATACg < 1:723483/239‑1 (MQ=255) gATTTGCGTCACATTCAGGGAATTCCTCAATGCAGCGCATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAACCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATCG‑AGATCTGAATTT‑CAGTCAAATACGCAGGGTTACCCTGGCACGTTAGCTTAACTGCTTTCACGTTCTCTTTTcc > 2:2352430/1‑288 (MQ=255) gATTTGCGTCACATTCAGGGAATTCCTCAATGCAGCGCATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAACCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATCG‑AGATCTGAATTT‑CAGTCAAATACGCAGGGTTACCCTGGCACGTTAGCTTAACTGCTTTCACGTTCTCTTTTcc > 2:2040249/1‑288 (MQ=255) aTTTGCGTCACATTCAGGGAATTCCTCAATGCAGCGCATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAACCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATCG‑AGATCTGAATTT‑CAGTCAAATACGCAGGGTTACCCTGGCACGTTAGCTTAACTGCTTTCACGTTCTCTTTTccc > 2:2531452/1‑288 (MQ=255) aGGGAATTGCTAGATGCAGCGAATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAGGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAAGCAGATGATTAAGAACCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATCG‑AGATCTGAATTT‑CAGTCAAATACGCAGGGTTACCCTGGCACGTTAGCTTAACTGCTTTCACGTTCTCTTTTCCCCAGCTTTTGGCAAAgg < 2:2675849/289‑1 (MQ=255) aGGGAATTCCTCAATGCAGCGCATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAACCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATCG‑AGATCTGAATTT‑CAGTCAAATACGCAGGGTTACCCTGGCACGTTAGCTTAACTGCTTTCACGTTCTCTTTTCCCCAGCTTTTGGCAAAgg > 2:1585790/1‑289 (MQ=255) tCCTCAATGCAGCGCATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAACCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATCG‑AGATCTGAATTT‑CAGTCAAATACGCAGGGTTACCCTGGCACGTTAGCTTAACTGCTTTCACGtt < 2:2577035/256‑1 (MQ=255) cTCAATGCAGCGCATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAACCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATCG‑AGATCTGAATTT‑CAGTCAAATACGCAGGGTTACCCt < 2:1897730/226‑1 (MQ=255) cTCAATGCAGCGCATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAACCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATCG‑AGATCTGAATTT‑CAGTCAAATACGCAGGGTTACCCt > 1:1897730/1‑226 (MQ=255) tGCAGCGCATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAACCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATCG‑AGATCTGAATTT‑CAGTCAAATACGCAGGGTTACCCTGGCACGTTAGCTTAACTGCTTTCACGTTCTCTTTTCCCCAGCTTTTGGCAAAGGCGGCGTCAAAGTc > 2:159730/1‑288 (MQ=255) tGCAGCGCATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAACCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATCG‑AGATCTGAATTT‑CAGTCAAATACGCAGGGTTACCCTGGCACGTTAGCTTAACTGCTTTCACGTTCTCTTTTCCCCAGCTTTTGGCAAAGGCGGCGTCAAAGTCa < 1:999271/289‑1 (MQ=255) cgcATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAACCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATCG‑AGATCTGAATTT‑CAGTCaa > 1:1248784/1‑199 (MQ=255) cgcATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAACCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATCG‑AGATCTGAATTT‑CAGTCAAATACGCAGGGTTACCCTGGCACGTTAGCTTAACTGCTTTCACGTTCTCTTTTCCCTAGCTTTTGGTAAAGGCGGCGTCAAAGTGAcggcg > 1:2023361/1‑289 (MQ=255) cgcATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAACCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATCG‑AGATCTGAATTT‑CAGTCAAATACGCAGGGTTACCCTGGCACGTTAGCTTAACTGCTTTCACGTTCTCTTTTCCCCAGCTTTTGGCAAAGGCGGCGTCAAAGTCAcggcg > 1:195088/1‑289 (MQ=255) cgcATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAACCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATCG‑AGATCTGAATTT‑CAGTCAAATACGCAGGGTTACCCTGGCACGTTAGCTTAACTGCTTTCACGTTCTCTTTTCCCCAGCTTTTGGCAAAGGCGGCGTCAAAGTCAcggcg > 2:125879/1‑289 (MQ=255) cgcATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTGCTGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAACCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTGTGATCG‑AGATCTGACTTT‑CAGTCAATTACTTAGGGTTACCCTGGCACTTTAGCTTAACTGCTTTCACGTTCTCTTTTCCTCAGCTTTTGGCAAAGGCGGCGTCAAAGtatcg > 2:1767679/1‑282 (MQ=255) aTTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAACCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATCG‑AGATCTGAATTT‑CAGTCAAATACGCAGGGTTACCCTGGCACGTTAGCTTAACTGCTTTCACGTTCTCTTTTCCCCAGCTTTTGGCAAAGGCGGCGTCAAAGTCACGGCGGCt < 2:912897/289‑1 (MQ=255) tATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAACCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATCG‑AGATCTGAATTT‑CAGTCAAATACGCAggg > 2:1036640/1‑204 (MQ=255) tATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAACCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATCG‑AGATCTGAATTT‑CAGTCAAATACGCAGGGTTACCCTGGCACGTTAGCTTAACTGCTTTCACGTTCTCTTTTCCCCAGCTTTTGGCACAGGCGGCTTCAAAGTCACCGCGGCTc > 2:2559241/1‑288 (MQ=255) tATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAACCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATCG‑AGATCTGAATTT‑CAGTCAAATACGCAGGGTTACCCTGGCACGTTAGCTTAACTGCTTTCACGTTCTCTTTTCCCCAGCTTTTGGCAAAGGCGGCGTCAAAGTCAcggcgg < 1:205807/285‑1 (MQ=255) tATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAACCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATCG‑AGATCTGAATTT‑CAGTCAAATACGCAGGGTTACCCTGGCACGTTAGCTTAACTGCTTTCACGTTCTCTTTTCCCCAGCTTTTGGCAAAGGCGGCGTCAAAGTCACGGCGGCTc > 2:1635637/1‑288 (MQ=255) tATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAACCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATCG‑AGATCTGAATTT‑CAGTCAAATACGCAGGGTTACCCTGGCACGTTAGCTTAACTGCTTTCACGTTCTCTTTTCCCCAGCTTTTGGCAAAGGCGGCGTCAAAGTCACGGCGGCTCa < 1:257711/289‑1 (MQ=255) tATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAACCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATCG‑AGATCTGAATTT‑CAGTCAAATACGCAGGGTTACCCTGGCACGTTAGCTTAACTGCTTTCACGTTCTCTTTTCCCCAGCTTTTGGCAAAGGCGGCGTCAAAGTCACGGCGGCTCa < 1:1635637/289‑1 (MQ=255) tATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAACCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATCG‑AGATCTGAATTT‑CAGTCAAATACGCAGGGTTACCCTGGCACGTTAGCTTAACTGCTTTCACGTTCTCTTTTCCCCAGCTTTTGGCAAAGGCGGCGTCAAAGTCACGGCGGCTCa < 1:917753/289‑1 (MQ=255) aaTCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAACCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATCG‑AGATCTGAATTT‑CAGTCAAATACGCAGGGTTACCCTGGCACGTTAGCTTAACTGCTTTCACGTTCTCTTTTCCCCAGCTTTTGGCAAAGGCGGCGTCAAAGTCACGGCGGCTCACTGTTTTa < 1:1585790/289‑1 (MQ=255) aaTCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAACCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGCGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTGGCAGAATGCGGTGCGTTGATGTCGTCAGCTTTGATCG‑AGATTTGATTCA‑CAGTCAAGTACGCAGGGTTACCCTGGAACGTTAGCTTAATTGTTGTCACGTCCTCTTTTCCCCAGCCTTCGCCAAAGGCGGCGTCATAGTCACGGAGGCACACCGtttt > 2:309341/1‑288 (MQ=255) aTCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAACCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATCG‑AGATCTGAATTT‑CAGTCAAATACGCAGGGTTACCCTGGCACGTTAGCTTAACTGCTTTCACGTTCTCTTTTCCCCAGCTTTTGGCAAAGGCGGCGTCAAAGTCACGGCGGCTCACTGTTTTa > 1:2495944/1‑288 (MQ=255) aaTCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAACCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATCG‑AGATCTGAATTT‑CAGTCAAATACGCAGGGTTACCCTGGCACGTTAGCTTAACTGCTTTCACGTTCTCTTTTCCCCAGCTTCTGGCAAAGGCGGCGTCAATGTCACGGCGTCTCAAGGTTCTAACGtca > 2:2602401/1‑287 (MQ=255) gCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAACCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATCG‑AGATCTGAATTT‑CAGTCAAATACGCAGGGTTACCCTGGCACGTTAGCTTAACTGCTTTCACGTTCTCTTTTCCCCAGCTTTTGGCAAAGGCGGCGTCAAAGTCACGGCGGCTCACTGTTTTACCGTAATTAt < 1:1883018/289‑1 (MQ=255) cTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAACCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATCG‑AGATCTGAATTT‑CAGTCAAATACGCAGGGTTACCCTGGCACGTTAGCTTAACTGCTTTCACGTTCTCTTTTCCCCAGCTTTTGGCAAAGGCGGCGTCAAAGTCACGGCGGCTCACTGTTTTACCGTAATTATc > 2:1523029/1‑288 (MQ=255) ttATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAACCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATCG‑AGATCTGAATTT‑CAGTCAAATACGCAGGGTTACCCTGGCACGTTAGCTTAACTGCTTTCACGTTCTCTTTTCCCCAGCTTTTGGCAAAGGCGGCGTCAAAGTCACGGCGGCTCACTGTTTTACCGTAATTATCCGCAAg < 1:398147/288‑1 (MQ=255) aGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAACCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATCG‑AGATCTGAATTT‑CAGTCAAATACGCAGGGTTACCCTGGCACGTTAGCTTAACTGCTTTCACGTTCTCTTTTCCCCAGCTTTTGGCAAAGGCGGCGTCAAAGTCACGGCGGCTCACTGTTTTACCGTAATTATCCGCAAGGAATTTTc < 1:599438/289‑1 (MQ=255) aGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAACCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATCG‑AGATCTGAATTT‑CAGTCAAATACGCAGGGTTACCCTGGCACGTTAGCTTAACTGCTTTCACGTTCTCTTTTCCCCAGCTTTTGGCAAAGGCGGCGTCAAAGTCACGGCGGCTCACTGTTTTACCGTAATTATCCGCAAGGAATTTTc < 1:830605/289‑1 (MQ=255) gACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAACCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATCG‑AGATCTGAATTT‑CAGTCAAATACGCAGGGTTACCCTGGCACGTTAGCTTAACTGCTTTCACGTTCTCTTTTCCCCAGCTTTTGGCAAAGGCGGCGTCAAAGTCACGGCGGCTCACTGTTTTACCGTAATTATCCGCAAGGAATTTTcc > 2:1927465/1‑289 (MQ=255) aGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAACCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATCG‑AGATCTGAATTT‑CAGTCAAATACg > 1:2667864/1‑157 (MQ=255) gtgtTTTGTAAATCAGATGATTAATAACCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATCG‑AGATCTGAATTT‑CAGTCAAATACGCAGGGTTACCCTGGCACGTTAGCTTAACTGCTTTCACGTTCTCTTTTCCCCAGCTTTTGGCAAAGGCGGCGTCAAAGTCACGGCGGCTCACTGTTTTACCGTAATTATCCGCAAGGAATTTTCCGGCTTCGctc < 1:1906760/288‑1 (MQ=255) ttttGTAAATCAGATGATTAATAACCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATCG‑AGATCTGATTTT‑CAGTCAAATACGCAGGGTTACCCTGGCACGTTAGCTTAACTGCTTTCACGTTCTCTTTTCCCCAGCTTTTGGCAAAGGCGGCGTCAAAGTCACGGCGGCTCACTGTTTTACCGTAATTATCCGCAAGGAATTTTCCGGCTTCGCTCTCtt > 1:2277964/1‑289 (MQ=255) ttttGTAAATCAGATGATTAATAACCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATCG‑AGATCTGAATTT‑CAGTCAAATACGCAGGGTTACCCTGGCACGTTAGCTTAACTTCTTTCACGTTCTCTTTTCCCCAGCTTTTGGCAAAGGCGGCGTCAAATTCACGGCCGCTCACTGTTTTACCGTAAGTCTCCGCAAGGAATTTTCCGGCTTCGCTCTCtt > 2:2659850/1‑289 (MQ=255) ttttGTAAATCAGATGATTAATAACCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATCG‑AGATCTGAATTT‑CAGTCAAATACGCAGGGTTACCCTGGCACGTTAGCTTAACTGCTTTCACGTTCTCTTTTCCCCAGCTTTTGGCAAAGGCGGCGTCAAAGTCACGGCGGCt > 2:1151870/1‑239 (MQ=255) cAGATGATTAATAACCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATCG‑AGATCTGAATTT‑CAGTCAAATACGCAGGGTTACCCTGGCACGTTAGCTTAACTGCTTTCACGTTCTCTTTTCCCCAGCTTTTGGCAAAGGCGGCGTCAAAGTCACGGCGGCTCACTGTTTTACCGTAATTATCCGCAAGGAATTTTCCGGCTTCGCTCTCTTTAATTTCTTg > 1:2403404/1‑289 (MQ=255) atgatTAATAACCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATCG‑AGATCTGAATTT‑CAGTCAAATACGCAGGGTTACCCTGGCACGTTAGCTTAACTGCTTTCACGTTCTCTTTTCCCCAGCTTTTGGCAAAGGCGGCGTCAAAGTCACGGCGGCTCACTGTTTTACCGTAATTATCCGCAAGGAATTTTCCGGCTTCGCTCTCTTTAATTTCTTGAt > 1:240786/1‑288 (MQ=255) atgatTAATAACCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATCG‑AGATCTGAATTT‑CAGTCAAATACGCAGGGTTACCCTGGCACGTTAGCTTAACTGCTTTCACGTTCTCTTTTCCCCAGCTTTTGGCAAAGGCGGCGTCAAAGTCACGGCGGCTCACTGTTTTACCGTAATTATCCGCAAGGAATTTTCCGGCTTCGCTCTCTTTAATTTCTTGAt > 2:1863174/1‑288 (MQ=255) ttAATAACCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATCG‑AGATCTGAATTT‑CAGTCAAATACGCAGGGTTACCCTGGCACGTTAGCTTAACTGCTTTCACGTTCTCTTTTCCCCAGCTTTTGGCAAAGGCGGCGTCAAAGTCACGGCGGCTCACTGTTTTACCGTAATTATCCGCAAGGAATTTTCCGGCTTCGCTCTCTTTAATTTCTTGATTCAgg < 2:2294344/289‑1 (MQ=255) cccGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATCG‑AGATCTGAATTT‑CAGTCAAATACGCAGGGTTACCCTGGCACGTTAGCTTAACTGCTTTCACGTTCTCTTTTCCCCAGCTTTTGGCAAAGGCGGCGTCAAAGTCACGGCGGCTCACTGTTTTACCGTAATTATCCGCAAGGAATTTTCCGGCTTCGCTCTCTTTAATTTCTTGATTCAGGCGTACCa < 1:1140532/289‑1 (MQ=255) cGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATCG‑AGATCTGAATTT‑CAGTCAAATACGCAGGGTTACCCTGGCACGTTAGCTTAACTGCTTTCACGTTCTCTTTTCCCCAGCTTTTGGCAAAGGCGGCGTCAAAGTCACGGCGGCTCACTGTTTTACCGTAATTATCCGCAAGGAATTTTCCGGCTTCg < 2:1289003/256‑1 (MQ=255) gCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATCG‑AGATCTGAATTT‑CAGTCAAATACGCAGGGTTACCCTGGCACGTTAGCTTAACTGCTTTCACGTTCTCTTTTCCCCAGCTTTTGGCAAAGGCGGCGTCAAAGTCACGGCGGCTCACTGtt > 2:2388232/1‑219 (MQ=255) cTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATCG‑AGATCTGAATTT‑CAGTCAAATACGCAGGGTTACCCTGGCACGTTAGCTTAACTGCTTTCACGTTCTCTTTTcccc > 2:1718134/1‑174 (MQ=255) cTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATCG‑AGATCTGAATTT‑CAGTCAAATACGCAGGGTTACCCTGGCACGTTAGCTTAACTGCTTTCACGTTCTCTTTTCCCCAGCTTTTGGCACAGGCGGCGTCAAAGTCACGGCGGCTCACTGTTTTACCGTAATTATCCGCAAGGAATTTTCCGGCTTCGCTCTCTTTACTTTCTTGATTCAGGTGTACCATCGt > 2:541495/1‑289 (MQ=255) cTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATCG‑AGATCTGAATTT‑CAGTCAAATACGCAGGGTTACCCTGGCACGTTAGCTTAACTGCTTTCACGTTCTCTTTTCCCCAGCTTTTGGCAAAGGCGGCGTCAAAGTCACGGCGGCTCACTGTTTTa > 2:760234/1‑221 (MQ=255) cTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATCG‑AGATCTGAATTT‑CAGTCAAATACGCAGGGTTACCCTGGCACGTTAGCTTAACTGCTTTCACGTTCTCTTTTCCCCAGCTTTTGGCAAAGGCGGCGTCAAAGTCACGGCGGCTCACTGTTTTa < 1:760234/221‑1 (MQ=255) cTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATCG‑AGATCTGAATTT‑CAGTCAAATACGCAGGGTTACCCTGGCACGTTAGCTTAACTGCTTTCACGTTCTCTTTTCCCCAGCTTTTGGCAAAGGCGGCGTCAAAGTCACGGCGGCTCACTGTTTTACCGTAATTATCCGCAAGGAATTTTCCGGCTTCGCTCTCTTTAATTTCTTGATTCAGGCGTACCATCGt < 2:220883/289‑1 (MQ=255) cTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATCG‑AGATCTGAATTT‑CAGTCAAATACGCAGGGTTACCCTGGCACGTTAGCTTAACTGCTTTCACGTTCTCTTTT‑CCCAGCTTTTGGCAAAGGCGGCGTCAAAGTCACGGCGGCTCACTGTTTTACCGTAATTATCCGCAAGGAATTTTCCGGCTTCGCTCTCTTTAATTTCTTGATTCAGGCGTACCATCGt > 1:868340/1‑288 (MQ=255) tttATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATCG‑AGATCTGAATTT‑CAGTCATATACGCAGGGTTACCCTGGCACGTTAGCTTAACTGCTTTCACGTTCTCTTTTCCCCAGCTTTTGGCAAAGGCGGCGTCAAAGTCACGGCGGCTCACTGTTTTACCGTAATTATCCGCAAGGAATTTTCCGGCTTCGCTCTCTTTAATTTCTTGATTCAGGCGTACCATCGt < 1:259843/288‑1 (MQ=255) ttATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATCG‑AGATCTGAATTT‑CAGTCAAATACGCAAGGTTACCCTGGCACGTTAGCTTAACTGCTTTCACGTTCTCTTTTCCCCAGCTTTTGGCAAAGGCGGCGTCAAAGTCACGGCGGCTCACTGTTTTACCGTAATTATCCGCAAGGAATTTTCCGGCTTCGCTCTCTTTAATTTCTTGATTCAGGCGTACCATCGTAc < 2:1235795/289‑1 (MQ=255) atcaatcaCAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATCG‑AGATCTGAATTT‑CAGTCAAATACGCAGGGTTACCCTGGCACGTTAGCTTAACTGCTTTCACGTTCTCTTTTCCCCAGCTTTTGGCAAAGGCGGCGTCAAAGTCACGGCGGCt < 2:2407118/207‑1 (MQ=255) aGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATCG‑AGATCTGAATTT‑CAGTCAAATACGCAGGGTTACCCTGGCACGTTAGCTTAACTGCTTTCACGTTCTCTTTTCCCCAGCTTTTGGCAAAggc < 2:833590/175‑1 (MQ=255) tttGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATCG‑AGATCTGAATTT‑CAGTCAAATACGCAGGGTTACCCTGGCACGTTAGCTTAACTGCTTTCACGTTCTCTTTTCCCCAGCTTTTGGCAAAGGCGGCGTCAAAGTCACGGCGGCTCACTGTTTTACCGTAATTATCCGCAAGGAATTTTCCGGCTTCGCTCTCTTTAATTTCTTGATTCAGGCGTACCATCGTACCGAAGTATGCGTCCGGa > 1:902597/1‑289 (MQ=255) aGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATCG‑AGATCTGAATTT‑CAGTCAAATACGCAGGGTTACCCTGGCACGTTAGCTTAACTGCTTTCACGTTCTCTTTTCCCCAGCTTTTGGCAAAGGCGGCGTCAAAGTCACGGCGGCTCa < 2:2446898/186‑1 (MQ=255) aGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATCG‑AGATCTGAATTT‑CAGTCAAATACGCAGGGTTACCCTGGCACGTTAGCTTAACTGCTTTCACGTTCTCTTTTCCCCAGCTTTTGGCAAAGGCGGCGTCAAAGTCACGGCGGCTCACTGTTTTACCGTAATTATCCGCAAGGAATTTTCCGGCTTCGCTCTCTTTAATTTCTTGATTCAGGCGTACCATCGTACCGAAGTATGCGTCCGGATCAAAAcc > 1:1492340/1‑289 (MQ=255) tGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATCG‑AGATCTGAATTT‑CAGTCAAATACGCAGGGTTACCCTGGCACGTTAGCTTAACTGCTTTCACGTTCTCTTTTCCCCAGCTTTTGGCAAAGGCGGCGTCAAAGTCACGGCGGCTCACTGTTTTACCGTAATTATCCGCAAGGAATTTTCCGGCTTCGCTCTCTTTAATTTCTTGATTCAGGCGTACCATCGTACCGAAGTATGCGTCCGGATCAAAACCAAAGCAGGCa < 1:2531452/288‑1 (MQ=255) tGAGGTTGTGGAAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATCG‑AGATCTGAATTT‑CAGTCAAATACGCAGGGTTACCCTGGCACGTTAGCTTAACTGCTTTCACGTTCTCTTTTCCCCAGCTTTTGGCAAAGGCGGCGTCAAAGTCACGGCGGCTCACTGTTTTACCGTAATTATCCGCAAGGAATTTTCCGGCTTCGCTCTCTTTAATTTCTTGATTCAGGCGTACCATCGTACCGAAGTATGCGTCCGGATCAAAACCAAAGCAGGCa < 2:195088/288‑1 (MQ=255) acgaagcggTTTGCATAAACCCGAGCGTTGATGGCGTCAGCCTTGATCG‑GGATCTGAATTT‑CAGTCAAATACGCAGGGTTACCCTGGCACGTTAGCTTAACTGCTTTAACGTTCTCTTTTCCCCCGCTTTTGGCAAATGCTGCGTCAAAGTCACGGCGGCTCACTGTTTTACCGTAATTATCCGCAAGGAATTGTCCGGCTTCGCTCTCTTTAATTTCTTGATTCAGGCCTTCCAGCGTACCGAAGTATGCGTCCGGATCAAAACCAAAGCTGGCACCGTGTTTGGCa < 2:614255/280‑1 (MQ=255) aagaatgagTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATCG‑AGATCTGAATTT‑CAGTCAAATACGCAGGGTTACCCTGGCACGTTAGCTTAACTGCTTTCACGTTCTCTTTTCCCCAGCTTTTGGCAAAGGCGGCGTCAAAGTCACGGCGGCTCACTGTGTTACCGTAATTATCCGCAAGGAATTTTCCGGCTTCGCTCTCTTTAATTTCTTGATTCAGGCGTACCATCGTACCGAAGTATGCGTCCGGATCAAAACCAAAGCAGGCACCGTGTTTGGCa < 1:2555907/280‑1 (MQ=255) gaatgagTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATCG‑AGATCTGAATTT‑CAGTCAAATACGCAGGGTTACCCTGGCACGTTAGCTTAACTGCTTTCACGTTCTCTTTTCCCCAGCTTTTGGCAAAGGCGGCGTCAAAGTCACGGCGGCTCACTGTTTTACCGTAATTATCCGCAAGGAATTTTCCGGCTTCGCTCTCTTTAATTTCTTGATTCAGGCGTACCATCGTACCGa < 1:1109507/236‑1 (MQ=255) gaatgagTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATCG‑AGATCTGAATTT‑CAGTCAAATACGCAGGGTTACCCTGGCACGTTAGCTTAACTGCTTTCACGTTCTCTTTTCCCCAGCTTTTGGCAAAGGCGGCGTCAAAGTCACGGCGGCTCACTGTTTTACCGTAATTATCCGCAAGGAATTTTCCGGCTTCGCTCTCTTTAATTTCTTGATTCAGGCGTACCATCGTACCGAAGTATGCGTCCGGATCAAAACCAAAGCAGGCACCGTGTTTgg < 1:2183638/278‑1 (MQ=255) aatgagTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATCG‑AGATCTGAATTT‑CAGTCAAATACGCAGGGTTACCCTGGCACGTTAGCTTAACTGCTTTCACGTTCTCTTTTCCCCAGCTTTTGGCAAAGGCGGCGTCAAAGTCACGGCGGCTCACTGTTTTACCGTAATTATCCGCAAGGAATTTTCCGGCTTCGCTCTCTTTAATTTCTTGATTCAGGCGTACCATCGTACCGAAGTATGCGTCCGGATCAAAACCAAAGCAGGCACCGTGTTTGGCatat > 1:1306287/6‑288 (MQ=255) gagTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATCG‑AGATCTGAATTT‑CAGTCAAATACGCAGGGTTACCCTGGCACGTTAGCTTAACTGCTTTCACGTTCTCTTTTCCCCAGCTTTTGGCAAAGGCGGCGTCAAAGTCACGGCGGCTCACTGTTTTACCGTAATTATCCGCAAGGAATTTTCCGGCTTCGCTCTCTTTAATTTCTTGATTCAGGCGTACCATCGTACCGAAGTATGCGTCCGGATCAAAACCAAAGCAGGCACCGTGTTTGGCATATTCGt > 1:54212/3‑289 (MQ=255) gTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATCG‑AGATCTGAATTT‑CAGTCAAATACGCAGGGTTACCCTGGCACGTTAGCTTAACTGCTTTCACGTTCTCTTTTCCCCAGCTTTTGGCAAAGGCGGCGTCAAAGTCACGGCGGCTCACTGTTTTACCGTAATTATCCGCAAGGAATTTTCCGGCTTCGCTCTCTTTAATTTCTTGATTCAGGCGTACCATCGTACCGAAGTATGCGTCCGGATCAAAACCAAAGCAGGCACCGTGTTTGGCATATTCGTa < 1:1272399/288‑1 (MQ=255) gTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATCG‑AGATCTGAATTT‑CAGTCAAATACGCAGGGTTACCCTGGCACGTTAGCTTAACTGCTTTCACGTTCTCTTTTCCCCAGCTTTTGGCAAAGGCGGCGTCAAAGTCACGGCGGCTCACTGTTTTACCGTAATTATCCGCAAGGAATTTTCCGGCTTCGCTCTCTTTAATTTCTTGATTCAGGCGTACCATCGTACCGAAGTATGCGTCCGGATCAAAACCAAAGCAGGCACCGTGTTTGGCATATTCGTa < 1:1040792/288‑1 (MQ=255) ttGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATCG‑AGATCTGAATTT‑CAGTCAAATACGCAGGGTTACCCTGGCACGTTAGCTTAACTGCTTTCACGTTCTCTTTTCCCCAGCTTTTGGCAAAGGCGGCGTCAAAGTCACGGCGGCTCACTGTTTTACCGTAATTATCCGCAAGGAATTTTCCGGCTTCGCTCTCTTTAATTTCTTGATTCAGGCGTACCATCGTACCGAAGTATGCGTCCGGATCAAAACCAAAGCAGGCACCGTGTTTGGCATATTCGTAg < 2:1079564/287‑1 (MQ=255) cAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATCG‑AGATCTGAATTT‑CAGTCAAATACGCAGGGTTACCCTGGCACGTTAGCTTAACTGCTTTCACGTTCTCTTTTCCCCAGCTTTTGGCAAAGGCGGCGTCAAAGTCACGGCGGCTCACTGTTTTACCGTAATTATCCGCAAGGAATTTTCCGGCTTCGCTCTCTTTAATTTCTTGATTCAGGCGTACCATCGTACCGAAGTATGCGTCCGGATCAAAACCAAAGCAGGCACCGTGTTTGGCATATTCGTAGCGtt > 1:696097/1‑288 (MQ=255) aaGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATCG‑AGATCTGAATTT‑CAGTCAAATACGCAGGGTTACCCTGGCACGTTAGCTTAACTGCTTTCACGTTCTCTTTTCCCCAGCTTTTGGCAAAGGCGGCGTCAAAGTCACGGCGGCTCACTGTTTTACCGTAATTATCCGCAAGGAATTTTCCGGCTTCGCTCTCTTTAATTTCTTGATTCAGGCGTACCATCGTACCGAAGTATGCGTCCGGATCAAAACCAAAGCAGGCACCGTGTTTGGCATATTCGTAGCGTTCcagg < 1:1923292/289‑1 (MQ=255) aGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATCG‑AGATCTGAATTT‑CAGTCAAATACGCAGGGTTACCCTGGCACGTTAGCTTAACTGCTTTCACGTTCTCTTTTCCCCAGCTTTTGGCAAAGGCGGCGTCAAAGTCACGGCGGCTCACTGTTTTACCGTAATTATCCGCAAGGAATTTTCCGGCTTCGCTCTCTTTAATTTCTTGATTCAGGCGTACCATCGTACCGAAGTATGCGTc > 2:809434/1‑236 (MQ=255) gCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATCG‑AGATCTGAATTT‑CAGTCAAATACGCAGGGTTACACTGGCACGTTAGCTTAACTGCTTTCACGTTCTCTTTTCCCCAGCTTTTGGCAAAGGCGGCGTCAAAGTCACGGCGGCTCACTGTTTTACCGTAATTATCCGCAAGGAATTTTCCGGTTTCGCTCTCTTTAATTTCTTGATTCAGGCGTACCATCGTACCGAAGTATGCGTCCGGATCAAAACCAAAGCAGGCAACGGGTTTGGCATATTCGTAGCGTTCCAGGCAGGaaa > 2:1102253/1‑288 (MQ=255) tGATGGCGTCAGCTTTGATCG‑AGATCTGAATTT‑CAGTCAAATACGCAGGGTTACCCTGGCACGTTAGCTTAACTGCTTTCACGTTCTCTTTTCCCCAGCTTTTGGCAAAGGCGGCGTCAAAGTCACGGCGGCTCACTGTTTTACCGTAATTATCCGCAAGGAATTTTc < 2:428057/168‑1 (MQ=255) tGATGGCGTCAGCTTTGATCG‑AGATCTGAATTT‑CAGTCAAATACGCAGGGTTACCCTGGCACGTTAGCTTAACTGCTTTCACGTTCTCTTTTCCCCAGCTTTTGGCAAAGGCGGCGTCAAAGTCACGGCGGCTCACTGTTTTACCGTAATTATCCGCAAGGAATTTTc > 1:428057/1‑168 (MQ=255) tGATGGCGTCAGCTTTGATCG‑AGATCTGAATTT‑CAGTCAAATACGCAGGGTTACCCTGGCACGTTAGCTTAACTGCTTTCACGTTCTCTTTTCCCCAGCTTTTGGCAAAGGCGGCGTCAAAGTCACGGCGGCTCACTGTTTTACCGTAATTATCCGCAAGGAATTTTCCGGCTTCGCTCTCTTTAATTTCTTGATTCAGGCGTACCATCGTACCGAAGTATGCGTCCGGATCAAAACCAAAGCAGGCACCGTGTTTGGCa > 1:985822/1‑260 (MQ=255) tGATGGCGTCAGCTTTGATCG‑AGATCTGAATTT‑CAGTCAAATACGCAGGGTTACCCTGGCACGTTAGCTTAACTGCTTTCACGTTCTCTTTTCCCCAGCTTTTGGCAAAGGCGGCGTCAAAGTCACGGCGGCTCACTGTTTTACCGTAATTATCCGCAAGGAATTTTCCGGCTTCGCTCTCTTTAATTTCTTGATTCAGGCGTACCATCGTACCGAAGTATGCGTCCGGATCAAAACCAAAGCAGGCACCGTGTTTGGCATATTCGTAGCGTTCCAGGCAGGAACGTcc > 1:2367604/1‑289 (MQ=255) ggCGTCAGCTTTGATCG‑AGATCTGAATTT‑CAGTCAAATACGCAGGGTTACCCTGGCACGTTAGCTTAACTGCTTTCACGTTCTCTTTTCCCCAGCTTTTGGCAAAGGCGGCGTCAAAGTCACGGCGGCTCACTGTTTTACCGTAATTATCCGCAAGGAATTTTCCGGCTTCGCTCTCTTTa > 1:307522/1‑181 (MQ=255) ggCGTCAGCTTTGATCG‑AGATCTGAATTT‑CAGTCAAATACGCAGGGTTACCCTGGCACGTTAGCTTAACTGCTTTCACGTTCTCTTTTCCCCAGCTTTTGGCAAAGGCGGCGTCAAAGTCACGGCGGCTCACTGTTTTACCGTAATTATCCGCAAGGAATTTTCCGGCTTCGCTCTCTTTAATTTCTTGATTCAGGCGTACCATCGTACCGAAGTATGCGTCCGGATCAAAACCAAAGCAGGCACCGTGTTTGGCATATTCGTAGCGTTCCAGGCAGGAACGTCCGcc < 2:721970/288‑1 (MQ=255) gCGTCAGCTTTGATCG‑AGATCTGAATTT‑CAGTCAAATACGCAGGGTTACCCTGGCACGTTAGCTTAACTGCTTTCACGTTCTCTTTTCCCCAGCTTTTGGCAAAGGCGGCGTCAAAGTCACGGCGGCTCACTGTTTTACCGTAATTATCCGCAAGGAATTTTCCGGCTTCGCTCTCTTTAATTTCTTGATTCAGGCGTACCATCGTACCGAAGTATGCGTCCGGATCAAAACCAAAGCAGGCACCGTGTTTGGCATATTCGTAGCGTTCCAGGCAGGAACGTCCGCCa > 1:21481/1‑288 (MQ=255) aGCTTTGATCG‑AGATCTGAATTT‑CAGTCAAATACGCAGGGTTACCCTGGCACGTTAGCTTAACTGCTTTCACGTTCTCTTTTCCCCAGCTTTTGGCAAAGGCGGCGTCAAAGTCACGGCGGCTCACTGTTTTACCGTAATTATCCGCAAGGAATTTTCCGGCTTCGCTCTCTTTAATTTCTTGATTCAGGCGTACCATCGTACCGAAGTATGCGTCCGGATCAAAACCAAAGCAGGCACCGTGTTTGGCATATTCGTAGCGTTCCAGGCAGGAACGTCCGCCAGCt > 1:1003655/1‑286 (MQ=255) |||| CACCGTCAGGCGGCGAGGGTTTAACTCACATGATGATACTGACTGTTGCTCACTCTTTGAAGTGATTTGCGTCACATTCAGGGAATTCCTCAATGCAGCGCATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAACCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAAACTGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATGC‑TGATCTGAATTT‑CAGTCAAATACGCAGGGTTACCCTGGCACGTTAGCTTAACTGCTTTCACGTTCTCTTTTCCCCAGCTTTTGGCAAAGGCGGCGTCAAAGTCACGGCGGCTCACTGTTTTACCGTAATTATCCGCAAGGAATTTTCCGGCTTCGCTCTCTTTAATTTCTTGATTCAGGCGTACCATCGTACCGAAGTATGCGTCCGGATCAAAACCAAAGCAGGCACCGTGTTTGGCATATTCGTAGCGTTCCAGGCAGGAACGTCCGCCAGCT > CP042583/517596‑518148 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |