Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 1,825,494 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 1,825,494 | 0 | A | T | 99.4% | 822.6 / NA | 350 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (169/179); minor base C (1/1); total (170/180) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,825,495 | 0 | G | C | 99.7% | 833.0 / NA | 350 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base C (169/180); minor base A (1/0); total (170/180) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.86e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,825,496 | 0 | C | G | 99.7% | 827.6 / NA | 350 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base G (168/180); total (170/180) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.84e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 350 total aligned reads displayed.
CCGCTGATGTCTCAATGGTTTAGTCCGGAAACTTTCGGTATCTACATTGGTTCTACTGTGCACGAAGTGGCGCAGGTGGTGGCGGCAGGTCATGCCATCAGCCCGGATGCGGAAAACGCAGCAGTTATTTCCAAAATGCTGCGCGTG‑ATGATGCTGGCTCCGTTCCTCATCCTGCTGGCGGCGCGTGTTAAACAGCTGTCTGGGGCGAACAGCGGCGAGAAAAGCAAAATCACTATTCCGTGGTTTGCCATCTTGTTCATCGTAGTTGCCATCTTTAACAGCTTCCACCTGTTACCGCAGAGCGTGGTGAACATGCTGGTAACGCTGGATACCTTCCTGCTGGCAATGGCGATGGCGGCGCTGGGTCTGACCACTCACGTCAGCGCGCTGAAAAAAGCTGGGGCGAAACCTCTGCTGATGGCACTGGTACTGTTTGCCTGGCTGATTGTTGGTGGTGGTGCGATTAACTATGTGATTCAAAGCGTCATCGCATAAACCACTACATCTTGCTCCTGTTAACCCGCTATCATTACCGTTTTCCTCCAGCGGGTTTAACAGG > CP042583/1825215‑1825773 ||| ccGCTGATGTCTCAATGGTTTAGTCCGGAAACTTTCGGTATCTACATTGGTTCTACTGTGCACGAAGTGGCGCAGGTGGTGGCGGCAGGTCATGCCATCAGCCCGGATGCGGAAAACGCAGCAGTTATTTCCAAAATGCTGCGCGTG‑ATGATGCTGGCTCCGTTCCTCATCCTGCTGGCGGCGCGTGTTAAACAGCTGTCTGGGGCGAACAGCGGCGAGAAAAGCAAAATCACTATTCCGTGGTTTGCCATCTTGTTCATCGTAGTTGCCATCTTTAACTCGTTCCAcc < 1:535071/289‑1 (MQ=255) ccGCTGATGTCTCAATGGTTTAGTCCGGAAACTTTCGGTATCTACATTGGTTCTACTGTGCACGAAGTGGCGCAGGTGGTGGCGGCAGGTCATGCCATCAGCCCGGATGCGGAAAACGCAGCAGTTATTTCCAAAATGCTGCGCGTG‑ATGATGCTGGCTCCGTTCCTCATCCTGCTGGCGGCGCGTGTTAAACAGCTGTCTGGGGCGAACAGCGGCGAGAAAAGCAAAATCACTATTCCGTGGTTTGCCATCTTGTTCATCGTAGTTGCCATCTTTAACTCGTTCCAcc < 2:2179601/289‑1 (MQ=255) tGTCTCAATGGTTTAGTCCGGAAACTTTCGGTATCTACATTGGTTCTACTGTGCACGAAGTGGCGCAGGTGGTGGCGGCAGGTCATGCCATCAGCCCGGATGCGGAAAACGCAGCAGTTATTTCCAAAATGCTGCGCGTG‑ATGATGCTGGCTCCGTTCCTCATCCTGCTGGCGGCGCGTGTTAAACAGCTGTCTGGGGCGAACAGCGGCGAGAAAAGCAAAATCACTATTCCGTGGTTTGCCATCTTGTTCATCGTAGTTGCCATCTTTAACTCGTTCCACCTGTTAcc < 2:2497567/289‑1 (MQ=255) cAATGGTTTAGTCCGGAAACTTTCGGTATCTACATTGGTTCTACTGTGCACGAAGTGGCGCAGGTGGTGGCGGCAGGTCATGCCATCAGCCCGGATGCGGAAAACGCAGCAGTTATTTCCAAAATGCTGCGCGTG‑ATGATGCTGGCTCCGTTCCTCATCCTGCTGGCGGCGCGTGTTAAACAGCTGTCTGGGGCGAACAGCGGCGAGAAAAGCAAAATCACTATTCCGTGGTTTGCCATCTTGTTCATCGTAGTTGCCATCTTTAACTCGTTCCACCTGTTACCGCaga < 1:564626/289‑1 (MQ=255) ttAGTCCGGAAACTTTCGGTATCTACATTGGTTCTACTGTGCACGAAGTGGCGCAGGTGGTGGCGGCAGGTCATGCCATCAGCCCGGATGCGGAAAACGCAGCAGTTATTTCCAAAATGCTGCGCGTG‑ATGATGCTGGCTCCGTTCCTCATCCTGCTGGCGGCGCGTGTTCAACAGCTGTCTGGGGCGAACAGCGGCGAGAAAAGCAAAATCACTATTCCGTGGTTTGCCATCTTGTTCATCGTAGTTGCCATCTTTAACTCGTTCCACTTGTTACCGCaagcgctggt > 2:1052335/1‑280 (MQ=255) tAGTCCGGAAACTTTCGGTATCTACATTGGTTCTACTGTGCACGAAGTGGCGCAGGTGGTGGCGGCAGGTCATGCCATCAGCCCGGATGCGGAAAACGCAGCAGTTATTTCCAAAATGCTGCGCGTG‑ATGATGCTGGCTCCGTTCCTCATCCTGCTGGCGGCGCGTGTTAAACAGCTGTCTGGGGCGAACAGCGGCGAGAAAAGCAAAATCACTATTCCGTGGTTTGCCATCTTGTTCATCGTAGTTGCCATCTTTAACTCGTTCCACCTGTTACCGCAGAGCgtggtg < 1:2618558/289‑1 (MQ=255) cGGAAACTTTCGGTATCTACATTGGTTCTACTGTGCACGAAGTGGCGCAGGTGGTGGCGGCAGGTCATGCCATCAGCCCGGATGCGGAAAACGCAGCAGTTATTTCCAAAATGCTGCGCGTG‑ATGATGCTGGCTCCGTTCCTCATCCTGCTGGCGGCGCGTGTTAAACAGCTGTCTGGGGCGAACAGCGGCGAGAAAAGCAAAATCACTATTCCGTGGTTTGCCATCTTGTTCATCGTAGTTGCCATCTTTAACTCGTTCCACCTGTTACCGCAGAGCGTGGTGAACAt < 1:64068/289‑1 (MQ=255) gAAACTTTCGGTATCTACATTGGTTCTACTGTGCACGAAGTGGCGCAGGTGGTGGCGGCAGGTCATGCCATCAGCCCGGATGCGGAAAACGCAGCAGTTATTTCCAAAATGCTGCGCGTG‑ATGATGCTGGCTCCGTTCCTCATCCTGCTGGCGGCGCGTGTTAAACAGCTGTCTGGGGCGAACAGCGGCGAGAAAAGCAAAATCACTATTCCGTGGTTTGCCATCTTGTTCATCGTAGTTGCCATCTTTAACTCGTTCCACCTGTTACCGCAGAGCGTGGTGAACAt > 2:191876/1‑287 (MQ=255) cgttCGGTATCTACATTGGTTGTCGTGTGCACGAAGTGGGGCAGGTGGTGGCGGCAGGTCATGCCATCAGCCCGGATGCGGAAAACGCAGCAGTTATTTCCAAACTGCTGCGCGTG‑AAGATGCTGGCTCCGTTCCTCATCCTGCTGGCGGCGCGTGTTAAACAGCTGTCTGGGGCGAACAGCGGCGAGAAAAGCAAAATCACTATTCCGTGGTTTGCCATCTTGTTCATCGTAGTTGCCATCTTTAACTCGTTCCACCTGTTACCGCAGAGCGTGGTGAACATGCTGGt < 2:297638/287‑1 (MQ=255) tttCGGTATCTACATTGGTTCTACTGTGCACGAAGTGGCGCAGGTGGTGGCGGCAGGTCATGCCATCAGCCCGGATGCGGAAAACGCAGCAGTTATTTCCAAAATGCTGCGCGTG‑ATGATGCTGGCTCCGTTCCTCATCCTGCTGGCGGCGCGTGTTAAACAGCTGTCTGGGGCGAACAGCGGCGAGAAAAGCAAAATCACTATTCCGTGGTTTGCCATCTTGTTCATCGTAGTTGCCATCTTTAACTCGTTCCACCTGTTACCGCAGAGCGTGGTGAACATGCTGGTa < 1:191876/289‑1 (MQ=255) ggTTCTACTGTGCACGAAGTGGCGCAGGTGGTGGCGGCAGGTCATGCCATCAGCCCGGATGCGGAAAACGCAGCAGTTATTTCCAAAATGCTGCGCGTG‑ATGATGCTGGCTCCGTTCCTCATCCTGCTGGCGGCGCGTGTTAAACAGCTGTCTGGGGCGAACAGCGGCGAGAAAAGCAAAATCACTATTCCGTGGTTTGCCATCTTGTTCATCGTAGTTGCCATCTTTAACTCGTTCCACCTGTTACCGCAGAGCGTGGTGAACATGCTGGTAACGCTGGATACCtt > 1:1434504/1‑287 (MQ=255) ttCTACTGTGCACGAAGTGGCGCAGGTGGTGGCGGCAGGTCATGCCATCAGCCCGGATGCGGAAAACGCAGCAGTTATTTCCAAAATGCTGCGCGTG‑ATGATGCTGGCTCCGTTCCTCATCCTGCTGGCGGCGCGTGTTAAACAGCTGTCTGGGGCGAACAGCGGCGAGAAAAGCAAAATCACTATTCCGTGGTTTGCCATCTTGTTCATCGTAGTTGCCATCTTTAACTCGTTCCACCTGTTACCGCagag < 2:1180564/252‑1 (MQ=255) cTACTGTGCACGAAGTGGCGCAGGTGGTGGCGGCAGGTCATGCCATCAGCCCGGATGCGGAAAACGCAGCAGTTATTTCCAAAATGCTGCGCGTG‑ATGATGCTGGCTCCGTTCCTCATCCTGCTGGCGGCGCGTGTTAAACAGCTGTCTGGGGCGAACAGCGGCGAGAAAAGCAAAATCACTATTCCGTGGTTTGCCATCTTGTTCATCGTAGTTGCCATCTTTAACTCGTTCCAcc < 2:1972699/237‑1 (MQ=255) cTACTGTGCACGAAGTGGCGCAGGTGGTGGCGGCAGGTCATGCCATCAGCCCGGATGCGGAAAACGCAGCAGTTATTTCCAAAATGCTGCGCGTG‑ATGATGCTGGCTCCGTTCCTCATCCTGCTGGCGGCGCGTGTTAAACAGCTGTCTGGGGCGAACAGCGGCGAGAAAAGCAAAATCACTATTCCGTGGTTTGCCATCTTGTTCATCGTAGTTGCCATCTTTAACTCGTTCCACCTGTTACCGCAGAGCGTGGTGAACATGCTGGTAACGCTGGATACCTTCct > 2:633046/1‑286 (MQ=255) aCTGTGCACGAAGTGGCGCAGGTGGTGGCGGCAGGTCATGCCATCAGCCCGGATGCGGAAAACGCAGCAGTTATTTCCAAAATGCTGCGCGTG‑ATGATGCTGGCTCCGTTCCTCATCCTGCTGGCGGCGCGTGTTAAACAGCTGTCTGGGTCGAACAGCGGCGAGAAAAGCAAAATCACTATTCCGTGGTTTGCCATCTTGTTCATCGTAGTTGCCATCTTTAACTCGTTCCACCTGTTACCGCAGAGCGTGGTGAACATGCTGGTAACGCTGGATACCTTCctgctg > 1:2272464/1‑288 (MQ=255) tgCACGAAGTGGCGCAGGTGGTGGCGGCAGGTCATGCCATCAGCCCGGATGCGGAAAACGCAGCAGTTATTTCCAAAATGCTGCGCGTG‑ATGATGCTGGCTCCGTTCCTCATCCTGCTGGCGGCGCGTGTTAAACAGCTGTCTGGGGCGAACAGCGGCGAGAAAAGCAAAATCACTATTCCGTGGTTTGCCATCTTGTTCATCGTAGTTGCCATCTTTAACTCGTTCCACCTGTTACCGCAGAGCGTGGTGAACATGCTGGTAACGCTGGATACCTTCCTGCTGGCAat > 2:2162708/1‑289 (MQ=255) gCACGAAGTGGCGCAGGTGGTGGCGGCTGGTCATGCTATCAGCCCGGAGGCGGAAAACGCCGCAGTTATTTCCAAAATGCTGCGCGTG‑ATGATGCTGGCTCCGTTCCTCATCCTGCCGGCGGCGCGTGGTAAACAGCTGTCTGGGGCGAACAGCGGCGAGAAAAGCAAAATCACTATTCCCTGGTTTGCCATTTTGTTCATCGTAGTTGCCATCTTTAATTCGTTCAATCTGTTACCGCAGAGCGTGGTGAACATGCCGGTAACGCTGGACACCTTCCTGCTGGCTatg > 2:1775080/1‑289 (MQ=255) gCACGAAGTGGCGCAGGTGGTGGCGGCAGGTCATGCCATCAGCCCGGATGCGGAAAACGCAGCAGTTATTTCCAAAATGCTGCGCGTG‑ATGATGCTGGCTCCGTTCCTCATCCTGCTGGCGGCGCGTGTTAAACAGCTGTCTGGGGCGAACAGCGGCGAGAAAAGCAAAATCACTATTCCGTGGTTTGCCATCTTGTTCATCGTAGTTGCCATCTTTAACTCGTTCCAcc < 1:1679671/230‑1 (MQ=255) gCACGAAGTGGCGCAGGTGGTGGCGGCAGGTCATGCCATCAGCCCGGATGCGGAAAACGCAGCAGTTATTTCCAAAATGCTGCGCGTG‑ATGATGCTGGCTCCGTTCCTCATCCTGCTGGCGGCGCGTGTTAAACAGCTGTCTGGGGCGAACAGCGGCGAGAAAAGCAAAATCACTATTCCGTGGTTTGCCATCTTGTTCATCGTAGTTGCCATCTTTAACTCGTTCCACCTGTTACCGCAGAGCGTGGTGAACATGCTGGTAACGCTGGATACCTTCCTGCTGGCAatg > 2:1159400/1‑289 (MQ=255) cACGAAGTGGCGCAGGTGGTGGCGGCAGGTCATGCCATCAGCCCGGATGCGGAAAACGCAGCAGTTATTTCCAAAATGCTGCGCGTG‑ATGATGCTGGCTCCGTTCCTCATCCTGCTGGCGGCGCGTGTTACACAGCTGTCTGGGGCGAACAGCGGCGAGAAAAGCAAAATCACTATTCCGTGGTTTGCCATCTTGTTCATCGTAGTTGCCATCTTTAACTCGTTCCACCTGTTACCGCAGAGCGGGGTGAACATGCTGGTAACGCTGCATACCTTCCTGCTGGCAaggg > 2:1433576/1‑289 (MQ=255) cACGAAGTGGCGCAGGTGGTGGCGGCAGGTCATGCCATCAGCCCGGATGCGGAAAACGCAGCAGTTATTTCCAAAATGCTGCGCGTG‑ATGATGCTGGCTCCGTTCCTCATCCTGCTGGCGGCGCGTGTTAAACAGCTGTCTGGGGCGAACAGCGGCGAGAAAAGCAAAATCACTATTCCGTGGTTTGCCATCTTGTTCATCGTAGTTGCCATCTTTAACTCGTTCCAcc > 1:2318706/1‑229 (MQ=255) cACGAAGTGGCGCAGGTGGTGGCGGCAGGTCATGCCATCAGCCCGGATGCGGAAAACGCAGCAGTTATTTCCAAAATGCTGCGCGTG‑ATGATGCTGGCTCCGTTCCTCATCCTGCTGGCGGCGCGTGTTAAACAGCTGTCTGGGGCGAACAGCGCCGAGAAAAGCAAAATCACTATTCCGTGGTTTGCCATCTTGTTCATCGTAGTTGCAATCTTTAACTCGTTCCACCATTTACCGCAGAGCGTTGTAAACATGCGGGTAACGCTGGACACCTTTCTGCTGGCCatc > 2:2251734/1‑287 (MQ=255) aGTGGCGCAGGTGGTGGCGGCAGGTCATGCCATCAGCCCGGATGCGGAAAACGCAGCAGTTATTTCCAAAATGCTGCGCGTG‑ATGATGCTGGCTCCGTTCCTCATCCTGCTGGCGGCGCGTGTTAAACAGCTGTCTGGGGCGAACAGCGGCGAGAAAAGCAAAATCACTATTCCGTGGTTTGCCATCTTGTTCATCGTAGTTGCCATCTTTAACTCGTTCCACCTGTTACCGCaga < 1:1178166/236‑1 (MQ=255) tGGCGCAGGTGGTGGCGGCAGGTCATGCCATCAGCCCGGATGCGGAAAACGCAGCAGTTATTTCCAAAATGCTGCGCGTG‑ATGATGCTGGCTCCGTTCCTCATCCTGCTGGCGGCGCGGGTTAAACAGCTGTCTGGGGCGAACAGCGGCGAGAAAAGCAAAATCACTATTCCGTGGTTTGCCATCTTGTTCATCGTAGTTGCCATCTTTAACTCGTTCCACCTGTTACCGCAGAGCGTGGTGAACATGCTGGTAACGCTGGATACCTTCCTGCTGGCAatggcgatgg < 2:240045/288‑1 (MQ=255) tGGCGCAGGTGGGGGCTGCAGTGCATGCCATCAACCCGTATGCGGAAAACGCAGCAGTTATTTCCAAAATGCTGCGCGTG‑ATGATGCTGGCTCCGTTCCTCATCCTGCTGGCGGCGCGTGTTAAACAGCTGTCTGGGGCGAACAGCGGCGAGAAAAGCAAAATCACTATTCCGTGGTTTGCCATCTTGTTCATCGTAGTTGCCATCTTTAACTCGTTCCACCTGTTACCGCAGAGCGTGGTGAACATGCTGGTAACGCTGGATACCTTCCTGCTGGCAatggcgatgg < 2:2673208/288‑1 (MQ=255) ggCGCAGGTGGTGGCGGCAGGTCATGCCATCAGCCCGGATGCGGAAAACGCAGCAGTTATTTCCAAAATGCTGCGCGTG‑ATGATGCTGGCTCCGTTCCTCATCCTGCTGGCGGCGCGTGTTAAACAGCTGTCTGGGGCGAACAGCGGCGAGAAAAGCAAAATCACTATTCCGTGGTTTGCCATCTTGTTCATCGTAGTTGCCATCTTTAACTCGTTCCACCTGTTACCGCAGAGCGTGGTGAACATGCTGGTAACGCTGGATACCTTCCTGCTGGCAatggcgatggcg > 2:1553892/1‑289 (MQ=255) cgcAGGTGGTGGCGGCAGGTCATGCCATCAGCCCGGATGCGGAAAACGCAGCAGTTATTTCCAAAATGCTGCGCGTG‑ATGATGCTGGCTCCGTTCCTCATCCTGCTGGCGGCGCGTGTTAAACAGCTGTCTGGGGCGAACAGCGGCGAGAAAAGCAAAATCACTATTCCGTGGTTTGCCATCTTGTTCATCGTAGTTGCCATCTTTAACTCGTTCCACCTGTTACCGCAGAGCGTGGTGAACATGCTGGTAACGCTGGATACCTTCCTGCTGGCAATGGCGATggcgg < 1:6599/288‑1 (MQ=255) gggtggtGGCGGCATGTCAGGCCATCCGCCCGGATGCGGAAAACGGAGCAGTTATTTCCAAAAGGCTGCGCGTG‑ATGATGCTGGCTCCGTTCCTCATCCTGCTGGCGGCGCGTGTTAAACAGCTGTCTGGGGCGAACAGCGGCGAGAAAAGCAAAATCACTATTCCGTGGTTTGCCATCTTGTTCATCGTAGTTGCCATCTTTAACTCGTTCCACCTGTTACCGCAGAGCGTGGTGAACATGCTGGTAACGCTGGATACCTTCCTGCTGGCAATGGCGATGGCGgcgc < 2:2738131/287‑1 (MQ=255) gtggtgGCGGCAGGTCATGCCATCAGCCCGGATGCGGAAAACGCAGCAGTTATTTCCAAAATGCTGCGCGTG‑ATGATGCTGGCTCCGTTCCTCATCCTGCTGGCGGCGCGTGTTAAACAGCTGTCTGGGGCGAACAGCGGCGAGAAAAGCAAAATCACTATTCCGTGGTTTGCCATCTTGTTCATCGTAGTTGCCATCTTTAACTCGTTCCACCTGTTACCGCAGAGCGTGGTGAACATGCTGGTAACGCTGGATACCTTCCTGCTGGCAATGGCGATGGCGGCGCTgg > 1:1393128/1‑289 (MQ=255) gtggggGGGGCAGGTGATGCAGTAGGCCCGGAGGCGGAAAACGCAGCAGTTATTTCCTAAATGCTGCGCTTG‑ATGATGCTGGCTCCGTTCCTCATCCTGCTGGCGGCGCGTGTTAAACAGCTGTCTGGGGCGAACAGCGGCGAGAAAAGCAAAATCACTATTCCGTGGTTTGCCATCTTGTTCATCGTAGTTGCCATCTTTAACTCGTTCCACCTGTTACCGCAGAGCGTGGTGAACATGCTGGTAACGCTGGATACCTTCCTGCTGGCAATGGCGATGGCGGCGCTg < 2:2334623/288‑1 (MQ=255) ggcggcAGGTCATGCCATCAGCCCGGATGCGGAAAACGCAGCAGTTATTTCCAAAATGCTGCGCGTG‑ATGAGGCTGGCTCCGTTCCTCATCCTGCTGGCGGCGCGTGTTAAACAGCTGTCTGGGGCGAACAGCGGCGAGAAAAGCAAAATCACTATTCCGTGGTTTGCCATCTTGTTCATCGTAGTTGCCATCTTTAACTCGTTCCACCTGTTACCGCAGAGCGTGGTGAACATGCTGGTAACGCTGGATACCTTCCTGCTGGCAATGGCGATGGCGGCGCTGGGTCt < 2:2638281/288‑1 (MQ=255) cAGGTCATGCCATCAGCCCGGATGCGGAAAACGCAGCAGTTATTTCCAAAATGCTGCGCGTG‑ATGATGCTGGCTCCGTTCCTCATCCTGCTGGCGGCGCGTGTTAAACAGCTGTCTGGGGCGAACAGCGGCGAGAAAAGCAAAATCACTATTCCGTGGTTTGCCATCTTGTTCATCGTAGTTGCCATCTTTAACTCGTTCCACCTGTTACCGCAGAGCGTGGTGAACATGCTGGTAACGCTGGATACCTTCCTGCTGGCAATGGCGATGGCGGCGCTGGGTCTGACCa > 2:1269288/1‑288 (MQ=255) tCATGCCACCAACCCGGATGCGGAGAACGCAGCAGGTATTTCGCAAATGCTG‑GGGTGTATGCTGCTGGCTCCGTTCCTCATCCTGCTGGCGGCGCGTGTTAAACAGCTGTCTGGGGCGAACAGCGGCGAGAAAAGCAAAATCACTATTCCGTGGTTTGCCATCTTGTTCATCGTAGTTGCCATCTTTAACTCGTTCCACCTGTTACCGCAGAGCGTGGTGAACATGCTGGTAACGCTGGATACCTTCCTGCTGGCAATGGCGATGGCGGCGCTGGGTCTGACCACt < 2:1600302/286‑1 (MQ=255) cAGCCCGGATGCGGAAAACGCAGCAGTTATTTCCAAAATGCTGCGCGTG‑ATGATGCTGGCTCCGTTCCTCATCCTGCTGGCGGCGCGTGTTAAACAGCTGTCTGGGGCGAACAGCGGCGAGAAAAGCAAAATCACTATTCCGTGGTTTGCCATCTTGTTCATCGTAGTTGCCATCTTTAACTCGTTCCACCTGTTACCGCAGAGCGTGGTGAAc > 2:1399417/1‑214 (MQ=255) 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atggtgtgccgg‑atgatGGTTGCTCCGTTCCTCTTCCTGCTGGCGGCGCGTGTTAAACAGCTGTCTGGGGCGAACAGCGGCGAGAAAAGCAAAATCACTATTCCGTGGTTTGCCATCTTGTTCATCGTAGTTGCCATCTTTAACTCGTTCCACCTGTTACCGCAGAGCGTGGTGAACATGCTGGTAACGCTGGATACCTTCCTGCTGGCAATGGCGATGGCGGCGCTGGGTCTGACCACTCACGTCAGCGCGCTGAAAAAAGCTGGGGCGAAACCTCTGCTGATGGCAc < 2:944419/278‑1 (MQ=255) cgcgTG‑ATGATGCTGGCTCCGTTCCTCATCCTGCTGGCGGCGCGTGTTAAACAGCTGTCTGGGGCGAACAGCGGCGAGAAAAGCAAAATCACTATTCCGTGGTTTGCCATCTTGTTCATCGTAGTTGCCATCTTTAACTCGTTCCACCTGTTACCGCAGAGCGTGGTGAACATGCTGGTAACGCTGGATACCTTCCTGCTGGCAatggcgatggc > 2:2297633/1‑215 (MQ=255) cgcgTG‑ATGATGCTGGCTCCGTTCCTCATCCTGCTGGCGGCGCGTGTTAAACAGCTGTCTGGGGCGAACAGCGGCGAGAAAAGCAAAATCACTATTCCGTGGTTTGCCATCTTGTTCATCGTAGTTGCCATCTTTAACTCGTTCCACCTGTTACCGCAGAGCGTGGTGAACATGCTGGTAACGCTGGATACCTTCCTGCTGGCAATGGCGATGGCGGCGCTGGGTCTGACCACTCACGTCAGCGCGCTGAAAAAAGCTGGGGCGAAACCTCTGCTGATGGCACTGGt > 1:2005913/1‑287 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |