| Predicted mutation | ||||||
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| RA | CP042583 | 1,973,577 | 3 bp→CGA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP042583 | 1,973,578 | 0 | C | G | 100.0% | 539.7 / NA | 227 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (105/122); total (105/122) | |||||||||||
| * | CP042583 | 1,973,579 | 0 | T | A | 100.0% | 534.8 / NA | 227 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base A (105/122); total (105/122) | |||||||||||
Only 100 of 227 total aligned reads displayed.
TCAGCTCAAAAGCCTCGGTTTGTGGTTGTTGATTCTCGTGCATAATTAGCGGTCCACATCACTCATAACAAAATCGATACTGCCCAGATAAACAATCAGGTCAGACACCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCGGAATTTGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACG‑GGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCGTCGCTGGTCAGGTAGTAACTGTTGATCCCTTTGGTCGCCTCAATCATCTGGAAAGATTCATTGGCAGGCATCACCGGACCCCAGCTCACTTGCAGGAAGTGGGTGATCAGGGTTTCGATATGTTGCAGCGTGCGCTCTTTCGGCGGCGGCGTGGTCAGCGGGTGATCCGCTTTGAACGGGCCTTCCGGCATGTTGTTGAGGCACTGCTCAAGAATGCGCAGACTCTGGCGCAGCTCTTCCACTTTAAGCATTACGCGGGTGTAGCAGTCAGAAACGCCACCACCCACCGGGATTTCAAAGTCGAAGTTTTCATAGCCAGAATAAGGACGCGCCTTACGCACGTCGAAGTCGATCCCGG > CP042583/1973298‑1973851 ||| tCAGCTCAAAAGCCTCGGTTTGTGGTTGTTGATTCTCGTGCATAATTAGCGGTCCACATCTGACATAACAAAATCGATACTGCCCAGATAAACAATCAGGTCAGACACCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCGGAATTTGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACG‑GGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCGTCGCTGGTCAGGTAGTAACTGTTGATCCCTTTGGTCGCCTCAATCATCTGGACAGATTCATTGGCAGGCATCACCGGACCCCACGACACTTGc > 1:1477663/1‑289 (MQ=255) 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aTCACCGGACCCCACGACACTTGCAGGAAGTGGGTGATCAGGGTTTCGATATGTTGCAGCGTGCGCTCTTTCGGCGGCGGCGTGGTCAGCGGGTGATCCGCTTTGAACGGGCCTTCCGGCATGTTGTTGAGGCACTGCTCAAGAATGCGCAGACTCTGGCGCAGCTCTTCCACTTTAAGCATTACGCGGGTGTAGCAGTCAGAAACGCCACCACCCACCGGGATTTCAAAGTCGAAGTTTTCATAGCCAGAATAAGGACGCGCCTTACGCACGTCGAAGTCGATCCCgg > 1:840010/1‑289 (MQ=255) ||| TCAGCTCAAAAGCCTCGGTTTGTGGTTGTTGATTCTCGTGCATAATTAGCGGTCCACATCACTCATAACAAAATCGATACTGCCCAGATAAACAATCAGGTCAGACACCAGGCTGCCGCGGATCGCCGCCGGAATTTGCTGCAAATGCGCAAAGCTCGGGGTACGAACACG‑GGTGCGGTAACTCATGGTGCTGCCGTCGCTGGTCAGGTAGTAACTGTTGATCCCTTTGGTCGCCTCAATCATCTGGAAAGATTCATTGGCAGGCATCACCGGACCCCAGCTCACTTGCAGGAAGTGGGTGATCAGGGTTTCGATATGTTGCAGCGTGCGCTCTTTCGGCGGCGGCGTGGTCAGCGGGTGATCCGCTTTGAACGGGCCTTCCGGCATGTTGTTGAGGCACTGCTCAAGAATGCGCAGACTCTGGCGCAGCTCTTCCACTTTAAGCATTACGCGGGTGTAGCAGTCAGAAACGCCACCACCCACCGGGATTTCAAAGTCGAAGTTTTCATAGCCAGAATAAGGACGCGCCTTACGCACGTCGAAGTCGATCCCGG > CP042583/1973298‑1973851 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |