Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 1,924,599 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 1,924,599 | 0 | A | T | 99.4% | 759.5 / NA | 320 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (151/167); minor base C (2/0); total (153/167) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.28e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,924,600 | 0 | G | C | 99.7% | 755.8 / NA | 320 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base C (153/166); total (153/167) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,924,601 | 0 | C | G | 100.0% | 755.0 / NA | 320 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (153/167); total (153/167) |
Only 100 of 320 total aligned reads displayed.
CGCGGTGAAAGTTCCGGATGGCACCGTTGATCCATTTCGTCTGACCGCAGCAAACATGCTGGATGCCAAAGAACACGGTGCCGTTATCCTTACCGCTCATGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCA‑TTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGAAGCCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCGATATTCTGGTGCCTGGCGATACCATTAGCCTGATTGGTACCACCTCTTTACGTATTGATTACAACGAGATTGACGATAATCGAGTGACGGCAGAAGAGGTTGATATTCTGCTGCGTGAAGGGGAAAAACTGGCCCCCGTGATGGCGAAAACGCGCATTTTGCGGGCCTATTCTGGCGTGCGCCCGCTGGTTGCCAGCGATGACGACCCGAG > CP042583/1924322‑1924879 ||| cgcgGTGAAAGTTCCGGATGGCACCGTTGATCCATTTCGTCTGACCGCAGCAAACATGCTGGATGCCAAAGAACACGGTGCCGTTATCCTTACCGCTCATGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCA‑TTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATc > 1:2696956/1‑289 (MQ=255) gAAAGTTCGGGATGGCACCACTGATCCATTTCCCCTGACCGCAGCAAACATGCTGGATGCCAAAGAACACGGTGCCGTTATCCGTACCGCTCATGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCA‑TTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGAt < 2:1326140/289‑1 (MQ=255) aaGTTCCGGATGGCACCGTTGATCCATTTCGTCTGACCGCAGCAAACATGCTGGATGCCAAAGAACACGGTGCCGTTATCCTTACCGCTCATGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCA‑TTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCa < 2:1018080/289‑1 (MQ=255) cGGATGGACCCGTTCATCCATTTCGTCTGACCGCAGCAAACAGTCTGGATGCCAAAGCACACGGTGCCGTTATCCTTACCGCTCATGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCA‑TTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCAt < 2:730183/289‑1 (MQ=255) tGGCACCGTTGATCCATTTCGTCTGACCGCAGCAAACATGCTGGATGCCAAAGAACACGGTGCCGTTATCCTTACCGCTCATGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCA‑TTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAAc < 1:1237965/289‑1 (MQ=255) ggCACCGTAGATCCATTTCGGCACCACGCAGCGAACATGTCTGATGCCTACGATCACGGTGCCGTTTTGCTTACCGATCTTGAAGTCCCGGTGCTGATTAGTGGCGGCGCGACGGTGTGCGTTGTGCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGACACTCATGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCA‑TTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAAcc < 2:1465290/289‑1 (MQ=255) cACCGTTGATCCATTTCGTCTGACCGCAGCAAACATGCTGGATGCCAAAGAACACGGTGCCGTTATCCTTACCGCTCATGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCA‑TTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCa > 1:767363/1‑288 (MQ=255) aCCGTTGATCCATTTCGTCTGACCGCAGCAAACATGCTGGATGCCAAAGAACCCGGTGCCGTTATCCTTACCGCTCATGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCA‑TTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGc < 1:468104/289‑1 (MQ=255) ttGATCCATTTCGTCTGACCGCAGCAAACATGCTGGATGCCAAAGAACACGGTGCCGTTATCCTTACCGCTCATGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCA‑TTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCAtgt > 1:905605/1‑289 (MQ=255) tCGTCTGACCGCAGCAAACATGCTGGATGCCAAAGAACACGGTGCCGTTATCCTTACCGCTCATGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCA‑TTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGc < 2:767363/289‑1 (MQ=255) aCATGCTGGATGCCAACGAACACGGTGCCGTTATCCTTACCGCTCATGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCA‑TTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGa < 1:2096954/289‑1 (MQ=255) tagATGCCAAAAAACACGGTGCCCTTATCCTTACGTCTCATGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCCGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCA‑TTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCg < 2:509516/286‑1 (MQ=255) ggATGCCAAAGAACACGGTGCCGTTATCCTTACCGCTCATGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCA‑TTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGGAAACCTTCCGACGCCGat > 2:1403887/1‑289 (MQ=255) cAAAGAACCCGGGTCGGTTCTCGTTAACGGAGATGAAGTAACGGGGCTGATTCGGGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGGTCGGTTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCA‑TTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCGATATTCTg < 2:2213792/289‑1 (MQ=255) cAAAGAACACGGTGCCGTTATCCTTACCGCTCATGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCA‑TTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCGATATTCTg > 1:1308908/1‑289 (MQ=255) aGAACACGGTGCCGTTATCCTTACCGCTCATGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCA‑TTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCGATATTCTGGTg < 1:217019/289‑1 (MQ=255) aGAACACGGTGCCGTTATCCTTACCGCTCATGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCA‑TTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCGATATTCTGGTg < 1:1416387/289‑1 (MQ=255) gCCGTTATCCTTACCGCTCATGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGAGGCAACACATTGCCGAATATGCCGCTCTGTGCA‑TTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCGATATTCTGGTGCCTGGCGAt > 2:310084/1‑288 (MQ=255) gCCGTTATCCTTACCGCTCATGAAGGCACGGGGCTGCTTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCA‑TTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCGATATTCTGGTGCCTGGCGATa < 1:2631285/289‑1 (MQ=255) gCCGTTATCCTTACCGCCCATGCAGTCACGGGGCTGCTTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCA‑TTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCGATATTCTGGTGCCTGGCGATa < 2:2571488/289‑1 (MQ=255) cGTTATCCTTACCGCTCATGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCA‑TTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCGATATTCTGGTGCCTGGCGCTAcc > 1:1670305/1‑289 (MQ=255) cGTTATCCTTACCGCTCATGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCA‑TTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGACCACCGCATTCACCAGCATGTTATCAACCGCCGCCGTAAACCTTCCGACGCCCACCTTCTGGTGCCTGGCGATAcc > 2:1715761/1‑289 (MQ=255) tCCTTACCGCTCATGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCA‑TTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCATAAACCTTCCGACGCCGATATTCTGGTGCCTGGCGATACCAtttc > 1:1781202/1‑287 (MQ=255) ccTTACCGCTCATGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCA‑TTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCGATATTCTGGTGCCTGGCGATACCAtttcg < 1:669092/289‑4 (MQ=255) cTTACCGCTCATGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCA‑TTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCa > 2:1233937/1‑209 (MQ=255) 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aCCGCTCATGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCA‑TTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCAt > 2:2178306/1‑212 (MQ=255) aCCGCTCATGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCA‑TTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCg > 1:1656095/1‑233 (MQ=255) aCCGCTCATGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCA‑TTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCg < 2:1656095/233‑1 (MQ=255) aCCGCTCATGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCA‑TTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCGATATTCTGGTGCCTGGCGATACCAtttcgctga > 2:2135438/1‑282 (MQ=255) aCCGCTCATGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGAGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCA‑TTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCGATATTCTGGTGCCTGGCGATACCAtttcgctga > 1:989429/1‑282 (MQ=255) cgcacattGAAGTCACGGGGTTGGTTCGGGAAGGGTCGAGTGTGGGATGTATGCGTGTACGTAAACATCTAACCGGCGAGACTCATGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTGTATGACGCTTGTATCGGGGGGCAACACAATGACGAATAGGGCGTTCTGCGCA‑TTCGCATGTTCCAGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCAAGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTGCCGACGCCGATAATCTGGTGCCTGGCGATACCAtttcgctga < 2:192726/281‑8 (MQ=255) 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aTGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCA‑TTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCa > 1:1011362/1‑214 (MQ=255) aTGAAGTCACGGGGCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCA‑TTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCGATATTCTGGTGCCTGGCGATACCATTTCGCTGATTGGTa > 2:2687103/1‑288 (MQ=255) tGAAGGCACGGGGGTGAGTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGGTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCA‑TTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCGATATTCTGGTGCCTGGCGATACCATTTCGCTGATTGGTacc < 2:43538/289‑1 (MQ=255) 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ggggCTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCA‑TTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCGATATTCTGGTGCCTGGCGATACCATTTCGCTGATTGGTACCACCTCttt > 1:1032236/1‑288 (MQ=255) ggggcaTTCGTGCAGGCGGGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTCGTTAACCACCTCCCCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCA‑TTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCGATATTCTGGTGCCTGGCGATACCATTTCGCTGATTGGTACCACCTCTTTAc < 2:1032236/283‑1 (MQ=255) cTGATTCGTGAAGGCGCGACGGTGTGCGGTGTTCGTGTACGTAACCATCTCACCGGCGAAACTCAGGCCCTTCATGCACCTGTCGTGGTTAATGCCGCTGGGATCTGGGGGCAACACATTGCCGAATATGCCGATCTGCGCA‑TTCGCATGTTCCCGGCGAAAGGATCGCTGCTGATCATGGATCACCGCATTAACCAGCATGTGATCAACCGCTGCCGTAAACCTTCCGACGCCGATATTCTGGTGCCTGGCGATACCATTTCGCTGATTGGTACCACCTCTTTACGTa > 1:856698/1‑289 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |