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Read alignment evidence... | |||||||||||
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Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 587,042 | 0 | T | A | 99.2% | 943.0 / NA | 395 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base A (219/172); minor base C (3/0); total (222/173) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.60e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 395 total aligned reads displayed.
AACGATCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTGATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAGTTCGATCTGGCGTTTGCTAACGACCCGGATTATGACCGTCACGGTATCGTCACTCCGGCAGGTTTGATGAATCCGAACCACTACCTGGCGGTGGCAATCAATTACCTGTTCCAGCATCGTCCGCAGTGGGGCAAAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTAGTTCTGCGATGATCGACCGTGTGGTCAACGACTTGGGCCGTAAACTGGTAGAAGTCCCGGTAGGTTTCAAATGGTTTGTCGATGGTCTGTTCGACGGCAGCTTCGGCTTTGGCGGCGAAGAGAGTGCAGGGGCTTCCTTCCTGCGTTTCGACGGCACGCCGTGGTCCACCGACAAAGACGGCATCATCATGTGTCTGCTGGCGGCGGAAATCACCGCTGTCACCGGTAAGAACCCGCAGGAACACTACAACGAACTGGCAAAACGCTTTGGTGCGCCG > CP042583/586764‑587318 ||| aaCGATCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTGATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAGTTCGATCTGGCGTTTGCTAACGACCCGGATTATGACCGTCACGGTATCGTCACTCCGGCAGGTTTGATGAATCCGAACCACTACCTGGCGGTGGCAATCAATTACCTGTTCCAGCATCGTCCGCAGTGGGGCAAAGATGTTGACGTCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCgatga > 1:2173496/1‑289 (MQ=255) 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