| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | CP042583 | 613,159 | 3 bp→TGA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP042583 | 613,159 | 0 | A | T | 99.4% | 775.0 / NA | 324 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
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| * | CP042583 | 613,160 | 0 | C | G | 99.7% | 764.9 / NA | 324 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base G (151/172); total (152/172) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.69e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| * | CP042583 | 613,161 | 0 | T | A | 99.1% | 767.5 / NA | 324 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/2); new base A (151/169); total (152/172) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 324 total aligned reads displayed.
TCGGGTAAGTCATTCATGTTCACCGCCACGGTGGAAGGCTGGTAACTGGAAATCAACGGCACCACCGCAATGCCAAAATGGTTGGTGTAGTCGAGATTGCCCTGAACCGGAATATCTGCCACGCCATCGGTGCTGACCATCAGGCGTGGTTCATTGGTGGAGCTGCGGCGATGAAATGCTGCACCATATTGGGTTGCGGTGAAAGAACCGCTCCAGCTGCTGCTGACGGAACTGTAATCACTGGCGGCATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCACTACTCAGGTGCTGATAGTTACCGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCCCCAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCAGCTCATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCACCGTTACCGAAGGGGAGGCTAATGCTCAGATAAATCTGGTTGTCGCGATCTTTATCTTCGTAGTGGGTCGTATTGAAACTCGTGCTAATGCTGATATCTCTCCAGTCACCA > CP042583/612881‑613438 ||| tCGGGTAAGTCATTCATGTTCACCGCCACGGTGGAAGGCTGGTAACTGGAAATCAACGGCACCACCGCAATGCCAAAATGGTTGGTGTAGTCGAGATTGCCCTGAACCGGAATATCTGCCACGCCATCGGTGCTGACCATCAGGCGTGGTTCATTGGTGGAGCTGCGGCGATGAAATGCTGCACCATATTGGGTTGCGGTGAAAGAACCGCTCCAGCTGCTGCTGACGGAACTGTAATCACTGGCGGCATAGGTACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGt > 1:967282/1‑289 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| Alignment Legend |
|---|
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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |