Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 1,839,391 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 1,839,391 | 0 | A | T | 99.6% | 623.8 / NA | 262 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (142/119); minor base G (0/1); total (142/120) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.58e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,839,392 | 0 | G | C | 99.6% | 619.5 / NA | 262 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base C (141/119); total (142/120) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.60e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,839,393 | 0 | C | G | 99.2% | 621.0 / NA | 262 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base G (140/120); minor base T (2/0); total (142/120) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.02e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 262 total aligned reads displayed.
TCGCAACTACTTTGTTTTGCTATTCGTTGGCGTCTTTCTTAGCAGCTTTGGCAGCACCGCTAACCCGCAAATGTTTGCCCTTGCCCGTGAACATGCCGACAAAACCGGACGTGAGGCGGTGATGTTCAGCTCTTTTTTACGCGCTCAGGTTAGTCTGGCATGGGTCATTGGCCCACCGCTGGCTTATGCCTTAGCGATGGGTTTCAGCTTTACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGAGCATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGTG‑GGGCAGCAACAGCCTGTACATCATCAACATGCCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGCCGGTGTGATGATGGGGACCGCCGCCGGGCTGGAAATCCCGACGATGTTGATTGCCGGATATTTCGCCAAACGTCTGGGTAAGCGTTTCTTAATGCGCGTTGCTGCC > CP042583/1839111‑1839672 ||| cAACTACTTTGTTTTGCTATTCGTTGGCGTCTTTCTTAGCAGCTTTGGCTCGACCGCTAACCCGCAAATGTTTGCCCTTGCCCGTGAACATGCCGACAAAACCGGACGTGAGGCGGTGATGTTCAGCTCTTTTTTACGCGCTCAGGTTTCACTGGCATGGGTCATTGGCCCACCGCTGGCTTATGCCTTAGCGATGGGTTTCAGCTTTACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGaaaa > 1:813628/1‑289 (MQ=255) tGCTATTCGTTGGCGTCTTTCTTAGCAGCTTTGGCTCGACCGCTAACCCGCAAATGTTTGCCCTTGCCCGTGAACATGCCGACAAAACCGGACGTGAGGCGGTGATGTTCAGCTCTTTTTTACGCGCTCAGGTTTCACTGGCATGGGTCATTGGCCCACCGCTGGCTTATGCCTTAGCGATGGGTTGCAGCTTTACGGTAATGTATCTGTGCGCAGCGGTAGCGTTGTGTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTCTCGTCGATGCGaaaatgtctgccgcgggc > 2:2308286/1‑275 (MQ=255) gTCTTTCTTAGCAGCTTTGGCTCGACCGCTAACCCGCAAATGTTTGCCCTTGCCCGTGAACATGCCGACAAAACCGGACGTGAGGCGGTGATGTTCAGCTCTTTTTTACGCGCTCAGGTTTCACTGGCATGGGTCATTGGCCCACCGCTGGCTTATGCCTTAGCGATGGGTTTCAGCTTTACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCg < 1:862697/289‑1 (MQ=255) cttAGCAGCTTTGGCTCGACCGCTAACCCGCAAATGTTTGCCCTTGCCCGTGAACATGCCGACAAAACCGGACGTGGGGCGGTGATGTTCAGCTCTTTTTTACGCGCTCAGGTTTCACTGGCATGGGTCATTGGCCCACCGCTGGCTTATGCCTTAGCGATGGGTTTCAGCTTTACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAgcgc < 2:89112/289‑1 (MQ=255) ttgtcagcTTTGGCACGACCGCTAACCCGAAAATGTTTGCCCTTGCCCGTGAACATGCCGACAAAACCGGACGTGAGGCGGTGATGTTCAGCTCTTTTTTACGCGCTCAGGTTTCACTGGCATGGGTCATTGGCCCACCGCTGGCTTATGCCTTAGCGATGGGTTTCAGCTTTAGGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAgcgcc < 2:845693/285‑1 (MQ=255) cagcTTTGGCTCGACCGCTAACCCGCAAATGTTTGCCCTTGCCCGTGAACATGCCGACAAAACCGGACGTGAGGCGGTGATGTTCAGCTCTTTTTTACGCGCTCAGGTTTCACTGGCATGGGTCATTGGCCCACCGCTGGCTTATGCCTTAGCGATGGGTTTCAGCTTTACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAgcgccgcg > 1:344947/1‑288 (MQ=255) gtcgaccacgaaCCCTCAAATGTTTGCCCTTGCCCGTGAACATGCCGACAAAACCGGACGTGGGGCGTTGATGTTCAGCTCTTTTTTACGCGCTCAGGTTTCACTGGCATGGGTCATTGGCCCACCGCTGGCTTATGCCTTAGCGATGTGTTTCAGCTTTACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCg < 2:577045/278‑1 (MQ=255) gcccTTGAACAGGCCGACAAAACCGGACGTGGGGCGGTGATGTTCAGCTCTTTTTTACGCGCTCAGGTTTCACTGGCATGGGTCATTGGCCCACCGCTGGCTTATGCCTTAGCGATGGGTTTCAGCTTTACGGTAATGTAGCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTa < 1:2308286/289‑1 (MQ=255) gcccGTGACCAGTCCGAATAAGTCGGACGTGGGGCGGTGATGTTCAGTCATTGTTTACGCGCTCAGTGTTCACGGGCATGTGTCATTGGCGCACCGCTGGCTTATGCCTTAGCGATGGGTTTCAGCTTTACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTa < 2:148038/289‑1 (MQ=255) cATGCCGACAAAACCGGGCGTGAGGCGGTGATGTTCAGCTCTTTTTTACGCGCTCAGGTTTCACTGGCATGGGTCATTGGCCCACCGCTGGCTTATGCCTTAGCGATGGGTTTCAGCTTTACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGAtgt < 1:744103/289‑1 (MQ=255) cATGCCGACAAAACCGGACGTGAGGCGGTGATGTTCAGCTCTTTTTTACGCGCTCAGGTTTCACTGGCATGGGTCATTGGCCCACCGCTGGCTTATGCCTTAGCGATGGGTTTCAGCTTTACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGAtgt < 1:2015829/289‑1 (MQ=255) cATGCCGACAAAACCGGACGTGAGGCGGTGATGTTCAGCTCTTTTTTACGCGCTCAGGTTTCACTGGCATGGGTCATTGGCCCACCGCTGGCTTATGCCTTAGCGATGGGTTTCAGCTTTACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGAtgt < 1:1171249/289‑1 (MQ=255) cATCCCGACAAAACCGGACGTGAGGCGGTGATGTTCAGCTCTTTTTTACGCGCTCAGGTTTCACTGGCATGGGTCATTGGCCCACCGCTGGCTTATGCCTTAGCGATGGGTTTCAGCTTTACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGAtgt < 1:2219550/289‑1 (MQ=255) tGCCGACAAAACCGGACGTGAGGCGGTGATGTTCAGCTCTTTTTTACGCGCTCAGGTTTCACTGGCATGGGTCATTGGCCCACCGCTGGCTTATGCCTTAGCGATGGGTTTCAGCTTTACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCgg > 1:2257902/1‑219 (MQ=255) gCCGACAAAACCGGACGTGAGGCGGTGATGTTCAGCTCTTTTTTACGCGCTCAGGTTTCACTGGCATGGGTCATTGGCCCACCGCTGGCTTATGCCTTAGCGATGGGTTTCAGCTTTACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCTCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTCTACATTTATTTg‑gg > 2:2333051/1‑289 (MQ=255) gCCGACAAAACCGGACGTGAGGCGGTGATGTTCAGCTCTTTTTTACGCGCTCAGGTTTCACTGGCATGGGTCATTGGCCCACCGCTGGCTTATGCCTTAGCGATGGGTTTCAGCTTTACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACgctgct < 1:2126323/260‑1 (MQ=255) gCCGACAAAACCGGACGTGAGGCGGTGATGTTCAGCTCTTTTTTACGCGCTCAGGTTTCACTGGCATGGGTCATTGGCCCACCGCTGGCTTATGCCTTAGCGATGGGTTTCAGCTTTACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGTg‑gg > 2:183714/1‑289 (MQ=255) aaaCCGGACGTGAGGCGTGGATGTTCAGCTCTTTTTTACGCGCTCAGGTTTCACTGGCATGGGTCATTGGCCCACCGCTGGCTTATGCCTTAGCGATGGGTTTCAGCTTTACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGTG‑GGgctcgaa < 1:1186194/289‑6 (MQ=255) aaaCCGGACGTGAGGCGGTGATGTTCAGCTCTTTTTTACGCGCTCAGGTTTCACTGGCATGGGTCATTGGCCCACCGCTGGCTTATGCCTTAGCGATGGGTTTCAGCTTTACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGTG‑GGgctcgaa < 1:1464652/289‑6 (MQ=255) aaaCCGGACGTGAGGCGGTGATGTTCAGCTCTTTTTTACGCGCTCAGGTTTCACTGGCATGGGTCATTGGCCCACCGCTGGCTTATGCCTTAGCGATGGGTTTCAGCTTTACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGTG‑GGgctcgaa < 2:640817/289‑6 (MQ=255) aaCCGGGCGTGGGGCGGTGATTGTGAGCTCTTTTTTACGGGCTCAGGTTTCACTGGCATGGGTCATTGGCCCACCGCTGGCTTATGCCTTAGCGATGGGTTTCAGCTTTACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGTG‑GGgctcgaac < 2:1446735/289‑7 (MQ=255) ccGGAGGTGAGGCGTTGTTGTTCAGCTCTTTTTTACGCGTTCAGGTTTCACTGGCATGGGTCATTGGCCAACCGCTGGCTACTGCCTTAGCGATGGGTTTCAGCTTTGCGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGTG‑GGgctcgaaca < 2:1379309/288‑8 (MQ=255) cGGACGTGAGTCGGTGATGTTCAGCTCTTTTTTACGCGCTCAGGTTTCACTGGCATGGGTCATTGGCCCACCGCTGGCTTATGCCTTAGCGATGGGTTTCAGCTTTACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGTG‑GGGCTCGAACAGc < 1:2648259/289‑1 (MQ=255) ggACGTGAGGCGGTGATGTTCAGCTCTTTTTTACGCGCTCAGGTTTCACTGGCATGGGTCATTGGCCCACCGCTGGCTTATGCCTTAGCGATGGGTTTCAGCTTTACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGTG‑GGGCTCGAACAGcc < 1:619302/289‑1 (MQ=255) gACGTGAGGCGGTGATGTTCAGCTCTTTTTTACGCGCTCAGGTTTCACTGGCATGGGTCATTGGCCCACCGCTGGCTTATGCCTTAGCGATGGGTTTCAGCTTTACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGttt > 1:2695397/1‑254 (MQ=255) aCGTGAGGCGGTGATGTTCAGCTCTTTTTTACGCGCTCAGGTTTCACTGGCATGGGTCATTGGCCCACCGCTGGCTTATGCCTTAGCGATGGGTTTCAGCTTTACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACAt > 1:103166/1‑266 (MQ=255) cGTGAGGCGGTGATGTTCAGCTCTTTTTTACGCGCTCAGGTTTCACTGGCATGGGTCATTGGCCCACCGCTGGCTTATGCCTTAGCGATGGGTTTCAGCTTTACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGTG‑GGGCTCGAACAGCCTg < 1:1523626/288‑1 (MQ=255) gTGGGGTGGTGTTGTTCAGCTCTTTTTTACGCGGTCAGGTTTCACTGGCATGGGTCATTGGCCCACCGCTGGCTTATGCCTTAGCGATGGGTTTCAGCTTTACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGTG‑GGGCTCGAACAGCCTGt < 2:2128556/288‑1 (MQ=255) gTGAGGCGGTGATGTTCAGCTCTTTTTTCCGCGCTCAGGTGTCACTGGCATGGGTCATTGGCCCACCGCTGGCTTATGCCTTAGCGATGGGTTTCATCTTTACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTCGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGAGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGAGCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGTG‑GGGCTCGAACAGCCTGTa < 1:1957375/289‑1 (MQ=255) aGGCGGTGATGTTCAGCTCTTTTTTACGCGCTCAGGTTTCACTGGCATGGGTCATTGGCCCACCGCTGGCTTATGCCTTAGCGATGGGTTTCAGCTTTACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGt > 2:2423147/1‑227 (MQ=255) cAGCTCTTTTTTCCGCGCTGAGGTTTGACGGGCATGGGTCTTTGGCCGACCGCTGGCTTATGCCTTAGCGATGGGTTTCAGCTTTACGGTAATTGATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGTG‑GGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATGCCg < 2:963755/289‑1 (MQ=255) cAGCTCTTTTTTACGCGCTCAGGTTTCACTGGCATGGGTCATTGGCCCACCGCTGGCTTATGCCTTAGCGATGGGTTTCAGCTTTACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGTG‑GGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATGCCg < 1:2333051/289‑1 (MQ=255) cAGCTCTTTTTTACCCGCTCCGGTTTCACTGGCATGGGTCATTGGCCCACCGCTGGCTTATGCCTTAGCGATGGGTTTCAGCTTTACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGTG‑GGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATGCCg < 1:1814134/289‑1 (MQ=255) gCTATTTTTTACGCGGTCAGGTTTCACGGGAATGGGTCATTGTGCAACGGCTGGCTTTTGCCTTAGCGATGGGTTTCAGCTTTACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAAGCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGTG‑GGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATGCCGc < 2:1686342/288‑1 (MQ=255) cgcgCTCAGGTTTCACTGGCATGGGTCATTGGCCCACCGCTGGCTTATGCCTTAGCGATGGGTTTCAGCTTTACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGTG‑GGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATGCCGCTATTTATTATCa > 1:796310/1‑289 (MQ=255) gcTCAGGTTTCACTGGCATGGGTCATTGGCCCACCGCTGGCTTATGCCTTAGCGATGGGTTTCAGCTTTACGGTAATGAATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTa > 2:437995/1‑229 (MQ=255) tcgggTTACCCTGGTATGGGTCATTGGCCCACCGCTTGCTTATGGCTTAGCGATGGGTTTCCGCTTTACTGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTTGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGTG‑GGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATGCCGCTATTTATTATCAACGaa < 1:2100892/286‑1 (MQ=255) tCAGGTTTCACTGGCATGGGTCATTGGCCCACCGCTGGCTTATGCCTTAGCGATGGGTTTCAGCTTTACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACa > 2:719171/1‑229 (MQ=255) tCAGGTTTCACTGGCATGGGTCATTGGCCCACCGCTGGCTTATGCCTTAGCGATGGGTTTCAGCTTTACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGTG‑GGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATGCCGCTATTTATTATCAACGaa < 1:92654/289‑1 (MQ=255) cTGGCATGGGTCATTGGCCCACCGCTGGCTTATGCCTTAGCGATGGGTTTCAGCTTTACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCATGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGTG‑GGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATGCCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCtt > 1:1542848/1‑288 (MQ=255) cTGGCATGGGTCATTGGCCCACCGCTGGCTTATGCCTTAGCGATGGGTTTCAGCTTTACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGTG‑GGgctcgaa > 1:1772579/1‑231 (MQ=255) cTGGCATGGGTCATTGGCCCACCGCTGGCTTATGCCTTAGCGATGGGTTTCAGCTTTACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGTG‑GGgctcgaa < 2:1772579/236‑6 (MQ=255) cTGGCATGGGTCATTGGCCCACCGCTGGCTTATGCCTTAGCGATGGGTTTCAGCTTTACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGTG‑GGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATGCCGCTTTTTTTTATCCAACAACTTCAttct > 2:2512095/1‑285 (MQ=255) cATGGGTCATTGGCCCACCGCTGGCTTATGCCTTAGCGATGGGTTTCAGCTTTACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGACGCGCCTCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGTT‑GTGCCCGAACATCCTGTACATCATCAACATGGCGCTATTTATTATCAACGAACTGTCTCTTCCCg > 2:1787811/1‑288 (MQ=255) cATGGGTCATTGGCCCACCGCTGGCTTATGCCTTAGCGATGGGTTTCAGCTTTACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCCTTTGTACATTGATGTG‑GGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATGCCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCga > 2:1026353/1‑289 (MQ=255) aTGGGTCATTGGCCCACCGCTGGCTTATGCCTTAGCGATGGGTTTCAGCTTTACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAGGAGCTTCCGCTGGCGAACGGCCCGATCGAAGCGCCGCGCCGTAAACGTCGCGATACGCCGCTGCAGTTTGTCATTTGTGCATTGACATGTGCGCA‑TAACAGCCGTTCCATCATCATCAACACGCTAGTTTTTATCACGGAACtcagtatccccgat > 2:1184509/1‑276 (MQ=255) gTCATTGGCCCACCGCTGGCTTATGCCTTAGCGATGGGTTTCAGCTTTACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGTG‑GGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATGCCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGaaa < 1:341339/288‑1 (MQ=255) ttGGCCCACCGCTGGCTTATGCCTTAGCGATGGGTTTCAGCTTTACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGTG‑GGGCTCGAACAGCCTg > 1:1711004/1‑230 (MQ=255) ttGGCCCACCGCTGGCTTATGCCTTAGCGATGGGTTTCAGCTTTACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGTG‑GGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATGCCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGc < 2:1518781/289‑1 (MQ=255) ccACCGCTGGCTTATGCCTTAGCGATGGGTTTCAGCTTTACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGTG‑GGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATGCCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGCCGgtg < 1:183714/289‑1 (MQ=255) cACCGCTGGCTTATGCCTTAGCGATGGGTTTCAGCTTTACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATa > 1:1809832/1‑174 (MQ=255) cACCGCTGGCTTATGCCTTAGCGATGGGTTTCAGCTTTACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGTG‑GGgctcgaa < 2:1503490/217‑6 (MQ=255) cACCGCTGGCTTATGCCTTAGCGATGGGTTTCAGCTTTACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGTG‑GGgctcgaa > 1:1503490/1‑212 (MQ=255) tGCCTTAGCGATGGGTTTCAGCTTTACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGTG‑GGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATGCCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGCCGGTGtgat > 1:485194/1‑279 (MQ=255) tGCCTTAGCGATGGGTTTCAGCTTTACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGTG‑GGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATGCCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGCCGGTGTGATGATGGGGAcc > 1:1368862/1‑289 (MQ=255) tGCCTTAGCGATGGGTTTCAGCTTTACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGTG‑GGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATGCCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGCCGGTGTGATGATGGGGAcc > 1:702540/1‑289 (MQ=255) tGCCTTAGCGATGGGTTTCAGCTTTACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGTG‑GGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATGCCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGCCGGTGTGATGATGGGGAcc > 1:1898154/1‑289 (MQ=255) tGCCTTAGCGATGGGTTTCAGCTTTACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAACCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGGTGTG‑GGGCTAGAACAGCCTGTACATCCTCAAAATGCCGCTATTTATTACCAACGAACTGCATCTTCCCAAGAAACTGGCCGGTGCTCTTATGGGGAcc > 2:2088785/1‑289 (MQ=255) tAGCGATGGGTTTCAGCTTTACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCg > 2:460658/1‑148 (MQ=255) tAGCGATGGGTTTCAGCTTTACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCg < 1:460658/148‑1 (MQ=255) tAGCGATGGGTTTCAGCTTTACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGttt < 2:2624420/170‑1 (MQ=255) tAGCGATGGGTTTCAGCTTTACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGTG‑GGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATGCCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGCCGGTGTGATGATGGGGAccgccg > 1:564448/1‑288 (MQ=255) aGCGATGGGTTTCAGCTTTACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGTg‑ggg < 1:2433945/192‑1 (MQ=255) aGCGATGGGTTTCAGCTTTACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGTG‑GGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATGCCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGCCGGTGTGATGATGGGGAccgccgc > 2:2376001/1‑288 (MQ=255) gtGGGTTTCAGCGTTACGGTAATTTATCTGGGCGCAGCGGTATCGTTTATTGGTTGCGGTGTGATGGTGGGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGTG‑GGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATGCCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGCCGGTGTGATGATGGGGACCGCCGCCggg < 2:813628/287‑1 (MQ=255) aTGGGTTTCAGCTTTACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTa < 1:1578370/175‑1 (MQ=255) gggTTTCAGCTTTACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGTG‑GGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATGCCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGCCGGTGTGATGATGGGGACCGCCGCCAGGCTg > 1:2450436/1‑289 (MQ=255) ggTTTCAGCTTTACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGTG‑GGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATGCCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCt > 1:1090893/1‑242 (MQ=255) ggTTTCAGCTTTACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGTG‑GGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATGCCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCt < 2:1090893/242‑1 (MQ=255) cAGCTTTACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGTG‑GGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATGCCg > 2:414112/1‑211 (MQ=255) cAGCTTTACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGTG‑GGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATGCCg < 1:414112/211‑1 (MQ=255) ttACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGTG‑GGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATGCCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGCCg < 1:2463322/249‑1 (MQ=255) ttACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGTG‑GGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATGCCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGCCg > 2:2463322/1‑249 (MQ=255) aggcGGTAATGAATCGGAGCGCTGTGGTAGCGTTTATGGTTTGCGGGGTGATGGTGTGGCTGTTTTGCCCGTCGAGGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTTATTTGTACATTGATGTG‑GGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATGCCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGCCGGTGTGATGATGGGGACCGCCGCCGGGCTGGAAATCCcga < 2:126629/285‑1 (MQ=255) tACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGTG‑GGgctcgaa < 2:2235513/180‑6 (MQ=255) tACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGTG‑GGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATGCCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGCCGGTGTGATGATGGGGACCGCCGCCGGGCTGGAAATCCcgacg > 1:2664158/1‑289 (MQ=255) agttATCTGGGCGGAGCGGTTGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAGGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGTG‑GGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATGCCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGCCGGTGTGATGATGGGGACCGCCGCCGGGCTGGAAATCCCGACGATGTTGa < 2:528504/286‑1 (MQ=255) aTGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGTG‑GGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATGCCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGCCGGTGTGATGATGGGGACCGCCGCCGGGCTTGAAATCCCGACGATGTTGa > 1:1724183/1‑289 (MQ=255) tCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGTG‑GGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATGCCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGCCGGTGTGATGATGGGGACCGCCGCCGGGCTGGAAATCCCGACGATGTTGAttctg > 1:126629/1‑286 (MQ=255) tCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGTG‑GGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATGCCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGCCGGGGTGATGATGGGGACCGCCGCCCGGCTGGGAATCCCGACGGTGTTGATTGcc > 2:777940/1‑289 (MQ=255) tCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGTG‑GGGCCCGAACAGCCTGTACATCATCAACATGCCGCTATTTATTATCACCGAACTGCCTCTTCCCGAGAAACTGGCCGGTGTGATGATGGGGACCGCCGCCGGGCTGGAAATCCCGACGATGTTGATTGcc > 2:1544225/1‑289 (MQ=255) cTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGAtgt > 2:277949/1‑157 (MQ=255) cgcAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGTG‑GGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATGCCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGCCGGTGTGATGATGGGGAACGCCGCCGGGCTGGGAATCCCGGCGAGGTTGATTGCCGGagat > 2:494131/1‑289 (MQ=255) cAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAGGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGTG‑GGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACa > 2:1937468/1‑180 (MQ=255) cAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGTG‑GGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATGCCg > 2:685528/1‑185 (MQ=255) cAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGTG‑GGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATGCCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCg < 2:1409659/216‑1 (MQ=255) tAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGTG‑GGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATGCCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGCCGGTGTGATGATGGGGACCGCCGCCGGGCTGGAAATCCCGACGATGTTGATTGCCGGATATTTCGCCaa > 1:2421395/1‑289 (MQ=255) tgtgATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGTG‑GGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATGCCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGCCGGTGTGATGATGGGGACCGCCGCCGGGCTGGAAATCCCGACGATGTTGATTGCCGGATATTTCGCCAAAc > 2:1730076/1‑272 (MQ=255) gtgATGGTGTGGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACa > 2:2553797/1‑117 (MQ=255) tgtgGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGTG‑GGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATGCCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGCCGGTGTGATGATGGGGACCGCCGCCGGGCTGGAAATCCCGACGATGTTGATTGCCGGATATTTCGCCAAACGTCTGGGTAAGCGTTTCTTAATgc > 1:542270/1‑288 (MQ=255) gtgGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGTG‑GGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATGCCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGCCGGTGTGATGATGGGGACCGCCGCCGGGCTGGAAATCCCGACGATGTTGATTGCCGGATATTTCGCCAAACGTCTGGGTAAGCGTTTCTTAATgcg < 1:643359/288‑1 (MQ=255) tgGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGTG‑GGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATGCCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGCCGGTGTGATGATGGGGACCGCCGCCGGGCTGGAAATCCCGACGATGTTGATTGCCGGATATTTCGCCAAACGTCTGGGTAAGCGTTTCTTAATGcgcg > 1:2146390/1‑289 (MQ=255) tgGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGTG‑GGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATGCCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGCCGGTGTGATGATGGGGACCGCCGCCGGGCTGGAAATCCCGACGATGTTGATTGCCGGATATTTCGCCAAACGTCTGGGTAAGCGTTTCTTAATGcgcg > 1:1423286/1‑289 (MQ=255) tgGCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGTG‑GGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATGCCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGCCGGTGTGATGATGGGGACCGCCGCCGGGCTGGAAATCCCGACGATGTTGATTGCCGGATATTTCGCCAAACGTCTGGGTAAGCGTTTCTTAATGcgcg > 1:2611156/1‑289 (MQ=255) gCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGTG‑GGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATGCCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGCCGgtg < 2:1573893/194‑1 (MQ=255) gCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGTG‑GGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATGCCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGCCGGTGTGATGATGGGGACCGCCGCCGGGCTGGAAATCCCGACGATGTTGATTGCCGGATATTTCGCCAAACGTCTGGGTAAGCGTTTCTTAATGcgcggt > 1:2577769/1‑287 (MQ=255) gCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGTG‑GGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATGCCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGCCGGTGTGATGATGGGGACCGCCGCCGGGCTGGAAATCCCGACGATGTTGATTGCCGGATATTTCGCCAAACGTCTGGGTAAGCGTTTCTTAATGCGCGtt > 2:32751/1‑289 (MQ=255) gCTGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGTG‑GGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATGCCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGCCGGTGTGAGCATGGGGACCGCAGCCGGGCTGGCAATCCCGACGCTGTTGATTGCCGGATATTTCTCCTAACGTCGGGGTAAGGGTTTACTAATGcgcggt > 2:1212438/1‑287 (MQ=255) tGTTTTTACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGTG‑GGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATGCCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGCCGGTGTGATGATGGGGACCGCCGCCGGGCTGGAAATCCCGACGATGTTGATTGCCGGATATTTCGCCAAACGTCTGGGTAAGCGTTTCTTAATGCGCGTtg < 1:1770864/288‑1 (MQ=255) tttACCGTCGATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGTG‑GGGCTCGAACAGCCTGTACATCATCAACATGCCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGCCGGTGTGATGATGGGGACCGCCGCCGGGCTGGAAATCCCGACGATGTTGATTGCCGGATATTTCGCCAAACGTCTGGGGAAGCGTGTCTTAATTGGGGTTGCTGcc > 1:1470689/1‑289 (MQ=255) ||| TCGCAACTACTTTGTTTTGCTATTCGTTGGCGTCTTTCTTAGCAGCTTTGGCAGCACCGCTAACCCGCAAATGTTTGCCCTTGCCCGTGAACATGCCGACAAAACCGGACGTGAGGCGGTGATGTTCAGCTCTTTTTTACGCGCTCAGGTTAGTCTGGCATGGGTCATTGGCCCACCGCTGGCTTATGCCTTAGCGATGGGTTTCAGCTTTACGGTAATGTATCTGAGCGCAGCGGTAGCGTTTATTGTTTGCGGTGTGATGGTGTGGCTGTTTTTACCGAGCATGCGAAAAGAGCTTCCGCTGGCGACCGGCACGATCGAAGCGCCGCGCCGTAACCGTCGCGATACGCTGCTGCTGTTTGTCATTTGTACATTGATGTG‑GGGCAGCAACAGCCTGTACATCATCAACATGCCGCTATTTATTATCAACGAACTGCATCTTCCCGAGAAACTGGCCGGTGTGATGATGGGGACCGCCGCCGGGCTGGAAATCCCGACGATGTTGATTGCCGGATATTTCGCCAAACGTCTGGGTAAGCGTTTCTTAATGCGCGTTGCTGCC > CP042583/1839111‑1839672 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |