Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
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RA | CP042583 | 1,766,616 | 3 bp→TGA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | CP042583 | 1,766,616 | 0 | A | T | 99.7% | 706.9 / NA | 295 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
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Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,766,617 | 0 | C | G | 99.7% | 703.3 / NA | 295 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base G (135/159); minor base A (1/0); total (136/159) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.61e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,766,618 | 0 | T | A | 100.0% | 711.0 / NA | 295 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base A (136/159); total (136/159) |
Only 100 of 295 total aligned reads displayed.
AGAACGGTTTCCCTGGTTCATCAACTGCACCATCACTTCTTTATTTTCTGCCGGGTAAATAATGCGCGTCCCGTAGATAACAATTCCGGCATGTGCAGGAAGGACCATAGAAAAAATGAGTAAAGATAATAATCCTTTCATTTTAATGCCTCTTAAATTAAAAGGCCGCCATGGGATAGCGGCCATGTTTATTACCTGGAGAAACTTACAATTTTATTTATTAATCCTGCGCCACACGCATAACCAGAGAAGATAACACATCACCACTTTGCACA‑CTGTTATCTGTCAGTTTCAGGTATTTTGCTTTAAACGGAATAGCATATTGACCTTCCGCTGTTTTATAACTCTCAATGTTAAAAGGTGCAGAAACATCCAGGACATCGCTGTTATCACCTAAATAGAGATAGTAACCCACGGTATCGTTGCTACTGGCTATCGCCTTATCGTTACCGGTTATTTTATCGTTGGTAATCAAGCTGAGTTTTACACCAGCAACTTCTTTCGGGCAGCTAATTTTTAACATGCTGCTGGTTACACCGACTGCA > CP042583/1766342‑1766886 |||| aGAACCGTTTACCAGGTTCATCAACTGCACCATCACGTCTTTATTTTCTGCCGGGTAAATAATGCGCGTCACGTAGATAACAATTCCGGCATGTGCAGGAAGTACCATAGAAAAAATGAGTAAAGATAATACTCCTTTCATTTTAATGCCTCTTCAATTAAAAGGCCGCCATGGGATAGCGGCCATGTTTATTACCTGGAGAAACTTACAATTTTATTTATTAATCCTGCGCCACACGCATAACCAGAGAAGATAACACATCACCTGATTGCACT‑GAGTTATCTGTCa < 2:1259997/288‑1 (MQ=255) 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