Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
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RA | CP042583 | 655,723 | 3 bp→CGA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | CP042583 | 655,723 | 0 | G | C | 99.7% | 759.4 / NA | 322 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
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Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 655,724 | 0 | C | G | 99.7% | 753.8 / NA | 322 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base G (150/171); minor base A (1/0); total (151/171) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.69e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 655,725 | 0 | T | A | 99.4% | 758.2 / NA | 322 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/2); new base A (150/169); total (151/171) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.01e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
Only 100 of 322 total aligned reads displayed.
CGTTTATCAATGCCGAGAATATCCAGCCACTGCTGCACCAGTTTTTGCTGGCGATCGCTAACGGCCTGATAAATGCCAATGCTATCAAAATAGCCAGAAAGAATCACATTACGCACGGTAGTGCTGACCCGGTAATCCAGATGCAAACTACTGCTGACGTAACCGATATGCTTTTTGATATCCCAGATGGTTTCGCCGCTGCCGCGACGTCGTCCGAAAAGCGTCAAATCGTTGCTGTAACCTTGCGGATGATCGCCAGTAACCAGGCTTAATAACGTGCTTTTTCCTGCACCATTTGGCCCGACAATTTGCCAGTGTTCGCCTGGATTCACCTGCCAGCTAAGGTTATTAAGAATGGGGCGATCGTTATAAGAAACCACGCCATTGTTCAGCACAATGCGCGGTTCGTTGGCGGGTAAGGC‑GTGACGTGCACTAGGTTCATCCGGCTCCGGCAGTTGCACACCTTCAAGCTGTTCACTATGCGCCAGTTGCGCGACGAGTGCTTGTTGGAGCAGTTCCTCTTTAGCGCCAGTTTCCGCTAACGTGCAATCCGCCAGCA > CP042583/655445‑656003 ||| gTTTATCAATGCCGAGAATATCCAGCCACTGCTGCACCAGTTTTTGCTGGCGATCCGAAACGGCCTGATAAATGCCAATCGAATCAAAATAGCCAGAAAGAATCACATTACGCACGGTAGTGCTGACCCGGTAATCCAGATGCAAACTACTGCTGACGTAACCGATATGCTTTTTGATATCCCAGATGGTTTCGCCGCTGCCGCGACGTCGTCCGAAAAGCGTCAAATCGTTGCTGTAACCTTGCGGATGATCGCCAGTAACCAGGCTTAATAACGTCGATTTTCCTGc < 2:2082475/289‑1 (MQ=255) 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tccgaaaCGGCCTGATAAATGCCAATCGAATCAAAATAGCCAGAAAGAATCACATTACGCACGGTAGTGCTGACCCGGTAATCCAGATGCAAACTACTGCTGACGTAACCGATATGCTTTTTGATATCCCAGATGGTTTCGCCGCTGCCGCGACGTCGTCCGAAAAGCGTCAAATCGTTGCTGTAACCTTGCGGATGATCGCCAGTAACCAGGCTTAATAACGTCGATTTTCCTGCACCATTTGGCCCGACAATTTGCCAGTGTTCGCCTGGATTCACCTGCCAGCTa < 1:1541563/283‑1 (MQ=255) ccTGATAAATGCCAATCGAATCAAAATAGCCAGAAAGAATCACATTACGCACGGTAGTGCTGACCCGGTAATCCAGATGCAAACTACTGCTGACGTAACCGATATGCTTTTTGATATCCCAGATGGATTCGCCGCTGCCGCGACGTCGTCCGAAAAGCGTCAAATCGTTGCTGTAACCTTGCGGATGATCGCCAGTAACCAGGCTTAATAACGTCGATTTTCCTGCACCATTTGGCCCGACAATTTGCCAGTGTTCGCCTGGATTCACCTGCCAGCTAAGGTTATTAAg > 1:1038512/1‑289 (MQ=255) tGCCAATGGAATCAAAATGGCCGAGAATAATCACATTCCGCCCGGTAGTGCTGACCCGGTAATCCAGATGCAAACTACTGCTGACGTAACAGATATGCTTTTTGATATCCCAGATGGTTGCGCCGCTGCCGCGACGTCGTCCGAAAAGCGTCAAATCGTTGCTGTAACCTTGCGGATGATCGCCAGTAACCAGGCTTAATAACGTCGATTTTCCTGCACCATTTGGCCCGACAATTTGCCAGTGTTCGCCTGGATTCACCTGCCAGCTAAGTTTATTAAGAATGGGGCg < 2:627865/289‑1 (MQ=255) 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