Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 1,954,241 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 1,954,241 | 0 | A | T | 99.7% | 686.8 / NA | 288 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); new base T (138/149); total (138/150) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,954,242 | 0 | G | C | 100.0% | 687.5 / NA | 288 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base C (138/150); total (138/150) | |||||||||||
* | CP042583 | 1,954,243 | 0 | C | G | 99.7% | 678.4 / NA | 288 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); new base G (138/148); total (138/150) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 288 total aligned reads displayed.
CTTGATTCAGCACAACCTTTGCAACTAAAAGGAGCCCATGATGGTTACAGTTGTCAGCAATTATTGTCAATTATCTCAAACGCAACTCAGTCAGACATTTGCAGAAAAATTTACTGTGACCGAGGAATTACTGCAGTCTTTAAAAAAAACAGCGTTATCCGGAGATGAAGAAAGCATTGAGTTACTGCATAATATTGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTAAGCATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAAAGTCATGATAGTGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTAGCAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGAGCCTTAGTAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCT > CP042583/1953964‑1954520 ||| cTTGATTCAGCACAACCTTTGCAACTAAAAGGAGCCCATGATGGTTACAGTTGTCAGCAATTATTGTCAATTATCTCAAACGCAACTCAGTCAGACATTTGCAGAAAAATTTACTGTGACCGAGGAATTACTGCAGTCTTTAAAAAAAACAGCGTTATCCGGAGATGAAGAAAGCATTGAGTTACTGCATAATATTGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGa < 1:1828059/289‑1 (MQ=255) aCCTTTGCAACTAAAAGGAGCCCATGATGGTTACAGTTGTCAGCAATTATTGTCAATTATCTCAAACGCAACTCGGTCAGACATTTGCAGAAAAATTTACTGTGACCGAGGAATTACTGCAGTCTTTAAAAAAAACAGCGTTATCCGGAGATGAAGAAAGCATTGAGTTACTGCATAATATTGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGc < 1:1348178/289‑1 (MQ=255) aCCTTTGCAACTAAAAGGAGCCCATGATGGTTACAGTTGTCAGCAATTATTGTCAATTATCTCAAACGCAACTCAGTCAGACATTTGCAGAAAAATTTACTGTGACCGAGGAATTACTGCAGTCTTTAAAAAAAACAGCGTTATCCGGAGATGAAGAAAGCATTGAGTTACTGCATAATATTGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGc < 1:779465/289‑1 (MQ=255) tGCAACTAAAAGGAGCCCATGATGGTTACAGTTGTCAGCAATTATTGTCAATTATCTCAAACGCAACTCAGTCAGACATTTGCAGAAAAATTTACTGTGACCGAGGAATTACTGCAGTCTTTAAAAAAAACAGCGTTATCCGGAGATGAAGAAAGCATTGAGTTACTGCATAATATTGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGtt < 1:2163288/289‑1 (MQ=255) aCTAAAAGGAGGCCACGATGGTTACAGTTGTCATCAATTATTGTCAATTATCTCACACGCAACTCAGTCAGACATTTGCAGAAAAATTTACTGTGACCGAGGAATTACTGCAGTCTTTAAAAAAAACAGCGTTATCCGGAGATGAAGAAAGCATTGAGTTACTGCATTATATTGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTCAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTaaa < 2:1959410/289‑1 (MQ=255) tAAAAGGAGCCCATGATGGTTACAGTTGTCAGCAATTATTGTCAATTATCTCAAACGCAACTCAGTCAGACATTTGCAGAAAAATTTACTGTGACCGAGGAATTACTGCAGTCTTTAAAAAAAACAGCGTTATCCGGAGATGAAGAAAGCATTGAGTTACTGCATAATATTGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAAt > 1:2072548/1‑289 (MQ=255) tAAAAGGAGCCCATGATGGTTACAGTTGTCAGCAATTATTGTCAATTATCTCAAACGCAACTCAGTCAGACATTTGCAGAAAAATTTACTGTGACCGAGGAATTACTGCAGTCTTTAAAAAAAACAGCGTTATCCGGAGATGAAGAAAGCATTGAGTTACTGCATAATATTGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAAt > 1:2491538/1‑289 (MQ=255) cccATGATGGTTACAGTTGTCAGCAATTATTGTCAATTATCTCAAACGCAACTCAGTCAGACATTTGCAGAAAAATTTACTGTGACCGAGGAATTACTGCAGTCTTTAAAAAAAACAGCGTTATCCGGAGATGAAGAAAGCATTGAGTTACTGCATAATATTGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATaa > 2:967521/1‑287 (MQ=255) cccATGATGGTTACAGTTGTCAGCAATTATTGTCAATTATCTCAAACGCAACTCAGTCAGACATTTGCAGAAAAATTTACTGTGACCGAGGAATTACTGCAGTCTTTAAAAAAAACAGCGTTATCCGGAGATGAAGAAAGCATTGAGTTACTGCATAATATTGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATaa > 1:2620628/1‑287 (MQ=255) tgatgGTTACAGTTGTCAGCAATTATTGTCAATTATCTCAAACGCAACTCAGTCAGACATTTGCAGAAAAATTTACTGTGACCGAGGAATTACTGCAGTCTTTAAAAAAAACAGCGTTATCCGGAGATGAAGAAAGCATTGAGTTACTGCATAATATTGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGc < 1:967521/289‑1 (MQ=255) gTTACAGTTGTCAGCAATTATTGTCAATTATCTCAAACGCAACTCAGTCAGACATTTGCAGAAAAATTTACTGTGACCGAGGAATTACTGCAGTCTTTAAAAAAAACAGCGTTATCCGGAGATGAAGAAAGCATTGAGTTACTGCATAATATTGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAAt < 2:2046625/279‑1 (MQ=255) tACAGTTGTCAGCAATTATTGTCAATTATCTCAAACGCAACTCAGTCAGACATTTGCAGAAAAATTTACTGTGACCGAGGAATTACTGCAGTCTTTAAAAAAAACAGCGTTATCCGGAGATGAAGAAAGCATTGAGTTACTGCATAATATTGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATc < 2:826594/289‑1 (MQ=255) ttGTCAGCAATTATTGTCAATTATCTCAAACGCAACTCAGTCAGACATTTGCAGAAAAATTTACTGTGACCGAGGAATTACTGCAGTCTTTAAAAAAAACAGCGTTATCCGGAGATGAAGAAAGCATTGAGTTACTGCATAATATTGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATtatata > 1:520922/1‑270 (MQ=255) gTCAGCAATTATTGTCAATTATCTCAAACGCAACTCAGTCAGACATTTGCAGAAAAATTTACTGTGACCGAGGAATTACTGCAGTCTTTAAAAAAAACAGCGTTATCCGGAGATGAAGAAAGCATTGAGTTACTGCATAATATTGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATAAAATCTGGCACATATCGcaacca > 2:1365005/1‑289 (MQ=255) tCAGCAATTATTGTCAATTATCTCAAACGCAACTCAGTCAGACATTTGCAGAAAAATTTACTGTGACCGAGGAATTACTGCAGTCTTTAAAAAAAACAGCGTTATCCGGAGATGAAGAAAGCATTGAGTTACTGCATAATATTGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACGCTATCGATTATCCGACTTATCAACAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGTTACATATCGcaaccaa > 2:1752123/1‑289 (MQ=255) aGCAATTATTGTCAATTATCTCAAACGCAACTCAGTCAGACATTTGCAGAAAAATTTACTGTGACCGAGGAATTACTGCAGTCTTTAAAAAAAACAGCGTTATCCGGAGATGAAGAAAGCATTGAGTTACTGCATAATATTGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGcaaccaac > 1:2305145/1‑288 (MQ=255) aGCAATTATTGTCAATTATCTCAAACGCAACTCAGTCAGACATTTGCAGAAAAATTTACTGTGACCGAGGAATTACTGCAGTCTTTAAAAAAAACAGCGTTATCCGGAGATGAAGAAAGCATTGAGTTACTGCATAATATTGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGcaaccaac > 2:1293115/1‑288 (MQ=255) cAATTATTGTCAATTATCTCAAACGCAACTCAGTCAGACATTTGCAGAAAAATTTACTGTGACCGAGGAATTACTGCAGTCTTTAAAAAAAACAGCGTTATCCGGAGATGAAGAAAGCATTGAGTTACTGCATAATATTGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTcc < 2:1336611/289‑1 (MQ=255) cAATTATTGTCAATTAACTAAAACGCAAATCAGTCAAACATTTGAAGAAAAATTTACTGGGACCGAGGAATTACTGCAGTCTTTAAAAAAAACAGCGTTATCCGGTGATGAAGAAAGCATTGAGTTACTGCATAATATTGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTcc < 2:1107337/289‑1 (MQ=255) aaTTATTGTCAATTATCTCAAACGCAACTCAGTCAGACATTTGCAGAAAAATTTACTGTGACCGAGGAATTACTGCAGTCTTTAAAAAAAACAGCGTTATCCGGAGATGAAGAAAGCATTGAGTTACTGCATAATATTGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTccc < 1:1789778/289‑1 (MQ=255) aaTTATTGTCAATTATCTCAAACGCAACTCAGTCAGACATTTGCAGAAAAATTTACTGTGACCGAGGAATTACTGCAGTCTTTAAAAAAAACAGCGTTATCCGGAGATGAAGAAAGCATTGAGTTACTGCATAATATTGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTcc < 2:2103037/288‑1 (MQ=255) ttattGTCAATTATCTCAAACGCAACTCAGTCAGACATTTGCAGAAAAATTTACTGTGACCGAGGAATTACTGCAGTCTTTAAAAAAAACAGCGTTATCCGGAGATGAAGAAAGCATTGAGTTACTGCATAATATTGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTaaa > 2:1222781/1‑252 (MQ=255) ttattGTCAATTATCTCAAACGCAACTCAGTCAGACATTTGCAGAAAAATTTACTGTGACCGAGGAATTACTGCAGTCTTTAAAAAAAACAGCGTTATCCGGAGATGAAGAAAGCATTGAGTTACTGCATAATATTGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTaaa < 1:1222781/252‑1 (MQ=255) tATCTCAAACGCAACTCAGTCAGACATTTGCAGAAAAATTTACTGTGACCGAGGAATTACTGCAGTCTTTAAAAAAAACAGCGTTATCCGGAGATGAAGAAAGCATTGAGTTACTGCATAATATTGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCaaatcaca < 1:2036757/289‑6 (MQ=255) tATCTCAAACGCAACTCAGTCAGACATTTGCAGAAAAATTTACTGTGACCGAGGAATTACTGCAGTCTTTAAAAAAAACAGCGTTATCCGGAGATGAAGAAAGCATTGAGTTACTGCATAATATTGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCaaatcaca < 2:2376792/289‑6 (MQ=255) tATCTCAAACGCAACTCAGTCAGACATTTGCAGAAAAATTTACTGTGACCGAGGAATTACTGCAGTCTTTAAAAAAAACAGCGTTATCCGGAGATGAAGAAAGCATTGAGTTACTGCATAATATTGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCaaatcaca < 1:328144/289‑6 (MQ=255) tATCTCAAACGCAACTCAGTCAGACATTTGCAGAAAAATTTACTGTGACCGAGGAATTACTGCAGTCTTTAAAAAAAACAGCGTTATCCGGAGAGGAAGAAAGCATTGGGTTACTGCATAATATTGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCaaatcaca < 1:870263/289‑6 (MQ=255) caaCGCAACTCCGTCAGACATTTGAAGAAAAAGTTGCTGTGAACGAGGAAATACTGCAGTCTTTAAAAAAAACAGCGTTATCCGGATATGAAGAAAGCATGGAGTTACTGCATAATATTGCGTTAGGTTATGATAAATTTGTGAAAGGAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGTACCCCAACAAATGAGACCCGATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCaaatcacaggattc < 2:1826619/288‑12 (MQ=255) aaaCGCAACTCAGTCAGACATTTGCAGAAAAATTTACTGTGACCGAGGAATTACTGCAGTCTTTAAAAAAAACAGCGTTATCCGGAGATGAAGAAAGCATTGAGTTACTGCATAATATTGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGAttc < 1:1318008/289‑3 (MQ=255) aaaCGCAACTCAGTCAGACATTTGCAGAAAAATTTACTGTGACCGAGGAATTACTGCAGTCTTTAAAAAAAACAGCGTTATCCGGAGATGAAGAAAGCATTGAGTTACTGCATAATATTGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATAACATGAttc < 1:2709480/289‑3 (MQ=255) aCTCAGTCAGACATTTGCAGAAAAATTTACTGTGACCGAGGAATTACTGCAGTCTTTAAAAAAAACAGCGTTATCCGGAGATGAAGAAAGCATTGAGTTACTGCATAATATTGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTaaaa < 2:915553/229‑1 (MQ=255) aTTTGCAGAAAAATTTACTGTGACCGAGGAATTACTGCAGTCTTTAAAAAAAACAGCGTTATCCGGAGATGAAGAAAGCATTGAGTTACTGCATAATATTGCGTTAGGTTATGATAAGTTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCaaa < 2:333647/289‑1 (MQ=255) ttGCAGAAAAATTTACTGTGACCGAGGAATTACTGCAGTCTTTAAAAAAAACAGCGTTATCCGGAGATGAAGAAAGCATTGAGTTACTGCATAATATTGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCaaaaa > 2:1916951/1‑289 (MQ=255) tGCAGAAAAATTTACTGTGACCGAGGAATTACTGCAGTCTTTAAAAAAAACAGCGTTATCCGGAGATGAAGAAAGCATTGAGTTACTGCATAATATTGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAAt < 2:1436001/223‑1 (MQ=255) tGCAGAAAAATTTACTGTGACCGAGGAATTACTGCAGTCTTTAAAAAAAACAGCGTTATCCGGAGATGAAGAAAGCATTGAGTTACTGCATAATATTGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAAt > 1:1436001/1‑223 (MQ=255) aCCGAGGAATTACTGCAGTCTTTAAAAAAAACAGCGTTATCCGGAGATGAAGAAAGCATTGAGTTACTGCATAATATTGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCAGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCaaatcaca < 1:1668401/242‑6 (MQ=255) ccGAGGAATTACTGCAGTCTTTAAAAAAAACAGCGTTATCCGGAGATGAAGAAAGCATTGAGTTACTGCATAATATTGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCttcgaaatt < 1:1282610/289‑9 (MQ=255) gAATTACTGCAGTCTTTAAAAAAAACAGCGTTATCCGGAGATGAAGAAAGCATTGAGTTACTGCATAATATTGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGa > 2:1604837/1‑165 (MQ=255) gAATTACTGCAGTCTTTAAAAAAAACAGCGTTATCCGGAGATGAAGAAAGCATTGAGTTACTGCATAATATTGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAGCTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATg > 2:576977/1‑288 (MQ=255) tGCAGTCTTTAAAAAAAACAGCGTTATCCGGAGATGAAGAAAGCATTGAGTTACTGCATAATATTGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTAt < 2:1686612/289‑1 (MQ=255) tGCAGTCTTTAAAAAAAACAGCGTTATCCGGAGATGAAGAAAGCATTGAGTTACTGCATAATATTGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTAt < 2:2638960/289‑1 (MQ=255) tCTTTAAAAAAAACAGCGTTATCCGGAGATGAAGAAAGCATTGAGTTACTGCATAATATTGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGtg > 1:416929/1‑289 (MQ=255) cTTTAAAAAAAACAGCGTTATCCGGAGATGAAGAAAGCATTGAGTTACTGCATAATATTGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGtga < 2:2557187/289‑1 (MQ=255) aCAGCGTTATCCGGAGATGAAGAAAGCATTGAGTTACTGCATAATATTGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTcc > 2:2163774/1‑287 (MQ=255) gTTATCCGGAGATGAAGAAAGCATTGAGTTACTGCATAATATTGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTtat < 1:226522/288‑1 (MQ=255) tATCCGGAGATGAAGAAAGCATTGAGTTACTGCATAATATTGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATc < 1:552867/289‑1 (MQ=255) agaTGAAGAAAGCATTGAGTTACTGCATAATATTGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGaaaa > 1:1611712/1‑288 (MQ=255) aTGAAGAAAGCATTGAGTTACTGCATAATATTGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTaaa > 2:221498/1‑148 (MQ=255) aTGAAGAAAGCATTGAGTTACTGCATAATATTGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTaaa < 1:221498/148‑1 (MQ=255) aagaaAGCATTGAGTTACTGCATAATATTGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGAttc < 2:1861858/199‑3 (MQ=255) aagaaAGCATTGAGTTACTGCATAATATTGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGAttc > 1:1861858/1‑197 (MQ=255) aaGCATTGAGTTACTGCATAATATTGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACagtcgctt > 1:1394711/1‑283 (MQ=255) tGAGTTACTGCATAATATTGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACagtcgctttcaaag < 2:728060/289‑13 (MQ=255) tGAGTTACTGCATAATATTGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACagtcgctttcaaag < 2:2620628/289‑13 (MQ=255) cTGCATAATATTGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTaaaa > 1:1565093/1‑129 (MQ=255) cTGCATAATATTGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTaaaa < 2:1565093/129‑1 (MQ=255) cTGCATAATATTGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCaaatca < 2:2529731/174‑4 (MQ=255) cTGCATAATATTGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCttt > 2:655842/1‑289 (MQ=255) tatTGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAatgat < 1:655842/289‑1 (MQ=255) ttGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTa > 1:1073130/1‑116 (MQ=255) ttGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAAtgatga < 2:1058805/289‑1 (MQ=255) ttGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAAtgatga < 2:1394711/289‑1 (MQ=255) gCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATgaga < 2:2072548/289‑1 (MQ=255) cGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGTTGCTTTTAAATGATGAGaa > 1:733611/1‑289 (MQ=255) cGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGaa > 1:2054968/1‑289 (MQ=255) cGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGaa > 2:58692/1‑289 (MQ=255) gTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGaat > 1:2406306/1‑289 (MQ=255) ggTTGTGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACagtcgctttcaaagg < 2:1287976/265‑14 (MQ=255) ggTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCaaatcaca < 1:1292545/158‑6 (MQ=255) ggTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATg > 2:1137601/1‑210 (MQ=255) ggTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATg < 1:1137601/210‑1 (MQ=255) ggTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTaa < 1:710458/274‑1 (MQ=255) ggTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATg > 1:263521/1‑289 (MQ=255) ggTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATg > 2:2420948/1‑289 (MQ=255) ttATAATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGTTATTTTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCCATTACCCGACTTACCAAAATTCCTTGTTTAAAATTATATATTCTGCCACATATCGC‑ACCCACCCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGaa < 1:2366470/288‑1 (MQ=255) aaTTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGa < 1:981511/289‑1 (MQ=255) aaTTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGa < 1:485944/289‑1 (MQ=255) aaTTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGa > 1:2545830/1‑289 (MQ=255) aagCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACt > 2:519169/1‑288 (MQ=255) ttACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAAtgatga > 2:460760/1‑243 (MQ=255) tatTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCGCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTa > 2:2730799/1‑289 (MQ=255) atTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTa > 1:1316590/1‑288 (MQ=255) ttGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATACGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCt < 1:60180/267‑1 (MQ=255) ttAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTg < 1:1528583/245‑1 (MQ=255) ttAGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACcac < 2:22982/289‑1 (MQ=255) aGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCaaatcaca < 2:698827/107‑6 (MQ=255) aGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAg < 1:1336798/289‑1 (MQ=255) aGAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAg > 2:1663889/1‑289 (MQ=255) gAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAAtgatga > 2:1594579/1‑229 (MQ=255) gAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAAtgatga > 1:1378921/1‑229 (MQ=255) gAACCCCAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAAtgatga < 1:1594579/229‑1 (MQ=255) cccAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAGATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAACCAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAACTGATGAGCATAATGAACTGAGTTATGTTCCAAACTTCTGGGATaaaaa > 2:60180/1‑267 (MQ=255) cccAACAAATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGaa < 1:1177747/289‑1 (MQ=255) aacaaATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATa > 1:942069/1‑289 (MQ=255) aacaaATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATa > 2:118912/1‑289 (MQ=255) aacaaATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATa > 1:174447/1‑289 (MQ=255) aacaaATGAGACCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATGCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGTATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATa > 2:2655099/1‑289 (MQ=255) gagaCCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATTGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCt < 1:684459/289‑1 (MQ=255) gagaCCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCt < 1:1003938/289‑1 (MQ=255) gagaCCCTATCGATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAATCACATGATTCAGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTTCGAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGTCGCTTTCAAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCt < 1:1027384/289‑1 (MQ=255) ||| CTTGATTCAGCACAACCTTTGCAACTAAAAGGAGCCCATGATGGTTACAGTTGTCAGCAATTATTGTCAATTATCTCAAACGCAACTCAGTCAGACATTTGCAGAAAAATTTACTGTGACCGAGGAATTACTGCAGTCTTTAAAAAAAACAGCGTTATCCGGAGATGAAGAAAGCATTGAGTTACTGCATAATATTGCGTTAGGTTATGATAAATTTGGGAAAGAAGCTGAAGATATTCTTTACCATATTGTTAGAACCCCAACAAATGAGACCCTAAGCATTATCCGACTTATCAAAAATGCTTGTTTAAAATTATATAATCTGGCACATATCGCAACCAACTCCCCCCTCAAAAGTCATGATAGTGATGATCTCCTGTTCAAAAAACTATTCTCCCCTAGCAAATTAATGACAATTATCGGTGATGAAATTCCTCTTATATCTGAAAAACAGAGCCTTAGTAAGGTGCTTTTAAATGATGAGAATAATGAACTGAGTGATGGTACAAACTTCTGGGATAAAAATCGTCAATTAACCACAGATGAAATAGCTTGCT > CP042583/1953964‑1954520 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |