| Predicted mutation | ||||||
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| RA | CP042583 | 614,359 | 3 bp→CGA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP042583 | 614,360 | 0 | C | G | 99.7% | 761.3 / NA | 323 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base G (169/153); minor base A (0/1); total (169/154) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.77e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| * | CP042583 | 614,361 | 0 | T | A | 99.7% | 758.2 / NA | 323 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base A (169/152); minor base G (0/1); total (169/154) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.75e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
Only 100 of 323 total aligned reads displayed.
AACAGACTGATTGAGGTCATCAATAATAAACGGGCCTGGCGGGACTTTTTTCTGGTAAATGACGCGGCCACTTTGACTGATCGTCACCGTGGCATTGGTCTGTGCAATACCGCTAATTTGTGGGGCGTAGCCACGCAGCTCCCACGGTAACATTCGATCGTCACTCGCCAGTGCCGCGCCGGTATAAGAAAAACCATCGAAAATATTGGAACTGAAATCGGTTTCGCCGAGGGTTAACTTAGAGCCTAATTGCGGTAATGGACGAAAAAGATAGGTGCGGCTTATTCCGCCACTCTGGTCATGGTTATCTTCGCTATCGGTCTTATTAAGCTGGTAATCACTGCGTAAGCGCCATGCCCCGGCGTTAATTCCGGCGGTACCGTAGGCATTCAGGTTAGTGCTGCTGCTGCCGTCCTGTGGGCGGTAGCTGCTGGCAAACAAGTTGTAATCCATCAGGACACCGGCAACACCTTCTTTCCATGTAGAGGGGGGAGCCCAGTTTTCACTGTGCCACGCCAGCCAGGCTTGCGGAATACTAATATTCAGTTGCTGAT > CP042583/614080‑614633 ||| ttGAGGTCATCAATAATAAACGGGCCTGGCGGGACTTTTTTCTGGTAAATGACGCGGCCTGATTGACTGATCGTCACCGTGGCATTGGTCTGTGCAATACCGCTAATTTGTGGGGCGTAGCCACGCAGCTCCCACGGTAACATTCGATCGTCACTCGCCAGTGCCGCGCCGGTATAAGAAAAACCATCGAAAATATTGGAACTGAAATCGGTTTCGCCGAGGGTTAACTTAGAGCCTAATTGCGGTAATGGACGAAAAAGATAGGTGCGCGATATTCCGcctgactgg > 1:752416/1‑281 (MQ=255) 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