| Predicted mutation | ||||||
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| RA | CP042583 | 531,313 | 3 bp→TGA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP042583 | 531,314 | 0 | C | G | 99.7% | 738.6 / NA | 313 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base G (126/186); minor base T (1/0); total (127/186) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.06e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| * | CP042583 | 531,315 | 0 | T | A | 98.7% | 729.2 / ‑3.0 | 313 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base A (126/183); minor base G (1/3); total (127/186) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.49e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.71e-01 | |||||||||||
Only 100 of 313 total aligned reads displayed.
CTTGCTGAAGGTCAGCGCGTAGAGTTCGAAATCACTAACGGTGCCAAAGGCCCTTCTGCTGCAAACGTAATCGCTCTGTAAGATACGTCAGCAAGAATTCAAAACCCGCTTAATCAGCGGGTTTTTTTTGGTCTTTAGTGTGCGGTACTGGCGCTAAACAGCCAGAATGCCAGTGCGGTCATGGCAAAAGACCCCAGAAGGTTGACGAAAACGTTCAGTAATGCCCAGCCAAAGCGGCCCTCTTGTAACAAAAACACCACTTCTGCGCTAAATGTACTGAAGGTTGTTAGACCGCCACAAAATCCGGTGGTGATTAATACTTTCCACACTGGATCAATGTTCGTCATCCTGCTGAACCATGCGAATCCTATTCCTATGATGAATGCCCCAATCAGGTTTGCTGTCAGCGTCCCCAACGGAATCGCCTGATGCAGTGGGTTAAATCGCATACTTAACAGCCATCTCGCCACGCTTCCCGTACCACCGCCAATAAAAACTGCTAAAAGAAGTTGTAACACTGCAAAATCCTGCTATTTGATTTGTATG > CP042583/531038‑531583 ||| ctTGCTGAAGGTCAGCGCGTAGCGTTCGAAATCACTAACGGTGCCAAAGGCCCTTCTGCTGCAAACGTAATCGCTCTGTAAGATACGTCAGAAAGAATTCAAAACCCGCTTAATCAGCGGGTTTTTTTTGGTCTTTAGTGTGCGGTTGAGGCCGAAAACAGCCAGAATGCCAGTGCGGTCATGGAAAAAGACCCCAGAAGGTTGAAGAAAACGTTCAGTAATGCCCAGCCAAAGCGGACCTCTTGTAACAAAAACACAACTTCTGCCGAAAATGTTGAGAAGGTTGTTa > 1:211214/1‑289 (MQ=255) 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