Predicted mutation | ||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,918,064 | 0 | C | G | 100.0% | 1084.0 / NA | 454 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (225/229); total (225/229) |
Only 100 of 454 total aligned reads displayed.
CTCTAATGAGCTGGCGAAAGAGCAAGGCGCGTGCCCGTGGTTTAACGAAACCACTTACGCGAAAGGGATCCTGCCGATCGATACCTATAAGAAAGATCTGGATACCATCGCTAATGAGCCGCTGCATTACGACTGGGAAGCTCTGCGTGAGAGTATCAAAACGCACGGTCTGCGTAACTCCACGCTTTCTGCTCTGATGCCGTCCGAGACTTCTAGCCAGATCTCTAACGCCACTAACGGTATTGAACCGCCGCGCGGTTACGTCAGCATCAAAGCGAGCAAAGACGGTATTTTGCGCCAGGTGGTGCCGGACTACGAGCACCTGCACGACGCCTATGAGCTGCTGTGGGAAATGCCGGGTAACGATGGTTATCTGCAACTGGTGGGTATCATGCAGAAATTTATCGATCAGAGCATCTCTGCCAACACCAACTACGATCCGAGTCGCTTCCCGAGTGGAAAAGTGCCGATGCAGCAGTTGCTGAAAGACCTGCTCACCGCCTACAAATTCGGGGTCAAAACACTGTATTATCAGAACACCCGTGACGGCGCTGAAGAC > CP042583/1917785‑1918343 ||| ctctAATGAGCTGGCGAAAGAGCAAGGCGCGTGCCCGTGGTTTAACGAAACCACTTACGCGAAAGGGATCCTGCCGATCGATACCTATAAGAAAGATCTGGATACCATCGCTAATGAGCCGCTGCATTACGACTGGGAAGCTCTGCGTGAGTCAATCAAAACGCACGGTCTGCGTAACTCCACGCTTTCTGCTCTGATGCCGTCCGAGACTTCTTCGCAGATCTCTAACGCCACTAACGGTATTGAACCGCCGCGCGGTTACGTCAGCATCAAAGCGTCGAAAGACg < 1:2560543/287‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |